检索结果-南通市图书馆

SARS冠状病毒基因组、蛋白质与侵入宿主细胞过程的研究近况

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中华医学杂志 2003年第11期83卷 913-921页

作者：芮伟张其鹏石磊卢铭北京大学医学部医学生物信息组 100083

世界卫生组织（WHO）在今年3月12日发出关于非典型肺炎（atypical pneumonia）的全球性警告之后，经过WHO的组织协调，于3月17日成立了不念旧恶由全球10个国家和地区11个预级实验室组成的合作研究网络。中国的两上实验室（中国疾病预防... 详细信息

世界卫生组织（WHO）在今年3月12日发出关于非典型肺炎（atypical pneumonia）的全球性警告之后，经过WHO的组织协调，于3月17日成立了不念旧恶由全球10个国家和地区11个预级实验室组成的合作研究网络。中国的两上实验室（中国疾病预防控制中心病毒研究所和广东省疾病预防控制中心）于3月28日加入该研究网络。该网络启动后，围绕着严重急性呼吸综合征（severe acute respiratory syndrome，SARS）的各方面研究工作迅速展开，取得了一系列速度惊人的进展。香港大学3月22日最先宣布分离出了引起SARS的一种未知冠状病毒。

关键词： SARS冠状病毒基因组蛋白质宿主细胞研究近况非典型肺炎传染病

基于Web服务的流感病毒基因组自动化翻译注释系统

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

病毒学报 2021年第2期37卷 309-317页

作者：陈翠霞杨磊蒋太交王小龙曹宗富李天君于磊高华方马旭国家卫生健康委科学技术研究所人类遗传资源中心北京100081 国家人类遗传资源中心生物信息组北京102206 国家流感中心生物信息组北京100055 中国科学院生物物理研究所蛋白质多肽重点实验室北京100101 中国科学院空天信息创新研究院七室北京100100

随着流感病毒基因组测序数据的急剧增加,深入挖掘流感病毒基因组大数据蕴含的生物学信息成为研究热点。基于中国流感病毒流行特征数据,建设一个集自动化、一体化和信息化的序列库系统,对于实现流感病毒基因组批量快速翻译、注释、存储... 详细信息

随着流感病毒基因组测序数据的急剧增加,深入挖掘流感病毒基因组大数据蕴含的生物学信息成为研究热点。基于中国流感病毒流行特征数据,建设一个集自动化、一体化和信息化的序列库系统,对于实现流感病毒基因组批量快速翻译、注释、存储、查询、分析具有重要的应用价值。本课题组通过集成一系列软件和工具包,并结合自主研发的其他功能,在底层维护的2个关键的参考数据集基础上另外追加了翻译注释信息最佳匹配的精细化筛选规则,构建具有流感病毒基因组信息存储、自动化翻译、蛋白序列精准注释、同源序列比对和进化树分析等功能的自动化系统。结果显示,通过Web端输入fasta格式的流感病毒基因序列,本系统可针对参考序列片段数据集(***)进行Blast同源性检索,可以鉴定流感病毒的型别(A、B或C)、亚型和基因片段(1~8片段);在此基础上,通过查询数据库底层用于翻译、注释的基因片段参考数据集,可以获得一组肽段数据集,然后通过循环调用ProSplign软件对其进行预测。结合精细化的筛选准入规则,选出与输入序列匹配最好的翻译后产物,作为该输入序列的预测蛋白,输出为gbk,asn和fasta等通用格式的文件,给出序列长度、是否全长、病毒型别、亚型、片段等信息。基于以上工作,另外自主研发了系统其他的附加功能如进化树分析展示、基因组数据存储等功能,构建成基于Web服务的流感病毒基因组自动化翻译注释系统。本研究提示,系统高度集成系列软件以及自有的注释翻译数据库文件,实现从序列存储、翻译、注释到序列分析和展示的功能,可全面满足我国高通量基因检测数据共享化、本土化、一体化、自动化的需求。

