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昆明市一起聚集性发热疫情中腺病毒3型Penton base、Hexon和Fiber基因遗传进化分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第3期44卷 241-248页

作者：刘艳艳古文鹏段忠文王钰龚娇茶琦雁吴林蔚侯敏昆明市疾病预防控制中心微生物检验科昆明650228 云南省疾病预防控制中心急性传染病防制所昆明650022 昆明市呈贡区疾病预防控制中心检验科昆明650500 玉溪市疾病预防控制中心卫生监测检验科玉溪678400

目的对昆明市一起聚集性发热疫情样本进行腺病毒检测和遗传进化分析。方法采集典型发热患者咽拭子标本,使用微流体芯片技术进行30种常见呼吸道传染病病原体核酸检测。对腺病毒核酸阳性标本使用Nanopore三代高通量测序技术进行Penton bas... 详细信息

目的对昆明市一起聚集性发热疫情样本进行腺病毒检测和遗传进化分析。方法采集典型发热患者咽拭子标本,使用微流体芯片技术进行30种常见呼吸道传染病病原体核酸检测。对腺病毒核酸阳性标本使用Nanopore三代高通量测序技术进行Penton base、Hexon和Fiber三个重要基因全长序列扩增、测定和分型鉴定,构建系统进化树,开展分子变异、遗传进化等分析。结果共采集5份标本,均检出呼吸道腺病毒及流感嗜血杆菌。对腺病毒进行Nanopore三代基因测序最终均获得Penton base、Hexon和Fiber基因全长编码区核苷酸序列,5份标本之间3个基因核苷酸相似性依次为100.0%、99.9%~100.0%和100.0%,氨基酸同源性均为100.0%;与HAdV3原型株(AY599834)核苷酸相似性最高,分别为98.6%、98.7%和98.9%。系统发育分析表明,3个基因系统进化树分析结果基本一致,人腺病毒3型(HAdV3)原型株单独一支,本研究中HAdV3序列均划分在同一进化分支上,与较早年份国外及中国台湾毒株亲缘关系较远,与近年国内外毒株亲缘关系较近,与2019年日本株(LC703523)和中国广州株(MZ540961)高度同源。与原型株比较分析昆明HAdV3氨基酸突变位点,Penton base有5处变异;Hexon有10处变异;Fiber有11处变异。结论本起疫情中的腺病毒在Penton base、Hexon和Fiber基因全长序列中型别分型结果一致,为P3H3F3型,与包括原型株在内的国内外HAdV3毒株显示出非常小的遗传变异。与原型株相比发生了多处氨基酸位点突变,并且多数氨基酸位点变异发生在蛋白质的高变区或功能区,其中Hexon蛋白中M7L为昆明序列独有氨基酸突变位点。

关键词：人腺病毒3型五邻体基座蛋白六邻体蛋白纤维蛋白遗传进化

2014—2021年云南省水产品病原生物监测结果分析

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中国食品卫生杂志 2024年第1期36卷 49-55页

作者：陈志辉汤晓召杨祖顺杨菁马妮范璐昆明市疾病预防控制中心云南昆明650028 云南省疾病预防控制中心云南昆明650022

目的分析云南省水产品病原生物污染情况,为食源性疾病防控策略提供依据。方法2014—2021年,按年度对云南省16个州市水产品开展随机抽样监测,以统计学方法分析不同病原生物在水产品类型、地区、季节分布上的差异以及可能的污染途径。结果... 详细信息

目的分析云南省水产品病原生物污染情况,为食源性疾病防控策略提供依据。方法2014—2021年,按年度对云南省16个州市水产品开展随机抽样监测,以统计学方法分析不同病原生物在水产品类型、地区、季节分布上的差异以及可能的污染途径。结果在3540份生鲜、冷鲜、冷冻(糜制品)、即食4类水产样品中,检出9种致病菌、1种寄生虫,总检出率为10.8%(383/3540),致病菌中检出较多的为副溶血性弧菌(10.3%,139/1347)、单核细胞增生李斯特菌(4.2%,41/980)、沙门菌(3.3%,32/980);寄生虫中广州管圆线虫在中间宿主中感染较为普遍(9.0%,167/1861),其他病原生物检出率较低。病原生物在不同类型水产品中检出率差异有统计学意义(χ^(2)=34.077,P检验显示,部分病原生物在地区分布、产地及采样场所存在有检出差异;副溶血性弧菌(χ^(2)=15.850,P=0.001)、溶藻弧菌(χ^(2)=8.400,P=0.029)检出率在季度分布上差异有统计学意义。结论云南省水产品病原生物污染较普遍,存在引发食源性疾病的风险。改变饮食习惯、改善水产品储运条件及加强病原生物监测是降低食源性疾病发病率的有效途径。

