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基于转录组学和机器学习算法的肺结核铁死亡相关关键基因的研究

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中国防痨杂志 2024年第1期46卷 92-99页

作者：叶江娥方雪晖熊延军刘盛盛安徽省胸科医院结核一科合肥230022 安徽省胸科医院办公室合肥230022 安徽省胸科医院结核八科合肥230022 安徽省胸科医院结核七科合肥230022

目的:运用转录组学和机器学习方法探索铁死亡关键基因与肺结核发病机制的相关性。方法:以“pulmonary tuberculosis”为关键词,以测序类型(转录组学)和物种(HOMO sapiens)等为条件从公共存储库NCBI GEO(http://***/geo)中进行搜索和筛选... 详细信息

目的:运用转录组学和机器学习方法探索铁死亡关键基因与肺结核发病机制的相关性。方法:以“pulmonary tuberculosis”为关键词,以测序类型(转录组学)和物种(HOMO sapiens)等为条件从公共存储库NCBI GEO(http://***/geo)中进行搜索和筛选,得到GSE153326和GSE67589两套转录组数据集。将GSE153326作为训练组数据[包含健康人群血液样本8份,结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)阳性血液样本52份]、GSE67589作为验证组数据(包含健康人群血液样本30份,MTB阳性27份);使用R脚本对数据进行矫正和注释,对两转录组的差异表达基因鉴定后,筛选出GSE153326训练组差异基因中与铁死亡相关基因(TBFerDEG)的表达情况,并对TBFerDEG的基因本体(GO)及京都基因和基因组百科全书(KEGG)进行富集分析;利用LASSO回归分析和SVM算法,从TBFerDEG中获得与铁死亡有明显差异的关键基因,并对其进行ROC分析,探索与关键基因相关的药物调控网络;最后将关键基因导入GSE67589验证组中,以验证训练组筛选出的铁死亡关键基因的诊断意义。结果:通过生物信息学分析,共筛选得到416个TBFerDEG,剔除不符合入选要求的基因,最终得到56个TBFerDEG差异基因。GO富集分析发现,肺结核中与铁死亡相关的生物学进程有细胞对化学应激的反应自噬调节、线粒体自噬、线粒体解体等;参与的通路有AMPK信号通路和铁死亡等。通过LASSO回归分析和SVM算法,最终得到5个与铁死亡相关的关键基因,分别为BID、AR、STK11、ALOX12和SRC,AUC分别为0.807、0.858、0.734、0.840和0.880;验证关键基因结果表明,AR和SRC基因在验证组(GSE67589)中MTB阳性与健康人群中的表达差异均有统计学意义(P值分别为0.004和0.017)。结论:AR和SRC是肺结核中与铁死亡相关的关键基因,可能为今后的基础研究奠定一定的借鉴和参考。

关键词：结核,肺铁死亡基因表达机器学习

144例老年利福平耐药肺结核患者治疗转归及影响因素分析

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中国防痨杂志 2024年第7期46卷 799-807页

作者：高磊梁雅雪刘盛盛王华安徽省胸科医院耐药结核科合肥230022 安徽医科大学胸科临床学院合肥230022 安徽省胸科医院结核科合肥230022

目的:分析老年利福平耐药肺结核患者治疗转归及影响因素。方法:采用回顾性研究方法,参照入组标准收集2020年9月至2023年9月安徽省胸科医院收治的144例老年利福平耐药肺结核患者相关临床资料,分析患者治疗转归情况及影响因素。结果:144... 详细信息

