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核酸提取产物中乙醇对实时荧光定量PCR的影响

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中国生物制品学杂志 2025年第1期38卷 102-108,114页

作者：龚向莲黄玉麟林伟春杨连威胡祐邵珊张东旭厦门大学国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心福建厦门361104 厦门万泰凯瑞生物技术有限公司福建厦门361022

目的研究核酸提取产物中乙醇对实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)的影响,为更高灵敏度核酸检测提供乙醇浓度界限。方法建立重铬酸钾氧化法检测两种商品化磁珠法核酸提取试剂盒提取产物的乙醇残留,检测其是否对qPCR产生... 详细信息

目的研究核酸提取产物中乙醇对实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)的影响,为更高灵敏度核酸检测提供乙醇浓度界限。方法建立重铬酸钾氧化法检测两种商品化磁珠法核酸提取试剂盒提取产物的乙醇残留,检测其是否对qPCR产生影响,再将不同浓度乙醇溶液混合核酸模拟提取产物溶解冷冻干燥处理的qPCR试剂(以下简称冻干试剂)并进行扩增,观察其灵敏度变化,并对Ct值、荧光增益强度和扩增效率进行统计学分析。结果两种试剂盒的提取产物中残留3%~9%乙醇,对扩增均造成影响,有可能会导致灵敏度下降。对于人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV),乙醇浓度达到4.38%时,荧光增益强度差异有统计学意义(P学意义(P=0.004);乙醇浓度达到3.50%时,Ct值差异有统计学意义(P=0.004),扩增效率出现明显差异。结论乙醇会影响qPCR灵敏度、Ct值、荧光增益和扩增效率。为进行更高灵敏度的核酸检测,建议乙醇在提取产物中的残留不超过3.50%。

关键词：乙醇实时荧光定量PCR 冷冻干燥 PCR试剂核酸提取残留

中国女性高危型HPV感染自然史的系统综述及Meta分析

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病毒学报 2025年

作者：匡雪凤贾鑫华王哲孙榕静吴婷赵方辉乔友林厦门大学公共卫生学院国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院流行病学研究室中国医学科学院/北京协和医学院群医学及公共卫生学院

探索中国女性高危型人乳头瘤病毒（High-risk human papillomavirus,HR-HPV）感染的自然转归状况，以指导开展正确的健康教育以及HPV感染相关的治疗药物或疫苗的研发。从PubMed,Embase,CNKI，万方等数据库中检索和筛选自建库以来至2024... 详细信息

探索中国女性高危型人乳头瘤病毒（High-risk human papillomavirus,HR-HPV）感染的自然转归状况，以指导开展正确的健康教育以及HPV感染相关的治疗药物或疫苗的研发。从PubMed,Embase,CNKI，万方等数据库中检索和筛选自建库以来至2024年5月有关中国女性HR-HPV感染自然消退以及持续感染相关的文章。使用纽卡斯尔-渥太华量（NOS）评估所纳入文献的质量，采用随机效应模型计算HR-HPV感染的自然转阴率（95%CI）以及HR-HPV感染的持续阳性率（95%CI），并分析随访时间与HR-HPV自然转阴率、HR-HPV持续阳性率之间的关联。最后通过漏斗图、Egger′s检验评价发表偏倚，采用敏感性分析评估合并参数值的稳健程度。共纳入54篇文章，涉及HR-HPV持续感染的文章共52篇，HR-HPV感染自然转阴的文章共51篇，NOS量表评分均≥5分共53篇。随访时间为6个月、12个月、24个月、36个月时，中国女性HR-HPV感染自然转阴率分别为0.3033(0.2238,0.3892),0.5174(0.4559,0.5786),0.6538(0.5834,0.7210),0.7608(0.6642,0.8455)。HR-HPV持续阳性率分别为0.6780(0.5897,0.7603),0.4528(0.3930,0.5133),0.2963(0.2319,0.3649),0.2294(0.1378,0.3362)。随着随访时间的延长，在中国高危人乳头瘤病毒（HR-HPV）的自然清除率逐渐增加，持续感染率逐渐下降。到了36个月时，约有22.94%的女性仍呈HR-HPV持续阳性。这一数据对于正确进行健康教育以及指导后续HPV感染相关的治疗药物或疫苗研发具有重要意义。

