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基于GEO数据库筛选胃癌差异表达基因及其功能和通路富集分析

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南方医科大学学报 2024年第3期44卷 605-616页

作者：梁一豪赖颖君袁燕文袁炜张锡波张拔山卢志锋南方医科大学第十附属医院(东莞市人民医院)检验科广东东莞523059 南方医科大学第十附属医院(东莞市人民医院)消化内科广东东莞523059 南方医科大学第十附属医院(东莞市人民医院)病理科广东东莞523059

目的基于基因表达数据库(GEO)运用生物信息学方法挖掘胃癌诊断和预后相关的核心基因,筛选参与胃癌发生发展的分子靶标。方法从GEO数据库中下载胃癌基因芯片数据GSE118916、GSE54129和GSE79973,筛选差异表达基因(DEGs)并进行分子功能和... 详细信息

目的基于基因表达数据库(GEO)运用生物信息学方法挖掘胃癌诊断和预后相关的核心基因,筛选参与胃癌发生发展的分子靶标。方法从GEO数据库中下载胃癌基因芯片数据GSE118916、GSE54129和GSE79973,筛选差异表达基因(DEGs)并进行分子功能和信号通路的富集分析,构建蛋白质互作网络(PPI),根据网络节点和位置筛选出核心基因,利用癌症基因图谱(TCGA)中胃腺癌(STAD)的全基因组测序数据对核心基因进行表达水平和诊断预后的验证分析,最后通过qRT-PCR检测核心基因在不同胃癌细胞株中的表达水平。结果共筛选出77个DEGs,主要位于细胞外基质(ECM)与基底膜,具有氧化还原酶和ECM受体配体活性,参与机体消化和激素代谢等生物学过程,与胃酸分泌、视黄醇和激素代谢等信号通路相关。共获得9个核心基因,其中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3和THY1在胃癌中表达上调(P<0.05);而TFF1、GKN1、TFF2、PGC在胃癌中下调(P<0.05)。生存预后分析显示,SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3、TFF2、THY1的异常表达与胃癌患者的生存时间显著相关;ROC曲线显示,TIMP1、SPARC、THY1、THBS2对胃癌有较高的诊断价值;在胃癌患者的病理组织中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3的高表达得到验证;qRT-PCR检测发现,核心基因在不同的胃癌细胞株中不尽相同,但表达趋势基本符合。结论SPARC、TIMP1、THBS2等DEGs可能与胃癌的发生发展有关,可能作为潜在的候选分子标志物,用于胃癌的早期诊断和预后判断。

关键词：胃癌基因芯片生物信息学分析差异表达基因分子标志物

氧化锆个性化穿龈结构对薄龈生物型患者前牙区种植体周软硬组织的影响

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中华口腔医学杂志 2024年第7期59卷 690-695页

作者：王雅蓉张慕陈沛李少冰卢海宾曾棉燕曾艳容明灯南方医科大学口腔医院牙周种植科广州510280 南方医科大学口腔医院种植中心广州510280 南方医科大学口腔医院特诊中心广州510280

目的探讨氧化锆个性化穿龈结构对薄龈生物型患者前牙区单牙种植修复后种植体周软硬组织稳定性的影响,以期为临床提供参考。方法回顾性纳入2018年1月至2022年12月于南方医科大学口腔医院牙周种植科进行前牙区单牙种植修复的20例薄龈生物... 详细信息

