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克氏原螯虾虾青蛋白A2基因克隆、组织分布及原核表达

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食品与生物技术学报 2024年第2期43卷 63-72页

作者：陈浩吉宏武张迪刘书成宋文奎郝记明广东海洋大学食品科技学院广东湛江524008 广东省水产品加工与安全重点实验室广东湛江524008 广东省海洋生物制品工程实验室广东湛江524008 广东省海洋食品工程技术研究中心广东湛江524008 水产品深加工广东普通高等学校重点实验室广东湛江524008

虾青蛋白对甲壳类水产品色泽的形成和调控具有重要作用。为探究克氏原螯虾虾青蛋白A2(PcCRA2)的基因结构及原核表达,作者通过基因克隆获得PcCRA2基因编码序列(cra2),采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测cra2基因在克氏原螯虾9种组织中的... 详细信息

虾青蛋白对甲壳类水产品色泽的形成和调控具有重要作用。为探究克氏原螯虾虾青蛋白A2(PcCRA2)的基因结构及原核表达,作者通过基因克隆获得PcCRA2基因编码序列(cra2),采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测cra2基因在克氏原螯虾9种组织中的表达模式,并以大肠杆菌BL21(DE3)为宿主,进行PcCRA2异源重组表达。结果表明,克氏原螯虾cra2基因cDNA全长573 bp,编码190个氨基酸。生物信息学分析显示,虾青蛋白A2相对分子质量为21 158.9,理论等电点为5.59。氨基酸序列比对发现,克氏原螯虾cra2编码蛋白质序列与红螯螯虾相似度最高,为91.58%。RT-qPCR结果显示,cra2在所检组织中均有表达,在表皮的表达量最高(P<0.05)。构建了pET28a-cra2原核表达载体,并在大肠杆菌BL21(DE3)诱导表达。其最佳诱导表达条件为:接种4 h后加入0.5 mmol/L IPTG于30℃诱导6 h;UV-vis结果表明重组蛋白质能与虾青素特异性结合,最大吸收峰为505 nm。该研究结果为进一步研究虾青蛋白质的生物功能奠定基础。

关键词：虾青蛋白克氏原螯虾实时荧光定量PCR 原核表达

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哈维氏弧菌LAMP可视化检测方法的建立

海洋渔业 2024年

作者：于劼豪黄郁葱孙良娟钟键鲁义善简纪常蔡双虎广东海洋大学水产学院广东省水产动物病害防控与健康养殖重点实验室广东海洋大学深圳研究院广东省水生动物健康评估工程技术研究中心湛江海关技术中心

为加强对哈维氏弧菌（Vibrio harveyi）早期快速诊断，本研究探究建立一种基于环介导等温扩增（LAMP）技术的可视化快速检测方法。基于环二聚体磷酸二酯VieA基因序列在哈维氏弧菌中的保守性，将其作为靶基因设计引物并初步建立LAMP反应... 详细信息

为加强对哈维氏弧菌（Vibrio harveyi）早期快速诊断，本研究探究建立一种基于环介导等温扩增（LAMP）技术的可视化快速检测方法。基于环二聚体磷酸二酯VieA基因序列在哈维氏弧菌中的保守性，将其作为靶基因设计引物并初步建立LAMP反应体系，对LAMP反应体系中各反应物浓度、内外引物比例、反应时间和反应温度进行优化，并对优化后的LAMP反应的特异性和灵敏度进行检测；分别在优化后的LAMP反应体系中加入SYBR Green I、钙黄绿素-锰离子或羟基萘酚蓝作为指标剂对LAMP反应产物进行可视化判别，从而建立了一种针对哈维氏弧菌的LAMP可视化检测方法。研究表明该LAMP反应体系最佳反应温度60℃、反应时间60 min、Mg2+浓度1.2 mmol·L-1、dNTPs浓度0.64 mmol·L-1、甜菜碱浓度0.25 mmol·L-1及内外引物比例16:1；该反应体系能特异性检测到哈维氏弧菌，且灵敏度为3.4×10-6ng·μL-1。可视化指标剂钙黄绿素-锰离子的添加比例为12:1或羟基萘酚蓝的添加浓度为390 μmol·L-1时LAMP反应结果的可视化效果最好，临床应用表明该LAMP可视化技术能准确并特异性地检测到珍珠龙胆石斑鱼和凡纳滨对虾组织中感染的哈维氏弧菌。本研究提供了一种简单、快速和结果可视化的哈维氏弧菌LAMP检测方法，可以为水生动物哈维氏弧菌的现场检测和弧菌病的早期诊断提供技术支持。

