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数据融合技术及其在疾病“防诊治康”领域中的应用

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中国公共卫生 2024年第1期40卷 91-97页

作者：李紫琳张媛武睿婕张同超陈佳齐王泽吕明山东大学齐鲁医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学系济南250012 山东大学齐鲁医院临床流行病学研究室济南250012 山东大学临床研究中心济南250012

数据融合技术是将多类同构或异构传感器的冗余或互补信息融合起来,更加精确的评估被观测对象的情况,以便对事物做出正确的判决。随着医学技术的不断进步,不同模态的医学数据迅速增多,相较于单一模态,利用数据融合技术处理多模态医学数据... 详细信息

数据融合技术是将多类同构或异构传感器的冗余或互补信息融合起来,更加精确的评估被观测对象的情况,以便对事物做出正确的判决。随着医学技术的不断进步,不同模态的医学数据迅速增多,相较于单一模态,利用数据融合技术处理多模态医学数据,可获得更加丰富全面的信息,避免信息孤岛,为开展医学研究提供强有力的信息支持。本文概述了数据融合的概念及原理,以及数据融合中不同层级和常用算法的工作原理及优缺点,并详细阐述了数据融合技术在疾病预防、诊断、治疗和康复领域中的应用,以期为充分应用医学数据,实现精准医疗和提高人民健康水平提供新的思路和信息支持。

关键词：数据融合算法医学

基于WGCNA和机器学习筛选帕金森病免疫相关关键基因

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中南大学学报（医学版） 2024年第2期49卷 207-219页

作者：黄一铭王爱民王凤琳徐雅琪张文婧石福艳王素珍山东第二医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053

目的:在帕金森病的发病过程中,免疫系统的异常激活和炎症反应起着重要作用。然而,目前对于免疫相关关键基因在帕金森病发生和发展中的具体作用和作用机制的了解仍然有限。本研究旨在通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expres... 详细信息

目的:在帕金森病的发病过程中,免疫系统的异常激活和炎症反应起着重要作用。然而,目前对于免疫相关关键基因在帕金森病发生和发展中的具体作用和作用机制的了解仍然有限。本研究旨在通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)和机器学习筛选帕金森病免疫相关关键基因。方法:从基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库下载基因芯片数据,采用WGCNA筛选出与帕金森病相关的重要基因模块;将重要模块中的基因导出,绘制帕金森病重要相关基因与免疫相关基因的韦恩图,从而筛选出帕金森病免疫相关基因。采用基因本体(gene ontology,GO)分析和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)深入分析免疫相关基因的功能及参与的信号通路。通过R语言的CIBERSORT包进行免疫细胞浸润分析。采用生物信息学方法和3种机器学习方法[最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)回归、随机森林(random forest,RF)和支持向量机(support vector machine,SVM)]对筛选出的帕金森病免疫相关基因进行进一步筛选研究,绘制4种方法筛选的差异表达基因的韦恩图,筛选交集基因即中心节点(hub node,hub)基因。通过STRING数据库搜索帕金森病hub基因的下游蛋白质,绘制蛋白质互作网络图。结果:筛选出帕金森病重要模块基因中与免疫相关的基因218个,其中45个为上调基因,50个为下调基因。富集分析结果显示218个基因主要在免疫系统对外来物反应和病毒感染通路富集。免疫浸润分析结果表明,CD4^(+)T细胞、NK细胞、CD8^(+)T细胞、B细胞在帕金森病患者样本中的浸润百分率较高,静息NK细胞、静息CD4^(+)T细胞在帕金森病患者样本中显著浸润。4种方法筛选出的hub基因为ANK1基因。交集基因蛋白质互作网络分析结果显示,ANK1基因翻译表达的11个蛋白质主要参与信号转导、铁稳态调节及免疫系统激活等功能。结论:通过WGCNA和机器学习方法,筛选出帕金森病免疫相关关键基因ANK1,该基因可能成为帕金森病诊断和治疗的候选靶点。

关键词：加权基因共表达网络分析机器学习帕金森病免疫 ANK1基因

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基于中断时间序列分析评估河南省新冠病毒感染疫情防控对手足口病流行趋势的影响

