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原发性骨质疏松潜在生物标志物的生物信息学分析

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中国组织工程研究 2025年第8期29卷 1741-1750页

作者：赵嘉诚任诗齐祝秦刘佳佳朱翔杨洋南通大学附属医院创伤中心江苏省南通市226001 南通大学医学院江苏省南通市226001 南通大学附属医院手外中心江苏省南通市226001

背景:原发性骨质疏松症的发病率高,但发病机制尚不完全清楚,目前尚缺乏有效的早期筛查指标和治疗方案。目的:通过综合生物信息学分析,进一步探索原发性骨质疏松症的发生机制。方法:原发性骨质疏松症数据来自公共基因表达数据库,筛选差... 详细信息

背景:原发性骨质疏松症的发病率高,但发病机制尚不完全清楚,目前尚缺乏有效的早期筛查指标和治疗方案。目的:通过综合生物信息学分析,进一步探索原发性骨质疏松症的发生机制。方法:原发性骨质疏松症数据来自公共基因表达数据库,筛选差异基因分别进行GO功能和KEGG通路富集分析。此外,将差异基因进行蛋白质-蛋白质相互作用网络确定原发性骨质疏松症相关核心基因,并通过最小绝对收缩和选择运算算法来识别并验证原发性骨质疏松症相关的生物标志物,并分别进行免疫细胞相关分析、基因富集分析以及药物标靶网络分析。最后将生物标志物行qPCR实验验证。结果与结论:①该研究中共获得126个差异基因以及前列腺素、表皮生长因子受体、丝裂原活化蛋白激酶3、转化生长因子B1和视网膜母细胞瘤基因1等5个生物标志物。②GO分析表明差异基因主要富集在细胞对氧化应激的反应以及自噬的调节等方面;KEGG分析显示主要集中在自噬以及细胞衰老等通路当中。③生物标志物的免疫分析发现,前列腺素,视网膜母细胞瘤基因1、丝裂原活化蛋白激酶3与免疫细胞密切相关。④基因富集分析表明,生物标志物与免疫相关途径有关。⑤药物标靶网络分析显示5个生物标志物与原发性骨质疏松症药物相关。⑥qPCR结果表明,前列腺素、表皮生长因子受体、丝裂原活化蛋白激酶3和转化生长因子B1在原发性骨质疏松症样本中,与对照样本相比表达显著上升(P诊断及靶向治疗提供了参考依据。

关键词：原发性骨质疏松生物标志物生物信息学药物标靶网络蛋白质-蛋白质相互作用网络

增殖诱导配体小干扰RNA对人结直肠癌裸鼠移植瘤细胞增殖和凋亡的影响

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中华肿瘤杂志 2010年第8期32卷 570-574页

作者：王敬春丁伟峰孙宝兰景蓉蓉黄华王惠民南通大学附属医院检验医学中心 226001 南通大学附属医院病理诊断中心 226001

目的研究增殖诱导配体（APRIL）小干扰RNA（siRNA）对人结直肠癌裸鼠移植瘤细胞增殖和凋亡的抑制作用.方法建立人结直肠癌裸鼠移植瘤模型,将裸鼠分为3组,瘤块内分别注射APRIL siRNA、空载体和PBS液,每2天注射1次,共2周.采用实时荧光定... 详细信息

