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基于机器学习转移性鼻咽癌关键特征基因的筛选及其免疫细胞浸润分析

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解剖学报 2024年第3期55卷 311-318页

作者：陆进陈云帆张浩轩黄学应安徽医科大学人体解剖学教研室合肥230032 蚌埠医学院人体解剖学教研室安徽蚌埠233030 数字医学与智慧健康安徽省重点实验室安徽蚌埠233030

目的利用机器学习算法筛选转移性鼻咽癌(mNPC)的关键特征基因,并分析其肿瘤微环境中免疫细胞浸润情况。方法首先,通过GEO数据库下载训练集GSE103611数据,并对数据进行差异表达基因(DEGs)筛选、基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书... 详细信息

目的利用机器学习算法筛选转移性鼻咽癌(mNPC)的关键特征基因,并分析其肿瘤微环境中免疫细胞浸润情况。方法首先,通过GEO数据库下载训练集GSE103611数据,并对数据进行差异表达基因(DEGs)筛选、基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)以及免疫细胞浸润分析。其次,通过最小绝对收缩和选择器操作(LASSO)回归筛选DEGs中的预测基因,并利用预测基因的表达水平和受试者工作特征曲线(ROC)筛选特征基因。再次,进一步分析特征基因与免疫细胞的相关性,从而判断关键特征基因。最后,利用反向验证集GSE1245数据,对关键特征基因的表达水平和ROC进行验证。结果共获得136个DEGs,其KEGG主要富集在细胞色素P450、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、朊病毒疾病以及EB病毒感染等通路。GO主要富集在肽基酪氨酸磷酸化修饰、病毒基因表达以及B细胞和白细胞活化的负调节过程。22种免疫细胞在鼻咽癌(NPC)和mNPC中的浸润程度差异不明显。LASSO回归最终得到2个mNPC的关键特征基因无精子蛋白1缺失(DAZ1)和酵母氨酸脱氢酶(SCCPDH),且两者与mNPC微环境中的免疫细胞显著相关(P0.05),且两者ROC的曲线下面积(AUC)值均<0.6。结论DAZ1和SCCPDH是mNPC的关键特征基因,可作为mNPC及其免疫治疗的重要标志物。

关键词：转移性鼻咽癌免疫细胞浸润生物信息学机器学习

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外泌体与肺纤维化研究进展

中国生物工程杂志 2024年第4期44卷 67-75页

作者：叶灏鑫王晓旭李明霏王宇河北大学中医学院保定071002

肺纤维化是一种由肺泡外基质蛋白过度沉积导致的肺部不可逆的结构和功能改变的肺部疾病,表现为纤维化重构和肺泡破坏。外泌体作为一种细胞外囊泡,可通过递送特定细胞类型产生的功能性核酸和蛋白质来介导细胞间通讯。近年来的研究发现,... 详细信息

肺纤维化是一种由肺泡外基质蛋白过度沉积导致的肺部不可逆的结构和功能改变的肺部疾病,表现为纤维化重构和肺泡破坏。外泌体作为一种细胞外囊泡,可通过递送特定细胞类型产生的功能性核酸和蛋白质来介导细胞间通讯。近年来的研究发现,外泌体在肺纤维化的诊断和治疗中具有重要作用,被认为是一种潜在的生物治疗方法和药物递送载体。研究外泌体在肺纤维化发生发展中的作用,以期为肺纤维化的外泌体治疗研究提供新的思路。

关键词：外泌体肺纤维化细胞外囊泡药物递送载体诊断和治疗

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西黄丸抑制卵巢癌细胞线粒体能量代谢的效应及机制

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中国实验方剂学杂志 2024年第1期30卷 70-76页

作者：颜显欣洪守亿马瑞瑞王艳秋布筠艺马民暨南大学中医学院广州510632

目的:研究西黄丸浸提液对卵巢癌SKOV3和HEY细胞线粒体能量代谢的影响,并探讨其作用机制。方法:体外培养卵巢癌SKOV3和HEY细胞,分别加入不同质量浓度(0、5、10、15、20 g·L^(-1))西黄丸浸提液干预SKOV3和HEY细胞,采用噻唑蓝(MTT)比色法... 详细信息

