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加权共表达网络分析与机器学习识别类风湿关节炎滑膜中的关键基因

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中国组织工程研究 2025年第2期29卷 294-301页

作者：武英楷史高龙谢宗刚苏州大学附属第二医院江苏省苏州市215000 宁阳县第一人民医院山东省泰安市271000

背景:类风湿关节炎是一种全身的免疫相关性疾病,主要病理特点是关节滑膜炎性增生及关节软骨的破坏,其发病机制目前尚不明确,迫切需要发现新的具有高度敏感性和特异性的诊断标志物。目的:联合使用生物信息学技术及计算机学习算法,识别并... 详细信息

背景:类风湿关节炎是一种全身的免疫相关性疾病,主要病理特点是关节滑膜炎性增生及关节软骨的破坏,其发病机制目前尚不明确,迫切需要发现新的具有高度敏感性和特异性的诊断标志物。目的:联合使用生物信息学技术及计算机学习算法,识别并筛选类风湿关节炎患者滑膜中的关键基因,构建类风湿关节炎预测模型并进行验证。方法:从基因表达综合数据库中下载3个包含类风湿关节炎患者滑膜的数据集(GSE77298、GSE55235、GSE55457),GSE77298和GSE55235作为训练集,GSE55457作为测试集,共纳入66个样本,其中类风湿关节炎患者滑膜样本39个,正常滑膜样本27个。应用R语言筛选训练集中的差异基因,然后使用加权共表达网络将训练集中的基因模块化,选出关键模块中的特征基因,将差异表达基因和特征基因取交集,交集基因进入下一步机器学习。采用3种机器学习方法:最小绝对值收敛和选择算子算法、支持向量机-递归特征消除和随机森林算法对交集基因进一步分析获得枢纽基因,将枢纽基因再次相交即得到类风湿关节炎滑膜中的关键基因。以关键基因为变量构建预测类风湿关节炎的列线图模型,推测患者发生类风湿关节炎的危险程度,使用受试者工作特征曲线确定类风湿关节炎预测模型及其关键基因的诊断价值。结果与结论:①通过差异分析,训练集中共筛选出差异基因730个,加权共表达网络分析得到特征基因185个,两者交集基因159个;②最小绝对值收敛和选择算子发现枢纽基因4个,支持向量机-递归特征消除发现枢纽基因11个,随机森林发现枢纽基因5个,取交集后获得关键基因2个(TNS3、SDC1);③基于2个关键基因,在训练集及测试集种构建列线图,其校准预测曲线与标准曲线贴合较好,且预测类风湿关节炎发生的临床效能良好;④上述结果证实,基于生物信息及机器学习算法获得的TNS3和SDC1有可能成为类风湿关节炎诊断和治疗的关键靶点。

关键词：加权基因共表达网络机器学习算法类风湿关节炎关键基因预测模型

自体骨与富血小板纤维蛋白修复牙槽骨重度缺损

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中国组织工程研究 2025年第10期29卷 2044-2051页

作者：刘子略王智宋文尚李苏娜蔡世新衡水市人民医院口腔正畸修复科河北省衡水市053000 衡水市人民医院神经内科河北省衡水市053000

背景:有研究将富血小板纤维蛋白与自体骨联合应用于牙周骨缺损治疗取得了良好效果,但二者联合治疗牙槽骨重度缺损的研究目前较为匮乏。目的:观察自体骨移植与富血小板纤维蛋白联合修复牙槽骨重度缺损的效果。方法:选择2022年4月至2023年... 详细信息

