检索结果-南通市图书馆

基于生物信息学的急性缺血性脑卒中后心功能不全关键基因筛选及验证

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中国医科大学学报 2024年第9期53卷 769-776页

作者：孙俊丽王昭君韩毅山西医科大学麻醉学院太原030002 山西医科大学基础医学院生理学系细胞生理学教育部重点实验室山西省细胞生理学重点实验室太原030002 山西医科大学第二医院麻醉科太原030001 朔州市大医院麻醉科山西朔州036000

目的基于生物信息学方法筛选急性缺血性脑卒中(IS)后心功能不全的关键基因及信号通路。方法从基因表达综合(GEO)数据库下载GSE102558数据集,以P0.6筛选差异表达基因(DEG)。Cytoscape软件MCODE插件对蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络进行... 详细信息

目的基于生物信息学方法筛选急性缺血性脑卒中(IS)后心功能不全的关键基因及信号通路。方法从基因表达综合(GEO)数据库下载GSE102558数据集,以P0.6筛选差异表达基因(DEG)。Cytoscape软件MCODE插件对蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络进行功能模块分析,CytoHubba插件筛选核心基因。基因本体(GO)和京都基因和基因组数据库(KEGG)进行富集分析。构建大脑中动脉闭塞模型,实时PCR验证核心基因的表达情况。结果筛选出的DEG中上调385个,下调354个。评分前10位的核心基因分别是Col1a1、Col1a2、Col3a1、Fbn1、Postn、Col5a1、Mmp3、Eln、Acta2、Timp3。GO分析显示主要富集在细胞外基质、胶原纤维组织、血管发育、蛋白酶结合等方面。KEGG分析显示主要在蛋白质消化和吸收、松弛素、AGE-RAGE、血小板活化等通路富集。实时PCR结果显示Col3a1和Postn 2个关键基因在急性IS后心脏组织中表达均下降。结论Co-l3a1和Postn可能与急性IS后心功能不全的发生发展密切相关。

关键词：急性缺血性脑卒中心脏生物信息学差异表达基因富集分析

索马鲁肽治疗阿尔茨海默病的潜在靶点:沉默信息调节因子1

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中国组织工程研究 2024年第20期28卷 3235-3239页

作者：柴世凡李欣儒叶育采孙俊丽蔡红艳王昭君山西医科大学基础医学院生理学系细胞生理学教育部重点实验室细胞生理学山西省重点实验室山西省太原市030000 山西医科大学麻醉学院山西省太原市030000 山西医科大学基础医学院微生物与免疫教研室山西省太原市030000

背景:研究发现胰高血糖素样肽1及其类似物具有显著的神经保护作用,并且已有部分药物应用到阿尔茨海默病临床三期研究阶段,然而其发挥神经保护作用的具体机制尚不明确,有待进一步探讨阐明。目的:拟通过生物信息学和网络药理学分析方法筛... 详细信息

