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基于关系融合和双向扩散模型的药物与靶标关系预测方法研究

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数据分析与知识发现 2024年第2期8卷 155-167页

作者：张云秋黄麒霏朱祥吉林大学公共卫生学院长春130021

【目的】提出了一种新的药物与靶标关系预测方法来提升预测性能。【方法】进一步丰富网络的语义信息,采用SNF、AVG和MAX方法分别对药物相似性网络和靶标相似性网络中的多种语义关系进行融合。基于关系融合后的相似性网络和已知的药物-... 详细信息

【目的】提出了一种新的药物与靶标关系预测方法来提升预测性能。【方法】进一步丰富网络的语义信息,采用SNF、AVG和MAX方法分别对药物相似性网络和靶标相似性网络中的多种语义关系进行融合。基于关系融合后的相似性网络和已知的药物-靶标互作网络构建双向扩散模型,以实现药物与靶标关系预测。【结果】实证研究表明,本文方法相较于主流的预测方法在AUC值指标上分别提升了2.2%和12.8%。并且通过对预测结果进行文献回溯,预测分数排在前10、20和30位的药物-靶标关系对中,可以分别在文献中找到3、8和11对药物-靶标的相关线索与证据。另外,SNF的融合效果最优,能够最大程度提高预测的性能。【局限】未融合药物或靶标客观属性上的相似性,如药物的化学结构或靶标的序列结构相似性,并且针对新药物和新靶标关系发现的冷启动问题仍待解决。【结论】本文提出的预测方法具有一定的优越性和有效性,可以为药物重定位以及其他生物医学实体的关系预测相关研究提供参考。

关键词：药物靶标机器学习 SNF

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中小学教师抑郁症状和负性生活事件与心理弹性的关系

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中国学校卫生 2024年第3期45卷 411-413,418页

作者：汪培朱璠贾碧波朱桂因赵田杰祁甜甜胡翼飞马迎华北京大学公共卫生学院/儿童青少年卫生研究所北京100191 首都医科大学公共卫生学院儿少卫生与妇幼保健学系

目的探讨中小学教师抑郁症状、负性生活事件与心理弹性之间的关系,为提升教师群体的心理健康水平提供参考。方法于2022年11—12月,采用方便整群抽样法抽取北京、广东、安徽、湖北、四川、新疆、辽宁、黑龙江等8省(市)38所学校的11332名... 详细信息

目的探讨中小学教师抑郁症状、负性生活事件与心理弹性之间的关系,为提升教师群体的心理健康水平提供参考。方法于2022年11—12月,采用方便整群抽样法抽取北京、广东、安徽、湖北、四川、新疆、辽宁、黑龙江等8省(市)38所学校的11332名中小学在职教师进行问卷调查。使用9项患者健康问卷、自编21条目负性生活事件调查问卷、10条目简明心理弹性量表分别评估中小学教师的抑郁症状、经历负性生活事件情况与心理弹性水平。采用Mann-Whitney U和Kruskal-Wallis H秩和检验比较抑郁症状得分的组间差异,使用多重线性回归、分层回归探讨教师抑郁症状与负性生活事件、心理弹性间的关系。结果中小学教师抑郁症状的检出率为14.0%;中小学教师负性生活事件与抑郁症状呈正相关(r=0.35),心理弹性与抑郁症状呈负相关(r=-0.45)(P值均<0.05)。在调整性别、婚姻状况等变量后,负性生活事件得分与抑郁症状得分呈正相关(β=0.22,P<0.01);心理弹性在负性生活事件对中小学教师抑郁症状的影响中起调节作用(B=-0.15,P<0.01)。结论中小学教师经历负性生活事件越多,产生抑郁症状的风险越大。心理弹性可以削弱负性生活事件对抑郁症状的负面影响,起到保护教师心理健康的作用。

关键词：抑郁生活变动事件精神卫生回归分析

北京市中小学生身体活动时间现状及影响因素的路径

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北京大学学报（医学版） 2024年第3期56卷 403-410页