目的研究增殖诱导配体（APRIL）小干扰RNA（siRNA）对人结直肠癌裸鼠移植瘤细胞增殖和凋亡的抑制作用.方法建立人结直肠癌裸鼠移植瘤模型,将裸鼠分为3组,瘤块内分别注射APRIL siRNA、空载体和PBS液,每2天注射1次,共2周.采用实时荧光定量PCR法和免疫组化SP法检测APRIL siRNA对APRILmRNA和蛋白表达的影响,采用酶联免疫吸附（ELISA）法检测肿瘤内增殖细胞核抗原（PCNA）含量的变化,采用免疫组化SP法检测肿瘤内bcl-2和bcl-xl蛋白的表达,采用原位末端标记（TUNEL）法检测肿瘤细胞的凋亡.结果 APRIL siRNA能敲低APRIL基因的表达水平,APRIL siRNA组移植瘤内APRIL mRNA的相对表达量为（0.13 ±0.05）×10-3,明显低于空载体组[（0.95 ±0.04）× 10-3]和空白对照组[（0.96±0.05）×10-3,P＜0.05].APRIL siRNA组APRIL蛋白的表达比空载体组和空白对照组降低了（87.5%±5.0%,P＜0.05）.APRILsiRNA组裸鼠移植瘤生长缓慢,瘤块重量较空载体组和PBS对照组明显降低（P＜0.05）.APRIL siRNA组移植瘤内PCNA的含量为（176.8±18.1）ng/ml,明显低于空载体组[（330.0±20.5）ng/ml]和空白对照组[（328.4±22.8）ng/ml,P＜0.05];bcl-2和bcl-xl蛋白的表达量也较空载体组和空白对照组明显降低（P＜0.05）.APRIL siRNA组移植瘤内凋亡细胞的数量增多,凋亡率为40.1%±2.5%,明显高于空载体组（2.5%±0.1%）和空白对照组（2.5%±0.2%,P＜0.05）.结论 APRIL siRNA能在裸鼠体内抑制人结直肠癌细胞的增殖,并促进细胞凋亡,达到显著的抑瘤效果.APRIL基因可能成为人结直肠癌基因靶向沉默治疗的重要候选基因之一.

关键词：增殖诱导配体 RNA干扰结直肠肿瘤裸鼠

一种罕见的菌血症病原菌——霍氏鲍特菌的分离鉴定及临床意义分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2019年第6期39卷 425-431页

作者：浦江钱晨李娴汪桂华汤自洁沈蕾鞠少卿褚少朋南通大学附属医院临床检验诊断中心 226001

目的通过探讨一株罕见菌——霍氏鲍特菌(Bordetella holmesii, ***)的鉴定及耐药特征,分析其临床意义,提高对该菌的检出及临床诊疗水平。方法从细菌培养特性、生化特征以及16S rRNA基因序列分析来鉴定一株菌血症分离菌;运用Mega 7.0软... 详细信息

目的通过探讨一株罕见菌——霍氏鲍特菌(Bordetella holmesii, ***)的鉴定及耐药特征,分析其临床意义,提高对该菌的检出及临床诊疗水平。方法从细菌培养特性、生化特征以及16S rRNA基因序列分析来鉴定一株菌血症分离菌;运用Mega 7.0软件对鲍特菌属全部成员模式菌株与所分离菌16S rRNA基因序列进行同源性比对,并构建系统进化树;E-test法检测该分离菌的药物敏感性;分别添加不同浓度核黄素及其抑制剂光黄素于该菌培养基中,检测其生长活力。结果引起该免疫功能完善者菌血症的病原菌为***,并将菌种上传中国普通微生物菌种保藏管理中心(CGMCC,菌种保藏号:CGMCC 1.13721);同时将该分离菌*** ABD2 16S rRNA基因序列上传美国国家生物技术信息中心(NCBI,序列号:KT828544.1);无根树显示***与百日咳鲍特菌更具有亲缘性;药物敏感性试验(AST)显示哌拉西林、头孢他啶、头孢吡肟、亚胺培南、美罗培南、环丙沙星、左氧氟沙星、庆大霉素、阿米卡星、红霉素、四环素以及多黏菌素对该菌株的最小抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)较低,而头孢唑啉、头孢呋辛酯、头孢西丁、头孢噻肟、氨曲南及复方新诺明的MIC值较高;核黄素能够促进***的生长,光黄素则抑制该菌的生长。结论***分离率极低,鉴定困难,因此临床、微生物学以及流行病学相关资料甚少,为一种罕见的病原菌,有待我们更深入地探讨。

关键词：霍氏鲍特菌菌血症免疫功能完善 16S rRNA基因序列分析核黄素光黄素

靶向增殖诱导配体的RNA干扰对人结直肠癌裸鼠移植瘤的影响

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中华实验外科杂志 2010年第4期27卷 465-467,I0002页

