检索结果-南通市图书馆

中国组织工程研究 2025年

作者：陈晖张璐陈婧王楠章王若淳陆翠华纪易斐南通大学附属医院消化内科南通大学附属医院临床医学研究中心

背景：胆汁酸代谢在克罗恩病的发生发展中具有重要影响，生物制剂治疗后胆汁酸代谢的变化及关键靶点基因尚未有相应的研究。目的：探讨胆汁酸代谢相关基因在克罗恩病患者中的表达特征，挖掘与生物制剂治疗响应相关的关键基因。方法：通... 详细信息

背景：胆汁酸代谢在克罗恩病的发生发展中具有重要影响，生物制剂治疗后胆汁酸代谢的变化及关键靶点基因尚未有相应的研究。目的：探讨胆汁酸代谢相关基因在克罗恩病患者中的表达特征，挖掘与生物制剂治疗响应相关的关键基因。方法：通过GEO数据库获取转录组数据，分析对比炎症组与对照组、炎症组与治疗组的差异表达基因。利用GO、KEGG和GSEA富集分析评估生物制剂治疗对胆汁酸代谢的影响，使用蛋白质互作网络和WGCNA算法分析差异表达基因，筛选出与生物制剂治疗反应密切相关的模块，进而确定胆汁酸代谢相关的关键基因UGT2A3。在GSE186582数据集的炎症组中，根据UGT2A3的表达水平将样本分为高、低表达组，研究其与免疫浸润的关系，深入探讨UGT2A3与免疫微环境的相互作用；对比分析高、低表达组的临床特征和肠道表现，研究UGT2A3与临床指标(C-反应蛋白、血细胞沉降率、克罗恩病活动指数和克罗恩病内镜活动评分)的相关性。构建UGT2A3的竞争性内源RNA调控网络，对其上游miRNA进行功能富集分析，探索UGT2A3参与胆汁酸代谢的分子机制。利用GSE134809的高通量测序数据进行单细胞分析聚类，观察UGT2A3在不同样本和细胞群间的表达。收集未治疗与经生物制剂治疗后克罗恩病患者的结肠组织样本以及肠息肉患者的健康结肠组织样本，通过免疫组化、qRT-PCR、Western blot检测UGT2A3表达。收集克罗恩病患者与健康对照人群的新鲜粪便，检测胆汁酸水平，并分析UGT2A3与粪便胆汁酸水平的关系。结果与结论：共筛选出11个胆汁酸代谢相关差异表达基因，经生物制剂治疗后这些基因的表达发生显著变化。GO和KEGG富集分析显示，治疗后患者的肠道营养物质吸收和物质代谢过程趋于正常，白细胞趋化和炎症反应通路的活性降低。GSEA分析揭示了胆汁酸代谢相关通路在治疗后显著富集。蛋白质互作网络构建和WGCNA分析确定UGT2A3为与治疗响应密切相关的关键基因。UGT2A3在克罗恩病患者炎症肠道组织中的表达显著降低，生物制剂治疗后其表达恢复正常，该结果在临床标本中得到验证。UGT2A3表达水平与C-反应蛋白、红细胞沉降率、克罗恩病活动指数和克罗恩病内镜活动评分呈显著负相关。受试者工作特征曲线分析显示UGT2A3具有良好的诊断价值(曲线下面积AUC=0.801 0)，并且能够有效反映治疗效果。免疫浸润分析显示，UGT2A3低表达样本中多种免疫细胞浸润显著增加，其表达水平与免疫评分、微环境评分和基质评分均呈负相关。与UGT2A3低表达组相比，高表达组患者粪隐血、穿透性炎症更少，肠道狭窄及一般情况的严重程度更轻。粪便胆汁酸分析发现UGT2A3表达与初级胆汁酸水平呈强负相关，与次级胆汁酸含量呈强正相关。

