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TTC9A在泛癌中的表达水平与多种癌症的预后和免疫微环境相关

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南方医科大学学报 2024年第1期44卷 70-82页

作者：姚倚钠刘佳周想军刘泽宇邱士珍何颖政周雪琼南方医科大学公共卫生学院职业卫生学系广东广州510515 广东省热带病研究重点实验室广东广州510515

目的确定四肽重复蛋白9A(TTC9A)在泛癌中的基因表达及其预后价值,明确其与免疫浸润的关系。方法R语言分析癌症基因组图谱及GTEx网站中TTC9A在不同肿瘤组织与正常组织中的表达及其与各种癌症的预后、DNA甲基化、肿瘤突变负荷、微卫星不... 详细信息

目的确定四肽重复蛋白9A(TTC9A)在泛癌中的基因表达及其预后价值,明确其与免疫浸润的关系。方法R语言分析癌症基因组图谱及GTEx网站中TTC9A在不同肿瘤组织与正常组织中的表达及其与各种癌症的预后、DNA甲基化、肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性的关系;应用TIMER和xCell比较TTC9A表达与免疫浸润的关系;运用免疫印迹法与RT-qPCR检测TTC9A在4种癌症中的表达情况。结果生信结果显示与正常组织相比,TTC9A在多种肿瘤中mRNA表达水平升高,少数肿瘤中下调(P<0.05)。实验结果显示在肺癌、结肠癌和肝癌中,TTC9A的蛋白和mRNA水平均较正常细胞高,与泛癌分析结果一致;而在膀胱癌细胞系中的表达下降,与泛癌分析结果相反。在头颈鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌、低级别胶质瘤、恶性间皮瘤、子宫内膜癌等肿瘤中,TTC9A的高表达与更好的总生存期、疾病特异性生存期、无进展间期密切相关(P<0.05);而在肺腺癌、胰腺癌、肾上腺癌、直肠腺癌中,高表达TTC9A与更差的总生存期、疾病特异性生存期、无进展间期密切相关(P<0.05)。在多形成性胶质细胞瘤、低级别胶质瘤、葡萄膜黑色素瘤、卵巢浆液性囊腺癌中,TTC9A高甲基化患者预后较好(P<0.05);但是,在宫颈鳞状细胞癌和宫颈内腺癌、头颈部鳞状细胞癌、肺鳞状细胞癌、肾上腺癌、子宫内膜癌中,TTC9A高甲基化患者预后较差(P<0.05)。TTC9A基因表达分别与7种和4种癌症类型的TMB和MSI显著相关(P<0.05)。在大多数癌症类型中,TTC9A与免疫细胞的浸润水平显著相关(P<0.05),尤其B细胞、CD4^(+)T细胞、CD8^(+)T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞。结论TTC9A可作为多种癌症的预后标志物,且与肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性和免疫细胞浸润密切相关。

关键词： TTC9A 泛癌分析免疫微环境预后

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登革热诊疗的最新研究进展

中国病原生物学杂志 2024年第10期19卷 1228-1233页

作者：苟文曦程镥轶吴焜南方医科大学第二临床医学院广东广州510515 南方医科大学公共卫生学院病原生物学系广东省热带病研究重点实验室

登革病毒(dengue virus, DENV)从受感染的伊蚊传播给人类,会引发轻度(登革热)至致命性疾病(登革休克综合征)。不同DENV血清型或不同黄病毒之间相似的保守结构和序列导致了交叉反应的发生,进而产生抗体依赖性增强效应。此外,黄病毒的交... 详细信息

登革病毒(dengue virus, DENV)从受感染的伊蚊传播给人类,会引发轻度(登革热)至致命性疾病(登革休克综合征)。不同DENV血清型或不同黄病毒之间相似的保守结构和序列导致了交叉反应的发生,进而产生抗体依赖性增强效应。此外,黄病毒的交叉反应性可能在临床中出现对登革热的误诊,从而影响治疗。因此,需要具有高特异性和敏感性的诊断方法,为DENV感染者提供早期诊断和治疗。目前,仍缺乏能够对不同DENV血清型感染提供有效保护的疫苗,故深入研究以开发有效的治疗药物至关重要。本文旨在对登革热诊断及治疗的最新进展进行综述。

