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基于WGCNA和机器学习算法探索结直肠癌肝转移的机制及其潜在生物标志物

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右江医学 2024年

作者：张平茜何亚玲李宇阳胡诗涵高波潘云大理大学基础医学院大理大学临床医学院大理大学第一附属医院病理科

目的通过基于加权基因共表达网络分析（WGCNA）和机器学习算法探索结直肠肝转移（CRCLM）潜在生物标志物，为CRCLM的分子机制研究提供基础。方法从GEO数据库中收集两个CRCLM的微阵列数据集(GSE6988和GSE14297)，鉴定出CRCLM中的差异... 详细信息

目的通过基于加权基因共表达网络分析（WGCNA）和机器学习算法探索结直肠肝转移（CRCLM）潜在生物标志物，为CRCLM的分子机制研究提供基础。方法从GEO数据库中收集两个CRCLM的微阵列数据集(GSE6988和GSE14297)，鉴定出CRCLM中的差异表达基因(DEGs)后进行GO分析、KEGG富集分析和GSEA基因集富集分析。应用WGCNA筛选与CRCLM组相关性最强的模块内基因，采用机器学习算法LASSO逻辑回归和SVM-RFE鉴定CRCLM的潜在生物标志物。比较GSE6988中CRCLM组和对照组的关键基因表达量，同时绘制关键基因诊断CRCLM的ROC曲线，通过曲线下面积（AUC）评估其诊断效能。并在GSE14297中进行验证。结果鉴定出73个DEGs，包括55个上调基因和18个下调基因。生物学功能富集分析表明，DEGs主要富集于与血液微粒和趋化因子相关的通路。WGCNA共得到了5个基因共表达模块，其中黄色模块与CRCLM相关性最强（cor=0.72，P=2e-14），其中包含81个基因。对黄色模块基因进行LASSO逻辑回归分析，其中4个基因(CCL11、SLC26A3、NR4A2、PLA2G2A)被确定为潜在的具有诊断性生物标志物，通过SVM-RFE算法，从DEGs中获得19个基因(CRP、HP、ORM2、CYP2E1、CCL11、MMP10、AQP3、SERPINA3、ENO3、HAO1、PLG、ENAM、DGUOK、UBE2Q2、HPX、APOA2、ITIH3、ANGPTL3、MMP1)作为潜在的诊断基因，将LASSO算法以及SVM-RFE算法得到的关键基因取交集。最终嗜酸细胞活化趋化因子（CCL11）被确定为有希望的生物标志物。在训练集及验证集中，CRCLM组的CCL11表达均显著低于对照组（P<0.001）。在训练集和验证集中的ROC曲线分析结果显示，CCL11诊断CRCLM的AUC分别为0.936和0.997，显示出很强的预测预后的能力。结论 CCL11在CRCLM中低表达，可能是CRCLM的抑制因素，是CRCLM可能的预后生物分子标志物。CRCLM的发生发展可能与肿瘤血管微环境及趋化因子相关通路相关。

关键词：结直肠癌肝转移加权基因共表达网络分析机器学习算法生物信息学 CCL11

CDK4/6抑制剂联合内分泌疗法治疗HR/HER2~–晚期/转移性乳腺癌有效性和安全性的网状Meta分析

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中国胸心血管外科临床杂志 2024年

作者：普艳姣李辉陈伟段雪玉陈春梅吴瑞王学昌大理大学药学院安宁市第一人民医院药学部

目的基于网状Meta分析比较不同细胞周期蛋白依赖性激酶4/6抑制剂(cyclin-dependent kinase4/6 inhibitor,CDK4/6i)联合内分泌疗法(ET)HR+/HER2-晚期或转移性乳腺癌的疗效和安全性。方法检索PubMed、EMbase、Web of Science、The Cochrane Library、中国知网、万方、维普、中国生物医学文献服务系统数据库中CDK4/6i治疗HR+/HER2-转移性/晚期乳腺癌的随机对照试验，检索时限为建库至2023年8月。利用R4.2.0软件进行贝叶斯网状Meta分析。结果最终纳入18个随机对照试验，25篇文献，包括8 031例患者，涉及11种治疗方案。不同CDK4/6i+ET组合之间的无进展生存期(PFS)和总生存期(OS)无显著差异。PFS率排序居第一位的是DAL+FUL,OS率排序居第一位的是RIB+FUL。在有效率方面，ABE+AI,ABE+FUL分别在客观缓解率(ORR)和临床获益率(CBR)位于第一。在安全性方面，部分不同类型CDK4/6i之间的3～4级AEs、SAE有显著差异(P<0.05)。结论当前证据显示，CDK4/6i+ET治疗HR+/HER2-晚期/转移性乳腺癌优于单独ET，不同CDK4/6i+ET组合之间具有同等或近似效果，但联合用药不良反应发生率更高，需根据患者个体状况选择合理的治疗方案。