关键词：流感病毒关键数据集翻译注释一体化序列库

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

SARS冠状病毒基因组初步分析

北京大学学报（医学版） 2003年第B5期35卷 128-129页

作者：张其鹏石磊芮伟卢铭国强华景霞尚彤北京大学医学部医学生物信息组北京100083

世界卫生组织(WHO)在今年3月12日发出关于非典型肺炎(atypica l pneumonia)的全球性警告 ,经过WHO的组织协调,3月17日成立了一个全球性的合作研究网络,由10个国家和地区的11个顶级实验室组成[1].中国疾病预防控制中心病毒研究所和广东... 详细信息

世界卫生组织(WHO)在今年3月12日发出关于非典型肺炎(atypica l pneumonia)的全球性警告 ,经过WHO的组织协调,3月17日成立了一个全球性的合作研究网络,由10个国家和地区的11个顶级实验室组成[1].中国疾病预防控制中心病毒研究所和广东省疾病预防控制中心也于3月28日加入该研究网络[2].该网络启动后,取得了一系列的进展.香港大学最先于 3月22日宣布分离出了引起SARS的一种未知冠状病毒[3].

关键词： SARS 冠状病毒基因组生物信息学突变序列分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

三维基因组数据分析方法进展

生物化学与生物物理进展 2018年第11期45卷 1093-1105页

作者：张祥林方欢汪小我清华大学自动化系合成与系统生物学研究中心生物信息学教育部重点实验室北京信息科学与技术国家研究中心生物信息学研究部北京100084

对染色质三维结构的探究逐渐成为了解基因组功能与基因调控关系的必要手段.近年来,随着高通量染色体构象捕获(Hi-C)等技术的发展和高通量测序成本的降低,全基因组交互作用的数据量快速增长,交互作用图谱分辨率不断提高.这给三维基因组... 详细信息

对染色质三维结构的探究逐渐成为了解基因组功能与基因调控关系的必要手段.近年来,随着高通量染色体构象捕获(Hi-C)等技术的发展和高通量测序成本的降低,全基因组交互作用的数据量快速增长,交互作用图谱分辨率不断提高.这给三维基因组学发展带来机遇的同时,也给计算建模带来了挑战.当前,三维基因组数据的分析方法覆盖面广,包括了数据前期处理、标准化、可视化、特征提取、三维建模等环节,但是如何从中选择高效、准确的方法却成为制约研究者们开展研究的一项关键因素.本文根据这些方法的适用场景、原理及特点进行系统地归纳,并重点关注了针对新技术或新需求的分析方法,以期促进这一领域中信息学方法的应用和开发,助力三维基因组学的研究.

关键词： Hi-C 三维基因组学基因组结构生物信息学

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基于细胞—计算机交互的细胞控制方法

自动化学报 2021年第3期47卷 489-500页

作者：颜钱明张鹏程乔榕古槿汪小我清华大学自动化系合成与系统生物学研究中心生物信息学教育部重点实验室北京100084 北京信息科学与技术国家研究中心生物信息学研究部北京100084

Wiener在控制论(Cybernetics)中强调了两大类控制对象:机器与动物.半个世纪以来,机器控制领域已形成一套较为完备且先进的控制理论,而在生物控制方面,由于生物系统的特殊性和复杂性,对生命的基本组成单位—细胞的控制仍然进展缓慢.近年... 详细信息

Wiener在控制论(Cybernetics)中强调了两大类控制对象:机器与动物.半个世纪以来,机器控制领域已形成一套较为完备且先进的控制理论,而在生物控制方面,由于生物系统的特殊性和复杂性,对生命的基本组成单位—细胞的控制仍然进展缓慢.近年来,随着合成生物学技术的发展,基于细胞—计算机交互的胞外控制手段开始引起研究者们的关注,为细胞控制带来了前所未有的机遇.胞机交互的方式能够适应生物系统的特殊性,发挥计算机控制的优势,实现细胞的自动化实时控制,为人类研究细胞内部基因调控机制与其他各项生命活动提供了大量的数据与方法支持.本文根据目前基于胞机交互的细胞控制工作,归纳与总结了胞机交互中常用的生物学工具以及控制算法,分析了细胞控制的特殊性与难点,指出研究实现细胞智能控制的可行性与重要性.