关键词：登革热诊断疫苗综述

《中华人民共和国生物安全法》实施背景下我国生物技术和人类遗传资源的伦理问题

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中国公共卫生 2024年第3期40卷 389-392页

作者：赵宇骐刘滢芳林一凡吴清华何小艳南方医科大学南方医院神经外科广州510515 南方医科大学广东省热带病研究重点实验室BSL-3实验室广州510515

随着生物技术的发展,特别是基因编辑技术的成熟与应用,而引发的生物技术和人类遗传资源相关伦理问题越来越多,我国对生物技术发展所带来的伦理问题也愈发关注和重视,2020年10月17日第十三届全国人民代表大会常务委员会第二十二次会议通... 详细信息

随着生物技术的发展,特别是基因编辑技术的成熟与应用,而引发的生物技术和人类遗传资源相关伦理问题越来越多,我国对生物技术发展所带来的伦理问题也愈发关注和重视,2020年10月17日第十三届全国人民代表大会常务委员会第二十二次会议通过了《中华人民共和国生物安全法》(以下简称《生物安全法》),并自2021年4月15日起施行。《生物安全法》对我国相关专业人员的伦理意识教育、对生物技术研发的伦理审查、人类遗传资源和生物资源的主权及其采集、保藏、利用、对外提供等方面均提出了明确要求。本文概述了《生物安全法》对我国生物技术研发与应用以及人类遗传资源的利用等方面的伦理要求,并以“基因编辑婴儿”等事件为例,阐述了《生物安全法》实施背景下我国生物技术和人类遗传资源的伦理问题,以提高国家生物安全治理能力。

关键词：《中华人民共和国生物安全法》生物技术人类遗传资源伦理

肝受体同源物-1通过转录激活多药耐药基因1调控肝癌细胞对奥沙利铂的敏感性

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中国热带医学 2024年第5期24卷 506-510,518页

作者：刘金连潘楠楠陈雪肖利佳南方医科大学深圳医院检验科广东深圳518001

目的探索肝受体同源物-1(the liver receptor homolog-1,LRH-1)在调控肝癌细胞对奥沙利铂敏感性过程中的功能和分子机制,为肝癌治疗提供新思路。方法在肝癌细胞系中构建低表达及过表达LRH-1的细胞模型,通过检测半抑制浓度(half maximal ... 详细信息

目的探索肝受体同源物-1(the liver receptor homolog-1,LRH-1)在调控肝癌细胞对奥沙利铂敏感性过程中的功能和分子机制,为肝癌治疗提供新思路。方法在肝癌细胞系中构建低表达及过表达LRH-1的细胞模型,通过检测半抑制浓度(half maximal inhibitory concentration,IC_(50))、细胞增殖和平板克隆形成实验等功能学实验探索LRH-1在肝癌细胞中对奥沙利铂敏感性的影响;通过定量PCR检测LRH-1对多药耐药基因1(multidrug resistance gene 1,MDR1)基因的转录调控作用;通过荧光素酶报告实验评估LRH-1对MDR1的转录激活能力。结果在HuH7细胞中过表达LRH-1后,细胞在奥沙利铂处理下,IC_(50)显著升高,达到18.012μmol/L,显著高于HuH-7对照组的2.042μmol/L,差异有统计学意义(P<0.05);同时其细胞增殖能力显著增强,MDR1 mRNA表达水平明显升高。在HepG2细胞中敲低LRH-1表达后,细胞在奥沙利铂处理下,IC_(50)显著降低,为1.012μmol/L,显著低于HepG2对照组的6.294μmol/L,差异有统计学意义(P<0.05);同时其细胞增殖能力和平板克隆形成能力显著降低,MDR1 mRNA表达水平明显降低。荧光素酶报告实验证实,LRH-1可以剂量依赖性激活MDR1启动子的转录活性,其特异性小分子抑制物ML-180能显著降低LRH-1对MDR1启动子的转录激活能力。结论LRH-1通过转录激活MDR1降低肝癌细胞对奥沙利铂的敏感性,因其特异性小分子抑制剂已经合成成功,LRH-1可作为肝癌耐药治疗的潜在靶点。

