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应用形态学与PCR技术鉴定黄胸鼠和黄毛鼠体内锥虫

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中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2015年第4期33卷 277-280页

作者：张玲玲倪庆翔姚立农张孝和陈华良丰燕张轩余可根阮卫浙江省疾病预防控制中心杭州310051 温州市疾病预防控制中心温州325001

目的应用形态学和PCR方法对浙江省发现的两例疑似感染锥虫的鼠血样进行鉴定。方法采集两例疑似感染锥虫的鼠血样,制作血涂片进行显微镜检查,测量锥虫的相关形态学指标。提取两例鼠血样DNA,应用PCR法扩增锥虫属18S r RNA基因特异性片段... 详细信息

目的应用形态学和PCR方法对浙江省发现的两例疑似感染锥虫的鼠血样进行鉴定。方法采集两例疑似感染锥虫的鼠血样,制作血涂片进行显微镜检查,测量锥虫的相关形态学指标。提取两例鼠血样DNA,应用PCR法扩增锥虫属18S r RNA基因特异性片段。扩增产物测序后,应用NCBI中Blast分析程序对测序序列进行比对分析,并将测序序列提交至Gen Bank。结果两份疑似感染锥虫的鼠血样分别来源于野外黄毛鼠和室内黄胸鼠。制作血涂片进行显微镜检查,测量锥虫的相关形态学指标。镜下观察发现,血涂片中的锥虫均具备核、鞭毛和动基体等锥虫特征性结构。分离自黄毛鼠和黄胸鼠的锥虫总体长分别为27.50μm和23.80μm,游离鞭毛的长度分别为9.60μm和9.20μm,核指数分别为0.74和1.05,动基体指数分别为1.40和1.57,属于啮齿动物内寄生的匍锥虫亚属(Herpetosoma)锥虫。应用PCR法扩增锥虫属18S r RNA基因的特异性片段,片段大小约为700 bp,对扩增产物测序后将序列提交至Gen Bank,登录号分别为KP098535和KP098536。分离自黄毛鼠锥虫的18S r RNA基因序列(KP098535)与Trypanosoma rabinowitschae(AY491765.1)、***(AY491764.1)和***(AJ223568.1)等序列的18S r RNA基因序列的同源性均为100%,可以确定其为匍锥虫亚属,但尚不能确定具体种。分离自黄胸鼠锥虫的序列(KP098536)与Gen Bank中路易斯锥虫(***)的18S r RNA基因序列(AB242273.1和AJ009156.1)的同源性为100%,可判定其为路易斯锥虫。结论分离自黄胸鼠的锥虫为路易斯锥虫,分离自黄毛鼠的锥虫隶属于匍锥虫亚属,可判为类路易斯锥虫。

关键词：锥虫路易斯锥虫黄胸鼠黄毛鼠 PCR

一种最小抑菌浓度检测试剂盒检测结核分枝杆菌临床菌株药物敏感性的效果评价

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中国人兽共患病学报 2023年第9期39卷 827-836页

作者：曹滨王泉于晋杰邓乐乐钱程宇方丹昂万康林李马超刘梦文赵秀芹赵丽丽刘海灿肖开提·米吉提袁秀琴李桂莲中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206 南华大学公共卫生学院衡阳421001 新疆医科大学第八附属医院乌鲁木齐830017 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 温州医科大学检验医学院与生命科学学院温州325035 新疆医科大学公共卫生学院乌鲁木齐830011

目的评价一种最小抑菌浓度检测试剂盒检测结核分枝杆菌(MTB)临床分离菌株对11种一、二线抗结核药物敏感性的效能。方法从2017年1月至2018年12月期间来自新疆不同地区4家结核病院的住院/门诊结核病患者的847株MTB临床分离菌株中,随机选取... 详细信息

