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基于干性指数模型对肉瘤预后、免疫浸润和铁死亡调控的分析

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中国组织工程研究 2025年第19期29卷 4151-4160页

作者：魏婧娴孟莲孙皓张田田刘春霞石河子大学医学院病理学系/石河子大学第一附属医院病理科新疆维吾尔自治区石河子市832000 广州医科大学附属第二医院病理科广东省广州市510260

背景:干性指数可能与肉瘤预后、免疫浸润有关,但具体调控机制与特征基因尚不清楚。目的:利用基因干性指数模型探究肉瘤干细胞与患者预后和免疫浸润的关系,并识别肉瘤干细胞铁死亡特征基因。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)中获取肉瘤RNA测... 详细信息

背景:干性指数可能与肉瘤预后、免疫浸润有关,但具体调控机制与特征基因尚不清楚。目的:利用基因干性指数模型探究肉瘤干细胞与患者预后和免疫浸润的关系,并识别肉瘤干细胞铁死亡特征基因。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)中获取肉瘤RNA测序数据及相关临床信息。利用肉瘤干性指数,对获取的肉瘤RNA测序数据进行分组。利用生存数据进行组间预后情况分析,获取组间差异表达基因后进行通路富集和免疫浸润分析。获得铁死亡相关差异基因,构建蛋白互作网络并进行预后相关性分析。培养横纹肌肉瘤细胞系,分为贴壁细胞组和干细胞组,贴壁细胞组不予任何干预,干细胞组通过无血清培养处理以诱导横纹肌肉瘤干细胞富集,qRT-PCR验证干细胞相关标志物、铁死亡相关差异基因以及铁死亡相关标志物的mRNA表达。结果与结论:①以干性指数中位数为界将患者分成高干性指数组和低干性指数组,通过患病风险预测显示高干性指数组患者的无进展生存期低于低干性指数组,提示预后不佳;②GO、KEGG分析显示肉瘤高、低干性指数组差异表达基因参与不同的细胞通路;高干性指数组和低干性指数组之间免疫浸润存在差异;差异基因中有23个铁死亡相关基因,其中9个可构成相关性较强的蛋白互作网络,其中IDO1、IFNG、AQP5高表达的肉瘤患者预后更好,CA9高表达的肉瘤患者预后不佳;③qRT-PCR结果显示,与贴壁细胞组相比,干细胞组干细胞相关标志物NANOG、SOX2和OCT4 mRNA表达显著升高(P<0.05);与贴壁细胞组相比,干细胞组铁死亡相关标志物SLC7A11的mRNA表达显著降低(P<0.05),ACSL4、GPX4、FTH1和COX2的mRNA表达显著升高(P<0.05);与贴壁细胞组相比,干细胞组差异基因CA9的mRNA表达显著降低,IDO1、IFNG、AQP5的mRNA表达显著升高(P<0.05)。经上述生物信息学分析与实验验证,干细胞与肉瘤生存、铁死亡过程密切相关,CA9、IDO1、IFNG、AQP5在肉瘤干细胞中异常表达,可能成为肉瘤诊断标志物和治疗新靶点。

关键词：肉瘤干细胞干性指数铁死亡生存预后免疫浸润

新型超声快速处理活检标本保存不同年限对DNA质量的影响

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中国组织工程研究 2025年第13期29卷 2655-2660页

作者：石晨曦朱卫东李三恩李秀明师逢丁亚云苏州大学附属第一医院病理科江苏省苏州市215000 苏州市立医院本部皮肤科江苏省苏州市215000

背景:新型超声组织处理技术越来越多地被用来进行分子生物学分析,研究新型超声处理不同存储年限组织DNA的质量,对进一步分子检测的标本质控具有重要意义。目的:探讨新型超声处理活检标本存储不同年限对DNA质量的影响,以期为分子检测探... 详细信息

