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香港牡蛎cyclin B基因组织表达特征及其多克隆抗体制备

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南方农业学报 2024年第4期55卷 909-919页

作者：邱衡通许贵林李宛怡周齐家刘小宁朱俊霖北部湾环境演变与资源利用教育部重点实验室/南宁师范大学地理与海洋研究院广西南宁530100 广西科学院广西海洋科学院(广西红树林研究中心)/广西北部湾碳汇与低碳工程研究中心广西南宁530007

【目的】明确香港牡蛎(Crassostrea hongkongensis)B型细胞周期蛋白基因(cyclin B)组织表达特征,并通过原核表达融合蛋白制备多克隆抗体,为探究香港牡蛎cyclin B基因在环境胁迫下的表达特征及揭示cyclin B调控贝类细胞周期的作用机制提... 详细信息

【目的】明确香港牡蛎(Crassostrea hongkongensis)B型细胞周期蛋白基因(cyclin B)组织表达特征,并通过原核表达融合蛋白制备多克隆抗体,为探究香港牡蛎cyclin B基因在环境胁迫下的表达特征及揭示cyclin B调控贝类细胞周期的作用机制提供理论依据。【方法】克隆香港牡蛎cyclinB基因c DNA序列,通过SignalP-5.0、ProtParam、TMHMM2.0、NetSurfP2.0及Bioedit7.0等软件进行生物信息学分析,采用实时荧光定量PCR检测cyclinB基因在香港牡蛎不同组织中的表达情况;构建重组质粒pET32a-cyclin B并运用原核表达系统诱导表达融合蛋白,经Ni-NTA镍离子亲和层析柱纯化后免疫BALB/c小鼠制备鼠源多克隆抗体,然后以间接ELISA检测多克隆抗体效价、Western blotting检测多克隆抗体特异性。【结果】香港牡蛎cyclinB基因cDNA序列全长2353bp,包括1299bp的开放阅读框(ORF)、103 bp的5’非编码区(5’-UTR)和951 bp的3’非编码区(3’-UTR),共编码432个氨基酸残基。香港牡蛎cyclin B蛋白相对分子量为49.13 kD,理论等电点为7.16,不含信号肽和跨膜结构域。香港牡蛎cyclin B氨基酸序列包含2个保守的周期蛋白框,与来自同属的长牡蛎cyclin B氨基酸序列相似性最高(98.8%),基于cyclin B氨基酸序列相似性构建的系统发育进化树也显示香港牡蛎与长牡蛎的亲缘关系最近。cyclin B基因在香港牡蛎的闭壳肌、外套膜、性腺、鳃、唇瓣、消化腺等组织中均有表达,以性腺中的相对表达量最高,显著高于其他组织中的相对表达量(P技术支持。

关键词：香港牡蛎 cyclin B基因表达特征多克隆抗体减数分裂

益生菌及其代谢产物在水产养殖中的应用及展望

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广东海洋大学学报 2024年第3期44卷 150-158页

作者：李鹏飞廖文钰黄琳余庆刘明珠黄静牟容丽陈嘉黄德华韦冬冬王尧广西职业师范学院广西南宁530007 广西科学院广西海洋科学院广西水产生物技术与现代生态养殖重点实验室广西渔业重大疫病防控与高效健康养殖产业技术工程研究中心广西南宁530007 北部湾大学海洋学院广西钦州535011 广西海洋科学院北部湾海洋产业研究院中国-东盟现代渔业产业技术转移示范中心广西南宁530007

在水产养殖疾病防控时,抗生素的过度使用会导致病原菌抗药性增强和环境恶化。益生菌作为潜在的抗生素替代品备受关注。综述益生菌在水产养殖中的应用,阐述其在改善水产动物生长性能指标,增强水产动物免疫力与抗氧化能力,防控水产动物细... 详细信息

