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视网膜色素变性中VSIG 4基因变异对小胶质细胞功能的影响及其作用机制

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中华实验眼科杂志 2024年第10期42卷 898-908页

作者：徐春龙张国伟杜君贾珍王静萍王梓文李杨陆宏南通大学附属医院眼科南通大学医学院南通226001

目的研究视网膜色素变性(RP)中的V-set和免疫球蛋白结构域4(VSIG 4)基因变异对小胶质细胞功能的影响及其作用机制。方法利用免疫荧光染色检测VSIG4在小鼠视网膜中的定位。给HMC3细胞(人小胶质细胞系)转染野生型(Len-WT)、突变型(Len-Mut... 详细信息

目的研究视网膜色素变性(RP)中的V-set和免疫球蛋白结构域4(VSIG 4)基因变异对小胶质细胞功能的影响及其作用机制。方法利用免疫荧光染色检测VSIG4在小鼠视网膜中的定位。给HMC3细胞(人小胶质细胞系)转染野生型(Len-WT)、突变型(Len-Mut)VSIG 4基因以及转染空载病毒(Len-Cont),并通过有或无脂多糖(LPS)刺激HMC3细胞分为对照组、LPS-Len-WT组、LPS-Len-Mut组、LPS-Len-Cont组、Len-WT组、Len-Mut组和Len-Cont组。采用实时荧光定量PCR检测炎症因子白细胞介素1β(IL-1β)和肿瘤坏死因子α(TNF-α)的mRNA表达水平;采用Western blot法检测核因子红细胞系2相关因子2(Nrf2)、血红素加氧酶1(HO-1)、谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)、核转录因子κB(NF-κB)p65亚单位(P65)和磷酸化P65(PP65)的蛋白表达水平;采用吞噬实验检测细胞吞噬功能;采用细胞划痕和Transwell实验检测细胞迁移能力。将LPS刺激状态下的HMC3细胞与661W细胞(小鼠视网膜感光细胞)共培养,采用Western blot法检测B细胞淋巴瘤因子2(Bcl-2)和Bcl-2相关X蛋白(Bax)表达水平,采用凋亡实验检测661W细胞的凋亡数量。结果VSIG4定位于小鼠视网膜小胶质细胞。实时荧光定量PCR检测结果显示,与LPS-Len-WT组相比,LPS-Len-Mut组HMC3细胞IL-1β、TNF-αmRNA相对表达量均显著升高,差异均有统计学意义(均P<0.05)。Western blot检测结果显示,与LPS-Len-WT组相比,LPS-Len-Mut组HMC3细胞Nrf2、HO-1、GPX4的蛋白表达水平均显著降低,PP65/P65比值显著升高,差异均有统计学意义(均P<0.05)。吞噬实验检测结果显示,Len-Cont组、LPS-Len-Cont组、LPS-Len-WT组和LPS-Len-Mut组细胞吞噬率分别为(35.67±3.22)%、(63.67±10.07)%、(84.00±3.46)%和(64.67±2.31)%,各组HMC3细胞吞噬率总体比较差异有统计学意义(F=59.06,P<0.001)。与LPS-Len-WT组相比,LPS-Len-Mut组HMC3细胞吞噬率显著降低,差异有统计学意义(P<0.05)。细胞划痕和Transwell实验检测结果显示,与LPS-Len-WT组相比,LPS-Len-Mut组HMC3细胞24、48 h时迁移率和24 h时单位面积侵袭细胞数显著降低,差异均有统计学意义(均P<0.05)。与LPS-Len-WT组相比,共培养系统中LPS-Len-Mut组Bax/Bcl-2蛋白表达量比值及细胞凋亡数量显著升高,差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论VSIG4定位于小鼠视网膜小胶质细胞。RP中的VSIG 4基因变异后,LPS刺激状态下的HMC3细胞NF-κB信号通路激活,Nrf2/HO-1信号通路活化程度减弱,细胞分泌炎症因子增多;吞噬和迁移能力减弱;共培养系统中细胞凋亡增加。

关键词： V-set和免疫球蛋白结构域4 基因变异视网膜色素变性小胶质细胞吞噬

一种改进的基于110 GHz在片S参数测试的HEMT器件寄生电阻提取方法

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红外与毫米波学报 2024年第1期43卷 85-90页

作者：李织纯吕渊婷张傲高建军华东师范大学物理与电子科学学院上海200241 南通大学交通与土木工程学院江苏南通226019

提出了一种改进的高电子迁移率晶体管寄生电阻提取方法,该方法利用了特殊偏置点(V_(gs)>V_(th),V_(ds)=0V)的等效电路模型,推导了寄生电阻的表达式,采用半分析法对寄生电阻进行了优化。1~110 GHz S参数实测结果和仿真的S参数一致,证明... 详细信息

