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非编码RNA编码多肽在原发性肝细胞癌中的研究进展

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中华肝脏病杂志 2024年第1期32卷 91-96页

作者：谌冬梅于洲张泽威黄金兰福建医科大学附属第一医院检验科福州350005 福建省检验医学重点实验室福州350005 福建医科大学基因诊断研究中心福州350005 福建医科大学医学技术与工程学院福州350004

肝细胞癌(HCC)是最常见的恶性肿瘤之一,其进展迅速,预后不良。越来越多的研究表明大量非编码RNA(ncRNA)的分子序列上存在小的开放阅读框(sORFs),这些sORFs可编码保守的多肽,而这些保守多肽在调控HCC的发生、发展中起着重要作用。现介绍n... 详细信息

肝细胞癌(HCC)是最常见的恶性肿瘤之一,其进展迅速,预后不良。越来越多的研究表明大量非编码RNA(ncRNA)的分子序列上存在小的开放阅读框(sORFs),这些sORFs可编码保守的多肽,而这些保守多肽在调控HCC的发生、发展中起着重要作用。现介绍ncRNA编码多肽的发现、预测与验证方法,并对其在HCC中的研究进展进行综述,以期为HCC的早期诊断、靶向治疗以及预后评估等方面提供新的靶点和思路。

关键词：肝细胞癌非编码RNA 开放阅读框多肽

雌激素和孕激素诱导的乳腺增生大鼠血清代谢组学研究

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中国病理生理杂志 2024年第9期40卷 1718-1726页

作者：马茜茜明慧白雪刘佳张俊飞内蒙古民族大学公共卫生学院内蒙古通辽028000 宁夏医科大学总医院医学实验中心宁夏银川750000 宁夏医科大学总医院急诊科宁夏银川750000

目的:基于液相色谱-质谱联用法(LC-MS)的血清代谢组学探究大鼠乳腺增生的发生机制以及潜在差异代谢物。方法:将12只SPF级8周龄Wistar雌性大鼠随机分为正常组(n=6)和模型组(n=6),模型组给予肌肉注射苯甲酸雌二醇(0.5 mg·kg^(−1)·d^(−1... 详细信息

目的:基于液相色谱-质谱联用法(LC-MS)的血清代谢组学探究大鼠乳腺增生的发生机制以及潜在差异代谢物。方法:将12只SPF级8周龄Wistar雌性大鼠随机分为正常组(n=6)和模型组(n=6),模型组给予肌肉注射苯甲酸雌二醇(0.5 mg·kg^(−1)·d^(−1)),连续注射21 d,随后肌肉注射黄体酮(4 mg·kg^(−1)·d^(−1)),连续注射7 d,制备乳腺增生模型。测定大鼠体重和乳头直径,并观察乳腺组织病理形态变化。造模成功后,利用大鼠血清进行LC-MS代谢组学分析,采用主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘判别分析法(PLS-DA)筛选正常组与模型组血清中的差异代谢物,并通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)开放数据库对差异的标志物进行代谢通路分析。结果:与正常组大鼠相比,模型组大鼠体重无显著变化(P>0.05);乳头直径显著扩大(P生物代谢和脂质代谢途径有关。血清代谢组学鉴定出的13种敏感度较高的差异代谢物,可为乳腺增生疾病的诊断提供参考。

关键词：乳腺增生发病机制代谢组学生物标志物代谢通路

METTL3通过YTHDF2/AKT1/PPARγ调控人骨髓间充质干细胞成脂分化的机制研究

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中国病理生理杂志 2024年第5期40卷 777-785页

作者：潘志鹏陈玲游若兰黄慧芳福建医科大学附属协和医院中心实验室福建福州350001 福建医科大学医学技术与工程学院福建福州350122

目的:探讨N^(6)-甲基腺苷(m^(6)A)甲基化酶甲基转移酶样蛋白3(METTL3)在体外调控人骨髓间充质干细胞(MSCs)向脂肪细胞分化的作用机制。方法:构建METTL3、AKT丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)和YTH m^(6)... 详细信息

