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基于传播动力学模型的超大型城市新发突发高致病性呼吸道传染病应对策略研究

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中国感染控制杂志 2024年第10期23卷 1264-1270页

作者：罗佳瑶雷志群闫小龙王秋月王睿蒋红卫魏晟华中科技大学同济医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学系湖北武汉430030 南方科技大学公共卫生与应急管理学院广东深圳518055

目的探索中国超大型城市应对新发突发高致病性呼吸道传染病暴发时不同干预策略的效果,为有效应对新发突发呼吸道传染病提供决策依据。方法构建易感-潜伏-感染-移出(SEIR)传播动力学模型,参考既往多种新发呼吸道传染病的致病性和传染性参... 详细信息

目的探索中国超大型城市应对新发突发高致病性呼吸道传染病暴发时不同干预策略的效果,为有效应对新发突发呼吸道传染病提供决策依据。方法构建易感-潜伏-感染-移出(SEIR)传播动力学模型,参考既往多种新发呼吸道传染病的致病性和传染性参数,并将其进行组合。模拟低、中、高传染性的新发突发高致病性呼吸道传染病在中国1000万人口超大型城市暴发的场景下,比较实施不同非药物干预措施(NPIs)组合应对暴发后100 d内疫情的发展情况。结果高致病性新发呼吸道传染病暴发时,如果其传染性较低(R 0约为1.5),无需采取严格的NPIs就可以控制疫情。若其传染性为中等(R 0约为6),则需要根据其已有的感染规模采取不同强度的NPIs:在初始感染人数为50例时,采取中等强度的NPIs,100 d内可将感染及死亡比例控制在较低水平,病例所需住院床位控制在全国平均储备水平以下;但在已有感染规模超过100例时,则需要采取高强度的NPIs才能控制疫情发展。在其传染性极强(R 0约为10)的情况下,无论感染规模如何,应立即采取高强度NPIs才能有效控制疫情发展及感染、死亡规模。结论在面对新发高致病性呼吸道传染病暴发时,尽早根据其流行病学特征及感染规模采取合适的NPIs,才能最大限度降低其对人群健康的危害。

关键词：呼吸道传染病传播动力学非药物干预措施超大型城市新发传染病

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南方科技大学冷冻电镜中心建设与管理

实验室研究与探索 2024年第9期43卷 213-218,240页

作者：马晓旻和思淼吴静高远瞩许淑嫚王培毅南方科技大学冷冻电镜中心广东深圳518055 南方科技大学生命科学学院广东深圳518055

近十年来,300 kV冷冻电镜已成为生物大分子结构解析、材料形貌及成分分析的有力工具。南方科技大学冷冻电镜中心是国内拥有该类设备最多的科研实验室,而且是国内首家集中化、自动化、可视化管理的冷冻电镜中心。它的建成填补了中国南方... 详细信息

近十年来,300 kV冷冻电镜已成为生物大分子结构解析、材料形貌及成分分析的有力工具。南方科技大学冷冻电镜中心是国内拥有该类设备最多的科研实验室,而且是国内首家集中化、自动化、可视化管理的冷冻电镜中心。它的建成填补了中国南方地区无高端冷冻电镜的历史空白。结合学校冷冻电镜中心大型仪器设备的状况、开放共享管理系统及运行模式,从管理框架和开放共享等方面探讨了该中心的管理及运行机制,为粤港澳大湾区结构生物学领域发展提供了重要支撑。

关键词：大型仪器设备平台开放共享冷冻电镜分级管理

LncRNA MAGI2-AS3通过靶向调控miR-1269a/PTEN/AKT通路增强非小细胞肺癌对顺铂化疗的敏感性

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南方医科大学学报 2024年

作者：范喜瑞戚之琳邓园洁杨子晗孙丽李国豪梁娟娟吴菲袁力文皖南医学院基础医学院生物化学与分子生物学教研室皖南医学院药学院皖南医学院临床医学院皖南医学院基础医学院生理学教研室皖南医学院检验学院皖南医学院麻醉学院

目的研究lncRNA MAGI2-AS3对非小细胞肺癌顺铂耐药的影响及其分子机制。方法采用qRT-PCR检测MAGI2-AS3和miR-1269a在顺铂敏感细胞（A549,H1299）和顺铂耐药细胞（A549/DDP,H1299/DDP）中的表达差异。采用慢病毒敲低A549和H1299中的MAG... 详细信息