关键词：肝受体同源物-1 奥沙利铂肝癌多药耐药基因1

广东省392台次CT质量控制和机房防护检测结果分析

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中国辐射卫生 2024年第1期33卷 61-67页

作者：程希元廖炎鹏刘书朋王闯周美娟南方医科大学公共卫生学院放射医学系广东广州510515 国家药品监督管理局化妆品安全评价重点实验室南方医科大学公共卫生学院广东广州510515 粤港澳污染物暴露与健康联合实验室南方医科大学公共卫生学院广东广州510515 广东省热带病研究重点实验室南方医科大学公共卫生学院广东广州510515 广州南方医大医疗设备综合检测有限责任公司广东广州510515 南方医科大学南方医院放疗科广东广州510515 广东省医疗器械质量监督检验所广东广州510663

目的分析近年来广东省部分CT机质量控制和CT机房防护情况,为放射卫生监督提供依据。方法收集广州某第三方放射卫生技术服务机构2019—2021年对392台次CT机的质量控制和放射防护检测数据,统计分析CT所在医院级别、CT生产厂家、CT质量... 详细信息

目的分析近年来广东省部分CT机质量控制和CT机房防护情况,为放射卫生监督提供依据。方法收集广州某第三方放射卫生技术服务机构2019—2021年对392台次CT机的质量控制和放射防护检测数据,统计分析CT所在医院级别、CT生产厂家、CT质量控制检测结果、防护检测合格率等指标。结果被检CT机覆盖了广东省各级别医院,分别来源于国内、国外9个主要CT设备制造商;机房防护检测合格率为99.88%,其中5次机房外周围剂量当量率超标情况中,4次为控制室防护门,1次为机房墙体;设备质量控制检测整体合格率99.49%,不符合指标出现在定位光精度和重建层厚偏差。结论广东省近年来CT设备质量控制和机房防护情况处于较好水平。

关键词： X射线计算机体层摄影装置质量控制放射防护加权CT剂量指数周围剂量当量率

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基于限制平均生存时间的多组疗效比较

中国卫生统计 2024年第3期41卷 409-413页

作者：江珮瑜周佳仪徐筠天张成凤巫宏基任嘉翘黑子健余磊侯雅文陈征南方医科大学公共卫生学院(广东省热带病研究重点实验室)生物统计学系 510515 暨南大学经济学院统计与数学科学系

目的在临床随访研究中,基于时间尺度指标的限制平均生存时间(restricted mean survival time,RMST)越来越受到关注,然而目前基于RMST的统计推断主要用于两组比较,缺少进行两组以上比较的方法。方法本文提出RMST多组间的假设检验法,包括... 详细信息

目的在临床随访研究中,基于时间尺度指标的限制平均生存时间(restricted mean survival time,RMST)越来越受到关注,然而目前基于RMST的统计推断主要用于两组比较,缺少进行两组以上比较的方法。方法本文提出RMST多组间的假设检验法,包括经典法(naive)、对数转换法(log)、双对数转换法(cloglog)三种检验法,并通过Monte Carlo模拟评价其Ⅰ类错误和检验效能,最后进行实例分析。结果综合Monte Carlo模拟的Ⅰ类错误及检验效能结果,显示所提出的RMST检验可以处理多组比较的问题,特别是cloglog转换法最为稳健。结论针对生存数据的多组比较问题,若考虑从时间尺度指标分析,推荐使用cloglog转换法的RMST多组检验。