在水产养殖疾病防控时,抗生素的过度使用会导致病原菌抗药性增强和环境恶化。益生菌作为潜在的抗生素替代品备受关注。综述益生菌在水产养殖中的应用,阐述其在改善水产动物生长性能指标,增强水产动物免疫力与抗氧化能力,防控水产动物细菌性疾病、病毒性疾病,抑制水产动物寄生虫与真菌感染方面的应用效果,研究表明,其可提高饲料营养价值和转化率、调节宿主肠道微生物群落、增强宿主对疾病的抵抗力、改善养殖环境。指出当前益生菌在水产养殖应用中存在深度研究不足、益生菌产品菌体抗逆性不强、缺乏科学配比、生产工艺不足、缺乏统一标准的问题,并提出相关建议。

关键词：益生菌水产养殖疾病防控应用研究

肉桂醇提物对大口黑鲈虹彩病毒的体外抗病毒作用

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广东海洋大学学报 2024年第3期44卷 17-24页

作者：廖文钰竺利波刘明珠余庆玉洁莹陈嘉韦云依黄吉利黄琳李鹏飞广西科学院广西海洋科学院/广西水产生物技术与现代生态养殖重点实验室/广西渔业重大疫病防控与高效健康养殖产业技术工程研究中心广西南宁530007 北部湾大学海洋学院广西钦州535011 南宁学院食品与质量工程学院广西南宁530200 北部湾海洋产业研究院/中国-东盟现代渔业产业技术转移示范中心广西南宁530007

【目的】探究肉桂醇提物在大口黑鲈(Micropterus salmoides)虹彩病毒(LMBV)感染中的抗病毒效果及作用机制,为开发抗LMBV药物提供参考。【方法】采用CCK-8试剂盒检测、结晶紫染色观察、实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测、病毒滴度[半数组织... 详细信息

【目的】探究肉桂醇提物在大口黑鲈(Micropterus salmoides)虹彩病毒(LMBV)感染中的抗病毒效果及作用机制,为开发抗LMBV药物提供参考。【方法】采用CCK-8试剂盒检测、结晶紫染色观察、实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测、病毒滴度[半数组织培养感染剂量(TCID50)]测定等方法确定肉桂醇提物在胖头鱥肌肉细胞系(FHM)上的安全工作浓度,评估肉桂醇提物在细胞水平对LMBV的抗病毒效果,分析其抗LMBV机制。【结果】肉桂醇提物在≤12.5μg/mL的质量浓度范围内对FHM细胞无明显毒性。FHM细胞与LMBV以及质量浓度分别为12.5、6.25、3.125μg/mL肉桂醇提物共孵育后,细胞病变明显减少,结晶紫染色后可见活细胞数明显升高,MCP、ICP46基因的表达量显著降低(P<0.01),且抗病毒效果有剂量依赖性。12.5μg/mL肉桂醇提物与LMBV共孵育后接入FHM细胞,细胞中MCP、ICP46基因的相对表达量以及TCID_(50)极显著下降(P<0.01);FHM细胞与经肉桂醇提物处理的LMBV共孵育后,细胞中LMBV MCP和ICP46基因的相对表达量显著低于未用肉桂醇提物处理的LMBV感染组(P<0.01);在LMBV感染FHM细胞后,接入肉桂醇提物的FHM细胞中MCP和ICP46基因的相对表达量显著下降(P<0.05);在LMBV感染FHM细胞3 h后用肉桂醇提物处理8 h的FHM细胞中MCP和ICP46基因的相对表达量显著下调(P<0.05)。【结论】肉桂醇提物可降低LMBV的感染力,干扰LMBV侵染宿主细胞过程中的吸附、侵入及复制,有良好的抗LMBV作用,可作为环保、高效的抗LMBV渔用药物候选者。

关键词：大口黑鲈虹彩病毒肉桂抗病毒作用渔用药物

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涠洲岛海水中可培养细菌的溶藻活性初探

中国抗生素杂志 2024年第2期49卷 157-167页

作者：黄华林覃仙玲农志文赖俊翔苏芯莹赖海清黄丹蕾李菲广西科学院广西近海海洋环境科学重点实验室南宁530007 北部湾海洋产业研究院防城港538000 南宁学院机电与质量技术工程学院南宁530200 广西民族大学海洋与生物技术学院南宁530006

