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2型糖尿病患者早期糖尿病肾脏病与肾脏异位脂肪沉积的关系

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中华糖尿病杂志 2024年第7期16卷 776-782页

作者：任惠珠马泽军徐国萍王珊珊程静丽朱艳娟王声翰单春艳天津医科大学朱宪彝纪念医院肾病内科、天津市内分泌研究所、国家卫健委激素与发育重点实验室、天津市代谢性疾病重点实验室天津300134 天津医科大学朱宪彝纪念医院血液净化中心、天津市内分泌研究所国家卫健委激素与发育重点实验室、天津市代谢性疾病重点实验室天津300134 天津医科大学第二医院放射科天津300211 天津医科大学朱宪彝纪念医院病案统计科、天津市内分泌研究所、国家卫健委激素与发育重点实验室、天津市代谢性疾病重点实验室天津300134 天津市宁河区医院内分泌与肾内科天津301599

目的探讨2型糖尿病(T2DM)患者早期糖尿病肾脏病(DKD)与肾脏异位脂肪沉积的关系。方法本研究为横断面研究。收集2021年7月至2023年7月于天津医科大学朱宪彝纪念医院住院且资料完整的375例T2DM患者作为研究对象,其中男性226例,女性149例... 详细信息

目的探讨2型糖尿病(T2DM)患者早期糖尿病肾脏病(DKD)与肾脏异位脂肪沉积的关系。方法本研究为横断面研究。收集2021年7月至2023年7月于天津医科大学朱宪彝纪念医院住院且资料完整的375例T2DM患者作为研究对象,其中男性226例,女性149例。将所有研究对象分为早期DKD组(129例)和正常白蛋白尿组(246例)。检测糖化血红蛋白(HbA1c)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、极低密度脂蛋白胆固醇(VLDL-C)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、可溶性CD36(sCD36)等生化指标及视黄醇结合蛋白(RBP)、β2-微球蛋白(β2-MG)、N-乙酰氨基葡萄苷酶(NAG)等肾小管功能指标,并计算稳态模型评估胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)和动脉硬化指数(AI)。按照随机数字表法每组选取20例患者,应用MR mDixon-Quant技术检测肾脏脂肪含量,计算肾脏脂肪分数(RFF)。采用独立样本t检验或χ^(2)检验进行组间比较,采用二元logistic回归分析法分析早期DKD的影响因素。结果早期DKD组HbA1c、HOMA-IR明显高于正常白蛋白尿组[分别为(8.1±2.0)%和(7.7±1.7)%、4.0±1.1和3.1±1.0,t=2.03、7.99,均P功能指标2项异常和3项异常的比例高于正常白蛋白尿组(χ^(2)=22.27、8.42,均P<0.05)。二元logistic回归分析结果显示,早期DKD与HbA1c、sCD36、LDL-C、RFF有关(OR=1.241、1.006、1.005、5.035,均P<0.05)。结论 T2DM患者早期DKD与血脂异常和肾脏异位脂肪沉积可能有关。

关键词：糖尿病,2型糖尿病肾脏病异位脂肪沉积

精神分裂症患者中脑多巴胺区亚频段静息态功能连接异常研究

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临床放射学杂志 2024年第8期43卷 1244-1249页

作者：郑明明周雪杨淑贤秦文梁猛天津医科大学医学技术学院 300203 天津市功能影像重点实验室 300052 天津医科大学总医院影像科 300052

目的探讨精神分裂症(SZ)患者中脑多巴胺区[腹侧被盖部(VTA)和黑质致密区(SNc)]不同亚频段(Slow⁃5:0.01~0.027 Hz,Slow⁃4:0.027~0.073 Hz)下静息态功能连接(rsFC)的异常。方法纳入91例SZ患者和91名健康志愿者对照组(HC)。所有被试均进行... 详细信息

