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杂色龙虾线粒体基因组全序列的测定与分析

海洋科学 2014年第11期38卷 16-23页

作者：刘皓姚维刘海情刘楚吾刘丽广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室广东湛江524025

为了解杂色龙虾(Panulirus versicolor)线粒体基因组多态位点及遗传变异,对龙虾类的分类研究奠定基础,作者通过常规PCR步移扩增法获得杂色龙虾线的线粒体基因组全序列,分析了其线粒体基因组的基本特征以及基因排列情况,并结合中国龙虾(P... 详细信息

为了解杂色龙虾(Panulirus versicolor)线粒体基因组多态位点及遗传变异,对龙虾类的分类研究奠定基础,作者通过常规PCR步移扩增法获得杂色龙虾线的线粒体基因组全序列,分析了其线粒体基因组的基本特征以及基因排列情况,并结合中国龙虾(Panulirus stimposni)、波纹龙虾(Panulirus homarus)线粒体基因组全序列,综合分析了龙虾属线粒体编码基因多态位点及基因变异状况。结果表明:杂色龙虾线粒体基因组全序列为15 700 bp,由13个蛋白质编码基因、22个t RNA基因、2个r RNA基因和D-loop区组成,保持了泛甲壳动物线粒体基因组的原始排列。杂色龙虾线粒体DNA的碱基组成具有AT偏好性,A+T含量为67%,4种碱基的含量分别为(A=34.6%,T=32.1%,C=20.5%,G=12.8%)。预测了杂色龙虾18个t RNA以及2个r RNA的二级结构。龙虾属线粒体基因组中的nad 2、nad 5基因以及D-loop区的多态位点比例较高,适合作为分子标记用于龙虾类系统进化关系、种内多态性以及遗传分化等方面的研究。

关键词：杂色龙虾(Panulirus versicolor) 线粒体基因组 RNA二级结构分子标记

管角螺Hemifusus tuba(Gmelin)稚贝在不同盐度下的生长和存活研究

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热带海洋学报 2011年第6期30卷 90-96页

作者：罗杰曹伏君刘楚吾陈加辉广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室广东湛江524025

在水温28.6—29.5℃、pH8.2条件下,研究了管角螺Hemifusus tuba稚贝[(壳高19.5±1.23)mm、体重(661.4±48.6)mg]在不同盐度下的生长和存活,并用二点法计算出最适宜存活和生长的盐度范围。结果表明,管角螺稚贝适宜存活盐度和最适存活盐... 详细信息

在水温28.6—29.5℃、pH8.2条件下,研究了管角螺Hemifusus tuba稚贝[(壳高19.5±1.23)mm、体重(661.4±48.6)mg]在不同盐度下的生长和存活,并用二点法计算出最适宜存活和生长的盐度范围。结果表明,管角螺稚贝适宜存活盐度和最适存活盐度分别为17.7‰—40.8‰和25.1‰—35.9‰,适宜生长盐度和最适生长盐度分别为17.5‰—39.9‰和27.8‰—33.2‰。在最适生长盐度范围内,稚贝壳高日平均增长率为0.358—0.397mm.d 1,体重日平均增长率为44.64—49.09mg.d 1。超出上述范围,其存活率下降、生长率降低。稚贝在盐度17.0‰和41.3‰的海水中适应20d后再分别移至盐度14.0‰和45.0‰的海水中,72 h后存活率分别为84.0%和96.0%,而直接把生活在盐度为30.5‰中的稚贝放入到盐度为14.0‰和45.0‰的海水,72h后其存活率为8.0%和0,可见稚贝对盐度的适应能力与原生活海水盐度有关,经过驯化后的稚贝能够扩大对盐度的适应范围,提高对盐度的耐受力。

关键词：管角螺稚贝盐度生长存活

四种环境因子对澄黄滨珊瑚和斯氏角孔珊瑚胁迫作用研究

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热带海洋学报 2013年第3期32卷 72-77页

作者：刘丽李泽鹏申玉春杨小东广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室广东湛江524025

在实验室条件下对澄黄滨珊瑚(Porites lutea)和斯氏角孔珊瑚(Goniopora stutchburyi)进行温度、pH、磷酸盐和铜离子4种环境因子的胁迫试验。结果表明,温度、pH、磷酸盐和铜离子含量对2种珊瑚单位面积虫黄藻密度和叶绿素a含量有重要影响... 详细信息

