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组蛋白去甲基化酶JMJD3通过调控巨噬细胞极化抑制实验性牙周炎牙槽骨破坏的研究

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中华口腔医学杂志 2024年第8期59卷 823-832页

作者：王瑞玲鲁嘉韦罗礼君同济大学附属口腔医院牙周病科、同济大学口腔医学院、上海牙组织修复与再生工程技术研究中心、同济大学口腔医学研究所上海200072

目的探究组蛋白去甲基化酶——含Jumonji结构域蛋白3(JMJD3)在炎症牙周组织中的表达及其对牙周炎调控的潜在机制。方法分析2022年发表在基因表达综合数据库(GEO)中牙周组织单细胞测序的结果,并收集2021年6至12月同济大学附属口腔医院牙... 详细信息

目的探究组蛋白去甲基化酶——含Jumonji结构域蛋白3(JMJD3)在炎症牙周组织中的表达及其对牙周炎调控的潜在机制。方法分析2022年发表在基因表达综合数据库(GEO)中牙周组织单细胞测序的结果,并收集2021年6至12月同济大学附属口腔医院牙周病科和口腔颌面外科牙周手术和拔牙术中获取的健康及牙周炎患者的牙龈样本各9例,进行免疫组织化学染色、实时荧光定量PCR(RT-qPCR)。构建小鼠牙周炎模型,实验分组为:健康对照+生理盐水组、丝线结扎+生理盐水组、丝线结扎+GSK-J4(JMJD3抑制剂)组。体外使用牙龈卟啉单胞菌(Pg)来源的脂多糖(LPS)(Pg-LPS)模拟牙周炎症微环境,并使用靶向Jmjd3的小干扰RNA(siRNA)、GSK-J4分别处理巨噬细胞。siRNA转染实验分组为:阴性对照序列转染(NC)组、siRNA-Jmjd3组、NC+LPS组、siRNA-Jmjd3+LPS组。抑制剂实验分组为:二甲基亚砜(DMSO)组、GSK-J4组、DMSO+LPS组、GSK-J4+LPS组。使用蛋白质免疫印迹法、免疫荧光染色等方法探索JMJD3在体内、体外环境下对巨噬细胞极化及牙周炎症的影响。结果牙周炎患者牙龈组织的JMJD3表达(1.97±0.91)显著高于健康牙龈组织(1.00±0.33)(t=2.45,P=0.048)。体外实验RT-qPCR结果显示,siRNA敲低JMJD3或使用GSK-J4抑制JMJD3均可促进炎症环境下巨噬细胞的M1极化,抑制M2极化:NC+LPS组精氨酸酶Ⅰ(Arg1)的表达(0.90±0.06)显著高于siRNA-Jmjd3+LPS组(0.61±0.11)(P<0.01);NC+LPS组白细胞介素(Il)-6、Il-1β和肿瘤坏死因子α(Tnf-α)的表达(分别为8.50±0.16、5.56±0.20、3.44±0.16)均显著低于siRNA-Jmjd3+LPS组(分别为14.63±0.48、8.55±0.10、11.72±0.58)(均P<0.01)。DMSO+LPS组Arg1、类几丁质酶3样分子(Ym1)、Il-10的表达(分别为0.82±0.01、0.35±0.16、1.47±0.11)均显著高于GSK-J4+LPS组(分别为0.55±0.03、0.22±0.21、0.51±0.11)(均P<0.01);DMSO+LPS组Il-6、Il-1β、Tnf-α的表达(分别为2.03±0.13、3.63±0.14和4.06±0.03)均显著低于GSK-J4+LPS组(分别为2.69±0.16、15.04±1.15、4.36±0.10)(均P<0.01)。体内实验结果发现,抑制JMJD3加剧了小鼠实验性牙周炎的骨丧失,增加了小鼠炎症牙周组织中巨噬细胞的M1极化,降低了M2极化。丝线结扎+生理盐水组的颊侧釉质牙骨质界至牙槽嵴顶的距离(CEJ-ABC)、腭侧CEJ-ABC及M1/M2型巨噬细胞比值[分别为(0.26±0.03)、(0.24±0.01)mm和0.35±0.10]均显著低于丝线结扎+GSK-J4组[分别为(0.34±0.04)、(0.30±0.05)mm和2.50±0.58](t=3.65,P=0.006;t=2.67,P=0.049;t=7.31,P=0.004)。结论单细胞测序及体内外实验验证JMJD3在牙周炎牙周组织中表达上调,JMJD3可能通过调控巨噬细胞极化抑制牙周炎的牙槽骨破坏,从而在牙周炎症过程中发挥保护作用。

