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我国西沙群岛仙掌藻属Halimeda(绿藻门钙扇藻科)的分类学研究

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天津师范大学学报（自然科学版） 2024年第3期44卷 28-36页

作者：丁兰平王雨昕刘金梅鲍时翔黄冰心天津师范大学生命科学学院天津300387 天津师范大学天津市动植物抗性重点实验室天津300387 中国热带农业科学院热带生物技术研究所海口571101

为了探究仙掌藻属(Halimeda)在我国的分布及其分类,利用形态学、解剖学以及分子系统发育学方法,对2019年6月采集于西沙群岛的仙掌藻属样品进行形态学观察和分子系统发育分析.基于形态特征和rbcL基因序列的系统发育分析结果,共鉴定出了4... 详细信息

为了探究仙掌藻属(Halimeda)在我国的分布及其分类,利用形态学、解剖学以及分子系统发育学方法,对2019年6月采集于西沙群岛的仙掌藻属样品进行形态学观察和分子系统发育分析.基于形态特征和rbcL基因序列的系统发育分析结果,共鉴定出了4个物种,即大叶仙掌藻(Halimeda macroloba)、仙掌藻(H. opuntia)、厚节仙掌藻(H. incrassata)和裂圆仙掌藻(新拟名)(H. monile).其中,H. monile为我国新纪录种,其主要特征为藻体节片分枝三裂,节片呈圆柱状,外层囊胞脱钙后不分离.在此基础上,分析仙掌藻属的属内组级系统以及属内其他相关物种间的关系,基于rbcL序列的分析结果显示,仙掌藻属物种(几乎涵盖了该属内的所有物种)形成了5个具有较好支持率的进化支.

关键词：仙掌藻属 Halimeda monile rbcL 分类学形态西沙群岛

基于转录组的海州香薷COPT铜转运蛋白家族鉴定及响应铜胁迫表达分析

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天津师范大学学报（自然科学版） 2024年第2期44卷 34-41页

作者：周仲乐马春婕王正宁宋文华马晗晗张海燕天津师范大学生命科学学院天津300387 天津师范大学天津市动植物抗性重点实验室天津300387 铜陵市自然资源和规划局(林业局)郊区分局安徽铜陵244000

为了解海州香薷(Elsholtzia splendens)COPT(copper transporter)铜转运蛋白对铜胁迫的响应规律,运用生物信息学方法对海州香薷转录组数据库中的COPT家族成员进行鉴定与分析,构建植物表达载体探究蛋白的亚细胞定位.结果显示:海州香薷转... 详细信息

为了解海州香薷(Elsholtzia splendens)COPT(copper transporter)铜转运蛋白对铜胁迫的响应规律,运用生物信息学方法对海州香薷转录组数据库中的COPT家族成员进行鉴定与分析,构建植物表达载体探究蛋白的亚细胞定位.结果显示:海州香薷转录组中有11个EsCOPT成员,它们编码的蛋白质由72~159个氨基酸组成,等电点介于4.72~9.92,平均相对分子质量为12.870×10^(3).11个成员均为膜蛋白,系统进化树分析显示EsCOPT蛋白分别属于3个亚组.正常条件下,EsCOPT2和EsCOPT9表达量较高,铜处理后,除EsCOPT5的表达无明显变化外,其他EsCOPTs的表达均呈下降趋势.全长EsCOPT9编码的蛋白具有3个跨膜结构域且N末端较短,共定位实验表明EsCOPT9-GFP定位于液泡膜上.

关键词：海州香薷铜转运蛋白铜胁迫转录组

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宝坻大蒜多倍体细胞诱导及试管鳞茎代际效应

分子植物育种 2024年

作者：杨凯丽周诗瑶张艳婷陈虔王玉雯张娜范宝莉尚云涛王振英天津师范大学天津市水资源与水环境重点实验室天津市农业科学院农产品保鲜与加工技术研究所(国家农产品保鲜工程技术研究中心(天津))农业农村部农产品贮藏保鲜重点实验室天津市农产品采后生理与贮藏保鲜重点实验室天津师范大学生命科学学院天津市动植物抗性重点实验室

为建立宝坻大蒜多倍体诱导的最优方法，创新大蒜的种质资源，本研究分别以秋水仙素和甲基胺草磷(amiprophose methyl， APM)为诱变剂，通过浸泡法处理大蒜花序轴，再以花序轴为外植体离体培养诱导试管鳞茎，经连续两代种植，对不同代际... 详细信息

