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糖蛋白过敏原N-糖链与过敏的相关性研究

生物化学与生物物理进展 2024年第5期51卷 1023-1033页

作者：张瑜芯刘瑞杰张绍兴袁舒颖陈妍雯叶以琳林谦阁芦鑫荣童永亮陈力孙桂芹浙江中医药大学医学技术与信息工程学院杭州310053 嘉兴妇幼保健院检验科嘉兴314009 上海交通大学医学院附属仁济医院宁波医院宁波市杭州湾医院中心实验室宁波315336 复旦大学基础医学院病原生物学系医学分子病毒学教育部/卫生健康委员会重点实验室上海200032

糖蛋白是一种含有寡糖链的蛋白质,糖链与蛋白质之间以共价键相连。N-糖蛋白为常见过敏原之一,主要来源于食物、吸入物、昆虫毒素等,能够引起过敏反应。N-糖蛋白过敏原的N-糖链结构影响过敏原与IgE的结合,影响抗原提呈细胞(APC)对过敏原... 详细信息

糖蛋白是一种含有寡糖链的蛋白质,糖链与蛋白质之间以共价键相连。N-糖蛋白为常见过敏原之一,主要来源于食物、吸入物、昆虫毒素等,能够引起过敏反应。N-糖蛋白过敏原的N-糖链结构影响过敏原与IgE的结合,影响抗原提呈细胞(APC)对过敏原的识别和提呈。本文在介绍与过敏相关的N-糖蛋白、常见N-糖蛋白过敏原的N-糖链结构及与过敏相关的糖基化酶的基础上,进一步分析过敏原N-糖链影响过敏的机制,为临床预防与治疗过敏性疾病提供新的思路。

关键词：过敏反应 N-糖基化 N-糖链结构糖基化相关酶过敏机制

结核病控制的新挑战:出人意料的气溶胶检测新发现

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中国防痨杂志 2024年第7期46卷 739-742页

作者：李蒙高谦复旦大学基础医学院教育部、卫健委、医科院医学分子病毒学重点实验室/上海市重大传染病和生物安全研究院上海200032

气溶胶是结核分枝杆菌传播的重要媒介,存在于气溶胶和痰液中的结核分枝杆菌的特性是否相同?近期在美国科学院院刊上发表了一篇气溶胶中结核分枝杆菌特征的论文,其研究结果颠覆了已有的认知。笔者将对此研究进行介绍,并提出基于此研究的... 详细信息

气溶胶是结核分枝杆菌传播的重要媒介,存在于气溶胶和痰液中的结核分枝杆菌的特性是否相同?近期在美国科学院院刊上发表了一篇气溶胶中结核分枝杆菌特征的论文,其研究结果颠覆了已有的认知。笔者将对此研究进行介绍,并提出基于此研究的一些思考。

关键词：结核传染病控制气溶胶

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TRPML1激动剂ML-SA5对铀暴露人肾近端小管上皮细胞的促排解毒作用及机制

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中华放射医学与防护杂志 2024年第7期44卷 549-554页

作者：张洪静王睿云王毅斐张旭霞陈红红复旦大学上海医学院放射医学研究所上海200032

目的探究溶酶体Ca^(2+)通道瞬时受体电位粘脂蛋白1(TRPML1)激动剂ML-SA5通过促进溶酶体胞吐促进醋酸铀酰暴露的人肾近端小管上皮HK-2细胞内铀的排出及减轻铀致细胞损伤的作用及机制。方法将HK-2细胞分为空白对照组(Ctrl组)、ML-SA5组(M... 详细信息