目的探讨氧化锆个性化穿龈结构对薄龈生物型患者前牙区单牙种植修复后种植体周软硬组织稳定性的影响,以期为临床提供参考。方法回顾性纳入2018年1月至2022年12月于南方医科大学口腔医院牙周种植科进行前牙区单牙种植修复的20例薄龈生物型患者资料,其中男性9例,女性11例,年龄(35.2±10.3)岁。计算机辅助设计与辅助制作技术制作钛基底氧化锆个性化穿龈结构,该穿龈结构包括两种方式:钛基底氧化锆一体冠或个性化氧化锆基台+氧化锆外冠双层冠,以维持前牙美学区软组织穿龈轮廓。患者戴入最终修复体即刻和修复后3年复查,记录种植体存留率,采用粉色美学评分进行美学评估,根据数字化根尖片测量种植体边缘骨吸收量,用改良菌斑指数和改良出血指数评价牙周健康水平。结果修复后3年种植体存留率为100%(20/20),粉色美学评分为(9.3±0.9)分。修复后3年种植体近中和远中边缘骨吸收量分别为0.09(-0.21,0.20)和0.17(-0.12,0.27)mm,与修复后即刻(0)相比差异均无统计学意义(Z=-1.03,P=0.394;Z=-2.05,P=0.065)。结论氧化锆个性化穿龈结构能维持薄龈生物型患者前牙区种植体周软硬组织的稳定。

关键词：美学牙科牙种植牙龈生物型氧化锆个性化穿龈结构

SCCLG-ALL-2016方案治疗伴CD20阳性儿童B细胞起源急性淋巴细胞白血病的临床疗效分析

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中国热带医学 2024年第5期24卷 591-597页

作者：丘家鹏田川廖柳华黎巧茹林丹娜孔宪玲符莹叶中绿广东医科大学附属医院广东湛江524000 惠州市中心人民医院广东惠州516000 中山市人民医院广东中山528000 南方医科大学珠江医院广东广州510000 中山市博爱医院广东中山528000 广东医科大学顺德妇女儿童医院广东佛山528300

目的通过分析华南地区儿童急性淋巴细胞白血病治疗协作组2016治疗方案(2016 program of the South China children′s acute lymphoblastic leukemia treatment cooperation group,SCCLG-ALL-2016)治疗B细胞起源急性淋巴细胞白血病(B cell acute lymphoblastic leukemia,B-ALL)患儿的临床资料,探讨CD20表达对儿童B-ALL预后的影响,为B-ALL临床个性化和精准化治疗提供科学依据。方法回顾分析华南地区儿童急性淋巴细胞白血病治疗协作组6个中心2016年10月—2023年5月期间接受SCCLG-ALL-2016治疗的273例初诊B-ALL患儿的临床资料,分析其临床特征、染色体核型、融合基因、临床危险度分层、早期和远期疗效,并通过绘制生存曲线进行生存分析。结果273例初诊B-ALL患儿CD20阳性表达率26.9%,与CD20阴性组比较在白血病基因融合及突变方面差异有统计学意义(P0.05)。CD20阳性组总生存率为(71.9±10.1)%,低于CD20阴性组(86.8±4.0)%,3年无病生存率(event-free survival,EFS)为(81.2±5.6)%,低于CD20阴性组(89.5±2.2)%,但2组间差异均无统计学意义(P>0.05);CD20合并与不合并IKZF1基因片段缺失的总生存率(overall survival,OS)和3年EFS的差异无统计学意义(P>0.05)。3年EFS、OS相关单因素和多因素Cox回归分析,与3年EFS相关的单因素为脾脏情况、危险度分层;多因素分析显示脾脏情况及危险度分层是影响3年EFS的预后独立因素。与OS相关的单因素为脾脏情况、第15天骨髓情况、危险度分层及复发情况,多因素分析显示复发情况是影响OS的预后独立因素。结论儿童B-ALL的CD20表达与基因融合及突变表达相关,但CD20不是预后影响因素。

关键词：急性B淋巴细胞白血病儿童 CD20 IKZF1 生存分析

旋转生物反应器内球形体培养对人胎盘间充质干细胞炎症因子分泌的影响

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中国组织工程研究 2024年第19期28卷 3012-3017页

作者：张萍萍梁婷婷范明松陈黎张世昌南京医科大学第一附属医院检验学部江苏省南京市210029 南京医科大学第一附属医院产科江苏省南京市210029 南方医科大学深圳医院妇产科广东省深圳市518110 南方医科大学深圳医院检验科广东省深圳市518110

