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人颊黏膜鳞状细胞癌细胞系SCC117的建立及其生物学特性分析

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中华口腔医学杂志 2024年第9期59卷 942-949页

作者：孟超李盛林王衣祥傅嘉葛兮源北京大学口腔医学院·口腔医院口腔颌面外科国家口腔医学中心国家口腔疾病临床医学研究中心口腔生物材料和数字诊疗装备国家工程研究中心口腔数字医学北京市重点实验室北京100081 北京大学口腔医学院·口腔医院中心实验室国家口腔医学中心国家口腔疾病临床医学研究中心口腔生物材料和数字诊疗装备国家工程研究中心口腔数字医学北京市重点实验室北京100081 首都医科大学口腔医学院特诊特需科北京100050

目的建立中国人颊黏膜鳞状细胞癌(BMSCC)细胞系SCC117,分析并鉴定其基本生物学特性。方法纳入2011年1月就诊于北京大学口腔医学院·口腔医院口腔颌面外科的1例BMSCC患者(59岁中国男性),采用改良组织块培养法对其原发灶手术标本进行体外... 详细信息

目的建立中国人颊黏膜鳞状细胞癌(BMSCC)细胞系SCC117,分析并鉴定其基本生物学特性。方法纳入2011年1月就诊于北京大学口腔医学院·口腔医院口腔颌面外科的1例BMSCC患者(59岁中国男性),采用改良组织块培养法对其原发灶手术标本进行体外原代培养,连续传代稳定生长后建立人BMSCC细胞系SCC117。光学显微镜和电镜观察SCC117细胞形态特征,通过生长曲线、染色体核型、异种移植裸鼠成瘤实验等分析其基本生物学特征,免疫组化检测细胞角蛋白(CK14)、肿瘤相关蛋白视网膜母细胞瘤抑制蛋白(RB)、P53、上皮钙黏素(E-cadherin)、P21、同源性磷酸酶-张力蛋白(PTEN)表达情况,PCR检测人乳头瘤病毒(HPV)携带情况。基因组DNA短串联重复序列(STR)分析鉴定细胞系身份。结果人BMSCC细胞系SCC117已在体外连续传代培养超过150代。SCC117细胞呈多角形镶嵌状生长,失去接触抑制,电镜观察可见典型的细胞桥粒结构及张力原纤维。免疫组化显示,SCC117细胞CK14阳性,倍增时间为40.16 h。染色体众数集中在67~69条之间,为亚三倍体。接种SCC117细胞的4只裸鼠均成瘤,SCC117细胞系具有异种致瘤能力,HE染色显示,裸鼠移植瘤与人原发肿瘤组织的病理组织学类型一致,均为鳞状细胞癌。免疫组化结果显示,人原发肿瘤及裸鼠移植瘤组织中RB、P53、E-cadherin均为阳性,P21弱阳性,PTEN阴性。PCR结果显示,SCC117细胞系的HPV检测为阴性。STR序列分析结果显示,SCC117细胞系来源于原发肿瘤组织,未被其他细胞系交叉污染。结论本研究成功建立中国人BMSCC细胞系SCC117,可为无HPV感染的口腔鳞状细胞癌尤其是BMSCC的研究提供新的实验模型。

关键词：癌,鳞状细胞头颈部鳞状细胞癌颊黏膜细胞系原代培养短串联重复序列人乳头瘤病毒阴性

黄连提取物对小鼠溃疡性结肠炎的保护作用以及对肠道菌群的影响

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饲料研究 2024年

作者：汤赛琳林秀莲岳美杉曾建国山西农业大学动物医学学院中兽医药现代化山西省重点实验室湘产大宗药材品质评价湖南省重点实验室湖南农业大学动物医学院中兽药湖南省重点实验室

【目的】研究黄连提取物（Coptis chinensis extract，CCE）对葡聚糖硫酸钠（DSS）诱导的小鼠溃疡性结肠炎（UC）的防治作用，为黄连配方颗粒生产剩余物的兽用中药综合利用开发奠定了基础。【方法】选择60只C57BL/6小鼠，随机分成6组，... 详细信息

