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原发性骨质疏松潜在生物标志物的生物信息学分析

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中国组织工程研究 2025年第8期29卷 1741-1750页

作者：赵嘉诚任诗齐祝秦刘佳佳朱翔杨洋南通大学附属医院创伤中心江苏省南通市226001 南通大学医学院江苏省南通市226001 南通大学附属医院手外中心江苏省南通市226001

背景:原发性骨质疏松症的发病率高,但发病机制尚不完全清楚,目前尚缺乏有效的早期筛查指标和治疗方案。目的:通过综合生物信息学分析,进一步探索原发性骨质疏松症的发生机制。方法:原发性骨质疏松症数据来自公共基因表达数据库,筛选差... 详细信息

背景:原发性骨质疏松症的发病率高,但发病机制尚不完全清楚,目前尚缺乏有效的早期筛查指标和治疗方案。目的:通过综合生物信息学分析,进一步探索原发性骨质疏松症的发生机制。方法:原发性骨质疏松症数据来自公共基因表达数据库,筛选差异基因分别进行GO功能和KEGG通路富集分析。此外,将差异基因进行蛋白质-蛋白质相互作用网络确定原发性骨质疏松症相关核心基因,并通过最小绝对收缩和选择运算算法来识别并验证原发性骨质疏松症相关的生物标志物,并分别进行免疫细胞相关分析、基因富集分析以及药物标靶网络分析。最后将生物标志物行qPCR实验验证。结果与结论:①该研究中共获得126个差异基因以及前列腺素、表皮生长因子受体、丝裂原活化蛋白激酶3、转化生长因子B1和视网膜母细胞瘤基因1等5个生物标志物。②GO分析表明差异基因主要富集在细胞对氧化应激的反应以及自噬的调节等方面;KEGG分析显示主要集中在自噬以及细胞衰老等通路当中。③生物标志物的免疫分析发现,前列腺素,视网膜母细胞瘤基因1、丝裂原活化蛋白激酶3与免疫细胞密切相关。④基因富集分析表明,生物标志物与免疫相关途径有关。⑤药物标靶网络分析显示5个生物标志物与原发性骨质疏松症药物相关。⑥qPCR结果表明,前列腺素、表皮生长因子受体、丝裂原活化蛋白激酶3和转化生长因子B1在原发性骨质疏松症样本中,与对照样本相比表达显著上升(P<0.001),而视网膜母细胞瘤基因1在原发性骨质疏松症样本中,与对照样本相比表达显著下降(P<0.001)。⑦总之,该研究筛选并验证了5个原发性骨质疏松潜在生物标志物,为进一步深入探究原发性骨质疏松症的发病机制、早期筛查诊断及靶向治疗提供了参考依据。

关键词：原发性骨质疏松生物标志物生物信息学药物标靶网络蛋白质-蛋白质相互作用网络

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胃印戒细胞癌的H3K27me3沉默子重塑特征及转录调控功能

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陆军军医大学学报 2025年

作者：杜艾贝任原锋储召乐刘碧颖李先锋向俊宇陈东风王涛王斌郭海英张璇李玉红陆军军医大学基础医学院细胞生物学教研室陆军特色医学中心(第三军医大学大坪医院)消化内科消化系统肿瘤精准防治重庆市重点实验室重庆市中医院肿瘤科

目的本研究旨在通过表观遗传组学技术，解析胃印戒细胞癌（Signet-Ring Cell Carcinoma of the stomach，SRCC）的H3K27me3沉默子的全基因组特征及其对基因转录的调控作用，以阐明SRCC恶性进展的表观调控机制。方法本研究收集2021年1... 详细信息

