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冬瓜响应高温胁迫的转录组测序及分析

分子植物育种 2024年

作者：朱白婢王静张文胡艳平李雪峤海南省农业科学院蔬菜研究所海南省蔬菜生物学重点实验室海南省农业科学院蔬菜研究所海南省瓜菜育种工程技术研究中心海南省农业科学院土壤与肥料研究所

为了挖掘冬瓜响应高温胁迫的基因，本研究以42 ℃处理的‘四季粉皮’冬瓜为试验材料，分别对处理0、2、4、6和8 h后的冬瓜幼苗叶片进行转录组测序，分析冬瓜在高温胁迫下的差异表达基因种类及其表达模式差异。结果表明，与对照高温处理... 详细信息

为了挖掘冬瓜响应高温胁迫的基因，本研究以42 ℃处理的‘四季粉皮’冬瓜为试验材料，分别对处理0、2、4、6和8 h后的冬瓜幼苗叶片进行转录组测序，分析冬瓜在高温胁迫下的差异表达基因种类及其表达模式差异。结果表明，与对照高温处理0 h相比，在高温处理2 h、4 h、6 h和8 h后共鉴定到5 069个共同差异表达的基因，其中有2 809个上调，2 260个下调。GO和KEGG富集分析结果表明，这些差异表达基因在高温胁迫时主要在内质网的蛋白质加工途径中富集，参与有关热激蛋白的合成。此外，还发现32个热激蛋白(Hsp)家族基因，其中7个Hsp17、8个Hsp18、8个Hsp70和3个Hsp83基因在遭遇高温时表达水平明显升高，推测其在冬瓜响应高温胁迫过程中发挥积极作用。本研究对高温胁迫下冬瓜的转录水平进行了初步分析，挖掘出了与冬瓜耐热有关的基因，这对进一步研究冬瓜的耐热分子机制有重要意义。

关键词：冬瓜高温胁迫热胁迫转录组分析耐热基因

一例肉鸡传染性支气管炎与H9亚型禽流感混合感染的病例分析

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家禽科学 2024年第1期46卷 16-22页

作者：林仲寅李世恒黄兵李继桐魏可欣格日勒图马秀丽内蒙古农业大学兽医学院内蒙古呼和浩特010018 山东省农业科学院家禽研究所/山东省禽病诊断与免疫重点实验室/山东省家禽育种工程技术研究中心山东济南250100

2023年山东某鸡场部分肉鸡发生不同程度的呼吸困难,并伴有零星死亡,死鸡剖检可见气管出血、支气管栓塞、部分鸡有尿酸盐沉积。为探究其发病原因,采集病料进行了常见呼吸道病原的PCR检测。结果显示,此鸡场呼吸道传染病是由禽传染性支气... 详细信息

2023年山东某鸡场部分肉鸡发生不同程度的呼吸困难,并伴有零星死亡,死鸡剖检可见气管出血、支气管栓塞、部分鸡有尿酸盐沉积。为探究其发病原因,采集病料进行了常见呼吸道病原的PCR检测。结果显示,此鸡场呼吸道传染病是由禽传染性支气管炎病毒(Infectious Bronchitis virus,IBV)与H9亚型禽流感病毒(Avian Influenza virus,AIV)混合感染引起。病料经分离纯化后分别获得一株IBV分离株(SDDZ/202301简称DZ01)和一株H9亚型AIV分离株(SDDZ/202302简称DZ02)。分别对DZ01的S1基因和DZ02的HA基因扩增,测序结果发现,DZ01与参考株核苷酸和氨基酸同源性分别为60.2%~96.7%和50.3%~95.6%,确定为GI-19基因型,与同型参考株相比有13个氨基酸发生点突变,裂解位点为HRRRR,并发现15个N-糖基化位点。AIV H9同源性分析显示DZ02与参考株核苷酸和氨基酸同源性为78.1%~95.1%和79.4%~94.2%,为H9.***.2.5分支,属于山东省内优势毒株。本研究明确了该养殖场中出现了IBV和H9亚型AIV的混合感染,这表明该养殖场仍需加强生物安全管理等方面的工作。