目的评价一种最小抑菌浓度检测试剂盒检测结核分枝杆菌(MTB)临床分离菌株对11种一、二线抗结核药物敏感性的效能。方法从2017年1月至2018年12月期间来自新疆不同地区4家结核病院的住院/门诊结核病患者的847株MTB临床分离菌株中,随机选取188株,采用一种最小抑菌浓度检测试剂盒(MYCOTB)检测其对11种一、二线抗结核药物的耐药性,以常规微孔板微量肉汤稀释法为对照方法,结合全基因组测序技术,评估MYCOTB法检测药物耐药性的灵敏度、特异度及两种表型药敏方法的一致性。结果以常规微孔板微量肉汤稀释法为标准,MYCOTB检测RFP、ETH、RFB、SM、INH、PAS、OFX、AMK、MFX、EMB和KM等11种药物耐药性的灵敏度分别为92.0%、88.6%、86.7%、84.6%、84.3%、75.0%、67.7%、57.4%、56.7%、56.5%和40.0%,特异度分别为97.1%、96.7%、96.2%、97.3%、90.0%、95.6%、96.1%、99.5%、91.1%、96.4%和100.0%,符合率分别为95.7%、95.2%、94.7%、94.7%、87.2%、94.7%、91.0%、97.9%、85.6%、91.5%和96.8%,Kappa值分别为0.89、0.84、0.81、0.84、0.75、0.52、0.68、0.66、0.47、0.57和0.87。对于两种表型药敏方法结果不一致的菌株,基因测序结果更支持MYCOTB的检测结果。结论MYCOTB检测MTB对11种一、二线抗结核药物耐药性具有良好的灵敏度和特异度,可用于MTB菌株耐药性的检测。

关键词：结核分枝杆菌药物敏感性试验 MYCOTB 微孔板微量肉汤稀释法

宁波地区不同基因型利福平耐药结核分枝杆菌耐药特征

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中华医院感染学杂志 2023年第16期33卷 2458-2462页

作者：陈琴车洋柳正卫贺天锋杨天池桑国鑫宁波市第二医院防保科浙江宁波315010 宁波市疾病预防控制中心结核病防制所浙江宁波315010 浙江省疾病预防控制中心结核病防制所浙江杭州310000

目的应用全基因组测序技术分析宁波市利福平耐药结核分枝杆菌(RR-TB)耐药特征,为RR-TB感染患者的临床诊疗及疫情防控提供科学依据。方法选取宁波市耐药肺结核唯一定点诊疗机构(宁波市第二医院)耐药监测期间保存的2018-2019年59株RR-T... 详细信息

目的应用全基因组测序技术分析宁波市利福平耐药结核分枝杆菌(RR-TB)耐药特征,为RR-TB感染患者的临床诊疗及疫情防控提供科学依据。方法选取宁波市耐药肺结核唯一定点诊疗机构(宁波市第二医院)耐药监测期间保存的2018-2019年59株RR-TB临床分离株,提取总DNA后进行全基因组测序。应用Perl脚本处理原始数据,并通过结核分枝杆菌(MTB)耐药基因数据库确定耐药基因相关突变,同时结合表型药敏试验结果综合分析本地区RR-TB临床分离株对异烟肼(INH)、利福平(RIF)、乙胺丁醇(EMB)、链霉素(SM)、阿米卡星(AM)、卷曲霉素(CAP)、左氧氟沙星(LFX)、丙硫异烟胺(PTO)及对氨基水杨酸(PAS)9种抗结核药物的耐药特征。结果 59株RR-TB菌株INH、RIF的耐药率分别为83.05%、100.00%;基于全基因组测序的59株RR-TB菌株共检测到40种耐药相关基因突变类型,其中以katG基因Ser315Thr(62.71%),rpoB基因Ser450Leu(62.71%),rpsL基因Lys43Arg(50.85%)和embB基因Met306Val(30.51%)为主;59株RR-TB菌株分为2个基因型,分别为L2型(89.83%)和L4型(10.17%);其中,L2型菌株又分为2个亚型,分别为L2.1型菌株(1.89%)和L2.2型菌株(98.11%);L4型菌株又分为3个亚型,分别为L4.2型菌株(16.67%),L4.4型菌株(66.67%)和L4.5型菌株(16.67%);9种抗结核药物的耐药基因主要突变类型在L2型菌株中的占比远高于L4型。结论宁波地区RR-TB临床分离株对9种抗结核药物的耐药形势较为严峻,主要流行基因型为L2型,需进一步加强耐药结核病的防控工作。

