检索结果-南通市图书馆

饲喂青贮黄梁木代替青贮玉米川中黑山羊肝转录组的表达分析

同方期刊数据库博看期刊评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

畜牧兽医学报 2024年第1期55卷 232-244页

作者：张德安杨若渚刘杰刘德武邓铭柳广斌孙宝丽郭勇庆李耀坤华南农业大学动物科学学院广州510642 华南农业大学畜禽育种国家地方联合工程研究中心广州510642 华南农业大学广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室广州510642

旨在分析饲喂青贮黄梁木替代50%青贮玉米的川中黑山羊肝转录组测序中差异表达的mRNA、lncRNA及其靶基因,挖掘饲喂青贮黄梁木影响川中黑山羊肝代谢的关键基因,从而探究青贮黄粱木的饲喂效果。试验共选取6只雄性健康川中黑山羊[5月龄,平... 详细信息

旨在分析饲喂青贮黄梁木替代50%青贮玉米的川中黑山羊肝转录组测序中差异表达的mRNA、lncRNA及其靶基因,挖掘饲喂青贮黄梁木影响川中黑山羊肝代谢的关键基因,从而探究青贮黄粱木的饲喂效果。试验共选取6只雄性健康川中黑山羊[5月龄,平均体重(21.07±4.05)kg]并随机分为两组,试验组为青贮黄梁木替代50%青贮玉米组,对照组为青贮玉米组。试验期间采用全混合日粮(TMR)进行饲喂。于试验期的最后1 d对山羊进行屠宰并取其肝,提取肝组织的RNA,构建文库后使用高通量测序技术进行转录组测序,以P基因,采用RT-qPCR进行验证分析。结果表明,共发现差异表达的mRNA有1696个,其中943个上调,753个下调;差异表达lncRNA共有33个,其中22个上调,11个下调。结合差异表达lncRNA的靶基因与差异表达mRNA的交集基因的富集分析发现,NDUFA10、NDUFB11、NDUFS 5参与肝功能相关的信号通路,如多糖代谢过程、葡聚糖分解代谢过程、纤维素分解代谢等。结合lncRNA靶基因预测发现,GSTA3、GSTA 4基因参与肝功能相关的信号通路如药物代谢-细胞色素P450及细胞色素P450对异源物质的代谢等代谢通路。本研究发现,在饲喂青贮黄梁木川中黑山羊的肝组织中,NDUFA10、NDUFB11、NDUFS 5以及GSTA3、GSTA 4等可能从营养物质代谢和毒素代谢等方面影响肝功能。

关键词：青贮黄粱木川中黑山羊肝 lncRNA mRNA

12株桑源克雷伯菌属细菌耐药性、毒力基因及分子分型分析

同方期刊数据库博看期刊评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国抗生素杂志 2024年第7期49卷 823-831页

作者：张雪吟罗龙辉刘吉平华南农业大学动物科学学院广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室广州510642 华南农业大学食品学院广州510642 华南农业大学群体微生物中心广州510642

目的为了解不同来源的人类条件病原体的特征和耐药机制,预防环境病原体和医院病原体交叉感染,对桑树中分离的克雷伯菌进行耐药性、毒力基因、分子分型特点的探究。方法从广东和广西两地采集桑树和桑树根际土壤样本,其中共分离得到12株... 详细信息