为建立宝坻大蒜多倍体诱导的最优方法，创新大蒜的种质资源，本研究分别以秋水仙素和甲基胺草磷(amiprophose methyl， APM)为诱变剂，通过浸泡法处理大蒜花序轴，再以花序轴为外植体离体培养诱导试管鳞茎，经连续两代种植，对不同代际植株进行鉴定分析。结果表明，花序轴经0.025%秋水仙素处理15 h以及8 μmol/L APM处理4 h诱导得到的试管鳞茎，直径、重量分别是对照组的1.23倍、1.72倍以及1.10倍、1.18倍。两种处理种植得到的一代鳞茎性状最优，且多倍体细胞诱导率最高，分别为40.00%和33.33%；二代鳞茎株高分别是对照组的1.22倍和1.23倍，多倍体细胞诱导率分别为29.17%和25.00%。本研究为建立宝坻大蒜多倍体育种体系提供理论依据。

关键词：宝坻大蒜多倍体育种秋水仙素 APM 倍性鉴定

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畜牧业抗生素抗性基因的分布与传播研究进展

家畜生态学报 2024年第4期45卷 1-7页

作者：刘影张晋东吴艳丽杨琰瑛周材权西南野生动植物资源保护教育部重点实验室/西华师范大学生命科学学院四川南充637009 农业农村部环境保护科研监测所天津300191 农业农村部农产品质量安全环境因子控制重点实验室天津300191 西华师范大学生态研究院四川南充637002

随着居民生活水平提高,人们对肉、蛋、奶的需求量增加,促使畜牧业迅速发展。由于抗生素在提高动物机能、预防疾病方面具有重要作用而被大量生产使用,在全球抗生素滥用的大背景下,畜禽已成为抗生素及抗性基因的一个重要储存库,亟需全面... 详细信息

随着居民生活水平提高,人们对肉、蛋、奶的需求量增加,促使畜牧业迅速发展。由于抗生素在提高动物机能、预防疾病方面具有重要作用而被大量生产使用,在全球抗生素滥用的大背景下,畜禽已成为抗生素及抗性基因的一个重要储存库,亟需全面了解畜牧业中抗生素及抗性基因的分布与传播,以便于为抗生素在畜牧业中的科学使用和合理控制提供参考依据。文章综述了畜牧业抗生素的使用现状,总结了抗生素抗性基因污染对畜禽、人类健康和野生动物的影响,并强调未来应关注畜禽粪便的二次污染在周围环境以及畜牧业抗生素抗性基因在野生动物栖息地的扩散机制研究,以期为今后畜牧业的健康发展、抗生素的科学控制以及抗生素抗性基因的相关研究提供参考。

关键词：畜牧业抗生素抗生素抗性基因分布传播

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可降解PLA/PBAT塑料的微生物菌群结构研究

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安徽农业科学 2024年第4期52卷 57-61,70页

作者：裴雯玉江雨韩李娜陈怡吴弘天津师范大学生命科学学院天津300387 天津师范大学天津市动植物抗性重点实验室天津300387

为探究PLA/PBAT复合材料在菌群处理下的降解情况,加快该塑料的生物降解速率。通过富集培养法筛选获得不同批次的可降解菌群,基于失重法评估不同批次菌群对于PLA/PBAT复合材料的降解能力,并利用高通量测序分析批次间微生物的结构特点。... 详细信息

为探究PLA/PBAT复合材料在菌群处理下的降解情况,加快该塑料的生物降解速率。通过富集培养法筛选获得不同批次的可降解菌群,基于失重法评估不同批次菌群对于PLA/PBAT复合材料的降解能力,并利用高通量测序分析批次间微生物的结构特点。结果发现,通过多轮富集后,在相同的处理周期内,PLA/PBAT塑料的失重率由2.52%提高到4.93%。转接多批次后在门分类水平上菌群丰度最高的5个菌门分别为拟杆菌门、浮霉菌门、变形菌门、装甲菌门和绿弯菌门,占比超过95.00%;在属水平上,丰度较高的分别为拟杆菌门OPB56属和浮霉菌门SH-PL14属。微生物群落结构随着不断的转接而趋于稳定。

关键词： PLA/PBAT塑料失重率高通量测序菌群结构

锦鸡儿属灌丛化对草原化荒漠区土壤线虫群落组成和代谢足迹的影响

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生态学报 2022年第10期42卷 4124-4136页

作者：赵芳张明伟王春雯梅续芳解李娜马成仓天津师范大学生命科学学院天津市动植物抗性重点实验室天津300387

调查了内蒙古草原化荒漠区3种锦鸡儿[垫状锦鸡儿(Caragana tibetica)、荒漠锦鸡儿(***)和狭叶锦鸡儿(***)]灌丛内、外土壤线虫群落多样性、组成和代谢足迹,以及相关的土壤理化性质和植物群落特征,旨在探讨锦鸡儿属灌丛对土壤线虫群落的... 详细信息

