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细胞与分子免疫学杂志 2025年第02期 97-104页

作者：杜文雅代禹美乐林芝马涛吴利先大理大学基础医学院微生物学与免疫学教研室

目的 miR-207被发现在自然杀伤(NK)细胞外泌体中表达，参与疾病进展，但暂无与结核病(TB)有关的研究。方法生物信息学方法预测并用双荧光素酶报告实验检测溶酶体关联膜蛋白2(LAMP2)是否与miR-207有靶向关系。使用脂质体转染法将实验分... 详细信息

目的 miR-207被发现在自然杀伤(NK)细胞外泌体中表达，参与疾病进展，但暂无与结核病(TB)有关的研究。方法生物信息学方法预测并用双荧光素酶报告实验检测溶酶体关联膜蛋白2(LAMP2)是否与miR-207有靶向关系。使用脂质体转染法将实验分为四组(OP-LAMP2组：共转染miR-207 mimics和LAMP2过表达质粒；EP组：共转染mimics NC和空载质粒；siLAMP2组：转染siLAMP2; siLAMP2-NC组：转染siLAMP2-NC)。使用H37Ra感染Ana-1细胞建立结核感染模型。结核菌落形成单位计数评估LAMP2对胞内分枝杆菌负荷的影响以及对胞外残留分枝杆菌的清除作用。流式细胞术检测细胞总凋亡率。实时荧光定量PCR检测LAMP2、细胞凋亡基因、焦亡基因及自噬基因相对表达量。Western blot法检测LAMP2蛋白、细胞凋亡、焦亡、自噬蛋白的相对表达量。结果双荧光素酶报告实验检测显示miR-207与LAMP2存在靶向关系，实时荧光定量PCR、Western blot结果统计分析和显微镜下观察证明成功建立感染模型。菌落形成单位计数发现OP-LAMP2组的菌落数低于EP组，siLAMP2组高于siLAMP2-NC组。流式细胞术检测发现OP-LAMP2组总凋亡率低于EP组，siLAMP2组高于siLAMP2-NC组。实时荧光定量PCR及Western blot法检测发现对照组凋亡、焦亡相关蛋白和基因相对表达量趋势为OP-LAMP2低于EP组，siLAMP2组高于siLAMP2-NC组。实时荧光定量PCR检测自噬正调节基因微管相关蛋白1轻链3(LC3)和重组人自噬效应蛋白(Beclin1)在OP-LAMP2组相对表达量高于EP组，siLAMP2组低于siLAMP2-NC组，负调节自噬基因相对表达量与自噬正调节基因趋势相反。自噬相关蛋白相对表达量与自噬基因趋势一致。结论 miR-207通过靶向自噬相关蛋白LAMP2促进巨噬细胞凋亡、细胞焦亡、抑制自噬，促进结核分枝杆菌(Mtb)的存活，为TB提供新的治疗方向。

关键词：结核分枝杆菌(Mtb) miR-207 LAMP2 自噬凋亡焦亡

干扰素调控COVID-19发生及发展的研究进展

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病毒学报 2025年

作者：张遥马宏炜何进伟张芳琳延安大学延安医学院病原生物学教研室空军军医大学基础医学院微生物与病原生物学教研室

自2019年12月至今，严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染所致的新型冠状病毒肺炎（Coronavirus disease 2019, COVID-19）疫情蔓延全球，对人类健康和社会经济产生了严重影响。病毒感染后机体可启动以干扰素（Interferon,IFN）为核心的固有免疫应答，而IFN作为一种重要的固有免疫分子，具有抗病毒和调节免疫反应的双重作用。近期研究表明，SARS-CoV-2可通过多种机制逃逸IFN反应，且在IFN应答缺陷或机体产生IFN自身抗体的条件下，COVID-19患者重症率增加、预后差，提示IFN对COVID-19病情转归具有重要调控作用。本综述将重点讨论IFN在SARS-CoV-2感染中的作用及其对疾病预后的影响，为COVID-19的防控和治疗提供理论支持。

