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基于红景天苷对三阴性乳腺癌关键差异基因作用机制的生物信息学和分子对接技术分析

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吉林大学学报（医学版） 2024年第3期50卷 759-769页

作者：朱紫嘉陈霞崔曼文继红王苹宋东吉林大学第一医院乳腺外科吉林长春130021 吉林大学基础医学院药理学系吉林长春130021 吉林大学第一医院普通妇一科吉林长春130021 吉林大学第一医院耳鼻咽喉-头颈外科吉林长春130021

目的:通过生物信息学和网络药理学方法探讨红景天苷治疗三阴性乳腺癌(TNBC)的作用机制,阐明其产生治疗作用的主要靶点和信号通路。方法:通过基因表达综合数据库(GEO)获取数据集GSE45827,利用R软件包GSEABase进行基因集富集分析(GSEA),采... 详细信息

目的:通过生物信息学和网络药理学方法探讨红景天苷治疗三阴性乳腺癌(TNBC)的作用机制,阐明其产生治疗作用的主要靶点和信号通路。方法:通过基因表达综合数据库(GEO)获取数据集GSE45827,利用R软件包GSEABase进行基因集富集分析(GSEA),采用limma R软件包寻找相邻正常组织和TNBC组织之间的差异表达基因(DEGs),对DEGs进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,将DEGs与药物靶点结合,导入基因/蛋白相互作用检索搜查工具String数据库,形成蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络。使用MCODE插件对PPI网络进行功能模块筛选,对SCORE值排名前2位的关键模块基因再次进行GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析。将2次KEGG富集分析所得通路与转录组数据GSEA富集分析结果取交集,获得红景天苷治疗TNBC的作用通路。使用CytoHubba插件计算出关键模块中最大团中心性(MCC)评分前10位的关键节点基因,即为核心基因。应用AutoDock Vina 1.1.2和PyMOL 2.3.0软件完成分子对接。结果:KEGG与GSEA富集分析的结果取交集得到13条共同通路,涉及细胞周期、细胞衰老和p53信号通路等。GO功能富集分析结果中所涉及的有丝分裂、核分裂和姐妹染色单体分离等生物学过程与细胞周期有密切关联,与KEGG富集分析结果一致。SCORE值排名第1位的关键模块中包含5个红景天苷药物作用靶点,分别为重组人细胞周期蛋白A2(CCNA2)、细胞周期检查点激酶1(CHEK1)、驱动蛋白家族成员11(KIF11)、DNA拓扑异构酶2(TOP2A)和胸腺嘧啶酸合酶(TYMS),将上述蛋白与红景天苷进行分子对接,结果均表现出很强的结合能力(结合能<-7.0 kcal·mol^(-1))。结论:红景天苷的紧密结合靶标位于TNBC的DEGs关键功能模块中,可以与CCNA2蛋白结合产生直接的调控作用,与KIF11、TOPA2、CHEK1和TYMS蛋白结合可针对TNBC的关键节点基因产生间接的调控作用,红景天苷有可能成为TNBC的临床治疗药物。

关键词：红景天苷三阴性乳腺癌生物信息学网络药理学分子对接

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尿沉渣评分对急性肾损伤诊断的临床应用研究

中华检验医学杂志 2024年第5期47卷 548-553页

作者：张慧续薇曲林琳赵春贺单洪丽张勤高洪臣孙文瑞朱丽娜张月闫欣杨笑权王婉宁张东付尧赵旭何亮吉林大学第一医院检验科长春130021 北华大学医学技术学院吉林132013 吉林大学第一医院肾病内科长春130021 吉林大学第一医院重症医学科长春130021 吉林大学第一医院肝胆胰内科长春130021 吉林大学第一医院普通外科中心胃结直肠外科长春130021

目的:评估尿沉渣评分(USS)在急性肾损伤(AKI)的早期诊断、病因鉴别、分期及预后判断中的临床应用,探讨独立的USS及其联合血尿素氮(Bun)、血清肌酐(sCr)和尿酸(UA)对AKI的诊断效能。方法:收集2023年8月23日至9月28日期间吉林大学第一医... 详细信息

