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SARS-CoV-2 S蛋白引起呼吸道上皮细胞炎症反应的研究进展

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中国感染控制杂志 2024年第1期23卷 112-118页

作者：刘兴健张华华张锐钢广东医科大学基础医学院生理学教研室广东湛江524023 广东医科大学基础医学院生物学教研室广东湛江524023

严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)感染引起的肺炎对人类生命健康产生威胁,对社会经济造成巨大损失。病毒的结构蛋白刺突蛋白(S蛋白)一直被认为主要介导病毒侵入宿主细胞。S蛋白可独立于病毒引起多种细胞产生炎症反应,因此,了... 详细信息

严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)感染引起的肺炎对人类生命健康产生威胁,对社会经济造成巨大损失。病毒的结构蛋白刺突蛋白(S蛋白)一直被认为主要介导病毒侵入宿主细胞。S蛋白可独立于病毒引起多种细胞产生炎症反应,因此,了解S蛋白本身对呼吸道的影响能够为防治新型冠状病毒感染提供新视角。本文对SARS-CoV-2结构蛋白S蛋白引起呼吸道上皮细胞炎症反应的可能机制、临床表现等方面的研究进展进行了梳理,以期为疾病的预防和治疗提供参考。

关键词： SARS-CoV-2 S蛋白 ACE2 呼吸道炎症

基于剪接因子SRSF9在头颈部鳞状细胞癌中的表达及临床意义的生物信息学分析

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吉林大学学报（医学版） 2024年第2期50卷 379-391页

作者：刘玉婷喻莹黎桂珍史沁雪李彬彬广东医科大学基础医学院病理生理学教研室广东东莞523808 广东医科大学第二临床医学院广东东莞523808

目的:基于生物信息学方法分析富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子9(SRSF9)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达情况、临床意义以及与肿瘤免疫浸润的关系,并探讨其作用机制。方法:利用癌症基因图谱(TCGA)数据库、基因表达综合(GEO)数据库中GSE30... 详细信息

目的:基于生物信息学方法分析富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子9(SRSF9)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达情况、临床意义以及与肿瘤免疫浸润的关系,并探讨其作用机制。方法:利用癌症基因图谱(TCGA)数据库、基因表达综合(GEO)数据库中GSE30784和GSE13601数据集、临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)数据库、基因表达交互分析(GEPIA)数据库和Kaplan-Meier plotter数据库分析SRSF9在HNSCC中的表达及与患者临床病理特征和预后的关系;利用cBioPortal数据库分析SRSF9基因变异情况;应用ESTIMATE算法和肿瘤免疫估计资源(TIMER)数据库评估SRSF9表达与肿瘤微环境和肿瘤免疫细胞浸润的关系;利用LinkedOmics数据库分析SRSF9在HNSCC中的共表达基因及其调控通路;基于TCGA SpliceSeq数据库分析HNSCC中SRSF9调控的可变剪接事件,并对靶基因进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果:TCGA数据库、GEO数据库中GSE30784和GSE13601数据集分析,HNSCC组织中SRSF9 mRNA表达水平较癌旁正常组织明显升高(P<0.01);CPTAC数据库分析,与正常组织比较,HNSCC组织中SRSF9蛋白表达水平明显升高(P<0.001)。TCGA数据库分析,SRSF9 mRNA表达与HNSCC患者病理分级(P=0.004)和HPV感染(P=0.031)有关联。GEPIA和Kaplan-Meier plotter数据库分析,HNSCC组织中SRSF9 mRNA高表达均与患者总生存期(OS)较差相关[风险比(HR)=1.40,P=0.019;HR=1.55,P=0.003]。cBioPortal数据库分析,HNSCC中SRSF9基因拷贝数变异(CNV)占26.85%,其CNV与SRSF9 mRNA表达水平呈正相关关系(r=0.44,P<0.001)。ESTIMATE算法分析,SRSF9 mRNA高表达组基质评分和免疫评分均较SRSF9 mRNA低表达组低(P<0.001),肿瘤纯度则高于SRSF9 mRNA低表达组(P<0.001)。TIMER数据库分析,SRSF9 mRNA表达水平与CD4+T淋巴细胞浸润呈正相关关系(r=0.186,P<0.001),而与B淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞和树突状细胞浸润呈负相关关系(r=-0.269,P<0.001;r=-0.353,P<0.001;r=-0.304,P<0.001)。SRSF9共表达基因富集分析,核糖体、剪接体和代谢通路等相关基因上调,而黏着斑、细胞因子和细胞黏附分子等相关基因下调。SRSF9相关可变剪接靶基因主要涉及脂类代谢、胰高血糖素和紧密连接等通路。结论:SRSF9在HNSCC中呈高表达,且与患者预后不良和肿瘤微环境免疫细胞浸润相关,可成为HNSCC诊断、预后评估和治疗的潜在分子靶标。