目的探讨精神分裂症(SZ)患者中脑多巴胺区[腹侧被盖部(VTA)和黑质致密区(SNc)]不同亚频段(Slow⁃5:0.01~0.027 Hz,Slow⁃4:0.027~0.073 Hz)下静息态功能连接(rsFC)的异常。方法纳入91例SZ患者和91名健康志愿者对照组(HC)。所有被试均进行静息态功能磁共振成像(rs⁃fMRI)扫描。将中脑多巴胺区划分为四个亚区(左、右侧VTA和SNc),全脑其他区域划分为272个脑区,分析SZ组和HC组在Slow⁃5和Slow⁃4频段上双侧VTA和SNc各自与全脑其他脑区的rsFC的组间差异,进一步分析这些异常rsFC是否具有频率特异性,并考察SZ组异常rsFC值与临床症状之间的相关性。结果两个频段下SZ患者右侧VTA与小脑蚓8区的rsFC均降低。此外,Slow⁃5频段SZ患者右侧SNc与小脑蚓7区的rsFC降低;Slow⁃4频段SZ患者右侧SNc与左侧腹侧尾状核的rsFC降低,右侧SNc与左侧舌前回和左侧中央后回的rsFC升高。其中,右侧SNc与小脑蚓8区和左侧腹侧尾状核的rsFC异常在两个频段间的差异具有统计学意义。与临床症状的相关性分析表明,Slow⁃5频段SZ组右侧SNc与小脑蚓7区的rsFC和阳性与阴性症状量表(PANSS)中的阳性症状分、思维障碍分、激活性分和攻击性(补充)分均呈正相关;Slow⁃4频段SZ组右侧SNc与左侧舌前回的rsFC和PANSS量表中的思维障碍分呈负相关。结论SZ患者中脑特定多巴胺区与小脑蚓、尾状核、舌前回和中央后回存在亚频段rsFC异常,且部分rsFC异常具有频率依赖性,这为SZ的神经生理机制研究提供了新思路。

关键词：精神分裂症腹侧被盖部黑质致密区静息态功能连接亚频段

肿瘤患者使用免疫检查点抑制剂后心律失常发生情况及心电图特征分析

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中华心血管病杂志 2024年第6期52卷 690-697页

作者：耿旭红张楠宋文华成思瑶郑屹马潇桐王莉李选刘彤河北医科大学第四医院功能科石家庄050011 天津医科大学第二医院心脏科、天津市心血管病离子与分子机能重点实验室、天津心脏病学研究所天津300211

目的分析肿瘤患者使用免疫检查点抑制剂(ICI)后心律失常发生情况及心电图特征的变化。方法本研究为一项队列研究,选取2020年11月至2022年9月于河北医科大学第四医院接受ICI治疗的肿瘤患者,对其接受ICI治疗前后的标准12导联心电图进行分... 详细信息

目的分析肿瘤患者使用免疫检查点抑制剂(ICI)后心律失常发生情况及心电图特征的变化。方法本研究为一项队列研究,选取2020年11月至2022年9月于河北医科大学第四医院接受ICI治疗的肿瘤患者,对其接受ICI治疗前后的标准12导联心电图进行分析比较。其中,出现窦性心律失常、心房颤动、心房扑动、阵发性室上性心动过速、室性心动过速、早搏、传导阻滞、ST-T改变等异常心电现象中任何1种,则该份心电图被定义为异常心电图。结果共纳入87例患者,年龄63(57,68)岁,男性66例(75.9%)。44.8%(39/87)的患者在接受ICI治疗前即存在至少1种心血管疾病或危险因素。在接受(5.0±2.7)个周期的ICI治疗后,与基线水平比较,异常心电图发生率升高[65.5%(57/87)比31.0%(27/87),P<0.001];ICI治疗后窦性心律失常发生率高于基线[23.0%(20/87)比9.2%(8/87),P=0.023],其中,以窦性心动过速患者的比例升高为著[11.5%(10/87)比2.3%(2/87),P=0.039]。ICI治疗后心电图出现ST-T改变的患者比例高于基线[31.0%(27/87)比17.2%(15/87),P=0.012],主要归因于T波改变的发生率升高[29.9%(26/87)比13.8%(12/87),P=0.001]。此外,ICI治疗后早搏的发生率较治疗前升高[9.2%(8/87)比0,P=0.008]。心电图各指标中,接受ICI治疗后患者的P波电轴较基线增大[(56.94±21.01)°比(52.00±22.69)°,P=0.043],静息心率较前升高[(79.07±15.37)次/min比(75.64±13.37)次/min,P=0.029];Sokolow-Lyon指数较基线有下降趋势[(2.21±0.81)mV比(2.33±0.75)mV,P=0.138],QTc间期较基线有延长趋势[(431.44±36.04)ms比(428.00±30.05)ms,P=0.415]。结论肿瘤患者在接受ICI治疗后异常心电图的发生率升高,其中主要以窦性心动过速、T波改变、早搏的发生率增高为主,心电图P波电轴在治疗后增大、静息心率加快,提示对于接受ICI治疗的肿瘤患者,进行规律的心电监测十分重要。

