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不同品种鸡腹脂游离脂肪酸差异比较及转录组分析

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中国家禽 2024年

作者：赵国玺符蓉李秋梅邹佳佳雷芷琳张细权华南农业大学动物科学学院农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室

为挖掘鸡腹脂中游离脂肪酸的候选基因，试验以上市日龄的杏花鸡、沙栏鸡、清远麻鸡、胡须鸡、怀乡鸡、文昌鸡和固始鸡为研究对象，测定其游离脂肪酸的组成及含量，并选取游离脂肪酸差异较大的鸡进行转录组测序分析。结果显示：胡须鸡腹... 详细信息

为挖掘鸡腹脂中游离脂肪酸的候选基因，试验以上市日龄的杏花鸡、沙栏鸡、清远麻鸡、胡须鸡、怀乡鸡、文昌鸡和固始鸡为研究对象，测定其游离脂肪酸的组成及含量，并选取游离脂肪酸差异较大的鸡进行转录组测序分析。结果显示：胡须鸡腹脂中的C18∶1n9c、C16∶0和C18∶0显著高于其它6个品种鸡（P鸡腹脂中的C18∶2n6c显著高于其它6个品种鸡（P鸡腹脂中的C16∶1n7显著高于固始鸡、杏花鸡和清远麻鸡（P鸡腹脂中的C20∶4n6不仅显著高于固始鸡、怀乡鸡、文昌鸡、沙栏鸡（P鸡腹脂中的C20∶4n6与固始鸡差异最大，C18∶3n3与固始鸡差异倍数也较大（P基因显著富集在α-亚麻酸代谢等通路中（P基因的下调与C18∶3n3/C20∶4n6的含量极显著负相关（P鸡腹脂中主要的脂肪酸含量存在差异，通过对固始鸡与杏花鸡进行代谢组与转录组联合分析，在腹脂中发现11个与风味有关的C20∶4n6和C18∶3n3的形成有关基因，为后续研究与风味有关的游离脂肪酸提供理论依据。

关键词：鸡腹脂游离脂肪酸风味候选基因

ARG2基因在ALV-J感染DF-1细胞中的作用研究

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黑龙江畜牧兽医 2024年第7期 74-80页

作者：赵永霞赵昌滨梁锦萍李红梅华南农业大学动物科学学院广州510642 农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室广州510642 广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室广州510642

为了研究线粒体相关基因精氨酸酶2(arginase-2,ARG2)在J亚群禽白血病病毒(J subgroup leukosis virus,ALV-J)感染中的作用,试验采用qRT-PCR方法分别检测感染ALV-J后试验组鸡不同器官和DF-1细胞中ARG2基因的表达情况,分析ARG2基因和ALV-... 详细信息

为了研究线粒体相关基因精氨酸酶2(arginase-2,ARG2)在J亚群禽白血病病毒(J subgroup leukosis virus,ALV-J)感染中的作用,试验采用qRT-PCR方法分别检测感染ALV-J后试验组鸡不同器官和DF-1细胞中ARG2基因的表达情况,分析ARG2基因和ALV-J感染之间是否有联系;设计ARG2基因的过表达载体(过表达ARG2组)和干扰片段(干扰ARG2组)转染DF-1细胞,并以pcDNA3.1或Si-NC为对照,采用qRT-PCR方法检测ARG2基因的过表达和干扰效率;采用qRT-PCR、Western-blot和间接免疫荧光试验检测过表达或干扰ARG2基因后感染ALV-J的DF-1细胞中gp85基因及Env蛋白表达情况,从而综合分析ARG2基因对ALV-J复制的影响。结果表明:与对照组相比,试验组鸡的脾脏、法氏囊中ARG2基因相对表达量极显著降低(P基因相对表达量极显著升高(P基因在感染后第6,12小时时相对表达量降低(P>0.05或P组相比,过表达ARG2组ARG2基因相对表达量极显著升高(P组ARG2基因相对表达量降低(P>0.05或P基因后,与对照组相比,过表达ARG2组第12,24小时的gp85基因相对表达量显著或极显著升高(P基因后,与对照组相比,干扰ARG2组第6,12,48小时的gp85基因相对表达量显著或极显著降低(P基因可以促进ALV-J在DF-1细胞中的复制。

