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基于基因组学数据的缺血性脑卒中免疫分子标志物的鉴定

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中华疾病控制杂志 2024年第6期28卷 664-671页

作者：张文婧徐雅琪黄一铭王凤琳王爱民王清华石福艳潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室潍坊261053

目的基于基因组学数据,探索缺血性脑卒中免疫相关分子标志物,为缺血性脑卒中的预防和临床治疗提供理论依据。方法选取基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中GSE16561和GSE58294两个数据,对缺血性脑卒中相关免疫分子标志物... 详细信息

目的基于基因组学数据,探索缺血性脑卒中免疫相关分子标志物,为缺血性脑卒中的预防和临床治疗提供理论依据。方法选取基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中GSE16561和GSE58294两个数据,对缺血性脑卒中相关免疫分子标志物进行分析和探索。基于免疫学数据库和分析网站(the immunology database and analysis portal,ImmPort)数据库,获取免疫相关的基因,分析其在缺血性脑卒中组和正常对照组中的差异表达,鉴定差异表达免疫基因(differentially expressed immune genes,DEIGs),并利用蛋白质互作网络(protein-protein interaction,PPI)鉴定免疫相关的关键基因。基于DEIGs进行通路富集分析,发现缺血性脑卒中可能富集的分子信号通路。最后,基于CIBERSORT算法评估22种免疫细胞的浸润丰度,并计算其在缺血性脑卒中组和正常对照组中的差异,以此推断缺血性脑卒中相关的免疫细胞。结果差异分析结果表明37个DEIGs在两组间差异均有统计学意义(均P<0.05),包含缺血性脑卒中样本上调基因31个,下调基因6个。通路分析结果表明鉴定的DEIGs主要富集于免疫相关分子通路上。PPI的分析结果显示,TLR4、TLR2、MMP-9、CCR7、STAT3、TNFSF13B、S100A12、CD19、CAMP和SLC11A1是缺血性脑卒中密切相关的关键免疫基因。CIBERSORT结果表明,与正常对照样本相比较,缺血性脑卒中样本免疫回应细胞的富集水平较低(均P<0.05),而免疫抑制细胞的水平较高(均P<0.05)。结论研究基于转录组表达数据鉴定了缺血性脑卒中相关的免疫基因、免疫信号通路和免疫细胞,从3个分子水平上揭示了与缺血性脑卒中相关的免疫分子标志物,对缺血性脑卒中的有效防控和治疗策略的制定具有重要意义。

关键词：缺血性脑卒中免疫基因信号通路免疫细胞分子标志物组学数据

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布鲁氏菌病合并骨关节炎患者临床特征分析

中华地方病学杂志 2024年第2期43卷 137-140页

作者：王登芹赵会丽张茜茜兰利珍山东省济宁医学院医学综合实训中心济宁272067 山东省济宁医学院临床医学院诊断学教研室济宁272067 山东省济宁市公共卫生医疗中心药剂科济宁272000

目的分析布鲁氏菌病合并骨关节炎患者临床症状及实验室特征。方法回顾性分析2021年1月至2022年12月在山东省济宁市公共卫生医疗中心住院治疗的168例布鲁氏菌病患者的病历资料,并根据影像学检查结果分为合并骨关节炎组和非合并骨关节炎组... 详细信息