作者：蔡珊张依航陈子玥刘云飞党佳佳师嫡李佳欣黄天彧马军宋逸北京大学公共卫生学院北京大学儿童青少年卫生研究所北京100191

目的:描述北京市中小学生每天身体活动时间现况,并分析个体、家庭、学校、社区层面的影响因素及其路径。方法:使用2023年北京市中小学生的横断面调查数据,研究对象为3157名小学生和初中生。使用问卷调查学生的基本信息、每天总体和在校... 详细信息

目的:描述北京市中小学生每天身体活动时间现况,并分析个体、家庭、学校、社区层面的影响因素及其路径。方法:使用2023年北京市中小学生的横断面调查数据,研究对象为3157名小学生和初中生。使用问卷调查学生的基本信息、每天总体和在校身体活动时间、掌握的运动项目数量,以及感知身体活动益处和障碍情况,感知家庭、学校和社区身体活动支持性环境情况。采用Log-binomial回归模型分析身体活动与影响因素的关联,使用结构方程模型进行影响因素的路径分析。结果:2023年北京市中小学生每天总体身体活动≥2 h报告率为33.1%,每天在校身体活动≥1 h报告率为64.8%。学生掌握的运动项目数量与每天总体身体活动≥2 h报告率呈剂量反应关系(P-trend<0.001),感知身体活动益处得分和障碍得分比值及感知家庭、学校、社区身体活动支持性环境得分均与学生每天总体身体活动≥2 h报告率呈正相关关系(PR=1.24,95%CI:1.20~1.28;PR=1.51,95%CI:1.38~1.66;PR=1.50,95%CI:1.37~1.64;PR=1.21,95%CI:1.16~1.27)。结构方程模型显示,学生掌握的运动项目数量(β=0.11,P<0.001)、感知身体活动益处得分和障碍得分比值(β=0.15,P<0.001),以及由家庭、学校和社区构成的支持性环境得分(β=0.13,P<0.001)均与学生每天总体身体活动≥2 h报告率直接相关,其中支持性环境得分通过影响学生掌握的运动项目数量(β=0.21,P<0.001)、感知身体活动益处得分和障碍得分比值(β=0.56,P<0.001),学生掌握的运动项目数量通过影响感知身体活动益处得分和障碍得分比值(β=0.05,P=0.003),与学生每天总体身体活动≥2 h报告率间接相关。学生每天在校身体活动≥1 h报告率与每天总体身体活动≥2 h报告率的影响因素及路径相似。结论:北京市中小学生身体活动时间未达到国家要求,未来需构建家庭、学校和社区一体化身体活动支持性环境,培育中小学生的运动技能,树立自主运动的观念,保障中小学生每天校内外各1 h身体活动时间。

关键词：身体活动危险因素社会支持学生

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中小学生青春发动时相与心血管代谢危险因素的相关性

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北京大学学报（医学版） 2024年第3期56卷 418-423页

作者：张祖洪陈天娇马军北京大学公共卫生学院北京大学儿童青少年卫生研究所北京100191

目的:探索北京市中小学生青春发动时相与心血管代谢危险因素的相关性及存在的性别差异。方法:分层整群抽取3067名来自北京市房山区16所中小学校的学生,对其进行问卷调查、体格检查和血清实验室检测,采用多分类多因素Logistic回归模型分... 详细信息