关键词：牙周炎牙槽骨质丢失单细胞测序含Jumonji结构域蛋白3 巨噬细胞巨噬细胞极化

犬弓首蛔虫感染性幼虫宿主血清反应性微RNA的鉴定与功能分析

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浙江大学学报(农业与生命科学版) 2024年

作者：陈宜杨一帆陈学秋熊志威杨晨雨杨怡马光旭杜爱芳浙江大学动物科学学院动物预防医学研究所

弓首蛔虫病是一种被严重忽视的人畜共患寄生虫病，呈世界性分布，主要由犬弓首蛔虫的感染性幼虫在人及多种动物体内移行所致。本研究以犬弓首蛔虫组织移行的第1个环节“侵入宿主”为切入点，首先用5%健康小鼠血清体外刺激孵化的犬弓首... 详细信息

弓首蛔虫病是一种被严重忽视的人畜共患寄生虫病，呈世界性分布，主要由犬弓首蛔虫的感染性幼虫在人及多种动物体内移行所致。本研究以犬弓首蛔虫组织移行的第1个环节“侵入宿主”为切入点，首先用5%健康小鼠血清体外刺激孵化的犬弓首蛔虫感染性幼虫，然后提取虫体样本的总RNA进行小RNA测序（small RNA-seq），最后开展处理组与未处理组的虫体微RNA(microRNAs, miRNAs)差异转录分析及靶基因预测。结果显示，在4个处理组样本和4个未处理组样本中共检测到972个miRNAs，其中血清刺激造成15个miRNAs的转录水平发生显著变化；靶基因预测发现，这些转录水平发生显著变化的miRNAs靶向宿主免疫细胞黏附与迁移、嗅觉信号传导等相关基因，提示在寄生虫与宿主互作中发挥作用。本研究鉴定到了一组具有宿主血清反应性的犬弓首蛔虫感染性幼虫miRNAs，为其在感染宿主、免疫调控以及致病机制中的具体作用研究奠定了基础。

关键词：弓首蛔虫血清反应性微RNA 感染与免疫致病机制

捻转血矛线虫脱鞘三期幼虫与体外发育四期幼虫的比较代谢组学分析

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浙江大学学报(农业与生命科学版) 2024年

作者：禹阳陈学秋陈洁刘伟吴飞杨怡马光旭杜爱芳浙江大学动物科学学院动物预防医学研究所

血矛线虫病是我国规定的三类动物疫病，由捻转血矛线虫（Haemonchus contortus）寄生于反刍动物的皱胃引起，常在热带、亚热带和温带地区造成养殖业经济损失。本研究旨在通过揭示捻转血矛线虫脱鞘的感染性三期幼虫（xL3s）体外发育至寄... 详细信息

血矛线虫病是我国规定的三类动物疫病，由捻转血矛线虫（Haemonchus contortus）寄生于反刍动物的皱胃引起，常在热带、亚热带和温带地区造成养殖业经济损失。本研究旨在通过揭示捻转血矛线虫脱鞘的感染性三期幼虫（xL3s）体外发育至寄生性四期幼虫（L4s）的代谢组学变化，探究其侵入宿主与建立感染过程中的关键代谢活动。基于液相色谱-质谱联用分析，在捻转血矛线虫xL3s和L4s中共鉴定出14类1 968种代谢物；聚类分析发现，苯丙烷和聚酮类化合物在2个阶段的样本中具有显著性差异；代谢通路分析发现，氨基糖、核苷酸糖、花生四烯酸、酪氨酸、药物代谢以及泛醌和其他萜醌生物合成等在2个阶段存在显著差异。与感染性x L3s相比，L-酪氨酸在L4s中的变化最为显著，可能与虫体适应宿主环境相关，这为进一步研究捻转血矛线虫感染与寄生过程提供了新的思路。

关键词：捻转血矛线虫感染性幼虫寄生性幼虫代谢组学感染与寄生

捻转血矛线虫胰岛素样肽编码基因的鉴定、表达与组织定位

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中国兽医学报 2024年第6期44卷 1184-1193页

作者：刘伟吴飞陈学秋杜振东马光旭杜爱芳浙江大学动物科学学院动物预防医学研究所浙江省动物预防医学重点实验室浙江杭州310058

胰岛素样肽(insulin-like peptides,ILPs)在线虫新陈代谢、信号转导、发育进程等生物学过程中发挥重要作用,是控制动物寄生线虫感染的潜在靶标。为探究ILPs在寄生线虫发育与感染中的具体作用,对捻转血矛线虫(Haemonchus contortus,***)I... 详细信息