目的:研究西黄丸浸提液对卵巢癌SKOV3和HEY细胞线粒体能量代谢的影响,并探讨其作用机制。方法:体外培养卵巢癌SKOV3和HEY细胞,分别加入不同质量浓度(0、5、10、15、20 g·L^(-1))西黄丸浸提液干预SKOV3和HEY细胞,采用噻唑蓝(MTT)比色法检测西黄丸浸提液对SKOV3和HEY细胞存活率的影响;用蛋白质量检测SKOV3和HEY细胞三磷酸腺苷(ATP)浓度;流式细胞术检测SKOV3和HEY细胞活性氧(ROS)含量;用蛋白免疫印迹法(Western blot)检测西黄丸浸提液对SKOV3和HEY细胞线粒体相关蛋白过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活因子1α(PGC1α)、线粒体转录因子A(TFAM)、线粒体外膜转位酶20(TOMM20)及印迹抑癌基因Ras同源家族Ⅰ(ARHⅠ)的表达;Mito-Tracker Green染色观察SKOV3和HEY细胞线粒体形态学变化。结果:与空白组比较,不同浓度西黄丸浸提液给药24、48 h能明显抑制卵巢癌SKOV3和HEY细胞存活率(P<0.05,P<0.01),呈浓度依赖关系。与空白组比较,西黄丸浸提液组(10、15、20 g·L^(-1))的ATP水平明显降低(P<0.05,P<0.01);与西黄丸浸提液组(10、15 g·L^(-1))比较,西黄丸组(20 g·L^(-1))ATP浓度明显降低(P<0.05)。与空白组比较,西黄丸浸提液组(10、15、20 g·L^(-1))SKOV3和HEY细胞内ROS含量明显增加(P<0.05,P<0.01),且呈浓度依赖性;与西黄丸浸提液组(10 g·L^(-1))比较,西黄丸浸提液组(20 g·L^(-1))ROS含量明显增加(P<0.05)。与空白组比较,西黄丸浸提液组(10、15、20 g·L^(-1))SKOV3和HEY细胞的ARHⅠ蛋白表达水平明显升高(P<0.05,P<0.01),且随着西黄丸浸提液浓度升高,ARHⅠ蛋白表达逐渐升高;与西黄丸组(10、15 g·L^(-1))比较,西黄丸浸提液组(20 g·L^(-1))ARHⅠ蛋白表达水平明显升高(P<0.05);与空白组比较,西黄丸浸提液组(10、15、20 g·L^(-1))SKOV3和HEY细胞的PGC1α、TFAM、TOMM20蛋白表达水平明显降低(P<0.05,P<0.01),且呈浓度依赖性;与西黄丸浸提液组(10、15 g·L^(-1))比较,西黄丸浸提液组(20 g·L^(-1))HEY细胞TFAM、TOMM20蛋白表达水平明显降低(P<0.05)。与空白组比较,西黄丸浸提液组(20 g·L^(-1))SKOV3和HEY细胞Mito-Tracker荧光强度明显降低(P<0.05)。结论:西黄丸能破坏卵巢癌SKOV3和HEY细胞线粒体功能并降低细胞能量代谢,从而抑制SKOV3和HEY细胞增殖,其机制可能是通过上调ARHⅠ,抑制PGC1α/TFAM信号轴实现的。

关键词：西黄丸印迹抑癌基因Ras同源家族Ⅰ(ARHⅠ) 卵巢癌线粒体能量代谢

脱细胞异体神经移植物联合电针对坐骨神经损伤大鼠脊神经节的保护作用及机制

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解剖学报 2024年第2期55卷 143-149页

作者：周泽宇马蕴涵李佳瑞胡余梦袁博张银娟于晓敏付秀美承德医学院基础医学院人体解剖学教研室河北承德067000 承德医学院中医系针灸推拿教研室河北承德067000 承德医学院教务处河北承德067000 河北省神经损伤与修复重点实验室河北承德067000