关键词：头颈部鳞状细胞癌富含丝氨酸/精氨酸剪接因子9 可变剪接肿瘤免疫生物信息学

2021年8月珠海一起食源性疾病暴发事件中金黄色葡萄球菌病原学特征分析

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中国食品卫生杂志 2024年第6期36卷 735-740页

作者：方艳梅龙冬玲京舒娉陈晶京杨春晓黄辉涛黄利群黄开松珠海市疾病预防控制中心微生物检验所广东珠海519064 广东医科大学广东省医学分子诊断重点实验室广东东莞523822

目的研究一起食源性疾病事件金黄色葡萄球菌(金葡菌)病原学特征和同源性。方法采用国标方法分离鉴定病原菌,微量肉汤稀释法检测菌株对16种药物的敏感性,全基因组测序和生物信息学分析病原菌分子遗传特征和同源性。结果该事件分离得到16... 详细信息

目的研究一起食源性疾病事件金黄色葡萄球菌(金葡菌)病原学特征和同源性。方法采用国标方法分离鉴定病原菌,微量肉汤稀释法检测菌株对16种药物的敏感性,全基因组测序和生物信息学分析病原菌分子遗传特征和同源性。结果该事件分离得到16株金黄色葡萄球菌,包括8株患者分离株,1株厨工分离株和7株食品分离株。MLST和Spa分型结果为ST7-t91、ST5-t548、ST398-t588和ST965-t62,患者株分为ST7-t91型和ST5-t548型;ST7分离株均对四环素和青霉素耐药,携带耐药基因aadD、te(t K)、blaZ和lnu(A),ST5株对16种抗生素均敏感;cgMLST分析发现ST7型菌株间等位基因差异≤3;毒力基因注释发现ST7株携带sea、chp、scn和sak毒力基因,ST5株携带chp、scn、sak、seg、selk、selm、selo和seln毒力基因。结论该事件由多个ST型金葡菌混合感染引起,以ST7-t91型为主,该克隆株致病力强,但对头孢类抗生素和喹诺酮类等临床一线抗生素敏感。

关键词：食源性疾病金黄色葡萄球菌全基因组测序 cgMLST 肠毒素

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脂代谢紊乱在肾脏衰老和肾纤维化中的作用

生物化学与生物物理进展 2024年第5期51卷 1067-1078页

作者：吴胜泉杨萌刘新光广东医科大学衰老研究所广东省医学分子诊断重点实验室东莞523808 广东医科大学生物化学与分子生物学研究所东莞523808

肾间质纤维化是终末期肾脏病的病理基础,肾脏衰老是肾间质纤维化的危险因素。越来越多的研究证明,脂代谢紊乱会导致肾脏衰老和肾间质纤维化。脂代谢紊乱引起的脂质堆积,会造成脂毒性和细胞应激性损伤,从而诱发衰老与细胞外基质(extracel... 详细信息

