检索结果-南通市图书馆

乙酰辅酶 A 羧化酶调控肝癌细胞增殖的效应与机制

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中国药科大学学报 2024年

作者：简阿妮白雪霞杨南飞沈萍萍南京大学生命科学学院

为了探究巨噬细胞如何促进肝癌细胞的脂滴囤积，并深入研究脂滴的关键代谢酶在肝癌细胞恶性生物学中的作用，本研究利用肿瘤相关巨噬细胞（tumor-associatedmacrophages，TAMs）上清液诱导Hepa1-6脂滴（lipiddroplets，LDs）生成，发现T... 详细信息

为了探究巨噬细胞如何促进肝癌细胞的脂滴囤积，并深入研究脂滴的关键代谢酶在肝癌细胞恶性生物学中的作用，本研究利用肿瘤相关巨噬细胞（tumor-associatedmacrophages，TAMs）上清液诱导Hepa1-6脂滴（lipiddroplets，LDs）生成，发现TAMs中的白细胞介素10（interleukin-10，IL-10）能够促进脂滴的积累。乙酰辅酶A 羧化酶（acetyl-CoA carboxylase alpha， ACC1）是脂肪酸合成的关键酶之一，影响着肝癌的发生发展。本研究发现，ACC1在LDhighHepa1-6中高表达，之后通过ACC1的小分子抑制剂、siRNA干扰和CRISPR-cas9敲除等手段阻断ACC1的活性，发现Hepa1-6脂滴积累降低，同时减少了Hepa1-6增殖的恶性生物学行为，促进了Hepa1-6发生凋亡事件。综上所述，TAMs释放的IL-10促进了肝癌细胞的脂滴形成，导致肝癌细胞的恶性增殖与凋亡。ACC1在TAMs促进肝癌细胞脂滴积累过程中发挥关键作用，并且可能受TAMs释放的IL-10的调控，这些发现可为肝癌治疗提供新的靶点。

关键词：肝癌肿瘤相关巨噬细胞代谢重编程脂滴乙酰辅酶A羧化酶1

身板小、力量大、无处不在的microRNA如何重塑生命科学

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生理学报 2024年第5期 673-676页

作者：陈熹张辰宇南京大学生命科学学院

1微小RNA （microRNA,miRNA）的发现被授予诺贝尔奖生物体的遗传信息通过转录从DNA传递到RNA，再由RNA翻译为蛋白质，从而执行各种生物学功能。这种编码-翻译系统是所有生命活动的基础，驱动着细胞内的各类生物过程。尽管人类与其它动...

1微小RNA （microRNA,miRNA）的发现被授予诺贝尔奖生物体的遗传信息通过转录从DNA传递到RNA，再由RNA翻译为蛋白质，从而执行各种生物学功能。这种编码-翻译系统是所有生命活动的基础，驱动着细胞内的各类生物过程。尽管人类与其它动物在基因组序列上存在极高相似度，但人类表现出更加复杂的表型性状，这种复杂性主要归因于基因表达调控机制的高度精细化和多样化。miRNA是一类长约22个核苷酸的小分子非编码RNA，它并不直接参与蛋白质的合成，而是通过与靶mRNA互补配对从而在转录后水平上对基因表达进行调控。研究显示，人类基因中有超过45 000个miRNA靶点，超过60%的人类蛋白编码基因能被miRNA调控[1]。

关键词：

基于亚细胞水平RNA-seq鉴定RIDD潜在靶基因

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基因组学与应用生物学 2024年第Z1期 1499-1509页

作者：王梦琪陈加余南京大学生命科学学院

RIDD(regulated inositol-requiring enzyme 1 dependent RNA decay,受调控的肌醇需求酶1依赖性的RNA降解)是内质网应激传感器IRE1(inositol-requiring enzyme 1,肌醇需求酶1)的RNA内切酶活性的表现形式之一。RIDD与细胞命运密切相关，参与调控细胞分化、脂质和糖类代谢以及炎症反应等。因此，明确RIDD靶基因及其生理意义对于疾病机制解析、新靶点发现和新疗法开发具有重要意义。然而，当前的RIDD靶基因研究尚存在诸多问题，新的靶基因有待发现。本研究基于亚细胞水平RNA-seq,设置了三个筛选RIDD潜在靶基因的标准：(1)内质网应激后，细胞质中特异性下调的基因；(2)在内质网膜胞质侧富集表达的基因；(3)具有一致序列CUGCAG且能形成茎环结构的基因。最终，本研究鉴定出128个RIDD潜在靶基因。相较于其他研究，本研究聚焦于内质网膜胞质侧RNA的序列依赖性的降解，排除了转录水平变化和其他RNA降解机制等因素的干扰。这些潜在靶基因除富集于细胞分裂相关通路外，还与Wnt(wingless-related integration site,无翅整合相关位点)信号通路密切相关。该发现有助于阐明内质网应激调控Wnt信号通路的机制，并有望为Wnt活动异常相关癌症的治疗提供新靶点及新思路。