关键词：心律失常肿瘤心脏病学免疫检查点抑制剂免疫相关不良反应心电图

2型糖尿病患者肾小管功能受损与胰岛α和β细胞功能的关系研究

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中华糖尿病杂志 2024年第6期16卷 648-653页

作者：任惠珠马泽军王珊珊程静丽朱艳娟单春艳天津医科大学朱宪彝纪念医院肾病内科天津市内分泌研究所国家卫健委激素与发育重点实验室天津市代谢性疾病重点实验室天津300134 天津医科大学朱宪彝纪念医院血液净化中心天津市内分泌研究所国家卫健委激素与发育重点实验室天津市代谢性疾病重点实验室天津300134 天津医科大学朱宪彝纪念医院病案统计科天津市内分泌研究所国家卫健委激素与发育重点实验室天津市代谢性疾病重点实验室天津300134

目的探讨2型糖尿病(T2DM)患者肾小管功能受损与胰岛α和β细胞功能的关系。方法为横断面研究。收集2020年1月至2023年7月于天津医科大学朱宪彝纪念医院住院、尿白蛋白正常、资料完整的T2DM患者为研究对象。根据研究对象肾小管功能是否... 详细信息

目的探讨2型糖尿病(T2DM)患者肾小管功能受损与胰岛α和β细胞功能的关系。方法为横断面研究。收集2020年1月至2023年7月于天津医科大学朱宪彝纪念医院住院、尿白蛋白正常、资料完整的T2DM患者为研究对象。根据研究对象肾小管功能是否正常将其分为肾小管功能正常组和肾小管功能受损组。收集研究对象糖化血红蛋白(HbA1c)、24 h尿糖,所有研究对象行口服葡萄糖耐量试验(OGTT)并于空腹及口服75 g葡萄糖后30、60、120、180 min检测血糖、胰岛素、C肽和胰高糖素,计算其稳态模型评估胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)、胰高糖素曲线下面积(AUCG)、C肽曲线下面积(AUCC)和胰岛素敏感性指数(ISI)。采用独立样本t检验或χ^(2)检验进行组间比较,采用二元logistic回归分析肾小管功能受损的影响因素。结果共纳入T2DM患者196例,其中肾小管功能正常组104例,肾小管功能受损组92例。与肾小管功能正常组相比,肾小管功能受损组T2DM患者空腹血糖(t=2.00)、HbA1c(t=3.58)、24 h尿糖(t=2.97)、HOMA-IR(t=8.17)、180 min胰高糖素(t=1.98)均更高,AUCG更大(t=2.33),ISI更低(t=2.80),AUCc更小(t=2.52)(均P功能受损与HbA1c、HOMA-IR、AUCG均呈正相关[OR值(95%CI)分别为4.705(2.080~10.643)、4.055(1.751~9.394)和1.930(1.324~2.812),均P功能受损可能与胰岛α和β细胞功能有关。