关键词： IBV AIV 混合感染遗传变异

混合比例、菌剂和压实密度对玉米秸秆和花生秧混合青贮发酵品质和营养价值的影响

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动物营养学报 2024年第4期36卷 2633-2647页

作者：张相伦张正李俊玲杨赵军盛清凯刘晓牧赵国朵赵红波山东省农业科学院畜牧兽医研究所山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室农业农村部畜禽生物组学重点实验室济南250100 山东省农业科学院农作物种质资源研究所济南250100 山东省畜产品质量安全中心济南250100 山东美事达农牧科技有限公司济南市反刍动物营养与饲料重点实验室济南251400

本试验旨在研究混合比例、菌剂和压实密度对玉米秸秆和花生秧混合青贮发酵品质和营养价值的影响。试验分为2部分,试验1研究混合比例和菌剂对玉米秸秆和花生秧混合青贮发酵品质和营养价值的影响。将玉米秸秆和花生秧按5个混合比例(4∶0、... 详细信息

本试验旨在研究混合比例、菌剂和压实密度对玉米秸秆和花生秧混合青贮发酵品质和营养价值的影响。试验分为2部分,试验1研究混合比例和菌剂对玉米秸秆和花生秧混合青贮发酵品质和营养价值的影响。将玉米秸秆和花生秧按5个混合比例(4∶0、3∶1、2∶2、1∶3、0∶4)进行混合,每个比例下设4个组,分别为对照组(CON组,喷洒无菌生理盐水)、植物乳杆菌组(LP组,喷洒1×10^(6)CFU/g植物乳杆菌)、粪肠球菌组(EF组,喷洒1×10^(6)CFU/g粪肠球菌)、植物乳杆菌+粪肠球菌组(LP+EF组,喷洒5×10^(5)CFU/g植物乳杆菌+5×10^(5)CFU/g粪肠球菌),每组3个重复,厌氧发酵60 d。试验2研究压实密度和菌剂对玉米秸秆和花生秧混合青贮发酵品质和营养价值的影响。将玉米秸秆和花生秧按3∶1比例混合后,按不同压实密度(300、450、600 kg/m^(3))进行发酵,每个压实密度下设4个组(同试验1),每组3个重复,厌氧发酵60 d。试验1结果表明:1)随着花生秧比例的提高,有机物、中性洗涤纤维和水溶性碳水化合物含量显著降低(P0.05)。与对照组相比,LP、EF和LP+EF组的乳酸菌数量显著升高(P0.05)。与对照组相比,LP和LP+EF组的乳酸菌数量显著升高(P0.05)。压实密度为600 kg/m^(3)组的乳酸含量显著高于压实密度为300 kg/m^(3)组(P<0.05),压实密度为300 kg/m^(3)组的乙酸和丁酸含量显著高于其他各组(P<0.05)。综合各项指标,推荐玉米秸秆和花生秧混合青贮的适宜混合比例为3∶1,菌剂为植物乳杆菌和粪肠球菌联合添加,压实密度为450~600 kg/m^(3)。

关键词：玉米秸秆花生秧混合青贮菌剂压实密度

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冠层活性相关性状全基因组关联分析及其对产量性状遗传效应的解析

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中国农业科学 2024年第4期57卷 627-637页

作者：李法计程敦公余晓丛闻伟锷刘金栋翟胜男刘爱峰郭军曹新有刘成宋健民刘建军李豪圣山东省农业科学院作物研究所/小麦玉米国家工程研究中心/农业农村部黄淮北部小麦生物学与遗传育种重点实验室/山东省小麦技术创新中心/济南市小麦遗传改良重点实验室菏泽学院农业与生物工程学院(牡丹学院) 遵义医科大学细胞生物学教研室中国农业科学院作物科学研究所

【目的】冠层活性是反映作物生长发育的重要指标，发掘小麦冠层活性相关基因并分析其与产量性状的关系，为解析产量遗传结构和辅助育种提供理论支撑。【方法】以166份国内外小麦品种为材料，将其种植于河南安阳和安徽濉溪，结合已构建... 详细信息