肾间质纤维化是终末期肾脏病的病理基础,肾脏衰老是肾间质纤维化的危险因素。越来越多的研究证明,脂代谢紊乱会导致肾脏衰老和肾间质纤维化。脂代谢紊乱引起的脂质堆积,会造成脂毒性和细胞应激性损伤,从而诱发衰老与细胞外基质(extracellular matrix,ECM)的分泌。维持脂代谢稳态有助于减轻肾脏衰老与肾间质纤维化的发生发展。脂代谢途径的关键酶和调控蛋白有望成为改善肾脏衰老和肾间质纤维化的潜在靶点。本综述概括了脂代谢紊乱在肾脏衰老和间质纤维化中的作用,并对脂代谢中肾脏衰老和间质纤维化的预防靶点和策略进行了总结,为治疗肾纤维化发现新靶点提供了参考。

关键词：肾脏衰老肾间质纤维化脂代谢肾小管上皮细胞

基于细胞焦亡与免疫相关基因构建及验证肝细胞癌预后风险模型

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中国免疫学杂志 2024年第5期40卷 981-991页

作者：谢彬任婷婷贵州医科大学医学检验学院临床生化教研室贵阳550004

目的:利用生物信息学方法构建并验证细胞焦亡与免疫相关基因的肝细胞癌预后风险模型,根据其风险评分探索免疫相关性特征,以指导个性化免疫治疗。方法:从TCGA、GEO官网分别下载TCGA-LIHC和GSE14520基因表达谱,从INNATEDB和IMMPORT官网下... 详细信息

目的:利用生物信息学方法构建并验证细胞焦亡与免疫相关基因的肝细胞癌预后风险模型,根据其风险评分探索免疫相关性特征,以指导个性化免疫治疗。方法:从TCGA、GEO官网分别下载TCGA-LIHC和GSE14520基因表达谱,从INNATEDB和IMMPORT官网下载免疫相关基因。以TCGA为训练组,GEO为测试组,对训练组细胞焦亡基因表达谱采用Cox回归分析,筛选预后相关基因进行共识聚类分组,提取分组间差异基因与免疫相关基因的交集基因,对交集基因应用单因素Cox和Lasso回归分析,得到预后相关风险评分模型。根据训练组风险中位值划分高低风险组,利用测试组验证模型可行性,最后探索训练组富集分析(GO、KEGG、GSEA)、免疫相关性分析及模型基因蛋白表达情况。结果:共筛选出9个可靠的风险模型基因(ICAM1、S100P、FABP3、CCL20、HRG、IGHM、SPP1、C4BPA、C6)。GO富集分析显示风险差异基因主要参与各种代谢过程。KEGG富集分析显示风险差异基因主要参与补体和凝血级联信号通路。GSEA富集分析显示高风险组与致癌途径的激活密切相关。在免疫浸润、免疫相关通路及免疫检查点中发现高低风险组具有显著差异。HPA数据库证明ICAM1、S100P、SPP1模型基因免疫组化表达存在明显差异。结论:9个基因组成的风险模型可能成为肝细胞癌发生、发展及预后相关的潜在生物标志物,并为优化肝细胞癌的诊治提供新线索。

关键词：肝细胞癌细胞焦亡免疫相关基因预后免疫浸润

S100A4在肥大细胞的表达及血清S100A4含量的检测对过敏性哮喘的诊断价值

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细胞与分子免疫学杂志 2024年第9期40卷 826-833页

作者：莫诗卉陶甜王晨予晏世荣李静吴通前余芳贵州医科大学医学检验学院微生物及免疫教研室贵州贵阳550004 贵州医科大学附属医院临床研究中心贵州贵阳550004

目的初步研究S100钙结合蛋白A4(S100A4)是否参与肥大细胞脂质代谢以及对过敏性哮喘的临床意义。方法从基因表达数据集(GEO)数据库中下载过敏性哮喘相关的单细胞RNA(scRNA)表达矩阵GSE213085,使用R包进行数据可视化处理。通过体外培养C5... 详细信息