背景:有研究将富血小板纤维蛋白与自体骨联合应用于牙周骨缺损治疗取得了良好效果,但二者联合治疗牙槽骨重度缺损的研究目前较为匮乏。目的:观察自体骨移植与富血小板纤维蛋白联合修复牙槽骨重度缺损的效果。方法:选择2022年4月至2023年2月衡水市人民医院收治的102例牙槽骨重度缺损患者,采取随机数字表法分为对照组(n=51)与观察组(n=51),两组患者均进行引导性组织再生手术,对照组术中采用自体骨填充骨缺损,观察组术中采用自体富血小板纤维蛋白与自体骨填充骨缺损。观察两组临床疗效、手术前后牙齿松动度、牙周微生态环境(探诊深度、临床附着丧失、出血指数)、牙槽骨高度及密度、龈沟液指标(转化生长因子β、丝氨酸蛋白酶抑制剂、基质金属蛋白酶3)变化及不良反应情况。结果与结论:术后6个月,两组治疗有效率比较差异无显著性意义(P> 0.05);观察组患者术后3,6个月的牙齿松动度及牙周探诊深度、临床附着丧失、出血指数均低于对照组(P <0.05),术后6个月的牙槽骨高度高于对照组(P <0.05),术后3,6个月的龈沟液转化生长因子β水平高于对照组(P <0.05),术后3,6个月的龈沟液丝氨酸蛋白酶抑制剂、基质金属蛋白酶3水平均低于对照组(P <0.05)。结果提示:在引导性组织再生手术中,采用自体富血小板纤维蛋白与自体骨联合填充可改善牙槽骨重度缺损患者的牙周微生态环境、减轻牙龈组织炎症、促进牙槽骨组织再生与修复、降低牙齿松动度。

关键词：牙槽骨缺损自体骨富血小板纤维蛋白引导骨组织再生骨移植材料

有限元分析冠状动脉新型刻痕球囊的安全性及有效性

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中国组织工程研究 2025年第10期29卷 2083-2090页

作者：曹政郑晓新蒋学俊武汉大学人民医院心内科武汉大学心血管病研究所心血管病湖北省重点实验室湖北省武汉市430060

背景:目前临床上使用的冠状动脉介入预扩张球囊主要是传统的高压球囊、乳突球囊等,它们在病变血管中可能会出现滑脱进而擦伤血管的情况。目的:评估新型旋刻球囊在血管扩张中的安全性及有效性。方法:(1)有限元分析:通过采集相关人体组织... 详细信息

背景:目前临床上使用的冠状动脉介入预扩张球囊主要是传统的高压球囊、乳突球囊等,它们在病变血管中可能会出现滑脱进而擦伤血管的情况。目的:评估新型旋刻球囊在血管扩张中的安全性及有效性。方法:(1)有限元分析:通过采集相关人体组织数据建立血管三维有限元模型,随后建立乳突球囊植入血管三维有限元模型与旋刻球囊植入血管三维有限元模型,分析不同充气压下球囊扩张时的血管应力、血管位移、球囊应力、球囊位移。(2)动物实验:将8只新西兰大耳兔随机分成2组,在髂动脉中分别植入乳突球囊与旋刻球囊进行扩张,每组4只。球囊撤出后取材,苏木精-伊红染色与透射电镜观察血管损伤情况。结果与结论:(1)有限元分析:两种球囊的弹力性质无明显差异,在相同充气压下,乳突球囊组血管应力、血管位移、球囊应力、球囊位移均远远大于旋刻球囊组,并且各指标的均匀性优于旋刻球囊组;随着充气压的增加,乳突球囊组血管应力、血管位移、球囊应力、球囊位移增加幅度远远大于旋刻球囊组。(2)动物实验:苏木精-伊红染色与透射电镜观察显示,旋刻球囊扩张造成的血管损伤只局限在内膜,而乳突球囊扩张造成的血管损伤比较严重,内膜、中膜损伤严重,部分节段可以看到血肿形成,血管周围的炎性细胞较多,局部可见有巨噬细胞堆积。(3)结果表明:相较于乳突球囊扩张,旋刻球囊扩张造成血管闭塞以及夹层的风险较小,但有一定出现球囊弯曲的概率。