目的本研究旨在通过表观遗传组学技术，解析胃印戒细胞癌（Signet-Ring Cell Carcinoma of the stomach，SRCC）的H3K27me3沉默子的全基因组特征及其对基因转录的调控作用，以阐明SRCC恶性进展的表观调控机制。方法本研究收集2021年1月至2023年12月期间就诊于陆军特色医学中心消化内科患者内镜下获得的15例正常胃窦/胃体样本和20例SRCC样本，进行染色质可及性测序（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high-throughput Sequencing，ATAC-seq），H3K27me3沉默子的染色质靶向捕获测序（Cleavage Under Targets and Tagmentation，CUT&Tag）以及RNA测序，并联合分析。筛选受沉默子调控的候选差异表达基因，利用GO和KEGG分析其潜在肿瘤生物学功能。富集SRCC特征性沉默子的关键转录因子调控基序，构建转录因子调控网络，探讨其调控机制。结果 SRCC沉默子主要分布于基因组远端基因间区（占37.06%）。与正常组织相比，SRCC中H3K27me3沉默子信号显著降低（P＜0.01），共鉴定出6 257个丢失位点。CUT&Tag和RNA-seq整合分析显示，380个因沉默子丢失而上调的基因显著富集于免疫相关通路，如T细胞受体信号通路（P＜0.01）。免疫组化验证表明转录因子EHF表达显著升高（P＜0.05）。结论本研究揭示SRCC中H3K27me3沉默子的重塑现象及其转录调控关键作用，为SRCC的防治提供了干预新思路。

关键词：胃印戒细胞癌表观遗传组蛋白修饰沉默子

竹节参总皂苷通过调节FGF21抵抗改善高脂饮食诱导的焦虑症

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中国中药杂志 2025年第1期 29-41页

作者：黄艳岳博文胡月琴李维丽余典梅许杰王金娥周志勇三峡大学健康医学院国家中医药管理局中药药理三级实验室三峡大学第一临床医学院湖北省功能性消化系统疾病中医临床医学研究中心三峡大学基础医学院

焦虑症是高发的心理疾病，研究表明肥胖是导致焦虑症的重要危险因素。该研究探讨竹节参总皂苷(saponins from Panax japonicus,SPJ)对高脂饮食小鼠焦虑症的改善作用及机制。将50只C57BL/6J小鼠随机分为正常组、高脂饮食组、SPJ低剂量组... 详细信息

焦虑症是高发的心理疾病，研究表明肥胖是导致焦虑症的重要危险因素。该研究探讨竹节参总皂苷(saponins from Panax japonicus,SPJ)对高脂饮食小鼠焦虑症的改善作用及机制。将50只C57BL/6J小鼠随机分为正常组、高脂饮食组、SPJ低剂量组、SPJ高剂量组。第12周从高脂饮食组取6只小鼠，分为对照组、外源性给予成纤维细胞生长因子21(FGF21)组。旷场和高架十字迷宫实验评价小鼠焦虑样行为；苏木素-伊红(HE)染色和油红O染色观察肝脏、脂肪的病理变化；葡萄糖耐量实验和胰岛素耐量实验评估小鼠糖代谢水平；蛋白免疫印迹法检测肝脏和皮层中FGF21及下游相关蛋白和大脑皮层中脑源性神经营养因子(BDNF)、突触后膜蛋白4(DLG4)和突触素(SYP)表达；实时荧光定量PCR(qPCR)检测肝脏和皮层中FGF21及相关受体基因表达；免疫荧光检测大脑皮层神经元激活物(c-Fos)、FGF21、FGF21辅助受体β-klotho的表达。结果显示，SPJ可显著改善高脂饮食小鼠在高架十字迷宫的开臂区及旷场中心区的活动频率，并上调BDNF、DLG4和SYP表达，有效改善高脂饮食小鼠的焦虑样行为。与正常组相比，高脂饮食组小鼠的肝脏及大脑皮层中FGF21的表达上调，成纤维细胞生长因子受体1(FGFR1)与β-klotho的表达显著下降，提示高脂饮食小鼠呈FGF21抵抗状态；SPJ可显著上调高脂饮食小鼠β-klotho水平，逆转FGF21抵抗。进一步与外源性给予FGF21进行对比，显示SPJ激活大脑皮层区域与其一致，同时SPJ能促进大脑皮层中c-Fos与β-klotho阳性细胞数量及共定位。综上所述，SPJ可有效改善高脂饮食小鼠的焦虑样行为，其机制与上调大脑β-klotho表达，逆转FGF21抵抗，进而激活大脑皮层、杏仁核神经元有关。

关键词：竹节参总皂苷焦虑症高脂饮食 FGF21抵抗 FGF21-FGFR1/β-klotho信号通路

肠道微生物群对代谢综合征的遗传预测因果效应研究论著

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中国全科医学 2025年

作者：罗秀麻钊丽黄梦宇任茜兰州大学第一临床医学院兰州大学第一医院消化科

背景许多观察性研究发现肠道微生物群与代谢综合征（MetS）及组成部分存在相关关系。但两者之间的因果关系尚不明确。目的本研究旨在推测肠道微生物群与MetS及组成部分之间的双向因果关系。方法从MiBioGen获得肠道微生物群相关的单核... 详细信息