【目的】研究黄连提取物（Coptis chinensis extract，CCE）对葡聚糖硫酸钠（DSS）诱导的小鼠溃疡性结肠炎（UC）的防治作用，为黄连配方颗粒生产剩余物的兽用中药综合利用开发奠定了基础。【方法】选择60只C57BL/6小鼠，随机分成6组，即对照组（CON）组、DSS模型组、美沙拉嗪（MES）阳性对照组（200mg/kg）及CEE低（CEE-L，600 mg/kg）、中（CEE-M，1000 mg/kg）、高（CEE-H，1400 mg/kg）剂量组，试验期 14d。通过小鼠的体重增长率、疾病活动指数（DAI）、结肠长度及组织病理学等指标评价CCE对DSS诱导的小鼠结肠炎模型的治疗效果。使用实时荧光定量PCR检测结肠组织中白细胞介素1β（IL-1β）、白细胞介素6（IL-6）、肿瘤坏死因子α（TNF-α）的表达水平；通过分析16S rRNA测序结果评价CCE对肠道菌群的影响；【结果】（1）与DSS组相比，CCE组极显著抑制了UC小鼠的体重降低（P<0.01）、DAI评分升高（P<0.01）和结肠长度的缩短（P<0.01）。（2）CEE组改善了UC小鼠结肠组织病理损伤的情况，炎性细胞浸润减少，肠绒毛和隐窝结构有所恢复。（3）与DSS组相比，CEE组极显著下调了结肠中IL-1β、IL-6和TNF-α mRNA的表达水平（P<0.01）。（4）与DSS组相比，在门水平方面，CEE组明显降低了变形菌门、弯曲菌门的相对丰度，CEE-L、M组明显增加了疣微菌门的相对丰度，CEE-M、H组明显增加了拟杆菌门、脱硫杆菌门的相对丰度；在属水平方面，CEE-M、H组明显降低了大肠杆菌志贺菌属的相对丰度，CEE-L、M组明显升高了阿克曼氏菌属的相对丰度。【结论】CCE可通过抑制炎症因子表达和维持肠道菌群稳态发挥对UC的预防保护作用。

关键词：黄连提取物小鼠溃疡性结肠炎肠道菌群

中国地鼠口腔颊囊鳞癌组织的非靶代谢组学分析

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实用口腔医学杂志 2024年第5期40卷 608-613页

作者：张锐虎王渊续国强高继萍宋国华陈朝阳轩瑞晶实验动物与人类疾病动物模型山西省重点实验室山西医科大学实验动物中心太原030001 山西医科大学基础医学院微生物与免疫学教研室

目的:探讨口腔鳞状细胞癌(OSCC)发病的代谢基础及相关分子机制。方法:将20只中国地鼠分为模型组和对照组(n=10),采用化学诱导法建立颊囊黏膜鳞癌模型;色谱-质谱联用鉴定2组鼠颊囊的代谢物,以正交偏最小二乘判别分析模型的变量权重值>1和... 详细信息

目的:探讨口腔鳞状细胞癌(OSCC)发病的代谢基础及相关分子机制。方法:将20只中国地鼠分为模型组和对照组(n=10),采用化学诱导法建立颊囊黏膜鳞癌模型;色谱-质谱联用鉴定2组鼠颊囊的代谢物,以正交偏最小二乘判别分析模型的变量权重值>1和P<0.05为标准,筛选两组样本中的差异代谢物,进行KEGG通路富集分析。结果:二甲基苯并蒽-石蜡油溶液涂抹18周,模型组地鼠颊囊有弥漫性白斑分布、乳头状突起明显,病理学诊断为高分化鳞癌;脂类和类脂质分子是癌变组织和正常组织的主要差异代谢物;不饱和脂肪酸生物合成重编程、胆固醇积累、色氨酸分解代谢增强、天冬氨酸上调、嘧啶和嘌呤合成增加等是OSCC发生发展中的重要代谢特征。结论:靶向相关代谢途径的分子干预,有望抑制OSCC发病和进展。

关键词：中国地鼠口腔颊囊鳞癌组织非靶代谢组

基于多模态多示例学习的免疫介导性肾小球疾病自动分类方法

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南方医科大学学报 2024年第3期44卷 585-593页

作者：龙楷兴翁丹仪耿舰路艳蒙周志涛曹蕾南方医科大学生物医学工程学院//广东省医学图像处理重点实验室//广东省医学成像与诊断技术工程实验室广东广州510515 南方医科大学基础医学院广东广州510515 南方医科大学中心实验室广东广州510515 广州华银医学检验中心广东广州510515