目的:分析老年利福平耐药肺结核患者治疗转归及影响因素。方法:采用回顾性研究方法,参照入组标准收集2020年9月至2023年9月安徽省胸科医院收治的144例老年利福平耐药肺结核患者相关临床资料,分析患者治疗转归情况及影响因素。结果:144例老年利福平耐药肺结核患者中,治疗结局良好者65例(45.14%),包括治愈51例(35.42%)、完成疗程14例(9.72%);不良结局者79例(54.86%),包括失败7例(4.86%)、失访57例(39.58%)、死亡15例(10.42%),其中因结核病死亡7例。多因素logistic回归分析显示,体质量指数≥18.5(OR=0.131,95%CI:0.040~0.429,P安徽省老年利福平耐药肺结核患者治愈率较低,应重点关注合并糖尿病、营养状况欠佳、无长期督导服药管理及发生药物不良反应的老年患者,做到积极控制血糖水平、处理不良反应,加强营养支持和督导管理,进一步提高治愈率。

关键词：老年结核肺抗药性细菌治疗结果因素分析统计学

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瑞马唑仑与丙泊酚对肺癌电视胸腔镜手术患者的麻醉效果研究

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中国临床药理学杂志 2024年第8期40卷 1111-1115页

作者：姚晶曼胡友洋张欢欢孔婧孟璐李若男董喆安徽省胸科医院麻醉科安徽合肥230032

目的比较瑞马唑仑与丙泊酚用于肺癌电视胸腔镜手术患者的麻醉效果及安全性。方法回顾性分析进行电视胸腔镜手术治疗的肺癌患者的临床资料,其中瑞马唑仑组给予瑞马唑仑麻醉,丙泊酚组给予丙泊酚麻醉。比较2组患者麻醉诱导前(T0)、气管插... 详细信息

目的比较瑞马唑仑与丙泊酚用于肺癌电视胸腔镜手术患者的麻醉效果及安全性。方法回顾性分析进行电视胸腔镜手术治疗的肺癌患者的临床资料,其中瑞马唑仑组给予瑞马唑仑麻醉,丙泊酚组给予丙泊酚麻醉。比较2组患者麻醉诱导前(T0)、气管插管5 min后(T1)、手术1 h(T2)、关胸时(T3)、拔管后5 min(T4)的平均动脉压(MAP)、心率(HR)变化情况,记录2组患者镇静起效时间、苏醒时间及拔管时间,比较T0与T4时应激反应情况[促肾上腺皮质激素(ACTH)、皮质醇(Cor)],在T4用Ramsay镇静评分(RSS)评估镇静程度,术后2、12和24 h用视觉模拟评分(VAS)评估疼痛程度,观察围术期麻醉相关不良事件发生情况。结果瑞马唑仑组58例,丙泊酚组64例。瑞马唑仑组和丙泊酚组T1时MAP分别为(85.03±4.37)和(78.24±4.48)mmHg, T2时MAP分别为(80.39±3.95)和(75.49±4.11)mmHg, T3时MAP分别为(84.43±4.02)和(79.59±3.97)mmHg, T2时HR分别为(76.44±5.75)和(72.39±6.03)beat·min^(-1),在统计学上差异均有统计学意义(均P胸腔镜手术麻醉中均能发挥良好镇静效果,瑞马唑仑麻醉术中血流动力学更平稳,且起效及消除更快,安全性更高。

关键词：瑞马唑仑丙泊酚电视胸腔镜肺癌镇静

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肺浸润性黏液腺癌CT表现及临床特征分析

中国临床研究 2024年第1期37卷 52-56页

作者：王保明代晨马冬春安徽省胸科医院胸外科安徽合肥230000

目的探讨术后病理证实为原发性浸润性肺黏液腺癌(PIMA)患者的CT影像学表现及临床病理特征。方法回顾性分析安徽省胸科医院胸外科2019年11月至2021年11月经手术后病理确诊的PIMA共78例患者的临床资料。结果 78例中,男33例(42.3%),女45... 详细信息

