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组蛋白去乙酰化酶抑制剂在急性髓系白血病中的应用

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生物化学与生物物理进展 2024年第6期51卷 1393-1405页

作者：陈丹丹秦克宁吕纯莉曾建业王小敏遵义医科大学基础医学院遵义563000 国家感染性疾病临床医学研究中心深圳518106

急性髓系白血病(AML)是造血干/祖细胞恶性克隆性疾病,以骨髓、血液和其他组织中髓系起源的异常原始细胞增殖为特征。“3+7”诱导方案(蒽环类药物联合阿糖胞苷)一直是治疗AML的基石,但仍有部分AML患者无法耐受强化疗或完全缓解后复发,目... 详细信息

急性髓系白血病(AML)是造血干/祖细胞恶性克隆性疾病,以骨髓、血液和其他组织中髓系起源的异常原始细胞增殖为特征。“3+7”诱导方案(蒽环类药物联合阿糖胞苷)一直是治疗AML的基石,但仍有部分AML患者无法耐受强化疗或完全缓解后复发,目前AML的总体疗效仍不乐观。因此,寻找新药物以提高AML患者疗效具有重要的临床意义。越来越多的研究证明,表观遗传对AML的发生、发展起重要作用。组蛋白去乙酰化酶抑制剂(HDACi)是表观遗传修饰的分子靶向药物,可抑制组蛋白去乙酰化酶(HDAC)的活性,上调组蛋白赖氨酸的乙酰化水平,目前已应用于AML临床研究中,在联合治疗中显现出良好的耐受性与治疗效果。本综述介绍了HDAC和HDACi的分类依据以及在临床上的应用,阐述了伏立诺他、贝利司他、帕比司他、戊丙酸、恩替诺特、西达本胺等6种HDACi在AML中的临床前研究结果和临床应用研究进展,讨论了HDACi与其他抗癌药物联用在AML中的作用机制,并对HDACi今后的发展提出了建议,期望为临床治疗AML提供参考。

关键词：急性髓系白血病组蛋白去乙酰化酶抑制剂组蛋白去乙酰化酶表观遗传学

组蛋白变体H2A.Z的转录调控功能与动态作用机制

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遗传 2024年第4期46卷 279-289页

作者：孙朝冉吴旭东天津医科大学基础医学院天津市医学表观遗传学重点实验室天津300070

H2A.Z是组蛋白H2A常见的组蛋白变体。近年来,人们通过多学科手段探究了H2A.Z对于基因转录的激活或抑制作用。本文在概述组蛋白变体和H2A.Z发展史的基础上,重点阐述了H2A.Z不同亚型、不同翻译后修饰和基因组分布在转录调控过程中的作用,... 详细信息

H2A.Z是组蛋白H2A常见的组蛋白变体。近年来,人们通过多学科手段探究了H2A.Z对于基因转录的激活或抑制作用。本文在概述组蛋白变体和H2A.Z发展史的基础上,重点阐述了H2A.Z不同亚型、不同翻译后修饰和基因组分布在转录调控过程中的作用,明确了其生物学意义和在肿瘤发生发展、神经系统分化发育过程中的病理生理学意义,并总结了H2A.Z在染色质沉积或者移除的动态调控机制方面的研究进展,以期为深入了解组蛋白变体的多样性,并为寻找相关疾病诊疗的新靶点提供参考。

关键词：表观遗传调控核小体基因转录组蛋白变体 H2A.Z

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中华肿瘤杂志 2024年第2期46卷 108-117页

作者：马刚梁寒张汝鹏孙意国家恶性肿瘤临床医学研究中心、天津市肿瘤防治重点实验室、天津市恶性肿瘤临床医学研究中心、天津医科大学肿瘤医院胃部肿瘤科天津300060 北京大学医学部基础医学院北京100191

目的探讨Ras相关结合蛋白23(RAB23)在食管鳞状细胞癌(简称食管鳞癌)细胞侵袭和迁移中的作用和机制。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应检测16例配对食管鳞癌及癌旁正常组织中RAB23 mRNA的表达。比较基因表达综合(GEO)数据库的GSE20347... 详细信息