目的探讨如何利用多模态深度学习方法,联合光学显微镜(OM)、免疫荧光显微镜(IM)及透射电子显微镜(TEM)对应的3种图像进行免疫介导性肾小球疾病分类。方法基于273例患者的病理图像进行回顾性研究,构建多模态多示例模型对3种免疫介导性的... 详细信息

目的探讨如何利用多模态深度学习方法,联合光学显微镜(OM)、免疫荧光显微镜(IM)及透射电子显微镜(TEM)对应的3种图像进行免疫介导性肾小球疾病分类。方法基于273例患者的病理图像进行回顾性研究,构建多模态多示例模型对3种免疫介导性的肾小球疾病——免疫球蛋白A肾病(IgAN)、膜性肾病(MN)、狼疮性肾炎(LN)进行分类。该模型采用示例水平的多示例学习(I-MIL)方法挑选患者的TEM图像并与同一患者的OM图像和IM图像进行多模态特征融合。通过该模型与单模态、双模态模型的比较,探究3种模态之间的不同组合形式以及模态特征融合方式的特性。结果联合OM、IM以及TEM图像建立的多模态多示例模型准确率为(88.34±2.12)%,优于准确率为(87.08±4.25)%的最优的单模态模型,以及准确率为(87.92±3.06)%的最优的双模态模型。结论本研究成功建立基于OM、IM及TEM三种模态图像的多模态多示例模型,并验证了采用多示例学习结合多模态学习方法对免疫介导性肾小球疾病分类的有效性。

关键词：肾活检病理肾小球疾病深度学习多模态融合多示例学习

神经管闭合的新见解:叶酸不应答型神经管畸形

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中国生物化学与分子生物学报 2024年第5期40卷 575-587页

作者：任文彬李建婷解军山西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室出生缺陷与细胞再生山西省重点实验室太原030001 山西医科大学煤炭环境致病与防治教育部重点实验室太原030001

神经管畸形(neural tube defects,NTDs)是一种常见的、严重且复杂的先天性畸形,是遗传、营养和环境因素相互作用的结果。母体妊娠期补充叶酸(folic acid,FA)已被证明是一种非常有效的策略,常用于部分NTDs的初级预防。然而,仍有一部分NTD... 详细信息

神经管畸形(neural tube defects,NTDs)是一种常见的、严重且复杂的先天性畸形,是遗传、营养和环境因素相互作用的结果。母体妊娠期补充叶酸(folic acid,FA)已被证明是一种非常有效的策略,常用于部分NTDs的初级预防。然而,仍有一部分NTDs病例对FA治疗具有抵抗性,称为“FA不应答型NTDs”或“FA抵抗型NTDs”。FA不应答型NTDs的病因复杂,涉及遗传、营养、环境及母体相关因素。本文综述了叶酸不应答型NTDs的相关遗传、营养、环境及母体等风险因素,并揭示了其致病机制的研究进展。其中,遗传因素主要从小鼠突变体及品系、叶酸一碳代谢基因、关键凋亡基因三方面展开阐述,为该类患儿的产前诊断提供了可能的遗传检测位点。营养因素方面,本文主要聚焦目前已报道的肌醇和蛋氨酸,解释其对该种疾病潜在的干预机制,为NTDs患者早期营养干预提供新方向。此外,本文还探讨了叶酸一碳代谢中的辅助因子-维生素B12参与叶酸不应答型NTDs发生的可能机制,增加叶酸联合其他维生素治疗出生缺陷的可能性。最后,本文还综述了环境因素和母体因素在叶酸不应答型NTDs中的研究进展,为高危人群提供孕早期健康指导。总之,本文综述了叶酸不应答型NTDs的相关风险因素及其致病机制的研究进展,为当下该种疾病及同类型出生缺陷的防治提供新的见解。

关键词：神经管畸形肌醇小鼠模型叶酸卷尾

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吉林大学学报（医学版） 2024年第4期50卷 1062-1075页

作者：黎金连黄岚珍黄希仕李康智蒋佳丽张苗苗吴群英桂林医学院智能医学与生物技术学院细胞与遗传学教研室广西桂林541004 南宁中心血站输血传播疾病联合实验室广西南宁530007 桂林医学院科学实验中心广西桂林541004 桂林医学院全科医学院广西桂林541004

