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Char综合征的遗传学研究进展

中华医学遗传学杂志 2024年第6期41卷 758-760页

作者：赵美方范亮亮项荣中南大学生命科学院长沙410013

Char综合征是一种罕见的常染色体显性遗传病,以动脉导管未闭、面部畸形和指/趾发育异常为主要特征,并可能合并多乳头、牙齿发育异常、睡眠障碍等表现。TFAP2B已被证实为神经嵴衍生和发育相关的基因,现已发现该基因的多种变异。骨形态发... 详细信息

Char综合征是一种罕见的常染色体显性遗传病,以动脉导管未闭、面部畸形和指/趾发育异常为主要特征,并可能合并多乳头、牙齿发育异常、睡眠障碍等表现。TFAP2B已被证实为神经嵴衍生和发育相关的基因,现已发现该基因的多种变异。骨形态发生蛋白信号在胚胎发育中发挥重要的作用,参与肢体生长和模式形成、调控神经嵴细胞的发育等。TFAP2B是骨形态发生蛋白2和4的上游调控基因,其变异可能通过影响骨形态发生蛋白的表达造成神经嵴细胞增殖异常,进而导致多器官发育不全综合征。此外,TFAP2B变异也可能仅导致动脉导管未闭、而非典型的Char综合征。

关键词： TFAP2B基因 Char综合征动脉导管未闭发病机制

干旱改变了昆虫取食下琼岛杨（Populus qiongdaoensis）挥发物的排放

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应用与环境生物学报 2024年

作者：李哲李静徐晓婷李涛四川大学生命科学学院

生物源挥发性有机化合物(Biogenic volatile organic compounds，BVOCs)对于植物抵御生物与非生物胁迫具有重要作用。通过分析琼岛杨(Populus qiongdaoensis)在短期干旱与杨黄卷叶螟(Botyodes diniasalis)单独和双重作用下BVOCs排放的... 详细信息

生物源挥发性有机化合物(Biogenic volatile organic compounds，BVOCs)对于植物抵御生物与非生物胁迫具有重要作用。通过分析琼岛杨(Populus qiongdaoensis)在短期干旱与杨黄卷叶螟(Botyodes diniasalis)单独和双重作用下BVOCs排放的变化，探究单一和双重因子胁迫下植物BVOCs排放的变化。结果显示：(1)正常水分条件下，杨黄卷叶螟(Botyodes diniasalis Walker)对琼岛杨(Populus qiongdaoensis)的叶片的取食面积为23.1 cm2，干旱条件下为18.8 cm2，干旱降低了杨黄卷叶螟对琼岛杨的叶片的取食，但未达到显著水平(p > 0.05)。(2)昆虫取食后琼岛杨的单萜类(Monoterpenes)、倍半萜类(Sesquiterpenes)及呋喃类(Furans)BVOCs的排放速率显著上升(p < 0.05)，与对照相比分别增加37.7%、64.6%和92.1%；干旱胁迫显著降低了呋喃类BVOCs的排放速率(p < 0.05)，与对照相比降低了51.2%。(3)在干旱胁迫和对照条件下BVOCs的差异主要是干旱抑制苯乙烯排放和干旱刺激癸醛、反式 -2-甲基 -1，3-戊二烯排放造成的；昆虫取食的植物与对照植物之间的BVOCs差异主要是由于昆虫取食刺激3，4-二甲基呋喃、苯乙醛、2-羟基苯甲醛、苯乙醇、(Z) -2-庚醛、反式 -2-甲基 -1，3-戊二的排放烯引起的。(4)虽然干旱和昆虫的双重胁迫对琼岛杨BVOCs排放的交互作用并不显著，但干旱和昆虫取食对单萜、倍半萜和呋喃类BVOC排放存在加性效应。比如，昆虫取食增加了呋喃排放，但干旱消除了这种影响。综上所述，干旱降低昆虫对于琼岛杨叶片的取食；干旱与昆虫取食确实改变了挥发物的排放，但对于不同种类BVOCs的影响不同，并且干旱与昆虫取食之间存在着交互作用。植物BVOCs是植物防御的重要物质，本研究为预估未来由气候变化引起的干旱与昆虫爆发对植物BVOCs排放的影响提供了参考。

关键词：干旱昆虫取食生物源挥发性有机化合物萜类植物防御

小黄花茶内生真菌的多样性分析及抑菌活性初筛

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广西植物 2024年第2期44卷 382-395页

作者：易航何静杨希荣姝恬王丽四川大学生命科学学院成都610065

为探究小黄花茶内生真菌种类和种群分布规律以及对植物病原真菌的抑制作用,该研究采用组织分离法对小黄花茶内生真菌进行分离纯化,基于形态学和分子生物学进行鉴定并结合统计学分析评价其多样性,再通过平板对峙法筛选出具有抑菌活性的... 详细信息