关键词：哈维氏弧菌 LAMP技术可视化检测临床应用

甜高粱蔗糖转运蛋白SUT5的表达及功能分析

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分子植物育种 2024年第15期22卷 4884-4891页

作者：吉怡颖潘成才周扬江行玉海南大学热带作物学院海口570228 广东海洋大学滨海农业学院湛江524088

为揭示甜高粱蔗糖转运蛋白SdSUT5基因的功能及在不同非生物胁迫下的表达模式,本研究利用同源克隆获得一个甜高粱SUT5基因,并进行生物信息学及亚细胞定位分析。采用实时荧光定量PCR法研究该基因在低温、高温、盐和干旱4种非生物逆境下不... 详细信息

为揭示甜高粱蔗糖转运蛋白SdSUT5基因的功能及在不同非生物胁迫下的表达模式,本研究利用同源克隆获得一个甜高粱SUT5基因,并进行生物信息学及亚细胞定位分析。采用实时荧光定量PCR法研究该基因在低温、高温、盐和干旱4种非生物逆境下不同组织的响应特性,同时通过转化己糖转运缺陷型酵母***4000验证SdSUT5基因的功能。生物信息学分析结果表明,该基因全长1 602 bp,共编码534个氨基酸,理论等电点为8.63,属于稳定亲水性蛋白;存在12个跨膜区,43个磷酸化位点;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。亚细胞定位试验显示,SdSUT5蛋白定位在质膜。利用己糖转运缺陷型酵母***4000证明SdSUT5基因编码蛋白具有转运蔗糖的功能。系统进化树表明甜高粱SUT5蛋白与甘蔗和玉米的亲缘关系较近。实时荧光定量PCR分析表明,低温、高温、干旱和盐胁迫后,甜高粱不同部位SUT5基因均有不同程度的响应。甜高粱SdSUT5基因的克隆和功能分析为甜高粱的抗逆育种提供了理论参考。

关键词：甜高粱蔗糖转运蛋白细胞膜逆境胁迫功能分析

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基于正交试验的医用微管挤出工艺参数优化

塑料 2024年第3期53卷 7-14页

作者：张子林刘焕牢胡伟康何优广东海洋大学机械工程学院广东省海洋装备及制造工程技术研究中心广东湛江524088

为得到多腔医用微管挤出成型的最佳工艺参数组合,提高微管制品质量,进行了医用微管挤出模具设计,并且,采用Polyflow有限元软件进行数值模拟。通过正交试验,分析注气压力p、入口流量Q及牵引速度v对医用微管内外轮廓椭圆度、直径及月牙腔... 详细信息

为得到多腔医用微管挤出成型的最佳工艺参数组合,提高微管制品质量,进行了医用微管挤出模具设计,并且,采用Polyflow有限元软件进行数值模拟。通过正交试验,分析注气压力p、入口流量Q及牵引速度v对医用微管内外轮廓椭圆度、直径及月牙腔壁厚的相对误差的影响,采用极差分析得到最佳工艺参数组合注气压力p为25 Pa、入口流量Q为540 mm3/s、牵引速度v为36 mm/s。最后,采用最佳工艺参数组合进行医用微管挤出成型实验。结果表明,数值模拟与挤出成型实验结果均满足医用微管制品尺寸精度公差要求,并且,两者各项误差的差值均小于5%。与无工艺参数挤出成型相比,引入注气压力和牵引速度作为工艺参数后,挤出成型的微管截面形状及尺寸精度均得到了优化,挤出制品质量得到了提高。

关键词：医用微管挤出模具设计数值模拟正交试验工艺参数

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基于多核心节点的增量式动态社区发现算法

通信学报 2024年第3期45卷 66-80页

作者：陈晶刘志君杨新宇刘洺辛刘苗苗广东海洋大学数学与计算机学院广东湛江524088 燕山大学信息科学与工程学院计算机系河北秦皇岛066004 河北省虚拟技术与系统集成重点实验室河北秦皇岛066004 广东海洋大学电子信息工程学院广东湛江524088 东北石油大学计算机与信息技术学院黑龙江大庆163318

针对动态社区发现算法通常基于社区结构平稳变化的假设,而难以应对演化过程中可能出现的大量社区消亡或涌现等突发事件的问题,提出了一种基于多核心节点的增量式动态社区发现算法MCNIDCD。首先,将核心节点分为扩散型和内聚型,制定4种增... 详细信息