关键词：冠状动脉粥样硬化预扩张新型扩张球囊血管损伤有限元分析旋刻球囊

血清铁蛋白和25-羟维生素D与老年非酒精性脂肪性肝病患者颈部血管斑块及心脏代谢指数的相关性

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实用医学杂志 2025年第1期 78-83页

作者：雷蕾胡韵张笛黄鑫宇彭羽四川省医学科学院·四川省人民医院消化内科

目的探究血清铁蛋白（SF）、25-羟维生素D[25-(OH)D]与老年非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）患者颈部血管斑块及心脏代谢指数（CMI）的相关性。方法选取医院128例老年NAFLD患者作为研究组，另选80例健康体检者资料为对照组。比较研究组和... 详细信息

目的探究血清铁蛋白（SF）、25-羟维生素D[25-(OH)D]与老年非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）患者颈部血管斑块及心脏代谢指数（CMI）的相关性。方法选取医院128例老年NAFLD患者作为研究组，另选80例健康体检者资料为对照组。比较研究组和对照组及不同病变程度患者的血清Ferritin、25-(OH)D水平。根据是否形成颈动脉血管斑块将患者分为斑块组（n=36）和非斑块组（n=92）。比较两组临床资料，SF、25-(OH)D、CMI水平，分析影响老年NAFLD患者颈部血管斑块形成的多因素及血清Ferritin、25-(OH)D水平与患者颈部血管斑块及CMI的相关性。结果研究组血清SF值显著高于对照组（P 脂肪性肝炎组>肝硬化组（P <0.05）；斑块组BMI、合并糖尿病、高血脂、血清ALT、AST、LDL-C、SF、水平、FPG、FINS、HOMA-IR、CMI、NFS值显著高于非斑块组（P <0.05），血清25-(OH)D水平显著低于非斑块组（P <0.05）；多因素logistic回归分析显示，BMI、血清LDL-C、SF水平、CMI、NFS值升高是影响老年NAFLD患者颈动脉斑块形成的危险因素（P <0.05），血清25-(OH)D水平升高为保护因素（P <0.05）；相关性分析显示，SF与NAFLD患者颈动脉斑块及CMI呈显著正相关（P <0.05），血清25-(OH)D水平与NAFLD患者颈动脉斑块及CMI呈显著负相关（P <0.05）。结论血清SF、25-(OH)D与NAFLD病情进展相关，且可能影响患者颈部血管斑块形成及心脏代谢，可作为NAFLD患者血管病变的诊治观察指标。

关键词：铁蛋白 25-羟维生素D 非酒精性脂肪性肝病颈部血管斑块心脏代谢指相关性

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曲克芦丁调控核因子κB信号通路抑制脑梗死模型大鼠脑损伤及神经元凋亡

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中国组织工程研究 2025年第6期29卷 1137-1143页

作者：刘哲哲于梅青王婷婷张敏李百艳衡水市人民医院神经内科河北省衡水市253800 河北省中医院河北省石家庄市050000

背景:目前已有研究发现曲克芦丁对脑部疾病有明显的改善作用,但是关于曲克芦丁对脑梗死治疗及神经元细胞影响的研究较少。目的:探究曲克芦丁调控核因子κB信号通路对脑梗死大鼠脑损伤及神经元凋亡的作用机制。方法:选取清洁级大鼠50只,... 详细信息