目的探讨脱细胞异体神经移植物(ANA)联合电针对坐骨神经损伤(SNI)大鼠脊神经节的保护作用及机制。方法选取50只雄性SD大鼠,10只制备ANA;40只随机分为正常组、模型组、ANA组和联合组,每组10只。分离右侧坐骨神经,于梨状肌下缘5 mm处去除1... 详细信息

目的探讨脱细胞异体神经移植物(ANA)联合电针对坐骨神经损伤(SNI)大鼠脊神经节的保护作用及机制。方法选取50只雄性SD大鼠,10只制备ANA;40只随机分为正常组、模型组、ANA组和联合组,每组10只。分离右侧坐骨神经,于梨状肌下缘5 mm处去除10 mm制备SNI模型。ANA组将制备好的ANA连接在损伤神经的两断端处。联合组于ANA连接术后2 d采用电子针疗仪电针“环跳穴”和“阳陵泉穴”,15 min/d,7 d为1个疗程,共4个疗程。电生理检测各组大鼠坐骨神经传导速度,评估受损轴突再生情况;尼氏染色观察脊神经节中神经元的形态结构;Western blotting和免疫荧光法检测脊神经节中神经生长因子(NGF)和脑源性神经营养因子(BDNF)的表达。结果与正常组比较,模型组大鼠坐骨神经传导速度明显降低(P<0.01);神经节神经元中的尼氏体因肿胀、溶解导致结构不完整,数量显著减少(P<0.01);NGF和BDNF蛋白表达量明显降低(P<0.01)。与模型组比较,ANA组和联合组大鼠坐骨神经传导速度明显增加(P<0.01);神经节神经元中尼氏体损伤减弱,数量明显增加(P<0.01);NGF和BDNF蛋白表达量显著升高(P<0.01)。与ANA组比较,联合组大鼠坐骨神经传导速度显著增加(P<0.01);神经节神经元中尼氏体形态较规则,数量明显增加(P<0.01);NGF蛋白表达量显著升高(P<0.01)。结论ANA联合电针可提高大鼠坐骨神经传导速度,改善神经节中神经元的形态结构,发挥对脊神经节神经元的保护作用,其机制可能与提高神经元中NGF和BDNF蛋白的表达,尤其是NGF蛋白的表达相关。

关键词：脱细胞异体神经移植物电针脊神经节神经生长因子脑源性神经营养因子坐骨神经损伤免疫印迹法大鼠

NLRP3炎症小体在心力衰竭中的作用及中医药干预的研究进展

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中国中药杂志 2024年第4期49卷 894-901页

作者：王栋李芳赫于雪高阔郭淑贞北京中医药大学中医学院北京102488

心力衰竭存在高发病率、高病死率的特征,寻求针对心力衰竭的有效治疗策略并进一步提升临床疗效一直是重要的研究方向。炎症失衡已被证明是心力衰竭的重要病理环节之一,与心功能障碍、心肌纤维化等不良事件呈正相关。近些年研究证实NOD... 详细信息

心力衰竭存在高发病率、高病死率的特征,寻求针对心力衰竭的有效治疗策略并进一步提升临床疗效一直是重要的研究方向。炎症失衡已被证明是心力衰竭的重要病理环节之一,与心功能障碍、心肌纤维化等不良事件呈正相关。近些年研究证实NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3(NOD-like receptor thermal protein domain-associated protein 3,NLRP3)炎症小体激活在不同因素诱导心力衰竭的炎症失衡环节中具有共性调控机制,并且部分中药及其有效成分能够显著抑制NLRP3炎症小体激活而改善心力衰竭。该文首先概述了NLRP3炎症小体的基本情况,然后总结了NLRP3炎症小体在不同因素诱导心力衰竭中的调控机制,最后介绍了近年来抑制NLRP3炎症小体而改善心力衰竭的中药及有效成分的研究进展,以期为中西医结合防治心力衰竭的创新药物研究提供参考。

