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鸭疫里默氏杆菌CH-1株37℃和42℃的转录组测序及比较分析

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微生物学报 2024年第7期64卷 2368-2380页

作者：汪思懿郭方程安春刘马峰西南动物疫病防控技术教育部工程研究中心四川成都611130 四川省动物疫病防控国际联合研究中心四川成都611130 动物疫病与人类健康四川省重点实验室四川成都611130 四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心四川成都611130

【目的】鸭疫里默氏杆菌(Riemerella anatipestifer)是一种感染鸭的革兰氏阴性菌,给养鸭业造成较大经济损失。由于鸭体内温度为42℃,当鸭疫里默氏杆菌感染鸭后必然会调节自身基因表达来适应鸭体内温度。为鉴定鸭疫里默氏杆菌CH-1株感染... 详细信息

【目的】鸭疫里默氏杆菌(Riemerella anatipestifer)是一种感染鸭的革兰氏阴性菌,给养鸭业造成较大经济损失。由于鸭体内温度为42℃,当鸭疫里默氏杆菌感染鸭后必然会调节自身基因表达来适应鸭体内温度。为鉴定鸭疫里默氏杆菌CH-1株感染鸭的适应性机制,本研究测定和比较了鸭疫里默氏杆菌CH-1株在37℃和42℃下的转录组。【方法】将鸭疫里默氏杆菌RA-CH-1株在37℃培养至对数生长期后,分别在37℃和42℃热应激1 h,收集菌体,提取总RNA。利用转录组测序(RNA-seq)技术获得RA-CH-1在37℃和42℃下的转录组原始数据,筛选得到差异表达基因,通过基因本体论(geneontology,GO)数据库和京都基因与基因组百科全书(Kyotoencyclopediaof genes and genomes,KEGG)数据库对差异表达基因进行富集分析。选取dnaK作为热应激反应基因进行功能初步鉴定。【结果】共筛选获得234个显著差异表达基因,其中169个基因显著上调,65个基因显著下调。显著差异表达基因通过GO富集分析主要富集在核苷代谢过程、糖基化合物代谢过程和核心RNA聚合酶结合转录因子活性等;显著差异表达基因通过KEGG富集分析主要富集在氧化磷酸化、核糖体和细菌分泌系统等通路。与37℃条件下生长能力比较,dnaK缺失后导致鸭疫里默氏杆菌在42℃条件下生长能力受损。【结论】RA-CH-1在37℃和42℃下生长不受影响,通过热休克反应相关蛋白等因子表达上调或下调来应对温度升高后的应激状况。

关键词：鸭疫里默氏杆菌转录组温度

鸭源肠致病性大肠杆菌的耐药特征及全基因组学分析

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中国人兽共患病学报 2024年第8期40卷 701-707页

作者：李俊霖胡家萌汪骆李佳芮刘淏天夏静崔敏邹立扣韩新锋四川农业大学动物医学院成都611130 动物疫病与人类健康四川省重点实验室成都611130 四川农业大学资源学院成都611130

目的了解鸭源肠致病性大肠杆菌(EPEC)的耐药情况及全基因组特征,探究鸭源EPEC的致病潜力,为临床治疗提供理论基础。方法PCR鉴定出EPEC分离株,采用微量肉汤稀释法进行药敏试验,并对其进行全基因组测序,分析EPEC的血清型、ST型、质粒不相... 详细信息

目的了解鸭源肠致病性大肠杆菌(EPEC)的耐药情况及全基因组特征,探究鸭源EPEC的致病潜力,为临床治疗提供理论基础。方法PCR鉴定出EPEC分离株,采用微量肉汤稀释法进行药敏试验,并对其进行全基因组测序,分析EPEC的血清型、ST型、质粒不相容群类型及其携带的耐药基因与毒力基因。结果共鉴定出10株EPEC,血清型包括O71∶H40和O3∶H21两种;所有EPEC菌株均表现出多重耐药,对环丙沙星、链霉素、四环素、多粘菌素B最为耐药,耐药率高达100%,对头孢西丁最为敏感,对阿米卡星、亚胺培南较敏感;所有菌株均携带有四环素耐药基因tet(A),以及超广谱β-内酰胺酶(ESBL)耐药基因,包括bla OXA-10、bla TEM-1A、bla TEM-1B;分离株检测到多种毒力基因,与分泌系统相关的毒力基因最多,未检测到bfp基因及perABC基因。结论鸭源EPEC分离株都为非典型EPEC(aEPEC),具有多重耐药性,检测到多种质粒不相容群,携带多种耐药基因与毒力基因,对人具有潜在致病性,需要加强对鸭源EPEC的监测以有效控制鸭源EPEC的传播,防止其对人类健康造成危害。

