检索结果-南通市图书馆

sigma因子在结核分枝杆菌异烟肼或利福平不同耐药表型中的表达差异的研究

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疾病监测 2024年

作者：江丽娜高丽王志锐戴文汐王秀月王春花天津市病原微生物重点实验室天津市结核病控制中心

目的分析比较在结核分枝杆菌异烟肼耐药表型和利福平耐药表型中同一种sigma因子mRNA表达量的差异。方法回顾性收集天津市结核病控制中心门诊部2020—2022年耐药监测期间分离的利福平或异烟肼单耐药、耐多药和敏感菌株，提取对数期生长菌... 详细信息

目的分析比较在结核分枝杆菌异烟肼耐药表型和利福平耐药表型中同一种sigma因子mRNA表达量的差异。方法回顾性收集天津市结核病控制中心门诊部2020—2022年耐药监测期间分离的利福平或异烟肼单耐药、耐多药和敏感菌株，提取对数期生长菌株RNA，应用荧光定量聚合酶链式反应(RT-PCR)检测结核分枝杆菌sigma因子(sigA～sigL)在各个耐药组和敏感组中的mRNA表达水平，采用Mann-Whitney U检验分析各耐药组与敏感组之间的基因表达差异，采用χ2检验分析各耐药组与敏感组之间的基因高水平表达率差异。结果除sigB外，sigA，sigL在异烟肼单耐药组中的表达量均显著高于敏感组(均P＜0.05)；除sigD、sigI外，sigA，sigL在利福平单耐药组中的表达量均显著高于敏感组，(均P＜0.05)；sigA、sigD、sigF、sigG、sigH、sigJ、sigK在耐多药组(异烟肼含药培养基)与敏感组中的相对表达量比较差异均有统计学意义(均P＜0.05)；除sigD、sigI外，sigA，sigL在耐多药组(利福平含药培养基)与敏感组中相对表达量比较差异均有统计学意义(均P＜0.05)；sigG、sigI、sigJ、在异烟肼单耐药组中高水平表达率(高水平表达数/菌株数)均显著高于敏感组敏感，差异有统计学意义(χ2=32.676、26.424、21.171，均P＜0.05)；sigJ在利福平单耐药组中高表达率显著高于敏感感组，差异有统计学意义(χ2=21.171，P＜0.05)；sigG、sigI、sigJ在耐多药组(异烟肼含药培养基)中高表达率显著高于敏感感组，差异有统计学意义(χ2=32.676、26.424、21.171，均P＜0.05)；sigJ在耐多药组(利福平含药培养基)组中高水平表达率显著高于敏感感组，差异有统计学意义(χ2=21.171，P＜0.05)。结论通过对表达量和高表达率结果的综合比较和分析，sigma因子中的sigF、sigG、sigJ、在异烟肼单耐药、利福平单耐药、耐多药组中的表达量和表达率高于敏感感组，可能与异烟肼和利福平耐药相关。

关键词： sigma因子耐多药结核分枝杆菌基因表达

Xpert MTB/RIF检测利福平耐药的准确性与结核病患者痰细菌载量的相关性:一项天津市的回顾性研究

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疾病监测 2023年第8期38卷 944-950页

作者：江丽娜王志锐高丽孙蕊王秀月王春花天津市病原微生物重点实验室天津市结核病控制中心天津300011

目的分析Xpert MTB/RIF不同细菌载量(1+、2+、3+、4+)检测结核分枝杆菌利福平(RIF)耐药的准确性,为有效临床药敏结果判断提供参考。方法回顾性收集2020年1月至2021年12月天津市结核病控制中心参比室接收的1936份结核病疑似患者痰标本的... 详细信息

