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乳源凝固酶阴性葡萄球菌的PFGE分型及耐药性研究

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中国食品学报 2016年第9期16卷 33-41页

作者：许女史改玲陈旭峰李雅茹杜立红王俊东山西省生态畜牧与环境兽医学重点实验室山西农业大学山西太谷030801 山西农业大学食品科学与工程学院山西农业大学山西太谷030801

对分离自隐性乳房炎乳样中的25株凝固酶阴性葡萄球菌（CNS）进行脉冲场凝胶电泳（PFGE）分型，结果表明不同牛场流行的CNS种类和基因型有所不同，即使来自同一牛场的相同菌种也表现出完全不同的流行克隆型．证明了菌种基因型的多样性。... 详细信息

对分离自隐性乳房炎乳样中的25株凝固酶阴性葡萄球菌（CNS）进行脉冲场凝胶电泳（PFGE）分型，结果表明不同牛场流行的CNS种类和基因型有所不同，即使来自同一牛场的相同菌种也表现出完全不同的流行克隆型．证明了菌种基因型的多样性。MIC测定结果显示所有菌株都表现出三重以上耐药，且耐药程度高（36％～96％）。携带最多的耐药基因是ermC（96．55％）和tetK（89．66％）基因，然后是ermB（82．76％），tetM（82．76％），msrA（86．21％），msrB（82．76％）和lnuA（72．41％）基因，mph的基因含量最少，为41.38％。另外，本文还检测出4株恍cA基因阳性菌株，即超级耐药菌-***和刚果红试验结果显示88％的菌株都具有产生物被膜的能力。并且其多重耐药性显著高于不产生物被膜的菌株。综上所述，目前，乳源及食品动物源细菌耐药形式极其严峻，多重耐药菌及耐药基因的传播，给食品安全及公众健康造成了巨大风险，急需出台一系列的用药规定,加大科研力度，研究安全、绿色、高效新药物。

关键词：凝固酶阴性葡萄球菌 PFGE 耐药

长期秸秆还田配施有机肥对土壤有机碳组分和孔隙结构的影响

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农业工程学报 2024年第21期40卷 74-81页

作者：温云杰张建诚杨娜王秀红史向远王娟玲山西农业大学山西有机旱作农业研究院太原030031 山西农业大学棉花研究所运城044000 山西农业大学有机旱作农业国家重点实验室(筹) 太原030031

为探明长期施用有机肥和秸秆还田对土壤孔隙结构的影响,以及土壤有机碳与土壤孔隙结构之间的关系。该研究基于山西省运城市水头试验基地开展的16 a田间定位试验,设置单施化肥(F)、有机肥+化肥(MF)、秸秆还田+化肥(SF)以及有机肥+秸秆还... 详细信息

为探明长期施用有机肥和秸秆还田对土壤孔隙结构的影响,以及土壤有机碳与土壤孔隙结构之间的关系。该研究基于山西省运城市水头试验基地开展的16 a田间定位试验,设置单施化肥(F)、有机肥+化肥(MF)、秸秆还田+化肥(SF)以及有机肥+秸秆还田+化肥(MSF)4个处理,分别对土壤孔隙结构、有机碳和其物理组分、土壤有机碳分子结构进行定量分析。结果表明:与F处理相比,其余有机物料处理均提高了土壤总孔隙度和>0.50 mm孔径的孔隙度(P0.05);并且与F处理相比,MSF处理显著提高了土壤孔隙的连通性和复杂程度(P0.50 mm孔径的孔隙度、孔隙的连通性和复杂程度与土壤总有机碳和各有机碳组分含量以及多糖和脂肪类有机碳呈显著的正相关关系(P<0.05)。可见,秸秆还田配施有机肥提高了土壤有机碳含量,有利于脂肪和多糖类有机碳的累积,能够促进土壤孔隙形成,改善孔隙结构。

关键词：土壤孔隙有机碳分子结构 CT扫描

红苋R104种子谷蛋白亚基组成及二硫键连接蛋白研究

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西北农业大学学报 1996年第3期24卷 5-9页

作者：宋宏新汪沛洪西北农业大学生化研究室

应用还原和非还原单向ＳＤＳ－ＰＡＧＥ及二者结合的双向电泳技术，研究了红苋Ｒ１０４种子谷蛋白的亚基组成。谷蛋白由多种亚基组成，高分子量二硫键连接蛋白占其多数，经还原裂解成Ａ（５４ＫＤ）、Ｂ（４０ＫＤ，３９ＫＤ）、Ｃ（３... 详细信息