关键词： IFN SARS-CoV-2 COVID-19 固有免疫疾病预后

现代疫苗学赋能新突发病毒性传染病疫苗的快速“智造”——以猴痘疫情为例

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科学通报 2025年第7期70卷 789-798页

作者：郑婷婷王寒王奇慧中国科学院微生物研究所病原微生物与免疫学重点实验室北京大学未来技术学院生物医学工程系

在人类与疾病的不懈斗争中,疫苗始终是捍卫生命健康的坚强盾牌.从古代的人痘接种术到现代疫苗学的飞速发展,再到人工智能(artificial intelligence, AI)的融合创新,疫苗研发已经走过了从萌芽到迅猛发展的历程.然而,在当今人口密集、交... 详细信息

在人类与疾病的不懈斗争中,疫苗始终是捍卫生命健康的坚强盾牌.从古代的人痘接种术到现代疫苗学的飞速发展,再到人工智能(artificial intelligence, AI)的融合创新,疫苗研发已经走过了从萌芽到迅猛发展的历程.然而,在当今人口密集、交通网络四通八达的现代社会,人与人之间、人与自然之间的交互达到了前所未有的频繁程度,

关键词： modern vaccines rapid vaccine development intelligent manufacturing rational design monkeypox virus

结核分枝杆菌RpfB及RpfE蛋白的生物信息学分析

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微生物学杂志 2025年第1期45卷 106-116页

作者：杨雨婷杨国平王艳龚丽坤楚雄州中医医院检验科云南楚雄675000 楚雄州彝族医药研究院云南楚雄675000 大理大学基础医学院医学微生物学及免疫学教研室云南大理671000

运用生物信息学方法预测RpfB和RpfE蛋白的生物学特性及抗原表位,并分析其作为新型结核疫苗候选抗原的潜力。从NCBI数据库中获取Rv1009、Rv2450c基因的碱基序列,从Uniprot数据库中获取Rv1009基因编码蛋白RpfB及Rv2450c基因编码蛋白RpfE... 详细信息

运用生物信息学方法预测RpfB和RpfE蛋白的生物学特性及抗原表位,并分析其作为新型结核疫苗候选抗原的潜力。从NCBI数据库中获取Rv1009、Rv2450c基因的碱基序列,从Uniprot数据库中获取Rv1009基因编码蛋白RpfB及Rv2450c基因编码蛋白RpfE的氨基酸序列,运用生物信息学分析软件ORFfinder、ProtParam、ProtScale、TMPRED、TMHMM、SignalP 5.0、NetNGlyc 1.0、YinOYang 1.2、NetPhos 3.1、STRING、SOPMA、SWISS-MODEL、DNAStar、SYFPEITHI、NetCTL 1.2及Net MHCII pan 4.0对RpfB及RpfE蛋白的理化性质、亲疏水性、结构、信号肽、糖基化/磷酸化位点、跨膜结构、互作蛋白及抗原表位进行分析。结果表明,Rv1009基因全长1089 bp,有5个开放阅读框,其编码蛋白RpfB由362个氨基酸组成,为含有信号肽的疏水性跨膜蛋白,其二级结构以无规则卷曲为主,该蛋白含有1个N-糖基化位点、29个磷酸化位点、8个优势CTL细胞抗原表位、14个优势Th细胞抗原表位及10个优势B细胞抗原表位;Rv2450c基因全长519 bp,有1个开放阅读框,其编码蛋白RpfE由172个氨基酸组成,为含有信号肽的亲水性蛋白,无跨膜结构,其二级结构以无规则卷曲为主,该蛋白含有2个N-糖基化位点、9个磷酸化位点、4个优势CTL细胞抗原表位、6个优势Th细胞抗原表位及7个优势B细胞抗原表位。RpfB及RpfE蛋白具有较好的免疫原性及多个优势T、B细胞抗原表位,可作为Mtb多肽疫苗研制的候选优势蛋白。

关键词：结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb) RpfB RpfE 生信分析抗原表位多肽疫苗

基于生物信息学分析线粒体转录因子B1在结肠癌中高表达并促进细胞生长

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中国生物化学与分子生物学报 2025年第1期41卷 125-135页

作者：欧志高陈会莹汤婷朱剑军山西医科大学基础医学院医学细胞生物与遗传学教研室太原030001

线粒体转录因子B1(mitochondrial transcription factor B1,TFB1M)主要参与线粒体DNA转录,与肝细胞癌、星状细胞瘤等发生发展有关,然而其在结肠癌中的作用尚不清楚。本研究基于公共数据库和免疫组织化学方法分析TFB1M在结肠癌中的表达... 详细信息