关键词：糖尿病,2型肾小管功能受损胰岛α细胞胰岛β细胞

^(18)F⁃FDG PET/CT在三阴性乳腺癌分子分型诊断中的价值

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中华放射医学与防护杂志 2024年第5期44卷 421-427页

作者：刘建井边海曼付蔷王子阳杨芳戴东陈薇朱磊徐文贵天津医科大学肿瘤医院分子影像及核医学诊疗科天津300060 国家恶性肿瘤临床医学研究中心乳腺癌防治教育部重点实验室天津市肿瘤防治重点实验室天津市恶性肿瘤临床医学研究中心天津300060 天津市肿瘤医院空港医院核医学科国家恶性肿瘤临床医学研究中心天津300308 天津医科大学肿瘤医院放射科天津300060

目的探究^(18)F⁃氟脱氧葡萄糖⁃正电子体层扫描成像(^(18)F⁃FDG PET/CT)在三阴性乳腺癌分子分型诊断中的价值。方法回顾性分析2010年1月1日至2022年12月31日在天津医科大学肿瘤医院行^(18)F⁃FDG PET/CT检查的227例乳腺癌患者的临床和影... 详细信息

目的探究^(18)F⁃氟脱氧葡萄糖⁃正电子体层扫描成像(^(18)F⁃FDG PET/CT)在三阴性乳腺癌分子分型诊断中的价值。方法回顾性分析2010年1月1日至2022年12月31日在天津医科大学肿瘤医院行^(18)F⁃FDG PET/CT检查的227例乳腺癌患者的临床和影像学资料,根据乳腺癌原发灶雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)及人表皮生长因子受体2(HER-2)表达状态将患者分为三阴性乳腺癌和非三阴性乳腺癌两组;基于PET图像和CT图像,提取影像组学特征,构建影像组学模型用于预测三阴性乳腺癌的分子分型;并比较两组患者的临床资料、CT形态学特征和PET代谢参数的差异,筛选出差异有统计学意义的指标,建立联合临床特征的综合性影像组学模型。结果与非三阴性乳腺癌相比,三阴性乳腺癌在肿瘤直径、边缘、合并同侧腋下淋巴结转移、累犯邻近皮肤乳头及PET代谢参数等方面表现出更显著的侵袭性(t=-3.19,χ^(2)=7.30、8.10、5.34,t=3.80、3.30、3.42,P<0.05)。构建的^(18)F⁃FDG PET/CT影像组学模型能够有效预测三阴性乳腺癌的分子分型,受试者工作特征(ROC)曲线分析显示,曲线下面积(AUC)为0.83(95%CI 0.78~0.88),预测准确度为75.9%,灵敏度为74.5%,特异度为77.2%。构建的综合性影像组学模型AUC为0.86(95%CI 0.81~0.90),预测准确度为77.2%,灵敏度为78.6%,特异度为75.9%。结论^(18)F⁃FDG PET/CT在三阴性乳腺癌分子分型诊断中发挥重要价值,构建的影像组学模型和综合性影像组学模型进一步提高了PET代谢参数的预测效能,有助于临床上尽早制定准确的治疗方案,从而改善患者预后。

关键词：三阴性乳腺癌分子分型 18 F⁃FDG PET/CT 代谢参数影像组学

敲降低密度脂蛋白受体相关蛋白表达对肝癌血管异常化的影响及其机制

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中华肿瘤杂志 2024年第5期46卷 399-408页

作者：武强詹琳琳王宇贺钰超陈璐陈子叶李广涛刘东明包旭刘潇濛郭华宋天强天津医科大学肿瘤医院肝胆肿瘤科国家恶性肿瘤临床医学研究中心天津市肿瘤防治重点实验室天津300060 天津医科大学肿瘤医院肿瘤细胞生物学实验室国家恶性肿瘤临床医学研究中心天津市肿瘤防治重点实验室天津300060 北京清华长庚医院临床转化科学中心北京102218