目的分析Xpert MTB/RIF不同细菌载量(1+、2+、3+、4+)检测结核分枝杆菌利福平(RIF)耐药的准确性,为有效临床药敏结果判断提供参考。方法回顾性收集2020年1月至2021年12月天津市结核病控制中心参比室接收的1936份结核病疑似患者痰标本的液体BACTEC MGIT960培养阳性检测结果,排除16份非结核分枝杆菌后,1158份XpertMTB/RIF阳性标本的结果纳入分析,对Xpert MTB/RIF检测阳性且液体BACTEC MGIT960培养阳性的1142例结核分枝杆菌(MTB)菌株进行常规培养法体外药物表型药敏试验(DST)。应用SPSS 19.0软件进行统计学分析,结果采用配对χ^(2)检验,P结核的阳性筛查率为59.81%,XpertMTB/RIF检测结核的细菌载量1+~4+中,RIF耐药的检出率分别为8.88%、14.91%、11.37%、15.15%。以表型DST作为检测利福平耐药的参照标准,当细菌载量从1+到4+,表型DST与Xpert MTB/RIF检测利福平的符合率分别为95.39%(290/304)、95.96%(380/396)、96.79%(332/343)、96.97%(96/99),差异无统计学意义(趋势χ^(2)=1.069,P=0.785),一致性较高;Xpert MTB/RIF检测利福平的灵敏度呈上升趋势,分别为80.95%(17/21)、97.96%(40/41)、93.75%(30/32)、100.00%(12/12),差异无统计学意义(趋势χ^(2)=7.280,P=0.063);特异度分别为96.47%(273/283)、95.77%(340/355)、97.11%(302/311)、96.55%(84/87),差异无统计学意义(χ^(2)=0.860,P=0.835);阳性预测值分别为62.96%(17/27),72.73%(40/55),76.92%(30/39),80.00%(12/15),差异无统计学意义(χ^(2)=2.047,P=0.563);阴性预测值分别为98.56%(273/304)、99.71%(340/341),99.34%(302/304)、100.00%(84/84),且差异有统计学意义(χ^(2)=64.661,P<0.001)。Xpert MTB/RIF细菌载量从1+到4+的kappa值分别为0.68、0.81、0.83、0.87。表型DST与Xpert MTB/RIF检测RIF结果不一致的菌株中,细菌载量为1+,RIF的检测结果与熔解曲线相比,一致率为7.14%(1/14),细菌载量为2+~4+,RIF的检测结果与熔解曲线相比,一致率全部为100.00%。结论Xpert MTB/RIF技术在不同细菌载量下检测利福平耐药的灵敏度和特异度较高,整体阳性预测值偏低,在痰标本中细菌载量为1+及以下时,与DST检测利福平结果的一致性一般,而在2+到4+时,与DST检测结果一致性较好。

关键词：结核分枝杆菌体外药敏试验利福平细菌载量

γ-干扰素释放试验在结核病筛查中的辅助诊断价值

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中国热带医学 2024年第2期24卷 171-175页

作者：江丽娜陈盛玉孟苏凯孙蕊吴振萍王秀月张玉华王春花天津市结核病控制中心天津市传染病病原微生物重点实验室天津300011

目的分析比较γ-干扰素释放试验(interferon-gamma releaseassay,IGRA)对结核病诊断的辅助价值和意义。方法采用回顾性分析的方法收集2020年1月—2021年12月在天津市结核病控制中心门诊部进行IGRA检测的462例疑似结核病患者的检测结果,... 详细信息