关键词：线粒体相关基因精氨酸酶2(ARG2) J亚群禽白血病病毒(ALV-J) 病毒复制 DF-1细胞

Pcgf2促进鸡胚成纤维细胞重编程形成诱导多能干细胞

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华南农业大学学报 2024年第3期45卷 311-320页

作者：姚梓淇廖立钦宋佳蓓张新珩谢青梅华南农业大学动物科学学院/岭南现代农业科学与技术广东省实验室河源分中心/广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室广东广州510642

【目的】以提高诱导鸡多能干细胞的干性为目的,利用Pcgf2基因与传统诱导多能干细胞的重编程因子共同诱导鸡多能干细胞。【方法】以鸡早期胚胎为模板,对Oct4、Sox2、Nanog、Lin28、C-myc、Klf4这6种传统的重编程因子及Pcgf2进行基因扩增... 详细信息

【目的】以提高诱导鸡多能干细胞的干性为目的,利用Pcgf2基因与传统诱导多能干细胞的重编程因子共同诱导鸡多能干细胞。【方法】以鸡早期胚胎为模板,对Oct4、Sox2、Nanog、Lin28、C-myc、Klf4这6种传统的重编程因子及Pcgf2进行基因扩增,并与慢病毒载体重组为慢病毒质粒,在包装慢病毒并测定相对应的病毒滴度后,分组感染鸡胚成纤维细胞,在诱导的过程中对干细胞标记物进行检测。【结果】利用传统的重编程因子组合与加入Pcgf2共同诱导后的细胞都较早地表达出磷酸酶活性。加入Pcgf2诱导多能干细胞可以使细胞更早地出现类干细胞形态,且内源性基因Oct4、Sox2、Nanog和Lin28的表达得到更稳定的提高。【结论】Pcgf2在加入诱导体系后可以有效提高细胞的重编程接近干细胞状态。该研究可为选择重编程因子诱导鸡细胞完全重编程及其机制研究提供理论参考。

关键词：鸡慢病毒多能转录因子鸡胚成纤维细胞体细胞重编程诱导多能干细胞

Pcgf2对鸡胚胎成纤维细胞重编程为诱导多能干细胞的促进

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华南农业大学学报 2024年

作者：姚梓淇廖立钦宋佳蓓张新珩谢青梅华南农业大学动物科学学院/岭南现代农业科学与技术广东省实验室河源分中心/广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室

【目的】以提高诱导鸡多能干细胞干性为目的，利用Pcgf2基因与传统诱导多能干细胞的重编程因子共同诱导鸡多能干细胞。【方法】以鸡早期胚胎为模板对Oct4、Sox2、Nanog、Lin28、C-myc、Klf4这6种传统的重编程因子及Pcgf2进行基因扩增，... 详细信息

【目的】以提高诱导鸡多能干细胞干性为目的，利用Pcgf2基因与传统诱导多能干细胞的重编程因子共同诱导鸡多能干细胞。【方法】以鸡早期胚胎为模板对Oct4、Sox2、Nanog、Lin28、C-myc、Klf4这6种传统的重编程因子及Pcgf2进行基因扩增，并与慢病毒载体重组为慢病毒质粒，在包装慢病毒后且测定相对应的病毒滴度后，分组感染鸡胚胎成纤维细胞，在诱导的过程中对干细胞标记物进行检测。【结果】利用传统的重编程因子组合与加入Pcgf2共同诱导后的细胞都较早地表达出磷酸酶活性。加入Pcgf2诱导多能干细胞可以使细胞更早地出现类干细胞形态，且内源性基因Oct4、Sox2、Nanog以及Lin28的表达得到更为稳定的提高。【结论】Pcgf2在加入诱导体系后可以有效提高细胞的重编程接近干细胞状态。该试验结果可为诱导鸡完全重编程细胞的重编程因子的选择与机制研究提供理论参考。