调查了内蒙古草原化荒漠区3种锦鸡儿[垫状锦鸡儿(Caragana tibetica)、荒漠锦鸡儿(***)和狭叶锦鸡儿(***)]灌丛内、外土壤线虫群落多样性、组成和代谢足迹,以及相关的土壤理化性质和植物群落特征,旨在探讨锦鸡儿属灌丛对土壤线虫群落的影响,并分析这种影响是否具有灌木种间差异,同时从线虫功能团水平上探究灌丛如何通过非生物因素和生物因素影响线虫群落组成。结果表明:锦鸡儿属灌丛对土壤线虫多度、丰富度和多样性无显著影响,但却显著影响土壤线虫群落组成。原因是灌丛对土壤线虫群落具有物种选择性;灌丛可能主要是通过根系分泌物、凋落物质量等因素,而不是通过土壤理化性质和林下植物影响线虫群落组成。土壤线虫组成的变化引起线虫代谢足迹发生明显变化。灌丛内土壤线虫功能代谢足迹大于灌丛外(除狭叶锦鸡儿外),说明灌丛内土壤线虫群落对碳的利用率更高。3种锦鸡儿属灌木中,狭叶锦鸡儿的结构代谢足迹最大,表明狭叶锦鸡儿对捕食杂食类线虫代谢活性的促进作用更强。土壤线虫组成的变化通过线虫代谢足迹导致土壤食物网结构发生显著性变化。狭叶锦鸡儿灌丛土壤干扰程度低,营养富集状况好,食物网结构更成熟稳定;垫状锦鸡儿和荒漠锦鸡儿灌丛土壤环境干扰程度高,营养富集较好,食物网有退化倾向。

关键词：锦鸡儿属代谢足迹线虫cp类群线虫营养类群功能团

中华绒螯蟹代谢蛋白互作网络构建及分子功能、亚细胞定位和途径分析

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水产学报 2023年第3期47卷 66-76页

作者：杨佳睿郝彤李倩一孙金生天津师范大学生命科学学院天津市动植物抗性重点实验室

为了构建中华绒螯蟹代谢过程研究的系统工具，实验在已经构建的中华绒螯蟹蛋白互作网络的基础上，首先采用邻接节点注释法对未知蛋白的分子功能进行预测。随后采用GO回溯法，构建了代谢蛋白网络并对网络中蛋白分子功能、亚细胞定位和途... 详细信息

为了构建中华绒螯蟹代谢过程研究的系统工具，实验在已经构建的中华绒螯蟹蛋白互作网络的基础上，首先采用邻接节点注释法对未知蛋白的分子功能进行预测。随后采用GO回溯法，构建了代谢蛋白网络并对网络中蛋白分子功能、亚细胞定位和途径分布进行了分析。分子功能注释中，确定了932个蛋白的分子功能，占所有未知分子功能蛋白的97%。最终构建的代谢蛋白互作网络包含2 045个蛋白及这些蛋白之间的15 927条互作关系。网络中94.2%(1 926/2 045)的蛋白具有亚细胞定位信息，大多分布于有膜细胞器中；96.1%的蛋白(1 966/2 045)具有分子功能信息，大多具有催化活性和结合活性。进一步对确定了分子功能和亚细胞定位的蛋白在40个KEGG子系统中的分布进行分析，发现参与翻译和氨基酸代谢过程的蛋白较多，也有一部分参与免疫和运输过程。本实验结果可为中华绒螯蟹代谢相关的蛋白功能、定位的研究提供重要的数据参考，对系统研究中华绒螯蟹代谢过程及代谢相关疾病具有重要价值。

关键词：中华绒螯蟹蛋白互作网络分子功能亚细胞定位代谢

枯草芽孢杆菌对氨氮胁迫下半滑舌鳎非特异性免疫酶活性、血液生化指标及相关基因表达量的影响

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水产学报 2022年第5期46卷 857-869页

作者：张晶晶左志晗张晓月李文悦孙金生天津师范大学生命科学学院天津市动植物抗性重点实验室

为探究益生菌对氨氮胁迫下半滑舌鳎的非特异性免疫酶活、血液生化指标及相关基因表达是否具有调节作用，实验首先选用枯草芽孢杆菌Y2益生菌对半滑舌鳎进行饲喂，然后对半滑舌鳎进行氨氮胁迫，胁迫过程中持续饲喂Y2并对相关指标进行监测... 详细信息