目的分析比较γ-干扰素释放试验(interferon-gamma releaseassay,IGRA)对结核病诊断的辅助价值和意义。方法采用回顾性分析的方法收集2020年1月—2021年12月在天津市结核病控制中心门诊部进行IGRA检测的462例疑似结核病患者的检测结果,根据诊断结果分为结核病组229例(肺结核组203例和肺外结核组26例),非结核病组233例。分析IGRA对结核病的辅助诊断价值,并将其与结核分枝杆菌培养、结核分枝杆菌/利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术(geneXpert Mycobacterium tuberculosis/rifampin,Xpert MTB/RIF)2种方法进行比较。结果IGRA、结核分枝杆菌培养和Xpert MTB/RIF在结核病患者中的阳性率分别为76.42%、29.26%、40.62%,与非结核病组比较(38.20%、0.00%、0.00%),差异有统计学意义(P结核病的灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值分别为76.42%、61.80%、69.29%、72.73%,结核分枝杆菌培养检测结核病的灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值分别为29.26%、98.28%、94.37%、63.43%,Xpert MTB/RIF检测结核病的灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值分别为40.60%、100%、100%、63.14%。IGRA在肺结核和肺外结核患者中阳性率分别为76.85%、73.08%,差异无统计学意义(P>0.05)。在菌阳患者组、非结核患者组中IGRA检测结核的阳性率分别为79.34%、38.20%,差异有统计学意义(χ^(2)=54.526,P结核患者组中IGRA检测结核的阳性率分别为73.15%、38.20%,差异有统计学意义(χ^(2)=36.456,P结核病患者的诊断中具有较高的灵敏度,在肺外结核和菌阴结核的筛查也有一定的优势,为临床上诊断结核病提供重要的参考依据。

关键词： γ-干扰素释放试验结核分枝杆菌培养实时荧光定量核酸扩增检测结核病

基于全基因组测序的72株耐多药结核分枝杆菌耐药基因突变特征分析

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中国热带医学 2023年第7期23卷 725-729,741页

作者：穆成孙蕊王志锐赵慧王春花天津市结核病控制中心天津市传染病病原微生物重点实验室天津300011

目的利用全基因组测序(whole genome sequencing, WGS)了解天津地区72株耐多药结核分枝杆菌(multidrug-resistant tuberculosis, MDR-TB)的耐药基因突变特征,评估WGS预测MDR-TB耐药性的效果。方法收集2020年1-9月天津市结核病控制中... 详细信息

目的利用全基因组测序(whole genome sequencing, WGS)了解天津地区72株耐多药结核分枝杆菌(multidrug-resistant tuberculosis, MDR-TB)的耐药基因突变特征,评估WGS预测MDR-TB耐药性的效果。方法收集2020年1-9月天津市结核病控制中心门诊部就诊患者的临床菌株,使用硝基苯甲酸(PNB)培养基进行菌种鉴定和固体比例法药敏试验。排除重复菌株后,筛选出72株MDR-TB进行WGS。使用在线数据库进行数据分析,对表型药敏结果与WGS预测的耐药谱进行比较。结果 72株MDR-TB基因型均为L2分支,准广泛耐药(pre-extensive drug-resistant tuberculosis, pre-XDR-TB)在现代株和古代株中的差异无统计学意义(χ^(2)=0.287,P=0.592)。共发现与12种药物耐药相关基因的突变类型81种,对不同药物耐药的菌株中常见突变类型分别为链霉素:rpsL Lys43Arg;异烟肼:katG Ser315Thr;利福平:rpoB Ser450Leu;乙胺丁醇:embB Met306Val;氧氟沙星、左氧氟沙星、莫西沙星:gyrA Asp94Gly;卡那霉素、卷曲霉素、阿米卡星:rrs 1401a>g;对氨基水杨酸:folC Ile43Thr。丙硫异烟胺耐药株9种突变类型,每种1株。WGS预测不同药物耐药的灵敏度和特异度分别为链霉素:98.15%,88.89%;异烟肼:90.28%,-;利福平:98.62%,-;乙胺丁醇:79.49%,75.76%;氧氟沙星:97.30%,85.71%;卡那霉素:85.71%,98.46%;对氨基水杨酸:27.27%,95.08%;丙硫异烟胺:81.82%,60.66%;卷曲霉素:60.00%,98.51%;左氧氟沙星:97.22%,83.33%;莫西沙星:97.30%,85.71%;阿米卡星:100.00%,100.00%。结论 WGS方法快速,与表型药敏一致性较高,具有良好的应用前景。

关键词：结核全基因组关联研究高通量核苷酸测序突变

基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法对MGIT960阳性管中微生物的菌种鉴定

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中国热带医学 2023年第11期23卷 1157-1163页

