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转录因子NKX2.1促进诱导多能干细胞向肺干细胞的分化

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中国组织工程研究 2025年第36期29卷 7790-7796页

作者：邓丽刘洋王慧杨秋董明清成都市第五人民医院医学研究与转化中心四川省成都市611130

目的:探究NKX2.1对诱导多能干细胞向肺干细胞方向分化的影响。方法:体外培养人诱导多能干细胞,采用实时荧光定量PCR和免疫荧光检测多能干细胞特异基因的表达;通过瞬时转染向人诱导多能干细胞中过表达NKX2.1,再诱导其向肺干细胞方向分化... 详细信息

目的:探究NKX2.1对诱导多能干细胞向肺干细胞方向分化的影响。方法:体外培养人诱导多能干细胞,采用实时荧光定量PCR和免疫荧光检测多能干细胞特异基因的表达;通过瞬时转染向人诱导多能干细胞中过表达NKX2.1,再诱导其向肺干细胞方向分化,诱导分化7 d采用实时荧光定量PCR、免疫荧光检测FoxA2、SOX9和P63的表达,诱导分化13 d采用免疫荧光检测肺泡细胞标记分子SPB和SPC的表达。结果与结论:(1)诱导多能干细胞紧密集结呈典型克隆样生长,显著高表达干细胞特异表达基因OCT-4、SOX2和NANOG;(2)与未转染对照组相比,过表达NKX2.1组人诱导多能干细胞中NKX2.1表达显著升高(P干细胞相关标记物FoxA2、SOX9和P63的表达显著升高(P细胞标记分子SPB和SPC荧光强度显著增加。结果表明NKX2.1可以促进诱导多能干细胞向肺干细胞方向分化。

关键词：诱导多能干细胞肺干细胞 NKX2.1 定型内胚层前肠内胚层肺损伤工程化干细胞

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mRNA表观修饰方式及m^6A功能研究进展

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生物工程学报 2019年第5期35卷 775-783页

作者：甘海丽洪岭杨凤莲柳定凤金莉萍郑青亮同济大学附属第一妇婴保健院临床转化研究中心上海201204

mRNA上能发生100多种化学修饰,其中N^6-腺嘌呤(m^6A)是mRNA修饰中最广泛的表观修饰方式之一。在细胞分化、胚胎发育和应激等生物学过程中,特定的mRNA会发生包括N^1-腺嘌呤甲基化、N^5-胞嘧啶甲基化、假尿嘧啶以及N`6-腺嘌呤甲基化等修饰... 详细信息

mRNA上能发生100多种化学修饰,其中N^6-腺嘌呤(m^6A)是mRNA修饰中最广泛的表观修饰方式之一。在细胞分化、胚胎发育和应激等生物学过程中,特定的mRNA会发生包括N^1-腺嘌呤甲基化、N^5-胞嘧啶甲基化、假尿嘧啶以及N`6-腺嘌呤甲基化等修饰,它们共同形成了mRNA转录后调控的表观修饰转录组,实现对mRNA翻译成蛋白质过程的精确时空调控,特别是m^6A修饰能通过调控mRNA的代谢和翻译等进而调控细胞的一系列生物学过程。文中主要综述mRNA的表观修饰类型和特点,特别是m^6A修饰参与调控mRNA和细胞生物学功能的最新研究进展,并展望了将来m^6A表观修饰的研究重点和方向。

关键词： mRNA表观修饰 m^6A m^1A 假尿嘧啶 mRNA代谢细胞分化

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椎间盘退变中的力学信号转导蛋白

中国组织工程研究 2025年第3期29卷 579-589页

作者：高夕林吴思张超朱立国符碧峰王平天津中医药大学第一附属医院天津市300193 国家中医针灸临床医学研究中心天津市300193 中国中医科学院望京医院北京市100102

背景:近年来的研究表明椎间盘退变与异常压力负荷密切相关,而力学信号转导蛋白在其中发挥了关键作用。目的:探讨力学信号转导蛋白在异常机械力刺激诱导椎间盘退变的力化学信号换能过程中发挥的作用及机制,总结目前靶向力学信号延缓椎间... 详细信息