目的分析布鲁氏菌病合并骨关节炎患者临床症状及实验室特征。方法回顾性分析2021年1月至2022年12月在山东省济宁市公共卫生医疗中心住院治疗的168例布鲁氏菌病患者的病历资料,并根据影像学检查结果分为合并骨关节炎组和非合并骨关节炎组,比较分析两组患者人口学特征、临床症状和实验室检查结果。结果168例布鲁氏菌病患者中,合并骨关节炎患者组83例、非合并骨关节炎患者组85例,男、女性别比为2.73∶1.00(123∶45),年龄为56(46,64)岁;合并骨关节炎组患者年龄中位数高于非合并骨关节炎组(58岁比53岁,Z=-2.89,P=0.004)。临床症状中,合并骨关节炎组患者腰背痛、乏力、关节肌肉疼痛发生率均高于非合并骨关节炎组[75.9%(63/83)比56.5%(48/85),30.1%(25/83)比15.3%(13/85),47.0%(39/83)比17.6%(15/85),χ^(2)=7.07、5.27、16.58,均P室检查中,合并骨关节炎组红细胞沉降率(ESR)和超敏C-反应蛋白(hs-CRP)均高于非合并骨关节炎组[27.0(17.0,34.0)mm/h比21.0(10.5,34.0)mm/h,22.7(14.3,43.4)mg/L比17.9(10.8,34.2)mg/L,Z=-2.51、-2.00,均P<0.05]。合并骨关节炎组患者中,以合并脊柱炎占比最高(55.4%,46/83),其次是外周关节炎(51.8%,43/83)。结论骨关节炎是布鲁氏菌病常见的并发症,布鲁氏菌病合并骨关节炎患者更易出现腰背痛、乏力、关节肌肉疼痛等临床症状,且ESR和hs-CRP水平均较高。

关键词：布鲁氏菌病骨关节炎临床特征

miR-362-3p调控垂体肿瘤转化基因1抑制口腔鳞状细胞癌侵袭及增殖的研究

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华西口腔医学杂志 2024年第1期42卷 46-55页

作者：丁啸陈嘉雯曲鹏宇孙晨雨李洪利胡温庭范欣潍坊医学院附属医院口腔科潍坊261000 潍坊医学院口腔医学院潍坊261053 潍坊医学院医学研究实验中心潍坊261053

目的探讨垂体肿瘤转化基因1(PTTG1)在miR-362-3p作用下对口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞Cal-27、HN-30侵袭以及增殖能力的影响。方法生物信息学在线数据库查询PTTG1在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达。蛋白质印迹法(Western blot)实验检测PT... 详细信息

目的探讨垂体肿瘤转化基因1(PTTG1)在miR-362-3p作用下对口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞Cal-27、HN-30侵袭以及增殖能力的影响。方法生物信息学在线数据库查询PTTG1在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达。蛋白质印迹法(Western blot)实验检测PTTG1在Cal-27、HN-30以及HOK细胞系中的表达。划痕愈合实验、Transwell侵袭实验及5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷(EdU)细胞增殖实验检测PTTG1对Cal-27、HN-30细胞迁移、侵袭、增殖的影响。生物信息学在线数据库预测PTTG1的上游miRNA,双荧光素酶实验检测结合情况,实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测该miRNA在组织中的表达。结果ENCORI数据库结果显示PTTG1在OSCC组织中表达上调;Western blot实验显示Cal-27、HN-30细胞中PTTG1表达量较HOK细胞中高。转染Si-PTTG1质粒的Cal-27、HN-30细胞的迁移能力、侵袭能力和细胞增殖能力均较对照组降低(P<0.05)。通过网站预测出PTTG1的上游miRNA为miR-362-3p,双荧光素酶实验检测出PTTG1与miR-362-3p存在结合位点;qRT-PCR检测结果显示miR-362-3p在OSCC肿瘤组织中相对于正常组织表达下调(P<0.05);并且敲低miR-362-3p的表达后能够促进敲低PTTG1后的Cal-27、HN-30侵袭和增殖。结论miR-362-3p可通过靶向PTTG1抑制Cal-27、HN-30细胞侵袭、增殖。

关键词：口腔鳞状细胞癌垂体肿瘤转化基因1 微小RNA 侵袭增殖

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重复外周磁刺激治疗慢性肌骨疼痛的研究进展

中国康复医学杂志 2024年第2期39卷 294-299页

作者：潘佳欣贾延兵刘晓艳沈蓁管廷凤刘浩赣南医学院康复学院江西省赣州市341000 潍坊医学院康复医学院潍坊医学院智能康复研究院潍坊市脑康复与功能重塑重点实验室潍坊医学院附属医院潍坊医学院第一附属医院