目的初步研究S100钙结合蛋白A4(S100A4)是否参与肥大细胞脂质代谢以及对过敏性哮喘的临床意义。方法从基因表达数据集(GEO)数据库中下载过敏性哮喘相关的单细胞RNA(scRNA)表达矩阵GSE213085,使用R包进行数据可视化处理。通过体外培养C57肥大细胞,慢病毒感染肥大细胞建立S100A4低表达的细胞系,实时荧光定量PCR和Western blot法分别检测S100A4的mRNA和蛋白水平,实时荧光定量PCR检测脂质代谢相关基因ATP柠檬酸合成酶(ACLY)、乙酰辅酶A羧化酶1(ACC1)、CD36、溶质载体家族27a成员6(SCL27a6)、过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)的mRNA水平。采集过敏性哮喘的患者和健康对照人群外周血,ELISA检测血清S100A4水平,绘制受试者工作特征(ROC)曲线,分析S100A4对疾病的诊断效能,并计算曲线下面积(AUC)。结果用scRNA数据集GSE213085鉴定出26225个细胞,提取出肥大细胞进行后续分析,功能富集分析结果表明,肥大细胞特征基因集中于脂质代谢相关的途径。肥大细胞低表达S100A4时,其脂质代谢相关基因ACLY、ACC1、CD36、SCL27a6、PPARα表达下调。ELISA检测显示过敏性哮喘患者血清S100A4较健康对照人群升高,ROC曲线发现,血清S100A4含量对过敏性哮喘具有一定诊断效能(AUC=0.746)。结论S100A4可能参与肥大细胞脂质代谢调节,血清S100A4检测对过敏性哮喘诊断可能有一定价值。

关键词：过敏性哮喘肥大细胞 S100钙结合蛋白A4(S100A4) 生物信息学分析受试者特征曲线

自噬相关基因ATG8在酵母细胞时序性寿命调控中的作用

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微生物学通报 2024年

作者：杨晓迪袁頔崔晓静华伟邓雁文陈亚芹崔红晶广东省医学免疫与分子诊断重点实验室广东医科大学医学技术学院广东医科大学第二临床医学院广东医科大学附属东莞第一医院广东医科大学基础医学院

[背景] 自噬在调控细胞寿命和衰老过程中起着至关重要的作用，本课题组前期研究发现缺失自噬相关基因ATG8缩短酵母细胞复制性寿命，但有关其在寿命调控中的作用机制尚未明了。[目的]研究自噬相关基因ATG8在酵母细胞寿命调控中的作用及... 详细信息

[背景] 自噬在调控细胞寿命和衰老过程中起着至关重要的作用，本课题组前期研究发现缺失自噬相关基因ATG8缩短酵母细胞复制性寿命，但有关其在寿命调控中的作用机制尚未明了。[目的]研究自噬相关基因ATG8在酵母细胞寿命调控中的作用及可能机制。[方法]基于基因同源重组原理构建ATG8基因过表达酵母菌株(ATG8 OE)，检测ATG8基因缺失(atg8Δ)酵母菌株和ATG8 OE酵母菌株的时序性寿命(chronological lifespan，CLS)，生长曲线仪检测各菌株的增殖速率，流式细胞仪检测各菌株的活性氧(reactive oxygen species，ROS)含量，实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR， RT-qPCR)检测各菌株的氧化应激相关基因转录水平，比色法检测各菌株的细胞凋亡关键酶胱天蛋白酶3 (Caspase-3)活性。[结果]缺失ATG8 基因缩短酵母时序性寿命，减弱细胞增殖速率；且细胞内ROS含量增多，氧化应激相关基因表达下调，Caspase-3酶活性升高；ATG8 OE菌株时序性寿命和细胞增殖能力无明显变化，活性氧含量下降，氧化应激相关基因表达上调，Caspase-3酶活性无明显变化。[结论]自噬相关基因ATG8在调控酵母细胞时序性寿命和氧化应激反应中具有一定作用。

关键词：酿酒酵母 ATG8 氧化应激时序性寿命

多参数流式细胞术检测人骨髓标本中非肿瘤性异常细胞表型研究

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中华检验医学杂志 2024年第7期47卷 740-746页

