检索结果-南通市图书馆

利用WGCNA鉴定棉花抗黄萎病相关基因共表达网络

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

作物学报 2020年第5期46卷 668-679页

作者：傅明川李浩陈义珍柳展基刘任重王立国山东棉花研究中心/农业部黄淮海棉花遗传改良与栽培生理重点实验室山东济南250100

加权基因共表达网络分析(Weighted Gene Co-expression Network Analysis,WGCNA)作为一种典型的系统生物学方法,可用来鉴定协同表达的基因模块,探索模块与目标性状之间的生物学相关性,并挖掘网络中的核心基因。黄萎病(Verticillium wilt... 详细信息

加权基因共表达网络分析(Weighted Gene Co-expression Network Analysis,WGCNA)作为一种典型的系统生物学方法,可用来鉴定协同表达的基因模块,探索模块与目标性状之间的生物学相关性,并挖掘网络中的核心基因。黄萎病(Verticillium wilt)可严重降低棉花(Gossypium spp.)的产量及品质,因此研究抗病基因及抗病机制,对于棉花抗病育种工作具有重要意义。本研究以黄萎病菌侵染不同时间点的海岛棉(Gossypium barbadense)幼苗根尖转录组数据为基础,分析其差异表达基因,并选取在不同样本之间表达水平变异最大的前50%基因(共35,647个)进行WGCNA。结果表明,在黄萎病菌侵染条件下,共有22,850个基因差异表达,其中4685个为所有侵染时间点共有的差异基因。共鉴定到18个基因共表达模块,其中5个为抗黄萎病相关特异性模块(black、mediumpurple3、darkolivegreen、plum3模块分别与侵染2 h、6 h、48 h、72 h时间点正相关;mediumpurple2与侵染2 h时间点负相关)。GO和KEGG富集分析表明,特异性模块可以富集到有生物学意义的富集结果,如刺激响应、钙离子结合、黄酮类化合物合成代谢等抗逆相关通路。通过计算模块内基因的连通性,挖掘出了网络中的核心基因,功能预测表明,这些基因可能在逆境胁迫响应中发挥重要作用。本研究为进一步理解棉花抗黄萎病的分子机制、选育棉花抗病新品种提供了理论指导。

关键词：棉花黄萎病加权基因共表达网络分析核心基因

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

陆地棉胆色素原脱氨酶基因的克隆及表达分析

农业生物技术学报 2020年第7期28卷 1221-1229页

作者：陈义珍李浩傅明川王立国刘任重柳展基农业部黄淮海棉花遗传改良与栽培生理重点实验室/山东棉花研究中心

叶色突变体是研究高等植物叶绿素代谢、叶绿体发育、光合作用和激素生理等一系列生理代谢过程的理想材料,也是遗传和育种研究中的重要材料。胆色素原脱氨酶(porphobilinogen deaminase, PBGD)是植物叶绿素生物合成的关键酶。本研究以陆... 详细信息

叶色突变体是研究高等植物叶绿素代谢、叶绿体发育、光合作用和激素生理等一系列生理代谢过程的理想材料,也是遗传和育种研究中的重要材料。胆色素原脱氨酶(porphobilinogen deaminase, PBGD)是植物叶绿素生物合成的关键酶。本研究以陆地棉(Gossypium hirsutum)’鲁棉418’的花斑叶突变体为材料,克隆了4个GhPBGDs,分别命名为GhPBGD1A (GenBank No. MN849924)、GhPBGD1D (GenBank No. MN849925)、GhPBGD2A (GenBank No. MN849926)和GhPBGD2D (GenBank No. MN849927)。测序结果表明,正常叶片与花斑叶片中的4个基因序列相同;4个基因均含有5个外显子和4个内含子,预测结果均定位于叶绿体;进化分析表明,GhPBGD蛋白与拟南芥(Arabidopsis thaliana)和油菜(Brassica napus)的PBGD同源蛋白亲缘关系较近。另外,4个基因启动子顺式作用元件中含有光响应元件、厌氧环境及多种激素相关的应答元件。qRT-PCR结果表明,4个GhPBGD基因在正常棉株的叶、花、铃和苞叶中均有表达,其中在叶片中的表达量最高;与正常叶相比,花斑叶中GhPBGD基因的表达量都显著降低。以上结果表明,GhPBGD基因家族可能参与调控叶色突变。本研究可为深入探讨叶色缺失突变体的分子机理提供参考依据。

关键词：棉花胆色素原脱氨酶(PBGD) 基因克隆表达分析

陆地棉NAC转录因子基因GhSNAC1的克隆及其抗旱耐盐分析

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

农业生物技术学报 2019年第4期27卷 571-580页

作者：王立国傅明川李浩刘任重柳展基农业部黄淮海棉花遗传改良与栽培生理重点实验室/山东棉花研究中心

NAC (NAM/ATAF/CUC)家族是植物中特有的一类转录因子,其功能涉及植物生长发育调控、激素信号转导、逆境胁迫响应等重要生理过程。本研究利用反转录PCR (reverse transcription PCR, RT-PCR)技术从陆地棉(Gossypium hirsutum)中克隆了1... 详细信息