针对动态社区发现算法通常基于社区结构平稳变化的假设,而难以应对演化过程中可能出现的大量社区消亡或涌现等突发事件的问题,提出了一种基于多核心节点的增量式动态社区发现算法MCNIDCD。首先,将核心节点分为扩散型和内聚型,制定4种增量更新策略。其次,通过局部更新调整节点社区归属,并采用增量模块度方法优化社区结构。最后,实现社区合并。在人工和真实网络上对该算法的性能进行了评估,实验结果表明,在对比目前相关动态社区检测算法时,在人工网络仿真环境中,MCNIDCD算法表现出与社区演化规律的高度契合性;在真实网络实验中,MCNIDCD算法在模块度性能指标上平均提升了28%,并且在稳定性方面具有良好的优势,其优势对于研究动态社区演化过程具有重要的意义。

关键词：核心节点增量式网络演化社区发现

苏拉威西海海面高度多频率季节内变化及其机制分析

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海洋学报 2024年第2期46卷 14-27页

作者：毛志榜王露李君益谢玲玲郑全安广东海洋大学海洋与气象学院广东湛江524088 陆架及深远海气候、资源与环境广东省高等学校重点实验室广东湛江524088 自然资源部空间海洋遥感与应用重点实验室北京100081 海军士官学校航海系安徽蚌埠233012 美国马里兰大学大气与海洋科学系马里兰州大学市20742

本文利用1993-2022年卫星高度计观测数据,分析苏拉威西海海面高度多频率季节内变化信号的时空特征,利用罗斯贝标准模理论给出动力解释。谱分析显示,苏拉威西海海面高度变化存在很强的30~90 d的季节内信号,其平均功率谱密度为半年内信号... 详细信息

本文利用1993-2022年卫星高度计观测数据,分析苏拉威西海海面高度多频率季节内变化信号的时空特征,利用罗斯贝标准模理论给出动力解释。谱分析显示,苏拉威西海海面高度变化存在很强的30~90 d的季节内信号,其平均功率谱密度为半年内信号平均功率谱密度的13倍。这些季节内信号具有离散、不连续的谱峰周期,其中54.0 d和64.4 d的峰值最大,分别为30~90 d信号平均谱值的28倍和23倍。罗斯贝标准模态理论分析显示,近封闭的苏拉威西深海盆存在离散的罗斯贝标准模态。卫星高度计观测的季节内变化与罗斯贝标准模态结果的二维空间结构演化、周期以及西传速度一致,罗斯贝标准模态解的叠加呈现出与海面高度变化相似的方差分布,这说明苏拉威西海海盆的固有振荡是其季节内变化特征形成的重要机制之一。

关键词：苏拉威西海多频率季节内变化时空特征罗斯贝标准模态固有振荡

某钻井船的静水力特性和大倾角稳性及溢油计算

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矿山工程 2024年第2期12卷 150-157页

作者：谢一凡张大朋赵博文严谨姜淏予广东海洋大学船舶与海运学院广东湛江广东海洋大学广东省南海海洋牧场智能装备重点实验室广东湛江广东海洋大学电信学院广东湛江

钻井船是一种重要的海上油气开发装置,对于开采海上油气资源有着重要的作用。对钻井船的静水力特性和大倾角稳性及溢油计算进行分析对于保障海上油气开采安全、促进海洋资源开发有着重要的意义。有鉴于此,本文结合某钻井船的具体结构与... 详细信息

钻井船是一种重要的海上油气开发装置,对于开采海上油气资源有着重要的作用。对钻井船的静水力特性和大倾角稳性及溢油计算进行分析对于保障海上油气开采安全、促进海洋资源开发有着重要的意义。有鉴于此,本文结合某钻井船的具体结构与参数,对其进行了相关分析,得到的结论对于具体实践有一定的指导意义。

关键词：钻井船静水力特性大倾角稳性溢油计算

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红树林沉积物聚乙烯降解菌的筛选和降解特性

广东海洋大学学报 2024年第3期44卷 143-149页

作者：卫婉聂芳红张敏林红英魏云丽吕广洲照那木拉康丹菊 HAY Anthony GOONERATNE Ravi 陈进军广东海洋大学滨海农业学院广东湛江524088 广东海洋大学食品科技学院广东湛江524088 Department of Microbiology Cornell UniversityUSA Ithaca NY 14853 Department of Wine Food and Molecular BiosciencesFaculty of Agriculture and Life SciencesLincoln UniversityNew Zealand Lincoln 7647