目的:探讨N^(6)-甲基腺苷(m^(6)A)甲基化酶甲基转移酶样蛋白3(METTL3)在体外调控人骨髓间充质干细胞(MSCs)向脂肪细胞分化的作用机制。方法:构建METTL3、AKT丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)和YTH m^(6)A RNA结合蛋白F2(YTHDF2)慢病毒载体,包装慢病毒并感染MSCs;采用成脂分化试剂盒诱导各组MSCs分化为脂肪细胞,利用油红O染色检测各组的脂肪细胞形成情况;采用分子克隆技术构建METTL3突变重组载体以证实METTL3的m^(6)A关键位点对靶基因的调控作用;利用放线菌素D作用于YTHDF2过表达的MSCs以探究阅读蛋白YTHDF2对AKT1 mRNA和蛋白表达的影响;采用RNA pull-down结合银染和Western blot实验检测可能发生甲基化修饰的片段与识别蛋白的结合情况。结果:m^(6)A甲基化酶METTL3以PPARγ/AKT1依赖的方式抑制骨髓MSCs的脂肪形成,并且以m^(6)A修饰阅读蛋白YTHDF2依赖的方式抑制AKT1的蛋白表达。YTHDF2可识别并结合发生m^(6)A修饰的AKT1编码序列(CDS),降低其表达水平,抑制MSCs脂肪形成过程。结论:m^(6)A甲基化酶METTL3通过YTHDF2/AKT1/PPARγ通路调控人骨髓MSCs成脂分化过程。本研究为从肿瘤微环境角度寻找急性髓系白血病治疗新靶点提供了理论依据。

关键词：急性髓系白血病间充质干细胞 METTL3蛋白成脂分化

慢性静力性损伤模型家兔颈后肌群转录组学的生物信息分析

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中国康复医学杂志 2024年第4期39卷 480-487页

作者：杨楠魏晓歌袁兰英穆静孙文静宋斐王燕李开颖马惠昇宁夏医科大学中医学院宁夏回族自治区银川市750000 宁夏少数民族医药现代化教育部重点实验室

目的:利用转录组测序分析技术研究慢性静力性损伤模型家兔颈后肌的差异表达基因(DEGs)和关键信号通路。方法:通过长期反复屈曲家兔颈部复制兔颈后肌慢性静力负荷损伤模型。利用转录组测序技术筛选DEGs并进行GO功能富集和KEGG通路富集分... 详细信息

目的:利用转录组测序分析技术研究慢性静力性损伤模型家兔颈后肌的差异表达基因(DEGs)和关键信号通路。方法:通过长期反复屈曲家兔颈部复制兔颈后肌慢性静力负荷损伤模型。利用转录组测序技术筛选DEGs并进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。构建PPI网络,筛选出前10位的DEGs。结果:与空白组相比,共有310个DEGs,其中上调193个,下调117个;GO分析显示,模型组差异基因主要涉及炎症和免疫反应调节等相关功能;KEGG分析显示吞噬体与Fcγ-R介导的吞噬作用、NF-κB等信号通路表现活跃。PPI网络确定了10个hub基因,其中TLR4、CTSS、ITGB2、TYROBP、CD74、LAPTM5等表达上调,仅PPARG表达下调。结论:颈肌慢性静力性损伤的病理变化涉及众多基本的生物学过程,炎症反应及免疫微环境的紊乱在其中发挥着重要作用;与炎症反应密切相关的差异基因以及NF-κB信号通路、吞噬体、Fcγ-R介导的吞噬作用等通路分子的转录激活可能是其主要的分子机制。

关键词：慢性静力性损伤颈肌损伤转录组测序差异表达基因

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数值孔径对飞秒激光角膜切削的影响

中国激光 2024年第9期51卷 247-253页

作者：吕海军王雨李华明张卓宇赵新恒吕晓华刘秀丽曾绍群华中科技大学武汉光电国家研究中心高端生物医学成像重大科技基础设施生物医学光子学教育部重点实验室BrittonChance生物医学光子学研究中心湖北武汉430074 天津市眼科医院南开大学附属眼科医院天津医科大学眼科临床学院南开大学眼科学研究院天津300020

飞秒激光得益于其精准、微创等优势被广泛应用于屈光疾病的治疗。在飞秒激光屈光手术中,光学系统的数值孔径是影响手术效果的重要参数。本研究旨在探讨数值孔径对飞秒激光角膜基质切削质量的影响规律,以帮助临床医生更好地选择合适的手... 详细信息

飞秒激光得益于其精准、微创等优势被广泛应用于屈光疾病的治疗。在飞秒激光屈光手术中,光学系统的数值孔径是影响手术效果的重要参数。本研究旨在探讨数值孔径对飞秒激光角膜基质切削质量的影响规律,以帮助临床医生更好地选择合适的手术参数。选用0.16、0.30、0.80三种数值孔径进行离体动物角膜的飞秒激光切削实验,并通过气泡尺寸与凋亡细胞比例评估激光切削质量与基质细胞损伤程度。实验结果显示:气泡体积随着数值孔径的增大而减小,高数值孔径下切割更易实现基质层的分离;上述三种数值孔径下的基质细胞损伤比例分别为9.4%、4.9%和1.0%,基质细胞的损伤比例随着数值孔径的增大而明显下降。因此,增大数值孔径有助于提高飞秒激光角膜基质切削的安全性。