【目的】冠层活性是反映作物生长发育的重要指标，发掘小麦冠层活性相关基因并分析其与产量性状的关系，为解析产量遗传结构和辅助育种提供理论支撑。【方法】以166份国内外小麦品种为材料，将其种植于河南安阳和安徽濉溪，结合已构建的包含326 570个来源于小麦90K和660K SNP芯片标记的高密度整合物理图谱，对苗期和花后10 d归一化植被指数(NDVI-S和NDVI-10)及花后10 d旗叶叶绿素含量(Chl-10)进行关联分析，并与前期利用相同材料得到的产量相关性状结果进行比较。【结果】NDVI-S、NDVI-10和Chl-10在基因型、环境及基因型×环境互作间变异方差均达极显著(P育种材料的检测。

关键词：小麦冠层活性产量归一化植被指数叶绿素含量关联分析

石榴蔗糖代谢相关酶SPS和INV基因家族鉴定与表达分析

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山东农业科学 2024年第3期56卷 11-18页

作者：冯立娟李英朋王传增尹燕雷郭琳谭伟枣庄学院山东省石榴精深加工工程技术研究中心/山东省石榴资源综合开发工程实验室山东枣庄277160 山东省果树研究所山东泰安271000 冠县店子镇农林水技术服务站山东冠县252500 山东省农业科学院山东济南250100 郓城县农业农村局山东郓城274700

蔗糖磷酸合成酶(SPS)和蔗糖转化酶(INV)是蔗糖代谢的关键调控酶,在植物生长发育过程中起重要作用。本研究利用生物信息学和荧光定量PCR等分子手段,鉴定石榴SPS和INV基因家族成员,分析其理化性质、保守结构域、保守基序、二级结构、亚细... 详细信息

蔗糖磷酸合成酶(SPS)和蔗糖转化酶(INV)是蔗糖代谢的关键调控酶,在植物生长发育过程中起重要作用。本研究利用生物信息学和荧光定量PCR等分子手段,鉴定石榴SPS和INV基因家族成员,分析其理化性质、保守结构域、保守基序、二级结构、亚细胞定位、系统进化关系和表达模式。结果表明,从石榴基因组中鉴定出4个SPS基因和11个INV基因,其编码蛋白均为不稳定蛋白,具有典型的保守结构域,家族成员间特征motif数量和种类大致相同,蛋白结构高度保守;这些蛋白不均匀地分布在染色体上,均定位于叶绿体中,二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成。石榴SPS和INV基因家族成员间存在不同程度的亲缘关系,与巨桉同源性较高;不同SPS和INV基因在石榴果实不同发育时期的表达模式存在差异,PgINV3在9月15日(果实增大期)表达水平最高,显著高于其他时期。本研究结果对解析石榴果实中蔗糖代谢的分子机理具有重要意义。

关键词：石榴 SPS基因 INV基因生物信息学分析基因表达

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大豆田反枝苋对除草剂多抗性及靶标抗性机理研究

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植物保护 2024年第4期50卷 32-38页

作者：杜龙李宁尚素琴李丹李晓曲明静山东省花生研究所国家花生工程技术研究中心青岛266100 黄冈市农业科学院黄冈438000 甘肃农业大学植物保护学院兰州730070

黑龙江省大豆田反枝苋Amaranthus retroflexus对ALS、PPO抑制剂类除草剂产生了严重抗性,为明确化学防除失败的反枝苋对咪唑乙烟酸、氟磺胺草醚的抗性机理,采用整株生物测定法测定了反枝苋抗性及敏感种群对除草剂的敏感性,克隆了抗性和... 详细信息

黑龙江省大豆田反枝苋Amaranthus retroflexus对ALS、PPO抑制剂类除草剂产生了严重抗性,为明确化学防除失败的反枝苋对咪唑乙烟酸、氟磺胺草醚的抗性机理,采用整株生物测定法测定了反枝苋抗性及敏感种群对除草剂的敏感性,克隆了抗性和敏感种群的ALS、PPO基因(质体型PPX1及线粒体型PPX2),查找突变位点,将突变基因转入拟南芥Arabidopsis thaliana验证其功能,明确抗性机理。结果显示:反枝苋抗性种群对咪唑乙烟酸、氟磺胺草醚抗性倍数分别为55.29倍和17.51倍,抗性植株ALS存在Ala205Val或Ser653Asn突变,PPX2存在Arg128Gly突变。将抗性种群的PPX2转入拟南芥,可导致拟南芥对氟磺胺草醚产生高水平抗性(10.3倍)。综上,东北大豆田反枝苋对咪唑乙烟酸、氟磺胺草醚产生了高水平多抗性,ALS、PPO基因突变是导致此类抗性的主要原因之一。