目的为了解不同来源的人类条件病原体的特征和耐药机制,预防环境病原体和医院病原体交叉感染,对桑树中分离的克雷伯菌进行耐药性、毒力基因、分子分型特点的探究。方法从广东和广西两地采集桑树和桑树根际土壤样本,其中共分离得到12株克雷伯菌,对其采用纸片扩散法(K-B法)检测菌株耐药性表征;采用PCR技术对6类9个抗生素相关耐药基因和毒力基因进行检测;采用多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)技术进行遗传分析。结果12株桑源克雷伯菌检测到bla_(SHV)、tet(D)、tet(A)和aadA14种耐药基因,其中携带氨基糖苷类相关基因aadA1的有5株(41.67%);12株桑源克雷伯菌均对氨基糖苷类抗生素红霉素和链霉素表现出耐药,对6种以上抗生素耐药的菌株有6株(50%),对7种抗生素耐药的菌株有2株(16.67%);8株(66.67%)携带脂多糖相关的wabG毒力基因;MLST分析显示12株桑源克雷伯菌划分为3大类,包括产酸克雷伯菌复合体(Klebsiella oxytoca species complex,KoSC)、肺炎克雷伯菌复合体(*** species complex,KpSC)以及产气克雷伯菌(***);可分成7个序列型(sequence typing,ST),ST260为优势序列型,有5株(41.67%)。结论12株桑源克雷伯菌对氨基糖苷类抗生素耐药情况严峻,氨基糖苷类aadA1耐药基因检出率最高;ST260是主要的序列型,菌株之间存在遗传多样性,为环境中桑树来源的克雷伯菌病原体致病机制提供理论依据。

关键词：克雷伯菌属条件致病菌耐药性毒力基因 ST分型

同方期刊数据库

Pcgf2对鸡胚胎成纤维细胞重编程为诱导多能干细胞的促进

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

华南农业大学学报 2024年

作者：姚梓淇廖立钦宋佳蓓张新珩谢青梅华南农业大学动物科学学院/岭南现代农业科学与技术广东省实验室河源分中心/广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室

【目的】以提高诱导鸡多能干细胞干性为目的，利用Pcgf2基因与传统诱导多能干细胞的重编程因子共同诱导鸡多能干细胞。【方法】以鸡早期胚胎为模板对Oct4、Sox2、Nanog、Lin28、C-myc、Klf4这6种传统的重编程因子及Pcgf2进行基因扩增，... 详细信息

【目的】以提高诱导鸡多能干细胞干性为目的，利用Pcgf2基因与传统诱导多能干细胞的重编程因子共同诱导鸡多能干细胞。【方法】以鸡早期胚胎为模板对Oct4、Sox2、Nanog、Lin28、C-myc、Klf4这6种传统的重编程因子及Pcgf2进行基因扩增，并与慢病毒载体重组为慢病毒质粒，在包装慢病毒后且测定相对应的病毒滴度后，分组感染鸡胚胎成纤维细胞，在诱导的过程中对干细胞标记物进行检测。【结果】利用传统的重编程因子组合与加入Pcgf2共同诱导后的细胞都较早地表达出磷酸酶活性。加入Pcgf2诱导多能干细胞可以使细胞更早地出现类干细胞形态，且内源性基因Oct4、Sox2、Nanog以及Lin28的表达得到更为稳定的提高。【结论】Pcgf2在加入诱导体系后可以有效提高细胞的重编程接近干细胞状态。该试验结果可为诱导鸡完全重编程细胞的重编程因子的选择与机制研究提供理论参考。

关键词：慢病毒多能转录因子 CEF 体细胞重编程鸡iPSC

GHR基因多态性与鸡生长、屠体性状的相关性分析

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国畜牧杂志 2024年第7期60卷 95-100页

作者：张帅郑子健罗文华南农业大学动物科学学院广东广州510642 广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室广东广州510642

鸡的生长轴上,GH(生长激素)作为调节动物生长的重要激素,具有促进生长的功能。GH通过结合靶细胞表面的GHR(生长激素受体),形成GHR传导信号进入细胞产生生理功能。因此,GHR基因是GH调节细胞生理功能的关键基因。为了解GHR基因多态性与肉... 详细信息