关键词：慢病毒多能转录因子 CEF 体细胞重编程鸡iPSC

GHR基因多态性与鸡生长、屠体性状的相关性分析

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中国畜牧杂志 2024年第7期60卷 95-100页

作者：张帅郑子健罗文华南农业大学动物科学学院广东广州510642 广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室广东广州510642

鸡的生长轴上,GH(生长激素)作为调节动物生长的重要激素,具有促进生长的功能。GH通过结合靶细胞表面的GHR(生长激素受体),形成GHR传导信号进入细胞产生生理功能。因此,GHR基因是GH调节细胞生理功能的关键基因。为了解GHR基因多态性与肉... 详细信息

鸡的生长轴上,GH(生长激素)作为调节动物生长的重要激素,具有促进生长的功能。GH通过结合靶细胞表面的GHR(生长激素受体),形成GHR传导信号进入细胞产生生理功能。因此,GHR基因是GH调节细胞生理功能的关键基因。为了解GHR基因多态性与肉鸡生长、屠体性状的关联,本试验以“杏花鸡×隐性白洛克鸡”F2代资源群作为试验材料,通过PCR扩增和直接测序方法对GHR基因外显子的多态性进行检测,在第10外显子区域中发现2个SNP位点:A1514T和G1595A。关联分析结果显示,A1514T与鸡的活重、胸重、腿重、翅膀重、屠体重、胸肌剪切力等多个与生长和肉质相关的性状显著关联,G1595A与鸡的活重、腿肉重、屠体重、腿肌肉色、腿肌剪切力、胸肌剪切力、腿肌pH值和腿肌电导率等多个性状显著相关。生物信息学分析表明,2个SNPs属于同义突变,其可能导致GHR mRNA二级结构改变,还将导致GHR mRNA翻译过程中选择使用频率更低的密码子,从而可能影响GHR mRNA的翻译效率,进而影响GHR蛋白含量。综上所述,鸡GHR基因第10外显子上的2个同义突变可影响肉鸡生长和屠体性状。

关键词：生长激素受体基因(GHR) SNP 生长性状同义突变鸡

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饲喂青贮黄梁木代替青贮玉米川中黑山羊肝转录组的表达分析

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畜牧兽医学报 2024年第1期55卷 232-244页

作者：张德安杨若渚刘杰刘德武邓铭柳广斌孙宝丽郭勇庆李耀坤华南农业大学动物科学学院广州510642 华南农业大学畜禽育种国家地方联合工程研究中心广州510642 华南农业大学广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室广州510642

旨在分析饲喂青贮黄梁木替代50%青贮玉米的川中黑山羊肝转录组测序中差异表达的mRNA、lncRNA及其靶基因,挖掘饲喂青贮黄梁木影响川中黑山羊肝代谢的关键基因,从而探究青贮黄粱木的饲喂效果。试验共选取6只雄性健康川中黑山羊[5月龄,平... 详细信息