目的:探索北京市中小学生青春发动时相与心血管代谢危险因素的相关性及存在的性别差异。方法:分层整群抽取3067名来自北京市房山区16所中小学校的学生,对其进行问卷调查、体格检查和血清实验室检测,采用多分类多因素Logistic回归模型分析中小学生青春发动时相与心血管代谢危险因素的相关性。结果:男生青春发动时相提前和延迟检出率分别为14.73%和9.46%,女生为12.89%和10.99%。学生中心性肥胖、高血压、高血糖和血脂异常检出率分别为35.87%、19.95%、2.54%和26.31%,心血管代谢危险因素聚集1项、2项和3项及以上的检出率分别为29.21%、16.17%和9.36%。调整学段、地区、出生体质量、喂养方式、是否独生子女、父母最高文化程度和家庭月收入后,相较于青春发动适时组,青春发动提前组女生发生1个危险因素聚集、2个危险因素聚集和3个及以上危险因素聚集的风险分别提高1.94倍(95%CI=1.29~2.91)、2.97倍(95%CI=1.89~4.67)和2.02倍(95%CI=1.13~3.63);男生青春发动时相与心血管代谢危险因素聚集的相关性无统计学意义(P>0.05)。结论:青春发动时相提前是女生心血管代谢危险因素聚集的独立危险因素,应实施一级预防策略以减轻人群心血管代谢疾病负担。

关键词：心血管代谢危险因素青春期发育中小学生

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广州市6~12岁儿童糖代谢异常流行状况及其影响因素

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中华疾病控制杂志 2024年第2期28卷 183-190页

作者：普迎琦桂曌环黄闪张羽珊陈亚军中山大学公共卫生学院妇幼卫生学系广州510080

目的了解广州市6~12岁儿童空腹血糖(fasting plasma glucose,FPG)水平和糖代谢异常现状及其影响因素。方法采用分层整群随机抽样方法,在广州市抽取5所小学共4690名6~12岁儿童进行问卷调查、体格检查和FPG检测。根据FPG值对儿童糖尿病(di... 详细信息

目的了解广州市6~12岁儿童空腹血糖(fasting plasma glucose,FPG)水平和糖代谢异常现状及其影响因素。方法采用分层整群随机抽样方法,在广州市抽取5所小学共4690名6~12岁儿童进行问卷调查、体格检查和FPG检测。根据FPG值对儿童糖尿病(diabetes mellitus,DM)(FPG≥7.0 mmol/L)、空腹血糖受损(impaired fasting glucose,IFG)(6.1 mmol/L≤FPG<7.0 mmol/L)和糖代谢异常(FPG≥6.1 mmol/L)进行筛查。采用多因素线性回归分析模型和多因素logistic回归分析模型分析儿童FPG和糖代谢异常的影响因素。结果广州市6~12岁儿童FPG平均水平为(5.16±0.34)mmol/L,糖代谢异常率、IFG和DM检出率分别为0.79%、0.64%和0.15%。多因素线性回归分析模型分析显示男童(β=0.161,95%CI:0.089~0.135,P<0.001)、9~12岁儿童(9~<11岁:β=0.071,95%CI:0.025~0.075,P<0.001;11~12岁:β=0.090,95%CI:0.056~0.126,P<0.001)、腹型肥胖儿童(β=0.042,95%CI:0.009~0.078,P=0.013)FPG水平较高。多因素logistic回归分析模型分析显示腹型肥胖(β=1.576,OR=4.838,95%CI:2.200~10.638,P<0.001)、未每天吃早餐的儿童(β=1.158,OR=3.184,95%CI:1.069~9.484,P=0.038)糖代谢异常风险较高。结论广州市6~12岁儿童糖代谢异常率偏低,腹型肥胖、未每天吃早餐是儿童糖代谢异常的危险因素。

关键词：空腹血糖糖代谢异常糖尿病影响因素

多基因风险评分在儿童肥胖干预效果可持续性中的作用

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中国儿童保健杂志 2024年第1期32卷 16-20页

作者：陈敬单蕊肖伍才宋洁云刘峥北京大学公共卫生学院妇幼卫生学系北京100191 北京大学儿童青少年卫生研究所

目的探索多基因风险评分(PRS)与儿童肥胖干预效果可持续性的关联,为未来开展基于遗传背景、可持续、个性化的儿童肥胖干预提供科学依据。方法从一项研究儿童干预效果的整群随机对照试验(2018年9月—2021年4月)中,选取北京地区148名基... 详细信息

