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靶向大肠埃希菌外膜蛋白的18β-甘草次酸的筛选及抗菌活性评价系统构建

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第5期44卷 390-395页

作者：王星媛李清蓉韩晓晨张续严王哲秦有才储引娣范恩国中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院病原学系北京100005

目的以大肠埃希菌桶状蛋白组装复合物的核心组分BamA和BamD作为靶点,从甘草提取物中进行抗菌活性成分的筛选,以应对日益严峻的抗生素耐药问题。方法使用亲和超滤联合高效液相色谱-质谱(high performance liquid chromatography-mass spe... 详细信息

目的以大肠埃希菌桶状蛋白组装复合物的核心组分BamA和BamD作为靶点,从甘草提取物中进行抗菌活性成分的筛选,以应对日益严峻的抗生素耐药问题。方法使用亲和超滤联合高效液相色谱-质谱(high performance liquid chromatography-mass spectrometry,HPLC-MS)技术,从甘草提取物中筛选能够与BamA和BamD相互作用的化合物。用荧光定量PCR检测化合物处理后大肠埃希菌外膜蛋白bamA和bamD基因表达量的变化,并且利用离体重组系统检测化合物对于β桶状蛋白组装(β-barrel assembly machinery,BAM)复合物整合外膜蛋白功能的影响,最后利用SDS在细菌细胞内的积累情况检测化合物处理过后细菌细胞膜完整性变化。结果生物亲和超滤联合HPLC-MS筛选发现18β-甘草次酸可以与BamD发生相互作用,经18β-甘草次酸处理后,大肠埃希菌bamA基因表达水平升高1.5倍,bamD基因表达水平升高2倍,但是,离体重组系统检测未观察到18β-甘草次酸对BAM复合物的插膜功能具有抑制效果,细胞膜完整性检测实验也未发现18β-甘草次酸对于大肠埃希菌细胞膜的破坏。结论以BamA和BamD蛋白作为靶点,建立了使用亲和超滤联合HPLC-MS进行天然产物筛选的方法。筛选得到18β-甘草次酸能够与BamD相互作用并能够影响大肠埃希菌外膜蛋白的表达,故本研究所建立的筛选和实验流程对于以外膜蛋白为靶点的、其他来源的新型抗菌药物的筛选具有良好的借鉴价值,且本研究也提示在筛选过程中,相关靶点的选择对成功筛选到相应的天然产物至关重要。

关键词： 18β-甘草次酸 β桶状蛋白组装复合物离体重组系统

羧胺三唑通过下调细胞因子和抗菌肽S100A7的表达改善实验性银屑病

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药学学报 2024年第11期 3085-3093页

作者：刘婧雯杨梅朱蕾中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院

应用咪喹莫特 (imiquimod， IMQ) 诱导的银屑病小鼠模型以及五联因子 (a mixture of five proinflammatory cytokines， M5) 诱导的银屑病角质形成细胞模型，评价羧胺三唑 (carboxyamidotriazole， CAI) 对银屑病的治疗效果和可能机制... 详细信息

应用咪喹莫特 (imiquimod， IMQ) 诱导的银屑病小鼠模型以及五联因子 (a mixture of five proinflammatory cytokines， M5) 诱导的银屑病角质形成细胞模型，评价羧胺三唑 (carboxyamidotriazole， CAI) 对银屑病的治疗效果和可能机制。银屑病皮损面积和疾病严重程度 (psoriasis area and severity index， PASI) 评分评估小鼠皮损严重程度，苏木素-伊红 (hematoxylin-eosin staining， HE) 染色观察皮肤病理学变化，酶联免疫吸附法 (enzyme-linked immunosorbent assay， ELISA) 检测皮肤中细胞因子水平，转录组测序分析差异表达基因，实时荧光定量PCR (real-time quantitative PCR， qPCR) 检测mRNA表达。动物实验经中国医学科学院基础医学研究所实验动物管理与伦理委员批准 (批准号: ACUC-A02-2022-115)。结果显示，与IMQ组相比， CAI显著改善小鼠银屑病样皮损，降低PASI评分，减轻皮损病理变化和评分，减少皮损处促炎细胞因子水平，转录组分析结果显示CAI可能通过调节角质形成细胞及其介导的表皮角化而发挥作用， qPCR验证发现CAI能够下调差异表达基因S100a7; 进一步使用M5刺激HaCaT细胞构建银屑病角质形成细胞模型， CAI能够抑制M5诱导的S100a7以及细胞因子的mRNA水平。综上， CAI可能对银屑病具有良好治疗作用，其作用机制与调节角质形成细胞功能以及减少细胞因子和S100a7表达有关。