目的:评估尿沉渣评分(USS)在急性肾损伤(AKI)的早期诊断、病因鉴别、分期及预后判断中的临床应用,探讨独立的USS及其联合血尿素氮(Bun)、血清肌酐(sCr)和尿酸(UA)对AKI的诊断效能。方法:收集2023年8月23日至9月28日期间吉林大学第一医院住院患者9020份晨尿标本,经Sysmex UF5000检测,筛出小而圆形上皮细胞(SRC)>1/μl和/或管型(CAST)>1/μl 3226份进行尿沉渣镜检,选取肾小管上皮细胞和/或CAST阳性的404例入组,其中男218例,女186例,年龄59.5(49.0,71.0)岁。404例分组方法:依据镜检结果的USS分为USS AKI组(345例)和USS非AKI组(59例);依据改善全球肾脏病预后组织(KDIGO)标准,分为KDIGO标准AKI组(63例)和KDIGO标准非AKI组(341例);依据病历记载的临床诊断,分为临床诊断AKI组(29例)和临床诊断非AKI组(375例);通过查阅病历,对KDIGO标准AKI组按病因分为肾性AKI组(33例)和非肾性AKI组(30例)。采用χ^(2)检验或Fisher精确检验比较不同AKI病因、分期的USS。采用Logistic回归法计算发生肾性AKI及3期AKI的优势比。应用受试者工作特征曲线下面积评价USS、sCr、UA、Bun单独及联合诊断AKI的敏感度、特异度并计算诊断AKI的最佳截断值、敏感度与特异度。结果:以USS对KDIGO标准AKI组进行病因鉴别,肾性与非肾性AKI的USS比较差异有统计学意义(χ^(2)=11.070,P<0.001)。与USS=1相比,当USS≥2分时肾性AKI的优势比为8.125(95%CI 2.208~29.901)。以USS进行AKI分期研究,各期USS的组间比较差异有统计学意义(χ^(2)=15.724,P<0.05)。与USS=1分相比,当USS≥2分时发生3期AKI优势比为9.714(95%CI 1.145~82.390)。独立的USS诊断AKI的AUC为0.687(95%CI 0.618~0.757,P<0.001),特异度65.7%,敏感度61.9%;USS联合Bun、sCr、UA诊断AKI的AUC为0.794(95%CI 0.608~0.980,P<0.05),特异度82.4%,敏感度88.9%。结论:USS≥2分提示发生肾性AKI或3期AKI的可能性增加,USS联合Bun、sCr、UA可提高AKI诊断效能。

关键词：尿尿沉渣评分急性肾损伤尿沉渣镜检检验临床应用

放射性粒子125I体外实验模型的发展和现状

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中国实验诊断学 2024年第2期28卷 241-244页

作者：韩莹波杨泽成董红梅孙雅敏张舵舵吉林大学第二医院胃肠外科吉林长春130022 吉林大学第一医院胸外科吉林长春130021

放射性粒子125I植入术作为临床治疗肿瘤的重要手段之一,近些年已在临床应用越来越广泛,并取得了令人瞩目的效果[1-5]。在我国,临床上主要使用的125I放射性粒子为6711型,结构见图1[6],半衰期59.6天,主要发射光子能量为 27.4 keV、31.4 k... 详细信息

放射性粒子125I植入术作为临床治疗肿瘤的重要手段之一,近些年已在临床应用越来越广泛,并取得了令人瞩目的效果[1-5]。在我国,临床上主要使用的125I放射性粒子为6711型,结构见图1[6],半衰期59.6天,主要发射光子能量为 27.4 keV、31.4 keV 的X射线和光子能量为35.5 keV的γ射线,半价层为0.025 mmPb。放射性粒子植入术属于近距离放射治疗范围,不同于其他放射治疗方法,是采用极低剂量率持续照射肿瘤来获得治疗效果的。

关键词：近距离放射治疗 125I放射性粒子半价层放射治疗方法光子能量放射性粒子植入术治疗肿瘤发展和现状

基于加速康复外科理念的循证护理对肾结石手术患者康复效果、并发症和生活质量的影响分析

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中文科技期刊数据库（引文版）医药卫生 2024年第9期 0190-0193页

作者：陆航通化市人民医院胸外科泌尿外科吉林通化134001

分析基于加速康复外科(ERAS)理念的循证护理对肾结石手术患者康复效果、并发症和生活质量的影响。方法选取82例我院收治的肾结石手术患者,随机分为观察组(n=41,基于ERAS理念的循证护理)和对照组(n=41,常规护理)。结果观察组的术后康... 详细信息

分析基于加速康复外科(ERAS)理念的循证护理对肾结石手术患者康复效果、并发症和生活质量的影响。方法选取82例我院收治的肾结石手术患者,随机分为观察组(n=41,基于ERAS理念的循证护理)和对照组(n=41,常规护理)。结果观察组的术后康复时间短于对照组;VAS评分、并发症发生率少于对照组;生活质量评分,高于对照组(P<0.05)。结论基于ERAS理念的循证护理可缩短肾结石手术患者的术后康复时间,减少并发症,提高生活质量。

关键词：加速康复外科理念循证护理肾结石手术疼痛程度并发症生活质量

舒适护理对肺癌患者身心舒适度和康复效果的影响分析

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中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生 2024年第10期 0185-0188页