背景:生物反应器内球形体培养是既能维持间充质干细胞干性又能大规模扩增的体外培养方法,明确其对干细胞免疫调节作用的影响有利于指导临床应用。目的:探讨旋转生物反应器内球形体培养对人胎盘间充质干细胞炎症因子分泌的影响。方法:从... 详细信息

背景:生物反应器内球形体培养是既能维持间充质干细胞干性又能大规模扩增的体外培养方法,明确其对干细胞免疫调节作用的影响有利于指导临床应用。目的:探讨旋转生物反应器内球形体培养对人胎盘间充质干细胞炎症因子分泌的影响。方法:从人胎盘组织中分离培养人胎盘间充质干细胞,分别进行二维培养和旋转生物反应器培养,利用倒置相差显微镜、免疫组化染色和CCK-8实验观察细胞形态与增殖能力,RT-qPCR和流式荧光法检测多种炎症因子基因表达与蛋白分泌量。结果与结论:①旋转生物反应器内培养的人胎盘间充质干细胞聚集成多细胞球形体,数量与体积逐渐增加;②苏木精-伊红染色可见旋转生物反应器内培养4 d的人胎盘间充质干细胞在球形体内分布均匀,形态正常;③免疫组化染色显示球形体内有大量人胎盘间充质干细胞的细胞核Ki-67阳性;④CCK-8实验结果显示,生物反应器内球形体培养的人胎盘间充质干细胞活力显著高于二维培养的细胞;⑤RT-qPCR和流式免疫荧光法检测结果显示,旋转生物反应器内球形体培养的人胎盘间充质干细胞中白细胞介素1β、白细胞介素4、白细胞介素6、白细胞介素8、白细胞介素10、白细胞介素17、肿瘤坏死因子α和干扰素α的基因表达量和蛋白分泌量显著高于二维培养的细胞;⑥结果表明,旋转生物反应器内球形体培养能显著提高人胎盘间充质干细胞分泌多种炎症因子的能力,加强人胎盘间充质干细胞的免疫调节作用。

关键词：胎盘间充质干细胞生物反应器球形体炎症因子免疫调节

小潮气量过度通气对俯卧位脊柱手术患者眼内压和颅内压的影响:一项双盲随机对照试验

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南方医科大学学报 2024年第4期44卷 660-665页

作者：段雪飞韦锦锋梁安怡纪雪霞南方医科大学附属广东省人民医院麻醉科广东广州510080 南方医科大学附属广东省人民医院眼科广东广州510080

目的探讨不同通气模式对全麻俯卧位脊柱手术患者眼内压及颅内压的影响。方法选择2022年11月~2023年6月接受全麻下俯卧位脊柱手术患者,随机纳入常规通气组(n=36)与小潮气量过度通气组(n=36)。常规通气组Vt 8 mL/kg,Fr 12~15/min,维持etCO... 详细信息

目的探讨不同通气模式对全麻俯卧位脊柱手术患者眼内压及颅内压的影响。方法选择2022年11月~2023年6月接受全麻下俯卧位脊柱手术患者,随机纳入常规通气组(n=36)与小潮气量过度通气组(n=36)。常规通气组Vt 8 mL/kg,Fr 12~15/min,维持etCO_(2)在35~40 mmHg;小潮气过度通气组Vt 6 mL/kg,Fr 18~20/min,维持etCO_(2)在30~35 mmHg。以手持式眼压计测量双眼眼内压(IOP),以床旁实时超声在眼球后3 mm处测量视神经鞘直径(ONSD),分别在麻醉前(T0),麻醉完成即刻(T1),俯卧位摆放即刻(T2),手术进行2 h(T3),术毕转至平卧位即刻(T4),术后30 min(T5)记录IOP、ONSD以及循环及呼吸指标,进行组间及组内比较,同时分析二者的相关影响因素。结果与T1相比,两组患者在T3、T4时刻IOP与ONSD均显著上升(P0.05;r=0.165(T4),P>0.05]。结论全麻下俯卧位脊柱手术可显著增加患者IOP与ONSD,过度通气模式可以一定程度缓解俯卧位手术所致IOP与ONSD升高。