目的探索多基因风险评分(PRS)与儿童肥胖干预效果可持续性的关联,为未来开展基于遗传背景、可持续、个性化的儿童肥胖干预提供科学依据。方法从一项研究儿童干预效果的整群随机对照试验(2018年9月—2021年4月)中,选取北京地区148名基线时处于超重肥胖的儿童作为研究对象,采集唾液进行全基因组测序。构建4个PRS:加权和未加权PRS69,加权和未加权PRS_(67)。分析PRS与干预组别对干预效果可持续性(干预结束到最后一次随访期间肥胖相关指标变化)的交互作用。结果 PRS与干预组别对干预结束后儿童校正体质量指数(BMI)的腰围、校正BMI的腰臀比和收缩压的反弹程度存在交互作用。与对照组相比,干预组儿童加权PRS69每增加一个单位(1个s),校正BMI的腰围(β=0.34,95%CI:0.05~0.63,P=0.020)和校正BMI的腰臀比(β=0.29,95%CI:0.03~0.56,P=0.031)在干预结束后反弹得越多;加权PRS_(67)和未加权PRS_(67)每增加一个单位(1个s),收缩压在干预结束后反弹得越多(β=3.58,95%CI:0.50~6.66,P=0.023;β=3.75,95%CI:0.78~6.71,P=0.014)。结论超重肥胖儿童PRS越高(携带风险等位基因越多),其在干预结束后的校正BMI的腰围、校正BMI的腰臀比和收缩压越容易反弹。未来应在干预结束后重点关注这些高危儿童的饮食和运动行为,预防和控制发生肥胖反弹。

关键词：儿童肥胖多基因风险评分干预效果可持续性

大气污染对中老年人生物学衰老影响的系统综述

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中华预防医学杂志 2024年第5期58卷 599-607页

作者：刘淑珍杨若澜田思帆姜玫婕高旭北京大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生学系北京100191

目的系统评价大气污染对中老年人多种生物学衰老标志物的影响。方法以“大气污染”“生物学年龄”“Air pollution”“Biological age”“Epigenetic age”“Biological aging”“Epigenetic aging”以及具体的大气污染物和生物学年龄... 详细信息

目的系统评价大气污染对中老年人多种生物学衰老标志物的影响。方法以“大气污染”“生物学年龄”“Air pollution”“Biological age”“Epigenetic age”“Biological aging”“Epigenetic aging”以及具体的大气污染物和生物学年龄名称为关键词,通过检索英文数据库PubMed、Web of Science和中国知网、万方、维普、中国生物医学文献、中国科学技术论文等中文数据库收集大气污染对生物学年龄影响的关系研究,检索时间为建库至2023年6月30日,语种限定为中文和英文。结果共纳入14篇文献,5项研究探讨了大气污染对不同算法的DNA甲基化年龄的影响,6项研究探讨了大气污染物和端粒长度的关系,6项以衰弱为结局,另有1项研究揭示了细颗粒物(PM_(2.5))及其组分与复合指标年龄(KDM年龄)的关系。结果提示,虽然不同的生物学年龄对不同大气污染物的敏感度不同,既往相关研究一致发现PM2.5及其黑碳(BC)组分的浓度增加可显著加速中老年人生物学衰老水平,而氮氧化物(NO_(x))以及臭氧(O_(3))等主要气态污染物虽然存在一定的衰老加速作用,但研究证据较为有限。结论主要大气污染物可加速中老年人衰老水平。

关键词：大气污染衰老中老年人生物学年龄 DNA甲基化

多色免疫组织化学技术在肿瘤标志物分析中的研究进展

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分析化学 2024年第3期52卷 313-322页

作者：杨马骏杨超杰贺月赵灿冀海伟王琦秦玉岭吴丽南通大学公共卫生学院

多色免疫组织化学（Multiplex immunohistochemistry, mIHC）技术是一种新型多靶点病理组织染色、成像及分析技术。该技术通过在单张组织切片上检测多种生物标志物的表达水平及空间分布，实现对细胞的表型、组成、形态及细胞间相互作用... 详细信息

