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靶向蛋白质泛素修饰及降解在前列腺癌治疗中的机遇与挑战

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生物化学与生物物理进展 2023年第4期50卷 782-794页

作者：彭韵桦刘莎崔莉刘健康龙建纲西安交通大学生命科学与技术学院线粒体生物医学研究所生物医学信息工程教育部重点实验室西安710049 陆军军医大学大坪医院重庆400042 西南医科大学基础医学院泸州646000 康复大学健康与生命科学学院青岛266071

前列腺癌是中国发病率增长最快的男性肿瘤,抗雄激素治疗耐药是导致前列腺癌患者预后差的主要原因。因此,解决耐药性难题是前列腺癌转化研究的关键问题。哺乳动物细胞利用泛素-蛋白酶体系统实现蛋白质的靶向降解。因此,前列腺癌中关键的... 详细信息

前列腺癌是中国发病率增长最快的男性肿瘤,抗雄激素治疗耐药是导致前列腺癌患者预后差的主要原因。因此,解决耐药性难题是前列腺癌转化研究的关键问题。哺乳动物细胞利用泛素-蛋白酶体系统实现蛋白质的靶向降解。因此,前列腺癌中关键的癌基因如雄激素受体(AR)的上游泛素化调控因子(如去泛素化酶)是潜在的治疗靶点。然而,这些酶具有较广的底物谱系,存在脱靶的可能性。近来,基于泛素-蛋白酶体系统开发的蛋白质降解靶向嵌合体(proteolysis-targeting chimeras,PROTAC)技术是最具前景和革命性的新型抗癌药物研发技术,能够利用特定E3泛素连接酶对靶蛋白进行降解而不影响其他底物。与传统小分子抑制剂相比,PROTAC分子在克服耐药性以及针对不可成药的靶点方面拥有巨大优势。目前,针对AR的PROTAC降解剂已在II期临床取得了成功,靶向蛋白质泛素化及降解途径的新技术将有望为前列腺癌的临床治疗带来新的突破。

关键词：前列腺癌泛素-蛋白酶体去势抵抗靶向策略

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基于ceRNA网络识别登革热诊断标志物

生物信息学 2023年第4期21卷 304-310页

作者：郑德华许达华毕小慢曹勐徐智洲陈荔旸李思鲁健平李孔宁海南医学院生物医学信息与工程学院热带转化医学教育部重点实验室海口570099 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院哈尔滨150076

通过比较登革热患者和健康人群转录组数据,识别差异基因,构建失调ceRNA网络,筛选关键基因富集分析,解析潜在生物学功能,助力登革热诊断标志物的研究。从GEO数据库下载登革热外周血芯片数据,识别差异基因并进行富集分析。结合miRNA-mRNA... 详细信息

通过比较登革热患者和健康人群转录组数据,识别差异基因,构建失调ceRNA网络,筛选关键基因富集分析,解析潜在生物学功能,助力登革热诊断标志物的研究。从GEO数据库下载登革热外周血芯片数据,识别差异基因并进行富集分析。结合miRNA-mRNA互作数据,利用超几何算法和皮尔森相关性计算方法识别登革热失调ceRNA互作对,使用Cytoscape软件可视化ceRNA网络与模块挖掘,对网络模块进行功能富集及外部数据验证表达模式。筛选出251个差异基因,发现其富集在细胞周期等生物学通路中。经外部数据验证,网络模块基因的表达趋势与训练集数据大致相同,表明模块基因在登革热疾病中的潜在诊断效能。本研究可为确定有效的疾病诊断分子标志物提供思路。

关键词：登革热竞争性内源RNA(ceRNA) 富集分析网络模块

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转化医学视域下的本科基础医学教学改革初探

中国高等医学教育 2017年第9期 26-27页

作者：马宁杨琳丽张艳芬王乐天乔瑜韩冬王璐晶高旭哈尔滨医科大学基础医学院哈尔滨医科大学高教研究与教学质量评估中心哈尔滨医科大学附属第二医院哈尔滨医科大学生物信息与技术学院黑龙江哈尔滨150081

临床医学发展不仅有赖于经验的传承,更得益于临床与基础的密切合作。医学生需要通过一定科研工作熟悉科学研究的基本流程及其在医学中的应用,即研究生培养阶段。如何在本科阶段基础医学教学中融入"转化医学"理念,强调基础研究与临床实... 详细信息