目的探究溶酶体Ca^(2+)通道瞬时受体电位粘脂蛋白1(TRPML1)激动剂ML-SA5通过促进溶酶体胞吐促进醋酸铀酰暴露的人肾近端小管上皮HK-2细胞内铀的排出及减轻铀致细胞损伤的作用及机制。方法将HK-2细胞分为空白对照组(Ctrl组)、ML-SA5组(M组)、Vacuolin-1组(V组)、ML-SA5+Vacuolin-1组(M+V组)、单纯铀染毒组(U组)、铀染毒+ML-SA5组(U+M组)、铀染毒+Vacuolin-1组(U+V组)和铀染毒+ML-SA5+Vacuolin-1组(U+M+V组),分别给予0和300μmol/L醋酸铀酰暴露24 h后加入ML-SA5和/或溶酶体胞吐抑制剂Vacuolin-1作用0.5 h。采用免疫荧光法检测溶酶体相关膜蛋白-1(LAMP-1)在细胞质膜的定位情况,ICP-MS检测细胞内铀含量,免疫荧光法检测肾损伤分子1(KIM-1)蛋白表达,Calcein-AM/PI双染色法检测细胞死亡率,免疫荧光法检测转录因子EB(TFEB)的亚细胞定位、LAMP-1及TRPML1蛋白表达,采用溶酶体LysoTracker荧光探针检测溶酶体数量。结果与Ctrl组相比,U组细胞质膜定位的LAMP-1蛋白、细胞KIM-1蛋白表达、细胞死亡率明显增加(t=12.86、18.86、38.53,P<0.05),TFEB核转位、TFEB下游靶基因LAMP-1和TRPML1蛋白表达及LysoTracker探针标记的溶酶体数量明显增加(t=9.12、16.47、32.33、7.75,P<0.05);与U组相比,U+M组HK-2细胞质膜定位的LAMP-1明显增加(t=3.33,P<0.05),细胞内铀含量明显减少(t=5.01,P<0.05),细胞内KIM-1蛋白表达和细胞死亡率显著降低(t=3.81、3.24,P<0.05),这些作用均能被溶酶体胞吐抑制剂Vacuolin-1所抵消;ML-SA5还可明显提高负载铀HK-2细胞的TFEB核转位(t=9.20,P<0.05)、TFEB下游靶基因LAMP-1及TRPML1蛋白表达(t=3.05、3.17,P<0.05)以及LysoTracker标记的溶酶体数量(t=3.13,P<0.05)。结论TRPML1激动剂ML-SA5通过刺激溶酶体胞吐,促进负载铀的HK-2细胞内铀排出及降低铀致细胞损伤/死亡,与其激活TFEB上调溶酶体生物发生和TRPML1蛋白表达有关。

关键词：铀 TRPML1 ML-SA5 溶酶体胞吐 HK-2细胞

双链RNA通过激活PKR/eIF2α通路抑制恶性胶质瘤生长和迁移

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复旦学报（医学版） 2024年第3期51卷 295-305页

作者：燕群卞莎莎束敏峰复旦大学基础医学院药理学系上海200032

目的研究放疗模拟剂博来霉素(Zeocin)诱导的双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)对PKR(double-stranded RNA-dependent protein kinase)通路激活和RNA m6A相关酶的影响,从而探索其抑制恶性胶质瘤生长和迁移的分子机制。方法通过划痕实验、平板克隆形成实验、CCK8实验检测Zeocin处理后的恶性胶质瘤细胞生长和迁移情况;通过Western blot和RT-qPCR实验检测甲基修饰酶的mRNA表达水平;使用J2抗体检测Zeocin处理胶质瘤细胞后细胞内dsRNA的产生水平;利用Western blot实验检测相关甲基修饰酶的表达水平、双链RNA依赖的蛋白激酶R(double-stranded RNA-dependent protein kinase,PKR)及真核生物起始因子2α(eukaryotic initiating factor 2α,eIF2α)的磷酸化水平。结果放疗模拟剂Zeocin显著抑制恶性胶质瘤细胞的生长和迁移;Zeocin处理恶性胶质瘤细胞可产生内源的双链RNA增多;随着Zeocin浓度的增加,磷酸化的PKR与eIF2α水平均显著上升;Zeocin可以剂量依赖性下调胶质瘤细胞内总m6A水平;Zeocin可以选择性下调甲基化酶METTL14的蛋白水平;Zeocin对m6A相关酶的mRNA水平无影响。结论Zeocin可能通过下调恶性胶质瘤细胞中RNA的m6A水平,产生较多的dsRNA,进而激活PKR/eIF2α免疫调节通路,最终导致肿瘤生长抑制。

关键词：胶质瘤 m6A甲基化 RNA修饰双链RNA PKR

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卵巢黏液性癌的诊治进展

中国癌症杂志 2024年第1期34卷 90-96页

作者：李桐杨慧娟复旦大学附属肿瘤医院胸外科复旦大学遗传工程国家重点实验室复旦大学胸部肿瘤研究所复旦大学上海医学院肿瘤学系上海200032 复旦大学附属肿瘤医院妇瘤科复旦大学上海医学院肿瘤学系上海200032

卵巢黏液性癌(mucinous ovarian cancer,MOC)是卵巢上皮性癌的一种罕见病理学类型,临床上治疗多参考卵巢浆液性癌(serous ovarian cancer,SOC)的相关指南,但由于MOC的临床病理学特征和分子生物学特征与SOC显著不同,因此诊断和治疗均需... 详细信息

