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上海地区地中海贫血基因突变类型的研究

中华医学遗传学杂志 2024年第4期41卷 385-392页

作者：顾燕英吴蓓颖陆一一顾鸣敏林佳菲上海交通大学医学院附属瑞金医院检验科上海200025 上海交通大学基础医学院基础医学实验教学中心上海200025

目的检测上海地区疑似地中海贫血(简称"地贫")患者珠蛋白基因的序列变化,分析常见及罕见地贫突变类型及频率,为遗传咨询提供参考。方法以2016年6月至2019年12月间在上海交通大学医学院附属瑞金医院儿科、血液科和妇产科就诊的4644例疑... 详细信息

目的检测上海地区疑似地中海贫血(简称"地贫")患者珠蛋白基因的序列变化,分析常见及罕见地贫突变类型及频率,为遗传咨询提供参考。方法以2016年6月至2019年12月间在上海交通大学医学院附属瑞金医院儿科、血液科和妇产科就诊的4644例疑似为地贫的患者作为研究对象。采用跨越断裂点聚合酶链反应(Gap-PCR)和反向斑点杂交法(RDB)对患者进行常见地贫基因检测。对血液型表型与常见地贫基因检测不符、疑似携带罕见突变的样本,采用Gap-PCR及Sanger测序法进行检测。结果在4644例标本中,共检出常见地贫基因突变2194例(47.24%),包括α-地贫701例(15.09%),β-地贫1448例(31.18%),α-复合β-地贫45例(0.97%)。检出罕见珠蛋白基因突变46例,包括α-珠蛋白基因突变17例,β-珠蛋白基因突变29例,其中α-珠蛋白基因突变CD77(CCC>ACC)(HBA2:c.232C>A),β-珠蛋白基因突变NG_000007.3:g.70567_71015del449、Codon102(-A)(HBB:c.308_308delA)和IVS-Ⅱ-636(A>G)(HBB:c.316-215A>G)为新发现的基因突变类型。结论上述研究中上海地区常见地贫基因的检出率为47.24%,检出罕见突变46例,地贫基因突变类型多样,可为更准确的基因诊断及遗传咨询提供参考。

关键词：地中海贫血实验室检测基因突变罕见型

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PRMT6促进乳腺癌细胞的增殖和迁移

上海交通大学学报（医学版） 2024年第8期44卷 999-1010页

作者：韩依杉徐梓淇陶梦玉范广建余波上海交通大学医学院附属第一人民医院肿瘤中心上海201600 复旦大学附属肿瘤医院肿瘤内科上海200032 复旦大学上海医学院肿瘤学系上海200032

目的·研究蛋白质精氨酸甲基转移酶6 (protein arginine methyltransferase 6,PRMT6)在乳腺癌中的表达及其对乳腺癌细胞增殖和迁移能力的影响。方法·通过R语言分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中PRMT6mRNA在多... 详细信息