关键词：全麻下俯卧位脊柱手术眼内压颅内压视神经鞘直径

蒙特利尔认知量表评分在ICU机械通气患者脱机中的预测价值

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中国康复医学杂志 2024年第6期39卷 804-812,827页

作者：谭金泽张雷庞文君梁桂英叶金群陈尚杰南方医科大学第二临床医学院广州市510080 南方医科大学附属广东省人民医院(广东省医学科学院)康复医学科南方医科大学附属深圳市宝安医院康复医学科

目的:探讨MoCA评分在ICU机械通气患者脱机中的预测价值。方法:选取2022年10月—2023年8月期间收治于广东省人民医院重症监护室的符合纳入标准与排除标准的机械通气患者127例,其中男性85例,女性42例。所有患者在入科后24h内均评估一般资... 详细信息

目的:探讨MoCA评分在ICU机械通气患者脱机中的预测价值。方法:选取2022年10月—2023年8月期间收治于广东省人民医院重症监护室的符合纳入标准与排除标准的机械通气患者127例,其中男性85例,女性42例。所有患者在入科后24h内均评估一般资料以及MoCA评分、每分通气量(MV)、Apache-II评分、潮气量(VT)、浅快呼吸指数(RSBI)、氧合指数(OI)、血气分析等临床资料,评估患者自主呼吸试验前的机械通气时长,最后评估患者的脱机结局。根据患者的脱机结局分成两组并进行病例对照分析,其中脱机成功组92例,脱机失败组35例,采用单因素分析筛查与脱机失败相关的因素;采用二元logistic多因素回归分析判断影响机械通气患者脱机过程的危险因素与保护因素,计算优势比(OR)、95%置信区间(95%CI)以及准确度(Acc),绘制MoCA评分的受试者工作曲线(ROC曲线),计算曲线下面积(AUC)、约尔登指数(YI)、截断值(Cutoff),以分析MoCA评分在机械通气患者脱机中的预测价值。结果:一般资料比较结果显示,两组患者除BMI外差异均无显著性意义(P>0.05);两组患者临床资料比较结果显示,两组患者的Apache-II、MoCA评分、PaO_(2)、VT、MV、机械通气时长差异有显著性意义(P<0.05);多因素分析结果显示,MoCA评分高(OR=0.824,95%CI:0.720—0.944,P=0.005)是影响脱机结局的独立保护因素。每分通气量高(OR=0.600,95%CI:0.416—0.865,P=0.006)是影响脱机结局的独立保护因素。ROC曲线分析结果显示:MoCA评分的ROC曲线下面积(AUC)为0.746,95%CI为0.661—0.819,P=0.001。最佳截断值为20分,对应的敏感度(Se)和特异度(Sp)分别是77.14%、68.48%,预测准确度(Acc)为74.02%。结论:MoCA评分高是影响脱机结局的独立保护因素,当患者MoCA评分≤20分时,患者发生脱机失败的风险增大。MoCA评分高的患者,其脱机成功率高,MoCA评分每提高1分,脱机成功率增加17.6%。

关键词：重症康复脱机机械通气蒙特利尔认知量表评分预测价值

CaMKⅡγ和CaMKⅡδ通过PI3K/Akt/Erk信号通路减轻小鼠神经元缺血再灌注损伤

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南方医科大学学报 2024年第3期44卷 563-570页

作者：刘昊铭林子诗叶靖南方医科大学南方医院麻醉科广东广州510515 佛山市第一人民医院麻醉科广东佛山528000 南方医科大学珠江医院麻醉科广东广州510260