目的研究lncRNA MAGI2-AS3对非小细胞肺癌顺铂耐药的影响及其分子机制。方法采用qRT-PCR检测MAGI2-AS3和miR-1269a在顺铂敏感细胞（A549,H1299）和顺铂耐药细胞（A549/DDP,H1299/DDP）中的表达差异。采用慢病毒敲低A549和H1299中的MAGI2-AS3的表达，过表达A549/DDP和H1299/DDP中的MAGI2-AS3并加入20μmol/L顺铂（DDP）处理。A549/DDP和H1299/DDP细胞实验分组为：OE-NC组，OE-MAGI2-AS3组，OE-NC+DDP组，OE-MAGI2-AS3+DDP组，A549和H1299细胞实验分组为：sh-NC组，sh-MAGI2-AS3组，sh-NC+DDP组，sh-MAGI2-AS3+DDP组。CCK-8和细胞克隆形成实验检测细胞存活率，流式细胞术和Western blotting分别检测细胞凋亡率和蛋白表达量，划痕实验和Transwell检测细胞EMT变化。通过网站GEPIA、StarBase和miRDB预测MAGI2-AS3、miR-1269a和PTEN之间的靶向关系，并采用荧光素酶报告基因实验和RIP实验验证。采用miR-1269a mimic和pcDNA3.1-PTEN进行Rescue实验。结果 MAGI2-AS3在肺癌组织中的表达显著低于正常癌旁组织（P<0.05）且与患者不良预后相关（P<0.05）。A549/DDP和H1299/DDP中的MAGI2-AS3表达量显著低于A549和H1299(P<0.01)。干扰MAGI2-AS3可以显著促进顺铂处理前、后A549和H1299细胞的存活及EMT进程（P<0.01），同时降低顺铂诱导的细胞凋亡（P<0.005）。过表达MAGI2-AS3可以显著抑制顺铂处理前、后A549/DDP和H1299/DDP细胞存活与EMT进程（P<0.01），同时提升顺铂诱导的细胞凋亡（P<0.005）。MAGI2-AS3与miR-1269a结合在一起，miR-1269a与PTEN 3'UTR结合。在A549/DDP细胞内MAGI2-AS3通过靶向吸附miR-1269a促进PTEN的表达并下调AKT磷酸化从而抑制顺铂刺激下细胞的EMT进程（P<0.01）、促进顺铂诱导的A549/DDP细胞凋亡（P<0.01）。结论 LncRNA MAGI2-AS3通过靶向调控miR-1269a/PTEN/AKT信号轴增强非小细胞肺癌对顺铂化疗的敏感性。

关键词： LncRNA MAGI2-AS3 miR-1269a 非小细胞肺癌顺铂耐药

Esco2上调CDK1、c-myc及下调p53促进肺癌细胞的增殖和迁移

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解剖科学进展 2024年第4期 360-363页

作者：刘铭王亮李庆昌邱雪杉王恩华中国医科大学基础医学院病理学教研室

目的探讨黏附素乙酰转移酶Esco2对肺癌细胞增殖和迁移的影响及可能机制。方法通过查找TCGA数据库中Esco2基因在肺癌中的差异表达与临床分期、生存率的关系。应用Esco2特异性siRNA干扰肺癌细胞系A549和H460,应用Transwell、MTX和集落... 详细信息

目的探讨黏附素乙酰转移酶Esco2对肺癌细胞增殖和迁移的影响及可能机制。方法通过查找TCGA数据库中Esco2基因在肺癌中的差异表达与临床分期、生存率的关系。应用Esco2特异性siRNA干扰肺癌细胞系A549和H460,应用Transwell、MTX和集落形成实验检测Esco2对细胞增殖和侵袭能力的影响，应用蛋白印迹检测干扰Esco2后对CDK1、CDK4、c-myc及p53蛋白表达水平变化。结果 Esco2基因在肺癌组织的表达水平明显高于癌旁组织，其表达与临床分期和生存率呈负相关(P<0.05),与P53呈负相关。特异性干扰Esco2后，细胞的增殖能力、集落形成能力和迁移能力均明显下调。蛋白印迹显示特异性干扰Esco2后，CDK1及c-myc蛋白水平明显下调，而p53蛋白水平上调(P<0.05)。结论 Esco2促进肺癌细胞的增殖和迁移能力，与上调CDK1、c-myc及下调p53蛋白水平相关。