目的探讨低密度脂蛋白受体相关蛋白(LDLR)表达对肝癌血管异常化的影响及其机制。方法从Oncomine癌症基因芯片数据库提取87例肝癌组织的基因转录组信息,分析肝癌组织中LDLR的表达水平与癌胚抗原(CEA)和CD31表达水平的相关性。采用短发卡... 详细信息

目的探讨低密度脂蛋白受体相关蛋白(LDLR)表达对肝癌血管异常化的影响及其机制。方法从Oncomine癌症基因芯片数据库提取87例肝癌组织的基因转录组信息,分析肝癌组织中LDLR的表达水平与癌胚抗原(CEA)和CD31表达水平的相关性。采用短发卡RNA靶基因慢病毒转染的方法,构建LDLR敲降的MHCC-97H和HLE肝癌细胞。通过转录组测序、实时荧光定量聚合酶链反应、蛋白免疫印迹法检测LDLR敲降后肝癌细胞的差异基因及其表达水平变化。通过富集分析明确LDLR参与的基因相关信号通路。通过对肝癌细胞条件培养基中CEA含量的检测评估LDLR对CEA的影响。采用血管生成实验检测LDLR对人脐静脉内皮细胞血管生成能力的影响,以及CEA在LDLR调控血管生成过程中的作用。收集2019年1月至2022年12月于天津医科大学肿瘤医院手术切除的肝癌组织标本176例,采用免疫组织化学染色检测176例肝癌组织中LDLR及146例肝癌组织中CEA和CD31的表达水平,分析肝癌组织中LDLR的表达水平与肝癌组织中CEA和CD31的表达水平、血清CEA和丙氨酸氨基转移酶(ALT)水平的相关性。结果Oncomine数据库分析显示,发生门静脉转移的肝癌患者肝癌组织中LDLR和CEA的表达呈负相关(r=-0.64,P=0.001),而CEA和CD31的表达呈正相关(r=0.46,P=0.010);转录组测序结果显示,LDLR敲降组与对照组MHCC-97H细胞的差异表达基因共有1032个,其中517个基因表达上调,515个基因表达下调。CEA相关细胞黏附分子5(CEACAM5)在LDLR敲降组细胞中上调明显。基因本体论功能富集分析显示,差异基因最明显富集在血管生成的功能上。京都基因与基因组百科全书信号通路富集分析显示,涉及的相关通路主要包括细胞粘着斑、细胞外基质受体相互作用等。LDLR敲降组条件培养基中CEA含量为43.75±8.43,高于对照组(1.15±0.14,P实验结果显示,在5 h,用LDLR敲降组MHCC-97H细胞的条件培养基培养HUVEC细胞形成的血管主结点数、主分段数和网格总面积分别为(295.3±26.4)个、(552.5±63.8)个和(2239781.0±138211.9)平方像素,均高于对照组[分别为(113.3±23.5)个、(194.8±36.5)个和(660621.0±280328.3)平方像素,均P<0.01];用LDLR敲降组HLE细胞的条件培养基培养HUVEC细胞形成的血管主结点数、主分段数和网格总面积分别为(245.3±42.4)个、(257.5±20.4)个和(2535754.5±249094.2)平方像素,均高于对照组[分别为(113.3±23.5)个、(114.3±12.2)个和(1565456.5±219259.7)平方像素,均P<0.01];在对照组MHCC-97H细胞条件培养基中加入CEA培养HUVEC细胞形成的血管主结点数、主分段数和网格总面积分别为(178.9±12.0)个、(286.9±12.3)个和(1966990.0±126249.5)平方像素,均高于对照组[分别为(119.7±22.1)个、(202.7±33.7)个和(1421191.0±189837.8)平方像素,均P<0.01]。肝癌组织中LDLR的表达与CEA的表达无相关性,与肝癌组织中CD31的表达、血清CEA水平、血清ALT水平均呈负相关(r=-0.167,P=0.044;r=-0.061,P=0.032;r=-0.147,P=0.05)。肝癌组织中CEA的表达与CD31的表达呈正相关(r=0.192,P=0.020),血清CEA水平与血清ALT水平呈正相关(r=0.164,P=0.029)。结论肝癌细胞敲降LDLR可通过释放CEA促进肝癌血管异常化。