作者：王敬春王惠民丁伟峰黄华孙宝兰景蓉蓉南通大学附属医院检验医学中心 226001 南通大学附属医院病理诊断中心 226001 江苏省南通大学公共卫生学院

目的利用RNA干扰（RNAi）技术观察增殖诱导配体（APRIL）siRNA（pGC—shAPRIL重组干扰质粒）对裸鼠SW480移植瘤的影响。方法建立裸鼠人结直肠癌移植瘤模型，待皮下瘤块长到一定体积，全部裸鼠分为APRILsiRNA组、空载体组和磷酸盐缓冲液... 详细信息

目的利用RNA干扰（RNAi）技术观察增殖诱导配体（APRIL）siRNA（pGC—shAPRIL重组干扰质粒）对裸鼠SW480移植瘤的影响。方法建立裸鼠人结直肠癌移植瘤模型，待皮下瘤块长到一定体积，全部裸鼠分为APRILsiRNA组、空载体组和磷酸盐缓冲液（PBS）组，分别进行瘤块内注射。逆转录-聚合酶链反应（RT—PCR）检测移植瘤APRILmRNA水平；瘤块和裸鼠肝肺苏木素-伊红（HE）染色病理检测；免疫组织化学法检测APRIL、核增殖抗原（Ki-67）、基质金属蛋白酶（MMP）-2蛋白表达。结果APRILsiRNA组，与空载体组和PBS组比较，APRILmRNA[（1．36±0．03）×10^8、（1．05±0．02）×10^7、（1．04±0．01）×10^8copy／ml]和蛋白表达得分（2．00±0．40、7．00±0．45、8．00±0．40）明显降低（P〈0．05）；瘤块体积显著减小[（0．78±0．04）、（1．60±0．07）、（1．66±0．06）cm3]（P〈0．05）；与之相应Ki-67（2．00±0．45、8．00±0．54、7．00±0．44）和MMP-2（3．00±0．44、7．00±0．45、7．00±0．55）蛋白表达显著减弱（P〈0．05）。结论RNAi敲低APRIL基因表达，抑制了裸鼠SW480移植瘤的生长和转移，打靶APRIL基因的RNAi技术有望成为人结直肠癌的治疗途径。

关键词： RNA干扰结直肠癌增殖转移

B淋巴细胞刺激因子及其受体在多发性骨髓瘤中的表达及其意义

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中华血液学杂志 2009年第4期30卷 247-250页

作者：浦江王跃国王梅袁红香鞠少卿南通大学附属医院临床检验诊断中心 226006

目的探讨B淋巴细胞刺激因子（BLyS）及其受体在多发性骨髓瘤（MM）中的表达及其意义。方法采用流式细胞术（FCM）分析人MM肿瘤细胞系KM3及CZ-1细胞表面BLyS及其受体的表达；RT—PCR及Western blot进一步验证BLyS及其受体的表达；采用荧... 详细信息

目的探讨B淋巴细胞刺激因子（BLyS）及其受体在多发性骨髓瘤（MM）中的表达及其意义。方法采用流式细胞术（FCM）分析人MM肿瘤细胞系KM3及CZ-1细胞表面BLyS及其受体的表达；RT—PCR及Western blot进一步验证BLyS及其受体的表达；采用荧光免疫细胞化学法和激光共聚焦技术鉴定KM3细胞中BEyS蛋白的表达与定位；WST细胞增殖实验检测BLyS对MM肿瘤细胞生长与存活的影响。ELISA及荧光定量-聚合酶链反应（RTQ-PcR）测定MM患者BLyS蛋白与mRNA的表达水平。同时分析乳酸脱氢酶（LDH）、β2微球蛋白浓度与BLys蛋白及mRNA表达水平的关系。结果①MM细胞能够表达BLyS及其受体；②BLyS定位表达于KM3细胞的浆膜上；③BLyS促进MM细胞的生长与存活；④MM患者BLys蛋白或mRNA表达水平显著高于正常对照组（P值均〈0．01）；⑤直线相关分析显示LDH、β2微球蛋白浓度与BLyS蛋白及mRNA表达水平呈显著相关性。结论BLyS及其受体对于MM发生、发展可能起着重要的作用。

关键词：多发性骨髓瘤 B淋巴细胞刺激因子乳酸脱氢酶 β2微球蛋白

B细胞活化因子及其特异性受体BAFF-R在B细胞性非霍奇金淋巴瘤中的表达及其意义

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中华微生物学和免疫学杂志 2015年第11期35卷 821-826页