背景:研究发现胰高血糖素样肽1及其类似物具有显著的神经保护作用,并且已有部分药物应用到阿尔茨海默病临床三期研究阶段,然而其发挥神经保护作用的具体机制尚不明确,有待进一步探讨阐明。目的:拟通过生物信息学和网络药理学分析方法筛选出阿尔茨海默病发病机制的相关基因,以及索马鲁肽(一种胰高血糖素样肽1受体激动剂)治疗阿尔茨海默病的相关靶点,对两者进行综合分析挑选出潜在靶点基因,并在细胞水平加以验证。方法:利用DisGeNET数据库筛选出阿尔茨海默病患者与健康人群的差异基因,利用PubChem在线数据库得到索马鲁肽的化学结构式和2D结构图,利用DAVID在线数据库进行GO/KEGG富集分析,利用STRING数据库进行蛋白互作网络的构建,利用HPA数据库判断目的蛋白在人体各组织中的分布特点,最后使用蛋白印迹技术和免疫荧光技术检测索马鲁肽干预HT22细胞之后的蛋白表达情况。结果与结论:①利用DisGeNET数据库内数据得到3374个阿尔茨海默病患者与健康人群的差异基因,同时获得索马鲁肽潜在药物的101个靶基因,取两者交集得到23个相关基因;结合蛋白互作网络从中筛选出10个关键基因,分别是沉默信息调节因子1(SIRT1)、CASP9、CCND1、CASP1、KEAP1、DLG4、CASP4、GRB2、GRIA1、EDNRA;②GO基因功能分析显示关键基因主要富集在:半胱氨酸型内肽酶的正向调节活动,蛋白溶解的正向调节,半胱氨酸型内肽酶的正向调节,涉及凋亡活动过程的细胞质部分,AMPA谷氨酸受体复合物,炎症复合物,CARD结构域结合,半胱氨酸型内肽酶活性,半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡过程;KEGG信号通路分析结果主要为:结直肠癌,非小细胞癌,子宫内膜癌,上述均与免疫浸润、炎症、自噬凋亡相关;此外,根据关键基因的关联度排名及在HPA在线数据库不同组织中的分布情况,挑选出最显著的差异基因为SIRT1;③细胞实验显示,SIRT1蛋白表达在β-淀粉样蛋白1-42干预后的HT22细胞中显著下调,而经过索马鲁肽处理后明显上升;④结果显示,SIRT1可能是索马鲁肽治疗阿尔茨海默病的靶点基因。

关键词： DisGeNet数据库阿尔茨海默病索马鲁肽 2型糖尿病生物信息学网络药理学沉默信息调节因子1

Csn-B联合伊马替尼通过Nur77/Pim-1/Drp1信号通路对慢性髓系白血病细胞凋亡的影响

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中国实验血液学杂志 2024年第4期32卷 1078-1084页

作者：宫宇心杨卓婧曹济民刘慧敏山西医科大学基础医学院生理学教研室山西太原030001 山西医科大学第二医院血液科山西太原030001

目的:探讨Nur77特异性激动剂Csn-B联合伊马替尼通过促进Nur77的表达发挥抗慢性髓系白血病细胞活性,并探讨其信号通路的潜在作用。方法:首先应用CCK-8、Transwell法分别检测单独Csn-B、伊马替尼以及两者联合对K562细胞增殖迁移的抑制作用... 详细信息

目的:探讨Nur77特异性激动剂Csn-B联合伊马替尼通过促进Nur77的表达发挥抗慢性髓系白血病细胞活性,并探讨其信号通路的潜在作用。方法:首先应用CCK-8、Transwell法分别检测单独Csn-B、伊马替尼以及两者联合对K562细胞增殖迁移的抑制作用;进一步通过流式细胞术分别检测Csn-B、伊马替尼以及两者联合处理K562细胞的凋亡率,Western blot检测K562细胞中凋亡相关蛋白Nur77、Pim-1、Drp1、p-Drp1 S616、Bcl-2和Bax的表达水平变化;最后再分别检测Csn-B、伊马替尼以及两者联合处理K562细胞活性氧的表达水平。结果:在GSE43754数据集中慢性髓系白血病患者Nur77水平较正常人群显著下降(P细胞的增殖和迁移(均P细胞凋亡(P细胞中Nur77的表达,且与伊马替尼联合应用后可起到协同作用,增强伊马替尼的敏感性。Csn-B与伊马替尼联合处理较单药处理更能显著增强K562细胞内及线粒体内的ROS水平(均P细胞活性氧的表达,诱导K562细胞凋亡。

关键词：慢性髓系白血病伊马替尼耐药 Csn-B Nur77 线粒体分裂

炎症反应在重性抑郁障碍发生发展中的作用和机制

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安徽医科大学学报 2024年第3期59卷 554-558页