应用还原和非还原单向ＳＤＳ－ＰＡＧＥ及二者结合的双向电泳技术，研究了红苋Ｒ１０４种子谷蛋白的亚基组成。谷蛋白由多种亚基组成，高分子量二硫键连接蛋白占其多数，经还原裂解成Ａ（５４ＫＤ）、Ｂ（４０ＫＤ，３９ＫＤ）、Ｃ（３３ＫＤ，３１ＫＤ）、Ｄ（２２ＫＤ，２０ＫＤ，１８ＫＤ，）和Ｅ（１５ＫＤ）５组主要单肽链单元，提出了二硫键连接蛋白的组成模式。

关键词：籽粒苋谷蛋白双向电泳二硫键连接蛋白

用GGE双标图及隶属函数综合分析山西小麦地方品种抗旱性

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应用生态学报 2013年第4期24卷 1031-1038页

作者：杨进文朱俊刚王曙光孙黛珍史雨刚陈卫国山西农业大学农学院山西太谷030801 山西农业大学生命科学学院山西太谷030801

以7个山西小麦地方品种和2个对照品种为试材,测定了其在大田正常供水及水分胁迫条件下的形态和生理指标,并计算各指标性状抗旱系数;再利用GGE双标图在主成分分析的基础上,分析各指标性状间的相关性及其与品种抗旱性的关系;最后利用隶属... 详细信息

以7个山西小麦地方品种和2个对照品种为试材,测定了其在大田正常供水及水分胁迫条件下的形态和生理指标,并计算各指标性状抗旱系数;再利用GGE双标图在主成分分析的基础上,分析各指标性状间的相关性及其与品种抗旱性的关系;最后利用隶属函数与抗旱指数相结合的方法对小麦品种的抗旱性进行综合评价.结果表明:影响小麦品种抗旱性的主要形态及生理指标包括穗下节长、株高、节间长、叶面积、过氧化物酶(POD)、超氧化物歧化酶(SOD)、叶片相对含水量(RWC)和相对电导率;各单项抗旱指标间存在不同程度的相关性,各指标对不同品种抗旱性的影响不同,这是造成小麦品种抗旱性差异的主要原因.依据抗旱性可将参试品种划分为3类,即抗旱型、中间型和敏感型,从中选出两个高抗旱小麦地方品种白和尚头和竹杆青,其抗旱性与对照抗旱型品种晋麦47相似,可作为小麦抗旱育种的亲本材料.

关键词：小麦抗旱性 GGE双标图抗旱系数隶属函数

中华蜜蜂气味结合蛋白AcerOBP7的表达及结合特性

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中国农业科学 2022年第3期55卷 613-624页

作者：赵慧婷彭竹姜玉锁赵淑果黄丽杜亚丽郭丽娜山西农业大学生命科学学院山西农业大学动物科学学院

【目的】中华蜜蜂(Apis cerana cerana，简称中蜂)是我国本土蜂种，也是重要的传粉昆虫和经济昆虫。气味结合蛋白(odorant binding protein,OBP)是蜜蜂嗅觉感知中的关键蛋白。在前人对中蜂AcerOBP7基因序列特征分析的基础上，本研究进... 详细信息

【目的】中华蜜蜂(Apis cerana cerana，简称中蜂)是我国本土蜂种，也是重要的传粉昆虫和经济昆虫。气味结合蛋白(odorant binding protein,OBP)是蜜蜂嗅觉感知中的关键蛋白。在前人对中蜂AcerOBP7基因序列特征分析的基础上，本研究进一步对其表达特性及与气味物质的结合能力进行探究，为揭示气味结合蛋白在中蜂嗅觉系统中的作用提供基础数据。【方法】采用qRT-PCR检测AcerOBP7在工蜂不同组织和发育阶段的表达特性；通过原核表达系统获得AcerOBP7融合蛋白，使用Ni-NTA柱进行蛋白纯化；采用荧光竞争结合法，以1-NPN(N-phenyl-1-naphthylamine)为荧光探针，测定AcerOBP7与信息素及植物挥发物的结合能力；设计并合成ds AcerOBP7，采用饲喂法对该基因进行沉默，通过qRT-PCR测定沉默效率；结合RNAi，利用EAG检测并比较对照组与干扰组中蜜蜂触角对待测物质反应值的差异。【结果】qRT-PCR结果显示，AcerOBP7mRNA在工蜂触角中的表达量极显著高于其他组织(P<0.01)，且在20日龄时表达量最高，在1日龄时表达量最低。成功构建了pET28a/AcerOBP7表达载体，通过大肠杆菌原核表达系统获得了高纯度的重组蛋白。与37种配体分子的荧光竞争结合试验表明，AcerOBP7与9-ODA、1-壬醇结合能力最强，Ki值均为1.85μmol·L-1，其次与(+)-柠檬烯、1-辛烯-3-醇、芳樟醇、反式肉桂酸乙酯、桉树脑、(+)-3-蒈烯及壬醛有较强的结合活性，Ki值分别为1.87、2.66、2.72、3.05、3.88、4.14和4.40μmol·L-1，与所选择的幼虫信息素均无结合能力。使用饲喂dsRNA的方法成功干扰了AcerOBP7的表达，干扰效率最高可达70.63%。干扰后的EAG试验表明，中蜂触角对所测气味物质的反应强度均有所下降，其中1-辛烯-3-醇、壬醛、桉树脑和9-ODA的EAG相对值显著降低(P<0.05)。【结论】AcerOBP7在中蜂采集蜂触角中高表达，重组蛋白能与多种气味分子结合，表明AcerOBP7是一种广谱型结合蛋白，推测其可能在工蜂采集和哺育蜂王的行为中发挥着重要作用。另外，1-辛烯-3-醇、壬醛、桉树脑和9-ODA可能是AcerOBP7结合特异性较高的配体物质。