关键词：耐药测序基因组结核分枝杆菌基因突变利福平耐药结核分枝杆菌

2009-2018年天津市河东区病毒性肝炎流行病学分析

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中国卫生统计 2020年第3期37卷 460-461,464页

作者：廖明卢达宫丽媛天津市河东区疾病预防控制中心 300151

目的掌握天津市河东区病毒性肝炎流行状况,为制定防制措施提供依据。方法采用描述流行病学方法对2009-2018年天津市河东区的病毒性肝炎疫情资料进行统计分析。结果河东区2009-2018年病毒性肝炎累计报告1230例,死亡3例,年平均发病率为12.... 详细信息

目的掌握天津市河东区病毒性肝炎流行状况,为制定防制措施提供依据。方法采用描述流行病学方法对2009-2018年天津市河东区的病毒性肝炎疫情资料进行统计分析。结果河东区2009-2018年病毒性肝炎累计报告1230例,死亡3例,年平均发病率为12.86/10万;乙型肝炎所占比例最高,占病毒性肝炎总数的61.79%,丙肝次之;病毒性肝炎发病年龄集中在30~50岁年龄组,男女发病率性别比为1.60∶1,职业以离退人员和家务待业为主。结论河东区病毒性肝炎防控工作应以加强预防接种为重点,提高医疗机构诊断报告水平,广泛开展健康教育宣传。

关键词：病毒性肝炎流行特征防制措施

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血液透析室消毒质量和卫生学监测

中国消毒学杂志 2013年第8期30卷 741-742页

作者：宁培勇丁津华费春楠沈芃刘军纪学悦刘贺天津市疾病预防控制中心天津300011

目的了解天津市医疗机构血液透析室环境卫生学情况和消毒质量,加强血液透析过程医院感染管理。方法通过现场采样和细菌检验技术,对天津市部分医疗机构血液透析室进行现场采样和检测评价。结果天津市医疗机构血液透析室物体表面和室内空... 详细信息

目的了解天津市医疗机构血液透析室环境卫生学情况和消毒质量,加强血液透析过程医院感染管理。方法通过现场采样和细菌检验技术,对天津市部分医疗机构血液透析室进行现场采样和检测评价。结果天津市医疗机构血液透析室物体表面和室内空气卫生质量合格率分别为90.24%和78.05%,医务人员手消毒合格率为82.93%,透析用水卫生质量全部合格。结论天津市医疗机构血液透析室环境卫生质量整体较好,室内空气和医务人员手卫生有待进一步加强管理。

关键词：血液透析环境卫生消毒效果医院感染

天津市2011-2015年不同来源新报告HIV/AIDS病例特征分析

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中国艾滋病性病 2017年第8期23卷 710-713页

作者：郭燕宁铁林柳忠泉周宁天津市疾病预防控制中心天津300011

目的分析2011-2015年天津市不同来源新报告的艾滋病病毒(HIV)感染者/艾滋病(AIDS)病人(简称HIV/AIDS病人)的情况,为尽早发现HIV/AIDS病例、及时提供随访和医疗服务,进而为有效防治艾滋病提供科学依据。方法对2011-2015年天津市新报告的H... 详细信息