作者：陈曼王榕周静傅旻婧赵玮同格乐王爱先宫美维王卉河北燕达陆道培医院检验科廊坊065201 贵州医科大学检验医学院临床微生物与免疫学教研室贵阳550000 北京陆道培医院病理与医学检验科北京100176

目的:分析多参数流式细胞术(MFC)检测骨髓标本中非肿瘤性异常表型相关疾病,包括意义不明的单克隆免疫球蛋白血症(MGUS)、单克隆B细胞增多症(MBL)、Fcγ受体Ⅲ类B(FcγRⅢB)缺失、CD36缺失等的表型特征。方法:回顾性观察性研究。选取2020... 详细信息

目的:分析多参数流式细胞术(MFC)检测骨髓标本中非肿瘤性异常表型相关疾病,包括意义不明的单克隆免疫球蛋白血症(MGUS)、单克隆B细胞增多症(MBL)、Fcγ受体Ⅲ类B(FcγRⅢB)缺失、CD36缺失等的表型特征。方法:回顾性观察性研究。选取2020年1月3日至2024年3月31日于河北燕达陆道培医院进行骨髓白血病/淋巴瘤一步法MFC筛查肿瘤性疾病的24 864例患者。收集患者一般临床资料以及MFC结果。根据年龄分为<45岁组(11 495例)、45~<60岁组(5 322例)、≥60岁组(7 081例);按疾病性质分为良性疾病组(8 336例)、恶性疾病组(15 562例)、其他组(966例)。分析各组骨髓标本中非肿瘤性异常表型的发生情况。结果:MGUS、MBL、FcγRⅢB缺失、CD36缺失的发生率分别为0.072%(18/24 864)、0.511%(127/24 864)、0.221%(55/24 864)、0.004%(1/24 864)。恶性疾病组MBL的发病率低于良性疾病组( P<0.001),MGUS的发病率高于良性疾病组( P=0.034)。良性疾病组中各疾病类型的MBL发生率比较,差异有统计学意义( P<0.001),其中全血细胞减少患者中MBL发生率最高为2.72%(48/1 765);恶性疾病组中,各疾病类型的MBL、MGUS发生率比较,差异均有统计学意义( P均<0.001),其中骨髓增生异常综合征/骨髓增殖性疾病患者发生率均最高,分别为1.95%(3/154)、1.30%(2/154)。结论:应用MFC进行白血病/淋巴瘤一步法检测的非肿瘤性异常细胞表型特征存在一定差异,对疾病的筛查具有一定的借鉴意义。

关键词：流式细胞术意义不明的单克隆免疫球蛋白血症单克隆B细胞增多症 Fcγ受体Ⅲ类B缺失

抗癌肽的抗肿瘤作用机制和临床应用的研究进展

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现代药物与临床 2024年第8期39卷 2169-2176页

作者：苏祖恒梅先林吴科锋陈起周余华军张海涛罗辉广东医科大学广东湛江524001 广东湛江海洋医药研究院广东湛江524001 广东医科大学湛江市环北部湾海洋微生物研究开发重点实验室广东湛江524023

抗癌肽是含有5~50个氨基酸的小型阳离子肽。抗癌肽具有独特的抗癌机制,如破坏细胞膜、诱导细胞凋亡、抑制血管生成、免疫调节、诱导DNA损伤和抑制细胞增殖。抗癌肽在治疗癌症方面具有巨大的潜力,但在临床上应用尚未成熟,仍处于临床试验... 详细信息

抗癌肽是含有5~50个氨基酸的小型阳离子肽。抗癌肽具有独特的抗癌机制,如破坏细胞膜、诱导细胞凋亡、抑制血管生成、免疫调节、诱导DNA损伤和抑制细胞增殖。抗癌肽在治疗癌症方面具有巨大的潜力,但在临床上应用尚未成熟,仍处于临床试验阶段。总结了抗癌肽的抗肿瘤作用机制、临床应用情况,以期为抗癌肽开发为新型高效低毒的抗癌药物提供思路。

关键词：抗癌肽细胞膜细胞凋亡血管生成免疫调节 DNA损伤细胞增殖临床应用