关键词：激光技术飞秒激光角膜数值孔径气泡细胞损伤

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细菌生物膜耐药机制与纳米生物治疗研究

生物化学与生物物理进展 2024年第7期51卷 1604-1617页

作者：何卓俊陈玉颖周泱戴桂琴刘德亮刘孟德高健辉陈泽邓嘉玉梁光炎魏莉赵鹏飞卢洪洲郑明彬广东医科大学药学院东莞市药物设计与制剂技术重点实验室广东医科大学纳米药物制剂重点实验室东莞523808 深圳市第三人民医院国家感染性疾病临床医学研究中心深圳市结核病临床医学研究中心肝病研究所深圳518112 中国科学院深圳先进技术研究院中国科学院健康信息学重点实验室广东省纳米医药重点实验室深圳518055 广东金融学院国际教育学院广州510521 临沂市人民医院呼吸与重症医学科临沂273300

由细菌生物膜造成的耐药是感染性疾病的临床挑战,严重危害人类健康。细菌定植在机体后产生胞外基质形成生物膜,其具有结构致密、高黏附性、药物低渗等特征,是临床传统药物治疗感染性疾病失败的关键原因。因此,亟待开发抗细菌生物膜感染... 详细信息

由细菌生物膜造成的耐药是感染性疾病的临床挑战,严重危害人类健康。细菌定植在机体后产生胞外基质形成生物膜,其具有结构致密、高黏附性、药物低渗等特征,是临床传统药物治疗感染性疾病失败的关键原因。因此,亟待开发抗细菌生物膜感染的新型治疗策略,应对日益严峻的耐药感染。纳米生物材料具有特异靶向、智能递送、载药量高、毒副性低、穿透性强等优势,被广泛用于细菌生物膜相关感染的治疗。本文阐述了细菌生物膜的生物学特性及其耐药分子机制,介绍了纳米生物材料通过破坏成熟生物膜、阻断细菌通信、抑制细菌代谢和增强生物膜渗透等策略治疗细菌感染的进展,并展望了纳米材料生物治疗的发展趋势与转化前景。

关键词：细菌生物膜耐药机制纳米药物生物治疗

副干酪乳杆菌FZU103对小鼠酒精性肝损伤的防控作用

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食品科学 2024年第7期45卷 135-144页

作者：梁梓华李嘉仪谢林惠杨梓翊尤适泽吴超李文龙艾连中倪莉吕旭聪陈有挺福州大学生物科学与工程学院食品科学技术研究所福建福州350108 福州大学先进制造学院食品营养与健康研究中心福建晋江362200 福建医科大学第一临床医学院福建福州350004 上海理工大学健康科学与工程学院上海食品微生物工程技术研究中心上海200093 福建医科大学附属第一医院肝胆胰外科福建福州350004

目的:探究副干酪乳杆菌FZU103(Lactobacillus paracasei FZU103,LP-FZU103)对酒精性肝损伤(alcoholic liver injury,ALI)的防控作用。方法:选取36只SPF级ICR小鼠,随机分为空白组、模型组、实验组(LP-FZU103干预),实验6周后测定体质量及脏器系数、血清及肝脏生化、肝组织病理学及炎症因子、肝功能相关基因转录和肠道菌群组成。结果:与模型组相比,LP-FZU103干预可改善ALI小鼠的脏器系数和肝组织病理损伤程度,显著降低血清中总胆固醇、甘油三酯和低密度脂蛋白胆固醇浓度以及谷丙转氨酶和谷草转氨酶活性,提高血清高密度脂蛋白胆固醇浓度;显著提高肝脏中过氧化氢酶和超氧化物歧化酶活性以及谷胱甘肽含量,降低肝脏中丙二醛含量和白细胞介素6、干扰素γ水平;显著上调脂质代谢相关基因Ldlr及下调Acc1、Hmgcr和Cd36的mRNA水平;显著增加小鼠肠道中约氏乳杆菌(Lactobacillus johnsonii)、罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri)、副干酪乳杆菌(Lactobacillus paracasei)等有益细菌的相对丰度。结论:LP-FZU103干预可一定程度防控小鼠ALI的发生,这与其改善肠道菌群及肝脏代谢功能密切相关。