线粒体转录因子B1(mitochondrial transcription factor B1,TFB1M)主要参与线粒体DNA转录,与肝细胞癌、星状细胞瘤等发生发展有关,然而其在结肠癌中的作用尚不清楚。本研究基于公共数据库和免疫组织化学方法分析TFB1M在结肠癌中的表达水平及预后;筛选TFB1M高低表达组差异表达基因,进行功能富集分析,突变分析、免疫细胞浸润和药物敏感性分析等。采用CCK-8、流式细胞术等方法检测过表达TFB1M对结肠癌细胞活力、凋亡及细胞周期分布的影响。结果发现,TFB1M在结肠癌中表达水平显著升高,其表达水平与N分期和TNM分期有关(P免疫、免疫球蛋白产生等信号通路有关。此外,ZFHX4、RYR2、PIK3CA和FAT 4等基因在TFB1M高表达组突变频率显著升高(均P免疫细胞浸润及功能在结肠癌细胞生长过程中发挥关键作用。

关键词：结肠癌线粒体转录因子B1 细胞活力细胞凋亡

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佛手柑内酯延缓骨关节炎软骨细胞衰老

陆军军医大学学报 2025年第3期47卷 262-274页

作者：叶元兰刘恺文潘一鸣郭风劲重庆医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室重庆

目的基于网络药理学、分子对接技术并结合体外实验探讨佛手柑内酯(Bergapten)治疗骨关节炎(osteoarthritis,OA)的作用与机制。方法检索Super-Pred、Swiss Target Prediction、Drug Bank等相关数据库获取佛手柑内酯的功能靶点和OA疾病相... 详细信息

目的基于网络药理学、分子对接技术并结合体外实验探讨佛手柑内酯(Bergapten)治疗骨关节炎(osteoarthritis,OA)的作用与机制。方法检索Super-Pred、Swiss Target Prediction、Drug Bank等相关数据库获取佛手柑内酯的功能靶点和OA疾病相关作用靶点,将靶点通过Venny 2.1.0进行交集,利用STRING数据库进行蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)分析,利用AutoDock Vina软件进行分子对接。在C28/I2细胞中进行体外验证实验,CCK-8检测佛手柑内酯对C28/I2细胞增殖活性的影响,RT-qPCR和细胞免疫荧光检测增殖凋亡、炎症和衰老相关分泌表型(senescence associated secretory phenotype,SASP)因子的表达情况。使用细胞衰老β-半乳糖苷酶(senescence-associatedβ-galactosidase,SA-β-Gal)染色试剂盒检测SA-β-Gal水平的变化。结果筛选得到145个佛手柑内酯治疗OA的潜在作用靶点。PPI分析发现HSP90AA1、EGFR、HIF1A、PIK3CA 4个潜在核心靶点,且分子对接可形成较稳定的复合物。CCK-8发现,10μmol/L佛手柑内酯处理48 h,C28/I2细胞的存活率最高(P免疫荧光、RT-qPCR和Western Blot实验显示,佛手柑内酯处理后,细胞增殖标志物PCNA、CCND1和CCNE1的表达增加(P<0.05),而凋亡指标Caspase3和BAX的表达降低(P<0.05)。同时,佛手柑内酯处理后,IL-1β诱导的炎性因子IL-6和TNF-α的表达降低,而抗炎因子IL-4和IL-10的表达增加(P<0.05)。SASP因子P16、P21、MMP9和MMP13的表达也显著减少(P<0.05)。Sa-β-Gal染色显示,IL-1β诱导后C28/I2细胞的β-半乳糖苷酶水平显著增加(P<0.05),而佛手柑内酯处理后,β-半乳糖苷酶染色的阳性细胞率显著降低(P<0.05)。结论佛手柑内酯可降低IL-1β刺激的软骨细胞中的SASP因子IL-6、TNF-α、P16、P21、MMP9、MMP13等的表达,从而在延缓OA进展中发挥其抗炎、抗衰老的作用。

关键词：骨关节炎 5-甲氧基补骨脂素网络药理学衰老相关分泌表型

大麻二酚对转化生长因子β1诱导肝星状细胞活化和肝纤维化的作用

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中国组织工程研究 2025年第23期29卷 4965-4974页