背景:新型超声组织处理技术越来越多地被用来进行分子生物学分析,研究新型超声处理不同存储年限组织DNA的质量,对进一步分子检测的标本质控具有重要意义。目的:探讨新型超声处理活检标本存储不同年限对DNA质量的影响,以期为分子检测探索最佳的标本存储时间。方法:收集40例乳腺穿刺小活检组织,采用超声技术制作石蜡标本,按照存储年限分为4组:3-5年组及>5年组,每组10例,对石蜡标本进行切片,每张切片厚3μm,切片10-15张,提取DNA后通过Nanophotometer N60超微量分光光度计和Qubit 4.0荧光计检测DNA的质量浓度,记录A_(260)/A_(280)比值判定DNA的纯度,利用全自动毛细管电泳核酸分析仪(Qsep 100)检测DNA片段完整性,以评估DNA片段的质量。结果与结论:4组样本A_(260)/A_(280)均值在1.8-2.0之间,达到纯度要求,无明显差异。4组样本的DNA质量浓度(Qubit浓度)均值分别为30.39,14.33,2.52,1.95 ng/μL;DNA的平均N/Q比值分别为6.48,14.18,24.56,29.86;DNA质量数均值分别为5.64,1.76,1.24,0.80;大片段占比均值分别为56.08%,17.72%,12.68%,7.90%。PCR检测内控基因Ct均值分别为15.32,17.09,18.39,21.24。与<1年组相比,其余3组DNA浓度显著降低,N/Q比值显著增加,DNA质量数和大片段占比均值显著降低,Ct值升高,差异有显著性意义(P<0.05)。实验结果表明,对于新型超声处理活检标本,应优先选择存储<1年的样本进行日常分子检测,储存3年内的样本可满足二代测序等检测要求,5年内样本仅可尝试进行PCR等检测,存储超过5年的样本不建议进行后续分子检测。

关键词：超声处理存储年限 DNA质量片段完整性降解程度二代测序

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巨噬细胞极化在组织修复过程中的可视化分析

中国组织工程研究 2025年第7期29卷 1486-1496页

作者：常金霞刘羽飞牛少辉王唱曹建春北京中医药大学北京市100029 中国中医科学院西苑医院北京市100091 北京中医药大学东方医院北京市100078

背景:巨噬细胞在组织修复和再生过程的各个阶段展现出促炎、抗炎、促纤维化、促伤口愈合等多重活性,巨噬细胞的异质性及其平衡极化对器官修复具有决定性作用。目的:通过可视化分析方法探究巨噬细胞极化在组织修复领域的研究热点和发展趋... 详细信息

背景:巨噬细胞在组织修复和再生过程的各个阶段展现出促炎、抗炎、促纤维化、促伤口愈合等多重活性,巨噬细胞的异质性及其平衡极化对器官修复具有决定性作用。目的:通过可视化分析方法探究巨噬细胞极化在组织修复领域的研究热点和发展趋势,以及该领域全球科研与临床工作者的研究水平。方法:利用文献计量分析方法,采用Citespace文献可视化分析软件和VOSviewer工具,在Web of Science Core Collection的科学引文索引扩展(SCI-Expanded)和社会科学引文索引扩展(SSCI-Expanded)数据库中检索2013-2023年间的相关文献,通过动态图谱形式呈现分析结果,揭示研究的主要趋势和焦点。结果与结论:在2013-2023年,有关巨噬细胞极化在组织修复领域的发文量迅速增加,尤其从2017年增加显著;中国研究者的发文量居于第一位(642篇),美国研究者较早关注到该领域;Elisseeff Hennifer H教授对该领域研究有非常高的贡献;上海交通大学是发文量最多的机构;近年来“透明质酸”“调控”等关键词出现频率较高。巨噬细胞极化在组织修复领域的研究主要集中在其多功能性的调节机制、与其他细胞类型的相互作用以及在特定病理条件下的表现,研究热点涵盖了巨噬细胞在创面、心血管疾病、慢性炎症、肿瘤微环境及再生医学中的作用。通过深入理解巨噬细胞的多功能性和极化机制可以开发新的治疗策略,促进组织修复和再生,提高患者治疗效果。

关键词：文献计量学巨噬细胞极化组织修复 VOSviewer Citespace

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EGR1在前列腺癌组织中的表达及临床意义

现代肿瘤医学 2025年第1期 85-89页

作者：燕德伦沈靖巩幼洁马志厚朱娅男余娜华浩铭黄岩王红群蚌埠医科大学附属蚌埠市第三人民医院外科蚌埠医科大学附属蚌埠市第三人民医院病理科蚌埠市第二人民医院病理科蚌埠市中医院病理科