关键词：内质网应激受调控的肌醇需求酶1依赖性的RNA降解肌醇需求酶1 Wnt

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计算生物学在药学研究中的应用

药学学报 2024年第8期59卷 2192-2198页

作者：汤佳宁孙洋南京大学生命科学学院医药生物技术全国重点实验室江苏南京210023

计算生物学(computational biology)属于生物学的一个分支,是指开发和应用数据分析及理论的方法、数学建模和计算机仿真技术等,用于生物学、行为学和社会群体系统的研究的一门学科。近年来,计算生物学越来越受到重视,这主要是因为高通... 详细信息

计算生物学(computational biology)属于生物学的一个分支,是指开发和应用数据分析及理论的方法、数学建模和计算机仿真技术等,用于生物学、行为学和社会群体系统的研究的一门学科。近年来,计算生物学越来越受到重视,这主要是因为高通量技术大大提高了数据的生成能力。海量计算数据的生成带动了设备计算能力的不断增长,数据的复杂性和异质性也需要更加系统的分析方法,它们共同推动着计算生物学的发展。随着大数据时代的发展,生物学研究和实验的数据呈指数型增长,单一的观察和实验已经无法支撑高复杂性的数据,计算生物学成为药物研究的一个重要且有力的工具。目前,计算生物学已经应用于肽合成与小分子设计、虚拟筛选、蛋白质结构与蛋白质相互作用预测、数据库构建、生物活性物质预测和药物释放监测等多个领域,从而为药物靶点预测、药物设计、药物筛选及药物的临床应用等多个药物研究的过程提供帮助。计算生物学如今已成为相较于传统药物研究工具更加省时省力的“臂膀”,同时药物研发的需求也不断推动着计算生物学的发展。二者相辅相成,共同发展,计算生物学已成为药物研究不可分割的一部分。

关键词：计算生物学药学药物靶点预测药物筛选药物设计应用

生物质炭和氮肥对马尾松人工林土壤微生物群落结构和酶活性的影响

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环境科学学报 2024年第4期44卷 333-343页

作者：陈健卢伟伟杜娅茹张芳超南京林业大学生态与环境学院南京210037

研究不同裂解温度制备的生物质炭和氮肥对马尾松人工林土壤微生物群落结构和酶活性影响的差异,探究影响微生物群落结构和酶活性的关键土壤理化性质,为改良马尾松人工林土壤提供理论参考.以江苏省镇江市下蜀林场马尾松人工林土壤为研究对... 详细信息

研究不同裂解温度制备的生物质炭和氮肥对马尾松人工林土壤微生物群落结构和酶活性影响的差异,探究影响微生物群落结构和酶活性的关键土壤理化性质,为改良马尾松人工林土壤提供理论参考.以江苏省镇江市下蜀林场马尾松人工林土壤为研究对象,开展60 d的培养实验,设计对照(CK)、添加300℃生物质炭(BC300)、添加500℃生物质炭(BC500)、添加氮肥(N)、添加300℃生物质炭和氮肥(BC300-N),以及添加500℃生物质炭和氮肥(BC500-N)共6个处理.结果表明,相比CK,BC500和BC500-N处理的真菌/细菌比值分别升高了2.82%和3.54%(p生物质炭增强了微生物对土壤难分解有机碳的分解.BC500、N和BC500-N处理分别降低土壤G^(+)菌比例5.14%、5.14%和5.24%(p生物质炭和氮可能缓解了土壤微生物的营养胁迫.N处理的β-D-葡萄糖苷酶(BG)活性降低了37.5%(p生物质炭可能增强了土壤对微生物所需求的氮、磷的供给.各处理均提高了多酚氧化酶(PPO)的活性,这表明土壤微生物分解难分解有机碳的能力提高.冗余分析(RDA)表明,可溶性有机碳(DOC)和氮含量是影响微生物群落结构和活性的最重要土壤性质.综上所述,相比低温生物质炭,高温生物质炭促使土壤微生物群落朝向分解难分解有机碳,降低了微生物获取土壤磷的酶活性.氮肥提高了土壤G-菌/G^(+)菌,降低了微生物获取土壤碳和氮的酶活性.因此,高温生物质炭和氮肥同时施用可能最有效的消除了土壤微生物的N、P营养限制.本研究为深入研究土壤微生物生长代谢提供了基础数据,并为马尾松人工林的土壤改良提供了参考.