多色免疫组织化学（Multiplex immunohistochemistry, mIHC）技术是一种新型多靶点病理组织染色、成像及分析技术。该技术通过在单张组织切片上检测多种生物标志物的表达水平及空间分布，实现对细胞的表型、组成、形态及细胞间相互作用机理的全面解析。近年来，mIHC技术被成功应用于肿瘤免疫研究领域，为肿瘤的诊断和治疗开辟了新的途径。本文从近年开发的mIHC检测技术出发，针对不同类型mIHC技术的检测原理及其特点进行了详细阐述，重点讨论了新型mIHC检测技术在肿瘤标志物及肿瘤微环境检测等领域中的应用，并对mIHC在肿瘤免疫诊断和治疗领域的应用前景和发展趋势进行了展望。

关键词：多色免疫组织化学荧光多色标记肿瘤诊断循环荧光成像评述

碳黑与镉复合暴露经PERK通路致人支气管上皮细胞自噬与炎症反应

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中华劳动卫生职业病杂志 2024年第1期42卷 1-9页

作者：毛儒琳郑丽婷梁晓虹吕少霞邵月婷广州医科大学公共卫生学院化学致癌研究所广州511436

目的探究碳黑与镉(cadmium,Cd)复合暴露对人支气管上皮细胞株16HBE细胞蛋白激酶R样内质网激酶(protein kinase R-like endoplasmic reticulum kinase,PERK)通路的影响,及其所致自噬和炎症反应的作用机制。方法于2022年1月,复苏培养人支... 详细信息

目的探究碳黑与镉(cadmium,Cd)复合暴露对人支气管上皮细胞株16HBE细胞蛋白激酶R样内质网激酶(protein kinase R-like endoplasmic reticulum kinase,PERK)通路的影响,及其所致自噬和炎症反应的作用机制。方法于2022年1月,复苏培养人支气管上皮16HBE细胞。将碳黑纳米颗粒(carbon black nanoparticles,CBNPs)氧化后吸附Cd^(2+)构建CBNPs-Cd复合物。CCK-8试验检测CBNPs与Cd不同浓度和时间组合暴露对16HBE细胞活力的影响。以2μg/ml Cd,100μg/ml CBNPs,100μg/ml CBNPs+2μg/ml Cd联合暴露24 h作为后续剂量分组。分别应用透射电镜检测自噬体和自噬溶酶体数量。蛋白免疫印迹(Western blotting)法检测PERK通路蛋白PERK、真核翻译起始因子2α(eukaryotic initiation factor 2α,eIf2α)、激活转录因子4(activating transcription factor 4,ATF4)、自噬相关蛋白螯合体1(sequestosome 1,SQSTM1)/P62和微管相关蛋白1轻链3(microtubule-associated protein 1 light chain 3,MAlPILC3,简称LC3)的表达。以基因沉默技术抑制PERK基因后,检测自噬标志蛋白P62、LC3的变化,使用荧光定量PCR技术检测炎症因子白细胞介素-6(interleukin-6,IL6)、白细胞介素-8(interleukin-8,IL8)的表达。多组比较采用单因素方差分析,组内两两之间的比较采用LSD检验;多因素的成分分析采用析因分析。结果CBNPs与Cd单独/复合暴露24 h后,16HBE细胞活力变化均无统计学意义(P>0.05)。与对照组比较,CBNPs与Cd单独/复合暴露组16HBE细胞P62和LC3表达均明显升高(P0.05),但复合暴露组p-PERK/PERK、p-eIf2α/eIf2α、ATF4蛋白的表达均升高(P0.05)。结论CBNPs-Cd复合暴露可能通过激活PERK-eIf2α-ATF4通路,致人支气管上皮细胞自噬受阻、炎症反应增加。

关键词：镉碳黑纳米颗粒上皮细胞蛋白激酶R样内质网激酶-真核翻译起始因子2α-激活转录因子4(PERK-eIF2α-ATF4)通路自噬炎症