关键词：水产品病原生物云南省风险监测污染食源性致病菌寄生虫

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2023年浙江省钩端螺旋体病监测分析

中华地方病学杂志 2024年第7期43卷 559-563页

作者：郭颂姚文武刘营施旭光任江萍张蓉罗明宇杨章女孙继民浙江省疾病预防控制中心传染病预防控制所杭州310051 浙江省疾病预防控制中心微生物检验所杭州310051

目的分析浙江省人群钩端螺旋体病(钩体病)流行病学和宿主动物病原学资料,为制定钩体病防控策略提供科学依据。方法2023年浙江省人群钩体病监测数据来源于中国疾病预防控制信息系统,采用描述性流行病学方法进行分析。自浙江省疾病预防控... 详细信息

目的分析浙江省人群钩端螺旋体病(钩体病)流行病学和宿主动物病原学资料,为制定钩体病防控策略提供科学依据。方法2023年浙江省人群钩体病监测数据来源于中国疾病预防控制信息系统,采用描述性流行病学方法进行分析。自浙江省疾病预防控制中心《浙江省钩端螺旋体病监测项目》收集鼠肾、蛙肾、猪肾和鸭肾钩端螺旋体病原体分离培养、核酸和鸭血清抗体检测结果,分析人群和宿主动物钩端螺旋体流行菌群携带和变动情况。结果2023年浙江省共报告钩体病病例83例,发病率为0.1262/10万,年龄为(62.66±11.31)岁,其中男性68例、女性15例。浙江省11个地市均有钩体病病例报告,主要集中在浙江省南部的温州市、丽水市和台州市(共68例),占总病例数的81.93%。8-10月为钩体病高发月份(共70例),占总病例数的84.34%。病例的男女比例为4.53∶1.00,且年龄均≥20岁,45~79岁中老年为高发人群(共77例),占总病例数的92.77%。病例职业以农民为主(54例),占总病例数的65.06%。钩体病病例发病至首诊时间最短为0 d,最长为13 d;首诊至确诊时间最短为0 d,最长为16 d。72.29%的钩体病病例(60例)发病前1个月内有田间劳动或可疑疫水接触史,18.07%的钩体病病例(15例)发病前1个月内有鼠、青蛙、猪、牛、狗、鱼、鸭等动物及其排泄物接触史。宿主动物钩端螺旋体平均核酸阳性率:鼠肾为5.92%(31/524)、蛙肾为6.74%(36/534)、猪肾为0.66%(1/151);鸭肾钩端螺旋体分离培养,核酸检测和鸭血抗体检测均为阴性。人群携带钩端螺旋体菌群为黄疸出血群(3份)和七日热群(4份)等,宿主动物携带钩端螺旋体菌群为黄疸出血群(3份)。结论浙江省钩体病疫情主要发生在夏、秋季,发病区域主要集中在浙江省南部地区,发病人群以中老年男性为主。人群携带钩端螺旋体菌群仍以黄疸出血群和七日热群为主,宿主动物携带菌群为黄疸出血群。

关键词：钩端螺旋体病流行特征血清群

2023年杭州市某区地表水和城市管网水中抗生素分布特征及风险评估

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中国公共卫生 2024年第1期40卷 75-81页

作者：洪宇伟李江波姜丽丹刘丹丹王军淋富阳区疾病预防控制中心检验科杭州311400 杭州医学院杭州310053 浙江省疾病预防控制中心杭州310051

目的了解浙江省杭州市某区地表水和城市管网水中抗生素的分布特征,评估抗生素对生态和人体的健康风险。方法2023年2—3月,在富春江流域19个采样点,采集水样,平行采样各2份,共38份。在某区29个采样点,采集相应的市政自来水厂的出厂水和... 详细信息