临床医学发展不仅有赖于经验的传承,更得益于临床与基础的密切合作。医学生需要通过一定科研工作熟悉科学研究的基本流程及其在医学中的应用,即研究生培养阶段。如何在本科阶段基础医学教学中融入"转化医学"理念,强调基础研究与临床实践的结合,培养医学生辩证思考能力、创新能力是当今基础医学教育培养未来医学人才不可忽视的重要内容,也是基础医学教改活动的课题之一。

关键词：本科教学转化医学教学改革创新能力科研思维

医学院校教师开展课程思政教学的现状及影响因素分析

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中华医学教育杂志 2023年第3期43卷 169-172页

作者：孙福川张瑞杰赵霁阳赵春辉王燕萍张淑娥曹德品哈尔滨医科大学教学督导委员会哈尔滨150081 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院哈尔滨150086 哈尔滨医科大学高教研究与教学质量评估中心哈尔滨150081 哈尔滨医科大学学生工作部哈尔滨150081 哈尔滨医科大学卫生管理学院医学教育管理教研室哈尔滨150081

目的评估医学院校教师课程思政教学的现状并识别其影响因素。方法采用问卷调查法,对黑龙江省某医学院校的311名任课教师进行网络问卷调研。运用单因素和多因素logistic回归分析法识别其开展课程思政教学的影响因素。结果311名教师中,197... 详细信息

目的评估医学院校教师课程思政教学的现状并识别其影响因素。方法采用问卷调查法,对黑龙江省某医学院校的311名任课教师进行网络问卷调研。运用单因素和多因素logistic回归分析法识别其开展课程思政教学的影响因素。结果311名教师中,197名(63.3%)教师能够在每次教学中开展课程思政教学。回归分析结果显示,教师开展课程思政教学的时间(Waldχ^(2)=12.962,P教研室重视程度(Waldχ^(2)=15.471,P学院校教师将思政教育融入医学课程较为普遍。开展时间越早和所在教研室的重视程度越高,教师开展课程思政教学的次数越多。

关键词：教师课程思政教学医学院校影响因素

PD-L1介导的胰腺癌ceRNA网络机制解析及标志物识别

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国际免疫学杂志 2019年第6期42卷 562-565页

作者：王红黄惠英郑立宇李孔宁海南医学院热带转化医学教育部重点实验室海口571199 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院 150081

目的对胰腺癌中程序性死亡因子配体1(programmed death factor ligand 1,PD-L1)基因介导的内源竞争RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)ceRNA互作网络的机制解析及其预后标志物进行识别.方法构建PD-L1基因相关的ceRNA网络,对网络中的... 详细信息

目的对胰腺癌中程序性死亡因子配体1(programmed death factor ligand 1,PD-L1)基因介导的内源竞争RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)ceRNA互作网络的机制解析及其预后标志物进行识别.方法构建PD-L1基因相关的ceRNA网络,对网络中的基因表达谱和甲基化谱进行聚类分析,识别与生存相关的基因.结果从PD-L1介导的ceRNA网络中识别了12个与生存潜在相关的mRNA以及挖掘出基因甲基化显著影响患者生存的多个mRNAs.结论通过生物信息学分析,在PD-L1介导的ceRNA网络中识别出多个潜在的胰腺癌生物标志物,从而为胰腺癌的临床治疗提供新的预后靶标.

关键词：胰腺癌程序性死亡因子配体内源竞争RNA 生存分析

Ⅰ-Ⅱ期肺腺癌癌微转移预测及铂类耐药预测双联标志

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Ⅰ-Ⅱ期肺腺癌癌微转移预测及铂类耐药预测双联标志

血清miR-34a表达水平预测乳腺癌新辅助化疗疗效

2017年中国肿瘤标志物学术大会暨第十一届肿瘤标志物青年科学家论坛

作者：戚丽霜李天浩石根根李昕王佳圣李颖郭政哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院福建医科大学基础医学院生物信息学系与消化道恶性肿瘤教育部重点实验室

目的:针对基因表达检测值变异高、存在批次效应并难以标准化等问题,本研究利用肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)样本内基因表达相对大小关系(秩次关系),识别个体化多级预后预测标志,可先预测I-II期LUAD患者是否存在微转移风险(即术后...