卵巢黏液性癌(mucinous ovarian cancer,MOC)是卵巢上皮性癌的一种罕见病理学类型,临床上治疗多参考卵巢浆液性癌(serous ovarian cancer,SOC)的相关指南,但由于MOC的临床病理学特征和分子生物学特征与SOC显著不同,因此诊断和治疗均需仔细鉴别。手术联合辅助化疗为目前治疗MOC的标准方案,但由于其患病率低,临床试验难以开展,循证医学证据缺乏,术中阑尾切除指征、术后辅助化疗方案的选择等均缺乏共识。此外,还需进一步转化靶向治疗和免疫治疗的临床前研究,以利于MOC的精准诊断及个体化治疗。

关键词：卵巢癌卵巢黏液性癌诊治进展

乙型肝炎病毒核心颗粒展示新型冠状病毒刺突蛋白B细胞线性表位及其免疫原性分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第3期44卷 234-240页

作者：陈小美袁雯婕王世杰王建荣杭小锋万延民王勇翔复旦大学上海医学院基础医学院病原生物学系教育部、卫健委、医科院医学分子病毒学重点实验室上海200032 海军军医大学长征医院感染科上海200003 复旦大学附属华山医院感染科上海市传染病与生物安全应急响应重点实验室国家传染病医学中心上海200040

目的获得展示新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)刺突蛋白B细胞线性表位的乙型肝炎病毒衣壳样颗粒(capsid-like particles,CLPs)并评价其免疫原性。方法将SARS-CoV-2的4条B细胞线性表位(M1、S1-57、S14P5和S21P2)置换乙型肝炎病毒核心蛋白(hepatitis B virus core protein,HBc)第80位丙氨酸。在大肠埃希菌BL21 Star(DE3)中诱导表达这4种线性表位和HBc的重组融合蛋白(M1-HBc、S1-57-HBc、S14P5-HBc和S21P2-HBc)。SDS-PAGE、Western blot和非变性琼脂糖凝胶电泳(native agarose gel electrophoresis,NAGE)鉴定表达产物。蔗糖密度梯度超速离心纯化CLPs并经Western blot验证其抗原性。用纯化的CLPs免疫BALB/c小鼠,通过ELISA测定血清中的抗体滴度。结果重组融合蛋白M1-HBc和S1-57-HBc自组装成M1-CLP和S1-57-CLP,S1-57-CLP免疫小鼠后靶向S1-57多肽的抗体滴度高达1∶1000000。结论在原核系统中成功表达了展示SARS-CoV-2 M1或S1-57线性表位的乙型肝炎病毒CLPs,S1-57-CLP具有良好的免疫原性,为研制SARS-CoV-2新型诊断试剂和疫苗提供了新思路。

关键词：免疫原性新型冠状病毒 B细胞线性表位衣壳样颗粒抗体

束缚应激致高脂血症ApoE^(-/-)小鼠心肌损伤的分子靶标筛选与机制分析

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法医学杂志 2024年第2期40卷 172-178页

作者：陈尚亨董盛仲王智敏洪光辉叶星林子杰林俊毅江洁清王守宇林汉成沈忆文复旦大学基础医学院法医学系上海200032

目的采用蛋白质组学技术筛选慢性束缚应激致高脂血症小鼠心肌损伤的标志物及其潜在机制。方法通过束缚ApoE-/-小鼠建立高脂血症合并慢性应激模型,运用蛋白质组学与生物信息学等技术描绘慢性应激对高脂血症小鼠心肌损伤的特征性分子改变... 详细信息

目的采用蛋白质组学技术筛选慢性束缚应激致高脂血症小鼠心肌损伤的标志物及其潜在机制。方法通过束缚ApoE-/-小鼠建立高脂血症合并慢性应激模型,运用蛋白质组学与生物信息学等技术描绘慢性应激对高脂血症小鼠心肌损伤的特征性分子改变及相关调控机制,并从中探索潜在的诊断标志物。结果蛋白质组学分析结果显示,与高脂血症组相比,高脂血症合并束缚应激组小鼠共有43个显著上调与58个显著下调的差异表达蛋白质。其中,GBP2、TAOK3、TFR1、UCP1是极具诊断潜力的分子标志物。KEGG通路富集分析结果表明,铁死亡是加剧高脂血症合并束缚应激模型心肌损伤的重要机制通路。mmu_circ_0001567/miR-7a/Tfr-1和mmu_circ_0001042/miR-7a/Tfr-1可能是该模型中与铁死亡相关的重要circRNA-miRNA-mRNA调控网络。结论慢性束缚应激可能通过铁死亡加剧高脂血症小鼠的心肌损伤,本研究筛选出4个具有潜在应用价值的心肌损伤分子诊断标志物,为高脂血症合并应激致心脏性猝死的研究提供了新的方向。