目的了解浙江省杭州市某区地表水和城市管网水中抗生素的分布特征,评估抗生素对生态和人体的健康风险。方法2023年2—3月,在富春江流域19个采样点,采集水样,平行采样各2份,共38份。在某区29个采样点,采集相应的市政自来水厂的出厂水和管网末梢水,平行采样各2份,共58份。利用固相萃取-超高效液相色谱串联质谱法(SPE-UPLC-MS/MS)分析杭州某区地表水和城市管网水中6类52种抗生素的浓度水平和分布特征,并采用风险熵值法评估水体中抗生素对生态环境和人体健康的潜在风险。结果在杭州某区地表水中检出25种抗生素,总抗生素浓度水平为ND~463.66 ng/L。在城市管网水中检出6种抗生素分别为磺胺吡啶(检出浓度ND~0.72 ng/L,检出率93.10%)、磺胺氯哒嗪(检出浓度ND~1.16 ng/L,检出率86.21%)、红霉素(检出浓度ND~0.60 ng/L,检出率6.90%)、克拉霉素(检出浓度ND~0.75 ng/L,检出率27.59%)、罗红霉素(检出浓度ND~0.68 ng/L,检出率34.48%)、脱水红霉素(检出浓度ND~0.96 ng/L,检出率86.21%)。生态风险评估表明,杭州市某区地表水中抗生素的生态风险熵值范围为0~10.56。其中磺胺嘧啶、氧氟沙星、红霉素、克拉霉素和脱水红霉素对该流域生态系统具有较高风险,其余抗生素则处于低风险或无风险暴露状态。人体健康风险评估表明,城市管网末梢水中6种抗生素的人体健康风险熵值为4.45×10^(-7)~1.68×10^(-4),均市某区地表水中具有较高风险,对生活在该水域的敏感水生生物存在潜在的生态风险,应予以关注。城市管网末梢水中仅检出痕量抗生素,不会对人体产生健康风险。

关键词：抗生素地表水管网水风险评估杭州市

我国布鲁氏菌病重点地区高风险职业人群个人防护用品使用及影响因素分析

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中华流行病学杂志 2024年第3期45卷 379-384页

作者：王哲林胜红刘新荣于爱枝木合塔·艾山杰恩斯·巴衣到列提李瑞卿梁新望侯碧桥王艺菲刘才兄张翠红王丽萍杭州市疾病预防控制中心传染病防制所杭州310021 微生物流行病研究所病原与生物安全国家重点实验室北京100071 大同市疾病预防控制中心大同037056 霍城县疾病预防控制中心伊犁835299 新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心乌鲁木齐830002 伊犁哈萨克自治州疾病预防控制中心伊犁835099 大同市阳高县疾病预防控制中心大同038199 大同市左云县疾病预防控制中心大同037599 大同市浑源县疾病预防控制中心大同037499 中国疾病预防控制中心传染病管理处/传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室北京102206

目的了解我国布鲁氏菌病(布病)高风险职业人群个人防护行为现状,为评估我国布病防治计划实施效果提供科学依据。方法选择山西省和新疆维吾尔自治区的4个县,采用横断面调查方法,于2019年12月至2020年7月对布病高风险职业人群开展问卷调... 详细信息

目的了解我国布鲁氏菌病(布病)高风险职业人群个人防护行为现状,为评估我国布病防治计划实施效果提供科学依据。方法选择山西省和新疆维吾尔自治区的4个县,采用横断面调查方法,于2019年12月至2020年7月对布病高风险职业人群开展问卷调查。结果共调查高风险职业人群2384人,个人防护用品规范使用率为20.13%(480/2384),手套、口罩、胶鞋和工作服4种主要个人防护用品的使用率分别为38.26%(912/2384)、31.80%(758/2384)、32.01%(763/2384)和30.87%(736/2384)。不同年龄、职业、文化程度、地区的人群不同防护用品的使用率和规范使用率的差异有统计学意义(均P<0.001),≥60岁、女性、农民、文化程度较低的人群各种防护用品的使用率和规范使用率均较低。多因素分析结果显示,职业和地区是布病个人防护用品规范使用的影响因素,牧民和兽医的个人防护用品规范使用率更高;阳高县和霍城县的高风险职业人群的个人防护用品规范使用率明显高于左云县和浑源县。结论我国布病重点地区高风险职业人群4种主要个人防护用品使用率均不高,规范使用率低,不同地区差异很大,与防治计划目标差距较大,亟需向高风险职业人群发放防护用品,并开展易于接受的个人防护使用的宣教活动,加强各地经验交流和沟通。

关键词：布鲁氏菌病高风险职业人群个人防护用品规范使用健康教育

钩端螺旋体磷酸二酯酶基因LARS06960的鉴定及其相关生物学功能初探

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第8期44卷 672-679页

作者：姚文武杨章女王凌波吴卓颖胡玮琳浙江省疾病预防控制中心微生物检验所杭州310051 浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室杭州310058