作者：昝翔(综述) 刘璐(综述) 刘志芬(综述) 张策(审校) 马久红(审校) 杨小荣(审校) 山西医科大学第五临床医学院太原030001 山西医科大学基础医学院生理学系太原030001 山西医科大学细胞生理学教育部重点实验室太原030001 山西医科大学第一医院精神卫生科太原030001 山西省人民医院神经外科太原030012

重性抑郁障碍(MDD)是一种常见的严重的神经精神障碍。越来越多的数据表明,炎症在精神疾病发生发展过程中发挥重要作用,且炎症过程与MDD的病理生理密切相关。现有研究证明,MDD患者存在先天性和后天性免疫失调,对患者健康产生不良影响。... 详细信息

重性抑郁障碍(MDD)是一种常见的严重的神经精神障碍。越来越多的数据表明,炎症在精神疾病发生发展过程中发挥重要作用,且炎症过程与MDD的病理生理密切相关。现有研究证明,MDD患者存在先天性和后天性免疫失调,对患者健康产生不良影响。本篇综述旨在总结近期文献中有关炎症反应在MDD发生发展中的作用及相关机制,为MDD的治疗提供基础与临床研究的新思路。

关键词：重性抑郁障碍免疫系统炎症反应炎症因子小胶质细胞下丘脑-垂体-肾上腺轴肠道微生物

基于CiteSpace的中药治疗高尿酸血症肾病的研究现状及趋势

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药物评价研究 2024年第6期47卷 1344-1357页

作者：何丽张楠陈磊曲婷丽高耀山西医科大学教务部山西太原030001 山西医科大学药学院山西太原030001 山西省药品检查中心(山西省疫苗检查中心) 山西太原030031 山西医科大学第一医院精神卫生科山西太原030001

目的基于CiteSpace 6.2.R6对“中药治疗高尿酸血症肾病”的中文及英文文献进行文献计量学及可视化分析,探讨中药治疗高尿酸血症肾病的研究现状及趋势,为将来的基础研究和临床研究提供参考。方法以中国学术期刊全文数据库(CNKI)、万方数... 详细信息

目的基于CiteSpace 6.2.R6对“中药治疗高尿酸血症肾病”的中文及英文文献进行文献计量学及可视化分析,探讨中药治疗高尿酸血症肾病的研究现状及趋势,为将来的基础研究和临床研究提供参考。方法以中国学术期刊全文数据库(CNKI)、万方数据知识服务平台(Wanfang)、维普中文科技期刊数据库(VIP)作为中药治疗高尿酸血症肾病的中文文献的检索平台,英文文献以Web of Science(WOS)为检索平台,不限制文献发表时间。应用CiteSpace 6.2.R6版软件对文献作者和机构进行合作分析,对关键词进行共现分析,以此提取可靠信息。结果通过检索共得到395篇中文和48篇英文文献,可视化分析结果显示中英文文献发文量整体呈上升趋势,但是年均发文量表明中药治疗高尿酸血症肾病的研究并不多。作者合作网络分析显示作者之间存在交流合作,但是较为分散,合作不够密切,该领域主要由国内学者进行研究,机构间合作相对独立,主要单位为国内中医药大学及其当地医院,缺乏跨省交流,更没有跨国合作。关键词共现分析表明高尿酸血症肾病的直接作用器官为肾脏,中药同高尿酸血症肾病联系比较密切,提示了中药治疗高尿酸血症肾病的更多方向和可能。中文关键词聚类分析表明该项研究多集中于临床层次,缺乏基础性研究。英文关键词聚类展示了与中药治疗高尿酸血症肾病相关性比较大的两种分子,分别是白细胞介素-1(IL-1)和核苷酸结合寡聚化结构域样受体含pyrin结构域蛋白3(NLRP3)。分析总结出该研究未来趋势更趋向于先应用生物医药大数据来探寻中药同高尿酸血症肾病的相关联系,在此基础上进行深入研究,这也反映该项研究正处于发展阶段。结论中药已经应用于高尿酸血症肾病的临床治疗中,对疾病起着一定作用,但是缺乏对其深入的基础性研究,因此限制了临床研究的发展。