背景:近年来的研究表明椎间盘退变与异常压力负荷密切相关,而力学信号转导蛋白在其中发挥了关键作用。目的:探讨力学信号转导蛋白在异常机械力刺激诱导椎间盘退变的力化学信号换能过程中发挥的作用及机制,总结目前靶向力学信号延缓椎间盘退变的治疗策略。方法:以“椎间盘,髓核,纤维环,软骨终板,细胞,力,信号转导,蛋白,生物力学”为中文检索词,以“intervertebral disc,nucleus pulposus,annulus fibrosus,cartilaginous endplate,cell,mechanical stimulation,signal transduction,protein,biomechanics”为英文检索词,检索PubMed、CNKI数据库中的相关文献,最终纳入88篇文献进行综述。结果与结论:椎间盘细胞能通过多种力学信号转导蛋白感知外界机械刺激并将其转化为细胞内生物学反应,这些转导蛋白主要包括细胞外基质中的胶原蛋白、细胞膜表面受体(如整合素及离子通道)、细胞骨架结构蛋白等。力学信号转导蛋白调控力化学信号换能的过程主要包括多个通路的激活,如PI3K/AKT信号通路、核因子κB信号通路、Ca^(2+)/Calpain2/Caspase3通路等。力学信号转导蛋白在椎间盘细胞机械信号换能中发挥了关键作用,这些蛋白表达异常或由此导致的细胞外基质环境改变会破坏椎间盘细胞的力学平衡,引发椎间盘退变。深入研究椎间盘细胞力学信号转导蛋白的表达及调控机制,寻找关键的病理环节和治疗靶点,对开发椎间盘退变治疗策略具有重要意义,目前靶向力学信号延缓椎间盘退变的策略主要包括对转导蛋白的调控、对细胞外基质的改良等,然而这方面研究还处于初级阶段,随着研究的不断深入,力学信号转导蛋白调控椎间盘退变有望实现新的突破。

关键词：力学信号转导蛋白质椎间盘退变靶向力学信号生物力学

基于生物信息学和实验验证探讨温经汤通过PI3K/Akt/mTOR通路对子宫内膜异位症自噬的影响

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中国中医药信息杂志 2025年第1期32卷 60-68页

作者：张翼吴璐璐贺冰梁莹莹唐俐谭泉宁湖南中医药大学第二附属医院湖南长沙410005 华中科技大学同济医学院附属武汉中心医院湖北武汉430014 湖南中医药大学湖南长沙410000

目的采用生物信息学方法及体外实验探讨温经汤治疗子宫内膜异位症的机制。方法通过TCMSP数据库收集温经汤有效成分及相关靶点,利用GEO数据库筛选子宫内膜异位症相关靶点并对靶点进行功能富集分析,预测温经汤治疗子宫内膜异位症的核心靶... 详细信息

目的采用生物信息学方法及体外实验探讨温经汤治疗子宫内膜异位症的机制。方法通过TCMSP数据库收集温经汤有效成分及相关靶点,利用GEO数据库筛选子宫内膜异位症相关靶点并对靶点进行功能富集分析,预测温经汤治疗子宫内膜异位症的核心靶点并对核心靶点-药物配体进行分子对接,通过体外实验对结果进行验证。结果通过TCMSP数据库筛选获得温经汤有效成分117种,对应靶点248个;GEO数据库收集子宫内膜异位症相关差异基因5312个;温经汤治疗子宫内膜异位症的潜在作用靶点97个,核心靶点为IL6、TNF、EGFR。子宫内膜异位症差异基因主要富集于神经活性配体-受体相互作用、MAPK信号通路、内吞作用、钙信号通路、自噬、PI3K-Akt信号通路等。分子对接表明IL6、TNF、EGFR与相应药物配体结合稳定。体外实验表明,温经汤可抑制PI3K/Akt/mTOR通路表达,促进LC3Ⅰ向LC3Ⅱ转化,增加Beclin-1表达,抑制P62表达。温经汤还可抑制子宫内膜异位症特异性生物标志物CA125表达,减少异位内膜细胞表皮生长因子受体、白细胞介素-6和肿瘤坏死因子-α表达,抑制异位内膜细胞增殖。结论温经汤可通过多途径、多靶点治疗子宫内膜异位症。其中,通过抑制PI3K/Akt/mTOR表达逆转自噬抑制是重要机制之一。

关键词：温经汤子宫内膜异位症生物信息学 PI3K/Akt/mTOR信号通路

扶正通络解毒方对慢性萎缩性胃炎“炎-癌”转化小鼠的作用及机制研究

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中药新药与临床药理 2025年

作者：杨泽虹麦紫涵陈彦彤江晓涛安金琪阮舒琪曾颖凤文艺李培武刘凤斌广州中医药大学第一附属医院广东省中医临床研究院广州中医药大学博士后科研流动站广州中医药大学第一临床医学院广州中医药大学继续教育学院梅州市中医医院广州中医药大学第一附属医院白云医院