目的:针对基因表达检测值变异高、存在批次效应并难以标准化等问题,本研究利用肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)样本内基因表达相对大小关系(秩次关系),识别个体化多级预后预测标志,可先预测I-II期LUAD患者是否存在微转移风险(即术后复发风险),再预测存在微转移风险的患者是否对铂类耐药。方法:利用单纯接受手术切除治疗的I-II期LUAD样本,识别一组基因对,根据其在样本内基因表达的大小关系可预测术后复发风险与生存预后(1级标志)。然后,在术后接受铂类辅助化疗的I-II期LUAD样本中,先利用1级预后标志识别术后复发高风险患者的样本;再利用这些可能存在微转移的样本,识别一组铂类耐药预测基因对标志(2级标志)。结果:识别出一组包含9对基因的预测术后复发及死亡风险的1级预后标志(9-GPS)(图1A),其预后能力在两套芯片平台检测的样本及一套RNA-sequencing平台检测的样本中得到了验证(图1B)。然后,在接受了术后铂类联合辅助化疗的LUAD数据中,利用1级预后标志识别术后复发高风险患者的样本,并利用这些可能存在微转移的样本识别出一组包含三个基因对的铂类耐药预测标志(3-GPS,分类规则同9-GPS)。在一套独立的整合验证数据集中,该标志能够有效预测接受铂类化疗治疗患者是否能够受益于铂类化疗(图1C)。最后,将9-GPS及3-GPS耦联应用于TCGA多维组学数据中,发现九个拷贝数区域的扩增或缺失频率均在对铂类敏感组中显著高(Fisher检验,FDR<0.05),提示敏感患者的基因组更倾向不稳定。结论:该基于基因表达秩次关系的双联标志不受实验批次影响,能够个体化预测I-II期LUAD患者术后复发风险(微转移)及对铂类辅助化疗的敏感性。图1.肺腺癌复发风险及铂类药效预测标志。A. 9-GPS的风险分类规则。当一个样本(黄色示例)内9对基因中,超过5个基因对的秩次关系投票其为高风险,则该样本(n=7)被预测为高风险,反之为低风险。B. 9-GPS在两套芯片平台及一套RNA-sequencing平台检测数据中预测复发风险及整体生存时间的能力。C. 3-GPS在一套验证整合数据集中预测样本能否受益于铂类化疗的能力。

关键词：

来源： cnki会议评论

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cnki会议

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解剖科学进展 2017年第5期23卷 467-470,474页

作者：何春波宿菲齐秀英游凯刘利华张雅芳张建国刘宝全哈尔滨医科大学附属第四医院放化疗科黑龙江哈尔滨150081 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院黑龙江哈尔滨150081 哈尔滨医科大学解剖学教研室黑龙江哈尔滨150081 哈尔滨医科大学附属第二医院乳腺外科黑龙江哈尔滨150081 西藏藏医学院现代医药学教研室西藏拉萨850000

目的探讨血清miR-34a对乳腺癌新辅助化疗疗效的预测价值。方法本研究包括78名确诊的原发性乳腺癌患者和30名健康志愿者。每位患者在化疗开始前,第二个周期结束和新辅助化疗结束时抽取6ml静脉血。实时定量PCR检测血清miR-34a的表达,其与... 详细信息

目的探讨血清miR-34a对乳腺癌新辅助化疗疗效的预测价值。方法本研究包括78名确诊的原发性乳腺癌患者和30名健康志愿者。每位患者在化疗开始前,第二个周期结束和新辅助化疗结束时抽取6ml静脉血。实时定量PCR检测血清miR-34a的表达,其与化疗响应的关系被分析。结果血清miR-34a的表达水平在乳腺癌患者化疗开始前显著高于健康志愿者。在治疗有效组和无效组,血清miR-34a的表达水平在化疗开始前,两周期结束时和化疗结束时均无显著差异。而血清miR-34a表达水平的变化是与治疗反应显著相关的。在治疗有效组,患者的血清miR-34a水平在化疗第二周期后和化疗结束时均低于化疗开始前(P=0.023和P=0.036),而无效组无显著变化。ROC曲线显示血清miR-34a表达水平的变化能准确地预测新辅助化疗的疗效。结论血清miR-34a是一个新的、非侵入性的生物标记物,能够准确地预测乳腺癌新辅助化疗的疗效。

关键词：乳腺癌新辅助化疗血清miR-34a

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高分辨力MRI测量中国汉族正常成人豆状核

中国医学影像技术 2012年第1期28卷 15-18页

作者：王国坤陈楠王星卓彦陈霖李坤成王丹申宝忠哈尔滨医科大学附属第四医院影像科黑龙江哈尔滨150001 首都医科大学宣武医院放射科北京100053 中国科学院生物物理研究所脑与认知科学国家重点实验室北京100101