关键词： CiteSpace 中药高尿酸血症肾病可视化分析文献计量学

聚吡咯-壳聚糖导电复合水凝胶促进缺血-再灌注损伤后心脏功能的恢复

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中国组织工程研究 2024年第15期28卷 2315-2322页

作者：王馨竹王琦郎丽敏何生山西医科大学再生医学中心出生缺陷与细胞再生山西省重点实验室山西省太原市030001 山西医科大学第一医院影像科山西省太原市030001

背景:导电生物材料被认为是传输心肌修复电信号的潜在候选者,将基于细胞或无细胞的策略与导电生物材料相结合以补充心肌细胞和/或恢复电信号通路,成为一种有前途的心脏修复方法。目的:评估聚吡咯-壳聚糖导电复合水凝胶对心肌缺血-再灌... 详细信息

背景:导电生物材料被认为是传输心肌修复电信号的潜在候选者,将基于细胞或无细胞的策略与导电生物材料相结合以补充心肌细胞和/或恢复电信号通路,成为一种有前途的心脏修复方法。目的:评估聚吡咯-壳聚糖导电复合水凝胶对心肌缺血-再灌注损伤大鼠心功能的改善作用。方法:采用化学氧化聚合法制备聚吡咯-壳聚糖导电复合水凝胶,表征水凝胶的微观形貌、生物相容性与导电性。取30只成年SD大鼠,利用夹闭心脏左前降支后再松解的方法建立心肌缺血-再灌注损伤模型,造模21 d后,采用随机数字表法将大鼠分为3组:空白组向左心室梗死区及梗死边缘区内注射生理盐水,普通水凝胶组向左心室梗死区及梗死边缘区内注射壳聚糖水凝胶,导电水凝胶组向左心室梗死区及梗死边缘区内注射聚吡咯-壳聚糖导电复合水凝胶,每组10只。设置造模后对应的时间点,分别进行心脏机械功能(超声心动图、压力-体积分析)、心脏电生理(心电图、程序性电刺激、光学映射技术、微电极阵列技术评估、八导联心电图、瘢痕区电阻率)及心脏组织学检测。结果与结论:①导电复合水凝胶表面存在大量孔隙,导电率为(3.19±0.03)×10^(-3)mS/cm,与平滑肌细胞共培养具有良好的生物相容性。②造模后105 d的超声心动图与压力-体积分析检测显示,与空白组、普通水凝胶组比较,导电复合水凝胶可明显改善心肌缺血-再灌注损伤大鼠心脏的收缩功能。造模后105 d的心电图、程序性电刺激、光学映射技术、微电极阵列技术评估、八导联心电图、瘢痕区电阻率检查结果显示,与空白组、普通水凝胶组比较,导电复合水凝胶可明显改善心肌缺血-再灌注损伤大鼠心脏的电传导功能,降低心律失常的发生。造模后105 d的心脏组织Masson染色显示,3组大鼠心肌梗死区均出现不同程度的纤维化,与生理盐水组和普通水凝胶组相比,导电水凝胶组梗死区正常心肌组织较多、纤维化程度较小。③结果表明,聚吡咯-壳聚糖导电复合水凝胶可能通过提高梗死瘢痕区组织电传导速度、增加瘢痕厚度、增强心脏同步收缩、减少受损组织来促进缺血-再灌注损伤后梗死心肌的修复。

关键词：导电生物材料聚吡咯壳聚糖水凝胶缺血-再灌注损伤心脏组织工程

低叶酸和维甲酸诱导神经管畸形小鼠模型胎脑的转录物组学分析

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中国生物化学与分子生物学报 2024年第5期40卷 638-646页

作者：曹志华谷小龙解琪李建婷方爱莉刘志贞山西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室出生缺陷与细胞再生山西省重点实验室太原030001 煤炭环境致病与防治教育部重点实验室太原030001 山西医科大学第三医院(山西白求恩医院山西医学科学院同济山西医院)麻醉科太原030000