提出了一种改进的高电子迁移率晶体管寄生电阻提取方法,该方法利用了特殊偏置点(V_(gs)>V_(th),V_(ds)=0V)的等效电路模型,推导了寄生电阻的表达式,采用半分析法对寄生电阻进行了优化。1~110 GHz S参数实测结果和仿真的S参数一致,证明该方法是有效的。

关键词： InP高电子迁移率晶体管等效电路模型寄生电阻器件建模

二维超声联合彩色多普勒超声预测乳腺癌Ki-67表达水平的研究

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中国临床医学影像杂志 2024年第4期35卷 234-237页

作者：陈桂芳钱红燕张晴冒玉香朱鹏飞何英南通大学附属肿瘤医院江苏南通226361

目的:基于超声声像图特征预测乳腺癌患者Ki-67表达水平。方法:回顾性分析南通大学附属肿瘤医院收治的172例乳腺癌患者资料,<50岁51例、≥50岁121例。根据手术病理免疫组化结果分为Ki-67高表达组(n=108)及低表达组(n=64),所有患者术前均... 详细信息

目的:基于超声声像图特征预测乳腺癌患者Ki-67表达水平。方法:回顾性分析南通大学附属肿瘤医院收治的172例乳腺癌患者资料,<50岁51例、≥50岁121例。根据手术病理免疫组化结果分为Ki-67高表达组(n=108)及低表达组(n=64),所有患者术前均进行彩色多普勒超声检查。收集患者的年龄、家族史、基础疾病等临床资料,分析肿块超声声像图特征与Ki-67表达水平的相关性,对两个组别间差异具有统计学意义的超声参数纳入多因素逐步Logistic回归,随即获取乳腺癌Ki-67高表达的独立预测因素,创建临床预测模型,并使用受试者工作特征(ROC)曲线、DeLong检验对其性能进行评价。结果:Ki-67高表达组与低表达组之间的肿瘤最大直径、内部回声及Adler血流分级这3个超声声像图特征的差异具有统计学意义(P<0.05),三者联合预测模型ROC曲线下面积达到0.825。并且联合模型AUC值与单一特征模型相比差异具有统计学意义,提示该预测模型有能力区分Ki-67表达情况。结论:基于超声的临床预测模型对乳腺癌患者Ki-67表达水平预测效能较好,临床应用价值较高。

关键词：乳腺肿瘤 Ki-67抗原超声检查

IATG:基于解释分析的自动驾驶软件测试方法

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软件学报 2024年第6期35卷 2753-2774页

作者：谢瑞麟崔展齐陈翔郑丽伟北京信息科技大学计算机学院北京100101 南通大学信息科学技术学院江苏南通226019

以深度神经网络(deep neural network,DNN)为基础构建的自动驾驶软件已成为最常见的自动驾驶软件解决方案.与传统软件一样,DNN也会产生不正确输出或意想不到的行为,基于DNN的自动驾驶软件已经导致多起严重事故,严重威胁生命和财产安全.... 详细信息

以深度神经网络(deep neural network,DNN)为基础构建的自动驾驶软件已成为最常见的自动驾驶软件解决方案.与传统软件一样,DNN也会产生不正确输出或意想不到的行为,基于DNN的自动驾驶软件已经导致多起严重事故,严重威胁生命和财产安全.如何有效测试基于DNN的自动驾驶软件已成为亟需解决的问题.由于DNN的行为难以预测和被人类理解,传统的软件测试方法难以适用.现有的自动驾驶软件测试方法通常对原始图片加入像素级的扰动或对图片整体进行修改来生成测试数据,所生成的测试数据通常与现实世界差异较大,所进行扰动的方式也难以被人类理解.为解决上述问题,提出测试数据生成方法IATG(interpretability-analysis-based test data generation),使用DNN的解释方法获取自动驾驶软件所做出决策的视觉解释,选择原始图像中对决策产生重要影响的物体,通过将其替换为语义相同的其他物体来生成测试数据,使生成的测试数据更加接近真实图像,其过程也更易于理解.转向角预测模型是自动驾驶软件决策模块重要组成部分,以此类模型为例进行实验,结果表明解释方法的引入有效增强IATG对转向角预测模型的误导能力.此外,在误导角度相同时IATG所生成测试数据比DeepTest更加接近真实图像;与semSensFuzz相比,IATG具有更高误导能力,且IATG中基于解释分析的重要物体选择技术可有效提高semSensFuzz的误导能力.