NAC (NAM/ATAF/CUC)家族是植物中特有的一类转录因子,其功能涉及植物生长发育调控、激素信号转导、逆境胁迫响应等重要生理过程。本研究利用反转录PCR (reverse transcription PCR, RT-PCR)技术从陆地棉(Gossypium hirsutum)中克隆了1个逆境胁迫响应(stress-responsive) NAC类转录因子基因,命名为GhSNAC1 (GenBank No. KU759894)。该基因长度为1 104 bp,预测编码蛋白含有299个氨基酸,分子量为33.9 kD,等电点为6.18。蛋白序列分析表明,GhSNAC1具有典型的NAC转录因子特征,N端含有保守的NAC结构域。进化分析表明,GhSNAC1与拟南芥(Arabidopsis thaliana) ATAF1 (Arabidopsis transcription activation factor 1)高度相似。qRT-PCR结果显示,GhSNAC1受到干旱、高盐、低温和黄萎病菌(Verticillium dahliae)胁迫诱导,提示该基因可能参与生物和非生物胁迫响应。在烟草(Nicotiana tabacum)中过表达GhSNAC1,分析干旱或盐胁迫条件下转基因和野生型烟草株系种子的萌发率和幼苗生长差异,实验结果显示,在100 mmol/L NaCl或200 mmol/L甘露醇胁迫下,野生型烟草的种子萌发受到明显抑制,萌发率低于50%,而转基因株系显著优于野生型,其种子萌发率均在80%以上;野生型烟草幼苗弱小,而转基因株系长势强,其单株鲜重和根长分别是野生型的2倍和1.5倍以上。上述结果表明,过表达GhSNAC1可显著提高转基因烟草的抗旱耐盐能力。本研究为深入探究GhSNAC1抗旱耐盐的分子机制提供了基础资料。

关键词：棉花 NAC转录因子干旱盐胁迫过表达分析

陆地棉EMS诱变体系的优化及种子和纤维发育异常突变体的鉴定

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

植物遗传资源学报 2019年第4期20卷 911-919页

作者：陈煜霍雪寒宋章强张传云杜召海周娟张景霞王芙蓉张军农业部黄淮海棉花遗传改良与栽培生理重点实验室/山东棉花研究中心

突变体是进行基因功能研究的遗传学材料。本研究利用浓度为0~1.5%EMS溶液处理已萌发露白的陆地棉(Gossypium hirsutum L.)鲁6269种子4~12 h,分析不同浓度的EMS溶液处理不同时间对棉花出苗率和生长的影响,并在M2和M3对突变体进行了初步... 详细信息

突变体是进行基因功能研究的遗传学材料。本研究利用浓度为0~1.5%EMS溶液处理已萌发露白的陆地棉(Gossypium hirsutum L.)鲁6269种子4~12 h,分析不同浓度的EMS溶液处理不同时间对棉花出苗率和生长的影响,并在M2和M3对突变体进行了初步的形态学鉴定。结果表明,1.0%EMS溶液处理10 h,鲁6269的出苗率为49%,为该材料的半致死浓度,诱变效果最佳。为了获得大量的突变体,利用该浓度,处理鲁6269萌发的种子(约10000粒)10 h,在M2发现一株纤维发育异常(纤维成熟脱水后不蓬松)的突变体,收获该突变体自交种子,M3跟踪调查,发现该突变体纤维发育异常表型与M2相同,种子解剖观察发现,该突变体种胚与外种皮之间存在一个大空腔,种胚弱小且扁瘪,影响种子的出土。本研究优化建立了陆地棉品种鲁6269种子EMS诱变体系,在M3筛选获得一个种子与纤维发育异常的突变体sfm-1,为研究棉花种子及纤维发育提供了遗传学材料。

关键词：甲基磺酸乙酯(EMS) 突变体种子纤维发育陆地棉鲁6269

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

棉花叶形种质资源研究及应用进展

棉花学报 2015年第1期27卷 89-94页

作者：姜辉赵军胜王家宝陈莹高明伟王秀丽山东棉花研究中心/农业部黄淮海棉花遗传改良与栽培生理重点实验室济南250100

对棉花叶形在遗传育种及栽培生理方面的相关研究及应用进展进行了综述,对影响棉花高光效育种的问题进行了分析,旨在为棉花叶形的遗传理论研究及其在育种中的应用提供参考依据。

关键词：棉花叶形育种栽培遗传

高产稳产型棉花品种鲁棉研28号选育及其栽培生理特性研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

棉花学报 2014年第6期26卷 569-576页

作者：王家宝王留明姜辉赵军胜陈莹高明伟王秀丽董合忠山东棉花研究中心/农业部黄淮海棉花遗传改良与栽培生理重点实验室济南250100

本文在简要回顾鲁棉研28号选育过程的基础上,总结了鲁棉研28号的选育经验和体会,全面分析了鲁棉研28号的高产稳产特性及其生理学机制,旨在为后继优良棉花品种的选育和栽培提供参考。