目的探讨Ras相关结合蛋白23(RAB23)在食管鳞状细胞癌(简称食管鳞癌)细胞侵袭和迁移中的作用和机制。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应检测16例配对食管鳞癌及癌旁正常组织中RAB23 mRNA的表达。比较基因表达综合(GEO)数据库的GSE20347数据集中食管鳞癌和配对癌旁正常组织RAB23 mRNA的表达水平。免疫组织化学检测106例配对食管鳞癌和癌旁正常组织、33例淋巴结阳性与10例淋巴结阴性患者原发灶与淋巴结组织中RAB23蛋白含量。在食管鳞癌KYSE30和KYSE150细胞中瞬时敲降RAB23表达(转染si-RAB23-1和si-RAB23-9)或者稳定敲降RAB23表达(转染sh-RAB23), 采用Western blot法验证RAB23敲降效率, 采用细胞计数试剂盒8法和裸鼠皮下成瘤实验检测食管鳞癌细胞的增殖能力, 采用Transwell实验和裸鼠尾静脉-肺转移实验检测食管鳞癌细胞的侵袭和迁移能力, 采用细胞黏附实验检测食管鳞癌细胞的黏附能力, 采用转录组测序技术分析RAB23敲降后对细胞转录谱的影响, 并通过Western blot检测验证相关信号通路。结果 16例食管鳞癌组织中RAB23 mRNA表达水平为0.009 7±0.008 9, 高于癌旁正常组织[0.003 2±0.003 7, P=0.006]。对GEO数据库GSE20347数据集中食管鳞癌和配对癌旁正常组织表达谱的生信分析显示, 食管鳞癌组织中RAB23 mRNA表达水平为4.30±0.25, 高于癌旁正常组织(4.10±0.17, P=0.037)。106例食管鳞癌组织中, 51例RAB23低表达, 55例RAB23高表达;而配对癌旁正常组织中, 82例RAB23低表达, 24例RAB23高表达, 食管鳞癌组织中RAB23表达水平高于配对癌旁正常组织(P<0.001)。33例淋巴结阳性食管鳞癌组织中, 1例RAB23低表达, 32例RAB23高表达;10例淋巴结阴性的食管鳞癌组织中, 3例RAB23低表达, 7例RAB23高表达。淋巴结阳性食管鳞癌组织中RAB23表达水平高于淋巴结阴性食管鳞癌组织(P=0.024)。33例阳性淋巴结组织中, 1例RAB23低表达, 32例RAB23高表达, 而10例阴性淋巴结组织中均为RAB23低表达。阳性淋巴结组织中RAB23表达水平高于阴性淋巴结组织(P<0.001)。瞬时或稳定敲降RAB23后, KYSE30细胞体外和体内的增殖能力无明显变化, KYSE30细胞的细胞侵袭和迁移能力下降, 而KYSE150细胞仅侵袭能力下降, 迁移能力无明显变化。sh-RAB23组KYSE30细胞黏附细胞的数量为(313.75±89.34)个, 少于sh-NC组[(1 030.75±134.29)个, P<0.001]。sh-RAB23组KYSE150细胞的黏附细胞数为(710.5±31.74)个, 也少于sh-NC组[(1 005.75±61.09)个, P<0.001]。转录组测序分析显示, 敲降RAB23后, si-RAB23-1组和si-RAB23-9组KYSE30细胞中黏着斑相关信号通路均被削弱, sh-RAB23组KYSE30和KYSE150细胞中p-FAK和p-paxillin表达水平降低。结论 RAB23在食管鳞癌组织中高表达, 与淋巴结转移有关。敲低RAB23表达后能够削弱黏着斑相关信号通路, 进而抑制食管鳞癌细胞的侵袭、迁移和黏附。

关键词：食管鳞状细胞癌 Ras相关结合蛋白23 黏着斑侵袭迁移

我国中老年人抑郁症状与心肺疾病关联的前瞻性队列研究

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中国慢性病预防与控制 2024年第2期32卷 81-85,89页

作者：蔺婧孙俐张馨予杨洪喜王耀刚天津医科大学公共卫生学院天津300070 天津医科大学护理学院天津医科大学基础医学院

目的探讨中国中老年人群抑郁症状与心肺疾病患病风险之间的关联,为心肺疾病的防治提供科学依据。方法数据来源于中国健康与养老追踪调查(CHARLS)。于2011年开展基线调查,采用10条目的流调中心抑郁量表(CESD-10)评估研究对象的抑郁症状,... 详细信息