关键词： HR /HER2 晚期/转移性乳腺癌 CDK4/6抑制剂内分泌疗法有效性安全性 Meta分析

血清标志物BAGE5、RUNX1T1、SLFN14对比CA19-9在胰腺癌诊断中的比较研究:一项全面评估其临床应用前景的综述

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临床医学进展 2024年第3期14卷 884-888页

作者：王宏基谭云波金礼权大理大学临床医学院云南大理大理大学第一附属医院普外一科云南大理

胰腺癌作为消化道最常见的恶性肿瘤之一,病因尚不明确,临床常表现为上腹不适、腹泻、食欲减退、腹痛、黄疸等。胰腺位于腹腔深部,疾病早期症状无特异性,起病较为隐匿,患者往往难以察觉且临床难以诊断。近年来,胰腺癌的发生率在国内外均... 详细信息

胰腺癌作为消化道最常见的恶性肿瘤之一,病因尚不明确,临床常表现为上腹不适、腹泻、食欲减退、腹痛、黄疸等。胰腺位于腹腔深部,疾病早期症状无特异性,起病较为隐匿,患者往往难以察觉且临床难以诊断。近年来,胰腺癌的发生率在国内外均呈明显上升趋势。胰腺癌的常用诊断方法包括影像学检查、肿瘤标志物检查以及组织病理学检验,目前临床早期筛查胰腺癌的肿瘤标记物是CA19-9,它被认为在胰腺癌检测时敏感性和特异性不理想,CA19-9升高占比低,检测到CA19-9升高时胰腺癌已进展到晚期。有研究表明,肿瘤标记物和生化单独检测对胰腺癌早期诊断价值不高,若用2种及2种以上的肿瘤标记物联合检测可帮助胰腺癌的筛选以及鉴别,且早期诊断可有效提高胰腺癌患者生存率。BAGE5、RUNX1T1、SLFN14与胰腺癌存在潜在相关性,或可作为新的血清标志物诊断胰腺癌,本文将评估其临床应用前景。

关键词：胰腺癌 CA19-9 BAGE5 RUNX1T1 SLFN14

超声造影联合临床特征在微波消融治疗甲状腺良性结节疗效中的预测作用

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影像研究与医学应用 2024年第2期8卷 7-11,14页

作者：杨荣娇王静陈海燕成家茂张代娣陈国卿大理大学临床医学院云南大理671000 大理大学第一附属医院超声科云南大理671000 大理大学基础医学院云南大理671000

目的:探讨超声造影(CEUS)定量参数联合临床特征预测微波消融(MWA)治疗良性甲状腺结节(BTN)疗效的临床价值。方法:回顾性分析2021年12月—2022年8月在大理大学第一附属医院接受MWA治疗的112例BTN患者的临床资料及超声检查结果,计算术后... 详细信息

目的:探讨超声造影(CEUS)定量参数联合临床特征预测微波消融(MWA)治疗良性甲状腺结节(BTN)疗效的临床价值。方法:回顾性分析2021年12月—2022年8月在大理大学第一附属医院接受MWA治疗的112例BTN患者的临床资料及超声检查结果,计算术后第12个月末的结节体积(V术后)和体积缩小率(VRR)。以术后第12个月末的VRR为依据分成高消融率组(VRR≥80%,n=85)和低消融率组(VRR一般资料、临床特征及CEUS定量参数如达峰时间(TTP)、峰值强度(PI)、上升时间(RT)、曲线下面积(AUC-CEUS),筛选出影响消融率相关因素,并以此作为变量进行多因素Logistic回归分析法,分析MWA疗效的风险因素。结果:采用单因素分析进行高、低消融率组间比较的结果显示,消融术前结节的最大直径、体积、位置、消融风险及PI、TTP、AUC-CEUS差异均有统计学意义(P<0.05),与消融率相关。采用多因素Logistic回归分析结果显示,消融风险等级中的高风险、TTP、AUC-CEUS是MWA治疗BTN疗效的风险因素(P<0.05),且受试者工作特征(ROC)曲线分析的AUC为0.984,灵敏度为91.8%,特异度为96.3%。结论:CEUS定量参数TTP、AUC结合临床特征中的高消融风险可作为有效预测MWA治疗BTN患者效果的风险因素。