目的探讨扶正通络解毒方（FTJF）干预慢性萎缩性胃炎（CAG）“炎-癌”转化的作用机制。方法（1）通过检索TCMSP、HERB数据库检索、筛选出FTJF方中各中药的活性成分及其对应的作用靶点；通过GeneCards、OMIM、Drugbank、TTD和DisDeNet... 详细信息

目的探讨扶正通络解毒方（FTJF）干预慢性萎缩性胃炎（CAG）“炎-癌”转化的作用机制。方法（1）通过检索TCMSP、HERB数据库检索、筛选出FTJF方中各中药的活性成分及其对应的作用靶点；通过GeneCards、OMIM、Drugbank、TTD和DisDeNet数据库检索、筛选获得CAG“炎-癌”转化相关疾病靶点；使用Venny 2.1在线平台对FTJF活性成分作用靶点与CAG“炎-癌”转化疾病靶点取交集，获得FTJF干预CAG“炎-癌”转化的潜在作用靶点。通过Cytoscape 3.9.1软件构建“药物-活性成分-靶点”网络，并筛选出核心活性成分；通过STRING数据库进行潜在作用靶点蛋白互作（PPI）网络分析，筛选核心靶点；通过DAVID数据库对核潜在作用靶点进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。（2）采用N-甲基-N-亚硝基脲（MNU）化学诱导法复制CAG “炎-癌”转化小鼠模型。将C57BL/6小鼠随机分为空白组、模型组及FTJF低、中、高剂量组(生药量9.56、19.11、38.22 g·kg-1)，每组10只，灌胃给药，每日1次，持续8周。采用苏木精-伊红（HE）染色法及阿利新蓝/过碘酸雪夫（AB/PAS）染色法观察胃黏膜组织病理变化；ELISA法检测血清胃功能激素胃蛋白酶原I（PGⅠ）、胃蛋白酶原II（PGⅡ）、胃泌素17（G-17）和炎性因子白细胞介素6（IL-6）、肿瘤坏死因子α（TNF-α）、白细胞介素1β（L-1β）的水平；q-PCR法检测胃黏膜组织肿瘤蛋白p53（TP53）、髓细胞增生原癌基因（MYC）、表皮生长因子受体（EGFR）基因表达水平。结果（1）共筛选得到199种活性成分，795个作用靶点，2 074个疾病相关靶点，FTJF干预CAG“炎-癌”转化的307个潜在作用靶点。分析得到槲皮素、黄酮、芹菜素、木犀草素、熊果酸等核心活性成分；TP53、AKT1、GAPDH、MYC、EGFR、VEGFA、TNF、JUN、CASP3、INS等核心靶点；KEGG通路富集分析主要涉及癌症通路、乙型肝炎、PI3K /Akt信号通路等。（2）与空白组比较，模型组小鼠胃黏膜结构严重破坏，细胞排列紊乱，可见大量炎性细胞浸润，细胞明显空泡样变，腺腔形成大小不等的黏液湖，有分泌酸性黏液的肠化生腺体形成；部分黏膜呈锯齿样或U型管样，两个或多个腺腔单层上皮变为多层无规则排列、无管腔结构的细胞团，表现出组织异型性；血清PGⅠ水平显著降低（P＜0.001），PGⅡ、G-17、IL-6、TNF-α、IL-1β水平均显著升高（P＜0.001）；胃黏膜组织TP53 mRNA表达显著下调（P＜0.001），MYC、EGFR mRNA表达显著上调（P＜0.05，P＜0.01）。与模型组比较，FTJF各剂量组小鼠胃黏膜组织细胞形态异常情况均有所好转，炎性浸润区域减少，空泡样变、黏液湖及组织异型性减少；血清PGI水平显著升高（P＜0.05，P＜0.001），PGⅡ、IL-6、TNF-α水平均显著降低（P＜0.05，P＜0.01，P＜0.001）；胃黏膜组织TP53 mRNA表达显著上调（P＜0.05，P＜0.01），MYC、EGFR mRNA表达明显下调（P＜0.05，P＜0.01）。FTJF中、高剂量组的血清G-17、IL-1β水平显著降低（P＜0.05，P＜0.01，P＜0.001）。结论 FTJF可能通过槲皮素、黄酮、芹菜素等多种活性成分，调节胃功能激素分泌水平、减轻炎症反应、下调癌症信号通路，发挥干预CAG “炎-癌”转化的作用。