关键词：棉花品种鲁棉研28号育种栽培

海岛棉WRKY转录因子的全基因组鉴定及响应黄萎病菌侵染的表达分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

植物遗传资源学报 2019年第5期20卷 1289-1300页

作者：傅明川李浩陈义珍王立国柳展基刘任重农业部黄淮海棉花遗传改良与栽培生理重点实验室/山东棉花研究中心济南250100

WRKY蛋白是植物中一类重要的转录因子,其在很多生物过程中都发挥有重要作用。目前,关于海岛棉(Gossypium barbadense L.)WRKY转录因子的研究相对较少。本研究利用生物信息学方法在海岛棉基因组中鉴定出180个WRKY转录因子(GbWRKY)。根据... 详细信息

WRKY蛋白是植物中一类重要的转录因子,其在很多生物过程中都发挥有重要作用。目前,关于海岛棉(Gossypium barbadense L.)WRKY转录因子的研究相对较少。本研究利用生物信息学方法在海岛棉基因组中鉴定出180个WRKY转录因子(GbWRKY)。根据基因结构及系统进化关系,可将GbWRKY基因分为3组(I^III),II组又可细分为5个亚组(IIa^IIe)。GbWRKY基因在染色体上分布不均匀。基因重复事件分析表明,全基因组复制及区段重复事件是GbWRKY基因数量增多的主要原因。表达分析发现,有61个GbWRKY基因在黄萎病菌(Verticillium dahliae)侵染条件下呈现差异表达,表明它们在黄萎病菌胁迫应答过程中发挥作用。本研究结果揭示了海岛棉WRKY转录因子的结构、进化及表达特征,为进一步研究棉花WRKY基因的功能提供了理论指导。

关键词： WRKY转录因子棉花黄萎病生物信息学

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

耐低温萌发棉花品种种子萌发期生理特性分析

华北农学报 2018年第A01期33卷 146-153页

作者：高利英邓永胜韩宗福孔凡金申贵芳王景会王宗文段冰李汝忠山东棉花研究中心农业部黄淮海棉花遗传改良与栽培生理重点实验室山东济南250100

为探讨低温胁迫下不同棉花品种萌发差异成因,以强耐低温萌发品种鲁棉研37号、鲁棉研36号和低温萌发敏感品种斯字棉2B、斯字棉5A为材料,研究了不同低温下不同萌发时期的生理指标与基因表达的差异。结果显示,12℃胁迫36 h,低温萌发敏感品... 详细信息

为探讨低温胁迫下不同棉花品种萌发差异成因,以强耐低温萌发品种鲁棉研37号、鲁棉研36号和低温萌发敏感品种斯字棉2B、斯字棉5A为材料,研究了不同低温下不同萌发时期的生理指标与基因表达的差异。结果显示,12℃胁迫36 h,低温萌发敏感品种MDA含量急剧上升,至胁迫48 h,低温萌发敏感品种斯字棉2B、斯字棉5A比鲁棉研37号MDA含量分别提高了48. 17%,50. 65%,因此,12℃胁迫36 h MDA含量的变化可以作为耐低温萌发的选择指标; SOD、POD活性在各种处理水平下鲁棉研37号、鲁棉研36号均保持较高水平; CAT活性在低温的刺激下,强耐低温萌发品种逐渐超越低温萌发敏感品种;游离脯氨酸含量在12℃胁迫48 h时,鲁棉研37号与斯字棉2B、斯字棉5A相差幅度分别为33. 32%,23. 27%,这些生理指标差异较好地反映了不同品种耐低温萌发差异。4个CBF基因家族成员CBF1、CBF2、CBF4、CBF6在强耐性品种中表达上调更迅速,在胁迫12 h时达到表达峰,这可能是强耐低温萌发品种应答低温胁迫时,表现更灵敏与迅速的原因。

关键词：棉花低温胁迫生理指标基因表达

棉花衰老和熟相形成的生理生态与调控研究进展

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

应用生态学报 2016年第2期27卷 643-651页

作者：陈义珍董合忠山东省农业科学院棉花研究中心/农业部黄淮海棉花遗传改良与栽培生理重点实验室济南250100 山东大学生命科学学院济南250100

衰老是棉株或其某些器官发生导致生命活动自然终止的败坏过程,是棉株生长发育过程的必然归宿,熟相则是棉株吐絮成熟期的表现,是衰老的表现形式和结果,有早衰、贪青晚熟和正常成熟之分.衰老和熟相都是基因型与环境互作的结果.本文总结评... 详细信息

衰老是棉株或其某些器官发生导致生命活动自然终止的败坏过程,是棉株生长发育过程的必然归宿,熟相则是棉株吐絮成熟期的表现,是衰老的表现形式和结果,有早衰、贪青晚熟和正常成熟之分.衰老和熟相都是基因型与环境互作的结果.本文总结评述了棉花衰老的生理生态和分子生物学方面的研究进展,提出了依靠选育稳发型棉花品种、合理使用植物生长调节剂并综合运用农艺栽培措施调控棉株生长发育和衰老,实现正常熟相,进而提高棉花产量和品质.

关键词：棉花衰老熟相生理生态调控