鸡的生长轴上,GH(生长激素)作为调节动物生长的重要激素,具有促进生长的功能。GH通过结合靶细胞表面的GHR(生长激素受体),形成GHR传导信号进入细胞产生生理功能。因此,GHR基因是GH调节细胞生理功能的关键基因。为了解GHR基因多态性与肉鸡生长、屠体性状的关联,本试验以“杏花鸡×隐性白洛克鸡”F2代资源群作为试验材料,通过PCR扩增和直接测序方法对GHR基因外显子的多态性进行检测,在第10外显子区域中发现2个SNP位点:A1514T和G1595A。关联分析结果显示,A1514T与鸡的活重、胸重、腿重、翅膀重、屠体重、胸肌剪切力等多个与生长和肉质相关的性状显著关联,G1595A与鸡的活重、腿肉重、屠体重、腿肌肉色、腿肌剪切力、胸肌剪切力、腿肌pH值和腿肌电导率等多个性状显著相关。生物信息学分析表明,2个SNPs属于同义突变,其可能导致GHR mRNA二级结构改变,还将导致GHR mRNA翻译过程中选择使用频率更低的密码子,从而可能影响GHR mRNA的翻译效率,进而影响GHR蛋白含量。综上所述,鸡GHR基因第10外显子上的2个同义突变可影响肉鸡生长和屠体性状。

关键词：生长激素受体基因(GHR) SNP 生长性状同义突变鸡

维普期刊数据库博看期刊

同方期刊数据库

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

非洲猪瘟下猪新育种规划的研究

中国畜牧杂志 2024年第1期60卷 161-167页

作者：魏趁林清张哲李加琪华南农业大学动物科学学院广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室国家生猪种业工程技术研究中心广东广州510642

在非洲猪瘟疫情背景下,由于种猪交流中止等原因,延缓了核心群优质基因传递到商品群的速度,影响商品群生产效益。然而,猪新育种模式的育种方案还需要进一步研究。本研究调研了我国杜洛克猪、长白猪和大白猪的育种目标、群体结构和育种技... 详细信息

在非洲猪瘟疫情背景下,由于种猪交流中止等原因,延缓了核心群优质基因传递到商品群的速度,影响商品群生产效益。然而,猪新育种模式的育种方案还需要进一步研究。本研究调研了我国杜洛克猪、长白猪和大白猪的育种目标、群体结构和育种技术等参数,基于基因组数据利用MoBPS软件和随机模拟的方法模拟了传统繁育体系下传统模式和新模式的育种方案,并比较了各育种方案的育种效果。结果表明:短期(3世代)和长期(10世代)育种方案中,传统模式和封闭模式下扩繁群拥有独立的大白母猪策略中,扩繁群和商品猪窝产仔数、100 kg体重日龄、100 kg体重背膘厚、饲料转化率和断配间隔的遗传进展最大,经济效益也最大。因此,在受到非洲猪瘟的影响下,封闭模式下扩繁群拥有独立的大白母猪策略可以替代传统模式进一步提高商品群的经济效益。

关键词：猪新模式基因组育种方案遗传进展

基于全基因组重测序检测中国地方猪的体型选择信号

同方期刊数据库博看期刊评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国畜牧兽医 2024年第8期51卷 3438-3446页

作者：马烨刘玉强吴煜伟李广祯冯雪燕刁淑琪高亚辉国家生猪种业工程技术研究中心华南农业大学动物科学学院广东省农业动物基因组学及分子育种重点实验室广州510642

[目的]利用全基因组选择信号检测方法探索中国地方猪基因组中与体型相关的候选基因,分析中国地方猪在进化和驯化过程中的受选择情况。[方法]基于310头地方猪的全基因组重测序数据,利用跨群体扩展单倍型纯合(cross population extended h... 详细信息