目的确定钩端螺旋体LARS06960基因产物蛋白具有磷酸二酯酶(PDE)活性,确定该酶降解的底物细菌二核苷酸可激活巨噬细胞固有免疫因子。方法PCR扩增钩端螺旋体56601株LARS06960基因并构建原核表达系统。通过Ni-NTA亲和层析法提纯表达的目的... 详细信息

目的确定钩端螺旋体LARS06960基因产物蛋白具有磷酸二酯酶(PDE)活性,确定该酶降解的底物细菌二核苷酸可激活巨噬细胞固有免疫因子。方法PCR扩增钩端螺旋体56601株LARS06960基因并构建原核表达系统。通过Ni-NTA亲和层析法提纯表达的目的重组蛋白rPDE。高效液相色谱法(HPLC)检测rPDE降解细菌二核苷酸c-di-AMP或5′-pApA底物为AMP的活性。荧光定量RT-PCR法检测钩端螺旋体感染巨噬细胞过程中钩体LARS06960基因和细胞固有免疫相关因子基因mRNA水平变化。采用荧光定量RT-PCR法和ELISA法检测细菌二核苷酸影响细胞固有免疫相关因子表达及分泌水平变化。结果成功构建钩端螺旋体LARS06960基因原核表达系统,纯化的rPDE具有体外降解5′-pApA和c-di-AMP为AMP的功能。钩端螺旋体感染巨噬细胞过程中,钩体LARS06960基因表达水平显著下降,巨噬细胞IFN-β、TNF-α、IL-6以及IL-1β编码基因表达水平均显著升高。LARS06960编码的PDE酶降解底物细菌二核苷酸可诱导IFN-β和IL-6基因mRNA表达水平或蛋白分泌水平的升高。结论LARS06960基因产物PDE具有PDE活性,其水解底物细菌二核苷酸激活巨噬细胞固有免疫应答。

关键词：钩端螺旋体磷酸二酯酶固有免疫

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中国慢性病风险人群流行特征分析

中国慢性病预防与控制 2024年第8期32卷 569-573,579页

作者：刘敏王丽敏张梅徐建伟吉宁贾艾楠白雅敏中国疾病预防控制中心慢性非传染性疾病预防控制中心健康促进与行为干预室北京100050 中国疾病预防控制中心慢性非传染性疾病预防控制中心中国疾病预防控制中心慢性非传染性疾病预防控制中心慢病危险因素监测室

目的了解中国慢性病高风险人群流行主要特征,为开展社区慢性病高风险人群健康管理和生活方式干预提供理论基础。方法数据来源于2018年中国成人慢性病及其危险因素监测调查数据,使用多阶段分层整群随机抽样方法选取中国31个省(自治区... 详细信息

目的了解中国慢性病高风险人群流行主要特征,为开展社区慢性病高风险人群健康管理和生活方式干预提供理论基础。方法数据来源于2018年中国成人慢性病及其危险因素监测调查数据,使用多阶段分层整群随机抽样方法选取中国31个省(自治区、直辖市)298个监测点≥18岁常住居民184 876人为研究对象,进行问卷调查、体格检查和实验室检测。使用SAS 9.4进行复杂抽样加权调整的Rao-Scottχ^(2)检验和趋势χ^(2)检验。结果最终纳入分析178 043人,平均年龄(43.6±16.1)岁,其中男性78 641人(44.2%),女性99 402人(55.8%)。慢性病高风险人群检出率为68.4%(95%CI:67.6%~69.2%),男性检出率为82.2%(95%CI:81.3%~83.2%),显著高于女性[54.6%(95%CI:53.4%~55.7%)],差异有统计学意义(P防控策略,预防或减缓慢性病的发生。

关键词：慢性病高风险人群流行特征分布

2018—2022年甘肃省医疗卫生机构布鲁氏菌病检测能力现状调查分析

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疾病监测 2024年

作者：王平贵何爱伟牛丽霞周晓艳赵琦马明辉关宏冯宇甘肃省疾病预防控制中心

目的调查分析2018—2022年甘肃省医疗卫生机构布鲁氏菌病（布病）实验室检测能力现状，以及其对布病监测系统敏感性的影响，为制定布病防控对策提供科学依据。方法采用分层随机抽样方法选取甘肃省7个市（州）11个县（区）作为调查点... 详细信息