胰岛素样肽(insulin-like peptides,ILPs)在线虫新陈代谢、信号转导、发育进程等生物学过程中发挥重要作用,是控制动物寄生线虫感染的潜在靶标。为探究ILPs在寄生线虫发育与感染中的具体作用,对捻转血矛线虫(Haemonchus contortus,***)ILPs编码基因进行全基因组鉴定、序列和进化分析;通过实时荧光定量PCR方法检测***不同发育时期ILPs编码基因的转录水平;经原核表达ILPs重组蛋白用于多克隆抗体制备及Western blot分析;采用间接免疫荧光定位试验明确ILPs在***虫体不同发育阶段的组织分布情况。结果显示,与秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)相比,*** ILPs编码基因发生显著缩减,仅有3个具备拮抗性分子特性的ILPs编码基因;ILPs编码基因在***感染性三期幼虫阶段的转录水平最高;ILPs蛋白主要分布于感染性幼虫的肠道与皮下组织。本研究鉴定3个可能参与调控***幼虫发育进程及感染过程的拮抗性ILPs编码基因,为寄生线虫在宿主体内的滞育现象研究以及潜在干预靶标的筛选奠定了基础。

关键词：捻转血矛线虫胰岛素样肽原核表达组织定位发育调控幼虫滞育

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正加速度暴露对人体心率变异性的影响

陆军军医大学学报 2024年第1期46卷 33-38页

作者：翟佳刘秋红姚永杰海军军医大学海军特色医学中心航空医学研究室上海200433

目的探讨正加速度暴露对心率变异性(heart rate variability,HRV)的影响。方法本研究为单臂试验。于2023年7月23-25日,招募同一训练批次、飞行时长>300 h的12名受试者在载人离心机上进行峰值为+3.5、+4.25 Gz,持续时间各10 s的过载暴露... 详细信息

目的探讨正加速度暴露对心率变异性(heart rate variability,HRV)的影响。方法本研究为单臂试验。于2023年7月23-25日,招募同一训练批次、飞行时长>300 h的12名受试者在载人离心机上进行峰值为+3.5、+4.25 Gz,持续时间各10 s的过载暴露,监测并分析受试者在正加速度过载暴露中的心率、呼吸频率、短时程HRV时域及频域指标。结果12名受试者在负荷+3.5和+4.25 Gz正加速度暴露条件下:(1)心率分别为(135.42±14.78)/min和(143.92±14.47)/min,呼吸频率为(23.57±4.09)/min和(26.80±4.71)/min;较暴露前的(97.08±14.61)/min、(14.86±2.06)/min均显著增加(P0.05);(4)+3.5和+4.25 Gz暴露时的LF/HF值分别为(4.02±1.52)、(5.32±1.86),与暴露前的(0.67±0.32)比较均显著增加(P<0.05)。结论正加速度暴露显著影响心率、呼吸频率、RMSSD、LF/HF和HF等生理指标,提示正加速度暴露导致人体交感神经张力增大,心率变异性显著增加。

关键词：正加速度心率变异性载人离心机航空医学

肺动脉高压右心重构中心肌细胞的细胞死亡途径:探索重塑之路

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科学通报 2024年第13期69卷 1725-1741页

作者：王尚徐唯傑何雯妮胡肖依屈奕阳刘雨杨颜艺姜蓉同济大学医学院同济大学附属上海市肺科医院肺循环科上海200433 同济大学医学院同济大学附属上海市肺科医院检验科上海200433 同济大学医学院上海200092 国家儿童医学中心(上海) 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心心脏中心和上海市小儿先天性心脏病研究所上海200127

细胞死亡对于机体生长、发育和调节稳态非常关键,是心脏病理学中的一个基本过程.证据表明,在各种心血管系统疾病中,细胞凋亡、坏死性凋亡、线粒体通透性改变驱动的坏死、焦亡、铁死亡以及自噬等死亡方式在心脏重构、心力衰竭过程中起着... 详细信息

细胞死亡对于机体生长、发育和调节稳态非常关键,是心脏病理学中的一个基本过程.证据表明,在各种心血管系统疾病中,细胞凋亡、坏死性凋亡、线粒体通透性改变驱动的坏死、焦亡、铁死亡以及自噬等死亡方式在心脏重构、心力衰竭过程中起着重要作用.随着肺动脉高压的进展,右心室发生失代偿性肥大,最终导致心室衰竭并伴随着心肌细胞死亡.因此,探讨此过程中心肌细胞死亡的具体机制对于改善患者预后意义重大.本文综述了各种心肌细胞死亡方式的信号通路和各种细胞死亡方式的检测、评估方法,总结了肺动脉高压中心肌细胞死亡方式的有关研究现况,讨论了针对不同细胞死亡方式研究对于肺动脉高压靶向治疗的研究前景.