关键词：羧胺三唑银屑病咪喹莫特 HaCaT细胞细胞因子 S100A7

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男性生殖系统:病毒的储存库与性传播

中国科学:生命科学 2024年

作者：张静王菲王宇韩代书中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院

近年来新冠等多种病毒在全球范围内暴发流行,进一步加深了人们对病毒性传染病的担忧.除了不同病毒引起的主要疾病外,人们还担忧一个共性问题:病毒对男性生殖系统(male reproductive system, MRS)的易感性,及其损害男性生殖与性传播风险.... 详细信息

近年来新冠等多种病毒在全球范围内暴发流行,进一步加深了人们对病毒性传染病的担忧.除了不同病毒引起的主要疾病外,人们还担忧一个共性问题:病毒对男性生殖系统(male reproductive system, MRS)的易感性,及其损害男性生殖与性传播风险. MRS为了保护生殖细胞不受免疫系统的攻击,建立了免疫豁免环境.睾丸是典型的免疫豁免器官,附睾也具有免疫豁免特性.然而免疫豁免环境也可成为微生物逃避免疫监视的庇护所,特别是多种病毒容易感染MRS,并逃避免疫系统的清除.病毒在睾丸中可以长期存在,也可以感染其他男性生殖器官,主要包括附睾、精囊和前列腺等.为了抵抗入侵的病毒,这些器官建立了独特的天然抗病毒机制.尽管如此,一些病毒仍可以诱发MRS炎症,影响男性生殖健康.此外,感染MRS的病毒还可能脱落到精液中,从而发生性传播. MRS的免疫环境、病毒感染机制、组织特异性的天然抗病毒反应以及性传播风险,是人们长期关注的重要研究领域.本文将综述该领域的研究进展,提出有待研究的主要方向,为相关领域的研究者提供参考.

关键词：病毒男性生殖系统免疫豁免天然抗病毒反应性传播

低压低氧刺激后小鼠小脑中RNA m6A甲基化调控因子表达的变化

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中华病理学杂志 2024年第5期53卷 452-457页

作者：肖灵凤马春卉赵顺莉李晴刘春英牛亚梅佟伟民中国医学科学院基础医学研究所暨北京协和医学院基础学院病理学系北京100005

目的探讨RNA m6A甲基化在低压低氧引起的小脑发育障碍中可能发挥的作用。方法将出生后5 d的C57/BL6小鼠放置于低压低氧饲养舱中连续处理9 d后,首先通过体重、脑重以及HE染色的方式来初步分析小鼠小脑发育情况;其次,利用免疫组织化学和... 详细信息

目的探讨RNA m6A甲基化在低压低氧引起的小脑发育障碍中可能发挥的作用。方法将出生后5 d的C57/BL6小鼠放置于低压低氧饲养舱中连续处理9 d后,首先通过体重、脑重以及HE染色的方式来初步分析小鼠小脑发育情况;其次,利用免疫组织化学和免疫荧光染色法检测小脑中不同类型细胞特异性标志物的表达以解析其细胞结构的紊乱程度;然后利用即时荧光定量聚合酶链反应、Western blot和免疫组织化学染色方法检测小鼠小脑中RNA m6A主要调控因子的表达变化。结果相比于对照组小鼠,低压低氧小鼠体重、脑重以及小脑体积显著减小(P<0.01);不同类型细胞特异性标志物的免疫染色结果显示,NeuN(成熟神经元)表达下降,Calbindin-D28K(浦肯野细胞)和胶质纤维酸性蛋白(星形胶质细胞)的表达下降(P<0.01),且细胞分布紊乱;RNA m6A主要调控因子的表达分析结果显示,甲基转移酶METTL3在低压低氧小鼠小脑中的表达显著下调(P<0.05)。结论低压低氧刺激会造成小鼠小脑发育障碍,成熟神经元、浦肯野细胞和星形胶质细胞结构异常;与常压常氧小鼠相比,低压低氧刺激后小鼠小脑METTL3表达下降,提示其介导的RNA m6A甲基化可能在低压低氧引起的小脑发育障碍过程中发挥重要的作用。

关键词：小脑细胞低氧 RNA甲基化甲基转移酶类

中国嗜酸性粒细胞增多症诊断和治疗指南(2024版)

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中华血液学杂志 2024年第1期45卷 1-7页

作者：中华医学会血液学分会白血病淋巴瘤学组肖志坚不详中国医学科学院血液病医院(中国医学科学院血液学研究所)