作者：巨韩芳穆成赵慧江丽娜王春花天津市结核病控制中心参比实验室天津市传染病病原微生物重点实验室天津300011

目的应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)法对BACTECTMMGIT960(简称“MGIT960”)仪器报告阳性的培养管中的微生物进行菌种鉴定,并分析不同菌株的分布情况。方法收集2021-2022年天津市结核病控制中心参比实验室MGIT960仪器报告的阳性管2 662管,将液体培养物分别转种至血平板和中性罗氏培养基,对获得的分离株应用MALDI-TOF MS法进行鉴定,根据质谱结果将同一患者在同一种培养基上不重复的结果全部纳入菌种分布情况的构成比分析。对于质谱未检出的菌株,选取38株进行16S rRNA基因测序。结果血平板共获得分离株605株,将501株纳入分析,其中分枝杆菌属占17.76%(89/501),以脓肿拟分枝杆菌10.18%(51/501)和偶发分枝菌酸杆形菌3.19%(16/501)为主,分枝杆菌以外的细菌占68.06%(341/501),以皮疽诺卡菌15.57%(78/501)、痰液戈登氏菌9.38%(47/501)和支气管戈登氏菌7.58%(38/501)为主,71株未检出,占14.17%(71/501);中性罗氏培养基获得分离株2 378株,纳入1 748株进行分析,其中分枝杆菌属占78.72%(1 376/1 748),以结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis, MTB)60.53%(1 058/1 748)、奇美拉胞内分枝杆菌组4.69%(82/1 748)、慢生黄分枝杆菌3.55%(62/1 748)为主,分枝杆菌以外的细菌占17.11%(299/1 748),以皮疽诺卡菌4.35%(76/1 748)、痰液戈登氏菌2.69%(47/1 748)和支气管戈登氏菌2.12%(37/1 748)为主,73株未检出,占4.18%(73/1 748)。38株质谱未检出的细菌经测序发现均为放线菌门和厚壁菌门的菌株。结论 MGIT960仪器报告阳性的培养管中非结核分枝杆菌(nontuberculous Mycobacterium, NTM)和分枝杆菌以外的细菌种类繁多,且绝大多数均可通过质谱快速鉴别。分枝杆菌以外的细菌以诺卡菌属和戈登氏菌属为主,应在鉴别诊断中关注此类细菌感染。

关键词：基质辅助激光解吸电离结核培养技术分枝杆菌属

天津市北京基因型结核分枝杆菌流行特征及与耐药表型关系研究

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中华流行病学杂志 2011年第2期32卷 116-119页

作者：巨韩芳王撷秀李桂莲谢彤赵德福李尚伦李敬新赵慧穆成天津市结核病控制中心 300041 天津市疾病预防控制中心

目的了解北京基因型结核分枝杆菌在天津市人群中的分布、流行特征及其与耐药表型的关系.方法收集2008年1月至2009年6月天津市结核病控制中心和10个区（县）结核病防治机构肺结核患者中初次分离培养的结核分枝杆菌656株及患者管理信息... 详细信息

目的了解北京基因型结核分枝杆菌在天津市人群中的分布、流行特征及其与耐药表型的关系.方法收集2008年1月至2009年6月天津市结核病控制中心和10个区（县）结核病防治机构肺结核患者中初次分离培养的结核分枝杆菌656株及患者管理信息、临床信息和实验室信息.菌株对利福平、异烟肼、链霉素和乙胺丁醇的药物敏感性试验采用比例法.应用多重PCR法鉴定北京和非北京基因型菌株,并分析北京基因型菌株与耐药表型的关系.结果本研究中菌株的总耐药率为26.98%,耐多药率为6.25%.北京基因型菌株600株（91.46%）,非北京基因型56株（8.53%）,其分布与天津市户籍（x2=4.26,P=0.039）有关,未见与耐药表型间有明显相关性.结论北京基因型菌株是天津市的主要流行株,感染北京基因型结核分枝杆菌的天津市户籍患者的比例明显高于本地区流动人口患者,但尚未发现北京和非北京基因型菌株之间在耐药方面有明显的差异.

