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发酵乳中活性益生菌三重数字PCR定量检测方法的建立

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中国乳品工业 2025年第1期53卷 73-80页

作者：赵磊刘洋凌李维柳鑫燕赵渝吴浩上海市质量监督检验技术研究院国家市场监督管理总局重点实验室(乳及乳制品检测与监控技术) 上海200233 上海师范大学生命科学学院上海200234 复旦大学人类表型组研究院复旦大学微生物组中心上海200438

益生菌发酵乳是益生菌市场发展的重要赛道,精确定量产品中活性益生菌对保障其营养功能至关重要。文章以嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)、鼠李糖乳杆菌(Lactobacillus rhamnosus)和动物双歧杆菌(Bifidobacterium animalis)为研... 详细信息

益生菌发酵乳是益生菌市场发展的重要赛道,精确定量产品中活性益生菌对保障其营养功能至关重要。文章以嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)、鼠李糖乳杆菌(Lactobacillus rhamnosus)和动物双歧杆菌(Bifidobacterium animalis)为研究对象,采用种特异性引物和探针,结合叠氮溴化丙锭(propidium monoazide,PMA)染色,基于芯片式数字PCR技术建立了发酵乳中活性益生菌的三重定量检测方法。结果表明,3组引物和探针均能特异性扩增目标菌株,无交叉反应,且20μg/mL的PMA能够有效抑制嗜酸乳杆菌、鼠李糖乳杆菌和动物双歧杆菌死菌DNA的扩增。该检测方法对嗜酸乳杆菌、鼠李糖乳杆菌和动物双歧杆菌的灵敏度分别为1.65、2.20、2.16 copies/μL,重复性检测的相对标准偏差为1.52%~8.69%,成功实现了对发酵乳中3种常见益生菌的活菌定量检测。为益生菌发酵乳中活菌检测的标准化提供了技术支持和科学依据。

关键词：发酵乳 PMA 种特异性芯片式数字PCR

体位提高颅内压联合药物治疗慢性硬膜下血肿的多中心前瞻性临床研究

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中华外科杂志 2025年第03期63卷 212-218页

作者：陈嘉宇王哲臧迪郑锐哲叶相如齐曾鑫许泽宇李志强孙成丰沈良军盛罗平徐福林叶汝勇周开宇汤伟军胡跃清施大鹏王昱泉乌锡真王莹张启麟刘飞利余果陆逸平孙一睿张宁黄锋顾夏龙张浛丁建毕永延杜昊蓝张静吉海龙丁玎张嵬吴雪海复旦大学附属华山医院神经外科国家神经疾病医学中心上海上海市奉贤区中心医院神经外科上海宁波市医疗中心李惠利医院神经外科宁波嵊州市人民医院神经外科嵊州复旦大学附属中山医院青浦分院神经外科上海上海市闵行区中心医院神经外科上海永康市第一人民医院神经外科永康台州市立医院神经外科台州复旦大学附属华山医院放射科上海复旦大学人类表型组研究院上海复旦大学数学科学学院上海宁海县第一医院神经外科宁波复旦大学附属华山医院神经内科上海复旦大学公共卫生学院生物统计学教研室上海

目的比较体位联合药物与单纯药物治疗慢性硬膜下血肿的临床效果。方法第一阶段研究为回顾性病例系列研究。回顾性收集2016年12月至2020年10月于复旦大学附属华山医院神经外科接受体位联合药物治疗的30例慢性硬膜下血肿患者的临床资料。... 详细信息