关键词：肝细胞癌低密度脂蛋白受体相关蛋白癌胚抗原血管生成

玻璃体切割术联合视网膜下注射组织型纤溶酶原激活剂对黄斑下出血的疗效观察

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中华实验眼科杂志 2024年第5期42卷 448-452页

作者：薛晓阳刘勃实李筱荣天津医科大学眼科医院、天津医科大学眼视光学院、天津医科大学眼科研究所、国家眼耳鼻喉疾病临床医学研究中心天津市分中心、天津市视网膜功能与疾病重点实验室天津300384

目的观察玻璃体切割术(PPV)联合视网膜下注射组织型纤溶酶原激活剂(t-PA)治疗黄斑下出血(SMH)的疗效。方法采用系列病例观察研究方法,纳入2022年2—11月于天津医科大学眼科医院确诊的SMH患者12例12眼,其中息肉样脉络膜血管病变(PCV)11... 详细信息

目的观察玻璃体切割术(PPV)联合视网膜下注射组织型纤溶酶原激活剂(t-PA)治疗黄斑下出血(SMH)的疗效。方法采用系列病例观察研究方法,纳入2022年2—11月于天津医科大学眼科医院确诊的SMH患者12例12眼,其中息肉样脉络膜血管病变(PCV)11例11眼,视网膜大动脉瘤1例1眼;男5例,女7例;年龄为56~78岁,平均(65.67±8.09)岁;人工晶状体眼2眼,合并白内障10眼;高血压9例,糖尿病2例。SMH持续时间为2~25 d,平均(14.67±8.03)d。患眼均行PPV联合视网膜下注射t-PA。术前和术后1、3、6个月,患眼均行最佳矫正视力(BCVA)、眼压、裂隙灯显微镜、间接检眼镜、光学相干断层扫描(OCT)以及超广角眼底成像检查。采用OCT测量中央视网膜厚度(CRT)。观察患者手术后眼部情况以及不良反应发生情况。结果患眼术前及术后1、3、6个月平均BCVA(LogMAR)分别为1.58±0.63、1.12±0.49、1.07±0.44和0.59±0.19,不同时间点患眼BCVA总体比较,差异有统计学意义(F=14.435,P<0.001),其中术后6个月患眼BCVA较术前明显提高,差异有统计学意义(P<0.001)。患眼术前及术后1、3、6个月平均CRT分别为(606.25±204.67)、(379.83±92.05)、(313.75±60.87)和(267.75±73.07)μm,不同时间点患眼CRT总体比较,差异有统计学意义(F=27.720,P<0.001),其中术后1、3、6个月患眼CRT较术前均明显变薄,差异均有统计学意义(均P<0.001)。1眼于术后3个月出现脉络膜上腔出血;随访期间6眼因PCV复发行玻璃体腔注射抗血管内皮生长因子(VEGF)药物,共注射给药16次。术后1、3、6个月内平均抗VEGF注射次数分别为(0.3±0.5)、(1.3±1.4)和(2.7±2.0)次。结论在SMH的治疗中,PPV联合视网膜下注射t-PA可提高患眼BCVA,降低CRT,减轻血凝块对视网膜的损伤,促进患眼术后早期视力恢复,是一种安全、有效的手术方式。

关键词：息肉样脉络膜血管病变组织型纤溶酶原激活剂玻璃体切割黄斑下出血视网膜下注射疗效

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原发性胶质母细胞瘤瘤内细菌特征基因及其功能研究

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中华神经外科杂志 2024年第9期40卷 945-951页

作者：于润泽魏成王博李泽生靖博元韩磊天津医科大学总医院天津市神经病学研究所教育部"中枢神经损伤与再生"重点实验室天津市"神经损伤变异与再生"重点实验室天津300052

