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基于全基因组重测序技术的浙江近岸海域耐盐金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)耐药机制解析

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海洋与湖沼 2022年第2期53卷 394-404页

作者：张旨轩王子言王泽刘岩刘松怡钱鹏宇叶欢韩姣姣周君苏秀榕宁波大学海洋学院浙江宁波315211 浙江正合谷生物科技有限公司浙江宁波315048

金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是近岸海域海水中的主要病原菌,严重威胁接触者的安全。抗生素处理是治疗金黄色葡萄球菌感染的重要手段,其耐药性的发生受到了高度重视。采用全基因组重测序与KEGG富集分析结合的方法,对红霉素(er... 详细信息

金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是近岸海域海水中的主要病原菌,严重威胁接触者的安全。抗生素处理是治疗金黄色葡萄球菌感染的重要手段,其耐药性的发生受到了高度重视。采用全基因组重测序与KEGG富集分析结合的方法,对红霉素(erythromycin)、氯霉素(chloramphenicol)和万古霉素(vancomycin)处理后的耐盐金黄色葡萄球菌(*** ZS01)和不耐盐金黄色葡萄球菌(*** 502A)进行耐药机制研究。结果表明,*** 502A经抗生素处理后发生突变的程度大于*** ZS01,二者在经过氯霉素处理发生了更大程度的突变。红霉素、氯霉素和万古霉素处理主要影响了金黄色葡萄球菌的致病能力;红霉素和氯霉素可能通过影响金黄色葡萄球菌脂类的代谢引起其耐药性的变化。除此之外,三种抗生素处理均出现了较多TIGR01741家族蛋白和假设蛋白基因的突变,推测与菌株的耐药性和致病性相关。耐盐金黄色葡萄球菌可通过外排系统作用产生红霉素耐药性,不耐盐菌株因细胞壁成分相关基因的突变提高了对万古霉素的耐受性。研究结果可为耐盐和不耐盐金黄色葡萄球菌的耐药机制及抗生素对金黄色葡萄球菌致病性影响的研究提供基础数据。

关键词：金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus) 全基因组重测序 KEGG富集分析耐药机制致病性

米尔贝霉素的产生菌、理化性质、生物学活性及应用研究进展

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中国抗生素杂志 2013年第4期38卷 314-320,I0001,I0002页

作者：林秀萍刘永宏李季伦中国科学院南海海洋研究所中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室/广东省海洋药物重点实验室/海洋微生物研究中心广州510301 中国农业大学生物学院农业生物技术国家重点实验室北京100193

米尔贝霉素(Milbemycins)是一系列在结构上非常类似的十六元环大环内酯类抗生素,可由几种链霉菌产生,具有强烈的杀虫和杀螨等生物学活性。自1967年发现首个米尔贝霉素类化合物以来,大量结构类似的其他化合物被报道。国际上已有多个米尔... 详细信息

米尔贝霉素(Milbemycins)是一系列在结构上非常类似的十六元环大环内酯类抗生素,可由几种链霉菌产生,具有强烈的杀虫和杀螨等生物学活性。自1967年发现首个米尔贝霉素类化合物以来,大量结构类似的其他化合物被报道。国际上已有多个米尔贝霉素类药品实现了商业化,被广泛地用作兽医药物或作物保护农药。主要综述了米尔贝霉素的产生菌,理化性质、生物学活性及应用。

关键词：米尔贝霉素产生菌理化性质生物学活性应用

高浓度CO_2对极大螺旋藻生长和光合作用的影响

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水生生物学报 2001年第5期25卷 474-480页

作者：夏建荣高坤山汕头大学海洋生物实验室汕头515063 中国科学院水生生物研究所武汉430072

以极大螺旋藻作为实验材料 ,研究了高CO2 浓度对极大螺旋藻的生长和光合作用效应 ,结果表明在高光强下 (40 0 μmolm- 2 s- 1 ) ,高浓度CO2 对其生长和光合作用有明显的影响 ,高浓度CO2 培养下 ,螺旋藻的比生长速率是低浓度CO2 培养的 1... 详细信息

以极大螺旋藻作为实验材料 ,研究了高CO2 浓度对极大螺旋藻的生长和光合作用效应 ,结果表明在高光强下 (40 0 μmolm- 2 s- 1 ) ,高浓度CO2 对其生长和光合作用有明显的影响 ,高浓度CO2 培养下 ,螺旋藻的比生长速率是低浓度CO2 培养的 1 2倍 ;而在低光强下 ,高浓度CO2 对其生长和光合作用无明显影响。两种不同CO2 浓度和光强下培养的极大螺旋藻 ,在不同的生长时期 ,分别测定其P -I曲线 ,结果表明低光强下培养的极大螺旋藻 ,在 5d、8d、1 1d ,两者的Ik、α值均无显著差异 ,Pmax在第 5d、1 1d差异不显著 ,但在第 8d有显著差异。而在高光强培养条件下 ,第 8、1 1d通高浓度CO2 培养的极大螺旋藻 ,其Pmax、α值明显大于通低浓度CO2 培养的极大螺旋藻 ,但两者在第 5d无明显差异。