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郑州大学学报（医学版） 2024年第4期59卷 459-463页

作者：李言言李鑫潇张冰洁薛晨路王永斌新乡医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室新乡453003

目的:使用中断时间序列分析方法评估河南省新冠病毒感染疫情防控对手足口病流行趋势的影响。方法:从河南省卫生健康委员会法定报告传染病系统中收集2013年1月至2022年9月手足口病发病数据。用河南省2013年1月至2019年6月手足口病发病数... 详细信息

目的:使用中断时间序列分析方法评估河南省新冠病毒感染疫情防控对手足口病流行趋势的影响。方法:从河南省卫生健康委员会法定报告传染病系统中收集2013年1月至2022年9月手足口病发病数据。用河南省2013年1月至2019年6月手足口病发病数据构建ARIMA预测模型,用2019年7月至2019年12月数据验证模型的预测效果。以该模型预测的2020年1月至2022年9月(疫情防控期间)手足口病发病数据为预测值,同期报告数据为真实值,采用阶跃变化、脉冲变化两种评价方法,分析疫情防控对手足口病发病的影响。结果:ARIMA(0,1,1)(0,1,1)12模型的MA1=0.43(t=3.14,P病发病数阶跃变化为-3471(95%CI为-11794~4852)例,估计的脉冲变化为每月9210(95%CI为3153~15268)例。结论:新冠病毒感染疫情防控降低了河南省手足口病发病水平。

关键词：中断时间序列分析自回归综合移动平均模型新冠病毒感染疫情手足口病河南省

TRAF1/C5和TNF-α基因多态性与结核病易感性分析

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中华疾病控制杂志 2024年第2期28卷 138-145页

作者：吴山客骆嘉泽廖寅谦张开漩胡宽邹频昂汪保国曾转萍广东药科大学公共卫生学院流行病学教研室广州510310

目的分析肿瘤坏死因子受体相关蛋白1(tumor necrosis factor receptor-associated factor 1,TRAF1)/补体5(complement component 5,C5)rs10818488和肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-alpha,TNF-α)rs1800629基因多态性、环境因素及其交互作用对结核病(tuberculosis,TB)易感性的影响。方法选取TB多发家庭中TB确诊患者作为TB病例组,当地社区同期体检的健康志愿者作为健康对照(healthy controls,HC)组,与TB组有血缘关系且共同居住者组成家庭密切接触(healthy household contacts,HHC)组。采用logistic回归分析模型分析基因型和环境因素与TB的关联,叉生分析结合logistic回归分析模型分析基因与环境交互作用。结果年龄>45岁(χ^(2)=7.90,OR=2.28,95%CI:1.28~4.04,P=0.005)、吸烟(χ^(2)=15.27,OR=4.70,95%CI:2.16~10.22,P病风险。吸烟(χ^(2)=13.94,OR=3.58,95%CI:1.83~7.01,P室环境卫生较差(χ^(2)=15.31,OR=3.20,95%CI:1.79~5.73,P病风险。TRAF1/C5 rs10818488位点中,携带AG基因型(共显性及超显性模型)、GG基因型(共显性模型)和AG-GG基因型(显性模型)增加HHC组和HC组患TB风险。TNF-αrs1800629位点与TB易感性暂未显示存在关联。分析基因与环境交互作用,在TB组和HHC组间,TRAF1/C5 rs10818488位点AG-GG基因型与吸烟存在协同作用;而在TB组和HC组间,rs10818488位点AG-GG基因型与吸烟和居室环境卫生较差存在协同作用,与居住地存在相乘交互作用,均使TB发病风险提高。结论TRAF1/C5 rs10818488位点的基因多态性可能与TB发病风险有关,且其与吸烟、居住地、居室环境卫生存在交互作用,共同影响TB的易感性。

关键词：肿瘤坏死因子受体相关蛋白1 补体5 肿瘤坏死因子-α 基因多态性结核病

睡眠质量低下与创伤患者创伤后应激障碍的发生相关

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南方医科大学学报 2024年第6期44卷 1166-1172页