关键词：克罗恩病炎症性肠病生物制剂胆汁酸代谢生物信息学工程化组织构建

来源：

同方期刊数据库评论

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的机器学习算法预测早期肺腺癌病理类型

引用

中国胸心血管外科临床杂志 2025年第1期32卷 67-72页

作者：黄润棋强光亮刘益飞史加海南通大学附属医院临床研究中心南通大学医学院江苏南通226001 北京大学第三医院胸外科北京100191 南通大学附属医院病理科江苏南通226001 南通大学附属医院胸心外科江苏南通226001

目的探讨基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的机器学习算法预测早期肺腺癌病理类型的准确性。方法回顾性分析2021年1月—2023年1月在南通大学附属医院接受肺部肿瘤切除手术患者的石蜡包埋(formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE)标本。... 详细信息

目的探讨基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的机器学习算法预测早期肺腺癌病理类型的准确性。方法回顾性分析2021年1月—2023年1月在南通大学附属医院接受肺部肿瘤切除手术患者的石蜡包埋(formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE)标本。根据肿瘤的病理学分类,将患者分为3组:良性肿瘤/原位腺癌(benign tumor/adenocarcinoma in situ,BT/AIS)组、微浸润腺癌(minimally invasive adenocarcinoma,MIA)组和浸润性腺癌(invasive adenocarcinoma,IA)组。使用LungMe试剂盒通过甲基化特异性PCR(MS-PCR)测量FFPE标本的SHOX2和RASSF1A甲基化水平。以SHOX2和RASSF1A的甲基化水平为预测变量,采用机器学习算法(包括逻辑回归、XGBoost、随机森林、朴素贝叶斯)预测不同的肺腺癌病理类型,并构建网络服务器供临床使用。结果共纳入272例患者,BT/AIS组、MIA组和IA组患者的平均年龄分别为57.97岁、61.31岁和63.84岁;女性患者占比分别为55.38%、61.11%和61.36%。基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平建立的早期肺腺癌预测模型中,随机森林与XGBoost模型在预测各病理类型时表现良好。随机森林模型的C统计量在BT/AIS组、MIA组和IA组分别为0.71、0.72和0.78。XGBoost模型的C统计量在BT/AIS组、MIA组和IA组分别为0.70、0.75和0.77。朴素贝叶斯模型仅在IA组表现较为稳健,C统计量为0.73,具有一定的预测能力。逻辑回归模型在各组中的表现最差,对各组均无预测能力。通过决策曲线分析,随机森林模型在BT/AIS和MIA病理类型的预测中展示了较高的净收益,表明其在临床应用中具有潜在价值。结论基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的机器学习算法预测早期肺腺癌病理类型具有较高的准确性。

关键词：肺腺癌 SHOX2 RASSF1A 甲基化侵袭性

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

膝关节单髁置换与胫骨高位截骨治疗内翻性膝骨关节炎的比较

引用

中国组织工程研究 2025年第3期29卷 503-509页

作者：石雷施松陆跃陶然马洪冬南通大学附属医院关节外科江苏省南通市226001

背景:早期膝关节炎可行单髁置换和胫骨高位截骨等方法保膝治疗,但两种保膝手术在术后不同时期膝关节恢复方面是否存在差异仍需进一步探讨。目的:比较单髁置换和胫骨高位截骨治疗膝关节内翻性骨关节炎的疗效及相关并发症等方面的差异,为... 详细信息