关键词： Esco2 增殖迁移肺癌

进气道防冰引气对压气机性能影响的快速评估方法研究

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推进技术 2024年

作者：杨宇飞魏佐君任光明李成南方科技大学深圳市宽速域变密度连续式风洞重点实验室中国航发湖南动力机械研究所南方科技大学工学院

为在不增加整机性能计算复杂度和数据信息要求的前提下，考虑进气道防冰热空气排入所造成的流动掺混和畸变的影响，本文提供了一种快速评估进气道防冰引气对压气机性能影响的计算方法。该方法采用多维度耦合计算方法，对于具有防冰引气... 详细信息

为在不增加整机性能计算复杂度和数据信息要求的前提下，考虑进气道防冰热空气排入所造成的流动掺混和畸变的影响，本文提供了一种快速评估进气道防冰引气对压气机性能影响的计算方法。该方法采用多维度耦合计算方法，对于具有防冰引气排入的进气道采用全三维CFD计算，同时引入平行压气机模型的思想评估畸变进气下的压气机特性，从而实现进气道与压气机的不同维度数据在AIP界面的动态交互，进而通过迭代求得进气道流量与防冰引气流量的匹配。通过该评估方法分析了进气道出口不同周向和径向分区数对压气机性能评估的影响，从而说明了耦合计算的重要性。采用本方法计及防冰引气引起的畸变影响后，防冰引气比为1.6%时压气机失速边界流量增加约2%，失速边界变窄，堵塞流量减小约2%。防冰引气排入流量越大，压气机性能下降越大。

关键词：防冰引气进气道压气机性能多维度耦合快速评估方法

基于过程的发动机进气道防冰引气模型及其多维度耦合分析

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推进技术 2024年

作者：魏佐君任光明李成杨宇飞南方科技大学工学院中国航发湖南动力机械研究所南方科技大学深圳市宽速域变密度连续式风洞重点实验室

进气道防冰引气及其影响的评估对于发动机的研制具有重要意义，但定引气比的经典引气模型对于非设计点的性能评估存在不合理。本文建立了基于过程的进气道防冰引气模型，通过防冰阀模型、引气函数、换热模型，实现了对防冰引气系统的低... 详细信息

进气道防冰引气及其影响的评估对于发动机的研制具有重要意义，但定引气比的经典引气模型对于非设计点的性能评估存在不合理。本文建立了基于过程的进气道防冰引气模型，通过防冰阀模型、引气函数、换热模型，实现了对防冰引气系统的低维度建模；提出了进气道、压气机、引气系统的多维度耦合分析方法。结果表明，该引气模型的引气比和排气温度将随工作点调整而动态改变，压气机等转速线与表示定引气比的多条线相交，增压比越高引气比越大。

关键词：进气道防冰防冰引气模型多维度耦合降维度模型基于过程

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虚拟标准化病人在机能实验教学中的应用

基础医学教育 2024年第4期26卷 335-339页

作者：赵玉郭忠西北民族大学医学部病理学与病理生理学教研室兰州730000 西北民族大学医学部药理学教研室

机能实验学是医学院校基础教育阶段的重要组成部分,侧重于学生的实践技能、科研思维和创新能力的培养。随着科技技术的发展和创新,虚拟实验逐步兴起,为教学改革提供新思路、新途径。虚拟实验活动,可激发学生参与热情,规避真实实验的软... 详细信息

机能实验学是医学院校基础教育阶段的重要组成部分,侧重于学生的实践技能、科研思维和创新能力的培养。随着科技技术的发展和创新,虚拟实验逐步兴起,为教学改革提供新思路、新途径。虚拟实验活动,可激发学生参与热情,规避真实实验的软硬件限制,减少设备更新和维护成本,丰富实验教学内容,优化教学资源。文章以急性左心衰竭为例,介绍虚拟标准化病人(virtual standardized patient,VSP)的整合实验,详细阐述了VSP技术平台在机能实验学中的应用及考核要求,验证动物实验与人体实验相结合、基础理论与临床实践技能相结合、虚拟仿真实验与实体实验相结合的“三位一体”的机能实验教学新体系,为机能实验学教学改革奠定了基石。

关键词：机能实验学实验教学虚拟实验标准化虚拟仿真病人教学改革

基于剪接因子SRSF9在头颈部鳞状细胞癌中的表达及临床意义的生物信息学分析

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吉林大学学报（医学版） 2024年第2期50卷 379-391页

作者：刘玉婷喻莹黎桂珍史沁雪李彬彬广东医科大学基础医学院病理生理学教研室广东东莞523808 广东医科大学第二临床医学院广东东莞523808

目的:基于生物信息学方法分析富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子9(SRSF9)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达情况、临床意义以及与肿瘤免疫浸润的关系,并探讨其作用机制。方法:利用癌症基因图谱(TCGA)数据库、基因表达综合(GEO)数据库中GSE30... 详细信息

