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水稻早衰叶突变体es-t的遗传分析与精细定位

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科学通报 2011年第19期56卷 1539-1545页

作者：杨窑龙饶玉春刘慧娟方云霞董国军黄李超冷语佳郭龙彪张光恒胡江高振宇钱前曾大力中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室杭州310006 杭州师范大学生命与环境科学学院杭州310036

突变体es-t是经EMS诱变处理日本晴后筛选获得的,该突变体主要表现为叶片从苗期开始黄化,叶绿素含量显著降低,随着其生长发育发黄的叶片伴有铁锈色的小斑点,尤以叶尖和叶缘为甚,表现严重的早衰现象,故将之命名为es-t(early senescence-te... 详细信息

突变体es-t是经EMS诱变处理日本晴后筛选获得的,该突变体主要表现为叶片从苗期开始黄化,叶绿素含量显著降低,随着其生长发育发黄的叶片伴有铁锈色的小斑点,尤以叶尖和叶缘为甚,表现严重的早衰现象,故将之命名为es-t(early senescence-temporary).扫描电子显微镜显示,突变体叶片表面比野生型的光滑,且气孔周围缺乏硅质化突起;另外,突变体的叶绿体发育不正常,含有大量大颗粒的淀粉粒;组织切片则显示突变体的厚壁细胞及维管束的发育表现异常.遗传分析表明,es-t为新发现的早衰突变体,受一隐性基因控制,借助图位克隆的手段将之定位于42.1kb的物理区间内,为进一步克隆该基因并阐明叶片早衰的分子机制奠定基础.

关键词：水稻早衰突变体es-t 基因定位

人重组磷脂酶D_2变构体cDNA和蛋白质序列分析

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中国生物工程杂志 2003年第3期23卷 80-84页

作者：朱玲陆惠民余传星苏东辉黄伟达黄瑞福建医科大学基础免疫系福州350004 苏州大学医学院寄生虫教研室苏州215007 福建省第二人民医院呼吸内科福州350003 复旦大学生命科学院分子生化系上海200433

采用VectorNTI、DNATools等计算机分析软件及信息库 ,研究人重组磷脂酶D2 (rhPLD2 )变构体的生物学特征。rhPLD2具有多种基因结构和功能调控元件 ,其编码的蛋白质具有发挥功能所必需的活性保守基序和一定的空间结构 ,表明rhPLD2应是一... 详细信息

采用VectorNTI、DNATools等计算机分析软件及信息库 ,研究人重组磷脂酶D2 (rhPLD2 )变构体的生物学特征。rhPLD2具有多种基因结构和功能调控元件 ,其编码的蛋白质具有发挥功能所必需的活性保守基序和一定的空间结构 ,表明rhPLD2应是一种具有一定生物学功能的异质性蛋白质。

关键词：人磷脂酶D2 重组变构体基因蛋白质序列分析

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德国小蠊全基因组中微卫星分布规律

昆虫学报 2015年第10期58卷 1037-1045页

作者：王晨杜联明李鹏杨茗羽李午佼沈咏梅张修月岳碧松四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室成都610064 药用美洲大蠊四川省重点实验室成都610081

【目的】分析德国小蠊Blattella germanica全基因组中微卫星的数量和分布规律,并对外显子中含有微卫星的基因进行功能注释。【方法】使用微卫星搜索软件查找德国小蠊基因组中微卫星的数量、重复次数以及所有微卫星的位置信息,编写Pytho... 详细信息

【目的】分析德国小蠊Blattella germanica全基因组中微卫星的数量和分布规律,并对外显子中含有微卫星的基因进行功能注释。【方法】使用微卫星搜索软件查找德国小蠊基因组中微卫星的数量、重复次数以及所有微卫星的位置信息,编写Python脚本对微卫星进行定位,并通过Blast2Go和KASS程序对外显子中含有微卫星的基因进行功能注释。【结果】共找到1~6碱基重复类型的微卫星序列604 386个,总长度15 301 255 bp,约占全基因组序列(约2.04 Gb)的0.75%,分布频率为1/3.37 kb,微卫星序列的长度主要在12~60个碱基长度范围内。不同类型的微卫星中,三碱基(226 876)重复类型微卫星数量最多,占微卫星总数的37.54%;四碱基(150 355)重复类型次之,占微卫星总数的24.88%;其余依次是单碱基(141 167)、二碱基(60 877)、五碱基(21 570)和六碱基(3 541)重复类型,分别占微卫星总数的23.36%,10.07%,3.57%和0.59%。出现最多的重复拷贝类别有:ATT,AAT,A,T,AAAT,ATTT和AT,共411 789个微卫星,占微卫星总数的68.13%,这7种类别的微卫星数量均大于30 000个。共有2 372个微卫星在外显子上,它们分别位于1 481个基因上。GO功能注释结果表明,其中434条归类于细胞组分(cellular component),402条归类于分子功能(molecular function),660条归类于生物学过程(biological process)。KEGG通路分析结果表明,与新陈代谢相关的基因最多(380个),其次是与机体系统相关的(276个),与遗传信息进程相关的基因最少(92个)。【结论】本研究为进一步系统深入分析德国小蠊微卫星功能及微卫星分子标记筛选打下了基础。