背景:早期膝关节炎可行单髁置换和胫骨高位截骨等方法保膝治疗,但两种保膝手术在术后不同时期膝关节恢复方面是否存在差异仍需进一步探讨。目的:比较单髁置换和胫骨高位截骨治疗膝关节内翻性骨关节炎的疗效及相关并发症等方面的差异,为临床决策提供参考。方法:选择2018年9月至2022年9月南通大学附属医院行手术治疗的膝关节内翻性骨关节炎患者103例,其中86例获得1年以上随访,根据手术方法分为单髁置换组(n=49)和胫骨高位截骨组(n=37)。分别对两组患者术前及术后4周、3个月、6个月、1年的膝关节功能、疼痛以及力线纠正情况进行评估,采用美国特种外科医院膝关节评分、美国西安大略大学和麦克马斯特大学功能评分、膝关节外侧间隙变化、关节活动度、本体感觉(位置觉)、术后活动恢复速度等指标综合评判。结果与结论:(1)两组患者术前美国特种外科医院膝关节评分、美国西安大略大学和麦克马斯特大学功能评分、膝关节外侧间室大小均无显著差异;(2)术后4周单髁置换组的美国特种外科医院评分高于胫骨高位截骨组(P医院评分低于胫骨高位截骨组,差异有显著性意义(P医院膝关节评分、伸展方向活动度以及膝关节外侧间隙宽度变化上未见明显差异;(5)所有患者的随访数据均超过1年,且在随访期间均未发现不良并发症;(6)提示采用胫骨高位截骨治疗的内翻性膝骨关节炎患者膝关节功能恢复短期效果优于单髁置换患者,但两种方案治疗内翻性膝骨关节炎的中长期疗效无明显差异。

关键词：膝骨关节炎单髁表面置换胫骨高位截骨膝关节功能并发症

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

原发性骨质疏松潜在生物标志物的生物信息学分析

引用

中国组织工程研究 2025年第8期29卷 1741-1750页

作者：赵嘉诚任诗齐祝秦刘佳佳朱翔杨洋南通大学附属医院创伤中心江苏省南通市226001 南通大学医学院江苏省南通市226001 南通大学附属医院手外中心江苏省南通市226001

背景:原发性骨质疏松症的发病率高,但发病机制尚不完全清楚,目前尚缺乏有效的早期筛查指标和治疗方案。目的:通过综合生物信息学分析,进一步探索原发性骨质疏松症的发生机制。方法:原发性骨质疏松症数据来自公共基因表达数据库,筛选差... 详细信息

背景:原发性骨质疏松症的发病率高,但发病机制尚不完全清楚,目前尚缺乏有效的早期筛查指标和治疗方案。目的:通过综合生物信息学分析,进一步探索原发性骨质疏松症的发生机制。方法:原发性骨质疏松症数据来自公共基因表达数据库,筛选差异基因分别进行GO功能和KEGG通路富集分析。此外,将差异基因进行蛋白质-蛋白质相互作用网络确定原发性骨质疏松症相关核心基因,并通过最小绝对收缩和选择运算算法来识别并验证原发性骨质疏松症相关的生物标志物,并分别进行免疫细胞相关分析、基因富集分析以及药物标靶网络分析。最后将生物标志物行qPCR实验验证。结果与结论:①该研究中共获得126个差异基因以及前列腺素、表皮生长因子受体、丝裂原活化蛋白激酶3、转化生长因子B1和视网膜母细胞瘤基因1等5个生物标志物。②GO分析表明差异基因主要富集在细胞对氧化应激的反应以及自噬的调节等方面;KEGG分析显示主要集中在自噬以及细胞衰老等通路当中。③生物标志物的免疫分析发现,前列腺素,视网膜母细胞瘤基因1、丝裂原活化蛋白激酶3与免疫细胞密切相关。④基因富集分析表明,生物标志物与免疫相关途径有关。⑤药物标靶网络分析显示5个生物标志物与原发性骨质疏松症药物相关。⑥qPCR结果表明,前列腺素、表皮生长因子受体、丝裂原活化蛋白激酶3和转化生长因子B1在原发性骨质疏松症样本中,与对照样本相比表达显著上升(P<0.001),而视网膜母细胞瘤基因1在原发性骨质疏松症样本中,与对照样本相比表达显著下降(P<0.001)。⑦总之,该研究筛选并验证了5个原发性骨质疏松潜在生物标志物,为进一步深入探究原发性骨质疏松症的发病机制、早期筛查诊断及靶向治疗提供了参考依据。

关键词：原发性骨质疏松生物标志物生物信息学药物标靶网络蛋白质-蛋白质相互作用网络

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：