疼痛是临床常见的症状,国际疼痛学会将其定义为一种与实际或潜在的组织损伤相关的不愉快的感觉和情绪情感体验,或与此相似的经历[1]。慢性疼痛是指持续存在3个月或以上的疼痛[2]。世界卫生组织(World Health Organization)在2018年最新... 详细信息

疼痛是临床常见的症状,国际疼痛学会将其定义为一种与实际或潜在的组织损伤相关的不愉快的感觉和情绪情感体验,或与此相似的经历[1]。慢性疼痛是指持续存在3个月或以上的疼痛[2]。世界卫生组织(World Health Organization)在2018年最新国际疾病分类(International Classification of Diseases,ICD-11)中将持续或者反复发作超过3个月的疼痛作为慢性疼痛纳入独立的疾病分类,其中慢性肌骨疼痛(chronic musculoskeletal pain,CMP)分为原发性和继发性两种类型[2]。

关键词：国际疾病分类慢性疼痛组织损伤国际疼痛学会

结核分枝杆菌潜伏相关蛋白Rv2204c的生物信息学分析

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中国病原生物学杂志 2024年第1期19卷 32-35,41页

作者：王文涛姜吉亮王晓强隽中乾付玉荣伊正君潍坊医学院医学检验学院山东潍坊261053 潍坊医学院基础医学院

目的应用生物信息学方法分析结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)潜伏相关蛋白Rv2204c的结构及功能。方法从NCBI数据库中搜索Rv2204c蛋白的氨基酸序列,运用ProtParam, Signal 6.0 Server, ProtScale, TMHMM Server v.2.0,ProtCompB,NetNGlyc-1.0及NetPhos-3.1预测蛋白的理化性质、疏水性、信号肽、跨膜螺旋区、亚细胞定位及糖基化和磷酸化位点;运用SOPMA、SWISS-MODEL预测蛋白的二、三级结构;运用IEDB预测蛋白的B细胞抗原表位;采用SYFPEITHI,RANKPEP,NetMHC和NetCTL预测其细胞毒性T淋巴细胞(CTL)抗原表位;采用SYFPEITHI、RANKPEP预测其辅助性T(Th)淋巴细胞表位;利用MEGA构建Rv2204c蛋白进化树;运用STRING蛋白相互作用数据库预测Rv2204c相互作用蛋白。结果 Rv2204c蛋白氨基酸总数为118,为亲水性稳定蛋白;该蛋白无信号肽,无跨膜螺旋区;亚细胞定位主要为细胞质;无糖基化位点,含5个磷酸化位点;二级结构中α-螺旋(Hh)占23.73%,β-转角(Tt)占10.17%,无规则卷曲(Cc)占39.83%;含多个优势T、B细胞表位;其互作蛋白为Rv0398c, Rv0883c, pyrD(Rv2139),Rv1465,Rv1463,Rv2205c, ppiA(Rv0009),mmsA(Rv0753c),kgd(Rv1248c)和lipA(Rv2218),参与固氮、脂酸盐合成等多个生物过程。结论 Rv2204c为亲水性稳定蛋白,具有多个T、B细胞抗原表位,可能在潜伏结核感染过程中发挥重要作用,可作为结核病诊断的候选蛋白和治疗新靶点。

关键词：结核分枝杆菌结核潜伏感染 Rv2204c 生物信息学

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重组酶聚合酶扩增技术的研究进展

微生物学通报 2024年第5期51卷 1495-1511页

作者：沈方园葛萧张晓宇张郁勃周慧姿李恒潍坊医学院医学检验学院山东潍坊261053

重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification,RPA)技术是一种利用重组酶(T4 UvsX)、单链DNA结合蛋白(T4 Gp32)和链置换DNA聚合酶(Bsu)等蛋白在恒温条件下扩增核酸的技术。由于其可以恒温、高效地扩增靶核酸片段,近几年在细... 详细信息