目的选取3种海洋赤潮甲藻为研究对象,从广西涠洲岛海域来源细菌中筛选出高效溶藻的菌株,研究菌株的溶藻效果和初步作用机制,为开展赤潮的防治工作奠定基础。方法采用细菌发酵液与甲藻共培养来测定菌株的溶藻活性,检测藻细胞中丙二醛... 详细信息

目的选取3种海洋赤潮甲藻为研究对象,从广西涠洲岛海域来源细菌中筛选出高效溶藻的菌株,研究菌株的溶藻效果和初步作用机制,为开展赤潮的防治工作奠定基础。方法采用细菌发酵液与甲藻共培养来测定菌株的溶藻活性,检测藻细胞中丙二醛和抗氧化相关酶系统的响应规律,分析甲藻胞外溶解性有机物组成,并通过KEGG和CAZy数据库预测目标菌株合成溶藻物质的能力。结果从24株细菌中筛选到15株对至少一种甲藻表现出溶藻活性的菌株,总阳性率为62.5%,菌株M026对3种甲藻均表现出显著的溶藻效果。添加10%的M026发酵无菌滤液,共培养3 d后,3种甲藻细胞死亡率均高达95.0%。生理生化响应表明,在M026发酵无菌滤液胁迫下,甲藻细胞膜脂过氧化损伤严重,3种抗氧化相关酶(SOD、CAT和APX)活性先增加后下降,且三维荧光光谱检测到藻细胞内溶产物为类富里酸和类蛋白类物质。通过全基因组分析,菌株M026含有溶藻活性的次级代谢产物生物合成基因,及多种降解植物细胞壁的酶。结论菌株M026可作为微生物溶藻菌剂的候选菌株。

关键词：涠洲岛可培养细菌甲藻溶藻活性

桂西北岩溶地质高背景和矿业活动叠加区土壤剖面镉分布特征及生物有效性

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地球科学与环境学报 2024年第1期46卷 81-95页

作者：王艺惠文鑫钟聪朱槟栾苏丹妮王成南宁师范大学北部湾环境演变与资源利用教育部重点实验室/广西地表过程与智能模拟重点实验室广西南宁530001 南宁师范大学地理与海洋研究院广西南宁530001 南京信息工程大学环境科学与工程学院江苏南京210044 南京信息工程大学江苏省大气环境监测与污染控制高技术研究重点实验室江苏南京210044

桂西北岩溶地质高背景与矿业活动叠加,导致土壤污染风险增大,对粮食和生态安全构成了潜在威胁。以广西河池地区典型岩溶地质高背景与矿业活动叠加区作为研究区域,采集了3条水稻田土壤剖面(0~100 cm)样品,分析镉(Cd)的空间分布特征和生... 详细信息

桂西北岩溶地质高背景与矿业活动叠加,导致土壤污染风险增大,对粮食和生态安全构成了潜在威胁。以广西河池地区典型岩溶地质高背景与矿业活动叠加区作为研究区域,采集了3条水稻田土壤剖面(0~100 cm)样品,分析镉(Cd)的空间分布特征和生物有效性,结合富集因子法、风险评价指数等对土壤剖面Cd污染状况与生态风险进行了评估。结果表明:3条剖面土壤Cd在表层(0~20 cm)均显著富集,表明在土壤表层有明显人为来源的重金属Cd积累。根据国家标准《土壤环境质量:农用地土壤污染风险管控标准(试行)》(GB 15618—2018),距离矿区较远的两条剖面土壤Cd含量有个别样品超过农用地土壤污染风险筛选值,而靠近矿区的剖面则有90%的土壤样品超过农用地土壤风险管控值。研究区土壤剖面Cd含量主要受控于地质背景、农业耕作和矿业活动等多因素相互叠加,不同剖面含量差异主要取决于距离矿区的远近,同一剖面则与土壤pH值和有机质含量有关。土壤剖面Cd主要以铁锰结合态、离子交换态和残渣态存在,其生物有效性主要受控于土壤Cd总含量、pH值、有机质含量以及铁锰氧化物的固定作用,表现出远离矿区的土壤剖面以及土壤表层的生物有效性相对较高的特点。