关键词：胞机交互反馈控制合成生物学人工生物系统光遗传学

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

数据驱动的公共卫生安全

科学通报 2024年第9期69卷 1156-1163页

作者：李翠萍吴林寰舒畅鲍一明马俊才宋述慧中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心) 国家基因组科学数据中心北京100101 中国科学院微生物研究所国家微生物科学数据中心北京100101 中国科学院大学北京100049 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心) 基因组科学与信息重点实验室北京100101 中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心北京100101 中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室北京100101

在现代社会中,数据已成为重要的生产要素和国家基础性战略资源,是维护国家生物安全与社会稳定的利器[1].正确处理和利用数据,有助于我们及时、快速、有效地发现和解决问题,进一步维护社会的和谐稳定发展.在公共卫生安全领域,公共卫生安... 详细信息

在现代社会中,数据已成为重要的生产要素和国家基础性战略资源,是维护国家生物安全与社会稳定的利器[1].正确处理和利用数据,有助于我们及时、快速、有效地发现和解决问题,进一步维护社会的和谐稳定发展.在公共卫生安全领域,公共卫生安全事件成为21世纪人类生存面临的非传统安全威胁之一,特别是新发再发传染病对全球公共卫生和社会经济安全构成严重威胁[2,3].

关键词：公共卫生安全数据驱动非传统安全威胁全球公共卫生和谐稳定发展传染病 21世纪基础性

中国流感疫苗预防接种技术指南(2019-2020)

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中华流行病学杂志 2019年第11期40卷 1333-1349页

作者：无冯录召彭质斌王大燕国家免疫规划技术工作组流感疫苗工作组不详

流行性感冒(流感)是由流感病毒引起的一种急性呼吸道传染病,严重危害人群健康.流感病毒其抗原性易变,传播迅速,每年可引起季节性流行,在学校、托幼机构和养老院等人群聚集的场所可发生暴发疫情.每年流感季节性流行在全球可导致300万~50... 详细信息

流行性感冒(流感)是由流感病毒引起的一种急性呼吸道传染病,严重危害人群健康.流感病毒其抗原性易变,传播迅速,每年可引起季节性流行,在学校、托幼机构和养老院等人群聚集的场所可发生暴发疫情.每年流感季节性流行在全球可导致300万~500万重症病例,29万~65万呼吸道疾病相关死亡.孕妇、婴幼儿、老年人和慢性基础疾病患者等高危人群,患流感后出现严重疾病和死亡的风险较高.接种流感疫苗是预防流感病毒感染及其严重并发症的最有效手段.我国现已批准上市的流感疫苗有三价灭活流感疫苗(IIV3)和四价灭活流感疫苗(IIV4),IIV3包括裂解疫苗和亚单位疫苗,IIV4为裂解疫苗.除个别地区外,流感疫苗在我国大多数地区属于第二类疫苗,实行自愿、自费接种.2018年,中国疾病预防控制中心印发了《中国流感疫苗预防接种技术指南(2018-2019)》(2018年版指南).一年来,新的研究证据在国内外发表,新的疫苗产品在我国上市.为更好的指导我国流感预防控制和疫苗应用工作,国家免疫规划技术工作组流感疫苗工作组综合国内外最新研究进展,在2018年版指南的基础上进行了更新和修订,形成了《中国流感疫苗预防接种技术指南(2019-2020)》.本指南更新的内容主要包括以下几个方面:第一,增加了新的研究证据,尤其是我国的研究结果,包括流感疾病负担、疫苗效果、接种疫苗可避免的疾病负担、疫苗安全性监测、疫苗预防接种成本效果等;第二,增加了一年来国家卫生健康委员会流感防控有关政策和措施;第三,更新了我国2019-2020年度国内批准上市及批签发的流感疫苗种类;第四,更新了本年度IIV3和IIV4疫苗组份.本指南建议:原则上,接种服务单位应为≥6月龄所有愿意接种流感疫苗且无禁忌证的人提供接种服务.对可接种不同类型、厂家疫苗产品的人群,可由受种者自愿选择接种任一种流感疫苗,无优先推荐.为降低高危人群罹患流感及感染后发生严重临床结局的风险,指南推荐6月龄至59月龄儿童、≥60岁老年人、慢性病患者、医务人员、流感季节怀孕的女性为优先接种对象.首次接种流感疫苗的6月龄至8岁儿童应接种2剂次,间隔≥4周;2018-2019年度或以前接种过≥1剂次流感疫苗的儿童,建议接种1剂次.≥9岁儿童和成年人仅需接种1剂次.建议各地疾控机构在疫苗供应到位后尽快安排接种工作,最好在10月底前完成免疫接种;对10月底前未接种的对象,整个流行季节都可以提供接种服务.孕妇在孕期的任一阶段均可接种流感疫苗.本指南适用于从事流感防控相关的各级CDC工作人员,预防接种点的接种人员,各级医疗机构儿科、内科、感染科等医务人员,以及各级妇幼保健机构的专业人员.根据国内外研究进展,本指南今后亦将定期更新、完善.