作者：陆航通化市人民医院胸外科泌尿外科吉林通化134001

分析舒适护理对肺癌患者身心舒适度和康复效果的影响分析。方法选取在我院行手术治疗的肺癌患者72例,随机分为对照组(n=36,常规围手术期护理)和观察组(n=36,舒适围手术期护理)。结果干预后,观察组的舒适度评分、生活质量评分,均高于... 详细信息

分析舒适护理对肺癌患者身心舒适度和康复效果的影响分析。方法选取在我院行手术治疗的肺癌患者72例,随机分为对照组(n=36,常规围手术期护理)和观察组(n=36,舒适围手术期护理)。结果干预后,观察组的舒适度评分、生活质量评分,均高于对照组;不良心理情绪评分低于对照组;术后康复效果优于对照组(P<0.05)。结论舒适护理可提升肺癌患者手术期间的身心舒适度,减轻其不良情绪,从而促进患者快速康复,提高其生活质量。

关键词：舒适护理肺癌舒适度不良情绪康复效果生活质量

通用转录因子2I在胶质母细胞瘤替莫唑胺化疗抵抗中的作用

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吉林大学学报（医学版） 2024年第2期50卷 457-464页

作者：周建国姜红建朱其辉张耿强邓琪琳齐玲李凯舒于洪泉吉林大学第一医院神经肿瘤外科吉林长春130021 广州医科大学附属清远医院神经外科广东清远511518

目的:探讨通用转录因子2I(GTF2I)在胶质母细胞瘤(GBM)替莫唑胺化疗抵抗中的作用,并阐明其作用机制。方法:基于转录因子预测网站(PROMO网站),生物信息学分析GBM组织中甲基转移酶1(DNMT1)、损伤特异性DNA结合蛋白1(DDB1)、染色盒同源物5(C... 详细信息

目的:探讨通用转录因子2I(GTF2I)在胶质母细胞瘤(GBM)替莫唑胺化疗抵抗中的作用,并阐明其作用机制。方法:基于转录因子预测网站(PROMO网站),生物信息学分析GBM组织中甲基转移酶1(DNMT1)、损伤特异性DNA结合蛋白1(DDB1)、染色盒同源物5(CBX5)和着色性干皮病基因组C(XPC)的共同转录因子,并基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库进行DDB1、CBX5、XPC和DNMT1与GTF2I和甲基鸟嘌呤甲基转移酶(MGMT)的相关性分析及生存分析。分别用小干扰序列(siRNA)转染并沉默人脑多形性成胶质细胞瘤T98细胞和人脑胶质瘤LN229细胞中MGMT及GTF2I的基因表达,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测上述基因的mRNA表达水平。沉默GTF2I基因后,平板克隆形成实验检测肿瘤细胞的集落形成能力,CCK-8法检测细胞对替莫唑胺的敏感性。结果:生物信息学分析,GBM组织中DDB1、CBX5、XPC和DNMT1表达水平与GTF2I表达水平呈显著正相关关系(P<0.05),与MGMT表达水平呈负相关关系(P<0.05);GTF2I表达水平与MGMT表达水平呈显著负相关关系(P<0.05)。剔除未接受替莫唑胺治疗的GBM患者的生存分析,GTF2I高表达的患者总体生存时间降低。沉默MGMT基因后,人脑胶质瘤T98细胞中GTF2I、DDB1、CBX5和XPC mRNA表达水平升高(P<0.001);沉默GTF2I基因后,人脑胶质瘤LN229细胞中MGMT mRNA表达水平升高(P<0.05),而DDB1、CBX5、XPC和DNMT1 mRNA表达水平明显降低(P<0.05或P<0.001)。平板克隆形成实验,沉默GTF2I基因前后,细胞集落形成能力比较差异无统计学意义(P=0.138);CCK-8法检测,与对照组比较,观察组细胞活力明显降低(P<0.05)。结论:转录因子GTF2I可以调控MGMT、DDB1、CBX5和XPC等关键DNA损伤修复蛋白的mRNA表达,参与GBM细胞替莫唑胺化疗抵抗,可能是GBM潜在的治疗新靶点。

关键词：胶质母细胞瘤替莫唑胺抵抗通用转录因子2I 甲基鸟嘌呤甲基转移酶关键DNA损伤修复基因

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肝细胞癌合并门静脉癌栓肝移植治疗进展

中华消化外科杂志 2024年第2期23卷 215-220页

作者：吕国悦吉林大学第一医院肝胆胰外科吉林大学肝移植中心长春130021

肝细胞癌(简称肝癌)易侵犯门静脉系统,10%~40%肝癌患者在初诊时已合并肉眼可见门静脉癌栓。在欧美国家,众多肝癌诊治指南将肝癌合并肉眼可见门静脉癌栓定义为进展期肝癌,故推荐该部分患者进行系统治疗。而在亚洲国家,外科医师对于肝癌... 详细信息