目的比较体位联合药物与单纯药物治疗慢性硬膜下血肿的临床效果。方法第一阶段研究为回顾性病例系列研究。回顾性收集2016年12月至2020年10月于复旦大学附属华山医院神经外科接受体位联合药物治疗的30例慢性硬膜下血肿患者的临床资料。男性27例, 女性3例, 年龄[M(IQR)]66(16)岁(范围:28～84岁)。其中19例为单侧血肿, 11例为双侧血肿。患者均接受体位治疗, 方法为平卧位时使用脚垫抬高下肢20～30 cm, 并通过定制的腹带进行腹部加压, 每日维持体位时间争取达到目标16～18 h。对于单侧硬膜下血肿患者, 头部偏向患侧, 避免偏向对侧;对双侧硬膜下血肿患者无头位偏侧要求。患者同时联合口服地塞米松和阿托伐他汀治疗。通过Clopper-Pearson方法分析患者的血肿改善率, 初步观察体位联合药物治疗的临床效果。然后开展二期多中心、前瞻性、随机对照研究, 采用分层区组随机化法, 将我国9个临床试验中心的慢性硬膜下血肿的患者按1∶1比例随机分配至药物治疗组(对照组)和体位联合药物治疗组(试验组), 共治疗3个月, 并随访至治疗后6个月。治疗有效定义为血肿完全吸收或血肿体积减小>10 ml, 同时Markwalder评分系统评分较治疗前改善≥1分。观察并计算3个月的治疗有效率、转手术率和6个月血肿复发率。组间比较采用配对样本t检验、Mann-WhitneyU检验、χ2检验、校正χ2检验或Fisher确切概率法。采用Logistic回归比较两组的疗效和转手术治疗率。结果回顾性研究中, 30例患者在接受治疗后13～353 d完成复查。末次复查时, 28例(93.3%)患者血肿完全吸收或显著改善(血肿体积明显减少伴随明显症状的缓解), Clopper-Pearson方法获得血肿改善率的双侧95%CI为77.9%～99.2%。多中心研究共纳入106例患者, 其中体位联合药物治疗组55例, 男性39例, 女性16例, 年龄74(17)岁(范围:26～92岁)。药物治疗组51例, 男性37例, 女性14例, 年龄69(12)岁(范围:48～84岁)。联合治疗组患者在日记卡上记录的每日体位治疗时间为(15.7±2.3)h(范围:7.6～19.3 h)。治疗第3个月时, 联合治疗组和药物治疗组的有效率分别为83.6%(46/55)和56.9%(29/51), Logistic回归结果显示, 联合治疗组疗效优于药物治疗组(OR=3.88, 95%CI:1.57～9.58, P=0.003)。联合治疗组和药物治疗组的转手术率分别为5.5%(3/55)和21.6%(11/51), Logistic回归结果显示, 药物治疗组更易转手术治疗(OR=0.21, 95%CI:0.05～0.80, P=0.023)。随访6个月时, 体位联合药物治疗组无复发, 药物治疗组的复发率为6.3%(3/48), 组间差异无统计学意义(P>0.05)。结论体位联合药物治疗慢性硬膜下血肿的效果优于单纯药物治疗。

关键词：血肿, 硬膜下, 慢性颅内压体位治疗地塞米松阿托伐他汀

基于临床血液生物标志物构建帕金森病辅助鉴别模型

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老年医学研究 2025年第01期6卷 1-7+14页

作者：韩家奇安宇孙梦鸽同济大学附属上海市东方医院南院检验科复旦大学生命科学学院复旦大学人类表型组研究院复旦大学医学遗传研究院上海中医药大学附属市中医医院检验科

目的探索临床实验室中与帕金森病（PD）相关的血液生物标志物，寻找潜在的PD血液生物标志物并构建PD辅助鉴别模型。方法回顾性收集2019年1月—2023年10月于上海市东方医院神经内科和功能神经科就诊的PD患者216例作为PD组，随机选取同... 详细信息

目的探索临床实验室中与帕金森病（PD）相关的血液生物标志物，寻找潜在的PD血液生物标志物并构建PD辅助鉴别模型。方法回顾性收集2019年1月—2023年10月于上海市东方医院神经内科和功能神经科就诊的PD患者216例作为PD组，随机选取同期性别、年龄匹配的健康体检者216例作为对照组。记录PD组和对照组的人口学特征和血液生物标志物检查结果。基于两组数据利用LASSO回归筛选PD特征生物标志物，将两组数据按照7∶3随机拆分为训练集和验证集，在训练集中利用特征生物标志物构建多因素逻辑回归模型并绘制列线图。分别对训练集和验证集作受试者工作特征（ROC）曲线分析、校正曲线和决策曲线分析（DCA）用于模型的验证和评估。结果经变量筛选和模型构建得到多因素逻辑回归模型，包含性别、天冬氨酸氨基转移酶/谷丙转氨酶比值（AST/ALT）、总胆固醇（TC）、超氧化物歧化酶（SOD）、尿酸（UA）5个变量。性别（OR=0.294,95%CI:0.134～0.643,P=0.002）、AST/ALT(OR=3.112,95%CI:1.411～6.864,P=0.005)、SOD(OR=0.933,95%CI:0.916～0.951,P生物标志物；基于血液标志物的PD辅助鉴别模型具有一定的临床参考价值。

关键词：帕金森病鉴别模型氧化应激生物标志物

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人工智能大语言模型在药物靶点发现中的应用

生命科学 2025年

作者：冯毅马小洁吴艳玲应天雷复旦大学基础医学院

药物靶点发现是现代药物研发的核心环节，然而，传统的生化筛选、组学分析等方法因难度大、成本高而应用受限。随着人工智能大语言模型的快速发展，药物靶点发现迎来了新的机遇。在药物靶点挖掘过程中，学习人类语言的自然语言模型能够... 详细信息