为探究小黄花茶内生真菌种类和种群分布规律以及对植物病原真菌的抑制作用,该研究采用组织分离法对小黄花茶内生真菌进行分离纯化,基于形态学和分子生物学进行鉴定并结合统计学分析评价其多样性,再通过平板对峙法筛选出具有抑菌活性的菌株。结果表明:(1)从小黄花茶324份组织块中分离得到内生真菌261株,隶属1门5纲9目22属,其中优势属包括炭疽菌属(Colletotrichum)、间座壳属(Diaporthe)、拟盘多毛孢属(Pestalotiopsis),分离频率分别为21.84%、16.86%、10.34%。(2)研究发现小黄花茶内生真菌在不同季节分布不同,冬季分离出的菌株数量最多,为72株(占27.59%,隶属16个属),春季62株(隶属13个属),夏季59株(隶属15个属),秋季68株(隶属13个属),冬季的香农-维纳指数(H′)、辛普森指数(D)、Pielou s均匀度指数(E)和Margalef s丰富度指数(M)最高,春季与冬季内生真菌种类相似性较高,夏季与秋季内生真菌种类相似性较高。(3)小黄花茶内生真菌不同部位分布不同,茎中内生真菌的分布最多,有102株(占39.08%,隶属15个属),根61株(隶属10个属),叶98株(隶属15个属);茎的H′、D、E、M最高,叶部与茎部内生真菌种类最为相似。(4)平板对峙结果显示,在35株供试内生真菌中,有26株内生真菌至少对1种植物病原真菌有抑制作用,占74.29%,其中CJ-Ⅱ-2、XY-V-3、QY-Ⅱ-4、QJ-Ⅲ-2、DJ-I-2对8种植物病原真菌均有不同程度的抑制作用,XY-V-3对8种植物病原真菌的抑制效果最佳,抑菌率均高于50%,XY-V-3和QJ-Ⅲ-2对2株小黄花茶病原真菌的抑菌率高于50%,具备防治小黄花茶自身病害的潜力。综上所述,小黄花茶内生真菌多样性丰富,部分菌株表现出较好的抑制植物病原真菌的作用,为生物防治产品的研发和小黄花茶病害的防治奠定了基础。

关键词：小黄花茶内生真菌分离鉴定多样性抑菌活性

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山茶属植物系统发育及分类研究进展

园艺学报 2024年第1期51卷 53-66页

作者：邝雪琨郑倩孔庆博周佳思周莉君冯士令丁春邦陈涛四川农业大学生命科学学院四川雅安625014

基于形态学特征,目前山茶属植物分类主要有Sealy、张宏达和闵天禄所创立的3种系统。由于所关注的表型特征不同,这3种分类观点存在较大争议。本文从国内外山茶属分类研究历史出发,对山茶属分类和系统发育研究进展进行综述,主要对基于不... 详细信息

基于形态学特征,目前山茶属植物分类主要有Sealy、张宏达和闵天禄所创立的3种系统。由于所关注的表型特征不同,这3种分类观点存在较大争议。本文从国内外山茶属分类研究历史出发,对山茶属分类和系统发育研究进展进行综述,主要对基于不同的标记类型对山茶属植物系统发育重建的相关研究进行整理总结,评价不同标记在山茶属物种系统发育分析中的利弊。提出目前分类中的问题和今后的重点研究方向,以期为重建山茶属物种间系统关系和解决分类争议提供一定的参考。

关键词：山茶属分类学系统发育研究进展

果胶酶与半纤维素酶复合酶解制备费约果果汁的工艺优化

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食品工业科技 2024年第3期45卷 179-186页

作者：李远蓬朱棚伟何慧谢雨彤翁静陈其阳王丹西南科技大学生命科学与工程学院四川绵阳621010

为减少费约果细胞壁中果胶和半纤维素等物质对果汁品质的负面影响,提高果汁出汁率,本文研究了复合酶(半纤维素酶和果胶酶)比例、加酶量、温度、时间对“Unique U-100”费约果果汁出汁率和可溶性固形物的影响。在单因素实验的基础上,进... 详细信息