关键词：流感疾病负担疫苗预防接种技术指南

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中药网络药理学:理论、方法与应用(英文)

中国天然药物 2013年第2期11卷 110-120页

作者：李梢张博清华大学清华信息国家实验室生物信息学研究部/合成与系统生物学中心北京100084

中医学将病人当作一个具有不同状态的系统来进行治疗,具有悠久的历史,积累了大量的方剂。中医学的整体观念与网络药理学、网络生物学等前沿科技的核心思想具有相通之处,也符合了对肿瘤等复杂疾病进行系统性治疗的需求。'中药网络药理学... 详细信息

中医学将病人当作一个具有不同状态的系统来进行治疗,具有悠久的历史,积累了大量的方剂。中医学的整体观念与网络药理学、网络生物学等前沿科技的核心思想具有相通之处,也符合了对肿瘤等复杂疾病进行系统性治疗的需求。'中药网络药理学'这一新领域的研究旨在从系统层次和分子水平揭示中药方剂的奥秘,促进中药研究从当前的'单一靶标,单一药物'模式转向'网络靶标,多成分药物'的新模式。近年来,中药网络药理学的一系列方法得以创建,包括基于网络的疾病基因预测、中药成分的靶标谱和药理活性预测、药物-基因-疾病的共模块分析、中药方剂多成分协同作用的大规模筛选、中药方剂的配伍规律和网络调节机理分析等。这些方法在清络饮、六味地黄丸等方剂的药效物质与作用机理等方面得到了有效应用。研究结果表明中药网络药理学能够为中医学从基于经验的医学迈向基于证据的医学提供新的途径,并能加速中药药物发现的进程,同时改进当前的药物研究策略。

关键词：中医药网络药理学网络靶标理论方法应用

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基因资源争夺:一场没有硝烟的战争

瞭望 2001年第13期 28-29页

作者：张猛中国科学院基因组生物信息中心

作为 21世纪的支柱产业之一，生物产业的发展有赖于基因资源。因而，基因资源势必成为未来各国发展的重要战略资源。世界各国围绕基因资源的争夺将会异常激烈。人类的生存、繁衍与发展需要各种各样的自然资源。在过去的千百年中，围绕... 详细信息

作为 21世纪的支柱产业之一，生物产业的发展有赖于基因资源。因而，基因资源势必成为未来各国发展的重要战略资源。世界各国围绕基因资源的争夺将会异常激烈。人类的生存、繁衍与发展需要各种各样的自然资源。在过去的千百年中，围绕着争夺资源，人类历史舞台上演出了难以计数（共2页)

关键词：基因资源人类遗传资源生物资源的利用发达国家与发展中国家人类基因组研究人类基因组计划基因专利国际合作生命科学科学的发展