肝细胞癌(简称肝癌)易侵犯门静脉系统,10%~40%肝癌患者在初诊时已合并肉眼可见门静脉癌栓。在欧美国家,众多肝癌诊治指南将肝癌合并肉眼可见门静脉癌栓定义为进展期肝癌,故推荐该部分患者进行系统治疗。而在亚洲国家,外科医师对于肝癌合并门静脉癌栓的处理方式更加积极,认为其并不是手术绝对禁忌证。目前,关于肝癌合并门静脉癌栓的治疗,尚无全球性共识或标准指南。肝移植是不可切除肝癌的根治性治疗措施,但肝癌合并门静脉癌栓患者行肝移植后肿瘤复发率高,故肝癌合并门静脉癌栓患者一度被视为肝移植的禁忌证。此外,肝癌合并门静脉癌栓常被认为存在肿瘤肝外转移。但临床实践中,在无有效治疗措施的情况下,越来越多的肝癌合并门静脉癌栓患者转向寻求肝移植并最终成功进行了手术。与此同时,诸多研究表明在合理选择受体的前提下,肝移植可以使肝癌合并门静脉癌栓患者生存受益。尤其是同其他治疗方案比较,在采用降期治疗(包括三维适形放疗、经肝动脉化疗栓塞、立体定向体部放疗、经肝动脉放疗栓塞、经肝动脉灌注化疗等)成功的肝癌合并门静脉癌栓患者中继续行肝移植可使患者获得更佳预后。鉴于肝移植在肝癌合并门静脉癌栓患者中的治疗争议显著,笔者深入阐述肝癌合并门静脉癌栓肝移植治疗进展,主要包括肝癌合并门静脉癌栓诊断和分型、支持肝移植证据以及反对肝移植理由。

关键词：肝肿瘤门静脉癌栓肝移植

不同入路脊柱内镜手术对单节段腰椎管狭窄症患者疼痛和腰椎功能的影响

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河南外科学杂志 2024年第5期30卷 135-137页

作者：梁威卓瑞立河南濮阳市油田总医院脊柱外科濮阳457001

目的探讨不同入路脊柱内镜手术对单节段腰椎管狭窄症(LSS)患者视觉模拟评分法(VAS)评分和腰椎Oswestry功能障碍指数(ODI)的影响。方法回顾性分析2022-01—2022-12濮阳市油田总医院脊柱外科行脊柱内镜手术治疗的单节段LSS患者的临床资料... 详细信息

目的探讨不同入路脊柱内镜手术对单节段腰椎管狭窄症(LSS)患者视觉模拟评分法(VAS)评分和腰椎Oswestry功能障碍指数(ODI)的影响。方法回顾性分析2022-01—2022-12濮阳市油田总医院脊柱外科行脊柱内镜手术治疗的单节段LSS患者的临床资料,根据入路方式分为椎板间入路组和椎间孔入路组,各53例。比较2组患者的围术期指标,评价术前和术后6个月时2组患者的VAS评分、ODI评分。结果2组患者的基线资料和住院时间差异无统计学意义(P>0.05)。椎板间入路组患者的手术时间短于椎间孔入路组,差异有统计学意义(P0.05)。术后6个月时,2组患者的VAS评分、ODI评分均较术前显著改善,且椎板间入路组患者的改善效果优于椎间孔入路组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论与椎间孔入路比较,椎板间入路脊柱内镜手术治疗LSS患者,能缩短手术时间,有利于消除患者的疼痛症状和改善腰椎功能。

关键词：单节段腰椎管狭窄症脊柱内镜手术椎板间入路椎间孔入路

孟德尔随机化及其在阻塞性睡眠呼吸暂停综合征研究中的应用进展

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中华耳鼻咽喉头颈外科杂志 2024年第7期59卷 774-781页

作者：李京蔓房宁汪欣吉林大学第一医院耳鼻咽喉头颈外科长春130000

孟德尔随机化是一种应用遗传变异作为特定暴露的工具变量,进而探索暴露与结局间因果关联的新兴统计学方法。其以耗时短,费用低,证据等级高,更少受到逆向因果关系和混杂因素的影响等为优势,成为了近些年的研究焦点。本文针对该方法及其... 详细信息

孟德尔随机化是一种应用遗传变异作为特定暴露的工具变量,进而探索暴露与结局间因果关联的新兴统计学方法。其以耗时短,费用低,证据等级高,更少受到逆向因果关系和混杂因素的影响等为优势,成为了近些年的研究焦点。本文针对该方法及其在阻塞性睡眠呼吸暂停综合征研究领域中的应用进展进行综述。

关键词：阻塞性睡眠呼吸暂停综合征混杂因素孟德尔随机化因果关联证据等级统计学方法工具变量因果关系