目的:利用生物信息学分析方法筛选与肝细胞癌(HCC)患者预后、诊断和免疫细胞浸润相关的关键基因,并分析其潜在治疗药物。方法:从基因表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载HCC基因表达谱数据及相应的HCC患者临床信息。采... 详细信息

目的:利用生物信息学分析方法筛选与肝细胞癌(HCC)患者预后、诊断和免疫细胞浸润相关的关键基因,并分析其潜在治疗药物。方法:从基因表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载HCC基因表达谱数据及相应的HCC患者临床信息。采用R软件limma包筛选HCC差异表达基因(DEGs),对DEGs进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,利用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,使用Cytoscape软件对PPI网络进行可视化并筛选关键基因。通过Kaplan-Meier生存曲线和LASSO回归算法鉴定HCC预后相关关键基因,并利用外部数据集对其表达进行验证和诊断效能分析。采用CIBERSORT算法评估预后相关的关键基因表达与HCC免疫细胞浸润的关系。利用MiRNet和Network Analyst数据库分别构建微小RNA(miRNA)-关键基因mRNA和转录因子(TFs)-关键基因mRNA分子调控网络。利用CMap数据库筛选潜在治疗HCC的小分子药物。结果:共筛选出146个DEGs,其中表达上调基因30个,表达下调基因116个。GO功能和KEGG信号通路富集分析,DEGs明显富集在类固醇、烯化合物和激素代谢等生物过程(BP)及视黄醇代谢、药物代谢-细胞色素P450(CYP450)、补体和凝血级联反应等信号通路。PPI网络分析筛选得到14个关键基因,其中甲酰氨基转移酶环化脱氨酶(FTCD)、分泌型磷蛋白2(SPP2)、凝血酶-抗凝血酶复合物(TAT)、补体C6(C6)和CYP450家族成员2C9(CYP2C9)与HCC患者预后、临床病理分期和组织学分级有明显相关性,在HCC诊断中具有较高的诊断效能,与HCC的免疫细胞浸润有密切关联。Hsa-mir-182-5p、同源框CUT样蛋白1(CUX1)、早期生长反应1(EGR1)、SMAD家族成员4(SMAD4)和肿瘤蛋白P53(TP53)是靶向上述预后相关关键基因的重要调控因子。DL-硫沙芬(DL-thiorphan)、异丙嗪(promethazine)和芹菜素(apigenin)可能对HCC有治疗作用。结论:FTCD、SPP2、TAT、C6和CYP2C9可能是HCC诊断、预后判断和治疗的潜在靶点,预测得到的3种小分子药物DL-thiorphan,promethazine和apigenin可为HCC治疗药物的研发提供参考。

关键词：肝细胞癌生物标志物小分子药物生物信息学

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肺泡灌洗液外泌体表皮生长因子受体基因突变检测对晚期非小细胞肺癌患者的临床意义

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实用医学杂志 2024年第1期40卷 48-52页

作者：杨昌恒陈颖张中元马庆庆贵州航天医院呼吸与危重症医学科贵州遵义563000 贵州航天医院中心实验室贵州遵义563000

目的通过对比分析晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者支气管肺泡灌洗液(BALF)外泌体、血液和肺癌组织3种标本表皮生长因子受体(EGFR)基因突变情况,评估支气管肺泡灌洗液外泌体标本是否适合应用于临床靶向治疗前的患者筛检,为晚期NSCLC患者尽... 详细信息

目的通过对比分析晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者支气管肺泡灌洗液(BALF)外泌体、血液和肺癌组织3种标本表皮生长因子受体(EGFR)基因突变情况,评估支气管肺泡灌洗液外泌体标本是否适合应用于临床靶向治疗前的患者筛检,为晚期NSCLC患者尽早个体化治疗提供新的思路和筛检方法。方法回顾性分析2021年5月至2023年5月贵州航天医院呼吸与危重症医学科78例晚期NSCLC患者利用扩增阻滞突变系统法(ARMS)检测支气管泡灌洗液外泌体、血液、肺癌组织标本EGFR基因突变的结果并以肺癌组织标本结果为标准进行相互比较。结果支气管肺泡灌洗液外泌体、血液、肺癌组织标本分别检出EGFR突变型33、25、38例,EGFR基因野生型分别42、53、40例,检测突变率分别为42.3%(33/78)、32.1%(25/78)、48.7%(38/78)。支气管肺泡灌洗液检测无结果3例,假阴性率6.4%(5/78),血液检测假阴性率16.7%(13/78)。支气管肺泡灌洗液外泌体标本EGFR基因突变的检测符合率86.8%(33/38),血液标本检测符合率65.8%(25/38)。结论支气管肺泡灌洗液外泌体标本检测EGFR基因突变与血液、肺癌组织标本检测具有一致性(P>0.05),优于血液标本,适用于临床靶向治疗前的患者筛选,为晚期NSCLC患者尽早个体化治疗决策提供了新的思路和筛检方法。