在实验室条件下对澄黄滨珊瑚(Porites lutea)和斯氏角孔珊瑚(Goniopora stutchburyi)进行温度、pH、磷酸盐和铜离子4种环境因子的胁迫试验。结果表明,温度、pH、磷酸盐和铜离子含量对2种珊瑚单位面积虫黄藻密度和叶绿素a含量有重要影响,对照组和试验组间差异显著(p增加,澄黄滨珊瑚和斯氏角孔珊瑚分泌黏液,触手逐渐回缩,直至全部紧缩,颜色逐渐变浅,白化死亡。澄黄滨珊瑚在25℃和28℃时有较高的虫黄藻密度,在28℃时有较高的叶绿素a含量;斯氏角孔珊瑚在28℃时单位面积虫黄藻密度与叶绿素a含量都达到最高值。在pH 6.5时,2种珊瑚单位面积虫黄藻密度和叶绿素a含量均达到最高值。澄黄滨珊瑚在磷酸盐浓度5.0μmol·L 1时,单位面积虫黄藻密度和叶绿素a含量达到最高值;斯氏角孔珊瑚在未添加磷酸盐时,单位面积虫黄藻密度和叶绿素a含量为最高值。在铜离子浓度为4μg·L 1时,2种珊瑚有较高的单位面积虫黄藻密度和叶绿素a含量。2种珊瑚比较,澄黄滨珊瑚单位面积虫黄藻密度和叶绿素a含量明显低于斯氏角孔珊瑚。

关键词：温度 pH 磷酸盐铜离子虫黄藻叶绿素a 珊瑚

盐度和营养对凡纳滨对虾生长、耗氧率及排氨率的影响

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热带海洋学报 2010年第5期29卷 111-118页

作者：申玉春陈作洲吴灶和黄翔鹄南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室广东海洋大学水产学院广东湛江524025

研究了盐度和饲料蛋白水平与凡纳滨对虾Litopenaeus vannamei生长、耗氧率、排氨率的关系,并分析了实验对虾肌肉成分。结果表明,随着饲料蛋白水平的提高,凡纳滨对虾的生长速率逐渐提高,但饲料蛋白水平对其存活率影响不显著(P>0.05)。在... 详细信息

研究了盐度和饲料蛋白水平与凡纳滨对虾Litopenaeus vannamei生长、耗氧率、排氨率的关系,并分析了实验对虾肌肉成分。结果表明,随着饲料蛋白水平的提高,凡纳滨对虾的生长速率逐渐提高,但饲料蛋白水平对其存活率影响不显著(P>0.05)。在不同饲料蛋白水平下,实验对虾的存活率随着盐度的增加而增加,差异不显著(P>0.05)。实验对虾的生长速率在低盐度水平下随着盐度的增加而增加,在盐度18‰时达到最快的生长速率,而后生长速率随着盐度的增加而降低。随着盐度的提高,实验对虾肌肉中粗蛋白质、粗脂肪和灰分含量显著提高(P实验对虾肌肉中粗蛋白质和灰分含量显著提高(P0.05)。盐度和饲料蛋白水平对凡纳滨对虾的耗氧率、排氨率有显著的影响(P<0.05)。随着盐度和饲料蛋白水平的提高,对虾的耗氧率显著下降(P<0.05),耗氧率高峰值出现在摄食后2-3h。排氨率随着饲料蛋白水平的提高逐渐升高,随盐度的升高逐渐降低,排氨率高峰值出现在摄食后2h。盐度与饲料蛋白水平对凡纳滨对虾氧氮比影响显著(P<0.05)。