[目的]利用全基因组选择信号检测方法探索中国地方猪基因组中与体型相关的候选基因,分析中国地方猪在进化和驯化过程中的受选择情况。[方法]基于310头地方猪的全基因组重测序数据,利用跨群体扩展单倍型纯合(cross population extended haplotype homozygosity,XP-EHH)和固定分化指数F ST统计量(fixation index)两种方法进行全基因组选择信号检测。取两种方法各前0.1%位点的交集作为候选位点,分别向上、下游延伸200 kb作为潜在受选择区域。通过富集分析进一步探索选择信号的生物学功能。[结果]使用XP-EHH和F ST两种方法共检测到633个潜在受选择位点,获得633个潜在区域,共注释到133个基因。数量性状基因座(quantitative trait locus,QTL)富集分析发现,不同体型中国地方猪之间的选择信号与肉质和胴体性状相关;染色质状态富集结果发现,不同体型中国地方猪群体之间的差异组织为内脏、消化系统和小脑。GO功能和KEGG通路富集分析发现16个基因在6个功能条目(P3)上显著富集,主要集中在生长代谢相关通路,其中ACSM 5、ACSM 4、FXR 1和FOXA 2作为候选基因主要富集于脂肪酸合成与代谢、肌肉生长发育等信号通路。[结论]本研究采用两种选择信号检测方法对不同体型的中国地方猪进行了分析,筛选到一系列候选位点和基因,重点挖掘了参与猪生长发育的候选基因,如ACSM 5、ACSM 4、FXR 1和FOXA 2。

关键词：中国地方猪选择信号全基因组重测序跨群体扩展单倍型纯合(XP-EHH) 固定分化指数(F ST)

同方期刊数据库

PGC介导的TMEM182基因敲除性腺嵌合体鸡的制备

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国家禽 2024年

作者：温华强陈家辉黄振文钟菁陈庚华聂庆华张细权张德祥陆阳清罗文广西大学动物科学技术学院华南农业大学动物科学学院广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室

为深入研究TMEM182基因在鸡体内的功能和表现，试验采用原始生殖细胞介导法，利用CRISPR/Cas9介导的HMEJ基因编辑技术，对体外培养的原始生殖细胞TMEM182基因进行敲除，以期产生TMEM182基因缺陷性腺嵌合体鸡。选择3个sgRNA靶向TMEM182... 详细信息

为深入研究TMEM182基因在鸡体内的功能和表现，试验采用原始生殖细胞介导法，利用CRISPR/Cas9介导的HMEJ基因编辑技术，对体外培养的原始生殖细胞TMEM182基因进行敲除，以期产生TMEM182基因缺陷性腺嵌合体鸡。选择3个sgRNA靶向TMEM182基因的第二外显子，利用T7E1进行基因打靶效率检测。对体外培养的PGCs进行外源基因mCherry定点插入，引起TMEM182基因插入突变，通过流式分选获得mCherry+PGCs。将mCherry+PGCs注射到发育至2.5 d的受体鸡胚，观察外源PGCs的性腺整合情况。结果显示：TMEM182-sgRNA1的打靶效率最高；通过将sgRNA1与模板质粒共转染PGCs，得到能稳定表达红色荧光的mCherry+PGCs；孵化第6天，在受体鸡胚性腺能明显观察到发出红色荧光的PGCs，最终孵化出10只小鸡。研究表明：利用CRISPR/Cas9技术对鸡PGCs进行基因编辑，制备性腺嵌合体鸡是一种高效、稳定的制备基因编辑鸡的方法。

关键词：鸡 CRISPR/Cas9 PGCs TMEM182基因基因编辑

高脂饲喂对肉鸡腹脂和肝脏组织RNA可变剪接的影响

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

广东农业科学 2024年第2期51卷 112-123页

作者：敖广宇陈庚华夏燚琳罗文华南农业大学动物科学学院/广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室/农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室广东广州510642

【目的】腹脂过度沉积会降低肉鸡抗病力和屠宰率。RNA可变剪接是影响基因功能的重要调控方式,对肉鸡腹脂沉积过程的RNA可变剪接事件进行系统分析,有助于进一步了解肉鸡腹脂沉积的分子调控机理。【方法】利用高脂饲喂肉鸡和普通饲喂肉鸡... 详细信息