关键词：副干酪乳杆菌酒精性肝损伤氧化应激肝功能基因肠道菌群

冠层活性相关性状全基因组关联分析及其对产量性状遗传效应的解析

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中国农业科学 2024年第4期57卷 627-637页

作者：李法计程敦公余晓丛闻伟锷刘金栋翟胜男刘爱峰郭军曹新有刘成宋健民刘建军李豪圣山东省农业科学院作物研究所/小麦玉米国家工程研究中心/农业农村部黄淮北部小麦生物学与遗传育种重点实验室/山东省小麦技术创新中心/济南市小麦遗传改良重点实验室菏泽学院农业与生物工程学院(牡丹学院) 遵义医科大学细胞生物学教研室中国农业科学院作物科学研究所

【目的】冠层活性是反映作物生长发育的重要指标，发掘小麦冠层活性相关基因并分析其与产量性状的关系，为解析产量遗传结构和辅助育种提供理论支撑。【方法】以166份国内外小麦品种为材料，将其种植于河南安阳和安徽濉溪，结合已构建... 详细信息

【目的】冠层活性是反映作物生长发育的重要指标，发掘小麦冠层活性相关基因并分析其与产量性状的关系，为解析产量遗传结构和辅助育种提供理论支撑。【方法】以166份国内外小麦品种为材料，将其种植于河南安阳和安徽濉溪，结合已构建的包含326 570个来源于小麦90K和660K SNP芯片标记的高密度整合物理图谱，对苗期和花后10 d归一化植被指数(NDVI-S和NDVI-10)及花后10 d旗叶叶绿素含量(Chl-10)进行关联分析，并与前期利用相同材料得到的产量相关性状结果进行比较。【结果】NDVI-S、NDVI-10和Chl-10在基因型、环境及基因型×环境互作间变异方差均达极显著(P<0.01)差异，广义遗传力(hb2)分别为0.81、0.81和0.91。分别检测到13、12和15个与NDVI-S、NDVI-10和Chl-10显著相关的位点，其中，有12、11和12个为新位点，5个位点与2个以上性状有关。166份小麦品种含有NDVI-S、NDVI-10和Chl-10优异等位基因数变幅分别为4-11、3-11和4-12，且随着优异等位基因数目增加其对应表型值呈递增趋势。NDVI-S与千粒重、粒长和粒宽显著正相关(P<0.01);Chl-10与产量和旗叶宽显著正相关(P<0.01)，与单位面积穗数、株高和穗下节长显著负相关(P<0.01)。检测到7个同时与产量和冠层活性相关的多效性位点。【结论】NDVI-S可用于品种产量性状的选择，检测到的稳定位点和多效性位点可在开发标记后用于育种材料的检测。

关键词：小麦冠层活性产量归一化植被指数叶绿素含量关联分析

高光谱结合哈里斯鹰优化核极限学习机鉴别化橘红胎切片年份

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光谱学与光谱分析 2024年第5期44卷 1494-1500页

作者：谢百亨马晋芳周泳欣韩雪勤陈嘉泽朱思祁杨懋勋黄富荣暨南大学光电工程系广东广州510632 广东医科大学药学院广东天然药物研究与开发重点实验室广东东莞523808 国家中药现代化工程技术研究中心海洋中药分中心广东湛江524023

化橘红胎是药用历史悠久的广东省道地中药材,由于其制品收藏年份越久远价格越高,市面上常有以次充好的现象。为此,采用高光谱成像技术,结合哈里斯鹰优化核极限学习机对四组不同年份的化橘红胎切片样品进行鉴别。采集四个年份共193个化... 详细信息

化橘红胎是药用历史悠久的广东省道地中药材,由于其制品收藏年份越久远价格越高,市面上常有以次充好的现象。为此,采用高光谱成像技术,结合哈里斯鹰优化核极限学习机对四组不同年份的化橘红胎切片样品进行鉴别。采集四个年份共193个化橘红胎切片样本400~1000 nm的高光谱图像。首先采用主成分分析法(PCA)分析化橘红胎切片的原始反射光谱,然后分别采用Savitzky-Golay平滑(S-G平滑)、多元散射校正(MSC)、标准正态变量交换(SNV)对样本光谱进行预处理并建立核极限学习机(KELM)模型;发现经SNV处理的样本光谱的判别准确率最高,训练集达到99.24%,测试集95.56%;进一步用竞争性自适应重加权算法(CARS)、蒙特卡洛无信息变量消除法(MCUVE)对样本光谱进行特征波长的选择;最后,采用KELM建立判别模型,同时使用哈里斯鹰算法(HHO)优化KELM参数选择并比较建模效果。结果表明:基于HHO-KELM的判别效果相较KELM有0.76%~4.44%的提升,通过MCUVE筛选所得特征波段信息冗余明显减少且精度提升,训练集和测试集最佳准确率均可达100%,故采用高光谱成像技术可以实现对不同年份的化橘红胎切片进行无损鉴别。

关键词：化橘红胎高光谱成像特征波长核极限学习机