关键词：宫颈癌人乳头瘤病毒持续感染自然史自然转阴 Meta分析

基于人DNA甲基化的宫颈癌及癌前病变机器学习预测模型构建与初步验证

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中华肿瘤杂志 2025年第2期47卷 193-200页

作者：杨源周航王亚坤戴钰皮若及章华黄紫玥吴婷杨敬红陈汶厦门大学公共卫生学院、国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心厦门361102 国家癌症中心、国家肿瘤临床医学研究中心、中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院流行病学研究室北京100021 首都医科大学附属北京中医医院疾控处北京100010 绵阳市妇幼保健院妇幼健康管理科绵阳621000

目的利用人基因的甲基化特征,构建预测宫颈癌及癌前病变的机器学习预测模型。方法对2014年4月至2015年3月来自中国医学科学院肿瘤医院、天津市中心妇产科医院、河南省新密妇幼保健院、四川大学华西第二附属医院和山西长治医学院附属和... 详细信息

目的利用人基因的甲基化特征,构建预测宫颈癌及癌前病变的机器学习预测模型。方法对2014年4月至2015年3月来自中国医学科学院肿瘤医院、天津市中心妇产科医院、河南省新密妇幼保健院、四川大学华西第二附属医院和山西长治医学院附属和平医院的224例宫颈脱落细胞标本进行人DNA甲基化检测,通过CpG高密度、高关联、高甲基化基因片段筛选和LASSO回归算法,筛选出与宫颈癌病变相关的高甲基化基因片段。以宫颈上皮内瘤变2级(CIN2)及以上病变为研究结局,以144例门诊患者标本为训练集,构建随机森林(RF)、朴素贝叶斯(NB)和支持向量机(SVM)3种机器学习预测模型,以80例参与宫颈癌筛查项目女性的宫颈脱落细胞标本为验证集对预测模型进行验证。以组织学诊断结果为金标准,比较3种机器学习预测模型与HPV检测和细胞学诊断对CIN2及以上病变的检出效能。结果训练集144例中,HPV阳性34例,阳性率为23.61%。细胞学诊断为无上皮内病变或恶性细胞(NILM)37例,不能明确意义的非典型鳞状上皮细胞(ASC-US)及以上病变107例。组织学诊断为未见宫颈上皮内病变或宫颈良性病变28例,CIN131例,CIN218例,CIN331例,鳞癌36例。从45个基因中筛选出7个高甲基化基因片段,构建了RF、NB和SVM机器学习预测模型。验证集80例中,HPV阳性28例,阳性率为35.00%。细胞学诊断为NILM 65例,ASC-US及以上病变15例。组织学诊断为未见宫颈上皮内病变或宫颈良性病变39例,CIN110例,CIN210例,CIN311例,鳞癌10例。在验证集中,RF模型、NB模型、SVM模型、HPV检测和细胞学诊断CIN2及以上病变的受试者工作特征曲线下面积(AUC)分别为0.90、0.88、0.82、0.68和0.45。DeLong检验显示,RF模型、NB模型和SVM模型的AUC差异无统计学意义(两两比较均P>0.05),RF模型、NB模型的AUC高于HPV检测(均P学诊断(均P学习预测模型中,NB模型对CIN2及以上病变的预测效能良好,或可用于女性的宫颈癌及癌前病变筛查。

关键词：子宫颈肿瘤甲基化甲基化单倍型负荷机器学习朴素贝叶斯模型

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戊型肝炎病毒高通量中和效价评价模型的建立

病毒学报 2015年第1期31卷 1-6页

作者：杨帆唐自闽王思令蔡薇温桂平纪文芳余静菲张可夏宁邵郑子峥厦门大学分子疫苗学与分子诊断学国家重点实验室、国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心、公共卫生学院厦门361102 厦门大学分子疫苗学与分子诊断学国家重点实验室、国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心、生命科学院厦门361102

广泛有效的体外感染模型的缺乏限制了抗戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)抗体及血清定量化中和效价的评估,从而阻碍了对HEV相关抗体应答及免疫机制的深入研究。本研究首先通过在HEV低效复制细胞系HepG2肝癌细胞株上进行了HEV感染细... 详细信息