为探究益生菌对氨氮胁迫下半滑舌鳎的非特异性免疫酶活、血液生化指标及相关基因表达是否具有调节作用，实验首先选用枯草芽孢杆菌Y2益生菌对半滑舌鳎进行饲喂，然后对半滑舌鳎进行氨氮胁迫，胁迫过程中持续饲喂Y2并对相关指标进行监测。其中宏观生长指标结果显示，氨氮胁迫组半滑舌鳎体质量、体长低于非氨氮胁迫组，在氨氮胁迫及非氨氮胁迫条件下Y2组舌鳎体质量、体长高于空白对照组。免疫酶活测定结果显示，氨氮胁迫后半滑舌鳎血清过氧化氢酶(CAT)、酸性磷酸酶(ACP)、过氧化物酶(POD)、碱性磷酸酶(AKP)活性均有所升高；在氨氮胁迫及非氨氮胁迫条件下饲喂Y2菌株的2组ACP、CAT和POD活性均高于其相应对空白照组。血液相关生化指标结果显示，非氨氮胁迫Y2组半滑舌鳎血清中白蛋白(ALB)和球蛋白(GLB)含量略高于空白对照组，白蛋白与球蛋白比值(A/G)较高，甘油三酯(TG)、胆固醇(CHO)含量差异较小；氨氮胁迫对照组舌鳎血清中ALB、CHO含量下降，GLB含量略有升高，血清中总蛋白(TP)及总脂肪呈下降趋势，且A/G降低，而氨氮胁迫Y2组比空白组舌鳎血清中ALB、TG及CHO含量升高，导致A/G升高。同时氨氮胁迫使血清中丙二醛(MDA)、谷草转氨酶(AST)及谷丙转氨酶(ALT)的含量显著升高，Y2在氨氮胁迫及非氨氮胁迫条件下均可以降低MDA、AST及ALT的含量。相关基因表达结果显示，氨氮胁迫使半滑舌鳎肠、肝脏、肌肉及鳃组织热休克蛋白基因(HSP70)及血红蛋白α1基因(Hb-α1)表达量升高，且HSP70的表达量Y2组高于空白组，其中在肝脏组织中上调最明显，相反，氨氮胁迫下Y2组的Hb-α1表达量下降，在肝脏及肌肉组织中下降最明显。此外氨氮胁迫使半滑舌鳎相应组织中生长因子基因(IGF)的表达量均降低，但在氨氮及非氨氮胁迫条件下Y2组的IGF表达量均高于其空白对照组。综上，Y2可以改善氨氮胁迫对半滑舌鳎的免疫能力、血液生化指标、氧气运输、应激能力及生长等造成的多方面影响，降低氨氮胁迫对半滑舌鳎造成的负面作用，在水产养殖行业中具有良好的应用前景。

关键词：半滑舌鳎枯草芽孢杆菌氨氮胁迫免疫酶活血清生化指标基因表达

半滑舌鳎源哈维氏弧菌分泌蛋白HutZ的功能鉴定及免疫原性

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水产学报 2022年第1期46卷 116-125页

作者：尚玉曼王恒刘静茹袁增智孙金生天津师范大学生命科学学院天津师范大学天津市动植物抗性重点实验室

哈维氏弧菌为我国海水鱼类养殖过程中的常见病原,为了进一步探究哈维氏弧菌的致病机制,本实验分别从前期筛选到的哈维氏弧菌强毒株H2LB1和弱毒株H1SAI3中提取胞外产物(ECPs),并通过蛋白质组学进行差异蛋白鉴定。从中选取了哈维氏弧菌强... 详细信息

哈维氏弧菌为我国海水鱼类养殖过程中的常见病原,为了进一步探究哈维氏弧菌的致病机制,本实验分别从前期筛选到的哈维氏弧菌强毒株H2LB1和弱毒株H1SAI3中提取胞外产物(ECPs),并通过蛋白质组学进行差异蛋白鉴定。从中选取了哈维氏弧菌强毒株特异性蛋白HutZ为研究对象,对其功能和免疫原性开展深入研究。首先利用qRT-PCR检测了哈维氏弧菌在不同铁源培养基培养条件下的HutZ基因表达量差异,进一步将克隆HutZ基因连接到原核表达载体上,并在大肠杆菌中成功表达出重组HutZ蛋白。将纯化的HutZ蛋白与血红素共孵育,检测发现该蛋白能够结合血红素并改变其光吸收峰。将HutZ蛋白乳化后免疫半滑舌鳎2次,以间接血凝法检测免疫后1—7周的血清效价,同时在免疫4周后进行攻毒检测其免疫保护率。研究表明,HutZ蛋白免疫后的半滑舌鳎抗体效价最高可达1∶128,攻毒免疫保护率达73.3%,说明HutZ蛋白可作为开发预防半滑舌鳎感染哈维氏弧菌的亚单位疫苗的有效候选抗原。

关键词：半滑舌鳎哈维氏弧菌 HutZ蛋白免疫