重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification,RPA)技术是一种利用重组酶(T4 UvsX)、单链DNA结合蛋白(T4 Gp32)和链置换DNA聚合酶(Bsu)等蛋白在恒温条件下扩增核酸的技术。由于其可以恒温、高效地扩增靶核酸片段,近几年在细菌、病毒、寄生虫、支原体、衣原体检测方面发挥着独特的作用,逐渐成为床旁检测(point-of-care testing,POCT)的重要技术。本文以RPA技术的原理为起点,对其临床应用、不足之处及改进方法进行阐述,以期为临床疾病的快速检测和诊断方面提供新思路。

关键词：重组酶聚合酶扩增技术等温扩增技术核酸检测

基于免疫信息学的猴痘病毒多表位疫苗设计及免疫效果评价

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中国病原生物学杂志 2024年第8期19卷 869-874,879页

作者：宋浩然辛继莹王亚孙艳丽潍坊医学院医学检验学院山东潍坊261053

目的构建一种以猴痘病毒(monkeypox virus,MPXV)优势保护性抗原为基础的多表位疫苗。方法从NCBI网站获取9种MPXV蛋白的GenBank登录ID及其氨基酸序列;通过ABCpred、NetCTL 1.2和IEDB的MHC-I Immunogenicity模块分别预测9种MPXV蛋白的B、... 详细信息

目的构建一种以猴痘病毒(monkeypox virus,MPXV)优势保护性抗原为基础的多表位疫苗。方法从NCBI网站获取9种MPXV蛋白的GenBank登录ID及其氨基酸序列;通过ABCpred、NetCTL 1.2和IEDB的MHC-I Immunogenicity模块分别预测9种MPXV蛋白的B、CTL及Th细胞(HTL)表位;采用IEDB的MHC I Binding模块预测各CTL表位与特定MHC-I类分子的亲和力;使用VaxiJen v2.0、ToxinPred、AllerTOP v.2.0分别预测所得表位的抗原性、毒性及致敏性,从中筛选出具有最高抗原性但无细胞毒性和致敏性的表位,其中,CTL表位选择IC_(50)值学方法成功构建一种含多个优势抗原表位的MPXV疫苗,可能对猴痘病毒感染有预防作用。

关键词：猴痘病毒(MPXV) 免疫信息学多表位疫苗保护性抗原免疫效果

有限元法分析腓骨瓣重建完全缺失跟骨的生物力学

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中国组织工程研究 2024年第12期28卷 1805-1809页

作者：陈默迪孙琪博徐天宇邰国梁赵玉祥潘朝晖潍坊医学院外科学教研室山东省潍坊市261053 陆军第八十集团军医院骨科研究所山东省潍坊市261053

背景:跟骨缺损在临床中屡见不鲜,因足跟复杂的解剖结构与运动功能使外科医生评估跟骨重建效果较为困难,而有限元分析已成为生物力学行为模拟和数值分析的有效方法之一。目的:比较Ⅱ字、V字排列腓骨瓣重建缺失跟骨的临床效果及生物力学... 详细信息