目的探讨中国中老年人群抑郁症状与心肺疾病患病风险之间的关联,为心肺疾病的防治提供科学依据。方法数据来源于中国健康与养老追踪调查(CHARLS)。于2011年开展基线调查,采用10条目的流调中心抑郁量表(CESD-10)评估研究对象的抑郁症状,并收集人口社会学资料、体格检查、健康状况、生活方式等相关数据。心肺疾病结局数据来源于2018年随访数据,最终纳入研究对象8356名。使用R V.1.4统计软件,采用Cox比例风险模型分别分析中老年人抑郁症状对心血管疾病、慢性肺部疾病、仅患1种疾病以及心肺共病的影响。结果8356名研究对象中,基线时3608人(43.2%)有抑郁症状,2018年随访时心血管疾病患病846人(10.1%),慢性肺部疾病患病374人(4.5%),仅患1种疾病1046人(12.5%),心肺共病87人(1.0%)。调整混杂因素后,多因素Cox回归分析结果显示,与无抑郁症状的中老年人群相比,有抑郁症状与心血管疾病(HR=1.16,95%CI:1.01~1.33)、慢性肺部疾病(HR=1.41,95%CI:1.14~1.74)以及仅患1种疾病(HR=1.29,95%CI:1.14~1.47)高风险相关,均有统计学意义(P0.05)。分层分析结果显示,与无抑郁症状的中老年人群相比,45~64岁(HR=1.24)、女性(HR=1.25)、初中及以上文化程度(HR=1.29)人群抑郁症状与心血管疾病高风险相关;45~64岁(HR=1.44)、男性(HR=1.48)、小学(HR=1.42)和初中及以上(HR=1.52)文化程度、城市(HR=1.44)人群抑郁症状与慢性肺部疾病高风险相关;45~64岁(HR=1.37)、男性(HR=1.22)、女性(HR=1.35)、小学(HR=1.31)和初中及以上(HR=1.44)文化程度、城市(HR=1.28)、农村(HR=1.42)人群抑郁症状与仅患1种疾病高风险相关,均有统计学意义(P0.05)。结论抑郁症状是中老年人群心血管疾病、慢性肺部疾病的独立危险因素,而与心肺共病的关联无统计学意义。

关键词：心血管疾病慢性肺部疾病心肺共病抑郁症状中老年人群

NCOR2基因通过调控PI3K/AKT通路促进食管鳞状细胞癌KYSE450细胞迁移和侵袭

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中国肿瘤生物治疗杂志 2024年第4期31卷 342-350页

作者：姚佳丽石秀枝程圣旗张雨彤安哲昆王彦强山西医科大学基础医学院山西太原030001 山西医科大学转化医学研究中心山西太原030001

目的:探究核受体辅阻遏物2(NCOR2)基因对食管鳞状细胞癌(ESCC)发生发展的影响及其潜在的分子调控机制。方法:收集2017年5月至2018年7月间在山西省肿瘤医院确诊的155例ESCC患者的癌及癌旁组织标本及临床资料,利用患者的转录组和临床病理... 详细信息

目的:探究核受体辅阻遏物2(NCOR2)基因对食管鳞状细胞癌(ESCC)发生发展的影响及其潜在的分子调控机制。方法:收集2017年5月至2018年7月间在山西省肿瘤医院确诊的155例ESCC患者的癌及癌旁组织标本及临床资料,利用患者的转录组和临床病理数据进行生存预后分析及临床关联性分析。采用qPCR法检测6种ESCC细胞(TE-1、TE-5、TE-9、KYSE150、KYSE180和KYSE450)中NCOR2基因的表达水平,筛选NCOR2基因高表达的KYSE450细胞进行siRNA敲低实验,构建敲降NCOR2的细胞模型。利用CCK-8、克隆形成、细胞划痕和Transwell实验检测敲低NCOR2对KYSE450细胞增殖活性、克隆形成、迁移和侵袭能力的影响。对NCOR2敲低的KYSE450细胞进行转录组测序分析,筛选差异表达基因,进行GO和KEGG富集分析,解析NCOR2可能影响的信号调控网络。结果:NCOR2在ESCC组织中表达水平显著高于癌旁组织(P0.05)。在KYSE450细胞中敲低NCOR2基因后,转录组测序分析后发现54个基因发生了显著上调、127个基因发生了显著下调。KEGG分析发现,显著差异基因富集于PI3K/AKT分子信号通路(P<0.01),该通路中的4个基因PIK3R3、IL4R、COL1A1、EFNA1的表达水平在155例ESCC患者临床样本的转录组数据中与NCOR2呈显著正相关(均P<0.01),与转录组测序结果相吻合。结论:NCOR2可以通过影响PI3K/AKT信号通路并促进KYSE450细胞迁移与侵袭,进而影响ESCC的发生与发展。