关键词：人工林生物质炭制备温度氮肥土壤微生物酶活性 PLFAs

苏北平原2个密度杨树人工林土壤团聚体及固碳差异

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林业科学 2024年第10期60卷 21-28页

作者：杨豆刘超华李凤巧唐罗忠田野方升佐李孝刚南京林业大学生态与环境学院南京210037 南京林业大学林草学院南京210037

【目的】比较2个密度杨树人工林的土壤团聚体和固碳差异,揭示其土壤固碳过程,为制定有效的可持续人工林经营措施提供理论基础。【方法】采集高密度(400株·hm^(-2))和低密度(278株·hm^(-2))杨树人工林(16年)表层土壤,利用最适湿度干筛... 详细信息

【目的】比较2个密度杨树人工林的土壤团聚体和固碳差异,揭示其土壤固碳过程,为制定有效的可持续人工林经营措施提供理论基础。【方法】采集高密度(400株·hm^(-2))和低密度(278株·hm^(-2))杨树人工林(16年)表层土壤,利用最适湿度干筛法将土壤团聚体分为小(2 mm)粒级,测定各粒级中活性、慢性和惰性有机碳含量及其矿化速率。【结果】与低密度相比,高密度杨树人工林土壤的中、小团聚体组成占比显著提升,大团聚体组成占比降低,分别为1.06%、21.92%和77.02%。2个密度杨树人工林的各粒级土壤团聚体的有机碳组分均存在显著差异,其中高密度人工林土壤各粒级活性和慢性有机碳含量较高,而惰性有机碳含量在生物碳代谢策略是高密度林土壤有机碳积累的关键。林分密度对土壤团聚体粒级分布及活性和慢性有机碳含量有显著影响,而对土壤惰性有机碳含量影响不显著;其中高密度林的土壤密度降低导致了活性和慢性有机碳含量的积累。【结论】合理调节林分密度是影响人工林土壤团聚体形成和有机碳组分的重要营林措施。高密度杨树人工林土壤的密度降低和保守的土壤碳代谢能力将有利于土壤碳固存。

关键词：人工林营林措施土壤团聚体土壤碳汇

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南京大学仙林校区流浪猫种群数量和繁殖调查

兽类学报 2024年第3期44卷 333-343页

作者：孙桃柱吴琼张振伟李忠秋南京大学生命科学学院动物行为与保护实验室南京210023

流浪猫已对全球生物多样性带来严重威胁,然而,中国对流浪猫的基础生物学研究却很少。2018—2022年,以南京大学仙林校区(约195 hm2)为研究区域,开展了基于个体识别的校园流浪猫种群及繁殖等基础生物学研究。通过连续20 d的样点调查,构建... 详细信息

流浪猫已对全球生物多样性带来严重威胁,然而,中国对流浪猫的基础生物学研究却很少。2018—2022年,以南京大学仙林校区(约195 hm2)为研究区域,开展了基于个体识别的校园流浪猫种群及繁殖等基础生物学研究。通过连续20 d的样点调查,构建了流浪猫的种群数量累积曲线,发现即便在熟知流浪猫种群分布的基础上,一天调查中流浪猫的发现率仅为51.22%(44.51%~53.66%),而累积6 d的重复调查,发现率可达到84.15%(81.10%~86.59%)。2018—2022年南京大学仙林校区流浪猫数量快速增长,从2018年的51只增加至2022年的220只。2021年3月至2022年3月每月6次调查,期间共记录到273只流浪猫,其中成年猫149只,幼猫124只,雌雄性比约为1∶1。在此期间流浪猫的一年留存率约为58.71%,且绝育流浪猫的留存率显著高于未绝育的流浪猫。流浪猫全年均可繁殖,但产仔高峰集中在3—6月。65窝幼猫中,有84只存活超过6个月,若家猫的平均产仔数为3~4只,则南京大学仙林校区的流浪猫幼仔6月龄成活率约为36.92%(32.31%~43.08%)。上述结果说明,低强度的样点调查可能低估了流浪猫的种群数量。同时,在人类提供庇佑的环境中,流浪猫的生存不受食物、住所以及疾病的限制,其生存率和繁殖成功率较高,高存活率和高繁殖力将为流浪猫种群数量的控制带来困难。