关键词：肠致病性大肠杆菌耐药性全基因组测序耐药基因毒力基因

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猪圆环病毒3型反向遗传研究进展

病毒学报 2024年第5期40卷 1202-1212页

作者：邵丽娜罗郑徐通张乐宜李幽幽徐志文朱玲四川农业大学动物生物技术中心成都611130 四川德康农牧食品集团股份有限公司成都610200 动物疫病与人类健康四川省重点实验室成都611130

猪圆环病毒3型(Porcine circovirus 3,PCV3)是与猪皮炎和肾病综合征(Porcine dermatitis and nephropathy syndrome,PDNS)、生殖衰竭和多系统炎症等临床症状相关的病原体,对养猪业构成严重威胁。然而,一直以来,因PCV3分离较为困难等原因... 详细信息

猪圆环病毒3型(Porcine circovirus 3,PCV3)是与猪皮炎和肾病综合征(Porcine dermatitis and nephropathy syndrome,PDNS)、生殖衰竭和多系统炎症等临床症状相关的病原体,对养猪业构成严重威胁。然而,一直以来,因PCV3分离较为困难等原因,其发病和致病机制目前仍不清楚。近年来,一些研究者成功地利用反向遗传操作系统拯救出PCV3,并初步揭示了其生物学特性。尽管如此,PCV3的致病机制仍未被完全阐明。本文综述了反向遗传技术在PCV3研究中的应用和进展,旨在为深入研究PCV3的致病机制、防控和疫苗研发等提供研究参考和新的思路。

关键词：病毒感染猪圆环病毒3型机制反向遗传病毒拯救

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绞股蓝皂苷体外抗牛病毒性腹泻病毒的作用

浙江农业学报 2024年

作者：才冬杰申子凡左之才田斌叶刚李伟强卜庆龙四川农业大学动物医学院四川农业大学动物疫病与人类健康四川省重点实验室山东畜牧兽医职业学院宠物科技学院

为研究绞股蓝皂苷对牛病毒性腹泻病毒（bovine viral diarrhea virus， BVDV）的作用，采用体外细胞培养技术、细胞病变效应观察与CCK-8相结合的方法，首先确定绞股蓝皂苷和α-单月桂酸甘油酯的安全浓度，然后采用先加药后加病毒、先加... 详细信息

为研究绞股蓝皂苷对牛病毒性腹泻病毒（bovine viral diarrhea virus， BVDV）的作用，采用体外细胞培养技术、细胞病变效应观察与CCK-8相结合的方法，首先确定绞股蓝皂苷和α-单月桂酸甘油酯的安全浓度，然后采用先加药后加病毒、先加病毒后加药，及药和病毒预先作用这3种加药方式，利用Western blot和定量PCR检测BVDV E2蛋白和5'-UTR基因表达量的变化，探究其在体外对病毒的抑制作用。结果表明，当绞股蓝皂苷和α-单月桂酸甘油酯的浓度分别为16 μmol·L-1和25 μg·mL-1时，细胞活性与空白组相比的差异无统计学意义（P>0.05），将其确定为两种药物的最大安全浓度。与对照组相比，绞股蓝皂苷可极显著（P<0.01）抑制BVDV E2蛋白和5'-UTR基因的表达，且其直接灭活作用优于α-单月桂酸甘油酯。此外，绞股蓝皂苷还显示出了显著（P<0.05）的吸附阻断作用，但其复制阻断作用与单独病毒组无显著差异。

关键词：牛病毒性腹泻病毒绞股蓝皂苷抗病毒

基于Web of Science数据库的植物内生真菌研究的可视化分析

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微生物学杂志 2024年第3期44卷 86-95页

作者：廖飞何洁任亚玲韩昌权钟孟淮胡延春四川农业大学动物医学院动物疫病与人类健康四川省重点实验室四川成都611130 贵州农业职业学院贵州贵阳551400 贵州大学林学院贵州贵阳550025

植物内生真菌作为一种高度生物多样性和多用途的微生物群落而备受关注。深入了解植物内生真菌研究现状,可为该领域未来研究方向的确立及发展趋势预测提供理论依据。本文通过文献计量学方法,对1926年至2022年11月期间Web of Science核心... 详细信息