关键词：中华蜜蜂气味结合蛋白表达模式蛋白纯化结合特性

利用WGCNA鉴定非生物胁迫相关基因共表达网络

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作物学报 2019年第9期45卷 1349-1364,I0001-I0015页

作者：李旭凯李任建张宝俊山西农业大学生命科学学院山西太谷030801 山西农业大学农学院山西太谷030801

加权共表达网络分析(Weighted Gene Co-expression Network Analysis,WGCNA)是用来描述不同样品之间基因关联模式的系统生物学方法,可以用来鉴定高度协同变化的基因集。本研究利用正常水稻组织共47份转录组数据,通过冷胁迫、干旱胁迫、... 详细信息

加权共表达网络分析(Weighted Gene Co-expression Network Analysis,WGCNA)是用来描述不同样品之间基因关联模式的系统生物学方法,可以用来鉴定高度协同变化的基因集。本研究利用正常水稻组织共47份转录组数据,通过冷胁迫、干旱胁迫、盐胁迫不同的处理方式,使用WGCNA方法,根据已克隆基因的报道与以上3种胁迫相关的关键基因,探究不同逆境下基因之间的调控关系。通过对低表达量基因的过滤,最终利用筛选的30,339个表达的基因来构建共表达矩阵,得到15个模块。分析发现已知的水稻3种相关基因在各个模块均有存在,于是对预测到的靶基因进行GO 富集分析。对3种胁迫下处理的转录组数据进行差异表达基因分析,结合已报道与胁迫相关的基因,选取各胁迫相关的2个模块进行了基因调控网络的构建。鉴于3种胁迫相关基因在green模块中大量分布,通过对green模块下各自特有的基因和共有的基因的GO功能富集分析,并对共有的基因构建调控网络,挖掘到2599个与3种胁迫都相关的基因,并预测出25个抗逆相关的关键基因,为水稻的抗逆及综合抗逆能力等研究提供了新思路。

关键词：水稻干旱胁迫冷胁迫盐胁迫权重基因共表达网络(WGCNA)

黄土丘陵区县域耕地时空格局变化及驱动因素分析——以天水市武山县为例

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国土与自然资源研究 2025年第1期 8-13页

作者：白永刚刘学录刘星雨甘肃农业大学资源与环境学院甘肃兰州730070 甘肃农业大学林学院甘肃兰州730070

以黄土丘陵区武山县为研究对象,基于土地利用数据,运用变化轨迹分析法、面积加权平均差椭圆和景观格局指数以及土地利用预测模型,探究1990-2018年武山县耕地格局变化特征,判断各要素对其变化的重要程度。结果显示,(1)3个研究时段武山县... 详细信息

以黄土丘陵区武山县为研究对象,基于土地利用数据,运用变化轨迹分析法、面积加权平均差椭圆和景观格局指数以及土地利用预测模型,探究1990-2018年武山县耕地格局变化特征,判断各要素对其变化的重要程度。结果显示,(1)3个研究时段武山县耕地面积总体呈减少趋势,耕地重心不同时段存在差异,耕地重心先向西南转移再向东南转移。(2)3个研究时段武山县耕地变化都具有减少补充的基本特征,2000年前速率缓慢,2000年后速率加快,耕地减少面积比补充面积多,耕地减少以城关镇和洛门镇为主。(3)3个研究时段武山县耕地图斑呈现出破碎化现象,破碎化程度加剧。(4)3个研究时段武山县耕地发生变化的主要原因可以归纳为政策影响、自然环境因子影响、空间距离要素的影响,而受地理空间要素影响较小。综上,武山县耕地在28年间变化明显,武山县需要贯彻耕地保护政策和可持续发展理念,合理利用耕地。

关键词：耕地格局变化景观格局指数驱动要素武山县

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甘薯IbKFB互作蛋白的筛选及分析

植物生理学报 2023年第10期59卷 1890-1898页

作者：常璐董海涛赵彩良张红梅武小平吕运韬贾小云唐锐敏贺立恒山西农业大学生命科学学院山西晋中030801 山西农业大学农学院山西晋中030801 山西农业大学玉米研究所山西忻州034000