作者：浦江褚少朋王梅钱晨申娴娟南通大学附属医院临床检验诊断中心 226001 南通大学附属医院外科综合实验室 226001 南通大学

目的探讨B细胞活化因子（BAFF）及其特异性受体BAFF-R在B细胞性非霍奇金淋巴瘤（B-NHL）中的表达及其意义。方法ELISA及荧光定量-聚合酶链反应（RTQ-PCR）测定临床标本BAFF及其特异性受体BAFF-R蛋白与mRNA的表达水平；RT—PCR、Western ... 详细信息

目的探讨B细胞活化因子（BAFF）及其特异性受体BAFF-R在B细胞性非霍奇金淋巴瘤（B-NHL）中的表达及其意义。方法ELISA及荧光定量-聚合酶链反应（RTQ-PCR）测定临床标本BAFF及其特异性受体BAFF-R蛋白与mRNA的表达水平；RT—PCR、Western blot、荧光免疫细胞化学法和激光共聚焦技术鉴定人Burkitt’s 淋巴瘤细胞Raji中BAFF及BAFF-R的表达与定位；运用免疫组化的方法分析B—NHL患者肿瘤组织中BAFF的表达；WST细胞增殖试验及TUNEL法检测BAFF及其受体BAFF-R对B—NHLRaji细胞生长、存活与凋亡的影响。直线相关分析LDH浓度与BAFF蛋白及mRNA表达水平的关系。结果（1）B-NHL患者BAFF蛋白或mRNA表达水平显著高于正常对照组（P〈0．01）；（2）Raji细胞表达BAFF及其受体BAFF-R，并定位表达于Raji细胞的质膜上；（3）BAFF在B—NHL患者的表达量与B—NHL组织亚型有关，BAFF在小B细胞恶性淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤、黏膜相关淋巴瘤和滤泡性淋巴瘤中表达量较高，而在套细胞淋巴瘤中表达量较低。（4）BAFF促进Raji细胞的生长与存活；（5）直线相关分析显示乳酸脱氢酶（LDH）与BAFF蛋白及mRNA表达水平呈显著相关性。结论BAFF及其特异性受体BAFF-R对于B—NHL的发生、发展起着重要的作用。

关键词： B细胞性非霍奇金淋巴瘤 B细胞活化因子 B细胞活化因子受体乳酸脱氢酶

经阴道彩色多普勒超声对子宫内膜癌筛查及术前分期评估的作用

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中华医学杂志 2010年第32期90卷 2250-2254页

作者：谢阳桂于秀张玉泉宋倩吕晓清章建国伏冰吴晨梅南通大学附属医院医学超声科 226001 南通大学附属医院普外实验室南通大学附属医院妇产科南通大学附属医院病理科南通大学硕士研究生

目的探讨经阴道彩色多普勒超声（TVCDS）对子宫内膜癌筛查及术前分期评估的作用.方法应用TVCDS筛查子宫内膜癌高危因素妇女713例,观察子宫内膜形态及病灶的部位、大小、回声、边缘是否规整,测量子宫内膜厚度,内膜与肌层交界面弱回声... 详细信息

目的探讨经阴道彩色多普勒超声（TVCDS）对子宫内膜癌筛查及术前分期评估的作用.方法应用TVCDS筛查子宫内膜癌高危因素妇女713例,观察子宫内膜形态及病灶的部位、大小、回声、边缘是否规整,测量子宫内膜厚度,内膜与肌层交界面弱回声晕的完整性及病灶内血流,检测阻力指数（RI）,判断内膜癌及其肌层浸润程度.根据1988年国际妇产科联盟（FIGO）手术分期标准及磁共振成像（MRI）分期方法,将子宫内膜癌分为Ⅰ～Ⅳ期,并将TVCDS诊断与分期结果与手术病理对照.结果在713例高危人群中TVCDS诊断子宫内膜癌100例,经手术病理证实的子宫内膜癌96例,TVCDS诊断和分期的符合率分别为96%（96/100）和94%（94/100）.结论应用TVCDS诊断子宫内膜癌并能确切分期,为临床制定治疗方案、判断预后提供了可靠依据,具有临床应用价值.