关键词：结核分枝杆菌北京基因型耐药

Sigma因子基因表达与结核分枝杆菌异烟肼耐药关系探讨

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中国热带医学 2024年第3期24卷 299-303页

作者：江丽娜高丽王志锐王秀月王春花天津市病原微生物重点实验室天津市结核病控制中心天津300011

目的研究调控基因Sigma因子(sigA-sigM)在katG突变导致的异烟肼耐药结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)中的表达调控是否与异烟肼耐药相关,为研究异烟肼耐药的分子机制提供参考依据。方法选择2020—2022年天津市结核病控制... 详细信息

目的研究调控基因Sigma因子(sigA-sigM)在katG突变导致的异烟肼耐药结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)中的表达调控是否与异烟肼耐药相关,为研究异烟肼耐药的分子机制提供参考依据。方法选择2020—2022年天津市结核病控制中心耐药检测期间收集的初治患者菌株共95株,其中katG基因未突变的全敏菌株30例,katG突变导致的异烟肼耐药菌株共65例,包括11例单耐异烟肼菌株,24株异烟肼多耐药菌株(同时耐异烟肼和链霉素),30例异烟肼耐多药菌株(同时耐异烟肼、链霉素和利福平)。在异烟肼含药培养基上收集菌株后,提取菌株RNA,应用反转录聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)方法检测Sigma因子的相对表达量,采用Mann-Whitney U检验分析各个Sigma因子在不同异烟肼耐药表型菌株中的表达差异。结果sigA、sigC、sigF、sigG、sigH、sigI、sigJ、sigK、sigL的基因表达量在单耐异烟肼组中的表达量高于全敏组,差异有统计学意义(Z=4.368、5.701、6.865、4.021、5.126、2.670、5.983、4.701、5.490,P均<0.001)。多耐药组中sigA、sigC、sigE、sigF、sigG、sigH、si⁃gI、sigJ、sigK、sigL的基因表达量显著高于全敏组,差异有统计学意义(Z=-5.017、-4.670、-4.667、-5.456、-4.083、-5.393、-4.712、-6.971、-8.206、-5.211,P均<0.001)。耐多药组中sigC、sigD、sigE、sigF、sigG、sigH、sigI、sigJ、sigK、sigL的基因表达量显著高于全敏组,差异有统计学意义(Z=-5.537、-4.003、-5.216、-7.328、-7.730、-5.658、-4.440、-6.036、-4.862、-4.312,P均<0.001)。sigB、sigF、sigG在异烟肼单耐药、异烟肼耐多药和异烟肼多耐药3组之间的基因表达量差异显著,有统计学意义(Z=10.139、7.735、14.532,P均<0.001)。sigF、sigG、sigI、sigJ、sigL在异烟肼耐药组中的高表达率显著高于敏感组,差异有统计学意义(χ^(2)=17.410、45.673、57.661、42.896、26.363,P均<0.001)。结论sigF、sigG、sigI、sigJ、sigL与katG突变导致的异烟肼耐药相关。

关键词： Sigma因子耐药结核表达

药物外排泵基因表达与结核分枝杆菌耐药关系的探讨

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中华检验医学杂志 2011年第7期34卷 605-611页

作者：李桂莲王撷秀谢彤巨韩芳赵慧穆成赵德福天津市结核病控制中心参比实验室 300041

目的探讨MTB药物外排泵基因的表达与耐药表型、耐药相关基因突变型的关系.方法从2007年天津市结核病控制中心参比室库存菌株中选择对异烟肼、利福平、链霉素和乙胺丁醇联合或单一耐药的全部耐药MTB菌株45株及对以上4种药物全敏感的MT... 详细信息