目的·研究蛋白质精氨酸甲基转移酶6 (protein arginine methyltransferase 6,PRMT6)在乳腺癌中的表达及其对乳腺癌细胞增殖和迁移能力的影响。方法·通过R语言分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中PRMT6mRNA在多种癌症中的表达情况。采用基因表达谱交互分析(GeneExpressionProfilingInteractive Analysis,GEPIA2)在线数据库分析PRMT6在正常乳腺组织和乳腺癌组织中的表达差异。利用人类蛋白质图谱(The Human Protein Atlas,HPA)数据库获得人正常乳腺组织和乳腺癌组织的免疫组织化学数据,分析PRMT6的蛋白表达情况。使用免疫组织化学法(immunohistochemistry,IHC)检测27例乳腺癌组织及配对癌旁组织中PRMT6的表达。通过小干扰RNA (small interfering RNA,siRNA)转染技术在MDA-MB-231和MCF-7细胞系中敲低PRMT6,实时荧光定量PCR (quantitative realtime PCR,qRT-PCR)及Western blotting在转录和蛋白水平验证PRMT6的敲低效率。通过细胞计数试剂盒8 (cell counting kit-8,CCK-8)、克隆形成实验探究PRMT6对乳腺癌细胞增殖能力的影响。通过细胞划痕实验和Transwell实验探究PRMT6对乳腺癌细胞迁移能力的影响。利用基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中GSE210948数据集的转录组测序数据分析对照组和PRMT6低表达组的差异基因,并进行京都基因与基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。使用流式细胞术进行细胞周期分析。采用Western blotting技术检测增殖和迁移相关靶蛋白细胞周期蛋白D1 (cyclin D1)、E-钙黏蛋白(E-cadherin)、N-钙黏蛋白(N-cadherin)和波形蛋白(Vimentin)的表达。结果·生物信息学相关分析显示,PRMT6在乳腺癌组织中的表达高于正常乳腺组织(P=0.000)。IHC结果显示,PRMT6在乳腺癌组织中的表达显著高于配对癌旁组织(P=0.001)。qRT-PCR及Western blotting验证MDA-MB-231和MCF-7细胞系中PRMT6的mRNA及蛋白质表达水平,发现与对照组相比,siRNA (siPRMT6#1、siPRMT6#2)显著降低两种细胞中PRMT6mRNA (P=0.006, P=0.004;P=0.001, P=0.043)和蛋白(P=0.035, P=0.001;P=0.003, P=0.002)的表达水平。敲低PRMT6显著降低MDA-MB-231和MCF-7细胞的增殖(P=0.014,P=0.000;P=0.003,P=0.003)和迁移能力(P=0.000,P=0.000;P=0.000,P=0.002)。KEGG通路富集分析显示,PRMT6的表达影响细胞周期通路。Western blotting结果显示,敲低PRMT6后,与细胞周期通路相关的cyclin D1蛋白水平下降(P=0.021,P=0.000;P=0.034,P=0.014);qRT-PCR结果显示,敲低PRMT6后,cyclin D1转录水平明显下降(P=0.036,P=0.001;P=0.044,P=0.000)。流式细胞术结果显示,敲低PRMT6后,G0/G1期细胞增加(P=0.000;P=0.003), G2/M期细胞减少。下调PRMT6表达后,与细胞迁移相关的Ecadherin表达增加(P=0.002, P=0.012;P=0.043, P=0.003), N-cadherin (P=0.004, P=0.041;P=0.032, P=0.034)和Vimentin (P=0.028,P=0.005;P=0.024,P=0.001)的蛋白表达减少。结论·PRMT6在乳腺癌组织中表达升高,可促进乳腺癌的增殖和迁移。

关键词：乳腺癌蛋白质精氨酸甲基转移酶6 增殖迁移细胞周期

泛素-蛋白酶体系统、自噬-溶酶体系统与代谢性疾病

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生命的化学 2024年第5期44卷 780-785页

作者：宋幸奇邱燕燕上海交通大学医学院基础医学实验教学中心上海200025

泛素-蛋白酶系统(ubiquitin-protease system,UPS)和自噬-溶酶体系统(autophagy-lysosomal system,ALS)是两种清理系统,负责清除功能失调/错误折叠的蛋白质,从而充当真核细胞中蛋白质稳态的关键调节因子。代谢性疾病是全球性的健康挑战... 详细信息

泛素-蛋白酶系统(ubiquitin-protease system,UPS)和自噬-溶酶体系统(autophagy-lysosomal system,ALS)是两种清理系统,负责清除功能失调/错误折叠的蛋白质,从而充当真核细胞中蛋白质稳态的关键调节因子。代谢性疾病是全球性的健康挑战,研究其病理生理机制是从根本上解决该类疾病的关键。在代谢性疾病中,由于UPS、ALS功能障碍而导致蛋白质稳态丧失,从而引起受损蛋白质过分累积是引起机体代谢功能障碍的重要原因之一。因此,本文重点阐述了UPS和ALS的基本过程及两者相互调控的机制,为开发新的药物作用靶点及研发新药物开辟新的途径。

关键词：泛素-蛋白酶体系统自噬-溶酶体系统代谢性疾病胰岛素抵抗 2型糖尿病

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西医院校中西医结合基础概论教学改革

中国中医药现代远程教育 2024年第17期22卷 187-190页

作者：俞瑾马淑兰毛应启梁冯异褚玉霞王彦青朱粹青复旦大学上海医学院基础医学院中西医结合学系上海200032 复旦大学上海医学院实验教学中心上海200032 复旦大学上海医学院脑科学研究院脑功能与脑疾病全国重点实验室上海200032

给西医院校的在校学生讲授中西医结合基础概论课程对于教师来说是一个巨大的挑战。西医院校的学生没有任何中医背景,如何在短短的几十个课时里让西医学生了解中西医结合学,尤其是中西医结合基础研究的意义和相关内容是一个值得攻克的难... 详细信息

给西医院校的在校学生讲授中西医结合基础概论课程对于教师来说是一个巨大的挑战。西医院校的学生没有任何中医背景,如何在短短的几十个课时里让西医学生了解中西医结合学,尤其是中西医结合基础研究的意义和相关内容是一个值得攻克的难题。经过这些年的不断摸索,目前课程的思政建设、教学形式和考核形式的改革,取得了一定的成果,对丰富课堂教学形式、增强学生对中西医结合学的热爱、培养学生的自主学习能力、提高课程的教学效果都具有显著的推进作用,并且引领了更多的西医学生关注及投身到中西医结合事业中来,深刻体现了课程设置的初心和目的。