背景:目前已有研究发现曲克芦丁对脑部疾病有明显的改善作用,但是关于曲克芦丁对脑梗死治疗及神经元细胞影响的研究较少。目的:探究曲克芦丁调控核因子κB信号通路对脑梗死大鼠脑损伤及神经元凋亡的作用机制。方法:选取清洁级大鼠50只,将其随机分为健康组、模型组、曲克芦丁+核因子κB激动剂组、曲克芦丁组、核因子κB抑制剂组,后4组均采用动脉结扎法建立脑梗死大鼠模型。健康组及模型组采用等量生理盐水灌胃处理,曲克芦丁+核因子κB激动剂组采用72 mg/kg曲克芦丁灌胃+20 mg/kg RANK腹腔注射干预,曲克芦丁组采用72 mg/kg曲克芦丁灌胃处理,核因子κB抑制剂组采用120 mg/kg核因子κB抑制剂二硫代氨基甲酸吡咯烷进行腹腔注射,各组给药均1次/d,均连续干预30 d。药物干预完成后24 h,采用Zea-longa检测大鼠神经功能损伤,苏木精-伊红染色观察脑组织病理改变,TUNEL法检测神经元凋亡,采用免疫印迹法及PCR检测核因子κB p65、核因子κB p50蛋白及mRNA表达水平。结果与结论:①与健康组比较,模型组大鼠神经功能评分、神经元凋亡率、核因子κB p65、核因子κB p50 mRNA及蛋白表达水平升高(P0.05);④模型组大鼠脑组织有大量神经元细胞胞质空泡化,明显水肿和坏死现象及大量炎性细胞浸润现象;曲克芦丁+核因子κB激动剂组脑组织肿胀减轻,网状结构和固缩细胞减少,仍伴有部分水肿;曲克芦丁组及核因子κB抑制剂组脑组织肿胀和神经元水肿变性、细胞胞质空泡化及神经元细胞核固缩减少,炎症细胞浸润明显降低;⑤提示曲克芦丁能够降低脑梗死大鼠神经功能损伤表达、抑制神经元凋亡及改善其脑组织病理损伤,其作用机制可能与调控核因子κB及相关信号通路的表达相关。

关键词：脑梗死曲克芦丁核因子Kappa B 神经元凋亡脑损伤

miR-34在认知障碍相关病理生理机制中作用的研究进展

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武汉大学学报(医学版) 2025年第01期 112-118页

作者：文萍毛善平武汉大学人民医院神经内科

认知障碍是一类复杂的神经退行性疾病，其病理生理过程涉及多个分子和细胞层面的变化。近年来，微小RNA(microRNA)在认知障碍中的作用逐渐受到关注，其中，miR-34作为一种重要的miRNA，在认知障碍的发病机制和疾病进展中扮演了关键角色... 详细信息

认知障碍是一类复杂的神经退行性疾病，其病理生理过程涉及多个分子和细胞层面的变化。近年来，微小RNA(microRNA)在认知障碍中的作用逐渐受到关注，其中，miR-34作为一种重要的miRNA，在认知障碍的发病机制和疾病进展中扮演了关键角色。miR-34在认知障碍中的表达的变化证明其与认知障碍息息相关，并且miR-34还能通过调控其下游靶基因影响神经元存活、突触可塑性、神经炎症等多个方面，进而参与认知障碍的发生和发展。因此，深入研究miR-34的作用机制及其和认知障碍之间的相互关系，有助于进一步揭示认知功能障碍的发病机制，为未来的治疗策略提供新的思路和方向。

关键词：微小RNA miR-34 认知障碍突触可塑性线粒体稳态

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糖尿病肾病模型:动物模型、二维细胞模拟及三维类器官模型

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中国组织工程研究 2025年第17期29卷 3632-3640页

作者：钱足平陈勇冉燕达静静查艳遵义医科大学贵州省遵义市563000 贵州省人民医院肾内科贵州省贵阳市550002

背景:近几年来,人类多能干细胞衍生的肾类器官及糖尿病肾病啮齿动物模型取得了一定的进展。然而,由于糖尿病肾病发病受环境因素及遗传因素共同作用,发病机制复杂,并且对于此类患者的临床治疗方法需要因人而异。因此,需要开发更灵活和综... 详细信息

