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基于表面等离激元共振的液体活检技术研究进展

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中国激光 2025年

作者：曹健荣李法君王秀琦朱锦锋徐国兵潘思骏厦门大学柔性电子(未来技术)研究院传染病疫苗研发全国重点实验室翔安创新实验室厦门大学电子科学与技术学院福建医科大学附属协和医院胸外科胸心外科福建省高校重点实验室(福建医科大学) 福建省胸部肿瘤临床医学研究中心胸外科国家临床重点专科

随着精准医学的迅速发展，液体活检技术正逐渐成为疾病筛查、诊断和监测的重要工具。通过分析体液中的循环生物标志物，如细胞外囊泡、循环游离核酸、蛋白质、代谢物和循环肿瘤细胞，液体活检不仅提供了一种无创的疾病检测手段，还能实... 详细信息

随着精准医学的迅速发展，液体活检技术正逐渐成为疾病筛查、诊断和监测的重要工具。通过分析体液中的循环生物标志物，如细胞外囊泡、循环游离核酸、蛋白质、代谢物和循环肿瘤细胞，液体活检不仅提供了一种无创的疾病检测手段，还能实现对疾病进展的实时监测。在众多液体活检技术中，表面等离激元共振（SPR）技术因其响应速度快、检测灵敏度高、实时监测能力强、多模态检测特性以及微纳结构的可调性，展现出显著的应用潜力。本文综述了基于SPR的液体活检技术的最新研究进展，系统分析了其技术原理及其在循环生物标志物检测中的应用，特别关注细胞外囊泡这一新兴领域，并深入探讨了当前技术面临的挑战与未来发展趋势。

关键词：表面等离激元共振液体活检精准诊疗循环生物标志物细胞外囊泡

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赖氨酸乙酰化调控细胞代谢的机制

生命科学 2018年第4期30卷 447-454页

作者：王义平雷群英复旦大学肿瘤医院肿瘤研究所和生物医学研究院肿瘤代谢实验室

赖氨酸乙酰化是一种重要的翻译后修饰。细胞内的蛋白质,特别是代谢酶,广泛受乙酰化修饰的调控。乙酰化修饰由乙酰化酶和去乙酰化酶调节,对细胞的物质代谢和能量稳态进行多层次、复杂而又精细的调控。乙酰化酶和去乙酰化酶活性的发挥依... 详细信息

赖氨酸乙酰化是一种重要的翻译后修饰。细胞内的蛋白质,特别是代谢酶,广泛受乙酰化修饰的调控。乙酰化修饰由乙酰化酶和去乙酰化酶调节,对细胞的物质代谢和能量稳态进行多层次、复杂而又精细的调控。乙酰化酶和去乙酰化酶活性的发挥依赖中间代谢产物,且多种代谢物能够调控乙酰化酶和去乙酰化酶的催化活力。因此,乙酰化修饰是调控细胞代谢的重要机制。此外,乙酰化修饰能够调节自噬和营养物质感受通路,从而调控细胞的物质和能量稳态;乙酰化修饰对组蛋白的调节则能根据细胞的营养状态在表观遗传水平改变基因的表达,使细胞高效地应对不同的营养和压力状态。乙酰化修饰与代谢相关疾病的发生发展具有重要联系,对乙酰化调控的研究将极大增进人们对细胞代谢、表观遗传等生命活动的认识。

关键词：乙酰化细胞代谢乙酰化酶去乙酰化酶翻译后修饰

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代谢物感受与信号传递

中国细胞生物学学报 2019年第7期41卷 1262-1270页

作者：王义平雷群英复旦大学附属肿瘤医院肿瘤研究所和生物医学研究院肿瘤代谢实验室

代谢物感受及信号传递是最基本的生命活动之一。细胞在生物进化过程中产生了多种多样的机制感受内外环境中的代谢物波动,以协调细胞代谢本身以及代谢与其他生物学过程。虽然经过几十年的研究,细胞代谢网络已被清楚地解析和绘制,但人们... 详细信息

代谢物感受及信号传递是最基本的生命活动之一。细胞在生物进化过程中产生了多种多样的机制感受内外环境中的代谢物波动,以协调细胞代谢本身以及代谢与其他生物学过程。虽然经过几十年的研究,细胞代谢网络已被清楚地解析和绘制,但人们对细胞感受代谢物波动的机制及其生理功能仍缺乏足够认识。除了经典的感受能量和氨基酸营养状态的AMPK和mTOR通路外,对于新的代谢物感受器分子以及代谢物感受机制了解甚少。根据目前对代谢物感受的认识,代谢物感受通路由感受器、信号转导蛋白和效应蛋白构成。代谢物的浓度变化可通过代谢物感受器、代谢物感受模块或代谢物分子对靶蛋白的化学修饰三种不同方式被细胞感受,并调控相应生理活动。细胞采取多种机制感受糖类、脂类、氨基酸、代谢中间体等代谢物的变化,整合细胞的营养和代谢状态,作出相应决策,协调生命活动的正常进行。代谢物感受异常是肿瘤代谢重塑的重要组成部分,因此代谢物感受也成为极具潜力的肿瘤代谢靶点。