目的观察钙/钙调蛋白依赖性激酶Ⅱ(CaMKⅡ)的同工型CaMKⅡγ和CaMKⅡδ对鼠神经元细胞缺血缺氧再灌注损伤的影响,并探究其作用机制。方法分离胚胎期第18天胎鼠大脑用于提取原代神经元,在5%CO_(2)、37℃条件下培养,分为常规培养的对照组... 详细信息

目的观察钙/钙调蛋白依赖性激酶Ⅱ(CaMKⅡ)的同工型CaMKⅡγ和CaMKⅡδ对鼠神经元细胞缺血缺氧再灌注损伤的影响,并探究其作用机制。方法分离胚胎期第18天胎鼠大脑用于提取原代神经元,在5%CO_(2)、37℃条件下培养,分为常规培养的对照组、空白对照组(si-NT)、CaMKⅡγ敲除组(si-CAMK2G)和CaMKⅡδ敲除组(si-CAMK2D)。研究组神经元转染处理后,更换为无糖培养基,并将其置于缺氧环境中模拟氧糖剥夺(OGD/R)条件,持续1 h,随后复原标准培养环境。通过对神经元裂解物行免疫蛋白印迹检测磷脂酰肌醇-3-激酶/细胞外信号调节激酶(PI3K/Akt/Erk)信号通路构件的表达量,并建立小鼠大脑中动脉闭塞(MCAO)模型,通过对比假手术组(Sham)(n=25)和MCAO组(n=25)PI3K/Akt/Erk信号通路表达来进行验证。结果si-CAMK2G组的胎鼠神经元细胞在OGD/R 12、24、48、72 h的生存率明显低于si-NT组(P<0.01或0.001),并可逆转OGD/R介导的胎鼠神经元细胞CaMKⅡγ表达上调。si-CAMK2G组和si-CAMK2D组与si-NT组相比,PI3K/Akt/Erk信号通路表达受到明显抑制(P<0.01)。在MCAO模型中,MCAO组小鼠脑CaMKⅡδ和CaMKⅡγ的表达显著增加并激活了PI3K/Akt/Erk信号通路,CaMKⅡδ和CaMKⅡγ,Erk、磷酸化Erk、Akt和磷酸化Akt在MCAO造模成功再灌注后24、48、72和96 h的表达显著高于Sham组再灌注24 h(P<0.05,0.01或0.0001)。结论CaMKⅡγ和CaMKⅡδ在神经元细胞发生缺血缺氧损伤时的神经保护作用可能是通过PI3K/Akt/Erk信号通路介导的。

关键词：脑缺血再灌注损伤钙/钙调蛋白依赖性激酶Ⅱ 神经保护磷脂酰肌醇-3-激酶细胞外信号调节激酶信号通路

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多巴胺在肾移植术中临床应用价值的再认识

器官移植 2024年第4期15卷 643-647页

作者：钟羽琦王於尘苗芸中山大学肿瘤防治中心麻醉科广州510060 南方医科大学南方医院器官移植科

多巴胺是去甲肾上腺素生物合成的前体,小剂量多巴胺主要兴奋多巴胺受体,可扩张肾及肠系膜血管,增加肾血流量,改善微循环。近年来,小剂量多巴胺以其血管活性作用广泛应用于肾移植领域。然而,随着循证医学的发展,多巴胺在肾移植术中保护... 详细信息

多巴胺是去甲肾上腺素生物合成的前体,小剂量多巴胺主要兴奋多巴胺受体,可扩张肾及肠系膜血管,增加肾血流量,改善微循环。近年来,小剂量多巴胺以其血管活性作用广泛应用于肾移植领域。然而,随着循证医学的发展,多巴胺在肾移植术中保护移植肾灌注功能的作用开始受到人们的质疑。多项研究发现多巴胺在肾移植术中对肾功能、心功能无明显益处,升压效能较低,甚至会增加围手术期并发症的发生风险,而去甲肾上腺素可成为一种较安全的替代。因此,本文就多巴胺在肾移植术中对肾功能、心功能以及血流动力学影响的新进展进行综述,以期为多巴胺在肾移植术中的临床应用提供参考。