作者：袁萍胡秀莉漆国佳代秀褚相远陈卫航石修权遵义医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室贵州遵义563006 习水县人民医院公共卫生科贵州遵义564600

目的阐明创伤患者睡眠质量及创伤后应激障碍(PTSD)临床流行病学特征,系统分析睡眠质量对创伤住院患者PTSD发生的作用,为PTSD患者的临床早期识别提供参考。方法收集256例于2021年10月~2022年11月在遵义市4所综合医院招募创伤住院患者,... 详细信息

目的阐明创伤患者睡眠质量及创伤后应激障碍(PTSD)临床流行病学特征,系统分析睡眠质量对创伤住院患者PTSD发生的作用,为PTSD患者的临床早期识别提供参考。方法收集256例于2021年10月~2022年11月在遵义市4所综合医院招募创伤住院患者,226例完成PTSD调查评估。采用PSQI量表结合智能手环睡眠监测评估患者创伤前后睡眠质量;采用PCL-C量表随访测评PTSD发生情况。结果创伤患者1个月后PTSD检出率为19.47%,3个月后PTSD检出率为17.61%。在睡眠质量方面,PTSD患者创伤前PSQI量表评分显著增高(P<0.001),其中患者PTSD发生前睡眠异常检出率为72.73%。在创伤后(入院7 d内)睡眠质量监测方面,PTSD患者评分降低,夜间清醒次数增多(P<0.05)。在创伤1个月与3个月后睡眠质量方面,PTSD患者PSQI量表评分均高于非PTSD人群(P<0.05)。结论创伤患者中创伤前睡眠质量差者更容易发生PTSD。

关键词：创伤创伤后应激障碍睡眠障碍影响因素

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Klotho蛋白与充血性心力衰竭的关联及炎症的介导作用

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郑州大学学报（医学版） 2024年第5期59卷 639-645页

作者：曹青青宋宇郇昌盛贾泽鑫高倩王重建毛振兴侯建刘晓田霍文倩郑州大学公共卫生学院环境卫生学教研室郑州450001 郑州大学公共卫生学院流行病学教研室郑州450001 郑州大学公共卫生学院计算机与卫生统计学教研室郑州450001

目的:探讨Klotho蛋白与充血性心力衰竭(CHF)的关联及炎症的介导作用。方法:选取美国国家健康与营养调查2007-2016年的10762例研究对象(男5240例,女5522例),根据Klotho蛋白的四分位数将研究对象分为4组(Q1、Q2、Q3、Q4组),采用Logistic... 详细信息

目的:探讨Klotho蛋白与充血性心力衰竭(CHF)的关联及炎症的介导作用。方法:选取美国国家健康与营养调查2007-2016年的10762例研究对象(男5240例,女5522例),根据Klotho蛋白的四分位数将研究对象分为4组(Q1、Q2、Q3、Q4组),采用Logistic回归模型分析Klotho蛋白及炎症生物标志物与CHF的关系,采用广义线性模型分析Klotho蛋白与炎症生物标志物的关联,中介分析用于评估炎症生物标志物在Klotho蛋白与CHF关联中的中介效应。结果:Klotho蛋白可降低CHF风险(OR=0.695,95%CI为0.513~0.942),且在男性中更显著(OR=0.604,95%CI为0.406~0.898)。炎症生物标志物在Klotho蛋白与CHF的关联中具有中介效应,其中中性粒细胞计数与淋巴细胞计数比值的中介作用最大,在总人群和男性中分别为11.93%和9.92%,中介效应β(95%CI)分别为-0.047(-0.078~-0.026)和-0.050(-0.093~-0.021)。结论:高水平的Klotho蛋白、低水平的炎症生物标志物可降低CHF风险。炎症生物标志物部分介导了Klotho蛋白对CHF的保护作用。

关键词： Klotho蛋白充血性心力衰竭炎症生物标志物中介作用

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河南省农村居民胎儿期饥荒暴露与成年期肥胖的关联及体力活动的影响

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郑州大学学报（医学版） 2024年第2期59卷 205-211页