关键词：重金属镉土壤剖面富集特征形态分布生物有效性岩溶地区广西

基于SWAN模型的西沙群岛永乐环礁波浪数值模拟与时空分析

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地理科学进展 2024年第9期43卷 1811-1825页

作者：邱妮珊姚作芳左秀玲罗盛广西大学资源与环境学院广西大学海洋学院广西大学广西南海珊瑚礁研究重点实验室

精细波浪数据是研究岛礁珊瑚分布和地形地貌结构的基础。目前，珊瑚礁体内部及更小尺度上开展的长时间序列精细化波浪模拟研究还很缺乏，不足以获取岛礁区域精细化的波浪特征。论文以中国南海西沙群岛的永乐环礁为研究区，基于SWAN模型... 详细信息

精细波浪数据是研究岛礁珊瑚分布和地形地貌结构的基础。目前，珊瑚礁体内部及更小尺度上开展的长时间序列精细化波浪模拟研究还很缺乏，不足以获取岛礁区域精细化的波浪特征。论文以中国南海西沙群岛的永乐环礁为研究区，基于SWAN模型自嵌套波浪模拟和16 m分辨率地形数据，开展2017—2021年永乐环礁高分辨率精细化岛礁波浪模拟，并基于地貌、方位和岛礁分析了研究区有效波高、浪向、波浪能流密度等的精细空间分布特征。研究结果表明：模型模拟波浪与实测波浪Pearson相关系数为0.95，显著性水平P北部和西部最低的规律；自外海传播进潟湖的波浪，各方位上礁坡到礁坪的能流密度衰减高于30%，岛礁南部衰减最多达72.7%。研究可为珊瑚分布规律探讨、珊瑚礁保护与恢复和海岸工程建设等提供方法和理论支撑。

关键词：南海 SWAN模型波浪特征珊瑚礁地貌

北部湾及其邻近海域棕斑兔头鲀7个地理群体形态差异

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海洋渔业 2024年第4期46卷 401-411页

作者：徐浩黄亮亮王才广吴志强承亚男苏琼源杨伊恒张秀国胥鹏桂林理工大学环境科学与工程学院广西桂林541004 桂林理工大学广西环境污染控制理论与技术重点实验室广西桂林541006 桂林理工大学广西岩溶地区水污染控制与用水安全保障协同创新中心广西桂林541006 广西精工海洋科技有限公司广西北海536000 广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室广西钦州535011

为解决棕斑兔头鲀(Lagocephalus spadiceus)群体分布广泛、种群结构不明等问题,分别采集北部湾沿岸海域(北海市、湛江市、雷州市、儋州市、东方市)和邻近海域(茂名市、漳州市)共7个不同地理群体的棕斑兔头鲀278尾,基于14项可量性状和16... 详细信息

为解决棕斑兔头鲀(Lagocephalus spadiceus)群体分布广泛、种群结构不明等问题,分别采集北部湾沿岸海域(北海市、湛江市、雷州市、儋州市、东方市)和邻近海域(茂名市、漳州市)共7个不同地理群体的棕斑兔头鲀278尾,基于14项可量性状和16项框架结构数据,运用多变量形态度量学方法对7个棕斑兔头鲀群体进行形态差异研究。单因素方差分析显示,仅尾柄高/体长(CPH/BL)和臀鳍基部末端至臀鳍基部起点/体长(G-H/BL)两个框架结构数据在各群体间无显著性差异(P>0.05);主成分散点图显示,茂名和漳州群体与北部湾海域群体差异较大,第1主成分反映头部的差异,第2主成分反映尾部的差异;聚类分析显示,北部湾海域5个群体聚为一组,邻近海域的茂名和漳州群体聚为另一组。判别分析构建了7个群体的判别函数,综合判别率为82.79%,其中漳州群体判别准确率最高(100.00%),儋州群体最低(68.42%)。不同群体间头部和尾部的差异可能是由于摄食和栖息地利用的差异造成的。研究结果可为棕斑兔头鲀资源养护和管理提供科学依据。