关键词：极大螺旋藻 CO2 生长光合作用

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仿刺参体壁手术缝合方法的研究

大连海洋大学学报 2013年第3期28卷 277-280页

作者：赵丽娜李霞李雅娟秦艳杰大连海洋大学辽宁省海洋生物资源与生境修复重点实验室农业部北方海水增养殖重点实验室辽宁大连116023

以仿刺参Apostichopus japonicus为试验材料,建立了一种海参体壁手术缝合的方法。将体质量为(55±2.6)g的仿刺参放入盛有0.54 mol/L硫酸镁溶液的解剖盘中麻醉1 h,然后用灭菌手术刀沿腹后部1/3处往前纵向切开约2 cm切口,深至体腔。采用... 详细信息

以仿刺参Apostichopus japonicus为试验材料,建立了一种海参体壁手术缝合的方法。将体质量为(55±2.6)g的仿刺参放入盛有0.54 mol/L硫酸镁溶液的解剖盘中麻醉1 h,然后用灭菌手术刀沿腹后部1/3处往前纵向切开约2 cm切口,深至体腔。采用单纯对合缝合法进行缝合,缝合后放回加有抗生素的水槽中培育。结果表明:试验组仿刺参伤口经缝合后,创口在10 d时已基本愈合,20 d时切口处组织与正常组织没有区别,且在培育过程中,化皮率为10%,死亡率仅为5%;对照组伤口未经缝合,其创口愈合时间较试验组平均慢10 d,且化皮率高达58.7%,死亡率为51.7%。该方法可应用到海参的创伤试验研究以及养殖生产中。

关键词：仿刺参体壁手术缝合

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中国近海马蹄鳃科(后鳃类)的研究

中国近海马蹄鳃科(后鳃类)的研究

南海东北部陆坡天然气水合物钻探区生物地层与沉积速率

中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学会分会第十四次学会研讨会

作者：尤仲杰林光宇宁波市海洋与渔业研究院宁波大学海洋生物工程重点实验室中国科学院海洋研究所

马蹄鳃科(Tergipedidae)动物小型,呈细长—蓑海牛形。口触手短,呈指状或没有口触手。嗅角比口触手长,简单,光滑,没有嗅角鞘。鳃突起有很多斜列,排列成规则的马蹄形,通常突起呈纺锤形或棍棒状,有肝分支到达,易脱落。生殖孔、肛门、肾孔... 详细信息

马蹄鳃科(Tergipedidae)动物小型,呈细长—蓑海牛形。口触手短,呈指状或没有口触手。嗅角比口触手长,简单,光滑,没有嗅角鞘。鳃突起有很多斜列,排列成规则的马蹄形,通常突起呈纺锤形或棍棒状,有肝分支到达,易脱落。生殖孔、肛门、肾孔位于身体右侧的鳃列之间。足狭长,前端双褶襞,前侧隅呈小尖角状或圆形,后端削尖形成尾部,有足腺或没有。阴茎有几丁质的针刺或无,有附属阴茎腺开口于阴茎鞘。

关键词：海牛属

来源： cnki会议评论

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cnki会议

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地球科学（中国地质大学学报） 2016年第3期41卷 416-424页

作者：陈芳庄畅周洋苏新段虓刘广虎吴聪荆夏广州海洋地质调查局国土资源部海底矿产资源重点实验室广东广州510075 中国地质大学海洋学院北京100083

2013年我国首次在南海东北部东沙陆坡实施天然气水合物钻探,并获取块状等可视天然气水合物样品.为了解钻区地层、天然气水合物产出带（the zone of gas hydrate occurrence）或天然气水合物储层的地层时代和沉积速率特征,对其中5个站位... 详细信息

2013年我国首次在南海东北部东沙陆坡实施天然气水合物钻探,并获取块状等可视天然气水合物样品.为了解钻区地层、天然气水合物产出带（the zone of gas hydrate occurrence）或天然气水合物储层的地层时代和沉积速率特征,对其中5个站位（GMGS05、GMGS07、GMGS08、GMGS09和GMGS16）的岩心沉积物进行钙质超微化石、有孔虫生物地层学和沉积速率变化的研究.钻孔取心最大深度为213.55m.共识别出第四纪中更新世以来3个钙质超微化石事件和2个有孔虫事件,确定了钻探区所钻达最老地层为中更新统;天然气水合物产出带的地层时代为中更新世-全新世约0.44Ma以来.钻区0.12Ma以来的沉积速率介于36.9~73.3cm/ka之间,平均值高达54.2cm/ka,0.44Ma以来平均沉积速率为47.4cm/ka,表明东沙海域天然气水合物钻探区位于一高沉积速率堆积体上,高沉积速率更有利于天然气水合物的成藏,该结论与前人研究结果一致.