关键词：心力衰竭炎症 NLRP3炎症小体中药

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电针对糖尿病模型大鼠海马CA3区神经元Nrf2、HO-1和PSD95表达的影响

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右江民族医学院学报 2024年第1期46卷 37-42页

作者：王薇龚鑫吴锋赵健皖南医学院人体解剖学教研室安徽芜湖241002

目的观察电针对糖尿病模型大鼠海马CA3区核因子E2相关因子(Nrf2)、血红素氧合酶(HO-1)与突触后致密蛋白95(PSD95)表达变化,探讨电针保护糖尿病神经系统损伤的可能机制。方法将雄性Wistar大鼠随机分为正常组、载体组、糖尿病组和电针组,... 详细信息

目的观察电针对糖尿病模型大鼠海马CA3区核因子E2相关因子(Nrf2)、血红素氧合酶(HO-1)与突触后致密蛋白95(PSD95)表达变化,探讨电针保护糖尿病神经系统损伤的可能机制。方法将雄性Wistar大鼠随机分为正常组、载体组、糖尿病组和电针组,每组8只。采用链脲佐菌素腹腔注射法制备糖尿病大鼠模型。造模成功1周后,电针组电针刺激一侧“足三里”及“胰俞”穴,30分钟/次,1次/天,连续4周。血糖仪检测大鼠空腹血糖水平;尼氏染色法观察大鼠海马CA3区神经元形态;免疫组织化学染色法检测大鼠海马CA3区的Nrf2、HO-1与PSD95的蛋白表达。结果空腹血糖检测结果显示,与正常组和载体组比较,糖尿病组血糖水平升高(P学染色结果显示,与正常组和载体组比较,糖尿病组海马CA3区Nrf2、HO-1与PSD95蛋白表达降低(P0.05)。结论电针可上调糖尿病模型大鼠海马CA3区Nrf2、HO-1与PSD95的表达,提示其可能通过抑制氧化应激和改善突触可塑性发挥对其对神经元的保护作用。

关键词：糖尿病电针核因子E2相关因子血红素氧合酶突触后致密蛋白95 海马CA3区

电针对脑缺血大鼠前扣带皮质HMGB1和p-JNK蛋白表达的影响

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包头医学院学报 2024年第2期40卷 14-19页

作者：聂泽银李晨妤陈家乐缪化春吴锋皖南医学院人体解剖学教研室安徽芜湖241002

目的:观察电针对脑缺血大鼠前扣带皮质高迁移率族蛋白1(high mobility group protein 1,HMGB1)和磷酸化的c-Jun氨基酸末端激酶(phosphorylated c-Jun N-terminal kinase,p-JNK)的表达影响,探讨电针对脑缺血大鼠前扣带皮质的保护作用及... 详细信息

目的:观察电针对脑缺血大鼠前扣带皮质高迁移率族蛋白1(high mobility group protein 1,HMGB1)和磷酸化的c-Jun氨基酸末端激酶(phosphorylated c-Jun N-terminal kinase,p-JNK)的表达影响,探讨电针对脑缺血大鼠前扣带皮质的保护作用及机制。方法:将24只雄性SD大鼠随机分为假手术组、模型组、电针组和假电针组,6只/组。采用右侧大脑中动脉栓塞法制备脑缺血大鼠模型,电针组选取“百会”穴、左侧“足三里”穴进行电针刺激,1次/d,30 min/次,持续14 d;假电针组仅浅刺入两穴位皮下,接电针仪但不通电。采用Longa评分评估各组大鼠神经功能损伤情况;Nissl染色观察右侧前扣带皮质神经元的形态与分布情况;免疫组化检测右侧前扣带皮质HMGB1和p-JNK蛋白的表达情况。结果:与假手术组相比,模型组和假电针组大鼠神经功能缺损评分升高(P<0.01),右侧前扣带皮质区Nissl阳性神经元数量减少(P<0.01),HMGB1和p-JNK蛋白表达增加(P<0.01);与模型组相比,电针组大鼠在脑缺血第7天、14天时神经功能缺损评分降低(P<0.05),Nissl阳性神经元数量增加(P<0.01),HMGB1和p-JNK蛋白表达降低(P<0.01)。结论:电针可能通过抑制脑缺血后HMGB1和p-JNK的过表达,减轻前扣带皮质的损伤。