关键词：扶正通络解毒方慢性萎缩性胃炎 “炎-癌”转化胃功能激素炎症反应癌症通路小鼠

高迁移率族蛋白B1(HMGB1)促进髓样树突状细胞成熟增加原发免疫性血小板减少症患者Th17细胞/Treg比例

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细胞与分子免疫学杂志 2025年第1期41卷 45-50页

作者：李芹芝段东升王秀娟孙明玲刘颖王新有王蕾范文霞宋梦婷郭新红新疆医科大学第一附属医院血液病中心新疆维吾尔自治区血液病研究所新疆血液病临床医学研究中心新疆乌鲁木齐830011

目的研究原发免疫性血小板减少症(ITP)患者外周血中高迁移率族蛋白B1(HMGB1)对髓样树突状细胞(mDC)及Th17细胞/调节性T细胞(Treg)平衡的调节作用。方法募集30例初诊ITP患者及30例健康对照,采用流式细胞术检测ITP患者及健康对照组外周血... 详细信息

目的研究原发免疫性血小板减少症(ITP)患者外周血中高迁移率族蛋白B1(HMGB1)对髓样树突状细胞(mDC)及Th17细胞/调节性T细胞(Treg)平衡的调节作用。方法募集30例初诊ITP患者及30例健康对照,采用流式细胞术检测ITP患者及健康对照组外周血mDC、Th17细胞、Treg比例,ELISA测定血清中HMGB1、白细胞介素6(IL-6)、IL-23、IL-17、转化生长因子β(TGF-β)的含量,实时荧光定量PCR检测外周血单个核细胞维甲酸相关孤核受体γt(RORγt)、叉头盒转录因子P3(FOXP3)的mRNA表达,通过Pearson线性相关分析方法分析上述细胞、细胞因子、转录因子及其与血小板之间的相关关系,探究HMGB1对mDC及Th17细胞/Treg平衡的影响。结果与对照组相比,ITP患者组外周血中Th17细胞比例及HMGB1、IL-6、IL-23、IL-17水平及RORγt mRNA表达明显增高,而Treg比例和TGF-β水平降低。ITP患者组mDC比例和FOXP3 mRNA水平变化不明显。mDC的比例与IL-6、IL-23的表达显著正相关;HMGB1的表达与mDC、IL-6、IL-23、RORγt mRNA、IL-17的表达显著正相关;mDC的比例、HMGB1的表达水平与血小板计数呈显著负相关。结论ITP患者外周血中HMGB1的高表达可能通过促进mDC的成熟并增加相关细胞因子的分泌,诱导Th17细胞/Treg失衡,可能参与ITP发病的免疫学机制。

关键词：原发免疫性血小板减少症高迁移率族蛋白B1(HMGB1) 髓样树突状细胞(mDC) Th17细胞 Treg

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IFN-γ调节间充质干细胞免疫应答的分子机制

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同济大学学报（医学版） 2020年第6期41卷 683-690页

作者：王艺静高文霞石凯燕施佳玉孙毅同济大学医学院上海200092 同济大学附属同济医院干细胞临床转化中心上海200065

目的通过基因芯片数据,比较不同浓度的炎症因子IFN-γ预处理对间充质干细胞(mesenchymal stem/stromal cells,MSCs)免疫应答的影响。方法从GEO数据库下载GSE77814骨髓间充质干细胞经不同浓度的IFN-γ预处理及未处理的基因表达数据,借助G... 详细信息

目的通过基因芯片数据,比较不同浓度的炎症因子IFN-γ预处理对间充质干细胞(mesenchymal stem/stromal cells,MSCs)免疫应答的影响。方法从GEO数据库下载GSE77814骨髓间充质干细胞经不同浓度的IFN-γ预处理及未处理的基因表达数据,借助GEO2R分析差异基因(differentially expressed genes,DEGs)。随后对差异基因进行GO富集分析(DAVID数据库)、KEGG通路富集分析(KEGG Mapper/GSEA)、蛋白分析(Uniprot数据库)、并构建差异基因蛋白质蛋白质相互作用关系(PPI),筛选hub基因。结果IFN-γ低浓度组与未处理组相比,共筛选出152个差异基因(以下简称IFN-γ-L DEGs),其中133个为上调基因,19个为下调基因。IFN-γ高浓度组与未处理组相比,共筛选出648个差异基因(以下简称IFN-γ-H DEGs),其中431个为上调基因,217个为下调基因。差异基因多与免疫反应、炎症、病毒反应相关。IFN-γ高浓度处理比低浓度处理上调表达更多趋化因子和抑炎因子。IFN-γ-H DEGs同IFN-γ-L DEGs在GO富集分析、KEGG通路富集分析、蛋白分析上的结果接近,但IFN-γ-H DEGs在代谢通路上富集显著。结论炎症因子IFN-γ对MSCs的转录组具有较大影响,尤其是对免疫应答相关的基因,并且与处理浓度有密切关系。此外,MSCs行使免疫抑制能力可能需要较高浓度的炎症因子授权。