关键词：核受体辅阻遏物2 食管鳞状细胞癌 KYSE450细胞迁移侵袭 PI3K/AKT信号通路

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多模态组学数据整合方法的性能评测

基因组学与应用生物学 2024年

作者：杨品任振华袁增强安徽医科大学基础医学院北京基础医学研究所脑科学中心

多模态组学数据的联合运用在揭示细胞异质性和解析细胞命运调控机制方面具有重要意义，目前已有多种方法开发用于处理不同组学模态数据的整合，本研究通过对应用于不同整合任务的多种数据整合方法进行性能评测，为相关领域的研究提供有... 详细信息

多模态组学数据的联合运用在揭示细胞异质性和解析细胞命运调控机制方面具有重要意义，目前已有多种方法开发用于处理不同组学模态数据的整合，本研究通过对应用于不同整合任务的多种数据整合方法进行性能评测，为相关领域的研究提供有益参考。使用6个联合测序数据集对16种单细胞多模态配对数据整合方法在两类整合任务上的性能进行测试，再通过4个模拟数据集和1个真实数据集对6种空间转录组反卷积方法的性能进行评估。在RNA和ATAC配对数据整合任务中，MOFA+、SCOIT、Cobolt分别在PBMC、BMMC、SNARE数据集上取得最优表现，SCOIT在三个数据集的汇总得分中均排名前三，MMDVAE、DAE在基于AE的融合算法中表现突出。在RNA和蛋白质配对数据整合任务中，Cobolt、MOFA+、Seurat分别在P5＿CITE、BM＿CITE、COVID中取得最优表现，totalVI在三个数据集的汇总得分中排名靠前，基于AE的融合算法中以efMMDVAE、lfMMDVAE的表现最好。在空间转录组反卷积方法评测中，Cell2location和SPACEL在模拟数据和真实数据中的性能表现均优于其他方法，其中Cell2location在真实数据集中表现最佳，正确地推断了两类心肌细胞在心室的比例。此外，本研究发现在配对数据整合任务中，不同方法对数据的适应性不同。SCOIT和totalVI分别是RNA与ATAC、RNA与蛋白质数据整合中表现稳定优异的方法。Seurat、MOFA+易受数据影响。

关键词：单细胞组学空间转录组学组学多模态联合测序数据整合

新疆达坂城盐湖土壤中可培养放线菌多样性及其活性筛选

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微生物学通报 2024年第7期 2353-2367页

作者：秦培钢冯华玺魏圆圆毕心怡迪丽孜巴·阿迪力马文静新疆医科大学基础医学院新疆医科大学药学院新疆医科大学中心实验室

【背景】近年来，新疆的一些盐湖和盐碱地如艾比湖、七角井盐湖和罗布泊等地不断有新的放线菌菌株被发现，而达坂城盐湖土壤分离放线菌的相关报道较少。【目的】研究新疆达坂城盐湖土壤中可培养放线菌的多样性并进行酶活性筛选，以期发... 详细信息

【背景】近年来，新疆的一些盐湖和盐碱地如艾比湖、七角井盐湖和罗布泊等地不断有新的放线菌菌株被发现，而达坂城盐湖土壤分离放线菌的相关报道较少。【目的】研究新疆达坂城盐湖土壤中可培养放线菌的多样性并进行酶活性筛选，以期发现新的药用微生物资源，为新抗生素的发现奠定基础。【方法】采用纯培养分离技术和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析研究达坂城盐湖土壤中可培养放线菌的多样性；采用PCR检测分析pksI、pksII、nrps和aph这4种抗生素合成相关基因的分布；利用琼脂块扩散法进行抗菌活性初筛；以9种酶活底物为指示物，结合琼脂块扩散法对可培养的放线菌进行功能酶活性筛选。【结果】从达坂城盐湖的14份土壤中共分离到65株放线菌，隶属于5个目5个科9个属，其中2株放线菌为潜在新种，优势菌属为链霉菌属(Streptomyces)和拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)；抗生素功能基因筛选出较为丰富的与抗生素合成相关的基因；筛选到一株对革兰氏阳性、革兰氏阴性及真菌都有拮抗效果的菌株D21E05；达坂城盐湖土壤中含丰富的产蛋白酶、脂酶、过氧化氢酶、纤维素酶和淀粉酶等生物活性酶的菌株。【结论】达坂城盐湖土壤中含有较为丰富的药用放线菌资源，具有从中发现放线菌新物种和新抗生素的潜力。