关键词：深度神经网络自动驾驶软件解释方法软件测试

考虑多类型主体的日前能量-调峰联合市场优化

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太阳能学报 2024年第3期45卷 357-366页

作者：张新松高希朱建峰陈沛郭云翔卢成南通大学电气工程学院南通226019

新型电力系统中,风电渗透率持续攀升,调峰需求随之增加,有必要通过日前能量-调峰联合出清调动市场主体调峰意愿,支撑大规模风电消纳。在对燃煤机组、风电场与储能等多类型市场主体调峰能力与报价规则进行分析的基础上,建立综合考虑燃煤... 详细信息

新型电力系统中,风电渗透率持续攀升,调峰需求随之增加,有必要通过日前能量-调峰联合出清调动市场主体调峰意愿,支撑大规模风电消纳。在对燃煤机组、风电场与储能等多类型市场主体调峰能力与报价规则进行分析的基础上,建立综合考虑燃煤机组深度调峰、启停调峰,风电场主动“弃风”调峰与储能充电调峰的日前能量-调峰联合市场优化模型。模型以能量与调峰辅助服务总采购成本最小为优化目标,同时考虑各市场主体技术约束、投标约束与电网潮流约束,是大规模混合整数规划问题,可采用CPLEX求解器求解。基于改进IEEE 14节点系统的仿真实验验证该文所提日前能量-调峰联合市场优化模型与求解方法的有效性。此外,结合仿真实验对各市场主体参与调峰辅助服务的收益进行详细分析。

关键词：储能风电电力市场调峰服务联合市场优化

下调PDCD4抑制MAP2K3和p38 MAPK的表达减轻LPS诱导的肾小管上皮细胞炎症和凋亡

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中国急救医学 2024年第4期44卷 305-313页

作者：蒋伟张益楠张健锋黄中伟南通大学附属医院急诊内科江苏南通226001 南通大学附属医院皮肤科江苏南通226001 南通大学附属医院消化内科江苏南通226001

目的研究程序性细胞死亡蛋白4(programmed cell death protein 4,PDCD4)在脓毒症诱导的急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)中的作用机制,以及调控PDCD4表达通过丝裂原活化蛋白激酶3(mitogen-activated protein kinase 3,MAP2K3)和p38蛋白激酶(p38 mitogen-activated protein kinase,p38 MAPK)对脓毒症AKI起到潜在治疗作用。方法用脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)刺激人肾小管上皮细胞(HK-2)构建脓毒症AKI细胞模型。进一步用腺病毒介导siRNA和过表达载体抑制和上调AKI细胞模型中PDCD4的表达;CCK-8法检测细胞增殖;用DCFH-DA及激光共聚焦显微镜检测细胞中ROS水平,用总SOD活性检测试剂和MDA检测试剂盒检测细胞中SOD和MDA水平;免疫共沉淀验证PDCD4和MAP2K3之间的蛋白相互作用;TUNEL染色法检测细胞凋亡;RT-qPCR和Western blot检测PDCD4及相关基因的mRNA和蛋白表达水平;ELISA法检测患者血清中炎症相关因子水平。结果LPS诱导可以促进HK-2细胞中PDCD4表达,下调PDCD4可抑制LPS诱导的HK-2细胞的炎症、氧化应激及细胞凋亡。数据库预测及免疫共沉淀证实PDCD4可以与MAP2K3相互作用,且在LPS诱导的HK-2细胞中,MAP2K3表达水平显著增强。MAP2K3过表达和p38 MAPK激动剂可以减轻PDCD4下调对LPS诱导的细胞炎症和氧化应激的影响并抑制细胞凋亡。结论下调PDCD4可以通过抑制MAP2K3和p38 MAPK从而抑制LPS诱导的肾小管上皮细胞的炎症和凋亡。

关键词：急性肾损伤脓毒症程序性细胞死亡蛋白4 丝裂原活化蛋白激酶3 p38蛋白激酶活性氧超氧化物歧化酶丙二醛

2016—2021年某妇幼保健院早产儿医院感染影响因素分析

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中国感染控制杂志 2024年第3期23卷 364-369页

作者：付路贾伯芹刘维韦南通大学附属妇幼保健院感染管理科江苏南通226000 南通大学附属妇幼保健院群体保健科江苏南通226000

目的了解早产儿医院感染现状及影响因素,为早产儿医院感染防控提供理论和实践依据。方法采用回顾性研究方法,对2016年1月—2021年12月某院新生儿病房收治的早产儿进行调查分析,查阅病历,收集早产儿基本信息及住院期间诊疗信息。结果 ... 详细信息