关键词：棕斑兔头鲀形态差异多变量形态度量学北部湾

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小样本条件下的典型海洋承灾体识别算法研究

应用海洋学学报 2024年

作者：文莉莉张炜邬满赵绪成广西科学院广西近海海洋环境科学重点实验室广西壮族自治区北部湾碳汇与低碳工程研究中心广西电网有限责任公司电力科学研究院广西电力装备智能控制与运维重点实验室广西大学电气工程学院广西科技项目评估中心有限公司评估二部

海洋承灾体的单体识别和精细化管理，对海洋灾害的精准预警和评估具有重要意义。由于海洋承灾体获取大量样本数据困难且成本高，难以满足传统深度学习模型的训练要求，因此本研究针对房屋、码头吊机、养殖网箱、养殖蚝排、危化品储存罐... 详细信息

海洋承灾体的单体识别和精细化管理，对海洋灾害的精准预警和评估具有重要意义。由于海洋承灾体获取大量样本数据困难且成本高，难以满足传统深度学习模型的训练要求，因此本研究针对房屋、码头吊机、养殖网箱、养殖蚝排、危化品储存罐5种典型海洋承灾体，提出一种小样本条件下基于注意力机制和孪生残差网络的海洋承灾体识别方法。为增强小样本条件下模型的关键特征提取能力和泛化能力，本研究从两个方面进行了改进：(1)引入注意力机制SKNet对残差网络进行改进，设计了具有多尺度自适应能力的SKNet-ResNet101网络，提高了模型的关键特征提取能力；(2)利用孪生网络度量学习的原理，以SKNet-ResNet101网络为主干网络，构建基于注意力机制的双路孪生残差网络，以减少网络训练对大量样本的依赖，同时增强网络在小样本条件下的泛化能力。经过与FSOD、Meta R-CNN等算法在海洋承灾体、VOC、COCO数据集上的对比测试，改进后的双路孪生残差网络在识别准确率上均有所提高，其中，在海洋承灾体数据集上提高了0.89%，在VOC数据集上平均提高了0.97%，在COCO数据集上平均提高了0.33%。该模型增强了小样本条件下网络针对复杂场景图像特征的提取能力，为构建精细化的海洋承灾体脆弱性评价和灾变预警模型提供了技术基础。

关键词：海洋环境科学小样本学习 SKNet ResNet-101 孪生神经网络海洋承灾体

波流作用下砂泥复合型海滩砂泥转换带迁移研究

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海洋工程 2024年第4期42卷 119-129页

作者：祝潇梁慧迪陈维时连强浙江海洋大学海洋工程装备学院浙江舟山316022 自然资源部第二海洋研究所浙江杭州310012 自然资源部海洋空间资源管理技术重点实验室浙江杭州310012

为研究波流耦合作用下复合型海滩砂泥转换带(SMT)的迁移规律,建立了洞头区人工沙滩的多组分泥沙动力地貌概化模型,并采用工程后人工沙滩实测剖面冲淤数据进行了模型验证。通过对比不同水动力条件下沙滩地形变化及沉积物演变,分析了SMT... 详细信息

为研究波流耦合作用下复合型海滩砂泥转换带(SMT)的迁移规律,建立了洞头区人工沙滩的多组分泥沙动力地貌概化模型,并采用工程后人工沙滩实测剖面冲淤数据进行了模型验证。通过对比不同水动力条件下沙滩地形变化及沉积物演变,分析了SMT迁移对各水动力条件的响应。模拟结果表明:人工沙滩在拦沙堤和岬角的掩护下滩面普遍呈淤积态势,湾内岸线稳定。然而由于拦沙堤波影区波浪动力削减,造成沙滩滩面泥化,SMT逐渐向岸移动,砂质滩面面积缩小约40%。SMT与潮汐、波浪关系密切,在潮波比值小于25时,SMT相对高程取决于潮汐和波浪的共同作用,与潮差呈正比、与波高呈反比。而在潮波比值大于25时,波浪作用几乎可以忽略,SMT高程取决于平均高潮位。此外,当波浪垂直于岸线时,沙滩泥化程度最低,SMT均匀分布在沙滩-潮滩交界面附近,随着水体含沙量(体积分数)的增加,波浪暴露区域SMT逐渐向岸迁移。

关键词：沙滩泥化砂泥转换带波流作用砂泥复合型海滩人工沙滩