广泛有效的体外感染模型的缺乏限制了抗戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)抗体及血清定量化中和效价的评估,从而阻碍了对HEV相关抗体应答及免疫机制的深入研究。本研究首先通过在HEV低效复制细胞系HepG2肝癌细胞株上进行了HEV感染细胞后的连续监测,直到第13d到达病毒载量的检测下限,验证了该细胞系建立感染模型的可行性,进一步采用96孔多通道平行感染、核酸提取及实时荧光定量PCR对五株抗HEV的鼠源单克隆抗体及四位戊肝疫苗接种者的接种前、后血清样本进行了细胞中和试验。结果显示应用该模型能够实现对不同中和能力的单抗及接种疫苗前后的血清进行中和效价的定量化评估。表明本研究已成功建立了HEV体外高通量中和评价模型,同时也显示出该模型在HEV疫苗及抗体应答表位研究中所具有的潜在价值。

关键词：阿霉素肾纤维化三七注射液转化生长因子-β1 P38MAPK

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带状疱疹流行病学研究进展

中华微生物学和免疫学杂志 2016年第12期36卷 948-953页

作者：马心静卫飞雪苏迎盈黄守杰吴婷厦门大学公共卫生学院国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心分子疫苗学与分子诊断学国家重点实验室361102

带状疱疹是由潜伏在神经节的水痘一带状疱疹病毒再激活引起的急性感染性皮肤病。老年人是带状疱疹发病的高危人群，随着我国人口老龄化程度日益加重，带状疱疹研究应受到重视。本文就带状疱疹病原学特征、临床诊断、流行病学特征、疾病... 详细信息

带状疱疹是由潜伏在神经节的水痘一带状疱疹病毒再激活引起的急性感染性皮肤病。老年人是带状疱疹发病的高危人群，随着我国人口老龄化程度日益加重，带状疱疹研究应受到重视。本文就带状疱疹病原学特征、临床诊断、流行病学特征、疾病负担、危险因素及防控措施的研究进展进行了综述。

关键词：带状疱疹流行病学危险因素带状疱疹疫苗

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HBV cccDNA检测方法的研究进展

科学通报 2020年第16期65卷 1529-1545页

作者：施恬树曹佳莉杨艺楠袁权厦门大学公共卫生学院分子疫苗学和分子诊断学国家重点实验室厦门361100 厦门大学生命科学学院国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心厦门361100

目前全球约有2.57亿慢性乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染者,是当前最为突出的公共卫生问题之一.HBV感染的肝细胞内稳定存在的共价闭合环状DNA(cccDNA)是造成HBV感染持续、抗病毒治疗停药后病毒反弹的重要原因.现有Anti-HBV药... 详细信息

目前全球约有2.57亿慢性乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染者,是当前最为突出的公共卫生问题之一.HBV感染的肝细胞内稳定存在的共价闭合环状DNA(cccDNA)是造成HBV感染持续、抗病毒治疗停药后病毒反弹的重要原因.现有Anti-HBV药物难以有效清除或直接抑制肝内cccDNA是慢性乙肝难以治愈的关键瓶颈.缺乏简单易行的cccDNA定量检测方法,影响了靶向cccDNA的Anti-HBV新药研发进展,也阻碍了这一指标在慢性乙肝患者临床管理实践中的应用.Southern blot被认为是目前cccDNA实验室检测的"金标准",但其操作复杂且灵敏度低,不适合于高通量药物筛选及临床应用.基于PCR的cccDNA检测方法相对操作简单、检测灵敏度更高,但其可靠性仍有待考验.本文系统整理分析了cccDNA样品提取和测定方法的研究现状与进展,希望通过综合比较不同cccDNA检测技术的性能和特点,为cccDNA相关基础研究、药物发展与临床研究提供方法学参考.