旨在分析饲喂青贮黄梁木替代50%青贮玉米的川中黑山羊肝转录组测序中差异表达的mRNA、lncRNA及其靶基因,挖掘饲喂青贮黄梁木影响川中黑山羊肝代谢的关键基因,从而探究青贮黄粱木的饲喂效果。试验共选取6只雄性健康川中黑山羊[5月龄,平均体重(21.07±4.05)kg]并随机分为两组,试验组为青贮黄梁木替代50%青贮玉米组,对照组为青贮玉米组。试验期间采用全混合日粮(TMR)进行饲喂。于试验期的最后1 d对山羊进行屠宰并取其肝,提取肝组织的RNA,构建文库后使用高通量测序技术进行转录组测序,以P学功能富集分析并构建靶向关系网络。再从差异表达lncRNA和mRNA中各随机选择3个基因,采用RT-qPCR进行验证分析。结果表明,共发现差异表达的mRNA有1696个,其中943个上调,753个下调;差异表达lncRNA共有33个,其中22个上调,11个下调。结合差异表达lncRNA的靶基因与差异表达mRNA的交集基因的富集分析发现,NDUFA10、NDUFB11、NDUFS 5参与肝功能相关的信号通路,如多糖代谢过程、葡聚糖分解代谢过程、纤维素分解代谢等。结合lncRNA靶基因预测发现,GSTA3、GSTA 4基因参与肝功能相关的信号通路如药物代谢-细胞色素P450及细胞色素P450对异源物质的代谢等代谢通路。本研究发现,在饲喂青贮黄梁木川中黑山羊的肝组织中,NDUFA10、NDUFB11、NDUFS 5以及GSTA3、GSTA 4等可能从营养物质代谢和毒素代谢等方面影响肝功能。

关键词：青贮黄粱木川中黑山羊肝 lncRNA mRNA

PGC介导的TMEM182基因敲除性腺嵌合体鸡的制备

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中国家禽 2024年

作者：温华强陈家辉黄振文钟菁陈庚华聂庆华张细权张德祥陆阳清罗文广西大学动物科学技术学院华南农业大学动物科学学院广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室

为深入研究TMEM182基因在鸡体内的功能和表现，试验采用原始生殖细胞介导法，利用CRISPR/Cas9介导的HMEJ基因编辑技术，对体外培养的原始生殖细胞TMEM182基因进行敲除，以期产生TMEM182基因缺陷性腺嵌合体鸡。选择3个sgRNA靶向TMEM182... 详细信息

为深入研究TMEM182基因在鸡体内的功能和表现，试验采用原始生殖细胞介导法，利用CRISPR/Cas9介导的HMEJ基因编辑技术，对体外培养的原始生殖细胞TMEM182基因进行敲除，以期产生TMEM182基因缺陷性腺嵌合体鸡。选择3个sgRNA靶向TMEM182基因的第二外显子，利用T7E1进行基因打靶效率检测。对体外培养的PGCs进行外源基因mCherry定点插入，引起TMEM182基因插入突变，通过流式分选获得mCherry+PGCs。将mCherry+PGCs注射到发育至2.5 d的受体鸡胚，观察外源PGCs的性腺整合情况。结果显示：TMEM182-sgRNA1的打靶效率最高；通过将sgRNA1与模板质粒共转染PGCs，得到能稳定表达红色荧光的mCherry+PGCs；孵化第6天，在受体鸡胚性腺能明显观察到发出红色荧光的PGCs，最终孵化出10只小鸡。研究表明：利用CRISPR/Cas9技术对鸡PGCs进行基因编辑，制备性腺嵌合体鸡是一种高效、稳定的制备基因编辑鸡的方法。

关键词：鸡 CRISPR/Cas9 PGCs TMEM182基因基因编辑

12株桑源克雷伯菌属细菌耐药性、毒力基因及分子分型分析

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中国抗生素杂志 2024年第7期49卷 823-831页

作者：张雪吟罗龙辉刘吉平华南农业大学动物科学学院广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室广州510642 华南农业大学食品学院广州510642 华南农业大学群体微生物中心广州510642

目的为了解不同来源的人类条件病原体的特征和耐药机制,预防环境病原体和医院病原体交叉感染,对桑树中分离的克雷伯菌进行耐药性、毒力基因、分子分型特点的探究。方法从广东和广西两地采集桑树和桑树根际土壤样本,其中共分离得到12株... 详细信息