植物内生真菌作为一种高度生物多样性和多用途的微生物群落而备受关注。深入了解植物内生真菌研究现状,可为该领域未来研究方向的确立及发展趋势预测提供理论依据。本文通过文献计量学方法,对1926年至2022年11月期间Web of Science核心合集数据库收录的植物内生真菌相关论文,以“植物内生真菌(Endophytic Fungi)”为检索词进行主题检索,统计相关文献的作者、国家、机构、年发表量、学科、期刊和关键词的分布情况,并利用文献可视化软件VOSviewer对所得数据进行分析。检索结果显示,1926年至2022年11月Web of Science一共收录“Endophytic Fungi”相关论文9945篇,从作者来看,以佘志刚、Proksch Peter、王斌贵以及Lee In-Jung等人为核心的研究团队发文量最高。中国、美国、印度、德国和巴西是发文量最多的国家,其中中国在该领域的发文量占总发文量的33.9%。国内主要发文机构集中在中国科学院、中国科学院大学、中山大学,国外的主要发文机构是圣保罗大学、美国农业部、法国国家科学研究中心。植物内生真菌生物多样性、植物内生真菌与宿主互作机制及利用以及植物内生真菌次生代谢产物生物活性物质挖掘为本领域研究热点,植物内生真菌代谢组学和天然衍生产品合成也是诸多学者关注的重点。本文为植物内生真菌相关领域的学者寻找潜在合作者与合作机构,并为其追踪当下研究热点和分析未来研究发展趋势提供重要参考依据。

关键词：植物内生真菌 Web of Science VOSviewer 文献计量学可视化分析多样性代谢产物

鸭疫里默氏杆菌耐药基因传播方式的鉴定及分布

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微生物学报 2024年第11期 4455-4465页

作者：杨宇豪姚弈舟朱德康张相德程安春刘马峰西南动物疫病防控技术教育部工程研究中心四川省动物疫病防控国际联合研究中心动物疫病与人类健康四川省重点实验室四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心江苏益客食品集团股份有限公司

【目的】鸭疫里默氏杆菌(Riemerella anatipestifer, RA)是一种感染鸭、鹅等禽类的革兰氏阴性病原菌。该菌的临床分离株具有多重耐药性，且其耐药性呈现逐年增加的趋势，但关于这些耐药基因在该菌的传播方式尚未被明确鉴定。本研究旨在... 详细信息

【目的】鸭疫里默氏杆菌(Riemerella anatipestifer, RA)是一种感染鸭、鹅等禽类的革兰氏阴性病原菌。该菌的临床分离株具有多重耐药性，且其耐药性呈现逐年增加的趋势，但关于这些耐药基因在该菌的传播方式尚未被明确鉴定。本研究旨在鉴定耐药基因在鸭疫里默氏杆菌的传播方式，以及这些耐药基因在该菌临床分离株中的分布情况。【方法】测定参考菌株RA ATCC 11845、临床分离株RA CH-1、RA CH-2对10类28种药物的耐药表型；通过基因组分析和基因缺失株的构建鉴定耐药基因；自然转化实验鉴定其耐药基因传播方式；通过PCR检测这些耐药基因在不同临床菌株的分布情况。【结果】耐药检测结果表明，鸭疫里默氏杆菌RA CH-1株、RA CH-2株对β-内酰胺类、四环素类、大环内酯类、林可胺类及酰胺醇类等药物均具有耐药性，而RA ATCC 11845株对以上药物敏感；13个耐药基因分别缺失后对相关药物变得敏感，表明其参与耐药；以上耐药基因均可通过自然转化方式转移至敏感菌株RA ATCC 11845；相关耐药基因在2017-2023年分离的100株临床株的检出率最低为3%，最高为89%。【结论】耐药基因在鸭疫里默氏杆菌可通过自然转化的形式进行传播，不同耐药基因在该菌临床分离株中的分布不同，其中tet(X)(B739＿0030)耐药基因携带率最高，blaOXA (G148＿1768)耐药基因携带率最低。

关键词：鸭疫里默氏杆菌耐药基因传播方式自然转化

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半枝莲醇提液对2型糖尿病大鼠HPA轴的结构损伤、糖原沉积及相关递质表达的改善作用

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四川农业大学学报 2024年第4期42卷 899-907页

作者：汪乐田春洋王荣会邓逸云唐丽四川农业大学动物医学院/动物疾病与人类健康四川省重点实验室成都611130 四川栗子坪国家级自然保护区管理局四川雅安625400

【目的】为明确半枝莲醇提液对2型糖尿病(T2DM)及伴其发的下丘脑-垂体-肾上腺轴(HPA轴)亢进的治疗效果,从HPA轴的角度为T2DM提供安全且有效的治疗手段。【方法】选取120只4周龄SPF级Wistar雄性大鼠,随机分为正常饮食组(GD组)24只和高糖... 详细信息