神经管畸形(neural tube defects,NTDs)是一类中枢神经系统相关的重大出生缺陷型疾病。随着孕龄期妇女叶酸增补政策的推广,其发病率逐年下降致临床标本不易获取,因此,建立可靠的动物模型来研究NTDs的致病机制尤为重要。本研究分别通过... 详细信息

神经管畸形(neural tube defects,NTDs)是一类中枢神经系统相关的重大出生缺陷型疾病。随着孕龄期妇女叶酸增补政策的推广,其发病率逐年下降致临床标本不易获取,因此,建立可靠的动物模型来研究NTDs的致病机制尤为重要。本研究分别通过低叶酸联合甲氨蝶呤(methotrexate,MTX)建立的诱导NTDs小鼠模型和维甲酸(retinoic acid,RA)诱导建立的NTDs小鼠模型,对NTDs胎鼠脑组织进行转录物组测序(transcriptome sequencing,RNA-seq)并分析差异表达谱,最后,通过实时荧光定量PCR(real-time quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)进行结果验证。结果显示,低叶酸联合MTX诱导的胎鼠NTDs发生率为21.7%;RA诱导的胎鼠出现了强烈的致畸现象,畸形率为73.2%。相比正常胎鼠,低叶酸联合MTX诱导的NTDs小鼠组筛选出1443个差异表达基因(differentially expression genes,DEGs);RA诱导NTDs小鼠组筛选出3070个DEGs。对DEGs进行生物信息学分析,GO富集显示,上调基因主要参与前后轴发育、区域化和模式分化过程等生物学过程;KEGG富集显示,上调基因与心肌收缩、心肌病、神经活性配体-受体相互作用等信号通路相关。对2种模型鼠的DEGs进行Veen交集分析,结果显示,共有132个DEGs在2组模型中显著上调,其中包括Hox基因家族。通过RT-qPCR进行验证,发现与RNA-seq的结果一致。本研究对2种NTDs小鼠胎脑进行RNA-seq和差异表达谱分析,发现Hox的异常表达可能导致了NTDs的发生,为后续发病机制的研究提供了探索与思考。

关键词：神经管畸形转录物组测序叶酸维甲酸同源盒基因

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中华风湿病学杂志 2024年第7期28卷 500-504页

作者：程婷常珈松张荷艺李小峰张升校山西医科大学第二医院风湿免疫科太原030001 山西医科大学细胞生理学教育部重点实验室太原030001

自身免疫病(AID)是机体免疫耐受机制破坏而导致无法识别自身成分并产生攻击的一系列疾病,几乎涉及身体所有组织。已有多项研究表明,AID与多基因多态性有关,因此基因编辑技术在AID发病机制的研究及治疗的探索方面具有重大的潜在意义,其... 详细信息

自身免疫病(AID)是机体免疫耐受机制破坏而导致无法识别自身成分并产生攻击的一系列疾病,几乎涉及身体所有组织。已有多项研究表明,AID与多基因多态性有关,因此基因编辑技术在AID发病机制的研究及治疗的探索方面具有重大的潜在意义,其中成簇的规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9(CRISPR-Cas9)基因编辑技术已成为最突出的方法之一。本文主要对CRISPR-Cas9技术的基本简介、该技术在自身免疫病中的应用以及存在的脱靶效应和优化策略进行了综述。

关键词：自身免疫疾病免疫异源 CRISPR相关蛋白9 CRISPR-Cas系统

星形胶质细胞调节缺血性脑卒中的胶质瘢痕形成

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中国组织工程研究 2024年第1期28卷 131-138页

作者：杨婷丁智斌江楠韩红霞侯苗苗马存根宋丽娟李新毅山西医科大学第三医院(山西白求恩医院山西医学科学院同济山西医院)神经内科山西省太原市030032 山西中医药大学国家中医药管理局多发性硬化益气活血重点研究室/第一临床学院脑病科山西省晋中市030619 山西医科大学细胞生理学教育部重点实验室山西省太原市030001 山西省心血管病医院(山西医科大学附属心血管病医院) 山西省太原市030024