目的探讨术后病理证实为原发性浸润性肺黏液腺癌(PIMA)患者的CT影像学表现及临床病理特征。方法回顾性分析安徽省胸科医院胸外科2019年11月至2021年11月经手术后病理确诊的PIMA共78例患者的临床资料。结果 78例中,男33例(42.3%),女45例(57.7%),年龄(60.3±7.8)岁。血清癌胚抗原(CEA)升高(>5 ng/mL)9例(11.5%)。根据临床表现可分为无症状者60例(76.9%),有症状者18例(23.1%),包括咳嗽、咳黏液痰8例,胸闷、胸背部痛4例,其他症状6例。影像学:两肺下叶51例(65.4%)和外周型71例(91.0%),其中完全实性结节46例(59.0%),常见征象包括浅分叶、血管集束征。术后病理分期Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲa期及以上的患者分别为61例(78.2%)、9例(11.5%)和8例(10.3%)。13例患者行基因检测,8例检测到Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因(KRAS)突变,1例检测到表皮生长因子受体(EGFR)基因突变。22例患者行程序性死亡配体1(PD-L1)表达检测,其中肿瘤比例评分(TPS)<1%为18例(81.8%)。结论除咳痰为黏液痰外,PIMA临床症状无特殊;CT显示病灶发生于肺下叶和外周、完全实性多见,浅分叶、血管集束征为常见征象;实验室检测PD-L1表达水平较低;KRAS突变相对较多;这些特征在PIMA的诊断和鉴别诊断中有一定价值。

关键词：肺黏液腺癌肺下叶肺外周实性结节浅分叶征血管集束征程序性死亡配体1 Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因表皮生长因子受体

参七虫草方通过ASS1/src/STAT3信号通路改善肺纤维化大鼠的炎症反应

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南方医科大学学报 2024年第4期44卷 644-651页

作者：何程陈炜张念志栾军王三凤张尤安徽中医药大学第一附属医院呼吸科安徽合肥230031

目的观察参七虫草方对肺纤维化大鼠精氨酸琥珀酸盐合成酶-1(ASS1)/src酪氨酸激酶(src)/信号转导和转化激活因子3(STAT3)通路相关因子表达的影响,探讨其治疗肺纤维化的作用机制。方法选择120只SPF级SD雄性大鼠,采用随机数字表法分为5组:... 详细信息

目的观察参七虫草方对肺纤维化大鼠精氨酸琥珀酸盐合成酶-1(ASS1)/src酪氨酸激酶(src)/信号转导和转化激活因子3(STAT3)通路相关因子表达的影响,探讨其治疗肺纤维化的作用机制。方法选择120只SPF级SD雄性大鼠,采用随机数字表法分为5组:空白组、模型组、参七虫草方组、吡非尼酮组、精氨酸脱亚胺酶(ADI)腹腔注射组(24只/组)。除空白组以外,4组均使用一次性气管内滴注博来霉素(BLM)诱导制备特发性肺纤维化的大鼠模型。造模成功后,参七虫草组予参七虫草方汤剂(0.423 g/kg)灌胃;吡非尼酮组予溶于生理盐水的吡非尼酮胶囊粉末(10 mL·kg^(-1)·d^(-1))灌胃2次;ADI腹腔注射组予以2.25 mg/(kg·d)腹腔注射,1次/3d;空白组、模型组分别以10mL/(kg·d)生理盐水灌胃;给药疗程28d。于第7、14、21、28天分4批处死大鼠,分离肺组织并计算肺指数。采用苏木素-伊红、马松染色观察大鼠肺组织的组织病理学;吉姆萨染色分析BALF中不同种类的炎症细胞;采用酶联免疫吸附测定法检测血清趋化因子配体2(CCL2)、转化生长因子β1(TGF-β1)的含量;蛋白免疫印迹法测定肺组织src、p-src^(Try529)、STAT3、p-STAT3^(Try705)的蛋白表达;采用实时荧光定量聚合酶链式反应技术检测肺组织ASS1、src、STAT3的表达水平。结果参七虫草组、吡非尼酮组和ADI腹腔注射组各时间点中性粒细胞、巨噬细胞、淋巴细胞均低于同一时间点的模型组(P<0.05)。在相同时间点,参七虫草组、吡非尼酮组和ADI腹腔注射组大鼠血清CCL2、TGF-β1水平均低于模型组(P<0.05)。参七虫草组、吡非尼酮组和ADI腹腔注射组的p-src^(Try529)、p-STAT3^(Try705)蛋白表达水平及肺组织ASS1、src、STAT3mRNA均低于同一时间点的模型组(P<0.05)。结论参七虫草方可以缓解大鼠的肺纤维化程度,其机制可能通过调控ASS1/src/STAT3信号通路的活化从而缓解BLM大鼠肺纤维化的炎症反应。