【目的】为明确半枝莲醇提液对2型糖尿病(T2DM)及伴其发的下丘脑-垂体-肾上腺轴(HPA轴)亢进的治疗效果,从HPA轴的角度为T2DM提供安全且有效的治疗手段。【方法】选取120只4周龄SPF级Wistar雄性大鼠,随机分为正常饮食组(GD组)24只和高糖高脂饮食组(H组)96只;H组注射STZ诱导T2DM模型,造模成功后随机分为模型对照组(HD组)24只、半枝莲低(SD-L)、中(SD-M)和高(SD-H)剂量组各24只;GD、HD组灌服生理盐水,SD组分别灌服半枝莲醇提液,分别于治疗第5、10、20、30天测定各组大鼠体重、FBG、INS及血脂代谢指标。最后于30 d分别采用H.E、PAS染色法观察HPA轴的组织病理结构及其内糖原数量的变化;醛复红染色法观察胰腺α、β细胞数量的变化;IHC法观察5-HT、GABA分别在下丘脑PVN、VMH中表达的变化。【结果】与GD组相比,HD组发生以下变化:(1)大鼠体重、INS极显著降低,FBG极显著升高。(2)下丘脑PVN和VMH-GE、VMH-GI神经细胞数量减少,神经胶质细胞增多;腺垂体嗜碱性细胞数量减少;肾上腺球状带、束状带萎缩;胰岛萎缩。(3)HPA轴内糖原量均显著或极显著升高。(4)胰岛β细胞坏死、α细胞增多。(5)5-HT、GABA在下丘脑PVN、VMH-GI中的表达量均极显著降低。给药治疗后,这些病理性变化基本得以改善。【结论】半枝莲醇提液对T2DM具有较好的治疗作用,可以缓解T2DM并发的HPA轴内糖原异常沉积及其过度活化。

关键词：半枝莲 2型糖尿病(T2DM) 大鼠 HPA轴糖原 5-HT GABA

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复方银花口服液防治仔猪细菌性腹泻效果

畜禽业 2024年第5期35卷 9-12页

作者：李思聪殷勤张敏王斌杨子仪李旭廷梁歌四川省畜牧科学研究院四川成都610066 动物遗传育种四川省重点实验室四川成都610066

为评估复方银花口服液对仔猪细菌性腹泻的防治效果,选取新生健康仔猪和哺乳腹泻仔猪,开展复方银花口服液对新生仔猪腹泻的预防效果及其联用四黄止痢颗粒治疗哺乳仔猪腹泻的疗效试验。结果显示:复方银花口服液对新生仔猪腹泻预防保护率为... 详细信息

为评估复方银花口服液对仔猪细菌性腹泻的防治效果,选取新生健康仔猪和哺乳腹泻仔猪,开展复方银花口服液对新生仔猪腹泻的预防效果及其联用四黄止痢颗粒治疗哺乳仔猪腹泻的疗效试验。结果显示:复方银花口服液对新生仔猪腹泻预防保护率为91.1%,较恩诺沙星注射液高30.6%;联用四黄止痢颗粒对哺乳仔猪细菌性腹泻的总有效率为88.2%,较恩诺沙星注射液高35.9%。研究表明:复方银花口服液对新生仔猪腹泻有较好预防效果,与四黄止痢颗粒联用可用于临床耐药细菌性腹泻的治疗。

关键词：复方银花口服液仔猪大肠杆菌腹泻

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圈养小熊猫疾病研究现状及展望

四川动物 2024年第5期43卷 565-576页

作者：刘颂蕊李运莉岳婵娟齐敦武侯蓉兰景超成都大熊猫繁育研究基地四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室成都610081

由于受栖息地丧失和人类活动干扰等的影响,小熊猫Ailurus fulgens野生种群数量锐减。人工圈养对小熊猫遗传多样性的保护发挥了重要作用,同时也促进了对小熊猫疾病的研究。小熊猫疾病是威胁圈养种群健康和发展的重要因素之一,基于此,本... 详细信息

由于受栖息地丧失和人类活动干扰等的影响,小熊猫Ailurus fulgens野生种群数量锐减。人工圈养对小熊猫遗传多样性的保护发挥了重要作用,同时也促进了对小熊猫疾病的研究。小熊猫疾病是威胁圈养种群健康和发展的重要因素之一,基于此,本文总结了病毒(犬瘟热病毒、细小病毒等)、细菌(大肠杆菌Escherichia coli、肺炎克雷伯菌Klebsiella pneumoniae等)、寄生虫(线虫、弓形虫等)和非感染性因素造成的圈养小熊猫疾病及相关研究进展,分析了疾病对圈养小熊猫种群的危害。旨在引起圈养单位对疾病研究的重视,为种群饲养管理和疾病防控提供参考,也为进一步开展圈养小熊猫的疾病相关研究提供借鉴。

关键词：小熊猫圈养感染性疾病非感染性疾病