关键词：流浪猫种群数量种群动态繁殖参数

华东地区亚热带典型常绿阔叶林地上生物量与环境因子的关系

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南京林业大学学报（自然科学版） 2024年第1期48卷 74-80页

作者：董玉洁毛岭峰张敏鲁旭东吴秀萍南京林业大学生态与环境学院江苏南京210037

【目的】以华东地区亚热带典型常绿阔叶林中的栲类(Castanopsis spp.)类林和木荷(Schima superba)林两种林分类型为研究对象,研究环境因子对林分乔木层地上生物量的影响。【方法】基于各植物种的异速生长方程计算群落的地上生物量,利用... 详细信息

【目的】以华东地区亚热带典型常绿阔叶林中的栲类(Castanopsis spp.)类林和木荷(Schima superba)林两种林分类型为研究对象,研究环境因子对林分乔木层地上生物量的影响。【方法】基于各植物种的异速生长方程计算群落的地上生物量,利用相关性检验(Pearson)分析不同类型常绿阔叶林地上生物量与环境因子的关系,通过偏最小二乘法结构方程模型(PLS-SEM)构建环境因素与地上生物量之间的作用机制。【结果】(1)华东地区亚热带典型常绿阔叶林地上生物量随林龄的增长表现出极显著的增加趋势。(2)栲类天然林和木荷天然林地上生物量在研究区范围内与土壤pH呈极显著正相关,气温与太阳辐射总强度因子对木荷天然林地上生物量的变化有显著影响。(3)环境因素与栲类天然林地上生物量构建的结构方程模型中,气候因素对其地上生物量的直接作用系数要显著高于土壤因素。【结论】太阳辐射总强度、土壤pH、土壤容重因子对华东地区亚热带典型常绿阔叶林地上生物量的变化有显著影响。其中,栲类天然林地上生物量与土壤pH呈极显著正相关。木荷天然林地上生物量与气温因子呈显著负相关,与太阳辐射总强度因子呈极显著负相关,与土壤pH因子呈极显著正相关。

关键词：亚热带常绿阔叶林地上生物量太阳辐射土壤pH 土壤容重

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中国亚热带杉木人工林不同林分发育阶段的群落构建机制

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南京林业大学学报（自然科学版） 2024年第1期48卷 67-73页

作者：鲁旭东董禹然李垚毛岭峰南京林业大学生态与环境学院江苏南京210037

【目的】杉木(Cunninghamia lanceolata)人工林作为中国亚热带地区最重要的生态系统形式与木材来源之一,其群落构建的过程对于解释人工林物种共存与生物多样性的维持至关重要。本研究旨在揭示中国亚热带杉木人工林群落的构建过程及其机... 详细信息

【目的】杉木(Cunninghamia lanceolata)人工林作为中国亚热带地区最重要的生态系统形式与木材来源之一,其群落构建的过程对于解释人工林物种共存与生物多样性的维持至关重要。本研究旨在揭示中国亚热带杉木人工林群落的构建过程及其机制,为杉木人工林在经营过程中提升局域生物多样性的稳定提供理论基础。【方法】通过文献检索和野外抽样调查,收集了中国亚热带地区林龄跨度较大(3~100 a)的143个杉木人工纯林的样方数据。根据群落系统发育结构随种植时间、胸径的变化趋势,探究环境过滤、竞争排斥和随机过程在林分发育过程中的变化。【结果】整体上,杉木人工林随着林龄的增加,植物群落的净种间亲缘关系指数(NRI)和净最近种间亲缘关系指数(NTI)均表现为先降低后平缓,系统发育结构由聚集转为随机后最终趋向于发散。这一过程NRI比NTI变化更显著:在幼龄林前期阶段,NRI和NTI均大于0、系统发育结构表现为聚集;随后在林分成熟前,NRI0,在群落整体水平上表现为发散,而在进化树末端上表现为聚集;在林分成熟后,NRI和NTI均小于0,系统发育结构表现为发散。系统发育结构随胸径的变化趋势与林龄基本一致。【结论】随着林分生长发育,亚热带杉木人工林群落构建主要动力由环境过滤,经过一段随机作用,最终由生物间相互作用主导。对于不同林龄阶段采取合理的营林措施有利于杉木人工林局域物种共存和植物多样性的维持。

关键词：杉木人工林林龄系统发育群落构建机制亚热带地区生物多样性

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