关键词：德国小蠊微卫星生物信息学功能注释基因组外显子

IgE高亲和力受体β链基因多态性与湖北汉族人变应性哮喘易感性的研究

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中华医学遗传学杂志 2003年第4期20卷 307-310页

作者：崔天盆王琳谢俊刚胡丽华吴健民华中科技大学同济医学院附属协和医院免疫室武汉430022 武汉大学生命科学学院华中科技大学同济医学院附属同济医院呼吸科武汉430022

目的　探讨 Ig E高亲和力受体 β链 (high- affinity Ig E receptorβ gene,Fcε RIβ)基因启动子 - 10 9位 C/ T和编码区 Glu2 37Gly基因多态性与湖北汉族人变应性哮喘易感性及血浆总 Ig E的关系。方法　采用聚合酶链反应 -限制性片段... 详细信息

目的　探讨 Ig E高亲和力受体 β链 (high- affinity Ig E receptorβ gene,Fcε RIβ)基因启动子 - 10 9位 C/ T和编码区 Glu2 37Gly基因多态性与湖北汉族人变应性哮喘易感性及血浆总 Ig E的关系。方法　采用聚合酶链反应 -限制性片段长度多态性技术检测 FcεRIβ基因启动子区 - 10 9位和编码区Glu2 37Gly两位点多态性 ,采用病例 -对照法研究了 2 16例变应性哮喘患者和 198名对照。结果　 (1)湖北汉族人变应性哮喘患者 Fcε RIβ基因启动子区 - 10 9位 T/ T、T/ C和 C/ C基因型频率是 0 .4 0 3、0 .4 91和0 .10 6 ;与对照相比差异无显著性 (χ2 =0 .384 ,P>0 .0 5 ) ,但变应性哮喘组 T/ T基因型患者血浆总 Ig E对数值 (2 .5 39± 0 .832 5 )与 T/ C基因型的对数值 (2 .2 78± 1.0 89)和 C/ C基因型的对数值 (2 .32 3± 0 .785 2 )相比差异具有显著性。(2 )变应性哮喘患者 FcεRIβ基因 Glu2 37Gly位点 Glu/ Glu、Glu/ Gly和 Gly/ Gly基因型频率为 0 .5 79、0 .370和 0 .0 5 1,与正常对照相比差异具有显著性 (χ2 =13.6 2 ,P<0 .0 1) ,变应性哮喘患者Gly/ Gly基因型血浆总 Ig E对数值为 (2 .6 2 2± 0 .9374 ) ,与 Glu/ Glu和 Glu/ Gly相比差异具有显著性。结论　 Fcε RIβ基因启动子区 - 10 9位 T/ T?

关键词： IgE高亲和力受体β链基因多态性湖北汉族人变应性哮喘易感性

应用多色引物原位标记技术在未培养羊水细胞中同时识别18号、X和Y染色体

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中华医学遗传学杂志 2009年第4期26卷 439-442页

作者：邓莉丁显平聂涌胡誉任洪进生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院遗传医学研究所成都610064 四川省成都市妇幼保健院

目的建立多色引物原位标记（multi-primed in situ labelling）技术在未培养羊水细胞中检测染色体数目异常。方法用非双膜氧核苷酸阻断的三色引物原位标记技术对未培养羊水细胞中的18、x和Y染色体同时进行标记。结果成功地在69份未培养... 详细信息

目的建立多色引物原位标记（multi-primed in situ labelling）技术在未培养羊水细胞中检测染色体数目异常。方法用非双膜氧核苷酸阻断的三色引物原位标记技术对未培养羊水细胞中的18、x和Y染色体同时进行标记。结果成功地在69份未培养羊水细胞间期核中检测到相应的染色体信号，且结果与培养羊水细胞的染色体制备分析及其三色引物原位标记相符合，反应成功率达96％，标记率达85％。结论该研究方法提高了检测通量，快速、简便、经济可行，值得进一步研究与推广。

关键词：多色引物原位标记未培养羊水细胞染色体产前诊断

青稞HvBADH1基因的克隆及其转化烟草的初步研究

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作物学报 2008年第7期34卷 1153-1159页

作者：赵宇玮郝建国步怀宇王英娟贾敬芬西北大学生命科学学院陕西省生物技术重点实验室西部资源生物与现代生物技术教育部重点实验室陕西西安710069

应用RT-PCR结合RACE技术,从青稞总RNA中扩增得长度为1512bp的甜菜碱醛脱氢酶(BADH)基因cDNA全长编码序列。通过氨基酸同源性比对,发现该序列的推定表达产物与大麦BADH同工酶BBD2的同源性为98.4%,而与小麦、玉米和水稻等禾本科作物的BAD... 详细信息