目的:探讨早期生长应答因子1(early growth response gene 1,EGR1)在前列腺癌组织中的表达及意义。方法:使用免疫组化方法检测EGR1在前列腺癌组织中的表达情况，显微镜下观察，并统计分析。结果:EGR1在前列腺癌中的阳性率30.7%(23/75),... 详细信息

目的:探讨早期生长应答因子1(early growth response gene 1,EGR1)在前列腺癌组织中的表达及意义。方法:使用免疫组化方法检测EGR1在前列腺癌组织中的表达情况，显微镜下观察，并统计分析。结果:EGR1在前列腺癌中的阳性率30.7%(23/75),其表达与AR呈负相关，也观察到在部分凋亡细胞中表达。EGR1在正常组织的表达低于前列腺癌组织(P<0.05),部分腺泡/导管的基底细胞阳性，在部分间质纤维细胞中阳性。结论:EGR1可能与前列腺癌的发生发展及凋亡相关。EGR1可能与基底细胞发育及纤维细胞的生长有关。

关键词：前列腺癌 EGR1 AR 基底细胞分化

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基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的机器学习算法预测早期肺腺癌病理类型

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中国胸心血管外科临床杂志 2025年第01期 67-72页

作者：黄润棋强光亮刘益飞史加海南通大学附属医院临床研究中心南通大学医学院北京大学第三医院胸外科南通大学附属医院病理科南通大学附属医院胸心外科

目的探讨基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的机器学习算法预测早期肺腺癌病理类型的准确性。方法回顾性分析2021年1月—2023年1月在南通大学附属医院接受肺部肿瘤切除手术患者的石蜡包埋（formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE）标本... 详细信息

目的探讨基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的机器学习算法预测早期肺腺癌病理类型的准确性。方法回顾性分析2021年1月—2023年1月在南通大学附属医院接受肺部肿瘤切除手术患者的石蜡包埋（formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE）标本。根据肿瘤的病理学分类，将患者分为3组：良性肿瘤/原位腺癌（benign tumor/adenocarcinoma in situ,BT/AIS）组、微浸润腺癌（minimally invasive adenocarcinoma,MIA）组和浸润性腺癌（invasive adenocarcinoma,IA）组。使用LungMe试剂盒通过甲基化特异性PCR(MS-PCR)测量FFPE标本的SHOX2和RASSF1A甲基化水平。以SHOX2和RASSF1A的甲基化水平为预测变量，采用机器学习算法（包括逻辑回归、XGBoost、随机森林、朴素贝叶斯）预测不同的肺腺癌病理类型，并构建网络服务器供临床使用。结果共纳入272例患者，BT/AIS组、MIA组和IA组患者的平均年龄分别为57.97岁、61.31岁和63.84岁；女性患者占比分别为55.38%、61.11%和61.36%。基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平建立的早期肺腺癌预测模型中，随机森林与XGBoost模型在预测各病理类型时表现良好。随机森林模型的C统计量在BT/AIS组、MIA组和IA组分别为0.71、0.72和0.78。XGBoost模型的C统计量在BT/AIS组、MIA组和IA组分别为0.70、0.75和0.77。朴素贝叶斯模型仅在IA组表现较为稳健，C统计量为0.73，具有一定的预测能力。逻辑回归模型在各组中的表现最差，对各组均无预测能力。通过决策曲线分析，随机森林模型在BT/AIS和MIA病理类型的预测中展示了较高的净收益，表明其在临床应用中具有潜在价值。结论基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的机器学习算法预测早期肺腺癌病理类型具有较高的准确性。

关键词：肺腺癌 SHOX2 RASSF1A 甲基化侵袭性

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机械应力调控血管平滑肌细胞的凋亡

中国组织工程研究 2025年第5期29卷 1064-1072页

作者：徐飞闫金强柴守栋北京航空航天大学生物与医学工程学院北京市100083 聊城市人民医院中心实验室山东省聊城市252000 聊城市人民医院病理科山东省聊城市252000 聊城市人民医院心外科山东省聊城市252000

背景:随着生物力学的发展,其在心血管疾病中的研究也日益广泛,通过研究血管的力学特性可以有效地揭示动脉粥样硬化、再狭窄等心血管疾病的发病机制,开发心血管疾病治疗的新思路和新方法。目的:综述机械应力刺激对血管平滑肌细胞凋亡的... 详细信息