甘薯(Ipomoea batatas)是一种极为重要的粮食、饲料和工业原料类块根作物。与普通甘薯相比,紫心甘薯块根中富含花青素,已成为当前功能性食品开发的热点作物。本课题组前期通过不同薯肉颜色的甘薯块根的小RNA、降解组和转录组测序以及靶... 详细信息

甘薯(Ipomoea batatas)是一种极为重要的粮食、饲料和工业原料类块根作物。与普通甘薯相比,紫心甘薯块根中富含花青素,已成为当前功能性食品开发的热点作物。本课题组前期通过不同薯肉颜色的甘薯块根的小RNA、降解组和转录组测序以及靶向代谢组联合分析发现,Ib-miRNA2111及其候选靶基因(IbKFB)可能参与花青素生物合成调控。为了深入探究IbKFB在甘薯花青素生物合成过程中的功能和调控机理,本研究克隆了IbKFB基因,构建IbKFB的酵母双杂诱饵载体pGBKT7-IbKFB,采用酵母双杂交(Y2H)技术从甘薯cDNA文库中筛选出21个与IbKFB相互作用的候选蛋白。通过对这些蛋白进行功能注释和分析,鉴定出5个注释与花青素生物合成相关的候选蛋白,分别为IbPAL、IbSAUR50、IbERF、IbWDR11和IbGAPCp1。进一步利用Y2H回转实验和双分子荧光互补实验(BiFC)验证了IbKFB与候选蛋白相互作用的真实性。本研究可丰富甘薯花青素生物合成的分子调控网络和植物地下器官花青素代谢调控机制的认识,为花青素生物强化专用型甘薯新种质的创制提供分子理论基础和基因资源。

关键词：甘薯花青素 IbKFB 互作蛋白

褐土全氮含量Vis/NIRS组合预测模型的构建

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光谱学与光谱分析 2024年第8期44卷 2310-2317页

作者：张秀全马世兴李志伟郑德聪宋海燕山西农业大学农业工程学院山西太谷030801 山西农业大学信息科学与工程学院山西太谷030801

准确掌握农田土壤全氮含量对于评估土壤肥力,合理施用氮肥具有重要意义。为综合利用各个单预测模型的优势,提升整体预测性能、降低模型方差,提高鲁棒性,以农田褐土土壤为研究对象,基于近红外-可见光高光谱数据,提出了一种基于标准差的... 详细信息

准确掌握农田土壤全氮含量对于评估土壤肥力,合理施用氮肥具有重要意义。为综合利用各个单预测模型的优势,提升整体预测性能、降低模型方差,提高鲁棒性,以农田褐土土壤为研究对象,基于近红外-可见光高光谱数据,提出了一种基于标准差的预测有效度组合预测模型(CPM),用于预测土壤全氮含量。对原高光谱数据采用Savitzky-Golay平滑和一阶微分变换,采用树模型进行特征波段提取,利用决策树回归(DTR)(模型1)、高斯核回归(GKR)(模型2)、随机森林回归(RF)(模型3)、LASSO回归(模型4)、多层感知器回归(MLP)(模型5)5个单预测模型,通过单预测模型的线性组合建立组合预测模型。结果表明:(1)通过广义简约梯度优化算法求得组合预测模型中5个单预测模型的权重分别为ω_(1)*=0.407,ω_(2)*=0.378,ω_(30*=0.215,ω_(4)*=0,ω_(5)*=0;(2)对于所有数据,基于5种单预测模型和组合预测模型对土壤全氮含量预测的预测有效度分别为M_(1)=0.855,M_(2)=0.856,M_(3)=0.847,M_(4)=0.785,M_(5)=0.796,M_(CPM)=0.880;与单模型预测有效度最大值相比,组合预测模型预测有效度提高了2.924%;(3)对于所有数据,基于5种单预测模型和组合预测模型对土壤全氮含量预测的预测精度和标准差分别为E(A_(1))=0.924,σ(A_(1))=0.075,E(A_(2))=0.928,σ(A_(2))=0.077,E(A_(3))=0.923,σ(A_(3))=0.082,E(A_(4))=0.882,σ(A_(4))=0.109,E(A_(5))=0.889,σ(A_(5))=0.104,E(A_(CPM))=0.937,σ(A_(CPM))=0.066,与单模型预测精度最大值相比,组合预测模型预测精度提高了0.970%,模型稳定性提高了12.000%,且为优性组合预测。组合预测模型可用于可见光-近红外光谱数据的农田褐土土壤全氮含量的有效估测,可为农田土壤全氮含量的快速监测提供依据和参考。

关键词：可见光-近红外高光谱预测全氮含量组合预测模型