背景:跟骨缺损在临床中屡见不鲜,因足跟复杂的解剖结构与运动功能使外科医生评估跟骨重建效果较为困难,而有限元分析已成为生物力学行为模拟和数值分析的有效方法之一。目的:比较Ⅱ字、V字排列腓骨瓣重建缺失跟骨的临床效果及生物力学特征。方法:采集1名50岁健康男性左足CT图像,用Mimics软件获取初步三维模型,导入Geomagic软件对模型进行修整和曲面化从而优化模型。再将模型通过Solidworks软件模拟跟骨重建并完成有限元计算前处理,最后进入Ansys软件求解。将仿真结果与既往文献结果进行对比,验证模型的有效性,再根据仿真得到的应力结果对手术效果和不同姿态下生物力学特性进行分析。结果与结论:①模型直观展现出腓骨瓣Ⅱ字、V字排列,均可以用来重建完全缺失的跟骨,能够一定程度恢复正常跟骨的长、宽、高,填补跟骨缺失的骨量;②两种重建跟骨相较正常跟骨在施加载荷后都表现出应力过于集中的趋势,正常跟骨应力多集中于跟骨结节、载距突及跟骨沟周围,而两种腓骨瓣应力多集中于骨瓣与距骨和骰骨衔接处;③两种重建跟骨与正常跟骨在不同模拟状态下最大应力值均不相同,差异有显著性意义(P<0.05);Ⅱ字相较V字腓骨瓣在不同状态下应力变化较小,更接近在相同状态时的正常跟骨;V字腓骨瓣在推离期出现局部应力过大,骨材料可能在此模拟状态下屈服,提示存在骨折的风险。

关键词：跟骨腓骨移植生物力学有限元分析步态分析复合组织瓣显微外科

穿山龙薯蓣皂苷通过调控自噬治疗胶原诱导性关节炎小鼠模型的机制

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中国药理学通报 2024年第4期40卷 645-651页

作者：江涛由涌夏东帅薄思涵王永为高亚贤宋鸿儒承德医学院基础医学院免疫学教研室河北承德067000 承德医学院基础医学院解剖学教研室河北承德067000 河北北方学院医学检验学院免疫学教研室河北张家口075000

目的探讨穿山龙薯蓣皂苷通过自噬治疗胶原诱导性关节炎(collagen-induced arthritis,CIA)模型小鼠的作用机制。方法通过鸡Ⅱ型胶原乳剂建立CIA模型小鼠,初次免疫DBA1小鼠(0.1 mL),第21天后再次给予相同剂量刺激。加强免疫后将胶原免疫... 详细信息

目的探讨穿山龙薯蓣皂苷通过自噬治疗胶原诱导性关节炎(collagen-induced arthritis,CIA)模型小鼠的作用机制。方法通过鸡Ⅱ型胶原乳剂建立CIA模型小鼠,初次免疫DBA1小鼠(0.1 mL),第21天后再次给予相同剂量刺激。加强免疫后将胶原免疫的50只小鼠随机分组为CIA模型组、雷公藤组和穿山龙薯蓣皂苷低、中、高剂量组,另有10只小鼠注射等量生理盐水作为对照组。在对小鼠进行连续14天灌胃治疗并观察各组小鼠足爪的炎症程度,取下各组小鼠脾、腹股沟淋巴结和踝关节、膝关节,对踝关节、膝关节进行HE染色,检测各组淋巴结、脾组织中mRNA和蛋白质水平的相关自噬指标。结果与CIA模型组相比,穿山龙薯蓣皂苷高剂量组关节炎指数(AI)评分降低(P<0.05);雷公藤组及穿山龙薯蓣皂苷组足爪厚度差值减小(P<0.01)。与对照组相比,CIA模型组体质量明显下降(P<0.01);小鼠膝关节滑膜和足爪踝关节HE染色结果显示CIA模型组对比对照组出现免疫细胞浸润、骨质侵蚀、软骨破坏和滑膜增生的症状;雷公藤组与穿山龙薯蓣皂苷中、高剂量组对CIA模型有不同程度的治疗作用,可以减轻和预防症状。与CIA模型组相比,雷公藤组和穿山龙薯蓣皂苷治疗组中LC3、Beclin-1的mRNA水平和蛋白水平的表达升高,p62的mRNA水平和蛋白水平的表达降低。结论穿山龙薯蓣皂苷可能通过抑制自噬对CIA模型小鼠起到治疗作用。

关键词：穿山龙薯蓣皂苷自噬类风湿性关节炎胶原诱导性关节炎 p62 LC3 Beclin-1