背景许多观察性研究发现肠道微生物群与代谢综合征（MetS）及组成部分存在相关关系。但两者之间的因果关系尚不明确。目的本研究旨在推测肠道微生物群与MetS及组成部分之间的双向因果关系。方法从MiBioGen获得肠道微生物群相关的单核苷酸多态性，在英国生物样本库、Complex Trait Genetics(CTG)和其他联盟研究中获得了MetS及其组成部分的汇总统计数据，进行了双向两样本孟德尔随机化分析，以评估之间的因果关系。除此之外，也进行了一系列敏感性分析验证孟德尔随机化分析结果的稳健性。为了获得更严格的因果关系解释，还使用了Bonferroni校正检验肠道菌群和MetS之间因果关系的强度。结果逆方差加权估计结果表明，双歧杆菌（Bifidobacteriaceae）(OR=0.96,95%CI=0.93-0.98,P=1.49E-03)与MetS有明显的负向因果关系。部分肠道菌群与腰围之间存在明显的正向因果关系，如疟原菌纲（***）(OR=1.02,95%CI=1.01-1.03,P=1.90E-03)、胃气单胞菌目（***）(OR=1.02,95%CI=1.01-1.03,P=1.61E-03)、NB1n目（***1n）(OR=1.02,95%CI=1.01-1.03,P=2.00E-03)和哈利优杆菌属（***）(OR=1.03,95%CI=1.01-1.04,P=6.97E-04)等。但是反向孟德尔随机化分析不支持两者之间的因果关系。敏感性分析表明不存在异质性或水平多效性。结论这项双向孟德尔随机化研究提供了肠道微生物群对MetS及组成部分有明显的因果关系证据，但是不支持反向因果关系。这个发现为MetS的防治提供了新的思路。未来仍需要进一步的随机对照实验来阐明益生菌等微生物制剂对MetS的作用关系。

关键词：肠道微生物群代谢综合征孟德尔随机化因果关系

聚己内酯-透明质酸静电纺丝膜联合间充质干细胞修复子宫内膜损伤

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中国组织工程研究 2025年第16期29卷 3369-3379页

作者：安江茹张锦艺王秋花杨杨杨王文双张晓晴滨州医学院基础医学院人体解剖与组织胚胎学教研室生物材料与组织再生国际合作联合实验室山东省烟台市264003 烟台毓璜顶医院妇科山东省烟台市264000

背景:人子宫内膜间充质干细胞能够直接修复受损的子宫内膜,促进血管生成、恢复子宫形态结构,然而将干细胞直接注入受损子宫内膜后的细胞存活率低、滞留时间短,修复效果有限。目的:观察聚己内酯-透明质酸静电纺丝膜复合人子宫内膜间充质... 详细信息

背景:人子宫内膜间充质干细胞能够直接修复受损的子宫内膜,促进血管生成、恢复子宫形态结构,然而将干细胞直接注入受损子宫内膜后的细胞存活率低、滞留时间短,修复效果有限。目的:观察聚己内酯-透明质酸静电纺丝膜复合人子宫内膜间充质干细胞修复大鼠子宫内膜损伤的效果。方法:①细胞实验:采用胶原酶消化法提取人子宫内膜间充质干细胞,静电纺丝技术制备聚己内酯-透明质酸静电纺丝膜。将人子宫内膜间充质干细胞分别接种于聚苯乙烯培养板与聚己内酯-透明质酸静电纺丝膜上,通过DNA定量分析、WST-1细胞活性实验、鬼笔环肽染色、扫描电镜观察细胞的增殖与黏附能力,qRT-PCR检测静电纺丝膜上细胞CD90、Meflin的mRNA表达。②动物实验:取27只处于动情期的雌性SD大鼠,通过机械搔刮法建立宫腔粘连模型后随机分为3组,每组9只:空白对照组不进行任何治疗,对照组将聚己内酯-透明质酸静电纺丝膜植入宫腔损伤部位,实验组将聚己内酯-透明质酸静电纺丝膜/人子宫内膜间充质干细胞补片植入宫腔损伤部位。术后第3,7,14天取材,采用苏木精-伊红染色观察子宫形态结构及腺体数量,qRT-PCR和免疫荧光染色观察子宫组织CD31、血管内皮生长因子的表达。结果与结论:①细胞实验:与聚苯乙烯培养板相比,聚己内酯-透明质酸静电纺丝膜可促进人子宫内膜间充质干细胞的增殖与黏附,并且聚己内酯-透明质酸静电纺丝膜支持人子宫内膜间充质干细胞基因CD90和Meflin的表达;②动物实验:苏木精-伊红染色显示,聚己内酯-透明质酸静电纺丝膜/人子宫内膜间充质干细胞补片可促进子宫内膜损伤后形态结构的恢复,术后第14天的内膜厚度与腺体数量均多于空白对照组、对照组(P实验组术后第7,14天的CD31、血管内皮生长因子mRNA与蛋白表达均高于空白对照组、对照组(P<0.05);③结果表明:聚己内酯-透明质酸静电纺丝膜可以提高干细胞的存活率、延长干细胞与受损组织的接触时间,二者复合移植可更好地修复受损子宫内膜组织。