目的为了解不同来源的人类条件病原体的特征和耐药机制,预防环境病原体和医院病原体交叉感染,对桑树中分离的克雷伯菌进行耐药性、毒力基因、分子分型特点的探究。方法从广东和广西两地采集桑树和桑树根际土壤样本,其中共分离得到12株克雷伯菌,对其采用纸片扩散法(K-B法)检测菌株耐药性表征;采用PCR技术对6类9个抗生素相关耐药基因和毒力基因进行检测;采用多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)技术进行遗传分析。结果12株桑源克雷伯菌检测到bla_(SHV)、tet(D)、tet(A)和aadA14种耐药基因,其中携带氨基糖苷类相关基因aadA1的有5株(41.67%);12株桑源克雷伯菌均对氨基糖苷类抗生素红霉素和链霉素表现出耐药,对6种以上抗生素耐药的菌株有6株(50%),对7种抗生素耐药的菌株有2株(16.67%);8株(66.67%)携带脂多糖相关的wabG毒力基因;MLST分析显示12株桑源克雷伯菌划分为3大类,包括产酸克雷伯菌复合体(Klebsiella oxytoca species complex,KoSC)、肺炎克雷伯菌复合体(*** species complex,KpSC)以及产气克雷伯菌(***);可分成7个序列型(sequence typing,ST),ST260为优势序列型,有5株(41.67%)。结论12株桑源克雷伯菌对氨基糖苷类抗生素耐药情况严峻,氨基糖苷类aadA1耐药基因检出率最高;ST260是主要的序列型,菌株之间存在遗传多样性,为环境中桑树来源的克雷伯菌病原体致病机制提供理论依据。

关键词：克雷伯菌属条件致病菌耐药性毒力基因 ST分型

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香苏杂交猪ARHGAP24基因SNP检测及生长性状关联分析

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农业生物技术学报 2024年第4期32卷 833-842页

作者：蒋传美阮涌李吉凤肖美美许家利黄家锦许厚强贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室/动物科学学院

RhoGTP酶激活蛋白24(Rho GTPase activating protein 24, ARHGAP24)基因与肌动蛋白重塑、细胞极性控制和细胞迁移密切相关，本研究旨在探究ARHGAP24基因多态性与香苏杂交猪(Sus scrofa)生长性状的关系，以便为后期继续研究香苏杂交猪分... 详细信息

RhoGTP酶激活蛋白24(Rho GTPase activating protein 24, ARHGAP24)基因与肌动蛋白重塑、细胞极性控制和细胞迁移密切相关，本研究旨在探究ARHGAP24基因多态性与香苏杂交猪(Sus scrofa)生长性状的关系，以便为后期继续研究香苏杂交猪分子选育工作提供理论参考。本研究采集164头相同饲养条件下的香苏杂交猪血液DNA，通过PCR扩增、测序，确定ARHGAP24基因SNP位点。利用SPSS 25.0软件中的一般线性模型对ARHGAP24基因SNP位点与香苏杂交猪生长性状进行关联分析。结果显示，在香苏杂交猪9个外显子中共检测出5个SNP位点，分别位于外显子1和外显子8。g.735024 A>G非同义突变导致mRNA上第455位缬氨酸变为天冬氨酸，对mRNA结构影响不明显，但导致蛋白质二级结构中α-螺旋以及无规则卷曲所占百分比上升，β-转角和延伸链降低；g.735242 A>C位点非同义突变后导致第528位缬氨酸变为丝氨酸，从而导致mRNA结构产生明显变化，而对蛋白质的二级结构影响则不明显，只是使各结构所占比例发生了轻微的波动。关联结果分析显示，g.735313 C>T位点对胸围有极显著影响(P基因中g.735313 C>T位点与香苏杂交猪胸围和腹围均存在显著关联，呈中度多态且处于Hardy-Weinberg平衡状态，可作为后期香苏杂交猪遗传标记分子育种候选位点。

关键词：香苏杂交猪 RhoGTP酶激活蛋白24(ARHGAP24) 生长性状关联分析