目的了解早产儿医院感染现状及影响因素,为早产儿医院感染防控提供理论和实践依据。方法采用回顾性研究方法,对2016年1月—2021年12月某院新生儿病房收治的早产儿进行调查分析,查阅病历,收集早产儿基本信息及住院期间诊疗信息。结果共纳入早产儿3 559例,其中男1 964例,女1 595例;平均出生体重(2 108.66±631.17)g。发生医院感染109例,发病率3.06%;主要感染类型为下呼吸道感染(44.04%)、血流感染(28.44%)、胃肠道感染(14.68%);检出医院感染相关病原菌38株,其中革兰阴性菌33株(86.84%),革兰阳性菌3株,真菌2株。主要分离病原菌为产气肠杆菌(28.95%)、肺炎克雷伯菌(28.95%)。经单因素、非条件多因素logistic回归分析,羊水污染、出生体重<2 500 g、使用呼吸机、中心静脉插管是早产儿医院感染的独立危险因素(OR值分别为2.424、3.805、3.776、5.412,均P<0.05);剖宫产是早产儿医院感染的保护因素(OR=0.362,P<0.05)。结论早产儿医院感染风险高,影响因素多,临床应引起重视,积极采取有循证依据的防控措施减少风险因素暴露,保护早产儿健康。

关键词：医院感染影响因素早产儿感染防控妇幼保健

MMCUP:融合多模态信息的代码注释自动更新方法

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计算机学报 2024年第1期47卷 172-189页

作者：刘诗凡崔展齐陈翔李莉北京信息科技大学计算机学院北京100101 南通大学信息科学技术学院江苏南通226019

良好的代码注释对于程序维护有着重要价值.但在实际开发过程中,开发人员经常会在更改代码后忽略更新相应的代码注释,导致更新后的代码和注释不一致,对软件可维护性造成影响.现有注释更新方法在进行注释更新时,通常仅将代码视为普通文本... 详细信息

良好的代码注释对于程序维护有着重要价值.但在实际开发过程中,开发人员经常会在更改代码后忽略更新相应的代码注释,导致更新后的代码和注释不一致,对软件可维护性造成影响.现有注释更新方法在进行注释更新时,通常仅将代码视为普通文本进行处理,忽视了代码结构信息.为此,本文提出了一种融合多模态信息的代码注释更新方法MMCUP(Multi-Modal Comment UPdating).MMCUP使用了旧代码注释、代码编辑序列和AST差异序列三种模态的信息来训练基于Transformer架构的模型,以对注释进行更新.实验结果表明,,MMCUP在Accuracy、Recall@5等指标上相较于CUP和HatCUP等方法至少提高了5.8%和4.4%.

关键词：代码注释更新程序理解代码-注释共同演化深度学习序列到序列模型

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基于可解释性分析的深度神经网络优化方法

计算机研究与发展 2024年第1期61卷 209-220页

作者：吴欢欢谢瑞麟乔塬心陈翔崔展齐北京信息科技大学计算机学院北京100101 南通大学信息科学技术学院江苏南通226019

近年来,深度神经网络(deep neural network,DNN)在众多领域取得了广泛应用,甚至在安全关键系统中已经可以代替人类作出决策,如自动驾驶和智慧医疗等,这对DNN的可靠性提出了更高的要求.由于DNN具有复杂的多层非线性网络结构,难以理解其... 详细信息

近年来,深度神经网络(deep neural network,DNN)在众多领域取得了广泛应用,甚至在安全关键系统中已经可以代替人类作出决策,如自动驾驶和智慧医疗等,这对DNN的可靠性提出了更高的要求.由于DNN具有复杂的多层非线性网络结构,难以理解其内部预测机制,也很难对其进行调试.现有的DNN调试工作主要通过修改DNN的参数和扩增数据集提升DNN性能,以达到优化的目的.然而直接调整参数难以控制修改的幅度,甚至使模型失去对训练数据的拟合能力;而无指导地扩增训练数据则会大幅增加训练成本.针对此问题,提出了一种基于可解释性分析的DNN优化方法(optimizing DNN based on interpretability analysis,OptDIA).对DNN的训练过程及决策行为进行解释分析,根据解释分析结果,将原始数据中对DNN决策行为产生不同程度影响的部分以不同概率进行数据变换以生成新训练数据,并重训练DNN,以提升模型性能达到优化DNN的目的.在使用3个数据集训练的9个DNN模型上的实验结果表明,OptDIA可以将DNN的准确率提升0.39~2.15个百分点,F1-score提升0.11~2.03个百分点.

关键词：深度神经网络 DNN优化 DNN缺陷 DNN性能可解释性分析