作者：贾泽鑫宋宇王冕郇昌盛曹青青高倩毛振兴王重建霍文倩郑州大学公共卫生学院环境卫生学教研室郑州450001 郑州大学公共卫生学院计算机与卫生统计学教研室郑州450001 郑州大学公共卫生学院流行病学教研室郑州450001

目的:探讨河南省农村居民胎儿期饥荒暴露与成年期肥胖的关联,并分析体力活动对这种关系的影响。方法:从“河南省农村队列研究”中选取9 069人为研究对象,根据出生日期分为胎儿期饥荒暴露组和非饥荒暴露组。采用国际体力活动问卷(IPAQ)... 详细信息

目的:探讨河南省农村居民胎儿期饥荒暴露与成年期肥胖的关联,并分析体力活动对这种关系的影响。方法:从“河南省农村队列研究”中选取9 069人为研究对象,根据出生日期分为胎儿期饥荒暴露组和非饥荒暴露组。采用国际体力活动问卷(IPAQ)评估体力活动水平,计算总体力活动值。采用Logistic回归模型分析胎儿期饥荒暴露与不同类型肥胖的关系,采用线性回归模型分析胎儿期饥荒暴露与肥胖指标[BMI、腰围(WC)、腰高比(WHtR)、腰臀比(WHR)]的关系,采用广义线性模型分析体力活动对胎儿期饥荒暴露与肥胖关系的影响。结果:胎儿期饥荒暴露与以WC、WHR和WHtR定义的肥胖均有关联,OR(95%CI)值分别为1.23(1.07~1.40)、1.41(1.23~1.61)和1.26(1.09~1.45),而且在女性中的关联更强;胎儿期饥荒暴露与肥胖指标WC、WHR和WHtR也存在类似的正关联关系。胎儿期饥荒暴露对肥胖及肥胖相关指标的不利影响随体力活动水平的升高而降低。结论:河南省农村居民胎儿期饥荒暴露增加成年期肥胖风险,适当的体力活动可在一定程度上减轻这一风险。

关键词：饥荒肥胖体力活动农村居民河南省

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国内外医学术语相关标准现状及发展分析

中国中西医结合杂志 2024年第8期44卷 997-1003页

作者：武睿婕吕明陈佳齐张同超王泽陈浩李紫琳李雨菲张媛山东大学齐鲁医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学系济南250012 山东大学齐鲁医院临床流行病学研究室济南250012 山东大学临床研究中心济南250012

医学术语是医学领域中用以沟通交流的专门用语,用来正确标记临床诊疗过程中的现象、特征和过程等^([1])。作为专业性和科学性较强的沟通和表达方式,术语是医学传播的重要基础和媒介,对于医学的发展起着关键作用^([2])。

关键词：医学术语临床诊疗过程医学领域专门用语沟通交流医学传播专业性

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临床数据交换标准协会体系及其应用现状

中国公共卫生 2024年第2期40卷 227-233页

作者：王泽陈浩陈佳齐武睿婕李紫琳李雨菲张媛吕明山东大学齐鲁医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学系济南250012 山东大学齐鲁医院临床流行病学研究室济南250012 山东大学临床研究中心济南250012

临床数据交换标准协会(CDISC)是全球性的非营利性标准开发组织,其基于临床研究的共识创建了一套标准体系,主要包括核心标准、数据交换标准、受控术语集和治疗领域标准四大方面,各类标准在研究中的角色不同,贯穿于研究流程的各个环节。... 详细信息

临床数据交换标准协会(CDISC)是全球性的非营利性标准开发组织,其基于临床研究的共识创建了一套标准体系,主要包括核心标准、数据交换标准、受控术语集和治疗领域标准四大方面,各类标准在研究中的角色不同,贯穿于研究流程的各个环节。伴随着自动化软件的开发,国际监管机构和大型药物研发企业已实现CDISC标准的应用,该标准体系在国内逐渐得到认可和推广,专业技术服务亦正在逐步开展和普及。本文详细介绍了CDISC标准体系下的各类标准及其关系和应用流程,总结国内外应用现状并提出建议,以期为相关研究的标准化建设提供重要参考。

关键词：临床数据交换标准协会(CDISC) 体系应用现状