关键词：反枝苋氟磺胺草醚咪唑乙烟酸多抗性机理

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笼养密度对公母分饲黄羽肉鸡生长性能、免疫器官发育、抗氧化能力、肠道组织形态及免疫相关基因mRNA表达的影响

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动物营养学报 2024年第4期36卷 2277-2291页

作者：姬改革巨晓军单艳菊章明邹剑敏屠云洁刘一帆束婧婷庞立川范晨宇江苏省家禽科学研究所江苏省家禽遗传育种重点实验室扬州225125 湖南农业大学动物科技学院长沙410128

本试验旨在探讨笼养密度对公母分饲黄羽肉鸡生长性能、免疫器官发育、抗氧化能力、肠道组织形态及免疫相关基因mRNA表达的影响。选用21日龄黄脚麻鸡720只,3层层叠式笼内饲喂,鸡笼规格为长×宽×高=1.2 m×0.8 m×0.4 m,公鸡和母鸡分开饲... 详细信息

本试验旨在探讨笼养密度对公母分饲黄羽肉鸡生长性能、免疫器官发育、抗氧化能力、肠道组织形态及免疫相关基因mRNA表达的影响。选用21日龄黄脚麻鸡720只,3层层叠式笼内饲喂,鸡笼规格为长×宽×高=1.2 m×0.8 m×0.4 m,公鸡和母鸡分开饲养,均随机分为4组(每组5个重复),笼养密度分别为15(低密度组)、17(中密度组)、19(中高密度组)和21只/m 2(高密度组)。试验期42 d。结果表明:1)对于公鸡,21~42日龄时,高密度组平均日采食量显著低于低密度组和中密度组(P<0.05);43~63日龄时,中高密度组和高密度组平均日采食量显著低于低密度组和中密度组(P<0.05),中高密度组和高密度组平均日增重显著低于低密度组(P<0.05)。对于母鸡,21~42日龄时,中高密度组和高密度组平均日采食量显著低于低密度组(P<0.05),高密度组平均日增重显著低于低密度组(P<0.05);43~63日龄时,高密度组平均日采食量显著低于低密度组和中密度组(P<0.05),中高密度组平均日增重显著低于低密度组(P<0.05)。2)对于公鸡,低密度组肝脏重量显著低于其他各组(P<0.05),肝脏指数显著低于高密度组(P<0.05)。3)对于母鸡,中密度组血清超氧化物歧化酶活性显著高于高密度组(P<0.05),中高密度组血清丙二醛含量显著高于高密度组(P<0.05)。4)对于公鸡,中密度组空肠绒毛高度/隐窝深度显著高于高密度组(P<0.05)。对于母鸡,高密度组十二指肠隐窝深度显著高于中高密度组(P<0.05),中高密度组十二指肠绒毛高度/隐窝深度显著高于高密度组(P<0.05);高密度组空肠绒毛高度显著低于中密度组和中高密度组(P<0.05),高密度组空肠绒毛高度/隐窝深度显著低于低密度组(P<0.05);高密度组回肠隐窝深度显著高于其他各组(P<0.05)。5)对于公鸡,中高密度组空肠肿瘤坏死因子-α(TNF-α)mRNA相对表达量显著高于其他各组(P<0.05)。对于母鸡,中高密度组空肠核因子E2相关因子2(Nrf2)和Toll样受体4(TLR4)mRNA相对表达量显著高于低密度组(P<0.05)。由此可见,高笼养密度会对黄羽肉鸡生长性能、抗氧化能力、肠道组织形态等相关指标产生影响;笼养密度可能通过影响肠道抗氧化和免疫相关基因表达影响黄羽肉鸡肠道免疫功能。