背景:近几年来,人类多能干细胞衍生的肾类器官及糖尿病肾病啮齿动物模型取得了一定的进展。然而,由于糖尿病肾病发病受环境因素及遗传因素共同作用,发病机制复杂,并且对于此类患者的临床治疗方法需要因人而异。因此,需要开发更灵活和综合的方法,从而发现强有力的临床前证据,以支持对糖尿病肾病患者进行更有针对性的干预。目的:从动物模型、二维细胞培养模拟及三维类器官模型等方面综述了糖尿病肾病模型的研究进展,为进一步的研究提供线索和思路。方法:以“糖尿病,糖尿病肾病,糖尿病肾病模型,糖尿病肾病动物模型,类器官,肾脏类器官,糖尿病肾病细胞模型,糖尿病肾病病证结合动物模型”为中文检索词,“Diabetes,diabetic nephropathy,diabetic kidney diseases,diabetic nephropathy models,diabetic nephropathy animal models,organoids,diabetic and organoids,diabetic and kidney organoids,kidney organoids,diabetic nephropathy cell models,diabetic nephropathy syndrome combined animal models”为英文检索词,检索中国知网及PubMed数据库,最终纳入101篇文献进行综述分析。结果与结论:糖尿病肾病体内模型和体外模型是深入研究糖尿病肾病发病机制的有力工具。动物模型可以观察到多系统之间的相互作用;二维细胞培养操作简便且成本较低;新兴的肾类器官填补了二维和整体水平之间的空白,无种属差异且一定程度模拟了人肾脏的复杂性。随着类器官技术的不断发展,肾类器官有望为探索糖尿病肾病的发病机制、病理生理过程和药物筛选提供一个新的视角。

关键词：糖尿病肾病肾脏类器官糖尿病肾病类器官细胞模型动物模型中医病证结合糖尿病肾病模型工程化组织构建

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肾动脉狭窄继发肾功能不全1例并文献复习

医学理论与实践 2025年第1期 112-114页

作者：朱晓君陈婷刘金彦济宁医学院临床医学院山东省济宁市第一人民医院肾内科

肾动脉狭窄(renal artery stenosis, RAS)起病隐匿，临床中容易忽视，是引起肾脏血液灌注不足、肾血管性高血压与肾功能进行性下降的常见原因。RAS继发肾功能不全是临床中较为少见的疾病，相关临床报道少之又少。全面分析其发病机制、... 详细信息

肾动脉狭窄(renal artery stenosis, RAS)起病隐匿，临床中容易忽视，是引起肾脏血液灌注不足、肾血管性高血压与肾功能进行性下降的常见原因。RAS继发肾功能不全是临床中较为少见的疾病，相关临床报道少之又少。全面分析其发病机制、危险因素对于疾病的诊断、治疗与改善预后至关重要。

关键词：肾动脉狭窄肾功能不全危险因素 CT血管成像肾动脉造影支架植入预后

继发于中耳乳突炎的局灶性肥厚性硬脑膜炎1例及文献复习

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医学理论与实践 2025年第1期 179-180+174页

作者：蒋心茹明文文四川省德阳市人民医院神经内科

肥厚性硬脑膜炎临床表现多样，常见症状如头痛、脑神经麻痹以及系统性疾病症状(指引起肥厚性硬脑膜炎的继发性因素如感染、肿瘤、风湿免疫相关疾病的症状)。肥厚性硬脑膜炎按照病因学可分为特发性肥厚性硬脑膜炎和继发性肥厚性硬脑膜炎... 详细信息

肥厚性硬脑膜炎临床表现多样，常见症状如头痛、脑神经麻痹以及系统性疾病症状(指引起肥厚性硬脑膜炎的继发性因素如感染、肿瘤、风湿免疫相关疾病的症状)。肥厚性硬脑膜炎按照病因学可分为特发性肥厚性硬脑膜炎和继发性肥厚性硬脑膜炎，其中，抗中性粒细胞胞质抗体(ANCA)相关肥厚性硬脑膜炎和IgG4相关肥厚性硬脑膜炎系特发性肥厚性硬脑膜炎的两大主要病因类型。本文报道了1例继发于中耳乳突炎的局灶性肥厚性硬脑膜炎，并结合相关文献进行分析。

关键词：中耳乳突炎肥厚性硬脑膜炎诊断