关键词：甲状腺良性结节微波消融术超声造影临床特征风险预测

阻塞性睡眠呼吸暂停与高血压:一项双向孟德尔随机化研究

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解放军医学杂志 2024年第6期49卷 636-642页

作者：夏露谢治年廖芯艺张启星李镇圻武警重庆总队医院耳鼻咽喉科重庆400061 大理大学第一附属医院耳鼻咽喉科云南大理671000 武警重庆总队医院普外科重庆400061

目的采用双向孟德尔随机化(MR)分析阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)与高血压的因果关系。方法OSA的相关遗传数据来自全基因组关联研究(GWAS)中的芬兰基因数据库(n_(病例组)=16761,n对照组=201194),从中筛选出5个单核苷酸多态性(SNPs)作为OSA的... 详细信息

目的采用双向孟德尔随机化(MR)分析阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)与高血压的因果关系。方法OSA的相关遗传数据来自全基因组关联研究(GWAS)中的芬兰基因数据库(n_(病例组)=16761,n对照组=201194),从中筛选出5个单核苷酸多态性(SNPs)作为OSA的工具变量(IVs)。高血压的相关遗传数据来源于GWAS中的英国基因数据库(n_(病例组)=124227,n对照组=337653),从中选取214个SNPs作为高血压的IVs。采用逆方差加权法(IVW)为主的多种MR方法进行分析。采用MR-Egger等方法对MR分析结果进行敏感性分析,并使用F值对IVs进行评估。结果OSA与高血压的风险增高相关(OR=1.053,95%CI 1.019~1.089,P<0.01),高血压与OSA的发病风险明显相关(OR=1.812,95%CI 1.354~2.425,P<0.001)。双向结果均存在异质性(OSA→高血压,P<0.001;高血压→OSA,P<0.001),均无水平多效性(OSA→高血压,P=0.666;高血压→OSA,P=0.556)。所选的OSA及高血压的IVs均为强IVs(OSA-IVs F=14.695;高血压-IVs F=39.624)。结论OSA与高血压具有双向因果关系,其中高血压对OSA发病的影响尤其明显。

关键词：阻塞性睡眠呼吸暂停高血压孟德尔随机化双向因果关系

基于CiteSpace探讨近5年慢性心力衰竭护理研究热点

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全科护理 2024年第11期22卷 2002-2006页

作者：张韵聆付吉芬纵艺璇艾敏邢星孙迎莉大理大学护理学院 671000 大理大学第一附属医院 671000

目的:分析国内近5年慢性心力衰竭护理的研究热点,为后续慢性心力衰竭护理临床研究提供参考。方法:检索中国知网收录的慢性心力衰竭护理相关文献,使用CiteSpace软件进行可视化分析。结果:共纳入1948篇,文献计量显示2018—2023年发文量呈... 详细信息

目的:分析国内近5年慢性心力衰竭护理的研究热点,为后续慢性心力衰竭护理临床研究提供参考。方法:检索中国知网收录的慢性心力衰竭护理相关文献,使用CiteSpace软件进行可视化分析。结果:共纳入1948篇,文献计量显示2018—2023年发文量呈下降趋势;主要合作团队以徐翠荣为核心作者群较大;关键词共现分析,研究热点为生活质量、心功能、慢性心衰、心力衰竭、老年、舒适护理、护理、冠心病、护理干预、自我管理。聚类分析发现,形成了心力衰竭、慢性心衰、心功能、护理、舒适护理、焦虑、生活质量、护理模式8个聚类。近5年的研究前沿是再入院率、遵医行为、质性研究、照护者、认知功能、互联网、糖尿病、运动耐力、微信平台、时机理论、营养不良。结论:国内近5年对慢性心力衰竭护理的研究呈下降趋势,其中的研究热点内容却很丰富。所以,护理研究人员应该加强合作,多关注慢性心力衰竭护理的研究,为临床提供更多的借鉴参考。