目的:基于生物信息学方法分析富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子9(SRSF9)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达情况、临床意义以及与肿瘤免疫浸润的关系,并探讨其作用机制。方法:利用癌症基因图谱(TCGA)数据库、基因表达综合(GEO)数据库中GSE30784和GSE13601数据集、临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)数据库、基因表达交互分析(GEPIA)数据库和Kaplan-Meier plotter数据库分析SRSF9在HNSCC中的表达及与患者临床病理特征和预后的关系;利用cBioPortal数据库分析SRSF9基因变异情况;应用ESTIMATE算法和肿瘤免疫估计资源(TIMER)数据库评估SRSF9表达与肿瘤微环境和肿瘤免疫细胞浸润的关系;利用LinkedOmics数据库分析SRSF9在HNSCC中的共表达基因及其调控通路;基于TCGA SpliceSeq数据库分析HNSCC中SRSF9调控的可变剪接事件,并对靶基因进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果:TCGA数据库、GEO数据库中GSE30784和GSE13601数据集分析,HNSCC组织中SRSF9 mRNA表达水平较癌旁正常组织明显升高(P病理分级(P=0.004)和HPV感染(P=0.031)有关联。GEPIA和Kaplan-Meier plotter数据库分析,HNSCC组织中SRSF9 mRNA高表达均与患者总生存期(OS)较差相关[风险比(HR)=1.40,P=0.019;HR=1.55,P=0.003]。cBioPortal数据库分析,HNSCC中SRSF9基因拷贝数变异(CNV)占26.85%,其CNV与SRSF9 mRNA表达水平呈正相关关系(r=0.44,P<0.001)。ESTIMATE算法分析,SRSF9 mRNA高表达组基质评分和免疫评分均较SRSF9 mRNA低表达组低(P<0.001),肿瘤纯度则高于SRSF9 mRNA低表达组(P<0.001)。TIMER数据库分析,SRSF9 mRNA表达水平与CD4+T淋巴细胞浸润呈正相关关系(r=0.186,P<0.001),而与B淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞和树突状细胞浸润呈负相关关系(r=-0.269,P<0.001;r=-0.353,P<0.001;r=-0.304,P<0.001)。SRSF9共表达基因富集分析,核糖体、剪接体和代谢通路等相关基因上调,而黏着斑、细胞因子和细胞黏附分子等相关基因下调。SRSF9相关可变剪接靶基因主要涉及脂类代谢、胰高血糖素和紧密连接等通路。结论:SRSF9在HNSCC中呈高表达,且与患者预后不良和肿瘤微环境免疫细胞浸润相关,可成为HNSCC诊断、预后评估和治疗的潜在分子靶标。

关键词：头颈部鳞状细胞癌富含丝氨酸/精氨酸剪接因子9 可变剪接肿瘤免疫生物信息学

瘢痕疙瘩发病机制中的脂代谢相关基因:基于生物信息学分析和验证

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皮肤性病诊疗学杂志 2024年第5期31卷 313-318页

作者：钟依秀王琦张江林南方科技大学第一附属医院南方科技大学医学院广东深圳518055 南方医科大学南方医院广东广州510515

目的基于生物信息学方法探讨瘢痕疙瘩发生发展的脂代谢相关基因。方法从GEO数据库获取瘢痕疙瘩相关数据集,从Genecards数据库下载脂代谢相关基因,进行交集分析筛选出共同基因;对差异基因进行GO、KEGG富集分析;使用实时荧光定量PCR(qRT-P... 详细信息

目的基于生物信息学方法探讨瘢痕疙瘩发生发展的脂代谢相关基因。方法从GEO数据库获取瘢痕疙瘩相关数据集,从Genecards数据库下载脂代谢相关基因,进行交集分析筛选出共同基因;对差异基因进行GO、KEGG富集分析;使用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和免疫组化验证显著差异基因。结果瘢痕疙瘩中脂代谢相关差异基因共有2个共同基因ACSS3和PRKD1,其中ACSS3差异最显著。差异基因的生物过程主要富集在甘油酯生物合成过程和脂肪酸衍生物代谢过程等。KEGG主要富集在甘油酯代谢过程和花生四烯酸代谢过程等。qRT-PCR和免疫组化显示ACSS3在瘢痕疙瘩组织中高表达。结论ACSS3可能通过影响脂代谢在瘢痕疙瘩发生发展中发挥重要作用。

关键词：瘢痕疙瘩脂代谢 ACSS3 生物信息学