关键词：代谢物感受代谢物感受器代谢物感受模块代谢中间体信号传导

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编者按

中国细胞生物学学报 2019年第7期41卷 1214-1215页

作者：雷群英复旦大学附属肿瘤医院肿瘤研究所和生物医学研究院肿瘤代谢实验室

细胞代谢是最基本的生命活动之一。基于目前的认知,细胞代谢是指生命体内对维持生命所必需的化学反应的总和。在20世纪50、60年代,生物学和化学领域的交叉在细胞代谢领域造就了前所未有的繁荣:人们对代谢物的种类及生理功能的认识得到... 详细信息

细胞代谢是最基本的生命活动之一。基于目前的认知,细胞代谢是指生命体内对维持生命所必需的化学反应的总和。在20世纪50、60年代,生物学和化学领域的交叉在细胞代谢领域造就了前所未有的繁荣:人们对代谢物的种类及生理功能的认识得到了极大的扩充;催化代谢反应的酶类分子也比较系统地被鉴定挖掘并绘制入代谢网络;对代谢具有调控作用但不直接参加化学反应的蛋白也得到了功能的注释。

关键词：细胞代谢生命活动代谢物糖稳态

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载脂蛋白E在恶性肿瘤中的作用机制

生物化学与生物物理进展 2024年第7期51卷 1551-1565页

作者：高博文王丽徐泱复旦大学附属中山医院肝肿瘤外科癌变与侵袭原理教育部重点实验室上海200032 复旦大学生物医学研究院上海200032

载脂蛋白E(apoE)是脂质代谢中的重要分子,通过调节细胞增殖、能量代谢、氧化应激、机体固有免疫等方式,在多种恶性肿瘤的发生发展中发挥重要作用,并影响患者的治疗效果,已成为潜在的肿瘤标志物和有潜力的治疗靶点,对于深入理解多种恶性... 详细信息

载脂蛋白E(apoE)是脂质代谢中的重要分子,通过调节细胞增殖、能量代谢、氧化应激、机体固有免疫等方式,在多种恶性肿瘤的发生发展中发挥重要作用,并影响患者的治疗效果,已成为潜在的肿瘤标志物和有潜力的治疗靶点,对于深入理解多种恶性肿瘤的病因学,推动恶性肿瘤的预防及开发新的治疗策略具有重要意义。本文对apoE的生物化学与分子生物学属性进行介绍,并梳理apoE在各个癌种的发生发展中发挥的作用,总结apoE与肿瘤的各种生物学特性之间的关系,探讨其作为肿瘤标志物与治疗靶点的潜力和应用价值。

关键词：载脂蛋白E 恶性肿瘤脂质代谢基因多态性肿瘤免疫

Hippo信号通路在乳腺癌中的调控机制及作用

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遗传 2017年第7期39卷 617-629页

作者：姚传波周鑫陈策实雷群英复旦大学附属肿瘤医院肿瘤研究所生物医学研究院肿瘤代谢实验室上海200032 德克萨斯大学MD安德森癌症中心肿瘤生物学系休斯顿77030 中国科学院昆明动物研究所肿瘤生物学实验室昆明650223

Hippo信号通路是调控器官大小和肿瘤发生发展的关键通路,近年来受到广泛的关注。TAZ/YAP作为哺乳动物中Hippo信号通路两个核心下游效应分子,通过Hippo信号通路依赖性和非依赖性的机制受到细胞内外信号的严密调控。除了参与正常乳腺组织... 详细信息

Hippo信号通路是调控器官大小和肿瘤发生发展的关键通路,近年来受到广泛的关注。TAZ/YAP作为哺乳动物中Hippo信号通路两个核心下游效应分子,通过Hippo信号通路依赖性和非依赖性的机制受到细胞内外信号的严密调控。除了参与正常乳腺组织发育,Hippo信号通路还在人乳腺癌细胞的增殖、分化、凋亡、迁移、侵袭、上皮-间质转化和干性维持等多个过程中起着关键性作用。本文总结了Hippo信号通路的调控机制和调节信号,阐述了Hippo信号通路异常在乳腺癌发生发展中的作用,并讨论了其在乳腺癌中作为治疗靶点的临床策略。