关键词：限制平均生存时间比例风险假定多组比较双对数转换

深圳市2013—2022年6~19岁人群主要呼吸道传染病流行趋势

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中国热带医学 2024年第2期24卷 184-189页

作者：罗日景温莹程雁鹏陈霓璇黄芳陈志高张振吕秋莹南方医科大学公共卫生学院广东广州510515 深圳市疾病预防控制中心广东深圳518055

目的分析2013—2022年深圳市6~19岁人群主要呼吸道传染病的流行特征及变化趋势,为开展防控工作提供参考。方法收集深圳市2013—2022年6~19岁人群流行性感冒(流感)、流行性腮腺炎(流腮)及水痘报告病例,采用描述性流行病学方法和Joinpoin... 详细信息

目的分析2013—2022年深圳市6~19岁人群主要呼吸道传染病的流行特征及变化趋势,为开展防控工作提供参考。方法收集深圳市2013—2022年6~19岁人群流行性感冒(流感)、流行性腮腺炎(流腮)及水痘报告病例,采用描述性流行病学方法和Joinpoint回归模型进行流行特征和发病率趋势变化分析。结果2013—2022年深圳市6~19岁人群流感、流腮和水痘的年平均发病率分别为961.44/10万、157.70/10万及664.34/10万。流感发病率呈上升趋势,年度变化百分比(annual percent change,APC)为52.88%(P0.05),水痘发病率APC分别为28.88%和−50.03%(P<0.05)。从季节分布上看,3种传染病发病均呈双峰分布,冬季(12月—次年1月)及春夏交际(4—6月)高发。6~<10岁人群报告3种传染病病例数占比超过60%。10~<15岁和15~19岁人群水痘发病占比呈上升趋势。15~19岁人群流感和水痘发病率上升速度最快,APC分别为77.89%和33.00%(P<0.05)。结论基于Joinpoint回归模型的趋势分析观察到2013—2022年深圳市6~19岁人群流感报告发病率呈上升趋势,水痘发病率呈“升-降”变化。6~<10岁儿童为主要发病人群,应继续推进小学的传染病防控工作,同时15~19岁人群的呼吸道传染病发病率的快速上升及10~19岁人群水痘发病占比升高,提示应对高年龄组未成年人群的免疫空白和集中住宿等影响因素开展干预。

关键词：流行性感冒流行性腮腺炎水痘流行特征 Joinpoint回归模型

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小鼠原代腹腔巨噬细胞外泌体的分离及鉴定

中国生物制品学杂志 2024年第3期37卷 356-360页

作者：刘玉国罗惠瑜林凤涓王洁娴莫嘉琦苏楚红陈俊斌郑钟黛西查龙应南方医科大学公共卫生学院营养与食品卫生学系广东省热带病研究重点实验室广东广州510515

目的分离纯化小鼠原代腹腔巨噬细胞分泌的外泌体并进行鉴定。方法分别经5只雄性C57BL/6小鼠腹腔注射3%巯基乙酸盐肉汤,灌洗获得小鼠原代腹腔巨噬细胞后,用流式细胞术分析纯度。采用ExoQuick TC外泌体试剂盒提取小鼠原代腹腔巨噬细胞外泌... 详细信息