关键词：子宫内膜宫腔粘连人子宫内膜间充质干细胞静电纺丝膜聚己内酯透明质酸

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基于YOLO神经网络构建耳穴特征点辅助检测的人工智能辅助系统

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中国针灸 2025年

作者：王甘红张子豪夏开建周燕婷奚美娟陈健常熟市中医院消化内科上海豪兄教育科技有限公司常熟市医学人工智能与大数据重点实验室常熟市第一人民医院消化内科

目的:基于YOLOv8神经网络开发用于21个常用耳穴特征点自动检测的人工智能辅助系统。方法:收集2018年6月至2024年2月来自3个中心的人体耳部图像数据，共计660张。使用LabelMe5.3.1图形标注工具进行了图像的矩形框和特征点标注，并转换为Y... 详细信息

目的:基于YOLOv8神经网络开发用于21个常用耳穴特征点自动检测的人工智能辅助系统。方法:收集2018年6月至2024年2月来自3个中心的人体耳部图像数据，共计660张。使用LabelMe5.3.1图形标注工具进行了图像的矩形框和特征点标注，并转换为YOLO模型兼容的格式。利用这些数据，进行不同规模YOLO神经网络预训练模型的迁移学习和微调训练。模型的性能在验证集和测试集上进行评估，包括不同阈值下的平均精度（mAP）、召回率（Recall）、推理速度（FPS）、精确率-召回率曲线（PR曲线）、混淆矩阵等。最后，将模型部署于本地计算机，并通过摄像头对人体耳部图像进行实时检测。结果:本研究开发了5种不同版本的YOLOv8关键点检测模型，包括YOLOv8n、YOLOv8s、YOLOv8m、YOLOv8l、YOLOv8x。在验证集上，YOLOv8n在速度（225.736帧/s）和精确率（0.998）上均表现最佳。在外部测试集，YOLOv8n识别耳部的准确率为0.991、敏感性为1.0、F1分数为0.995。耳穴特征点定位性能结果显示，50%交并比阈值下的平均精度(mAP50)为0.990，精确率为0.995，召回率为0.997。结论:基于YOLOv8n构建的21个常用耳穴关键点检测模型具有良好的预测性能，能够自动快速地对耳穴进行定位和分类。

关键词：耳穴深度学习关键点检测 YOLO 人工智能

柴胡桂枝干姜汤现代临床应用及作用机制研究进展

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中国实验方剂学杂志 2025年

作者：孟苗苗袁子博陈凯丽张钧于子轩邓伟河南中医药大学第一临床医学院河南中医药大学第一附属医院老年病科河南中医药大学第一附属医院血液肿瘤科郑州大学第一附属医院

柴胡桂枝干姜汤为《伤寒论》经典名方，具有清解少阳郁热、温化水饮、和解枢机等功效，是治疗脾虚肝郁，水饮内停证的经典方剂，该方组方精巧、配伍得当，常被古今医家加减化裁应用于各类内外科杂病的治疗中，疗效显著。近些年来，随着... 详细信息