药物靶点发现是现代药物研发的核心环节，然而，传统的生化筛选、组学分析等方法因难度大、成本高而应用受限。随着人工智能大语言模型的快速发展，药物靶点发现迎来了新的机遇。在药物靶点挖掘过程中，学习人类语言的自然语言模型能够高效整合和全面分析文献资料，识别与疾病相关的关键生物学途径及靶点。此外，通过对生物“语言”的学习，基因组学大语言模型提升了对致病变异和基因表达的预测能力；转录组学大语言模型可系统构建基因调控网络；蛋白质组学大语言模型在蛋白质结构、功能及互作预测中展现出巨大潜力；单细胞多组学大语言模型整合不同组学技术信息。这些大语言模型为药物靶点发现提供丰富的生物学信息，加速发现具有强大潜力的候选药物靶点。本文综述了大语言模型在药物靶点发现中的最新应用，并深入探讨其面临的挑战及未来发展方向。

关键词：大语言模型药物靶点发现生物信息学

不同糖尿病药物使用对欧洲人群结直肠癌风险的影响：一组孟德尔随机化分析

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复旦学报(自然科学版) 2025年

作者：胡颖侯宪玉复旦大学生命科学学院细胞与发育生物学系

结直肠癌（CRC）是目前危害人类健康的重大疾病之一，近年来发病年龄不断降低。此外，糖尿病也呈现发病率逐年升高，发病年龄低龄化的特点。诸多研究共同表明，结直肠癌与糖尿病之间存在共同的风险因素，二者的发病治疗以及预后之间关... 详细信息

结直肠癌（CRC）是目前危害人类健康的重大疾病之一，近年来发病年龄不断降低。此外，糖尿病也呈现发病率逐年升高，发病年龄低龄化的特点。诸多研究共同表明，结直肠癌与糖尿病之间存在共同的风险因素，二者的发病治疗以及预后之间关联密切。糖尿病通常需要长期口服或注射药物来治疗，然而长期的糖尿病药物治疗对结直肠癌风险的影响尚不明晰。本研究结合双样本孟德尔随机化（MR）分析和多变量孟德尔随机化（MVMR）分析，从遗传变异角度分析了多种糖尿病药物的治疗和CRC患病风险之间的因果效应，旨在揭示糖尿病药物在CRC防治中的潜在作用。研究结果显示，在多种糖尿病药物中，胰岛素类药物的使用与CRC风险增加相关，且与其他药物处理相互独立。二甲双胍（Metformin）和格列齐特（Gliclazide）的使用与CRC风险的效应受到其他药物使用的混杂影响。罗格列酮（Rosiglitazone）使用与CRC风险无明显关联。研究结果揭示了不同药物对CRC发病风险的影响，为糖尿病的药物使用和CRC的防治提供理论支持。

关键词：结直肠癌糖尿病药物孟德尔随机化

基因检测技术在罕见病诊疗中的应用前景及挑战

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检验医学 2025年第02期40卷 105-108+104页

作者：郭玮复旦大学附属中山医院检验科

精准医学时代的到来开启了罕见病的新型诊疗模式，多组学技术的发展也促进了罕见病精准表型的研究和临床应用。基因检测技术的飞速发展更是大大提高了罕见病的诊断效率，为其后续的精准治疗提供了分子生物学基础。如何把握这个历史机遇... 详细信息

精准医学时代的到来开启了罕见病的新型诊疗模式，多组学技术的发展也促进了罕见病精准表型的研究和临床应用。基因检测技术的飞速发展更是大大提高了罕见病的诊断效率，为其后续的精准治疗提供了分子生物学基础。如何把握这个历史机遇，促进罕见病诊疗的发展，如何让基因检测技术能更高效地进入临床，造福罕见病患者及家庭，实现罕见病的早诊早治，值得关注。文章从罕见病诊疗存在的困难和基因检测技术在罕见病诊疗中的应用前景入手，重点关注应用过程中的挑战，并提出可推广的应用模式。

关键词：罕见病基因检测全外显子组测序

镍金属有机框架改性柔性纤维的制备及其多巴胺传感应用

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科学通报 2021年第32期66卷 4187-4196页

作者：赵哲孔晔黄高山陈晨陈炜梅永丰复旦大学材料科学系上海200433 复旦大学信息科学与工程学院上海200433 复旦大学人类表型组研究院上海201203

功能纤维在可穿戴电子的应用中具有巨大的应用前景.但是,由于其成本高昂,且功能层与织物基材之间的黏合力很差,易导致功能层脱落,因此功能纤维在生物医学相关领域中的使用率很低.本文提出了一种高效的新策略,利用原子层沉积制备的氧化... 详细信息