关键词：子宫内膜肿瘤超声检查,多普勒,彩色肿瘤分期

鸟苷酸环化酶C和尾型同源盒转录因子2蛋白在胃癌及癌前病变组织中的表达

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中华医学杂志 2008年第48期88卷 3418-3421页

作者：朱惠君许钟毛振彪张健锋章建国潘正平南通大学附属医院病理科江苏南通226001 南通大学附属医院消化内科江苏南通226001 南通大学附属医院肾脏病理实验室江苏南通226001

目的检测鸟苷酸环化酶C（GC—C）和尾型同源盒转录因子2（CDX2）蛋白在胃癌及癌前病变中的表达，并探讨两者与胃癌生物学行为的关系。方法免疫荧光检测GC-C和CDX2蛋白在23例肠上皮化生、9例异型增生、30例胃癌及相应远癌胃组织中的表达... 详细信息

目的检测鸟苷酸环化酶C（GC—C）和尾型同源盒转录因子2（CDX2）蛋白在胃癌及癌前病变中的表达，并探讨两者与胃癌生物学行为的关系。方法免疫荧光检测GC-C和CDX2蛋白在23例肠上皮化生、9例异型增生、30例胃癌及相应远癌胃组织中的表达，Western印迹检测两者在30例胃癌及相应远癌胃组织中的表达。结果GC-C和CDX2蛋白在肠上皮化生（均为9例阳性）、异型增生（均为5例阳性）和胃癌（分别为17例、18例阳性）组织中表达阳性率均显著高于远癌胃组织（均无表达）；两者在肠型胃癌中的表达均高于弥漫型（均P〈0．05），与年龄、性别、病灶大小、临床病理分期、分化程度、淋巴结转移等因素无关；GC—C和CDX2蛋白在肠上皮化生和胃癌中两者的表达呈正相关（Spearman秩相关系数r=0．4524、0．3845）。结论GC—C和CDX2蛋白的异常表达与肠型胃癌发生发展有关，检测其变化可能有助于胃癌早期诊断。

关键词：胃肿瘤化生鸟苷酸环化酶尾型同源盒转录因子

血清hsa_circ_0000437对胃癌辅助诊断及预后判断的意义

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中华检验医学杂志 2022年第5期45卷 509-515页

作者：申娴娟沈蕾马硕戚菁鞠少卿南通大学附属医院医学检验中心南通226001 南通大学附属医院临床医学研究中心南通226001

目的探讨胃癌患者血清hsa_circ_0000437表达水平及其临床价值。方法选取2018年10月至2020年12月南通大学附属医院经病理确诊的80例胃癌患者(男57例,女23例);50例胃良性疾病患者(男28例,女22例)及80名健康对照者(男46例,女34例)。收集血... 详细信息

目的探讨胃癌患者血清hsa_circ_0000437表达水平及其临床价值。方法选取2018年10月至2020年12月南通大学附属医院经病理确诊的80例胃癌患者(男57例,女23例);50例胃良性疾病患者(男28例,女22例)及80名健康对照者(男46例,女34例)。收集血清样本,同时收集上述胃癌患者中35例患者手术后血清样本。采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)方法检测血清hsa_circ_0000437表达水平。采用Mann-Whitney U检验比较不同组间、胃癌患者不同分期及手术前后血清hsa_circ_0000437水平的差异,采用χ²检验分析胃癌患者血清hsa_circ_0000437水平与其临床病理特征之间的相关性。化学发光法检测癌胚抗原(CEA)、糖类抗原199(CA199)、糖类抗原724(CA724)。运用受试者工作特征(ROC)曲线及其曲线下面积(AUC)评估hsa_circ_0000437、CEA、CA199以及CA724的诊断效能。Kaplan-Meier生存曲线分析hsa_circ_0000437表达水平与患者预后的关系。结果胃癌、胃良性疾病患者和健康对照者血清hsa_circ_0000437表达水平分别为2.252(1.235,4.765)、1.598(1.139,1.982)及1.000(0.818,1.385),胃癌患者高于胃良性疾病和健康对照者(P均诊断和预后判断的一个生物学指标。

关键词：胃肿瘤环状RNA 实时荧光定量PCR 生物标志物