嗜酸性粒细胞增多症包括一组非血液系统(继发或反应性)和血液系统(原发或克隆性)疾病,该组疾病可能伴有器官受损。基于新的临床研究数据和对疾病分子遗传学解析结果,2022年世界卫生组织(WHO)和国际共识分型(ICC)对嗜酸性粒细胞增多性疾... 详细信息

嗜酸性粒细胞增多症包括一组非血液系统(继发或反应性)和血液系统(原发或克隆性)疾病,该组疾病可能伴有器官受损。基于新的临床研究数据和对疾病分子遗传学解析结果,2022年世界卫生组织(WHO)和国际共识分型(ICC)对嗜酸性粒细胞增多性疾病的诊断和分型标准进行了更新。本指南是在《嗜酸性粒细胞增多症诊断和治疗中国专家共识(2017年版)》基础上的更新,旨在为我国血液学工作者提供一个规范的嗜酸性粒细胞增多症的诊断程序、实验室检查、诊断标准和治疗原则。

关键词：嗜酸性粒细胞增多症诊断治疗指南

基于行政管理数据识别慢性病发病病例背景下确定洗脱期时长最佳策略的系统综述

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中国全科医学 2024年第4期27卷 460-467页

作者：杨文怡王敬鑫艾丽梅万霞中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院北京市100005

背景使用行政管理数据时,确立清晰、适当的慢性病洗脱期时长是正确确定反复就医的慢性病患者发病时点、确定新发病例的基础。目的通过系统文献回顾,综述确定洗脱期时长的方法,以期为我国研究者后续使用行政管理数据识别慢性病新发病例... 详细信息

背景使用行政管理数据时,确立清晰、适当的慢性病洗脱期时长是正确确定反复就医的慢性病患者发病时点、确定新发病例的基础。目的通过系统文献回顾,综述确定洗脱期时长的方法,以期为我国研究者后续使用行政管理数据识别慢性病新发病例时确认洗脱期长短、正确识别新发病例提供思路。方法于2021年10月,系统检索PubMed、Web of Science、EmBase、中国知网、维普中文科技期刊全文数据库、万方知识服务平台,获取有关利用行政管理数据探究慢性病发病、患病情况的文献,检索时限均为建库至2022-10-01。由两名研究者独立筛选文献并提取相关信息,并采用定性研究报告评价标准(SRQR)评价文献方法学质量后,使用描述性分析法总结洗脱期时长的确定方法。结果共纳入26篇文献,纳入文献的SRQR评分均≥15分,方法学质量较好。文献所使用的数据主要来自加拿大、美国、澳大利亚等行政管理数据完整、丰富的国家(地区),聚焦的疾病包括糖尿病、肿瘤、精神分裂症等多种慢性病。研究指出,设定合适的洗脱期时长是准确识别发病病例的基础。目前,文献中确定洗脱期时长的方法主要包括直接限定法、一致性检验法和逆向生存函数法三大类,其中最常用的方法是直接限定法,逆向生存曲线法的使用率相对较低。结论直接限定法、一致性检验法和逆向生存函数法均有相应的优势和局限性,方法的选择标准、判断标准和稳定性有待进一步探究。

关键词：慢性病行政管理数据医疗保险数据洗脱期发病率患病率

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知识图谱驱动的人类蛋白质组知识注释与知识探索研究

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中国生物医学工程学报 2024年第3期43卷 315-326页

作者：袁一泽王志刚王哲史涪仁杨晟杨啸林中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005

蛋白质组知识注释能够帮助科研人员从已有知识中凝练出重要的科学假说,传统的蛋白质组知识注释知识单一且多为简单的知识检索和罗列汇总,知识的综合性和系统性不足。为此,本研究展开知识图谱驱动的人类蛋白质组知识注释与知识探索研究... 详细信息

蛋白质组知识注释能够帮助科研人员从已有知识中凝练出重要的科学假说,传统的蛋白质组知识注释知识单一且多为简单的知识检索和罗列汇总,知识的综合性和系统性不足。为此,本研究展开知识图谱驱动的人类蛋白质组知识注释与知识探索研究。综合13种生物医学本体和数据库资源,依托图数据库Neo4j构建知识图谱(BMKG)管理生物医学知识;结合先验知识和中心度等图算法,从多层面多角度设计元路径,制定知识注释方案;实现相似度计算和链接预测算法,执行node2vec图嵌入,为辅助知识探索分析做准备。本研究所得BMKG图谱融合了13种生物医学知识资源,共9种2508348个节点,20种25362594条关系。以肾细胞癌蛋白质组知识注释为例,BMKG的知识注释方案能够从多层面多角度展开注释,实现对其关联的通路、药物和表型等知识的归纳提炼。此外,基于BMKG能够展开药物-疾病关联预测等知识探索研究,疾病知识的聚类结果与Mondo本体结构有很好的一致性。本研究建设了网站提供在线服务,网址:http://***,包括三大应用模块:知识检索、知识注释和知识分析。综上,本研究表明知识图谱能够为人类蛋白质组知识注释研究提供新的见解。