关键词：中西医结合基础概论教学改革思政建设

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基于微流控芯片的循环肿瘤细胞检测系统研究

中国医疗器械杂志 2024年第3期48卷 277-280页

作者：邸元帅罗吉高大地杨皓文复旦大学附属肿瘤医院放射治疗中心复旦大学上海医学院肿瘤学系上海市200032

目的实现人体外周血液中循环肿瘤细胞(circulating tumor cells,CTCs)的高通量、高检出率的分选富集与检测,为癌症患者提供高效、精准的早期筛查。方法设计一款分选富集与检测集成化的微流控芯片,采用荧光检测系统进行单细胞水平的CTCs... 详细信息

目的实现人体外周血液中循环肿瘤细胞(circulating tumor cells,CTCs)的高通量、高检出率的分选富集与检测,为癌症患者提供高效、精准的早期筛查。方法设计一款分选富集与检测集成化的微流控芯片,采用荧光检测系统进行单细胞水平的CTCs检测,得到样本中的CTCs数量。结果使用裂解红细胞后的外周血液样本进行6次实验,在进样速度达到0.2 mL/h时,CTCs能够达到78.6%的最佳检测率,组内相关系数达到0.8以上。结论CTCs检测系统能够实现较高的检出率并具有良好的可靠性,可以为相关领域的临床研究提供可靠的参考。

关键词：微流控芯片循环肿瘤细胞分选富集荧光检测早期筛查

基于深度学习算法的病理学图片淋巴细胞浸润检测

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中国癌症杂志 2024年第4期34卷 409-417页

作者：庄晗胡伟刚章真王佳舟复旦大学附属肿瘤医院放射治疗中心复旦大学上海医学院肿瘤学系上海市放射肿瘤学重点实验室上海市放射治疗临床医学研究中心上海200023

背景与目的:深度学习方法可用来在病理切片上开展淋巴细胞的自动分割和检测。本研究探讨使用变分自编码模型预训练的方法对病理学图片进行淋巴细胞浸润检测的性能,以及去除肿瘤坏死区域对模型性能的影响。方法:使用变分自编码模型(varia... 详细信息

背景与目的:深度学习方法可用来在病理切片上开展淋巴细胞的自动分割和检测。本研究探讨使用变分自编码模型预训练的方法对病理学图片进行淋巴细胞浸润检测的性能,以及去除肿瘤坏死区域对模型性能的影响。方法:使用变分自编码模型(variational auto-encoder,VAE)先在来自肿瘤基因组图谱(the Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库中的无标注的TCGA-COAD和TCGA-READ病理切片图像上进行预训练,获得一个自编码预训练模型,再在已标注淋巴细胞的公开数据集上进行淋巴细胞浸润检测的模型训练。为避免与坏死的区域相混淆,还训练了分割肿瘤坏死区域的Unet模型,以去除肿瘤坏死区域对淋巴细胞识别的影响。分析经过变分自编码模型预训练的淋巴细胞浸润检测模型在训练集和测试集上的受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)的曲线下面积(area under curve,AUC)及其95%置信区间(confidence interval,CI)。结果:检测模型在训练集上AUC为0.979(95%CI:0.978~0.980),准确率为92.5%(95%CI:92.3%~92.6%),Kappa值为0.849,灵敏度为0.908,特异度为0.941,精确率为0.939,召回率为0.908,F1为0.923。验证集的AUC为0.968(95%CI:0.964~0.972),准确率为91.3%(95%CI:90.6%~92.0%),Kappa值为0.826,灵敏度为0.898,特异度为0.928,精确率为0.925,召回率为0.898,F1为0.912。Resnet18模型在已标注的数据集上直接训练的结果为:验证集的准确率为83.2%(95%CI:82.2%~84.1%),Kappa值为0.664,灵敏度为0.823,特异度为0.840,精确率为0.838,召回率为0.823,F1为0.830。分割肿瘤坏死区域的Unet模型最终在训练集上的DICE值为0.78,在验证集上为0.76。去除坏死区域后本文提出的变分自编码模型预训练的淋巴细胞浸润检测模型的预测性能获得了一定的提升,在验证集上的AUC从0.968(95%CI:0.964~0.972)提升至0.971(95%CI:0.968~0.975)。准确率为92.4%(95%CI:91.7%~93.0%),Kappa值为0.849,灵敏度为0.928,特异度为0.921,精确率为0.921,召回率为0.928,F1为0.925。结论:采用变分自编码模型预训练的方法,对淋巴细胞浸润的病理学图片进行浸润检测,可获得比直接训练更优的模型表现;并且通过Unet去除肿瘤坏死区域的影响能够进一步提高模型的性能。