关键词：生物地层沉积速率中更新世天然气水合物钻区南海东北部陆坡

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水产养殖尾水处理技术的研究现状和发展趋势

中国农学通报 2024年第12期40卷 159-164页

作者：郑仕夫徐慧敏陈曦裘丽萍宋超范立民李丹丹孟顺龙徐跑上海海洋大学上海201306 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心/农业农村部水产品质量安全环境因子风险评估实验室(无锡)/中国水产科学研究院内陆渔业生态环境和资源重点开放实验室江苏无锡214081

随着中国水产养殖的快速发展,养殖尾水排放造成的环境问题越来越严重,如何处理养殖尾水成为了近年来要着重研究的内容。目前,水产养殖尾水处理技术主要包含物理处理、化学处理、生物处理等方法,在实际生产中常常组合使用。结合国内外的... 详细信息

随着中国水产养殖的快速发展,养殖尾水排放造成的环境问题越来越严重,如何处理养殖尾水成为了近年来要着重研究的内容。目前,水产养殖尾水处理技术主要包含物理处理、化学处理、生物处理等方法,在实际生产中常常组合使用。结合国内外的研究现状,对水产养殖尾水处理的物理、化学及生物技术进行了综述和分析,并对未来中国水产养殖尾水处理技术的发展趋势进行了展望,旨在为水产养殖尾水处理提供一些参考和方向。

关键词：水产养殖尾水处理现状趋势

半滑舌鳎雌性特异fosmid克隆的筛选及FISH定位

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中国海洋大学学报（自然科学版） 2011年第11期41卷 57-60页

作者：翟腾王旭波王晶高金宁翟介明张全启中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室山东青岛266003 莱州明波水产有限公司山东莱州261418

通过对半滑舌鳎雌鱼fosmid文库进行有序混合,成功构建了两步-三维PCR筛选体系,为后续的基因筛选奠定了基础。通过对半滑舌鳎W染色体文库序列进行引物设计,并分别在雌、雄鱼基因组DNA中筛选,获得1对雌鱼特异性引物。使用该引物对fosmid... 详细信息

通过对半滑舌鳎雌鱼fosmid文库进行有序混合,成功构建了两步-三维PCR筛选体系,为后续的基因筛选奠定了基础。通过对半滑舌鳎W染色体文库序列进行引物设计,并分别在雌、雄鱼基因组DNA中筛选,获得1对雌鱼特异性引物。使用该引物对fosmid文库进行筛选,得到1个雌鱼特异性克隆,并通过荧光原位杂交技术将克隆定位到了W性染色体上,证实了使用该体系进行文库筛选的有效性以及雌鱼引物的特异性,建立了半滑舌鳎遗传性别的分子及细胞遗传学鉴定方法,为后续半滑舌鳎基因组及性染色体的研究奠定了基础。

关键词：半滑舌鳎 fosmid文库超级池荧光原位杂交

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深海囊螂蛤铁蛋白的环境选择压力分析

海洋通报 2023年第5期42卷 533-544页

作者：孔雪王玮蔡月凤李亚男张驰乐张海滨申欣江苏海洋大学海洋科学与水产学院江苏连云港222000 江苏海洋大学江苏省海洋生物资源与环境重点实验室/江苏省海洋生物技术重点实验室江苏连云港222000 仲恺农业工程学院动物科技学院广东广州510225 中国科学院深海科学与工程研究所海南三亚572000

深海环境常有高压、极端温度、富含重金属、黑暗、寡营养等特点。生活在该种特殊环境中的生物可能演绎出不同机制适应此生境。囊螂科贝类是深海冷泉/热液区的优势物种,拟通过对来自冷泉/热液区囊螂科贝类铁蛋白进行环境选择压力分析,以... 详细信息

深海环境常有高压、极端温度、富含重金属、黑暗、寡营养等特点。生活在该种特殊环境中的生物可能演绎出不同机制适应此生境。囊螂科贝类是深海冷泉/热液区的优势物种,拟通过对来自冷泉/热液区囊螂科贝类铁蛋白进行环境选择压力分析,以期解析其适应深海特殊生境(高铁环境、高静水压)的机制。通过本地比对的方式获得了囊螂蛤和其近缘种铁蛋白的核苷酸和氨基酸序列,其均有ferritin保守功能域和相应的保守位点。其中,囊螂蛤铁蛋白Cmfer-2、Cmagfer-3、Pofer-3属于M型铁蛋白,其他归属为H型铁蛋白。Cmagfer-4和Pofer-4可初步判断为分泌型铁蛋白,而其他囊螂蛤铁蛋白与胞质型铁蛋白聚为一支。为了探索环境因素对深海贝类铁蛋白的影响,运用PAML软件对深浅海铁蛋白进行了选择压力分析。结果显示总共鉴定到8个正选择位点,其后验概率大于95%。其中,在含有嗜压氨基酸的对应组中,约50%浅海位点置换为嗜压的氨基酸,进一步证明了17A、55R、171S氨基酸置换是铁蛋白适应深海压力变化的一种策略。更进一步研究发现69K→I/T/M和171E/K→S由带电荷的极性氨基酸置换为不带电荷的氨基酸,并且大部分受到选择的位点位于蛋白的N端和C端,深海囊螂蛤铁蛋白可能通过特定氨基酸极性的转变和分布区域的改变来适应深海特殊环境。本文通过深浅海贝类铁蛋白的分析来为深海生物对极端环境的适应研究提供一些信息和见解。

关键词：铁蛋白冷泉热液区正选择囊螂蛤