关键词：黄羽肉鸡笼养密度生长性能免疫肠道形态抗氧化基因表达

葡萄VvMET1-1基因在葡萄和拟南芥中的功能研究

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中外葡萄与葡萄酒 2024年第3期 1-12页

作者：王风霞丁亭亭刘蕙萍李科杨国伟李傲张庆田 Chebukin Pavel 任凤山王鹏飞山东省葡萄研究院山东济南250100 俄罗斯瓦维洛夫植物研究所海参崴690014 山东省农业科学院山东济南250100 山东省酿酒葡萄与葡萄酒技术创新中心山东烟台265600

DNA甲基化修饰对于植物的生长发育十分重要,而MET1是植物中重要的甲基转移酶,能维持植物的CG位点甲基化修饰。为了研究葡萄MET1基因的功能及对植物发育的影响,将葡萄VvMET1-1基因转入葡萄胚性愈伤组织和拟南芥中进行研究。本研究选择35S... 详细信息

DNA甲基化修饰对于植物的生长发育十分重要,而MET1是植物中重要的甲基转移酶,能维持植物的CG位点甲基化修饰。为了研究葡萄MET1基因的功能及对植物发育的影响,将葡萄VvMET1-1基因转入葡萄胚性愈伤组织和拟南芥中进行研究。本研究选择35S::VvMET1-1-GFP表达载体转入葡萄胚性愈伤组织后检测到明显的GFP信号,且该胚性愈伤组织能被成功诱导为体细胞胚,表明VvMET1-1首次被成功转入葡萄胚性愈伤组织中并且不影响胚性愈伤组织的发育和分化。VvMET1-1被转入拟南芥中发现,该基因能影响拟南芥叶片的长度和宽度,但是不影响植株形态和种子发育;转录组数据分析表明,许多逆境胁迫、生长素、种子萌发、果实成熟、脱落酸和茉莉酸合成相关的基因差异表达;甲基化组结果显示,拟南芥过表达VvMET1-1后CG和CHH位点甲基化水平分别发生了明显的上调和下调,且DNA甲基化差异区(DMR)的类型主要是CG和CHH型,因此推测VvMET1-1可能通过调控DNA甲基化水平的变化影响下游基因的表达,进而调控拟南芥的生长发育。

关键词：葡萄胚性愈伤组织 VvMET1-1 转录组测序

不同苗龄蝴蝶兰形态指标与开花性状的相关性研究

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北方园艺 2024年第3期 58-62页

作者：董飞马蕾张冀华郭航徐蝉陈媛山东省农业科学院休闲农业研究所农业农村部华东都市农业重点实验室生态园艺植物育种山东省工程研究中心山东济南250100 济南麒麟花卉有限公司山东济南250100 重庆市农业科学院重庆404100

以‘16136’蝴蝶兰为试材,采用统计分析法,研究不同苗龄蝴蝶兰形态指标与开花性状的相关性,以期建立一个外观质量鉴定标准,从形态特征预测花朵性状,提前对实生苗进行选择,从而缩短育种周期。结果表明:苗龄6个月的‘16136’蝴蝶兰(T1)长... 详细信息

以‘16136’蝴蝶兰为试材,采用统计分析法,研究不同苗龄蝴蝶兰形态指标与开花性状的相关性,以期建立一个外观质量鉴定标准,从形态特征预测花朵性状,提前对实生苗进行选择,从而缩短育种周期。结果表明:苗龄6个月的‘16136’蝴蝶兰(T1)长至苗龄12个月(T2)时形态指标、开花性状均没有显著的变化,在T2长至苗龄18个月(T3)时各指标发生了极显著的变化。蝴蝶兰形态指标和开花性状之间有显著的相关性。T1蝴蝶兰的株高、最大叶宽、叶片数与其开花性状有显著相关性;T2蝴蝶兰的最大叶长、最大叶厚、叶片数与其开花性状有显著相关性;T3蝴蝶兰的株高、最大叶长、最大叶宽与其开花性状有显著相关性。因此,蝴蝶兰在不同苗龄催花时,可根据形态指标与开花性状的相关性预测其花横径、花纵径、花梗数、花序长、花梗数等。

关键词：蝴蝶兰形态指标开花性状相关性育种周期