关键词：乙型肝炎病毒共价闭合环状DNA 抗乙肝药物 cccDNA检测方法

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器官移植病人戊型肝炎病毒慢性化感染及治疗

病毒学报 2015年第3期31卷 293-298页

作者：陈书卫飞雪吴婷夏宁邵厦门大学公共卫生学院国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心分子疫苗学和分子诊断学国家重点实验室厦门361102

戊型肝炎是由戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)感染引起的急性病毒性肝炎,其发病率居急性病毒性肝炎之首。戊型肝炎通常呈急性感染病程,2008年以来陆续发现器官移植病人等免疫抑制患者感染HEV后可能迁延为慢性化。在无抗病毒药物治... 详细信息

戊型肝炎是由戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)感染引起的急性病毒性肝炎,其发病率居急性病毒性肝炎之首。戊型肝炎通常呈急性感染病程,2008年以来陆续发现器官移植病人等免疫抑制患者感染HEV后可能迁延为慢性化。在无抗病毒药物治疗的情况下,器官移植病人感染HEV后迁延为慢性感染的比例超过60%,其中10%的病人慢性感染HEV后可能出现肝纤维化,并且在较短的时间内进展为失代偿性肝硬化导致死亡。本文简要综述器官移植病人HEV慢性化感染及治疗。

关键词：戊型肝炎病毒器官移植慢性化感染治疗

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呼吸道传染性疾病鼻腔疫苗:进展与挑战

中华疾病控制杂志 2023年第2期27卷 231-237页

作者：黄兴成庄春兰刘晓辉胡潇文吴婷厦门大学公共卫生学院国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心分子疫苗学和分子诊断学国家重点实验室厦门361102

呼吸道传染性疾病由于传播途径难以被有效阻断,易发生大范围流行,而鼻腔免疫被认为是极有潜力的疫苗接种途径。与传统的疫苗不同,鼻腔疫苗可同时诱导呼吸道局部和全身性系统免疫,具有在抵御呼吸道传染性疾病的第一线预防病原体感染和阻... 详细信息

呼吸道传染性疾病由于传播途径难以被有效阻断,易发生大范围流行,而鼻腔免疫被认为是极有潜力的疫苗接种途径。与传统的疫苗不同,鼻腔疫苗可同时诱导呼吸道局部和全身性系统免疫,具有在抵御呼吸道传染性疾病的第一线预防病原体感染和阻断传播的特点。目前已有安全有效的鼻喷流感疫苗获批上市。自COVID-19流行以来,多条技术路线的新型冠状病毒疫苗(简称新冠疫苗)采用了鼻腔免疫方式。本文拟综述目前已上市或进入临床试验阶段的呼吸道传染性疾病鼻腔疫苗研究进展,并讨论鼻腔疫苗的独特优势和面临的挑战。

关键词：鼻腔疫苗呼吸道传染性疾病新型冠状病毒肺炎新型冠状病毒疫苗黏膜免疫

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母源抗体对轮状病毒疫苗保护性的影响

中华微生物学和免疫学杂志 2017年第9期37卷 703-708页

作者：罗国兴李廷栋葛胜祥厦门大学国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心分子疫苗学与分子诊断学国家重点实验室厦门大学生命科学学院361005 厦门大学国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心分子疫苗学与分子诊断学国家重点实验室.厦门大学公共卫生学院361005

轮状病毒是全世界范围内导致5岁以下婴幼儿严重腹泻的主要病原体,绝大部分儿童在婴幼儿时期都会感染此病毒.目前临床上没有治疗轮状病毒引起的腹泻的特效药,疫苗接种是控制轮状病毒的主要手段.随着轮状病毒疫苗的推广使用,由轮状病毒感... 详细信息

轮状病毒是全世界范围内导致5岁以下婴幼儿严重腹泻的主要病原体,绝大部分儿童在婴幼儿时期都会感染此病毒.目前临床上没有治疗轮状病毒引起的腹泻的特效药,疫苗接种是控制轮状病毒的主要手段.随着轮状病毒疫苗的推广使用,由轮状病毒感染而引起的严重腹泻率和死亡率均显著下降,但是这些疫苗在轮状病毒导致的死亡率较高的部分低收入国家的免疫保护效果显著低于发达国家.高滴度的母源抗体可能是导致轮状病毒疫苗在低收入国家保护性低的原因之一,近年来,已经对母源抗体与轮状病毒疫苗有效性的关系进行了大量研究,结果表明,婴儿接种疫苗后的免疫应答与母源抗体滴度呈负相关,但是,不同研究中对母乳喂养是否影响婴儿免疫应答的结果存在一定的差异.因此,分析阐明母源抗体与轮状病毒疫苗有效性的相关性,从而为制定新的轮状病毒疫苗免疫策略提供依据,以提高轮状病毒疫苗在不发达国家的保护性.

关键词：轮状病毒母源抗体乳汁抗体疫苗免疫应答