作者：王联谢娜赵珮伶陈浩李芏酉王豫萍贵州医科大学附属医院临床检验中心贵州省贵阳市550003 贵州医科大学医学检验学院临床微生物学及免疫学教研室贵州省贵阳市550004

背景:大麻二酚具有抗炎、抗氧化等药理学作用,并且不具有精神活性,在肝脏疾病中的研究日渐增加,但其对肝星状细胞转化生长因子β1/Smad信号转导通路的作用尚未明确。目的:探讨大麻二酚对肝星状细胞中转化生长因子β1/Smad信号转导通路... 详细信息

背景:大麻二酚具有抗炎、抗氧化等药理学作用,并且不具有精神活性,在肝脏疾病中的研究日渐增加,但其对肝星状细胞转化生长因子β1/Smad信号转导通路的作用尚未明确。目的:探讨大麻二酚对肝星状细胞中转化生长因子β1/Smad信号转导通路的影响,研究其抗肝纤维化的可能机制。方法:(1)体外实验:选取大鼠肝星状细胞株(HSC-T6),分6组培养:对照组常规培养24 h,单纯药物组加入大麻二酚培养24 h,造模组加入转化生长因子β1培养24 h,造模+低剂量药物组、造模+高剂量药物组、造模+阳性对照组均加入转化生长因子β1培养24 h后分别加入1,5μmol/L大麻二酚或水飞蓟素培养24 h。培养结束后,检测各组细胞α-平滑肌肌动蛋白与Ⅰ型胶原mRNA表达、白细胞介素1β与肿瘤坏死因子α水平及Ⅰ型胶原、转化生长因子β1/Smad信号转导通路蛋白表达。(2)动物体内实验:将C57BL/6J小鼠随机分为5组,每组8只:假手术组不造模,造模组、造模+低剂量药物组、造模+高剂量药物组、造模+阳性对照组通过胆管结扎法建立肝纤维化模型,造模3周后分别腹腔注射4,8 mg/kg大麻二酚或水飞蓟素,1次/d,连续给药7 d。给药结束后,检测各组小鼠肝功能、肝脏病理形态及α-平滑肌肌动蛋白、Ⅰ型胶原、转化生长因子β1/Smad信号转导通路相关蛋白表达。结果与结论:(1)体外实验:与对照组比较,造模组HSC-T6细胞α-平滑肌肌动蛋白与Ⅰ型胶原mRNA表达、白细胞介素1β与肿瘤坏死因子α水平以及Ⅰ型胶原、转化生长因子β1、p-Smad2/3蛋白表达均升高(P<0.05),Smad7蛋白表达降低(P<0.05);两种剂量大麻二酚处理可改善转化生长因子β1诱导的HSC-T6细胞上述指标的变化,并且以造模+高剂量药物组改善作用更明显;(2)体内实验:与假手术组比较,模型组小鼠血清丙氨酸氨基转移酶、天门冬氨酸氨基转移酶活性升高(P<0.05),肝组织中炎性细胞浸润及胶原含量增加(P<0.05),转化生长因子β1/Smad信号转导通路被激活,α-平滑肌肌动蛋白、Ⅰ型胶原蛋白表达升高(P<0.05);两种剂量大麻二酚干预可减轻造模小鼠上述指标的变化,并且以造模+高剂量药物组效果更明显;(3)结果表明,大麻二酚通过抑制肝星状细胞转化生长因子β1/Smad信号传导通路的激活抑制肝纤维化。

关键词：大麻二酚肝星状细胞肝纤维化信号转导通路转化生长因子β1/Smad HSC-T6细胞

基于人工智能设计的抗微生物肽Perceptide-TJ-2对汉滩病毒感染的抑制效果及其潜在机制

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空军军医大学学报 2025年

作者：侯诗源刘梓谕孙丹妮沈星刘欣悦刘蓉蓉吴兴安空军军医大学基础医学院微生物与病原生物学教研室

目的探讨基于人工智能设计的抗微生物肽（AMPs）Perceptide-TJ-2对汉滩病毒（HTNV）感染的抑制作用及主要抗病毒机制。方法利用免疫荧光、qRT-PCR、Westernblotting等技术，检测在不同感染时间点，Perceptide-TJ-2处理病毒或宿主细胞... 详细信息