关键词：参七虫草方精氨酸特发性肺纤维化 ASS1/src/STAT3信号通路炎症反应

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真菌感染的免疫治疗

中华实用儿科临床杂志 2024年第1期39卷 20-25页

作者：苟渊胡艳玲王文建深圳市儿童医院呼吸科深圳518038

侵袭性真菌感染是威胁人类健康的一个重要因素, 近年来易感人群逐年增加, 导致人类真菌疾病负担大幅增加。2022年世界卫生组织发布了一份重点真菌病原体清单, 以推动全球对真菌感染和抗真菌耐药性的研究和投资。目前抗真菌药物仍是真菌... 详细信息

侵袭性真菌感染是威胁人类健康的一个重要因素, 近年来易感人群逐年增加, 导致人类真菌疾病负担大幅增加。2022年世界卫生组织发布了一份重点真菌病原体清单, 以推动全球对真菌感染和抗真菌耐药性的研究和投资。目前抗真菌药物仍是真菌感染的治疗选择, 但是抗真菌药物的毒副作用及耐药影响了临床疗效, 改善受损的宿主免疫反应成为提高抗真菌药物有效性的合理途径。现简述真菌感染的流行病学, 总结宿主如何通过启动先天和适应性免疫反应来介导清除真菌, 同时讨论支持免疫调节疗法治疗侵袭性真菌感染的前景及临床证据。

关键词：真菌感染免疫疗法细胞因子治疗细胞免疫治疗

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欧洲儿童间质性肺疾病诊断程序解读

中华儿科杂志 2024年第2期62卷 114-119页

作者：陈杰华郑跃杰深圳市儿童医院呼吸科深圳518038

儿童间质性肺疾病(ILD)是呼吸系统的疑难病,病种多而罕见,诊治困难,预后不良。遵循诊断程序并实行多学科讨论可提高儿童ILD的诊断水平,及时启动疾病针对性的治疗。随着分子诊断学的发展,儿童ILD的诊断模式已从“临床-影像-病理”向“临... 详细信息

儿童间质性肺疾病(ILD)是呼吸系统的疑难病,病种多而罕见,诊治困难,预后不良。遵循诊断程序并实行多学科讨论可提高儿童ILD的诊断水平,及时启动疾病针对性的治疗。随着分子诊断学的发展,儿童ILD的诊断模式已从“临床-影像-病理”向“临床-影像-基因-病理”转变。现介绍欧洲呼吸学会儿童ILD临床研究协作组2023年发表的儿童ILD诊断程序。

关键词：分子诊断学诊断程序预后不良诊断模式研究协作组儿童间质性肺疾病诊断水平呼吸系统

2016-2022年安徽省结核病耐药监测结果分析

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中国防痨杂志 2024年第5期46卷 531-537页

作者：包训迪梁锁李军叶倩吴丹丹王舒李跃丁运生刘洁安徽省胸科医院(省结核病防治研究所) 合肥230022

目的:分析2016—2022年安徽省4个国家级结核病耐药监测点分离的结核分枝杆菌的耐药谱变化趋势,从而掌握安徽省结核病和耐药结核病的流行和防控效果。方法:连续纳入2016—2022年4个耐药监测点的病原学阳性肺结核患者3073例,采集患者的基... 详细信息