【目的】探究湛江市麻章区红树林沉积物中微生物对聚乙烯(PE)塑料的降解特性,丰富红树林塑料降解菌种类。【方法】在湛江市麻章区红树林的高、中、低潮带随机选取9个样点,并采用五点采样法从红树林表层2~5 cm的沉积物中取样。将采集到... 详细信息

【目的】探究湛江市麻章区红树林沉积物中微生物对聚乙烯(PE)塑料的降解特性,丰富红树林塑料降解菌种类。【方法】在湛江市麻章区红树林的高、中、低潮带随机选取9个样点,并采用五点采样法从红树林表层2~5 cm的沉积物中取样。将采集到的沉积物样本在以聚乙烯为唯一碳源的无机盐培养基中进行富集、分离、纯化,以筛选出能够降解PE的菌株,并通过显微形态分析、分子鉴定等方法确定其种属;通过测定生长曲线、失重率、以及分析官能团变化来验证菌株对PE塑料的降解性能。【结果与结论】从沉积物中共筛选出K1-1、K1-2和K1-3三株PE降解能力较强的菌,分别为威尼斯不动杆菌(Acinetobacter venetianus)、Pseudomonas juntendi和维德曼芽孢杆菌(Bacillus wiedmannii)。在120 d的培养周期中,这些菌株的生长曲线均呈抛物线形态。经三株菌作用后,PE表面生成羟基,并形成氨基和羟基化合物,羟基取代羰基,导致PE表观和内部结构明显改变。经120 d处理后,PE膜的失重率分别为6.42%、5.38%和5.73%,其中K1-1菌株处理后PE塑料的失重率相较于目前报道的红树林沉积物中最高降解效率菌株Bacillus gottheilii处理后塑料的失重率提升3.55%。威尼斯不动杆菌(***)在PE塑料降解上具有一定潜力,这丰富了湛江红树林沉积物中PE降解菌的种类,为PE塑料的生物降解提供理论支持。

关键词：红树林沉积物聚乙烯塑料降解菌降解性能

廉江高桥红树林沉积物微生物群落结构特征及其与营养因子相关性

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广东海洋大学学报 2024年第4期44卷 80-87页

作者：梁文雅王冼民刘琦广东海洋大学化学与环境学院广东湛江524088 岭南师范学院地理科学学院广东湛江524048

【目的】研究廉江高桥红树林沉积物中微生物群落构特征,及其与环境营养因子的相关性,为了解该研究区域红树林生态系统功能和红树林湿地保护提供基础。【方法】利用16S rDNA高通量测序手段,分析红树林生态系统表层沉积物中微生物的组成... 详细信息

【目的】研究廉江高桥红树林沉积物中微生物群落构特征,及其与环境营养因子的相关性,为了解该研究区域红树林生态系统功能和红树林湿地保护提供基础。【方法】利用16S rDNA高通量测序手段,分析红树林生态系统表层沉积物中微生物的组成、多样性和群落结构,并通过相关性分析探究其对环境营养因子的响应。【结果】研究区域沉积物中微生物优势细菌类群为变形菌门(Proteobacteria),绿弯菌门(Chloroflexi),酸杆菌门(Acidobacteria),拟杆菌门(Bacteroidetes)和芽单胞菌门(Gemmatimonadetes),其中变形菌门是相对丰度最高的类群,占比46.6%~68.9%。微生物α多样性中Shannon指数变化范围为9.95~10.34,Chao1指数变化范围为1 990~2 527,这两个指数在中高潮带间均存在显著差异(P <0.05)。沉积物中总磷、有效磷、总氮和氨氮的质量分数变化范围分别为383.575~760.283、41.772~97.076、820.201~1 452.442、1.511~9.048 mg·kg^(-1),且总磷在中高潮带间存在显著差异(P <0.05)。沉积物中营养因子对门水平上微生物群落组成的解释量为46%,其中总有机碳(TOC)和总氮是对群落结构影响较大的营养因子。【结论】廉江高桥红树林沉积物中微生物多样性丰富,中潮带微生物多样性和丰富度显著高于高潮带,且中潮带采样点的样本与高潮带的分离程度较好;不同分类的微生物对环境中营养因子具有不同程度的响应,TOC是影响中潮带沉积物中微生物群落组成和结构的关键因子,而氮磷是控制高潮带微生物群落结构的主要营养因子。

关键词：红树林沉积物微生物群落 16S rDNA高通量测序多样性相关性