目的分析原发性胶质母细胞瘤(GBM)患者肿瘤组织中细菌相关特征基因,并研究肿瘤内细菌相关特征基因在GBM中的功能及作用机制。方法采用基于癌症基因组图谱(TCGA)数据分析得到的原发性GBM瘤内细菌相关特征基因的公开数据,共152例。根据GB... 详细信息

目的分析原发性胶质母细胞瘤(GBM)患者肿瘤组织中细菌相关特征基因,并研究肿瘤内细菌相关特征基因在GBM中的功能及作用机制。方法采用基于癌症基因组图谱(TCGA)数据分析得到的原发性GBM瘤内细菌相关特征基因的公开数据,共152例。根据GBM患者总生存时间的中位数,将其分为低生存组(78例)和高生存组(74例)。使用秩和检验评估组间α多样性的差异;采用非度量多维尺度(NMDS)分析和主坐标分析(PCoA)评估组间β多样性的差异;采用线性判别分析(LDA)比较两组GBM样本中丰富度存在显著差异的细菌种类。分别根据各差异细菌相关特征基因的相对丰富度将152例患者分为高丰富度组和低丰富度组,采用Kaplan-Meier法分析高丰富度组与低丰富度组患者生存率的差异。对与良好预后相关的高丰富度细菌相关特征基因GBM样本中显著上调的基因进行基因本体论(GO)生物过程功能注释和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过TCGA转录组测序数据集分析肿瘤免疫微环境景观,应用曼特尔检验分析免疫细胞浸润含量与预后相关细菌特征基因的相关性。所有数据分析均采用R软件,以P功能富集分析显示,肿瘤内脆弱拟杆菌相关特征基因丰富度较高的患者肿瘤组织中高表达与免疫途径相关的基因(P<0.05)。曼特尔检验分析结果显示,原发性GBM肿瘤组织中脆弱拟杆菌相关特征基因的丰富度与M1巨噬细胞浸润呈正相关(P<0.05)。结论脆弱拟杆菌相关特征基因在高生存原发性GBM患者肿瘤组织中的丰富度较高,并影响肿瘤的免疫微环境。

关键词：胶质母细胞瘤细菌相关特征基因肿瘤内细菌转录组

基于生物信息学方法筛选复发性流产中巨噬细胞相关的免疫特征基因

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中华生殖与避孕杂志 2024年第6期44卷 617-627页

作者：郭艺芬任舒悦高志贤顾艳天津医科大学第二医院计划生育科天津300211 天津市环境与作业医学研究所、天津市环境与食品安全风险评估与控制技术重点实验室天津300050

目的通过生物信息学分析方法,筛选可能导致复发性流产(recurrent miscarriage,RM)的母胎免疫微稳态失衡相关基因,寻找潜在的RM分子标志物。方法从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载由24例RM患者和24例正常对照妇女子宫内膜组织数... 详细信息

目的通过生物信息学分析方法,筛选可能导致复发性流产(recurrent miscarriage,RM)的母胎免疫微稳态失衡相关基因,寻找潜在的RM分子标志物。方法从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载由24例RM患者和24例正常对照妇女子宫内膜组织数据所组成的数据集GSE165004,采用R语言的Limma包及CIBERSOR免疫浸润和加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法,筛选了差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)和免疫相关模块;通过基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)和基因集变异分析(gene set variation analysis,GSVA),评价了这些核心基因的功能关联性。最后我们使用蜕膜组织的数据集GSE161969进一步验证了关键基因的诊断价值。结果通过差异分析,识别出580个差异表达基因,并通过WGCNA筛选得到3271个与免疫相关的模块基因;利用机器学习技术,鉴定出FGF2、ANO1和LAPTM5作为关键基因,并通过GSVA分析,发现这些基因在免疫浸润和巨噬细胞途径中发挥重要作用。结论FGF2、ANO1和LAPTM5可能参与RM的免疫致病途径,是潜在的RM生物标志分子。

关键词：机器学习复发性流产生物信息学免疫浸润加权基因共表达网络分析