关键词：淋巴细胞浸润人工智能深度学习

基于沟通模型的晚期癌症患者病情告知策略的构建研究

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中国实用护理杂志 2024年第13期40卷 1000-1008页

作者：刘雨童陆箴琦张晓菊黄喆复旦大学附属肿瘤医院护理部、复旦大学上海医学院肿瘤学系上海200032 复旦大学附属肿瘤医院姑息治疗科上海200032

目的基于两种国内外广泛使用的沟通模型构建晚期癌症患者病情告知策略及实施方法,以减轻临床病情告知难度。方法于2022年1—10月,以六步癌症告知模型、共情沟通模型为理论基础,结合文献分析法、质性访谈和专家论证会构建晚期癌症患者病... 详细信息

目的基于两种国内外广泛使用的沟通模型构建晚期癌症患者病情告知策略及实施方法,以减轻临床病情告知难度。方法于2022年1—10月,以六步癌症告知模型、共情沟通模型为理论基础,结合文献分析法、质性访谈和专家论证会构建晚期癌症患者病情告知策略条目。结果文献分析共纳入18篇文献。质性访谈共访谈20名受访者(包括4名医生、11名护士和5例患者),男6名,女14名,年龄(35.94±8.03)岁。专家论证会共有8名专家参与论证,男2名,女6名,年龄(41.88±6.58)岁。最终构建出符合我国临床实践的晚期癌症患者病情告知策略的具体条目及话术,共构建包括沟通前准备、常规沟通策略和沟通不畅的处置策略3条一级条目,16条二级条目,53条三级条目。条目重要性评分4.50~5.00分,条目变异系数为0~0.12。结论基于沟通模型构建的晚期癌症患者病情告知沟通策略具有科学性、可行性,可以作为告知晚期癌症患者病情的工具。

关键词：策略,实验性晚期癌症安宁疗护医患沟通策略构建

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分子医学综合实验课程数字化转型的探讨

基础医学教育 2024年第4期26卷 330-334页

作者：孙筱钟山朱玉平海军军医大学基础医学院基础医学实验教学中心上海200433

分子医学综合实验是一门涵盖了免疫学、生物化学、分子生物学、细胞生物学、遗传学等基础实验技能的综合实验课程。分子医学综合实验课程的数字化转型,对丰富医学实验课程的教学模式,提高教学质量,促进学生自主学习以及培养医学学生的... 详细信息

分子医学综合实验是一门涵盖了免疫学、生物化学、分子生物学、细胞生物学、遗传学等基础实验技能的综合实验课程。分子医学综合实验课程的数字化转型,对丰富医学实验课程的教学模式,提高教学质量,促进学生自主学习以及培养医学学生的科研能力和创新性能力具有重要的意义。在当前医学教育改革的背景下,医科大学的教师需经历一个以教师为中心向以学生为中心的范式转变,即以学生学习的预期结果为导向,让学生参与教学过程,更加注重学生学习能力的培养,而非知识的单向灌输。以学生为中心的分子医学综合实验数字化转型,提高了学生学习的主动性,提升了教学质量,对培养适应新时代发展的医学和科研人才具有重要作用。

关键词：分子医学综合实验实验教学教学改革数字化转型混合式教学

基于PBL教学法与实验对照组设计相结合的实验教学探索

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基础医学教育 2024年第1期26卷 35-40页

作者：钟山邱丽娟巢雯孙筱卢占英林晓平朱玉平海军军医大学基础部基础医学实验教学中心上海200433

通过结合问题导向学习(PBL)教学法与实验对照组设计,探索了其在分子医学综合实验课程中的应用效果。研究对象为临床八年制医学生。教师通过将传统教学与PBL结合的教学模式,强调学生的主动学习和团队合作,以实验对照组设计为载体,加深学... 详细信息

通过结合问题导向学习(PBL)教学法与实验对照组设计,探索了其在分子医学综合实验课程中的应用效果。研究对象为临床八年制医学生。教师通过将传统教学与PBL结合的教学模式,强调学生的主动学习和团队合作,以实验对照组设计为载体,加深学生对实验原理的理解和应用。实验结果显示,采用PBL结合实验对照组设计的教学方法相较于传统教学方法显著提高了学生的实验设计能力、实验操作技能及科研思维能力,同时增强学生的批判性思维和团队合作精神。学生满意度调查显示,多数学生对新教学模式表示认可和满意。因此,PBL结合实验对照组设计的教学法在分子医学实验教学中具有积极的应用前景。

关键词：分子医学综合实验实验教学教学改革问题导向学习(PBL) 实验对照组设计科研能力培养