【目的】腹脂过度沉积会降低肉鸡抗病力和屠宰率。RNA可变剪接是影响基因功能的重要调控方式,对肉鸡腹脂沉积过程的RNA可变剪接事件进行系统分析,有助于进一步了解肉鸡腹脂沉积的分子调控机理。【方法】利用高脂饲喂肉鸡和普通饲喂肉鸡肝脏组织和腹脂组织的转录组测序结果,鉴定高脂饲喂过程中肉鸡腹脂和肝脏组织的差异表达和差异剪接基因。采用GO功能注释、KEGG通路富集分析和Metascape富集分析对显著差异剪接基因进行分析,并对显著差异剪接事件进行可视化处理,以及分析调控这些差异剪接事件的剪接因子。【结果】对高脂饲喂肉鸡与普通饲喂肉鸡的腹脂和肝脏组织进行转录组测序,在腹脂组织中发现233个显著差异表达基因和349个显著差异剪接基因,对显著差异剪接基因进行富集分析,发现显著差异剪接基因主要富集于细胞分裂、细胞生长等细胞增殖相关生物学进程,还富集于甘油磷脂代谢和胰岛素信号通路等脂肪生成相关通路。在肝脏组织中发现276个显著差异表达基因和224个显著差异剪接基因,对显著差异剪接基因进行富集分析,发现显著差异剪接基因主要富集于蛋白质乙酰化、蛋白质内部氨基酸乙酰化和mRNA加工等细胞代谢相关生物进程,还富集于胰岛素信号通路、胰高血糖素信号通路、AMPK信号通路等脂肪生成相关通路。在腹脂和肝脏的显著差异剪接基因中,共筛选到影响肉鸡腹脂沉积性状的相关候选基因4个,包括GPAT4、RELCH、CYP39A1和PPARA。【结论】研究结果初步揭示高脂饲喂下肉鸡腹脂和肝脏组织的RNA可变剪接调控规律。推断高脂饲喂可能通过影响基因可变剪接过程,进而激活前脂肪细胞的增殖和脂肪生成相关细胞代谢,从而导致肉鸡的腹脂沉积现象;剪接因子对靶基因的调控显著参与影响肉鸡的腹脂沉积过程。

关键词：杏花鸡高脂饲料腹脂沉积转录组可变剪接差异表达基因

同方期刊数据库博看期刊

不同品种鸡腹脂游离脂肪酸差异比较及转录组分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国家禽 2024年

作者：赵国玺符蓉李秋梅邹佳佳雷芷琳张细权华南农业大学动物科学学院农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室

为挖掘鸡腹脂中游离脂肪酸的候选基因，试验以上市日龄的杏花鸡、沙栏鸡、清远麻鸡、胡须鸡、怀乡鸡、文昌鸡和固始鸡为研究对象，测定其游离脂肪酸的组成及含量，并选取游离脂肪酸差异较大的鸡进行转录组测序分析。结果显示：胡须鸡腹... 详细信息

为挖掘鸡腹脂中游离脂肪酸的候选基因，试验以上市日龄的杏花鸡、沙栏鸡、清远麻鸡、胡须鸡、怀乡鸡、文昌鸡和固始鸡为研究对象，测定其游离脂肪酸的组成及含量，并选取游离脂肪酸差异较大的鸡进行转录组测序分析。结果显示：胡须鸡腹脂中的C18∶1n9c、C16∶0和C18∶0显著高于其它6个品种鸡（P基因显著富集在α-亚麻酸代谢等通路中（P基因的下调与C18∶3n3/C20∶4n6的含量极显著负相关（P组与转录组联合分析，在腹脂中发现11个与风味有关的C20∶4n6和C18∶3n3的形成有关基因，为后续研究与风味有关的游离脂肪酸提供理论依据。

关键词：鸡腹脂游离脂肪酸风味候选基因