应用RT-PCR结合RACE技术,从青稞总RNA中扩增得长度为1512bp的甜菜碱醛脱氢酶(BADH)基因cDNA全长编码序列。通过氨基酸同源性比对,发现该序列的推定表达产物与大麦BADH同工酶BBD2的同源性为98.4%,而与小麦、玉米和水稻等禾本科作物的BADH同源性分别为97.0%、84.7%和85.1%。将克隆到的青稞cDNA序列命名为HvBADH1,投递到GenBank,获得收录号EF492983。HvBADH1可以在原核表达系统TB1-pMALc2x中正常表达出分子量为54.2kD的多肽链。将HvBADH1的编码ORF,插入到添加了植物表达CaMV35S启动子和NospolyA终止子调控元件的植物表达载体pCAMBIA1301质粒相应的克隆位点中,构建了HvBADH1基因的农杆菌植物转化系统LBA4404(pCAM-ba)。进而采用农杆菌介导法,将HvBADH1基因导入烟草中,对所获得的潮霉素抗性烟草株系进行PCR、Southernblot和RT-PCR等分子生物学检测,结果表明,在得到的2个转基因株系中,HvBADH1基因已整合到受体植物基因组中,并且可以在mRNA水平上进行转录。

关键词：青稞 HvBADH1 基因克隆遗传转化耐盐性 RT-PCR RACE

组蛋白H2B单泛素化在植物生长发育和胁迫应答中的作用

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农业生物技术学报 2023年第5期31卷 1064-1073页

作者：刘善贺潘延云李君河北农业大学生命科学学院/河北省植物生理与分子病理学重点实验室省部共建华北作物改良与调控国家重点实验室

组蛋白H2B单泛素化(H2Bub1)是一种进化保守的组蛋白修饰形式，广泛存在于真核生物中，对生物体的生长发育过程至关重要。近年来，大量的研究表明H2Bub1广泛的参与了植物生长、发育及胁迫应答等生物学事件。本文主要介绍H2Bub1在种子休... 详细信息

组蛋白H2B单泛素化(H2Bub1)是一种进化保守的组蛋白修饰形式，广泛存在于真核生物中，对生物体的生长发育过程至关重要。近年来，大量的研究表明H2Bub1广泛的参与了植物生长、发育及胁迫应答等生物学事件。本文主要介绍H2Bub1在种子休眠、光形态建成、开花时间及组织器官发育等植物生长过程方面的作用；并介绍了其在植物响应生物胁迫和非生物胁迫中的生物学作用，以期为作物遗传改良提供参考。

关键词：组蛋白单泛素化修饰(H2Bub1) 表观遗传调控植物生长发育生物胁迫非生物胁迫

开放实验室实现学生和教师双赢的教学改革研究

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吉林师范大学学报（自然科学版） 2012年第1期33卷 127-129页

作者：程军郝希联王洪振刘春明李华吉林师范大学生命科学院吉林四平136000

实验教学是培养学生创新精神和实践能力的重要途径之一,实验室开放有利于调动学生的主观能动性,.对学生的创新能力和实践能力的培养起到积极的促进作用.文章探讨了高师遗传学实验室开放的内容、管理及资金来源..通过实验室开放使学生能... 详细信息

实验教学是培养学生创新精神和实践能力的重要途径之一,实验室开放有利于调动学生的主观能动性,.对学生的创新能力和实践能力的培养起到积极的促进作用.文章探讨了高师遗传学实验室开放的内容、管理及资金来源..通过实验室开放使学生能力得到了加强,使教师的教学和科研水平得到了提高,即学生和教师达到双赢.

关键词：高师遗传实验室开放

中医痰湿体质与HLA-II类基因相关性研究

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陕西中医 2007年第5期28卷 622-625页

作者：高洁吕凤娟林蒋海广州中医药大学方剂学教研室 510006 中山大学生命科学学院 510275

目的:研究中医痰湿体质与HLA-II类基因(DPB1、DRB1、DQB1)多态性的关系。方法:采用PCR-SBT(sequence-based typing)分型方法对正常体质、痰湿体质人群样本进行DPB1、DRB1、DQB1基因分型。比较组间表型频率(PF)并计算相对危险度(RR)。结... 详细信息

目的:研究中医痰湿体质与HLA-II类基因(DPB1、DRB1、DQB1)多态性的关系。方法:采用PCR-SBT(sequence-based typing)分型方法对正常体质、痰湿体质人群样本进行DPB1、DRB1、DQB1基因分型。比较组间表型频率(PF)并计算相对危险度(RR)。结果:与正常质组比较,痰湿质组DRB1*09012、DRB1*15021、DQB1*03032、DQB1*05011表型频率显著升高(P=0.002、0.04、0.0006、0.02);DRB1*11011表型频率显著降低(P=0.04)。结论:HLA基因与中医体质类型有一定关联,为中医体质的免疫遗传学研究提供依据。

关键词： HLA-Ⅱ类基因中医体质类型痰湿体质 DQB1基因分型表型频率 DRB1 相对危险度 HLA基因