目的调查分析2018—2022年甘肃省医疗卫生机构布鲁氏菌病（布病）实验室检测能力现状，以及其对布病监测系统敏感性的影响，为制定布病防控对策提供科学依据。方法采用分层随机抽样方法选取甘肃省7个市（州）11个县（区）作为调查点，现场调查医疗卫生机构布病实验室检测能力，回顾性调查2018—2022年县级医疗卫生机构布病检测情况，收集传染病报告系统人间布病报告发病数和发病率数据，分析县级医疗机构布病实验室检测数量与全省布病报告发病率的相关性。结果调查的市、县疾病预防控制中心均具备布病初筛和确诊实验检测能力，具备病原学检验能力机构比例分别为57.14%、9.09%。市级医院有60.00%的综合性医院和16.67%的专科医院具备布病确诊实验和病原学检验能力，县级医院有45.45%的具备布病血清学初筛和确诊实验能力。只有4.55%的乡镇卫生院有布病初筛检验能力。市、县级疾病预防控制中心参控实验室盲样检测结果正确率均在95.24%以上。2018—2022年，调查地区县级医疗机构开展布病确诊实验检测的机构比例从8.70%增加到了43.48%，年检测数量从55份增加到了13465份，检测阳性数从39份增加到了3220份，检测阳性率从70.91%下降到了23.92%。全省布病监测系统敏感性升高，报告发病率从2018年的5.77/10万增加到了2022年的20.03/10万。近5年实验室布病检测数量与全省布病报告发病率存在强相关性（r=0.981，P＜0.01），为正相关关系。结论甘肃省开展布病实验室检测的县级及以下医疗机构比例低，近几年甘肃省人间布病疫情实际流行程度比监测系统报告情况严重。建议进一步提升基层医疗机构布病实验室检测能力，加强疫情源头防控工作。

关键词：布鲁氏菌病检测能力监测

2023年河南省外环境H7N9禽流感病毒的基因组序列分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第5期44卷 377-381页

作者：毋碧聪罗雪卢世栋宋云张白帆卫海燕聂轶飞夏晖万思嘉叶莹黄学勇郭万申马红霞河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所河南省传染病病原生物重点实验室郑州450016 许昌市疾病预防控制中心检验检测中心许昌461000

目的分析活禽市场相关环境中检出的H7N9禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)的遗传进化和分子特征。方法采集禽类粪便、污水,以及脱毛机和案板擦拭拭子等标本,实时荧光定量PCR鉴定甲型流感病毒和H7N9亚型。对于H7N9阳性标本以甲型流... 详细信息

目的分析活禽市场相关环境中检出的H7N9禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)的遗传进化和分子特征。方法采集禽类粪便、污水,以及脱毛机和案板擦拭拭子等标本,实时荧光定量PCR鉴定甲型流感病毒和H7N9亚型。对于H7N9阳性标本以甲型流感病毒通用引物扩增病毒全基因组并测序,利用BLAST和MEGA X软件进行序列比对、系统进化和分子特征分析。结果2023年2月采集于许昌市活禽市场的7份外环境标本中检出4份H7N9 AIV阳性,3份H7N9 AIV阳性标本测序成功,其各基因核苷酸一致性较高(98.37%~100.00%)。BLAST分析显示主要与我国2020—2021年国内禽中分离的H7N9毒株一致性最高。遗传进化分析显示3株病毒株聚在同一分支,与最近环境分离株相聚较近,而与最近人/禽感染病毒株关系较远。通过与各时期的代表性病毒株序列比对发现,本研究检出的病毒株呈禽高致病性,裂解位点处插入了4个氨基酸KRAA,病毒株血凝素受体结合位点为QSG,属于禽结合受体,血凝素出现G186I位点突变。聚合酶碱性蛋白2未出现哺乳动物适应性E627K突变。未检测到与神经氨酸酶抑制剂(奥司他韦)和聚合酶酸性蛋白抑制剂(巴洛沙韦)耐药相关的R292K和I38T位点突变,提示病毒对上述药物敏感性未降低。M2蛋白出现S31N突变,提示对烷胺类药物耐药。结论从活禽市场检出的3株H7N9病毒株呈禽高致病性,与既往感染人/禽代表株相比,未明显增加人受体结合力、哺乳动物致病性、病毒传播力和耐药相关分子位点。

关键词：禽流感病毒 H7N9 活禽市场遗传进化突变