为减少费约果细胞壁中果胶和半纤维素等物质对果汁品质的负面影响,提高果汁出汁率,本文研究了复合酶(半纤维素酶和果胶酶)比例、加酶量、温度、时间对“Unique U-100”费约果果汁出汁率和可溶性固形物的影响。在单因素实验的基础上,进行四因素三水平的响应面优化。结果显示:在复合酶(半纤维素酶/果胶酶)比例为2.14:1,加酶量19.6 g/L,酶解温度56.8℃,酶解时间92 min的条件下,费约果果实出汁率最高,为79.5%,与模型预测值相对误差为5.67%;果汁中可溶性固形物含量为15.7%,与模型预测值相对误差为0.83%。此外,与直接压榨的费约果果汁相比,酶解后的果汁表现出更高的澄清度、总酚含量(24.4 mg GAE/100 g)和VC含量(2.42 mg/100 g)。因此,本研究优化了复合酶酶解制备费约果果汁的工艺,提高费约果果汁出汁率和营养品质,可为后续费约果果汁深加工提供理论依据。

关键词：费约果果汁果胶酶半纤维素酶工艺优化

根边缘细胞缓解土荆芥淋溶途径化感作用对苦荞麦代谢扰动的机制

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生态学报 2024年第6期44卷 2437-2451页

作者：龚意豫谢媛怡李玖一马丹炜四川师范大学生命科学学院成都610101

土荆芥(Chenopodium ambrosioides)可通过淋溶途径的化感作用抑制周围植物的种子萌发和幼苗生长,而根边缘细胞(Root border cells,RBCs)对此具有缓解效应。为探讨这一效应的分子机制,以苦荞麦(Fagopyrum tataricum)为研究对象,测定了在... 详细信息

土荆芥(Chenopodium ambrosioides)可通过淋溶途径的化感作用抑制周围植物的种子萌发和幼苗生长,而根边缘细胞(Root border cells,RBCs)对此具有缓解效应。为探讨这一效应的分子机制,以苦荞麦(Fagopyrum tataricum)为研究对象,测定了在土荆芥水浸提液处理前及处理后,保留RBC组和移除RBC组根尖活性氧(ROS)、超氧阴离子(O_(2)^(-))和丙二醛(MDA)含量以及抗氧化酶[超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)]活性的差异。再利用转录组测序分析上述处理对其代谢通路的影响,并进行qRT-PCR验证。结果表明:土荆芥水浸提液处理后,苦荞麦根尖ROS、O_(2)^(-)和MDA的含量以及抗氧化酶(POD和CAT)活性明显提高,且RBC移除组升高更多。通路分析表明,土荆芥水浸提液处理后,移除和保留RBCs组的苯丙素合成、α-亚麻酸代谢、类黄酮合成和谷胱甘肽代谢通路都显著发生改变。其中,苯丙素合成通路以抑制为主,且移除RBCs后受到抑制的程度更低;α-亚麻酸代谢通路中的甾酯水解酶(steryl ester hydrolase,TGL4)和磷脂酶A1(phospholipase A1,DAD1)的表达量大幅上调,而在移除RBCs组则未见变化,TGL4和DAD1负责将磷脂酰胆碱催化形成α-亚麻酸,为抑制植物生长并提高抗性的茉莉酸(JA)提供丰富的底物。此外,与根部疏水性有关的角质、木栓质和蜡合成通路只在移除RBCs组显著改变。上述结果表明,根边缘细胞通过影响根尖抗逆物质合成(苯丙素通路)、抗氧化酶和非酶抗氧化系统(类黄酮和谷胱甘肽)和根部疏水性等方面,以及提高茉莉酸(JA)的表达,在生长和防御中寻找平衡,缓解土荆芥水溶性物质化感胁迫;土荆芥水溶性物质成分复杂,具体哪一种成分在其化感作用中扮演主效作用,尚待进一步研究确证。

关键词：土荆芥化感作用苦荞麦根边缘细胞代谢调控转录组

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声动力治疗的研究进展与展望

分析测试学报 2024年第1期43卷 71-82页

作者：宋佳星赵誉封顺吴明雨西南交通大学生命科学与工程学院四川成都610031

癌症因其高发病率和致死率严重危害人类的健康。传统的癌症治疗方法,如手术、放疗和化疗等,存在创伤大、复发率高和毒副作用显著等缺点。因此开发新型的癌症治疗方法迫在眉睫。在众多新型的癌症治疗方法中,光动力治疗(Photodynamic ther... 详细信息

癌症因其高发病率和致死率严重危害人类的健康。传统的癌症治疗方法,如手术、放疗和化疗等,存在创伤大、复发率高和毒副作用显著等缺点。因此开发新型的癌症治疗方法迫在眉睫。在众多新型的癌症治疗方法中,光动力治疗(Photodynamic therapy,PDT)因具有无创伤性、低耐药性、低毒性和可消灭隐形肿瘤病灶等优点受到广泛关注。但由于光源难以穿透深层组织,PDT对于深层肿瘤的治疗效果不佳。声动力治疗(Sonodynamic therapy,SDT)利用超声激活声敏剂产生活性氧(Reactive oxygen species,ROS)和碳自由基,从而诱导肿瘤细胞死亡。SDT在保留PDT所有的优点外,还能有效克服PDT组织穿透能力不足的问题,展现出广阔的临床应用前景。该综述概括了SDT可能的机制和声敏剂的类型,总结了SDT发展所面临的挑战,并展望了未来可能的发展方向。