关键词： CiteSpace 慢性心力衰竭护理可视化分析

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清代云南盐业社会的儒学传播

民俗研究 2024年第1期 27-37,156页

作者：李陶红大理大学民族文化研究院云南大理671003

清代是云南儒学发展的成熟期。作为地方的云南盐业社会,儒学的传播有上层、中层、下层三个层次。上层的儒学传播包括地方官员提举与地方文化精英的学额争取及文庙儒学教育。中层的儒学传播包括书院、义学在内的儒学正统基层教育及地方... 详细信息

清代是云南儒学发展的成熟期。作为地方的云南盐业社会,儒学的传播有上层、中层、下层三个层次。上层的儒学传播包括地方官员提举与地方文化精英的学额争取及文庙儒学教育。中层的儒学传播包括书院、义学在内的儒学正统基层教育及地方家族儒学教育。底层的儒学传播包括面向民众的圣谕宣讲、地方大众教育慈善及其以儒家思想为中心的道德伦理建设。云南盐业社会的儒学传播实践,建立在国家与地方的互动基础之上,呈现出一统性与地方性。

关键词：儒学传播云南盐业社会一统性地方性

大理白族地区消化道恶性肿瘤患者术后生存质量的影响因素及其干预措施

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临床医学研究与实践 2024年第7期9卷 49-52页

作者：杨翠英李向华大理护理职业学院云南大理671006 大理大学第一附属医院云南大理671000

目的分析大理白族地区消化道恶性肿瘤患者术后生存质量的影响因素,并采取针对性干预措施。方法收集大理州2021年9月至2023年9月收治的123例经过手术治疗的消化道恶性肿瘤患者的临床资料。根据Karnofsky功能状态(KPS)评分将患者分为生存... 详细信息

目的分析大理白族地区消化道恶性肿瘤患者术后生存质量的影响因素,并采取针对性干预措施。方法收集大理州2021年9月至2023年9月收治的123例经过手术治疗的消化道恶性肿瘤患者的临床资料。根据Karnofsky功能状态(KPS)评分将患者分为生存质量低下组(57例)和生存质量良好组(66例)。对患者进行问卷调查,内容包括汉密尔顿焦虑量表(HAMA)评分、汉密尔顿抑郁量表(HAMD)评分、治疗方式、性别、年龄、民族、临床分期、严重术后并发症及严重化疗反应;采用多因素Logistic回归分析影响消化道恶性肿瘤患者术后生存质量的因素。结果生存质量良好组的HAMA、HAMD评分低于生存质量低下组(P一威胁消化道恶性肿瘤患者术后生存质量的危险因素,可以及时通过心理干预等手段进行预防,改善患者生存质量。

关键词：消化道恶性肿瘤大理白族地区生存质量抑郁

化解解剖学标本对新生身心影响的有效路径研究

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中文科技期刊数据库（文摘版）教育 2024年第1期 43-46页

作者：顾守美郭太兵罗海宣李渊大理大学第一附属医院云南大理671000 大理护理职业学院云南大理671000

以高职高专医学新生为研究对象,探究化解解剖学实验标本对医学新生身心影响的有效路径。本课题组前期已对护理专业新生在首次面对解剖学标本时身心变化进行了结果分析和研究论证,发现绝大部分新生在首次接触解剖学标本时,都会不同程度... 详细信息

以高职高专医学新生为研究对象,探究化解解剖学实验标本对医学新生身心影响的有效路径。本课题组前期已对护理专业新生在首次面对解剖学标本时身心变化进行了结果分析和研究论证,发现绝大部分新生在首次接触解剖学标本时,都会不同程度的或多或少出现身心变化。本研究以实验室建设和改造、改良教学模式、动态调整实验教学实施计划、融入思政元素和医学人文教育为切入点,探索研究化解此类影响的有效路径,从而达到增进学生学习兴趣、增强职业认同、转化学习动力、强化综合素质、凝聚团队协作、提高学习成绩的目的。

关键词：医学解剖学标本身心影响路径