关键词：外泌体表皮生长因子受体扩增阻滞突变系统晚期非小细胞肺癌肺泡灌洗液

新型冠状病毒感染与2型糖尿病共病联系的生物信息学分析

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病毒学报 2024年第1期40卷 65-79页

作者：黄泰于琦穆俊芳刘格良薛丹阳陈浩然常敏静贺培风山西医科大学临床决策研究大数据山西省重点实验室晋中030600 山西医科大学基础医学院晋中030600 山西医科大学管理学院晋中030600

本文基于转录组数据研究了新型冠状病毒感染(Coronavirus disease 2019,COVID-19)和2型糖尿病(Type 2diabetes,T2D)的相互作用机制,寻找疾病的潜在功能模块,为其治疗提供新思路。本文收集了来自GEO(Gene expression omnibus)数据库的10... 详细信息

本文基于转录组数据研究了新型冠状病毒感染(Coronavirus disease 2019,COVID-19)和2型糖尿病(Type 2diabetes,T2D)的相互作用机制,寻找疾病的潜在功能模块,为其治疗提供新思路。本文收集了来自GEO(Gene expression omnibus)数据库的10个COVID-19和T2D基因表达谱数据集,并按照4:6的比例分为训练集和验证集,并进行差异表达基因(Differential expression genes,DEGs)的富集分析和构建蛋白质相互作用(Protein-protein interaction,PPI)网络进行模块化分析,找到了与COVID-19和T2D最紧密相关的关键基因和蛋白质特征模块。基于各组织的DEGs交集结果,本文发现43个共有DEGs,并确定了5个关键基因(HSP90AA1、SRC、EGFR、MAPK3、CDK1),其中CDK1表现出最高的网络连接性。通过XGBoost等6种机器学习算法进行性能检验显示了关键基因对诊断COVID-19和T2D的潜在价值,并通过qPCR实验证实了关键基因在COVID-19患者和正常对照组PBMC中的表达差异。此外,本文基于模块划分算法得到了PPI网络的6个潜在功能模块,这些模块主要与糖类、脂类代谢和细胞复制相关联。最后,本文建立了miRNA-TF-mRNA调控网络,并筛选出TP53和NFIC作为调节共有基因转录的枢纽转录因子(Transcription factor,TF)。总之,本文分析了COVID-19和T2D之间共有的表达特征、生物学通路和调控因子,并探索了基因在转录和翻译中的复杂相互作用,为未来COVID-19和T2D的治疗提供了新思路。

关键词：生物信息学新冠疫情二型糖尿病基因表达谱炎症

利用串联的Staudinger/aza-Wittig/芳构化反应合成1,2,4-三取代咪唑衍生物

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有机化学 2024年第2期44卷 525-532页

作者：解海张雅丽秦秀婷谷永新山西大同大学化学与化工学院化学传感山西省重点实验室山西大同037009

报道了一种合成1,2,4-三取代咪唑衍生物的方法,即通过含有烯基叠氮基的苯甲酰胺衍生物为关键中间体,用三苯基膦处理,发生串联的Staudinger/aza-Wittig/芳构化反应,合成得到1,2,4-三取代咪唑衍生物.该反应具有原料廉价易得,反应条件温和... 详细信息

报道了一种合成1,2,4-三取代咪唑衍生物的方法,即通过含有烯基叠氮基的苯甲酰胺衍生物为关键中间体,用三苯基膦处理,发生串联的Staudinger/aza-Wittig/芳构化反应,合成得到1,2,4-三取代咪唑衍生物.该反应具有原料廉价易得,反应条件温和,无需使用金属催化剂,操作简便的特点,这是一种理想、高效的1,2,4-三取代咪唑杂环化合物的合成策略.

关键词： Staudinger反应 aza-Wittig反应芳构化反应 1,2,4-三取代咪唑