关键词：声动力治疗癌症机制声敏剂

机器学习在传统发酵食品微生物结构及品质控制中的应用研究进展

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食品工业科技 2024年第13期45卷 360-367页

作者：王宁晓璇李欣黄玉立王雅利赖海梅杨梦露汤臣薇葛黎红赵楠四川师范大学生命科学学院四川成都610101 四川省农业科学院农产品加工研究所四川成都610066 成都大学食品与生物工程学院四川成都610106 四川大学计算机学院四川成都610065

传统发酵食品独特的风味属性、丰富的营养成分与其复杂多变的微生物结构密切相关,这也使得发酵终产品的品质难以控制。为了探讨食品发酵过程中微生物结构、感官与营养品质变化规律及二者之间的内在联系,数据分析过程是关键步骤。因此,... 详细信息

传统发酵食品独特的风味属性、丰富的营养成分与其复杂多变的微生物结构密切相关,这也使得发酵终产品的品质难以控制。为了探讨食品发酵过程中微生物结构、感官与营养品质变化规律及二者之间的内在联系,数据分析过程是关键步骤。因此,建立发酵食品品质控制的快速、准确数据分析方法非常必要。机器学习具有维度简化率高、数据通量大、预测精度高等优势,在发酵食品品质控制领域展现出巨大的应用潜力,已成为研究热点之一。本文综述了机器学习在发酵食品品质控制中的应用,在概述常用机器学习分类模型的基础上,系统阐述了机器学习在食品发酵过程中菌群结构演变预测、风味化合物组成分析以及个性化消费定制等方面的应用,并对机器学习应用于传统发酵食品品质控制中存在的问题及发展趋势进行了总结和展望。尽管目前机器学习在发酵食品中的应用仍受限于模型普适应不足、预测指标单一、个性化消费场景有限等问题,但随着技术模型的迭代更新、面向工艺全流程多因素的适应性改进以及在个性化消费背景下的应用拓展,机器学习在发酵食品领域将发挥出更大的实际应用价值。本研究旨在为机器学习在传统发酵食品的标准化、可控化生产中的进一步应用提供参考。

关键词：机器学习传统发酵食品数据处理微生物结构风味个性化消费

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镇江香醋对正常小鼠肠道菌群及其代谢的影响

食品与发酵工业 2024年

作者：李文逸段文慧陆震鸣许正宏管祺杰耿燕江南大学生命科学与健康工程学院江南大学国工四川大学

本研究利用16S rRNA基因测序及代谢组学等技术探讨镇江香醋（VAR）对正常SPF级C57BL/6J小鼠肠道菌群及其代谢物的影响。与对照组相比，连续灌胃小鼠4周VAR后，小鼠体重明显增加，血清中高密度脂蛋白（HDL）含量也显著升高。VAR显著增加... 详细信息

本研究利用16S rRNA基因测序及代谢组学等技术探讨镇江香醋（VAR）对正常SPF级C57BL/6J小鼠肠道菌群及其代谢物的影响。与对照组相比，连续灌胃小鼠4周VAR后，小鼠体重明显增加，血清中高密度脂蛋白（HDL）含量也显著升高。VAR显著增加了正常小鼠肠道菌群的α多样性，促进了潜在有益菌如Akkermansia、Lachnospiraceae＿NK4A136的丰度，抑制了Desulfovibrio的丰度。线性判别分析（LEfSe）分析显示，VAR组的生物标志物为毛螺菌科（Lachnospiraceae）、拟杆菌目（Bacteroidales）、Muribaculaceae、颤螺旋菌科（Oscillospiraceae）及瘤胃球菌科（Ruminococcaceae）。基于基因组内容的宏基因组功能预测（PICRUST2）显示VAR促进了柠檬酸循环、酪氨酸和谷胱甘肽代谢，抑制了细胞凋亡。粪便广泛代谢组学分析显示，抗坏血酸类和肾上腺素类物质、异亮氨酸和尿胆素等有利于维持机体正常生命活动的代谢产物在VAR组中含量明显增高。上述研究表明VAR具有一定调节肠道菌群及代谢的作用，可为其功能性食品的开发奠定理论基础。

关键词：酿造食醋 16S rRNA基因测序肠道菌群代谢组学功能食品