目的探讨基于人工智能设计的抗微生物肽（AMPs）Perceptide-TJ-2对汉滩病毒（HTNV）感染的抑制作用及主要抗病毒机制。方法利用免疫荧光、qRT-PCR、Westernblotting等技术，检测在不同感染时间点，Perceptide-TJ-2处理病毒或宿主细胞后病毒的表达情况。同时，通过上述方法验证Perceptide-TJ-2在感染早期吸附和穿入阶段的作用。此外，利用表面等离子共振实验证实了Perceptide-TJ-2和HTNVGn蛋白之间的相互作用，并通过分子对接模拟了Perceptide-TJ-2和HTNVGn之间的结合情况。结果感染前对宿主细胞或HTNV病毒进行肽预处理，或在感染过程中加入肽和病毒，均能有效抑制HTNV的感染。进一步研究发现，Perceptide-TJ-2主要在病毒吸附阶段发挥抑制作用，其机制是Perceptide-TJ-2肽能够结合HTNVGn蛋白，从而阻止病毒入侵宿主细胞。结论研究结果表明，Perceptide-TJ-2具有显著的抗HTNV感染活性，其主要机制为通过结合HTNV Gn蛋白，阻碍病毒与宿主细胞的结合，从而发挥抗病毒作用。该研究为开发新型抗HTNV感染的AMPs药物提供了潜在的方案。

关键词：汉滩病毒抗微生物肽抗病毒作用机制包膜糖蛋白

小檗碱对2型糖尿病大鼠肠壁通透性和肠道菌群的影响

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中国微生态学杂志 2025年第02期 139-146+154页

作者：赵洋栾海艳李晶王肖烨高璐张昆佳木斯大学基础医学院黑龙江省微生物-免疫调解网络与相关疾病重点实验室

目的探究小檗碱（BBR）是否能改善糖尿病诱发的肠壁损伤和菌群紊乱，为BBR在2型糖尿病（T2DM）治疗方面的应用提供实验基础。方法将6～7周龄40只健康清洁级雄性SD大鼠称重后随机分为空白对照组（NC组）、高脂高糖组（HFG组）、糖尿病... 详细信息

目的探究小檗碱（BBR）是否能改善糖尿病诱发的肠壁损伤和菌群紊乱，为BBR在2型糖尿病（T2DM）治疗方面的应用提供实验基础。方法将6～7周龄40只健康清洁级雄性SD大鼠称重后随机分为空白对照组（NC组）、高脂高糖组（HFG组）、糖尿病组（DM组）及黄连素组（BBR组），每组10只。造模成功后取各组大鼠结肠、回肠进行肠壁通透性观察，取各组大鼠粪便样本进行16S rRNA基因测序。结果 HFG组、DM组大鼠结肠组织黏膜出现不同程度病理变化，BBR组大鼠结肠组织黏膜有改善；DM组大鼠肠脂肪酸结合蛋白（I-FABP）、法尼醇X受体（FXR） mRNA的表达水平降低（F=6.698, P微生物群落差异，DM组大鼠肠道菌群系统进化多样性（Faith's）指数低于NC组（t=33.000,P=0.015）,BBR组大鼠肠道菌群丰富度低于DM组（t=34.000,P=0.009）。与NC组相比，DM组大鼠肠道菌群物种总数和丰度降低，厚壁菌门＿C(t=-3.502,P=0.004)、脱硫杆菌门（t=2.537,P=0.012）相对丰度升高，Muribaculaceae菌科（t=-2.442,P=0.015）、瘤胃球菌属＿B(t=2.739,P=0.006)相对丰度降低；与DM组相比，BBR能降低T2DM大鼠厚壁菌门＿C(t=-2.394,P=0.018)、脱硫杆菌门（t=2.854,P=0.005）相对丰度，升高Muribaculaceae菌科（t=2.739,P=0.006）、瘤胃球菌属＿B(t=2.968,P=0.005)相对丰度。结论 BBR可以改善DM组大鼠肠道菌群结构。

关键词：小檗碱 2型糖尿病肠道菌群肠壁屏障 16S rRNA