关键词：达坂城盐湖放线菌多样性抗微生物活性

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运动改善创伤性脑外伤的研究进展

生理科学进展 2024年第2期55卷 99-106页

作者：隆远水徐子博刘素娟天津医科大学基础医学院天津300070 天津医科大学第二临床医学院天津300211 天津医科大学基础医学院人体解剖与组织胚胎学系天津300070

创伤性脑外伤(traumatic brain injury,TBI)是由外力作用引起的脑功能改变或其他脑部病理学变化,是世界范围内的重大公共卫生问题。目前大量研究证明运动作为非药物治疗方式可有效改善TBI。损伤前后的运动均可通过相关机制有益于TBI患... 详细信息

创伤性脑外伤(traumatic brain injury,TBI)是由外力作用引起的脑功能改变或其他脑部病理学变化,是世界范围内的重大公共卫生问题。目前大量研究证明运动作为非药物治疗方式可有效改善TBI。损伤前后的运动均可通过相关机制有益于TBI患者的康复。本文综述了创伤前/后运动对TBI的影响及其潜在调控机制,以期为深入理解运动改善TBI的研究机制及运动疗法在TBI临床中的应用提供理论依据。

关键词：创伤性脑外伤运动氧化应激炎症反应脑源性神经营养因子

植物雌激素鹰嘴豆芽素A(BCA)对肝纤维化去势小鼠模型的改善作用及机制

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临床肝胆病杂志 2024年第1期40卷 76-82页

作者：谭超容李小飘冉俊艳熊英廖尚高张金娟何迅贵州医科大学药学院贵阳550025 贵州医科大学基础医学院贵阳550025 贵州医科大学慢性病诊疗转化工程研究中心贵阳550025

目的探究植物雌激素鹰嘴豆芽素A(BCA)对CCl4诱导的雌性双侧卵巢切除(去势)小鼠肝纤维化的影响及其机制。方法取50只去势雌性昆明小鼠,腹腔注射CCl4建立肝纤维化模型,将建模小鼠按体质量随机分成模型组、阳性对照组、BCA低、中、高剂量组... 详细信息

目的探究植物雌激素鹰嘴豆芽素A(BCA)对CCl4诱导的雌性双侧卵巢切除(去势)小鼠肝纤维化的影响及其机制。方法取50只去势雌性昆明小鼠,腹腔注射CCl4建立肝纤维化模型,将建模小鼠按体质量随机分成模型组、阳性对照组、BCA低、中、高剂量组各10只,同时选取10只同批雌性小鼠切除双侧卵巢旁少量脂肪组织作为假手术组。假手术组和模型组灌胃等体积的0.5%羧甲基纤维素钠溶液,阳性对照组用雌二醇2 mg/kg灌胃,BCA低、中、高剂量组分别按25、50、100 mg/kg BCA灌胃,1次/d,连续7周。给药结束后麻醉处死小鼠取材,测定肝指数和子宫指数,HE及Masson染色观察肝组织病理改变,生化法检测AST、ALT活性,ELISA法检测肝组织中IL-6、TNF-α水平,Western Blot法测定肝组织中Ⅰ型胶原蛋白(CollagenⅠ)、转化生长因子-β1(TGF-β1)、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)、雌激素受体β(ERβ)、p-NF-κBp65/NF-κBp65蛋白的相对表达量。计量资料两组间比较采用成组t检验,多组间比较采用单因素方差分析;进一步两两比较采用LSD-t检验。非正态分布的计量资料多组间比较及进一步两两比较均采用Kruskal-Wallis H检验。结果与假手术组相比,模型组肝指数升高,子宫指数降低,血清AST和ALT活性、肝组织中IL-6、TNF-α水平及CollagenⅠ、TGF-β1、α-SMA、p-NF-κBp65/NF-κBp65蛋白表达均升高(P值均0.05),模型组肝组织明显纤维化病变,出现肝细胞水肿、脂肪样变、坏死并伴有炎细胞浸润,胶原纤维增生沉积、交错分布。与模型组比较,BCA各剂量组肝指数降低,血清ALT和AST活性、肝组织IL-6、TNF-α水平及CollagenⅠ、TGF-β1、α-SMA、p-NF-κBp65/NF-κBp65的蛋白表达均降低(P值均0.05),肝组织ERβ蛋白表达升高(P<0.05),肝组织的纤维化病变有不同程度改善。结论BCA可有效改善CCl4诱导的雌性去势小鼠肝纤维化,其作用机制可能是通过上调ERβ抑制NF-κB信号通路,减轻炎症反应而实现的。

关键词：肝纤维化植物雌激素类卵巢切除术小鼠