目的分离纯化小鼠原代腹腔巨噬细胞分泌的外泌体并进行鉴定。方法分别经5只雄性C57BL/6小鼠腹腔注射3%巯基乙酸盐肉汤,灌洗获得小鼠原代腹腔巨噬细胞后,用流式细胞术分析纯度。采用ExoQuick TC外泌体试剂盒提取小鼠原代腹腔巨噬细胞外泌体,BCA试剂盒测定外泌体蛋白含量,透射电镜观察外泌体形态,纳米颗粒跟踪分析仪检测外泌体粒径及分布,Western blot法检测外泌体标志物(CD9、CD63和TSG101)的表达。结果每只小鼠可获得约5×10^(6)个纯度为(99.17±0.65)%的腹腔巨噬细胞。5 mL小鼠原代腹腔巨噬细胞培养上清液中可提取869μg外泌体蛋白。小鼠原代腹腔巨噬细胞外泌体在电镜下呈折光性较强的典型茶托样囊泡,高表达外泌体特异性标志物TSG101、CD63和CD9,粒径分布集中在100~200 nm,平均粒径为175.2 nm。结论腹腔注射巯基乙酸盐肉汤可提高小鼠原代腹腔巨噬细胞得率,ExoQuick TC外泌体试剂盒能够提取足量且纯度较高的小鼠原代腹腔巨噬细胞外泌体。

关键词：外泌体巨噬细胞小鼠原代细胞分离巯基乙酸盐肉汤培养基

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胡椒碱对白纹伊蚊幼虫的毒性作用及发育影响

热带医学杂志 2024年第6期24卷 783-787,I0003页

作者：袁思祎王颖齐白钰邓雯洋李华南方医科大学公共卫生学院预防医学实验教学中心广东广州510515

目的探讨胡椒碱对白纹伊蚊幼虫的毒性作用,为绿色杀虫剂的研发提供科学基础。方法采用幼虫浸渍法,观察不同浓度(5、10、20、30 mg/L)胡椒碱处理对白纹伊蚊幼虫生长发育的影响,记录发育异常的幼虫形态、幼虫的化蛹数、羽化数和死亡数,计... 详细信息

目的探讨胡椒碱对白纹伊蚊幼虫的毒性作用,为绿色杀虫剂的研发提供科学基础。方法采用幼虫浸渍法,观察不同浓度(5、10、20、30 mg/L)胡椒碱处理对白纹伊蚊幼虫生长发育的影响,记录发育异常的幼虫形态、幼虫的化蛹数、羽化数和死亡数,计算化蛹率、羽化率和死亡率。利用不同浓度梯度(5、10、20、25、30 mg/L)的胡椒碱处理48 h后观察白纹伊蚊幼虫对应的死亡率,进行回归分析,并计算半数致死浓度(LC50)和95%CI。结果胡椒碱作用初期,白纹伊蚊幼虫活动正常,1 h后发现幼虫活动频率降低,高浓度(20、30 mg/L)胡椒碱处理组的幼虫活跃度较低浓度(5、10 mg/L)明显减弱;12 h后各浓度组均有幼虫发生死亡,部分幼虫反应迟钝,但用细玻璃棒轻触刺激后可做出逃避反应,并浮出水面;死亡幼虫多数沉于水底,表现为躯干局部发黑,虫体萎缩僵直;部分死亡幼虫浮在水面上,触动后下沉。经胡椒碱处理的存活幼虫化蛹后进入蛹期,部分在蛹期发生死亡,死蛹主要表现出两种形态,蜕皮后尚未形成新表皮的裸蛹和已发生色素沉着的蛹。与空白对照组比较,经不同浓度(5、10、20、30 mg/L)胡椒碱处理的白纹伊蚊幼虫化蛹率(χ^(2)=25.185、63.602、241.359、322.105)和羽化率(χ^(2)=5.046、14.203、68.629)均依次显著降低,死亡率依次显著升高(χ^(2)=37.600、84.050、272.046、291.256),差异均有统计学意义(P均<0.001)。胡椒碱对白纹伊蚊4龄幼虫的LC50为10.068 mg/L,95%CI为6.108~13.930 mg/L,毒力回归曲线方程y=3.301x-3.310。结论胡椒碱对白纹伊蚊幼虫具有毒性作用,通过影响化蛹和羽化这两个发育关键环节达到杀灭效果,可作为潜在的白纹伊蚊绿色杀虫剂。

关键词：白纹伊蚊发育胡椒碱