目的测量中国汉族正常成人豆状核体积,为建立中国成人数字标准脑提供基础数据。方法采用多中心临床研究形式,选取18~80岁健康志愿者1000名,按照年龄18~30、31~40、41~50、51~60、61~80岁进行分组,每组男、女各100名。采用三维磁化强度... 详细信息

目的测量中国汉族正常成人豆状核体积,为建立中国成人数字标准脑提供基础数据。方法采用多中心临床研究形式,选取18~80岁健康志愿者1000名,按照年龄18~30、31~40、41~50、51~60、61~80岁进行分组,每组男、女各100名。采用三维磁化强度预备梯度回波T1 W序列扫描获取图像,应用三维体积分析软件手工勾绘ROI,测量豆状核的体积,探讨豆状核体积与年龄的相关关系。结果 1000名正常成人左、右侧壳核体积分别为（4811.59±588.99）mm3和（4763.11±587.59）mm3,左侧壳核体积大于右侧（t=10.134,P〈0.0001）;左、右侧苍白球体积分别为（1591.31±226.81）mm3、（1627.28±235.06）mm3,左侧苍白球体积小于右侧（t=-9.877,P〈0.0001）。男性左、右侧壳核体积和苍白球体积分别为（4962.72±598.49）mm3、（4909.83±600.54）mm3、（1623.24±234.16）mm3和（1663.18±243.56）mm3;女性左、右侧壳核及苍白球体积分别为（4663.65±540.49）mm3、（4619.28±537.59）mm3、（1560.00±215.04）mm3、（1592.09±221.06）mm3,男性体积均大于女性（P均〈0.0001）。左、右侧壳核及左、右侧苍白球体积均随年龄增长而减低。结论正常成人豆状核中,壳核体积左侧大于右侧,苍白球体积右侧大于左侧;男性豆状核体积大于女性。豆状核体积均随年龄增大而减小。

关键词：豆状核磁共振成像人体测量术

中国正常成人中脑体积的高分辨力MRI的测量与分析

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中国医学影像技术 2012年第1期28卷 23-27页

作者：孙黎陈楠王星王丹卓彦陈霖李坤成申宝忠哈尔滨医科大学附属第四医院影像科黑龙江哈尔滨150001 首都医科大学宣武医院放射科北京100053 中国科学院生物物理研究所脑与认知科学国家重点实验室北京100101

目的测量中国健康汉族成人中脑体积,并建立正常值参考范围,分析中脑体积与年龄及性别的关系,为建立中国正常人标准脑提供基础数据。方法选取18~70岁健康成年志愿者1000名,按年龄18~30、31~40、41~50、51~60、6l^70分为共5组,标记为A、B... 详细信息

目的测量中国健康汉族成人中脑体积,并建立正常值参考范围,分析中脑体积与年龄及性别的关系,为建立中国正常人标准脑提供基础数据。方法选取18~70岁健康成年志愿者1000名,按年龄18~30、31~40、41~50、51~60、6l^70分为共5组,标记为A、B、C、D、E,每组共计200名,男、女各100名。对所有受试者行全脑容积MR扫描,用3D体积分析软件进行中脑体积测量。分析年龄与中脑体积的相关性。结果男性中脑平均体积[(8087.89±1177.43)mm3]大于女性[(7763.87±1007.44)mm3,t=-4.68,P<0.001]。男性A^E组中脑体积分别为(8857.65±980.12)mm3、(8691.22±913.56)mm3、(8072.26±1024.78)mm3、(7688.33±981.91)mm3、(7129.98±1059.98)mm3,女性A^E组中脑体积分别为(8290.68±995.41)mm3、(8034.79±1000.00)mm3、(7767.43±907.28)mm3、(7619.18±836.72)mm3、(7107.29±889.09)mm3。A^C组男性中脑体积均大于女性(P均<0.05),D、E组男、女差异则无统计学意义。男性除A组与B组外,其余各组间差异均有统计学意义(P均<0.05);女性除A组与B组、C组与D组外,其余各组间差异均有统计学意义(P均<0.05)。男性和女性中脑体积均与年龄相关(r=-0.55、-0.38,P均<0.001)。结论正常中国成人中脑体积存在性别差异,男性中脑体积总体上大于女性;18~50岁男性中脑体积大于女性,51~70岁男女间无显著差异。中脑体积及其性别间差异均随年龄增大而减小。

关键词：中脑磁共振成像人体测量术