关键词：肺动脉高压凋亡坏死性凋亡线粒体通透性改变驱动的坏死焦亡铁死亡

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集装箱海铁联运补贴优化研究

交通运输系统工程与信息 2024年第1期24卷 35-45页

作者：吴云强解乔雅张戎同济大学城市交通研究院上海201804 同济大学道路与交通工程教育部重点实验室上海201804

补贴是一种被政府广泛采用且能够有效促进海铁联运发展的措施。本文研究包括3种运输方式和两个起运港的集装箱运输系统中的海铁联运协同补贴优化问题。首先,构建双层规划模型描述政府与托运人之间的博弈关系,上层模型从政府角度出发,以... 详细信息

补贴是一种被政府广泛采用且能够有效促进海铁联运发展的措施。本文研究包括3种运输方式和两个起运港的集装箱运输系统中的海铁联运协同补贴优化问题。首先,构建双层规划模型描述政府与托运人之间的博弈关系,上层模型从政府角度出发,以海铁联运运量最大为目标,确定海铁联运班列单个重箱补贴金额;下层模型基于熵最大化理论,构建能力约束型巢式Logit模型描述托运人对起运港和运输方式的选择行为。其次,通过Karush-Kuhn-Tucker条件将双层模型转化为单层模型,并利用松弛迭代算法求解。结果表明:补贴会促进海铁联运运量的增长,其增量主要来自公海联运转移的货运量,少部分来自水水联运转移;相比于不协同补贴,协同补贴不仅显著降低单箱补贴金额,还能提高海铁联运运量;货物时间价值对补贴效果产生影响,补贴具有中等时间价值货物的托运人将会获得最佳结果。

关键词：综合运输补贴双层规划模型海铁联运能力约束型巢式Logit模型

基于图网络的汽车零部件应力场快速预测方法研究

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汽车工程 2024年第1期46卷 170-178页

作者：高泽楚遵康石稼晟林滏饶卫雄余海燕同济大学汽车学院上海201804 同济大学软件学院上海201804

有限元分析作为一种重要的计算机辅助工程技术,在汽车零部件开发中起着极为重要的作用,但是在分析复杂问题时耗时长,影响开发周期。为此,本文提出了一种以有限元仿真提供样本数据、以图网络技术建立有限元输入与输出间的映射关系的神经... 详细信息

有限元分析作为一种重要的计算机辅助工程技术,在汽车零部件开发中起着极为重要的作用,但是在分析复杂问题时耗时长,影响开发周期。为此,本文提出了一种以有限元仿真提供样本数据、以图网络技术建立有限元输入与输出间的映射关系的神经网络方法,将该图网络方法应用于座椅骨架总成的应力场预测。该预测方法中采用图节点和图边模拟了有限元模型中节点间的连接关系,由此表达有限元模型中单元之间的拓扑关系,并将预测结果与有限元仿真结果进行了对比。结果表明该方法能准确预测座椅骨架总成的最大应力及其出现的位置,对应力分布一致性均有较好的预测能力,且计算速度比相应有限元求解度快3个数量级以上。

关键词：有限元分析深度学习图网络汽车座椅

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基于BIM的自动合规性审查研究综述

土木工程学报 2024年第4期57卷 102-110页

作者：周逸苇王广斌曹冬平同济大学上海200092

随着BIM技术在建筑领域的深度应用,越来越多的建筑设计开始以BIM模型方式进行交付,基于BIM的建筑工程设计自动合规性审查因其客观性、高效性受到理论和实践领域越来越多的关注。文章以基于BIM的自动合规性审查为主题进行综述,在Web of S... 详细信息

随着BIM技术在建筑领域的深度应用,越来越多的建筑设计开始以BIM模型方式进行交付,基于BIM的建筑工程设计自动合规性审查因其客观性、高效性受到理论和实践领域越来越多的关注。文章以基于BIM的自动合规性审查为主题进行综述,在Web of Science核心数据库对建筑领域自动合规性审查相关的研究文献进行全面检索及分析,从基本框架、规范条文信息抽取、BIM模型信息抽取及语义丰富、规范-模型信息匹配、合规性推理等方面对现有基于BIM的自动合规性审查研究进行系统解构,并对未来的研究方向进行讨论。最后,文章指出基于BIM的自动合规性审查在复杂文本信息抽取的性能与深度、模型语义丰富、信息匹配的自动化程度与通用性,以及计算机代码的透明度与灵活性等方面仍面临巨大挑战。

关键词：建筑信息模型自动合规性审查信息抽取语义丰富信息匹配