目的分析2011-2015年天津市不同来源新报告的艾滋病病毒(HIV)感染者/艾滋病(AIDS)病人(简称HIV/AIDS病人)的情况,为尽早发现HIV/AIDS病例、及时提供随访和医疗服务,进而为有效防治艾滋病提供科学依据。方法对2011-2015年天津市新报告的HIV/AIDS病例的流行病学调查及随访资料进行统计学分析,结合病程信息对病例晚发现情况进行分析,同时通过BED捕获酶联免疫法(BED-CEIA)对血样进行检测,来判定其新近感染比例。结果累计报告的2 922例HIV/AIDS病人中,来源于自愿咨询检测(VCT)的占17.7%,专题调查的占35.0%,医疗机构检测的占26.1%,性病门诊就诊者检测的占8.2%,其他检测的占13.0%。专题调查病例晚发现的比例为20.5%,当年进行首次CD4^+T淋巴细胞计数检测的比例占93.8%,医疗机构发现的病例,经BED-CEIA检测判为新近感染的比例仅28.7%。来源于医疗机构、VCT与性病门诊的就诊者中,符合抗病毒治疗标准的病例,在发现当年即接受抗病毒治疗的比例分别为65.1%、65.6%与72.6%。结论天津市不同检测来源在发现病例的力度、发现病例的及时性、发现病例后及时接受CD4^+T淋巴细胞计数检测及抗病毒治疗方面存在差异。

关键词：检测来源新报告病例艾滋病病毒感染者/艾滋病病人天津

天津市南开区2015-2019年新报告HIV/AIDS患者首次CD4细胞检测情况分析

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中国艾滋病性病 2021年第9期27卷 991-994页

作者：郑雅静郭晓慧天津市南开区疾病预防控制中心天津300113

目的了解天津市南开区2015-2019年新报告的HIV/AIDS患者首次CD4细胞检测情况,为制订有效的艾滋病防治措施提供科学依据。方法以全国艾滋病综合防治信息系统数据为基础,采用描述性流行病学方法,分析2015-2019年新报告的HIV/AIDS患者首次... 详细信息

目的了解天津市南开区2015-2019年新报告的HIV/AIDS患者首次CD4细胞检测情况,为制订有效的艾滋病防治措施提供科学依据。方法以全国艾滋病综合防治信息系统数据为基础,采用描述性流行病学方法,分析2015-2019年新报告的HIV/AIDS患者首次CD4细胞检测情况。结果 2015-2019年,天津市南开区共报告HIV/AIDS患者711例,首次CD4细胞计数低于200个/μL的比例由2015年的35.6%下降至2019年的23.5%,差异有统计学意义(χ^(2)=4.325,P 检测及时率较低,分别为68.5%、67.0%、83.5%和50.2%。年龄较大、本市人口、非定点医院发现的病例晚发现比例较高,分别为59.1%、47.8%、57.7%。结论在现有工作的基础上,加强首次随访管理工作,强调CD4细胞检测的重要性;扩大HIV检测覆盖面,特别是针对老年人的宣传防治工作,加大医疗机构主动开展HIV检测的力度,让更多的人尽早了解自己的感染状况。

关键词：艾滋病新报告病例 CD4细胞检测

2021年1月-2021年5月中国大陆入境人群新型冠状病毒的基因型分析

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病毒学报 2022年第5期38卷 1035-1042页

作者：冯晔囡赵翔夏影陈志肖聂凯王佶牛培华韩俊王世文许文波陈操王大燕中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 卫生部医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 中国科学院生物安全大科学研究中心武汉430071

为了解输入中国大陆的新型冠状病毒(新冠病毒,SARS-CoV-2)基因组型别和分布特征,本研究收集了采样日期在2021年1月1日至2021年5月31日间239例境外输入中国大陆的SARS-CoV-2核酸检测阳性人员病毒基因组序列,采用Pangolin在线分型平台(htt... 详细信息