关键词：法医病理学生物信息学慢性束缚应激高脂血症铁死亡生物标志物心肌损伤小鼠

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早发性结直肠癌的诊治进展

中华胃肠外科杂志 2024年第5期27卷 441-446页

作者：李雅琪李心翔复旦大学附属肿瘤医院大肠外二科、复旦大学上海医学院肿瘤学系上海200032

近年来,早发性结直肠癌(EOCRC)的发病率持续上升,但其发病机制尚不清楚。EOCRC的临床特征和分子病理学特征不同于晚发性结直肠癌,但目前两者治疗并无差别,尚缺乏关于EOCRC针对性的筛查及诊治指南。本文总结了EOCRC患者的流行病学特点、... 详细信息

近年来,早发性结直肠癌(EOCRC)的发病率持续上升,但其发病机制尚不清楚。EOCRC的临床特征和分子病理学特征不同于晚发性结直肠癌,但目前两者治疗并无差别,尚缺乏关于EOCRC针对性的筛查及诊治指南。本文总结了EOCRC患者的流行病学特点、危险因素、临床特征、分子病理特征、发生发展机制及预防筛查策略的研究进展,以期为EOCRC的诊治提供理论依据。

关键词：结直肠肿瘤,早发性流行病学危险因素临床特征分子特征

利用单细胞测序和转录组测序建立结直肠癌免疫细胞的9基因预后模型

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中国癌症杂志 2024年第6期34卷 548-560页

作者：唐楠黄慧霞刘晓健复旦大学附属肿瘤医院肿瘤内科复旦大学上海医学院肿瘤学系上海200032 复旦大学附属肿瘤医院病理科复旦大学上海医学院肿瘤学系上海200032 复旦大学附属肿瘤医院肿瘤研究所上海200032 复旦大学病理学研究所上海200032

背景与目的:结直肠癌(colorectal carcinoma,CRC)是一种常见的恶性肿瘤,其发病率和死亡率仅次于胃癌和食管癌,在消化系统恶性肿瘤中居第二位。越来越多的证据表明,免疫细胞在CRC的发生、发展中发挥着重要作用。本研究旨在构建一个与免... 详细信息

背景与目的:结直肠癌(colorectal carcinoma,CRC)是一种常见的恶性肿瘤,其发病率和死亡率仅次于胃癌和食管癌,在消化系统恶性肿瘤中居第二位。越来越多的证据表明,免疫细胞在CRC的发生、发展中发挥着重要作用。本研究旨在构建一个与免疫细胞相关的基因的预后模型,以预测CRC患者的预后并进行精准管理。方法:从基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库和癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载结直肠癌的单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)和普通转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)数据以及临床信息,提取免疫细胞亚型的差异基因,通过Cox回归和LASSO回归分析在TCGA数据中筛选出与预后相关的基因,同时使用GSE39582和GSE41258进行外部验证。基于预后模型进行化疗药物敏感性分析、免疫治疗效果分析、风险评分相关的通路分析以及临床相关性分析。采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)和免疫组织化学检测验证模型基因在10例经术后病理学检查的新鲜冷冻结直肠癌样本和细胞系中的表达水平,样本采集均已获得复旦大学附属肿瘤医院伦理委员会的批准(伦理编号:050432-4-2108*)。结果:本研究根据scRNA-seq数据集(GSE161277)定义了16个细胞群,并通过R包celldex将这些群标记为不同的细胞类型。然后对免疫细胞亚型进行差异分析,共获得了374个差异表达基因。通过单因素Cox和LASSO回归分析,本研究在CRC中构建了一个9基因风险预后模型。该风险模型表现出对预后的可靠预测效果,对预测抗肿瘤药物敏感性、免疫治疗效果、潜在分子机制及临床特征等方面起重要作用,高风险分数的患者从免疫疗法中受益概率较低。结论:我们基于CRC肿瘤微环境中免疫细胞的异质性构建了一个包含9个基因的风险预后模型,并据此预测了CRC患者的生存和治疗效果。

关键词：结直肠癌预后模型肿瘤免疫与免疫治疗药物筛选 scRNA-seq