关键词：知识图谱蛋白质组知识注释知识探索

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尿液蛋白质组学对间质性肺病诊断价值

中华检验医学杂志 2024年第10期47卷 1159-1168页

作者：魏利龙周允王立伟宋清挽郭正光曹永彤中日友好医院检验科北京中国医学科学院基础医学研究所北京

目的评价尿液蛋白质组学在间质性肺病中的诊断价值。方法病例对照研究, 选择2023年3月12日至4月15日中日友好医院明确诊断间质性肺病患者10例, 年龄(56.70±14.78)岁, 肺部感染患者9例(年龄51.30±23.26岁);中日友好医院体检中心体检者... 详细信息

目的评价尿液蛋白质组学在间质性肺病中的诊断价值。方法病例对照研究, 选择2023年3月12日至4月15日中日友好医院明确诊断间质性肺病患者10例, 年龄(56.70±14.78)岁, 肺部感染患者9例(年龄51.30±23.26岁);中日友好医院体检中心体检者健康对照10名(年龄50.20±6.07岁), 使用液质联用蛋白质组学技术对三组人群的尿液进行尿液蛋白质组研究。基于数据非依赖型采集质谱定量技术对三组人群进行比较, 组间采用t检验, 并进行相关功能分析。结果共鉴定2 730个蛋白;尿液蛋白质组基于正交信号校正的偏最小二乘判别分析可以对三组人群进行明显区分;对蛋白进行定量比较, 差异蛋白筛选标准为P3/2或<2/3, 发现间质性肺病患者与健康人中存在49个差异蛋白, 间质性肺病患者与感染性疾病患者中存在57个差异蛋白;对差异蛋白进行GO和KEGG分析, 显著富集到ECM受体相互作用、补体和凝血级联通路等通路。结论尿液蛋白质组学能够有效地区分间质性肺病患者和肺部感染患者及正常人群, 本实验中鉴定的差异蛋白具有一定的诊断性能(AUC值0.68～1.00), 可以作为潜在的疾病标记物用于间质性肺病的诊断。

关键词：肺疾病, 间质性尿液蛋白质组学疾病标记物

超声心动图联合梅奥分期提高对轻链型心肌淀粉样变早期死亡高风险患者的识别

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科学通报 2024年第3期69卷 439-446页

作者：黎婧怡杨尹鉴邱露虹郭帆路丹胡婷婷沈恺妮徐希奇田庄张抒扬荆志成中国医学科学院/北京协和医学院北京协和医院心内科北京100730 中国医学科学院/北京协和医学院疑难重症及罕见病国家重点实验室医学科学研究中心北京100730 中国医学科学院/北京协和医学院北京协和医院血液科北京100730

轻链型心肌淀粉样变(AL-CA)是一类预后极差的浸润性心脏病,识别高危患者并尽早开展治疗,是改善预后的关键.梅奥分期是目前最常用的危险分层体系,但相同分期患者预后存在较大差异.本研究通过连续入选2020年5月~2022年12月间在北京协和医... 详细信息

轻链型心肌淀粉样变(AL-CA)是一类预后极差的浸润性心脏病,识别高危患者并尽早开展治疗,是改善预后的关键.梅奥分期是目前最常用的危险分层体系,但相同分期患者预后存在较大差异.本研究通过连续入选2020年5月~2022年12月间在北京协和医院确诊为AL-CA患者76名,旨在探讨超声心动图常规测量指标能否在现有危险分层基础上提高对AL-CA早期死亡高风险患者的识别.本研究中位随访时间为10月(5, 20), 20名患者6个月内死亡即早期死亡,左房前后径、左室射血分数(LVEF)、E/e′比值、(E/e′)/LVEF、梅奥2004分期Ⅲb期均对AL-CA患者6个月内死亡有预测价值(P基础上提高对早期死亡高风险患者的预测价值.

关键词：心肌疾病淀粉样变性超声心动图预后