关键词：盐度营养生长耗氧率排氨率凡纳滨对虾Litopenaeus vannamei

镉离子胁迫下半叶马尾藻中国变种生理生化响应的研究

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海洋湖沼通报 2019年第2期 139-146页

作者：全秋梅贺亮梁忠林斌全张艳苹刘丽广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室广东湛江524025

研究了不同浓度梯度Cd^(2+)对半叶马尾藻中国变种(*** ***)相对生长速率(RGR)及生理生化指标如丙二醛(MDA)、叶绿素a(Chl-a)、类胡萝卜素(Car)、超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)等的影响,探索半叶马尾藻中国变... 详细信息

研究了不同浓度梯度Cd^(2+)对半叶马尾藻中国变种(*** ***)相对生长速率(RGR)及生理生化指标如丙二醛(MDA)、叶绿素a(Chl-a)、类胡萝卜素(Car)、超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)等的影响,探索半叶马尾藻中国变种对污染水体中Cd^(2+)的适应机理。结果表明,低浓度的Cd^(2+)能促进藻体的生长,但胁迫浓度为0.5 mg·L^(-1)的相对生长速率比0.05 mg·L^(-1)的高; MDA含量随着Cd^(2+)浓度的增加而升高,浓度越高的变化越明显;Chl-a和Car含量的影响呈波动状态;SOD、POD、CAT活性则呈现先升高后降低的趋势,相对于对照组,胁迫组所对应的SOD活性没有显著差异(P>0.05),而POD、CAT活性存在极显著差异(P海洋环境修复提供理论依据。

关键词：半叶马尾藻中国变种 Cd^2+胁迫生理生化适应性

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鱼类视蛋白的研究进展

海洋与湖沼 2015年第6期46卷 1564-1570页

作者：刘楚吾余娟王中铎郭昱嵩广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室湛江524088

鱼类作为脊椎动物最重要的类群之一,在其生长发育和进化中,视蛋白在视觉图像形成和生物钟昼夜节律等非图像形成功能调节方面起着至关重要的作用,根据其是否直接参与视觉成像分视觉视蛋白和非视觉视蛋白两大类。本文对国内外鱼类视蛋白... 详细信息

鱼类作为脊椎动物最重要的类群之一,在其生长发育和进化中,视蛋白在视觉图像形成和生物钟昼夜节律等非图像形成功能调节方面起着至关重要的作用,根据其是否直接参与视觉成像分视觉视蛋白和非视觉视蛋白两大类。本文对国内外鱼类视蛋白生物学的最新研究进展进行了综述,重点介绍鱼类视觉系统视蛋白和非视觉系统视蛋白的研究进展,包括各自的组成、分类、分布、生理功能及视蛋白基因等,为进一步深入研究鱼类视觉感知的分子机制及鱼类资源的保护及应用奠定理论基础。

关键词：鱼类视觉非视觉视蛋白

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温度、pH和盐度对珊瑚小穗生长的影响

海洋环境科学 2014年第1期33卷 53-59页

作者：杨小东申玉春刘丽金磊广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室广东湛江524025

2012年7月在广东徐闻海域采集澄黄滨珊瑚、大管孔珊瑚和丛生盔形珊瑚,分解获得珊瑚小穗,在实验室条件下进行温度、pH、盐度渐变单因子对照试验,观察其在环境因子渐变条件下的生长特性。结果表明：三种珊瑚的骨骼密度平均值变化在（1.563... 详细信息

2012年7月在广东徐闻海域采集澄黄滨珊瑚、大管孔珊瑚和丛生盔形珊瑚,分解获得珊瑚小穗,在实验室条件下进行温度、pH、盐度渐变单因子对照试验,观察其在环境因子渐变条件下的生长特性。结果表明：三种珊瑚的骨骼密度平均值变化在（1.563-2.137）g/㎝^3之间,差异显著（P〈0.05）。温度和pH梯度的变化对同一规格珊瑚小穗生长率和组织延伸度影响差异显著（P〈0.05）;盐度梯度的变化对同一规格珊瑚小穗生长率影响差异显著（P〈0.05）,对组织延伸度影响差异不显著。三种环境因子对不同规格珊瑚小穗间生长率和组织延伸度影响差异不显著。澄黄滨珊瑚、大管孔珊瑚和丛生盔形珊瑚获得最大生长率和组织延伸度因子梯度有一定的差异,其中pH和盐度比较一致,均为7.8和32.5;而温度差异较大,澄黄滨珊瑚和丛生盔形珊瑚为29.5℃,大管孔珊瑚最大的生长率为25℃,最大的组织延伸度为28-29.5℃。