柴胡桂枝干姜汤为《伤寒论》经典名方，具有清解少阳郁热、温化水饮、和解枢机等功效，是治疗脾虚肝郁，水饮内停证的经典方剂，该方组方精巧、配伍得当，常被古今医家加减化裁应用于各类内外科杂病的治疗中，疗效显著。近些年来，随着现代药理学的快速发展，关于柴胡桂枝干姜汤微观作用机制的研究不断发展与深化，这为柴胡桂枝干姜汤治疗疾病提供了新的思路。因此，笔者系统检索中国知网、万方、维普、PubMed等数据库国内外学者近年来公开发表的关于柴胡桂枝干姜汤的临床应用及药理机制研究文献，本文通过总结，从柴胡桂枝干姜汤的现代临床应用和作用机制两个方面对文献进行梳理，阐述了现代文献记载柴胡桂枝干姜汤治疗的疾病涉及消化系统、呼吸系统、神经系统、内分泌系统、循环系统、泌尿系统，及其在减轻放化疗毒副作用、妇科、皮肤科、五官科、骨伤科等学科中的应用。同时从作用机制方面阐明了柴胡桂枝干姜汤治疗疾病的机制可能与抗炎、抗氧化应激及调节免疫、抗纤维化、抗肿瘤、改善胃肠道菌群及动力作用、保护肝脏组织、降低血脂、血糖、调节激素水平等有关。

关键词：柴胡桂枝干姜汤经方临床应用作用机制

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国际多中心COLOR Ⅳ研究的质量控制

中华外科杂志 2025年第1期63卷 68-71页

作者：姚宏伟魏鹏宇高加勒吴偲舒文龙孟聪赵翰铮宋建宁吴国聪张忠涛首都医科大学附属北京友谊医院普通外科国家消化系统疾病临床医学研究中心消化健康全国重点实验室首都医科大学结直肠肿瘤临床诊疗与研究中心北京

结直肠癌是常见的恶性肿瘤之一。2022年我国结直肠癌新发病例和死亡病例分别约为59.2万例、30.9万例, 其发病率和病死率分别居癌症谱的第2位、第5位[1, 2]。目前, 外科手术仍是治疗结直肠癌的主要手段。基于循证医学证据与临床实践经验,...

结直肠癌是常见的恶性肿瘤之一。2022年我国结直肠癌新发病例和死亡病例分别约为59.2万例、30.9万例, 其发病率和病死率分别居癌症谱的第2位、第5位[1, 2]。目前, 外科手术仍是治疗结直肠癌的主要手段。基于循证医学证据与临床实践经验, 结直肠癌手术仍在持续改进。在广大结直肠外科医师不断探索的道路上, 高质量的临床研究起到了关键的推动作用。

关键词：

lncRNA-BBOX1-2通过调控成纤维细胞生长因子受体1促进胃癌的发生和发展

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安徽医药 2025年第1期29卷 57-62,I0002页

作者：孙颖顾玮王吉郑雄上海交通大学医学院附属瑞金医院卢湾分院消化内科上海200020

目的探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)BBOX1-2通过调控成纤维细胞生长因子受体1(fibroblast growth factor receptor 1,FGFR1)对胃癌的发生发展机制的影响。方法回顾性选取2017年4月至2019年1月于上海交通大学医学院附属... 详细信息

目的探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)BBOX1-2通过调控成纤维细胞生长因子受体1(fibroblast growth factor receptor 1,FGFR1)对胃癌的发生发展机制的影响。方法回顾性选取2017年4月至2019年1月于上海交通大学医学院附属瑞金医院卢湾分院接受胃癌根治术30例病人肿瘤组织及癌旁相应正常组织作为研究对象,采用实时定量PCT(real-time PCR,RT-PCR)检测lncRNA-BBOX1-2和FGFR1表达;si-linc-BBOX1-2转染SGC-7901细胞后,通过蛋白质印迹法/细胞存活率分析(MTT)、细胞迁移和侵袭(Transwell)实验、细胞划痕、平板克隆一系列生物学功能实验,检测肿瘤细胞生物学功能及FGFR1表达的变化。结果胃癌组织中的lncRNA-BBOX1-2(3.68±0.58比1.15±0.11)和FGFR1(4.26±0.71比1.19±0.18)表达显著高于癌旁正常组织(P<0.05);si-linc-BBOX1-2转染SGC-7901细胞后,FGFR1表达下调,细胞活力、迁移、侵袭和生存能力明显下降。结论LincRNA-BBOX1-2可通过调控FGFR1的表达介导胃癌细胞的增殖、凋亡、迁移和侵袭,可能为胃癌的治疗提供了新的靶点和潜在的生物学标志物。

关键词：胃肿瘤长链非编码RNA BBOX1-2 成纤维细胞生长因子受体1 调控增殖凋亡

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