目的探讨MTB药物外排泵基因的表达与耐药表型、耐药相关基因突变型的关系.方法从2007年天津市结核病控制中心参比室库存菌株中选择对异烟肼、利福平、链霉素和乙胺丁醇联合或单一耐药的全部耐药MTB菌株45株及对以上4种药物全敏感的MTB菌株26株（全敏组）.采用直接测序法检测异烟肼耐药相关基因katG、inhA、oxyR-ahpC、ndh,利福平耐药相关基因rpoB,链霉素耐药相关基因rpsL、rrs和乙胺丁醇耐药相关基因embB、embC、embA的突变情况.提取菌株RNA后逆转录并采用real-time PCR方法检测药物外排泵基因Rv1410c、Rv2136c、Rv0783c和Rv1819c的表达量,并用方差分析和t检验的方法分析药物外排泵基因表达量在不同菌株耐药表型、耐药相关基因突变型菌株中的差异.结果 Rv1410c表达量在耐链霉素组[（8.48±6.33）×10-5],耐异烟肼组[（8.43±6.38）×10-5],耐利福平组[（9.59±7.27）×10-5],耐多药组[（10.37±7.86）×10-5],耐异烟肼＋链霉素组[（9.39±6.81）×10-5],均高于全敏组表达量[（5.67±3.29）×10-5],差异有统计学意义（t′值分别为2.18、2.20、2.29、2.34、2.43,P均〈0.05）.Rv2136c表达量在耐异烟肼组[（3.51±2.43）×10-5],耐多药组[（4.21±2.94）×10-5],耐异烟肼＋链霉素组[（3.81±2.46）×10-5]均高于全敏组表达量[（2.50±1.44）×10-5],差异有统计学意义（t′值分别为2.03、2.22、2.28,P均〈0.05）.rpoB 531突变型菌株Rv0783c的表达量[（5.41±3.03）×10-6]高于野生型耐利福平菌株[（2.29±1.62）×10-6],差异有统计学意义（t′=2.81,P〈0.05）.结论 Rv1410c和Rv2136c表达量高低与MTB对多种药物耐药有关,Rv0783c的高表达与利福平耐药株rpoB 531位密码子突变可能相关.

关键词：分枝杆菌结核抗药性多种细菌细菌蛋白质类膜转运蛋白质类 ATP结合匣式转运子突变

天津市监狱羁押人群结核病患者分离菌株的分子流行病学研究

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中国慢性病预防与控制 2021年第9期29卷 688-691页

作者：赵慧谢彤王春花巨韩芳孙蕊李旭天津市结核病控制中心天津300041 天津市疾病预防控制中心天津市红桥区看守所

目的研究天津地区监狱流行的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)菌株的主要基因型,菌株间的进化关系以及结核病在监狱羁押人员中传播的主要模式。方法选取天津市结核病控制中心参比实验室菌株库中保存的2013年1月至2016年6... 详细信息

目的研究天津地区监狱流行的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)菌株的主要基因型,菌株间的进化关系以及结核病在监狱羁押人员中传播的主要模式。方法选取天津市结核病控制中心参比实验室菌株库中保存的2013年1月至2016年6月来自天津市监狱管理局羁押人员不同结核病患者痰标本中分离培养的124株MTB菌株,采用多重PCR试验检测菌株基因组中RD105差异区域的缺失情况以鉴定北京基因型MTB;使用15个VNTR位点对菌株开展基因分型研究,根据菌株的成簇情况评估天津地区监狱羁押人员结核病近期传播的水平。结果天津监狱结核病患者分离培养的124株MTB菌株中,北京基因型MTB为116株,占全部分析菌株的93.5%。全部124株MTB菌株的VNTR基因分型显示93株(75.0%)为基因分型同簇株,共形成了18个基因分型簇,其中最大的分型簇由25株北京基因型MTB组成,其余的31株MTB为基因分型独特型。基因分型数据经最小生成树算法分析显示,124株MTB被分为3个基因型。其中116株北京基因型MTB组成了其中的1个基因型;8株非北京基因型菌株中,3株MTB和5株MTB分别组成另外2个基因型。结论天津监狱羁押人员中,北京基因型MTB传播的最为广泛,是绝对优势菌株。基因分型表明近期传播(外源性感染)是MTB在监狱羁押人群中传播的主要模式。

关键词：结核分枝杆菌基因分型分子流行病学可变数目串联重复序列差异区域监狱