为了解输入中国大陆的新型冠状病毒(新冠病毒,SARS-CoV-2)基因组型别和分布特征,本研究收集了采样日期在2021年1月1日至2021年5月31日间239例境外输入中国大陆的SARS-CoV-2核酸检测阳性人员病毒基因组序列,采用Pangolin在线分型平台(https://***/)进行SARS-CoV-2基因组分析。结果显示,2021年1月1日至2021年5月31日间,中国大陆23个省份报告了SARS-CoV-2核酸检测阳性人员病毒序列,广东省报送的SARS-CoV-2基因组序列数最多(42.68%),其次为江苏省(12.13%)。有序列报告的病例来自5个大洲的59个国家(或地区),主要以亚洲(55.23%)和非洲(25.10%)为主,居前3位的国家为肯尼亚、菲律宾和阿联酋,均为14例。依据Pango命名法,239例感染者SARS-CoV-2基因组序列可划分为53个基因型,包括4种关切变异株(Variant of Concern,VOC):Alpha(B.1.1.7)、Beta(B.1.351)、Gamma(P.1和P.1.1)和Delta(B.1.617.2),占比分别为31.80%、14.23%、1.26%和9.62%,分别在14、8、2和6个省份监测发现。输入SARS-CoV-2的基因型以Alpha、Beta和Delta变异株为主。广东省监测发现的输入SARS-CoV-2基因型种类最多(36种),且包括4种VOC(Alpha、Beta、Gamma和Delta)和2种曾经定义的关注变异株(Epsilon和Eta)。本研究数据表明,2021年1月1日至2021年5月31日期间输入中国大陆的SARS-CoV-2基因型呈多样性,多个省份监测发现了国际流行变异株VOC,发现时间与占比与同期国际流行趋势相似,多数省份面临着较大的由输入病例引起本土疫情的风险。建议继续加强入境核酸检测阳性人员SARS-CoV-2基因组测序、感染者的隔离管控以及对重要流行变异株的研究,从而为我国新型冠状病毒肺炎疫情的防控和免疫策略的调整提供科学依据。

关键词：新型冠状病毒新型冠状病毒肺炎输入病例基因型

天津市未接受抗病毒治疗HIV/AIDS病例CD_4^+T淋巴细胞计数变化情况及影响因素

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中国艾滋病性病 2015年第9期21卷 753-756页

作者：于茂河郭燕宁铁林周宁天津市疾病预防控制中心天津300011

目的探讨天津市新发现并报告的艾滋病病毒(HIV)感染者/艾滋病(AIDS)病人(简称HIV/AIDS病人),在未开展抗病毒治疗的情况下,CD+4T淋巴细胞(简称CD4细胞)计数的变化情况及其影响因素。方法计算2005-2013年间天津市新报告的HIV/AIDS病人的首... 详细信息

目的探讨天津市新发现并报告的艾滋病病毒(HIV)感染者/艾滋病(AIDS)病人(简称HIV/AIDS病人),在未开展抗病毒治疗的情况下,CD+4T淋巴细胞(简称CD4细胞)计数的变化情况及其影响因素。方法计算2005-2013年间天津市新报告的HIV/AIDS病人的首次CD4细胞计数,与在2013年12月31日之前无抗病毒治疗史或抗病毒治疗前最后一次CD4细胞计数的差值及其月均变化情况,运用Logistic回归分析快速下降的影响因素。结果纳入符合条件的研究对象942例,CD4细胞计数月均变化中位数为-4.94。68.68%的研究对象末次CD4细胞计数低于首次,31.32%的研究对象末次CD4细胞计数高于首次或持平。多因素分析表明,传播途径[比值比(OR)=1.785,95%可信区间(CI):1.025~3.107]、年龄组(OR=1.164,95%CI:1.013~1.338)、首末次CD4细胞检测时间间隔(OR=0.585,95%CI:0.521~0.657)、首次CD4细胞计数(OR=2.388,95%CI:2.016~2.828),与CD4细胞计数快速下降有统计学意义。结论天津市未接受抗病毒治疗的HIV/AIDS病例中,CD4细胞计数快速下降与多种因素有关,有必要有针对性地加强随访、检测了解病情进展,以便及时开展抗病毒治疗。

关键词：艾滋病抗病毒治疗 CD+4T淋巴细胞计数影响因素