关键词： TAZ/YAP Hippo信号通路乳腺癌

超声处理对PRC2相关蛋白染色质免疫共沉淀测序结果的影响

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生物工程学报 2020年第2期36卷 341-352页

作者：杨根生焦芳芳吕瑞途郭睿复旦大学生物医学研究院上海200031 复旦大学附属浦东医院肿瘤科上海201399

超声处理是染色质免疫共沉淀(Chromatin immunoprecipitation,Ch IP)实验过程中染色质片段化的重要手段之一。选用多梳抑制复合物2 (Polycomb repressive complex 2,PRC2)相关蛋白组蛋白甲基转移酶EZH2及其催化产物H3K27me3为代表,研究... 详细信息

超声处理是染色质免疫共沉淀(Chromatin immunoprecipitation,Ch IP)实验过程中染色质片段化的重要手段之一。选用多梳抑制复合物2 (Polycomb repressive complex 2,PRC2)相关蛋白组蛋白甲基转移酶EZH2及其催化产物H3K27me3为代表,研究不同分子量大小的蛋白在不同超声处理时间下对染色质免疫共沉淀测序(Chromatin immunoprecipitation sequencing,Ch IP-seq)实验的影响,结果表明在启动子区或非启动子区,不同超声时间下小分子量组蛋白H3K27me3结合位点的注释基因均无明显差异,说明超声时间对组蛋白Ch IP-seq数据影响不大。与组蛋白不同,超声时间从10 min延长至20 min后启动子区EZH2新增结合位点的注释基因能够显著聚类在与肌动蛋白丝组装等相关通路上。超声20min相比10min,非启动子区EZH2新增基因的GO(Gene ontology)聚类通路要远多于丢失基因,且超声30 min相比20 min,非启动子区丢失基因的GO聚类通路要远多于新增基因,这些通路大多与RNA聚合酶Ⅱ(RNApolymeraseⅡ,RNAPII)、器官发育、细胞形态发生相关。这表明超声时间不足或过长均会导致EZH2的基因组定位信息的不全。另外,超声主要影响启动子区中的PRC2非结合区域及二价启动子区域的EZH2结合位点,还影响非启动子区中PRC2结合区域、PRC2不结合区域以及活化态增强子区域的EZH2结合位点。综上,建议对大分子量的染色质修饰相关蛋白优化超声处理时间,使形成的染色质片段聚集在100–500 bp可获得比较全面的基因组信息。对小分子量的组蛋白来说,超声时间对Ch IP-seq结果影响不大。

关键词：超声时间染色质片段化 EZH2 PRC2 启动子增强子

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线粒体动力学与肿瘤的研究进展

复旦学报（医学版） 2019年第1期46卷 128-134页

作者：张泽董琼珠钦伦秀复旦大学附属华山医院普外科上海200040 复旦大学生物医学研究院上海200032 复旦大学肿瘤转移研究所上海200040

线粒体动力学是指线粒体处在融合(fusion)与裂解(fission)的动态平衡中,线粒体的这种动态变化,可表现为形态上的异质性,在胞质中可呈点状、碎片状、条状或线状等不同形态。线粒体动力学与线粒体的功能有密切联系,如细胞增殖、细胞代谢... 详细信息

线粒体动力学是指线粒体处在融合(fusion)与裂解(fission)的动态平衡中,线粒体的这种动态变化,可表现为形态上的异质性,在胞质中可呈点状、碎片状、条状或线状等不同形态。线粒体动力学与线粒体的功能有密切联系,如细胞增殖、细胞代谢、细胞迁移等,并受多种化学酶及蛋白质的调控。在肿瘤中存在线粒体动力学的失调,线粒体动力学相关蛋白在肿瘤中表达异常,而且线粒体动力学相关蛋白与患者的预后及生存时间相关。线粒体动力学状态的改变可影响肿瘤的发生、发展及转移,但具体机制尚不明确。

关键词：线粒体动力学融合裂解肿瘤

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肿瘤代谢与肿瘤转移

复旦学报（医学版） 2016年第1期43卷 86-93页

作者：王祥宇郑燕鲁明钦伦秀复旦大学附属华山医院普外科上海200040 复旦大学肿瘤转移研究所上海200040 复旦大学生物医学研究院上海200032

在肿瘤的发生、发展过程中,肿瘤细胞的代谢会改变为特定的谱式以适应肿瘤的快速生长。近年来的研究表明,肿瘤的代谢与肿瘤的转移也存在密切联系。本文主要从肿瘤细胞代谢及肿瘤微环境中的代谢两方面综述肿瘤代谢在肿瘤转移中的作用及机... 详细信息

在肿瘤的发生、发展过程中,肿瘤细胞的代谢会改变为特定的谱式以适应肿瘤的快速生长。近年来的研究表明,肿瘤的代谢与肿瘤的转移也存在密切联系。本文主要从肿瘤细胞代谢及肿瘤微环境中的代谢两方面综述肿瘤代谢在肿瘤转移中的作用及机制的研究进展。

关键词：糖类氨基酸胆固醇脂肪酸肿瘤微环境肿瘤转移