关键词：温度 pH 盐度生长率组织延伸度珊瑚小穗

基于线粒体COⅠ基因的海陵岛鲷科鱼类系统发育分析

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基因组学与应用生物学 2017年第3期36卷 874-881页

作者：黄元佳贺亮刘丽袁吉贵全秋梅广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室湛江524088

对采自海陵岛的6种鲷科鱼类(Sparidae)86个个体的线粒体COⅠ基因进行测序,结合Gen Bank上的17条同源序列,共7属11种103个个体进行系统进化分析。海陵岛11种鲷科鱼类COⅠ基因序列的T、C、A、G的平均含量分别为31.9%、27.6%、23.4%和17.1%... 详细信息

对采自海陵岛的6种鲷科鱼类(Sparidae)86个个体的线粒体COⅠ基因进行测序,结合Gen Bank上的17条同源序列,共7属11种103个个体进行系统进化分析。海陵岛11种鲷科鱼类COⅠ基因序列的T、C、A、G的平均含量分别为31.9%、27.6%、23.4%和17.1%,有保守位点359个,变异位点165个,简约信息位点162个,序列中转换大于颠换。Kimura 2-parameter种间遗传距离显示,真赤鲷和二长棘犁齿鲷的遗传距离小于前者与蓝点赤鲷的遗传距离。应用邻接法(NJ法)和最大似然法(ML法)对103条序列分别构建了鲷科鱼类的分子系统进化树。结果显示,鲷科鱼类分为两大类群,一类包括犁齿鲷属、赤鲷属、牙鲷属和四长棘鲷属,另一类包括平鲷属、棘鲷属和拟牛眼鲷属。根据种间遗传距离与系统发育树的结构特征推测,真赤鲷与二长棘犁齿鲷可能属于同一属,这与传统的形态分类学观点不完全相符。

关键词：海陵岛鲷科 CO I基因系统进化

紫红笛鲷线粒体全序列与笛鲷属鱼类分化年代的贝叶斯分析

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海洋科学 2013年第1期37卷 62-69页

作者：廖杰王中铎郭昱嵩刘楚吾广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室广东湛江524025

利用常规PCR未纯化产物直接测序的方法,获得紫红笛鲷(Lutjanus argentimaculatus)全长为16 543 bp线粒体DNA全序列,GenBank登录号为JN182927。结合GenBank中的已有数据比较分析表明:紫红笛鲷与笛鲷属(Lutjanus)线粒体基因组成基本一致,... 详细信息

利用常规PCR未纯化产物直接测序的方法,获得紫红笛鲷(Lutjanus argentimaculatus)全长为16 543 bp线粒体DNA全序列,GenBank登录号为JN182927。结合GenBank中的已有数据比较分析表明:紫红笛鲷与笛鲷属(Lutjanus)线粒体基因组成基本一致,符合脊椎动物的特征,各基因间进化速率差异显著;13个蛋白编码基因拼接序列贝叶斯建树的后验率显著高于单基因或全序列,更适用于笛鲷属的贝叶斯法系统分化分析和年代推断;13个蛋白编码基因及其拼接序列进行的系统进化分析均支持紫红笛鲷与勒氏笛鲷(Lutjanus russellii)及海鸡母笛鲷(Lutjanus rivulatus)亲缘关系较近;基于13个蛋白编码基因拼接序列的贝叶斯松散分子钟推算出笛鲷属鱼类两个主要支系大约在61.5Ma前古新世的达宁阶与蒙蒂阶交界时期发生分化。

关键词：紫红笛鲷(Lutjanus rivulatus) 线粒体全序列贝叶斯分析松散分子钟笛鲷属鱼类