功能纤维在可穿戴电子的应用中具有巨大的应用前景.但是,由于其成本高昂,且功能层与织物基材之间的黏合力很差,易导致功能层脱落,因此功能纤维在生物医学相关领域中的使用率很低.本文提出了一种高效的新策略,利用原子层沉积制备的氧化物薄膜来诱导自组装生长镍基金属有机框架(Ni-MOF-74),从而形成功能纤维复合结构(Ni-MOF-74-CF)及其平纹布.该复合结构中,自组装功能层黏附在纤维表面,形成多孔结构,从而增加反应活性位点、提高电子传导率,进而有效提高复合结构的电化学反应效率.在实现高灵敏多巴胺检测(在1~60μmol/L的宽线性范围内灵敏度高达434μA/(mmol L^(–1)cm^(2)))的同时,该结构具有良好的抗干扰性和实时响应特性.该结构有望应用于生物医学和可穿戴电子相关领域.此外,复合结构织物还具有良好的柔性,在大幅度(高达180°弯折、最小曲率半径为~1 mm)和多次(高达100次)形变下,其电化学传感性能依然保持稳定.

关键词：原子层沉积金属有机框架可穿戴电子多巴胺传感

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古代强直性脊柱炎的诊断标准及国内研究回顾

人类学学报 2023年第3期42卷 422-434页

作者：王邦彦王久存文少卿复旦大学人类表型组研究院上海201203 复旦大学科技考古研究院上海200433

强直性脊柱炎是一种主要累及中轴骨的风湿性疾病,骶髂关节炎是其主要诊断标准。基于古病理学在诊断强直性脊柱炎方面存在的误诊和漏诊情况,本文检索出我国已公开发表的、全新世以来的128个古代强直性脊柱炎病例,结合临床医学、医学影像... 详细信息

强直性脊柱炎是一种主要累及中轴骨的风湿性疾病,骶髂关节炎是其主要诊断标准。基于古病理学在诊断强直性脊柱炎方面存在的误诊和漏诊情况,本文检索出我国已公开发表的、全新世以来的128个古代强直性脊柱炎病例,结合临床医学、医学影像学研究的最新进展,提出了新的诊断强直性脊柱炎古病理学标准以及观察记录要点,并详细总结了与其他容易混淆疾病的区别方法。根据本文的标准,只有25.8%的个体可以明确诊断为强直性脊柱炎。本文旨在推动强直性脊柱炎相关古病理学研究的规范化和标准化,这对于研究强直性脊柱炎的发展和演变历程具有重要的意义。

关键词：生物人类学强直性脊柱炎古病理

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基于异丁酯化的脂肪酸GC-FID/MS定量分析研究

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上海交通大学学报（医学版） 2020年第1期40卷 22-29页

作者：干渺妍谢晖唐惠儒复旦大学生命科学学院上海200433 复旦大学人类表型组研究院上海201203

目的·探究生理病理状态下脂肪酸的种类及含量变化,建立该类代谢物的定量分析技术。方法·基于(-)-氯甲酸薄荷酯与异丁醇作为衍生化试剂的脂肪酸异丁酯化方法,采用气相色谱-氢火焰离子化检测器/质谱联用技术(gas chromatography-flame i... 详细信息

目的·探究生理病理状态下脂肪酸的种类及含量变化,建立该类代谢物的定量分析技术。方法·基于(-)-氯甲酸薄荷酯与异丁醇作为衍生化试剂的脂肪酸异丁酯化方法,采用气相色谱-氢火焰离子化检测器/质谱联用技术(gas chromatography-flame ionization detector/mass spectrometry,GC-FID/MS)对27种代表性脂肪酸进行定性定量分析。通过测量检测限、定量限、日内和日间相对标准偏差检验方法的灵敏度及稳定性。同时,将该方法应用于4类典型生物样本(人类血清、尿液、粪便及大鼠肝脏),以验证其在不同基质中的普适性。结果·27种脂肪酸的异丁酯可在HP-5MS色谱柱上实现分离,在2~3个数量级范围内线性良好(R2>0.99)且具有优异的灵敏度(检测限为柱上0.03~2.96 pmol,定量限为0.09~9.86 pmol)。方法学验证结果显示,该方法在高、中、低3个浓度范围内的日内及日间相对标准偏差均小于10%。在4类典型生物样本中,该方法分别检测并定量出10、7、14、9种脂肪酸。结论·建立了基于异丁酯化并能够对水溶液中的短、中、长链脂肪酸(C1~C24)同步定量的分析方法。该方法的条件温和、灵敏度高且稳定性好,操作简便快捷,可直接用于血清、尿液、粪便及肝脏等多种生物样本的检测,其或将为高通量代谢组分析提供新的思路。

关键词：脂肪酸异丁酯化代谢组学气相色谱-氢火焰离子化检测器/质谱联用技术