关键词：脑缺血前扣带皮质电针高迁移率族蛋白1 磷酸化c-Jun氨基酸末端激酶

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青蒿鳖甲汤治疗肺部疾病的研究进展

中国实验方剂学杂志 2024年第3期30卷 258-269页

作者：李燕李笑刘妍君郭平山东中医药大学中医学院济南250355

青蒿鳖甲汤出自清代吴鞠通的《温病条辨》,由青蒿、鳖甲、知母、牡丹皮、生地黄5味药组成,具有养阴透热之功效,常用于阴虚内热证的治疗。正气虚损,邪毒入侵,耗伤肺阴,虚热内生,为肺癌、肺炎等肺部疾病的病机之一,其治则为养阴益气,清肺... 详细信息

青蒿鳖甲汤出自清代吴鞠通的《温病条辨》,由青蒿、鳖甲、知母、牡丹皮、生地黄5味药组成,具有养阴透热之功效,常用于阴虚内热证的治疗。正气虚损,邪毒入侵,耗伤肺阴,虚热内生,为肺癌、肺炎等肺部疾病的病机之一,其治则为养阴益气,清肺透热。因此,青蒿鳖甲汤之功效基本契合肺部疾病之治则,故广泛应用于肺部疾病治疗,如肺癌癌性发热、咯血或合并骨转移及肺结核、社区获得性肺炎、新型冠状病毒感染合并肺炎等,疗效显著。基础实验表明,其机制可能为通过多靶点通路发挥调节炎症反应、维持免疫平衡、调节肠道菌群、抗肿瘤、调节激素分泌、调节脂类代谢、抗氧化等作用。此外,青蒿鳖甲汤单味药的主要有效活性成分青蒿素、木犀草素、谷甾醇、豆甾醇、鳖甲多糖、梓醇、芍药苷、槲皮素、丹皮酚、没食子酸、知母皂苷、芒果苷等也具有良好的抗肿瘤、抗氧化、抗病毒、炎症调节和免疫调节的作用。该文通过对青蒿鳖甲汤治疗肺部疾病的临床研究和基础研究进行综述,以期为该方的临床应用提供理论依据。

关键词：青蒿鳖甲汤肺部疾病临床应用作用机制

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陆彦功《伤寒类证便览》文献研究

中华医史杂志 2024年第2期54卷 119-124页

作者：张婷婷刘诗妍王帅虎陆翔安徽中医药大学中医学院合肥230012

《伤寒类证便览》是明新安医家陆彦功编集整理的一部伤寒类医籍,计12卷,初刊于明弘治十二年(1499)。国内外现存有3种版本:一种为藏于日本内阁文库全本和辽宁中医药大学图书馆藏的残本,两地藏本均为婺源汪范依据陆氏保和堂于明弘治十二... 详细信息

《伤寒类证便览》是明新安医家陆彦功编集整理的一部伤寒类医籍,计12卷,初刊于明弘治十二年(1499)。国内外现存有3种版本:一种为藏于日本内阁文库全本和辽宁中医药大学图书馆藏的残本,两地藏本均为婺源汪范依据陆氏保和堂于明弘治十二年刊本进行缮写翻刻的刻本,刊刻时间不详,原保和堂弘治十二年刊本未见;一种为藏于四川省图书馆的所谓“明弘治刻本”;一种为藏于上海中医药大学图书馆的清代精抄本。其文献来源主要有《伤寒类证》《注解伤寒论》《伤寒明理论》《活人书》《太平惠民和剂局方》《此事难知》《伤寒图歌活人指掌》《胎产药方》《小儿伤寒药方》。该书使已经亡佚的《伤寒类证》得以较完整地流传下来。

关键词：陆彦功《伤寒类证便览》《伤寒类证》版本