关键词：肾移植血管活性药物多巴胺小剂量去甲肾上腺素肾灌注心律失常急性肾损伤

腹膜透析患者血红蛋白变异性与全因死亡及心血管疾病死亡风险的相关性

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中华肾脏病杂志 2024年第8期40卷 611-618页

作者：黄淑婷艾军霍志濠朱露龚妮容钟晓红孔耀中刘德慧窦献蕊张广清南方医科大学南方医院肾内科广州510515 南方医科大学护理学院广州510515 广州中医药大学第一附属医院肾病科广州510405 佛山市第一人民医院肾内科佛山528000 赣州市人民医院肾内科赣州341000 南方医科大学顺德医院肾内科佛山528308 南方医科大学南方医院医院办公室广州510515

目的探讨腹膜透析(peritoneal dialysis,PD)患者血红蛋白变异性(hemoglobin variability,Hbvar)与全因死亡及心血管疾病死亡风险的关系,以期为降低PD人群死亡风险提供依据。方法该研究为多中心、回顾性队列研究,收集2008年7月1日至2019... 详细信息

目的探讨腹膜透析(peritoneal dialysis,PD)患者血红蛋白变异性(hemoglobin variability,Hbvar)与全因死亡及心血管疾病死亡风险的关系,以期为降低PD人群死亡风险提供依据。方法该研究为多中心、回顾性队列研究,收集2008年7月1日至2019年12月31日在南方医科大学南方医院、南方医科大学顺德医院、佛山市第一人民医院及赣州市人民医院规律PD患者的临床资料。以PD前基线及PD后第1年内血红蛋白计算Hbvar,根据第1年Hbvar三分位数将患者分为低变异性组、中变异性组和高变异性组,比较3组基线临床资料的差异。随访终点为患者死亡、转血液透析、转肾移植、转其他中心、失访或截至2021年12月31日。采用Cox回归分析模型分析第1年Hbvar与全因死亡及心血管疾病死亡的相关性,并使用FineGray竞争风险回归模型评估竞争事件对死亡风险的影响。结果该研究纳入1562例PD患者,年龄(47.6±13.8)岁,男性821例(52.6%),基线血红蛋白为81(69,94)g/L,PD第1年Hbvar为26.6(16.7,40.3)g/L。低变异性组(<20.0 g/L)、中变异性组(20.0~35.5 g/L)、高变异性组(≥35.5 g/L)患者年龄、体重指数、血清白蛋白、血红蛋白、血清肌酐、血清钙、血清磷、全段甲状旁腺素及肾素血管紧张素系统抑制剂使用比例的差异均有统计学意义(均P<0.05)。随访时间为33(19,51)个月,患者死亡208例(13.3%),其中心血管疾病死亡111例(53.4%)。多因素Cox回归分析结果显示,第1年高Hbvar是PD患者全因死亡(HR=0.98,95%CI 0.97~0.99,P=0.018)和心血管疾病死亡(HR=0.98,95%CI 0.97~0.99,P=0.041)风险低的独立影响因素。以低变异性组为参照,高变异性组全因死亡(HR=0.56,95%CI 0.37~0.82,P=0.003)及心血管疾病死亡(HR=0.54,95%CI 0.31~0.95,P=0.032)风险最低。竞争风险回归模型分析结果显示,第1年Hbvar与全因死亡(HR=0.98,95%CI 0.97~0.99,P=0.041)和心血管疾病死亡(HR=0.98,95%CI 0.97~0.99,P=0.039)风险仍呈负相关。结论对于基线贫血严重PD患者,第1年高Hbvar与低全因死亡及心血管疾病死亡风险相关。

关键词：腹膜透析血红蛋白类死亡率血红蛋白变异性