背景:缺血性脑卒中是临床上主要的致死及致残性疾病之一,经血管再通获益的患者数量极其有限,故探索有效治疗手段迫在眉睫。以星形胶质细胞为主所形成的胶质瘢痕作为缺血性脑卒中的重要病理变化之一,是阻碍脑卒中后期轴突再生和神经修复... 详细信息

背景:缺血性脑卒中是临床上主要的致死及致残性疾病之一,经血管再通获益的患者数量极其有限,故探索有效治疗手段迫在眉睫。以星形胶质细胞为主所形成的胶质瘢痕作为缺血性脑卒中的重要病理变化之一,是阻碍脑卒中后期轴突再生和神经修复的主要原因。目的:通过对缺血性脑卒中后星形胶质细胞瘢痕形成的病理过程、关键的信号调节机制和潜在治疗靶点进行分析,旨在为干预星形胶质细胞瘢痕形成以有效治疗缺血性脑卒中提供理论依据,并为促进脑卒中后康复提供新策略。方法:全面检索2010-2022年在中国知网、PubMed和Web of Science数据库收录的相关文献,中文检索词:“缺血性脑卒中、脑缺血、星形胶质细胞、胶质瘢痕、胶质增生、星形胶质细胞增多症”,英文检索词:“Ischemic stroke,Brain ischemi*,Cerebral ischemi*,Astrocyt*,Astroglia*,Glial scar,Gliosis,Astrogliosis”,经筛选后纳入78篇文献进行综述。结果与结论:①星形胶质细胞在中枢神经系统稳态的维持中具有重要作用,缺血性脑卒中发生后,星形胶质细胞从静息态转变为激活态,由于脑缺血部位损伤的严重程度的不同,其活化呈现从肿胀、增殖到胶质瘢痕形成的动态变化。②成熟的星形胶质细胞受到刺激重新进入细胞周期并发生增殖和迁移,是形成胶质瘢痕的主要细胞来源,脑室下区的神经干细胞、脑实质局部神经胶质抗原2(NG2)和室管膜细胞前体细胞也可分化为星形胶质细胞,内皮素1(ET-1)、水通道蛋白4(AQP4)、睫状神经营养因子(CNTF)和缝隙连接蛋白参与了此过程;硫酸软骨素蛋白多糖(CSPG)是细胞外基质的主要成分,同增殖的星形胶质细胞共同形成致密的胶质瘢痕屏障,阻碍了轴突的极化和延伸。③星形胶质细胞活化、增殖、迁移及促炎作用所涉及的关键信号分子的激活或者抑制调节了胶质瘢痕形成,转化生长因子β1(TGF-β1)/Smad和JAK/STAT3是经典的星形胶质细胞反应性相关通路,糖原合成酶激酶3β(GSK-3β)和受体相互作用蛋白激酶1(RIP1K)是调节炎症反应的关键分子,而关于Smad泛素化相关因子2(Smurf2)和白细胞介素17及其下游信号通路在胶质瘢痕形成中的研究相对较少,值得深入探索。④以星形胶质细胞反应性相关的信号通路、细胞增殖调控蛋白和炎症因子为靶点的药物有效抑制了缺血性脑卒中后胶质瘢痕的形成,其中临床常用药物如褪黑素和丙戊酸调节胶质瘢痕形成的作用已被发现,这使得通过抑制胶质瘢痕形成来促进神经功能恢复的药物应用于脑卒中患者成为可能。⑤然而,胶质瘢痕在脑卒中急性期发挥的神经保护作用是不可忽视的,因此如何选择合适的药物干预时机,以在保持胶质瘢痕发挥保护作用的同时促进局部微环境中的神经再生和修复是今后努力的方向。

关键词：缺血性脑卒中星形胶质细胞胶质瘢痕增殖炎症再生信号通路治疗