目的:分析2016—2022年安徽省4个国家级结核病耐药监测点分离的结核分枝杆菌的耐药谱变化趋势,从而掌握安徽省结核病和耐药结核病的流行和防控效果。方法:连续纳入2016—2022年4个耐药监测点的病原学阳性肺结核患者3073例,采集患者的基本信息并收集痰标本进行分离培养,培阳菌株进行菌种鉴定,共获得结核分枝杆菌2336株,采用比例法对结核分枝杆菌开展6种抗结核药物[异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(Sm)、乙胺丁醇(EMB)、氧氟沙星(Ofx)和卡那霉素(Km)]的药物敏感性试验。结果:2336株结核分枝杆菌菌株中,有1893株(81.04%)对6种抗结核药物全部敏感,443株对至少1种或更多抗结核药物耐药,耐药率为18.96%(443/2336),其中初治为16.80%(348/2071),复治为35.85%(95/265),耐多药菌株98株(4.20%)。在6种抗结核药物中,抗结核药物单耐药率由高到低分别为:INH(10.55%,236/2336)、Sm(8.18%,183/2336)、Ofx(6.53%,146/2336)、RFP(5.95%,133/2336)、EMB(2.37%,53/2336)、Km(1.97%,44/2336)。2016—2022年,抗结核药物Ofx、INH、EMB和Km耐药率[2016年分别为10.49%(30/286)、12.24%(35/286)、1.75%(5/286)、2.45%(7/286),2022年分别为3.89%(18/463)、9.29%(43/463)、0.86%(4/463)、1.08%(5/463)]呈下降趋势(χ^(2)_(趋势)值分别为16.964、15.989、15.798、26.075,P值均安徽省结核病的耐药形势依然严峻,复治患者、40~59岁人群和城镇地区患者结核病耐药问题需要重点关注。

关键词：分枝杆菌,结核抗药性,细菌人群监测

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原发性纵隔卵黄囊瘤临床和影像学分析

上海交通大学学报（医学版） 2024年第9期44卷 1155-1161页

作者：马美丽滕家俊高志强施春雷钟华韩宝惠上海市胸科医院/上海交通大学医学院附属胸科医院呼吸与危重症科上海200030

目的·总结原发性纵隔卵黄囊瘤(yolk sac tumor,YST)的临床特征、影像学特征和诊治经验。方法·回顾性分析2016年9月—2023年5月上海交通大学医学院附属胸科医院收治的病理明确的原发性纵隔YST 29例。收集患者的临床资料、影像学检查结... 详细信息

目的·总结原发性纵隔卵黄囊瘤(yolk sac tumor,YST)的临床特征、影像学特征和诊治经验。方法·回顾性分析2016年9月—2023年5月上海交通大学医学院附属胸科医院收治的病理明确的原发性纵隔YST 29例。收集患者的临床资料、影像学检查结果、血清学报告、病理学报告、治疗方法等进行分析。结果·纯YST 22例,混合型YST 7例。男28例,女1例。平均发病年龄(24.5±5.9)岁。初始临床表现为胸闷(34.5%)、胸痛(27.8%)、咳嗽(34.5%)、咳痰(34.5%),以及无特异性症状(24.1%)等。胸部电子计算机断层扫描(computerized tomography,CT)增强显示29例病灶均位于前纵隔,最大径范围5.6~18.2 cm;形态不规则,密度不均匀,部分呈囊实性密度影,增强扫描可见不均匀强化;肿瘤边界不清,常压迫和累及周边组织。29例初诊患者中,28例血清学检测结果显示甲胎蛋白(alpha-fetoprotein,AFP)显著升高,另外1例未检测。29例患者中接受化学治疗(化疗)25例,手术治疗26例,放射治疗8例。确诊后直接手术者7例;经化疗后再手术治疗者19例,其中16例(84.2%)化疗后疗效评价为病灶缩小。手术后73.1%(19/26)的患者血清AFP有明显下降。化疗后56.0%(14/25)的患者血清AFP下降。结论·原发性纵隔YST好发于中青年男性,有一定临床和影像学特征表现,血清AFP升高,需要多学科综合治疗。

关键词：纵隔卵黄囊瘤电子计算机断层扫描甲胎蛋白化学治疗