背景:随着生物力学的发展,其在心血管疾病中的研究也日益广泛,通过研究血管的力学特性可以有效地揭示动脉粥样硬化、再狭窄等心血管疾病的发病机制,开发心血管疾病治疗的新思路和新方法。目的:综述机械应力刺激对血管平滑肌细胞凋亡的研究现状,寻找临床治疗潜在靶分子和信号通路,以期改善临床动脉粥样硬化及再狭窄等心血管疾病的临床治疗效果。方法:检索1992年1月至2023年5月在中国知网、PubMed及ScienceDirect数据库收录的文献。中文检索词为“血管平滑肌细胞,机械应力,剪切力,牵张力,凋亡”;英文检索词为“vascular smooth muscle cell,mechanical stress,shear stress,stretch stress,apoptosis”,最终纳入63篇文献进行综述分析。结果与结论:①血管平滑肌细胞的生理性和病理性凋亡都是为了适应血管力学变化而发生的适应性重构。不同部位的平滑肌细胞承受不同的力学刺激,其发病机制也不同。②低剪切力、生理剪切力和高剪切力可通过直接与平滑肌细胞表面分子、受体及蛋白等作用调控凋亡信号分子和抑制增殖实现对血管平滑肌细胞凋亡的调控,该部分未对促进增殖的研究进行综述。③低牵张力、生理牵张力和高牵张力可导致平滑肌细胞凋亡,但仍存在争议。平滑肌表面存在多种力学感受分子(如整合素及受体络氨酸激酶等)可以将力学信号转导为细胞内的化学信号(如Hippo通路),启动平滑肌细胞的凋亡信号,调控平滑肌细胞的凋亡。④总之,不同力学刺激通过多种信号分子,启动多个信号通路共同作用,调控平滑肌细胞的凋亡,例如剪切力主要通过刺激分泌前列腺素、转化生长因子等影响Fas/FasL、Akt通路;而牵张力主要通过Yes相关蛋白等调控YAP通路和Notch通路等。这些分子在不同的作用时间,或不同作用强度下可能发挥相反的双向作用,比如,小鼠血管平滑肌细胞受到10%生理牵张1 h时,其增殖增加;然而,人的血管平滑肌细胞牵张12 h后可以减少其增殖。临床可以通过寻找其关键作用时间点干扰力学转导关键分子,达到预防和治疗临床心血管疾病的目的。

关键词：血管平滑肌细胞机械应力凋亡牵张力剪切应力整合素受体络氨酸激酶 G蛋白偶联受体和G蛋白离子通道

基于血常规炎性指标构建衰弱/衰弱前期发生风险列线图模型研究

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中国全科医学 2025年第5期28卷 587-593页

作者：石小天王珊杨华昱杨一帆李旭窦国泽马清首都医科大学附属北京友谊医院老年医学科北京市100050 首都医科大学全科医学与继续教育学院北京市100069

背景衰弱是一种常见的老年综合征,与不良临床结局密切相关。目前评估主要依赖各种量表,缺乏统一的金标准。慢性炎症作为衰弱的病理生理机制之一,血常规炎性指标简单易获得,关于血常规炎性指标和衰弱之间的相关研究较少。目的探讨体检老... 详细信息