关键词：间充质干细胞免疫应答免疫调节 IFN-γ GEO数据库

人源脐带间充质干细胞对脑缺血再灌注小鼠神经功能及神经炎症的影响

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同济大学学报（医学版） 2020年第5期41卷 537-545页

作者：石凯燕张春雪王艺静王臻孙毅同济大学医学院上海200092 同济大学附属同济医院干细胞临床转化中心上海200065

目的探究人源脐带间充质干细胞对脑缺血再灌注损伤小鼠神经功能及神经炎症的影响。方法将96只野生型C57BL/6小鼠随机分为假手术组、磷酸盐缓冲液(PBS)处理组、WJ-MSCs细胞移植组,每组32只。PBS处理组和细胞移植组小鼠通过线栓法构建大... 详细信息

目的探究人源脐带间充质干细胞对脑缺血再灌注损伤小鼠神经功能及神经炎症的影响。方法将96只野生型C57BL/6小鼠随机分为假手术组、磷酸盐缓冲液(PBS)处理组、WJ-MSCs细胞移植组,每组32只。PBS处理组和细胞移植组小鼠通过线栓法构建大脑中动脉阻塞再灌注模型;术后24 h,通过脑立体定位技术注射细胞悬液或PBS溶液。每组取6只小鼠,干细胞移植后对小鼠腹腔注射BrdU溶液,持续5 d。于术前及术后1、6、12、24 d对各组小鼠进行改良神经功能损伤评分;术后6 d时,采用神经元标志物NeuN免疫荧光单标记染色技术检测缺血侧大脑梗死灶及梗死灶周围区皮质神经元的变性丢失情况;采用RT-qPCR技术检测各组小鼠缺血侧大脑半球炎症因子的表达量;采用小胶质细胞/巨噬细胞标志物Iba1及增殖标记物BrdU免疫荧光双标记染色技术检测小胶质细胞/巨噬细胞的活化和增殖情况。结果与PBS处理组相比,WJ-MSCs细胞移植组小鼠神经功能显著改善(P细胞移植组小鼠缺血侧脑组织的抗炎因子表达量升高,促炎因子表达量下降,差异具有统计学意义(P细胞移植组小鼠缺血侧梗死灶和梗死灶周围区皮质小胶质细胞/巨噬细胞的活化显著抑制(P细胞/巨噬细胞的增殖明显降低(P干细胞可抑制神经炎症反应并改善脑缺血再灌注小鼠的神经功能。

关键词：脑缺血脐带间充质干细胞神经元神经炎症小胶质细胞/巨噬细胞

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人不同组织间充质干细胞免疫调控能力的比较

同济大学学报（医学版） 2017年第6期38卷 12-17页

作者：刘贤俊刘海亮景波张春雪孙毅同济大学医学院上海200092 同济大学附属同济医院干细胞临床转化中心上海200065

目的比较人5种不同组织来源间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)免疫调控能力的差异。方法炎症因子干扰素γ(interferon gamma,IFNγ)和肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor alpha,TNFα)可诱导MSCs高表达吲哚胺-2,3-双加氧酶(indole-amine-2,3-dioxygenase,IDO)和趋化因子,从而抑制抗CD3/CD28抗体激活的T细胞增殖。通过RT-PCR及Western印迹法检测抑制T细胞增殖相关基因表达。使用Cell Tracer Violet的染料对T细胞进行标记,检测其增殖能力变化。同时,使用Ed U染色检测MSCs细胞增殖。过程炎症因子刺激后的MSCs与PBMC进行共培养,检测PBMC的增殖情况,同时检测MSCs相关基因表达及其增殖情况。结果炎症因子刺激的MSCs对抗CD3/28抗体激活的单个核细胞增殖有明显抑制作用,不同组织来源MSCs对单个核细胞增殖的抑制作用无明显区别。结论与骨髓来源MSCs相比,其他组织来源MSCs对单个核细胞免疫调节作用无明显区别。

关键词：免疫调控间充质干细胞单个核细胞吲哚胺-2,3-双加氧酶趋化因子