背景衰弱是一种常见的老年综合征,与不良临床结局密切相关。目前评估主要依赖各种量表,缺乏统一的金标准。慢性炎症作为衰弱的病理生理机制之一,血常规炎性指标简单易获得,关于血常规炎性指标和衰弱之间的相关研究较少。目的探讨体检老年人血常规炎性指标和衰弱的相关性,分析衰弱的影响因素并构建衰弱发生风险的预测模型。方法选取2020年8月—2022年9月于首都医科大学附属北京友谊医院医疗保健中心行健康体检的老年人。收集研究对象的一般资料、体检实验室检查数据,并采用FRAIL量表评估衰弱。采用单因素及多因素Logistic回归分析探讨衰弱的影响因素并建立列线图预测模型,采用Bootstrap进行模型内部验证。使用受试者工作特征(ROC)曲线、Hosmer-Lemeshow校准曲线和临床决策曲线分析(DCA)评价预测模型的区分度、校准度及预测模型的临床有效性。结果共纳入554例老年人,其中衰弱/衰弱前期213例(38.4%)。多因素Logistic回归分析结果显示,年龄校正的查尔森合并症指数(ACCI)(OR=1.42,95%CI=1.21~1.66)、简易营养筛查量表(MNA-SF)评分(OR=0.71,95%CI=0.61~0.83)、血红蛋白与红细胞体积分布宽度比值(HRR)(OR=0.44,95%CI=0.23~0.86)及多重用药(OR=0.54,95%CI=0.36~0.81)是老年人衰弱/衰弱前期的独立影响因素(P0.05);DCA显示当患者的阈值概率为0.15~0.95时,使用列线图模型预测衰弱发生风险更有益。结论共病、多重用药、营养不良及HRR是老年人衰弱/衰弱前期的影响因素,构建的预测模型具有良好的区分度、一致性与临床实用性,可为衰弱/衰弱前期早期筛查提供指导。

关键词：衰弱炎性指标危险因素列线图预测模型 Logistic回归

胎盘部位滋养细胞肿瘤的临床病理特点及鉴别诊断

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中华病理学杂志 1998年第4期27卷 294-297页

作者：尹辉陈乐真李宝珠解放军总医院病理科北京市妇产医院病理科

目的了解胎盘部位滋养细胞肿瘤（ＰＳＴＴ）的临床病理特点及其鉴别诊断要点。方法对５例ＰＳＴＴ进行临床，光镜，电镜及免疫组化研究，并同时对比观察１０例绒癌及２例过度的胎盘部位反应（ＥＰＳ）。结果ＰＳＴＴ见于育龄妇女，前次... 详细信息

目的了解胎盘部位滋养细胞肿瘤（ＰＳＴＴ）的临床病理特点及其鉴别诊断要点。方法对５例ＰＳＴＴ进行临床，光镜，电镜及免疫组化研究，并同时对比观察１０例绒癌及２例过度的胎盘部位反应（ＥＰＳ）。结果ＰＳＴＴ见于育龄妇女，前次妊娠多为足月产，常见症状为闭经及／或阴道出血。血清绒毛膜促性腺激素（ｈＣＧ）可有轻～中度升高。光镜下瘤细胞组成单一，仅见中间型滋养细胞，成片状，条索状穿插浸润于子宫平滑肌束间。血管浸润明显，却少有出血或坏死。分裂相少见。电镜下瘤细胞核周有丰富的中间丝。免疫组化表现为胎盘催乳素（ｈＰＬ）阳性而ｈＣＧ多为阴性。结论ＰＳＴＴ为一少见的滋养细胞肿瘤，具有独特的光镜，电镜及免疫组化特点。

关键词：滋养层瘤胎盘部位鉴别诊断临床病理

椎管内复合性神经节细胞瘤/神经瘤和神经内分泌肿瘤伴血管畸形1例

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中华病理学杂志 2024年第5期53卷 489-491页

作者：李岩遆红娟付静姜北北京市海淀医院病理科北京100080

复合性神经节细胞瘤/神经瘤和神经内分泌肿瘤(composite gangliocytoma/neuroma and neuroendocrine tumor)是椎管内极少见的一种肿瘤。肿瘤组成成分多样,包含神经内分泌肿瘤、神经节细胞瘤,且血管丰富。在第5版WHO中枢神经系统肿瘤分类... 详细信息

复合性神经节细胞瘤/神经瘤和神经内分泌肿瘤(composite gangliocytoma/neuroma and neuroendocrine tumor)是椎管内极少见的一种肿瘤。肿瘤组成成分多样,包含神经内分泌肿瘤、神经节细胞瘤,且血管丰富。在第5版WHO中枢神经系统肿瘤分类及2022年WHO神经内分泌肿瘤分类中被认为是一种独特的肿瘤类型,并归入颅神经及椎旁神经肿瘤中。本文分析了1例发生于椎管内的复合性神经节细胞瘤/神经瘤和神经内分泌肿瘤,同时伴有血管畸形,并复习相关文献以期总结其临床病理特征。

关键词：神经节细胞瘤椎管内神经内分泌肿瘤复合性